BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg943408
Length=2688
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G03080.1 | Symbols: BSL1 | BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 1 |... 4566 0.0
> AT4G03080.1 | Symbols: BSL1 | BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 1
| chr4:1359655-1365475 REVERSE LENGTH=3235
Length=3235
Score = 4566 bits (2472), Expect = 0.0
Identities = 2618/2690 (97%), Gaps = 3/2690 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATACGCGTAAAGTGGTTTCC-ATGGGCTCCAAACCGTGGCTACATCCAGCTCCTCAGTAT 59
|||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 ATACCCGTAAAGTGGTTTCCAATGGGCTCGAAGCCTTGGCTACATCCAGCTCCTCAGTAT 348
Query 60 AAAACCCTAGAAACCTTTTGGGATGATGCAGACGATGCTCCTGGTCCTAGATGCGCTCAT 119
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 AAAACCCTAGAAACCTTTTGGGATGATGAAGACGATGCTCCTGGTCCTAGATGCGCTCAT 408
Query 120 ACACTTACGGCCGTTGCAGCTACTAAGACTCACGGTCCTCGACTTATACTCTTCGGCGGC 179
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 409 ACACTTACGGCTGTTGCAGCTACTAAGACTCACGGTCCTCGTCTTATTCTCTTCGGCGGC 468
Query 180 GCCACCGCTATTGAGGGCGGGAGTTCTTCAGTTCCTGGGATCAGGTTAGCTGGTGTTACC 239
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 GCCACCGCTATTGAGGGAGGGAGTTCTTCCGTTCCTGGGATCAGGTTAGCTGGTGTTACC 528
Query 240 AATTCGGTGCATTCTTATGATGTTCTCACTAGGAAGTGGACAAGGCTTAAACCGGCTGGT 299
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 AATACGGTGCATTCTTATGATATTCTCACTAGGAAGTGGACAAGGCTTAAACCGGCTGGT 588
Query 300 GAGCCTCCGTCTCCTAGAGCTGCTCACGCCGCAGCTGCTGTTGGCACCATGGTCGTTTTT 359
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 589 GAGCCTCCGTCTCCTAGGGCTGCTCACGCCGCAGCTGCAGTTGGCACCATGGTCGTTTTT 648
Query 360 CAGGGTGGCATTGGCCCGGCGGGGCATTCTACTGATGATCTTTACGTTCTTGACATGACT 419
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 CAGGGTGGCATTGGACCGGCGGGGCATTCTACTGATGATCTTTACGTTCTTGACATGACT 708
Query 420 AATGATAAGTTCAAGTGGCACAGGGTGGTGGTTCAAGGGGATGGTCCAGGCCCTCGCTAT 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 AATGATAAGTTCAAGTGGCACAGGGTGGTGGTTCAAGGGGATGGTCCAGGCCCTCGCTAT 768
Query 480 GGCCATGTTATGGATTTAGTTTCTCAGAGGTATCTTGTTACAGTCACCGGAAATGATGGT 539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 GGCCATGTTATGGATTTAGTTTCTCAGAGGTATCTTGTTACAGTCACCGGAAATGATGGG 828
Query 540 AAACGAGCTCTTTCTGACGCTTGGGCCCTGGATACAGCTCAGAAACCATATGTATGGCAG 599
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 AAACGAGCTCTTTCTGACGCTTGGGCACTGGATACAGCTCAGAAACCATATGTATGGCAG 888
Query 600 AGATTGAACCCAGATGGTGACCGGCCAAGTGCTAGAATGTATGCTTCTGGCAGTGCTCGT 659
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGATTGAACCCAGATGGTGACCGACCAAGTGCTAGAATGTATGCTTCTGGCAGTGCTCGT 948
Query 660 TCTGATGGCATGTTTTTACTCTGCGGGGGAAGAGACACCTTGGGAGCGCCGTTGGGAGAT 719
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 949 TCTGATGGCATGTTTTTGCTCTGCGGGGGAAGAGACACCTTGGGGGCGCCGTTGGGAGAT 1008
Query 720 GCTTATGGGCTGCTAATGCATAGAAATGGTCAGTGGGAGTGGACTCTGGCTCCAGGTGTA 779
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 GCTTATGGGCTACTGATGCATAGAAATGGTCAGTGGGAGTGGACTCTGGCTCCAGGTGTA 1068
Query 780 GCTCCTTCTCCAAGATATCAACATGCAGCGGTTTTTGTAGGTGCAAGATTACATGTCAGT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GCTCCTTCTCCAAGATATCAACATGCAGCGGTTTTTGTAGGTGCAAGATTACATGTCAGT 1128
Query 840 GGTGGTGTGCTGAGAGGAGGCCGTGTAATAGACGCTGAAGCATCTGTTGCAGTGCTTGAT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 GGTGGTGTGCTGAGAGGAGGCCGTGTAATAGACGCTGAAGCATCTGTTGCAGTGCTTGAT 1188
Query 900 ACTGCTGCCGGTGTATGGTTGGATAGAAATGGGCAAGTTACTTCTGCACGCGGAATTAAG 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 1189 ACTGCTGCCGGTGTATGGTTGGATAGAAATGGGCAAGTTACTTCTGCACGTGGAAGTAAG 1248
Query 960 GGACAAATCGATCAAGATCCGTCTTTTGAACTTATGCGACGCTGTCGCCATGGCGCCGCA 1019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1249 GGACAAATCGATCAAGATCCGTCTTTTGAACTTATGCGACGCTGTCGCCATGGCGCGGCA 1308
Query 1020 TCAGTTGGCATCCGGATCTATGTGCATGGTGGTCTAAGAGGAGATGTGTTACTTGACGAT 1079
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 TCAGTTGGTATCCGGATCTATGTGCATGGTGGTCTAAGAGGAGATGTGTTACTTGACGAT 1368
Query 1080 TTTCTAGTTGCTGAAAATTCAACATTCCAGTCAGACATCAGTTCTCCTTTGCTAGCATCA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 TTTCTAGTTGCTGAAAATTCAACATTCCAGTCAGACATCAGTTCTCCTTTGCTAGCATCA 1428
Query 1140 GATAGAACCCAACAAAGTTCTACTCCCAGGTTTTCTTATGCCGCACGACCTCCTTCAGGC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 GATAGAACCCAACAAAGTTCTACTCCCAGGTTTTCTTATGCCGCACGACCTCCTTCAGGC 1488
Query 1200 TCTGAACCAACCTT-TGCCATGTCTGAGGGATTGAGCTTGGATGAAAATTCATTGGAGAA 1258
|||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1489 TCTGAACCAAGCTTCT-CCATGTCTGAGGGACTGAGCTTGGATGAAAATTCGTTGGAGAA 1547
Query 1259 ATTGACGGAGGCTTCTGCAGCTGAAGCAGAGGTAGCTAGTTCTGTTTGGCGAGCTGCACA 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 ATTGACGGAGGCTTCTGCAGCTGAAGCAGAGGTAGCTAGTTCTGTTTGGCGAGCTGCACA 1607
Query 1319 ACTAGGATCTGGTACTCTGGATGAAGAACCCTCTACCTCTGATGCCAGCTCGCCAACTGT 1378
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1608 ACTAGGAGCTGGTACTCTGGATGAAGAACCCTCTACCTCTGATGCCAGCTCGCCAATTGT 1667
Query 1379 AGAAACTACTACTGATGATACTGCAAATGAAGGAGATGTCAGGCTTCATCCGAGAGCTGT 1438
|||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 AGAATCTACTACTGATGGTACCGCAAATGAAGGAGATGTCAGGCTTCATCCGAGAGCTGT 1727
Query 1439 TGTGGTAGCAAAAGAGACGGTTGGCAGTCTGGGTGGCATGGTAAGACAGCTAAGCTTGGA 1498
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 TGTGGTAGCAAAAGAGACGGTTGGTAGTCTGGGCGGCATGGTAAGACAGCTAAGCTTGGA 1787
Query 1499 TCAGTTTCAGAATGAGAGCCGGCGGATGGTTCCCATGAATAATAGCGATGTGCCACAACC 1558
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 TCAGTTTCAGAATGAGAGCCGACGGATGGTTCCCATGAACAATAGCGATGTGCCACAACC 1847
Query 1559 TACCAAGAAGTTCACGAGACAGAAGTCTCCGCAAGGCCTGCATAAAAAGGTCATTGCTGC 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TACCAAGAAGTTCACGAGACAGAAGTCTCCGCAAGGCCTGCATAAAAAGGTCATTGCTGC 1907
Query 1619 TTTGTTGAGACCTCGAAACTGGAAACCTCCTGGCAATAGGAAGTTTTTCTTGGATTCTTA 1678
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1908 TTTGTTAAGACCTCGAAACTGGAAACCTCCTGGCAATAGGAAATTTTTCTTGGATTCTTA 1967
Query 1679 CGAAGTTGGGGAACTCTGTTATGCAGCCGAACAAATATTTATGCATGAACAAACGGTTCT 1738
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 CGAAGTTGGGGAACTCTGTTATGCTGCCGAACAAATATTTATGCATGAACAAACGGTTCT 2027
Query 1739 TCAGTTAAAAGCTCCTATCAAAGTCTTTGGCGATCTCCATGGGCAATTCGGTGACTTAAT 1798
|||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 2028 TCAGCTAAAGGCTCCTATCAAAGTATTTGGCGATCTCCATGGGCAATTTGGCGATTTAAT 2087
Query 1799 GCGTTTATTTGATGAATATGGATTTCCCTCAACAGCTGGAGACATCACGTATATTGACTA 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088 GCGTTTATTTGATGAATATGGATTTCCCTCAACAGCTGGAGACATCACGTATATTGACTA 2147
Query 1859 TTTATTTTTGGGAGATTACGTTGACCGAGGACAACACAGCCTGGAGACTATAACTTTGCT 1918
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2148 TTTATTCTTGGGAGATTACGTTGACCGGGGACAACACAGCCTGGAGACTATAACGTTGCT 2207
Query 1919 GCTTGCATTGAAGATTGAATATCCGGAGAATGTTCACTTGATTCGCGGAAATCACGAGGC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2208 GCTTGCATTGAAGATTGAATATCCGGAGAATGTTCACTTGATTCGTGGAAACCACGAGGC 2267
Query 1979 TGCTGACATTAATGCACTATTTGGTTTCCGTCTTGAATGCATAGAAAGAATGGGAGAGAA 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 TGCTGACATTAATGCACTATTTGGTTTCCGTCTTGAATGCATAGAAAGAATGGGAGAGAA 2327
Query 2039 TGATGGCATCTGGGCATGGACAAGATTTAATCAACTTTTTAATTATCTTCCTCTCGCTGC 2098
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2328 TGATGGCATCTGGGCGTGGACAAGATTTAATCAACTTTTTAATTATCTTCCTCTTGCTGC 2387
Query 2099 ACTAATCGAGAATAAAATTATATGTATGCATGGTGGAATTGGGAGGTCAATCAGTACAGT 2158
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 ACTAATCGAGAACAAAATTATATGTATGCATGGTGGAATTGGGAGGTCAATCAGTACAGT 2447
Query 2159 GGAACAGATTGAGAAGATTGAAAGGCCCATAACAATGGATGCTGGATCCCTTGTTCTTAT 2218
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2448 GGAACAGATTGAAAAGATTGAAAGACCCATAACAATGGATGCTGGATCCCTTGTTCTAAT 2507
Query 2219 GGATTTATTATGGTCTGATCCTACAGAGAACGATAGTATCGAGGGTTTAAGACCAAACGC 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 GGATTTATTATGGTCTGATCCTACAGAGAACGATAGTATCGAGGGTTTAAGACCAAACGC 2567
Query 2279 CAGAGGACCTGGTCTTGTCACGTTTGGGCCTGATAGAGTCACAGAATTCTGTAAGAAGAA 2338
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2568 CAGAGGACCTGGCCTTGTCACGTTTGGGCCTGATAGAGTCACAGAATTCTGTAAGAGGAA 2627
Query 2339 TAAACTACAGTTAATTATCAGGGCCCATGAATGTGTAATGGATGGATTCGAAAGATTTGC 2398
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 TAAACTACAGCTAATTATCAGGGCCCATGAATGTGTGATGGATGGATTCGAAAGATTTGC 2687
Query 2399 ACAGGGACAGTTGATTACGCTTTTCTCCGCCACAAATTACTGCGGAACTGCGAACAATGC 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 ACAGGGACAGTTGATTACGCTTTTCTCCGCCACAAATTACTGCGGAACTGCGAACAATGC 2747
Query 2459 GGGAGCTATATTGGTGGTTGGCAGAGGATTGGTGATTGTTCCTAAGTTGATTCATCCTCT 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 2748 AGGAGCTATATTGGTGGTTGGCAGAGGATTGGTGATTGTTCCCAAGTTAATTCATCCTCT 2807
Query 2519 TCCACCTCCCATCTTATCTCCAGAGAATTCTCCAGAACATTCTGGAGACGACGCTTGGAT 2578
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 TCCACCTCCCATCTTATCTCCAGAGAACTCTCCAGAACATTCTGGAGACGACGCTTGGAT 2867
Query 2579 GCAGGAGCTGAATATCCAGAGACCGCCGACTCCAACACGAGGCAGGCCACAACCAGATTT 2638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 GCAGGAGCTGAATATCCAGAGACCGCCGACTCCAACACGAGGCAGGCCACAACCAGATTT 2927
Query 2639 TGACAGAAGCTCGCTTGCATACATCTGAACCTGATTGCATTCATGGTTTC 2688
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 2928 TGACAGAAGCTCGCTTGCATACATCTGAATCTGATTGCATTCCCGGTTTC 2977
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 133494235323
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5