BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg943535
Length=4022
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G02070.1 | Symbols: MSH6, MSH6-1, ATMSH6 | MUTS homolog 6 | ... 6318 0.0
> AT4G02070.1 | Symbols: MSH6, MSH6-1, ATMSH6 | MUTS homolog 6
| chr4:906079-912930 FORWARD LENGTH=3975
Length=3975
Score = 6318 bits (3421), Expect = 0.0
Identities = 3800/3985 (95%), Gaps = 18/3985 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGGCTCCGTCACGCCGACAGATCAGTGGAAGATCTCCGTTGGTGAACCAGCAGCGTCAA 80
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCCGTCTCGCCGACAGATCAGCGGAAGATCTCCGTTGGTGAACCAGCAGCGTCAA 60
Query 81 ATCACCTCCTTCTTTGGCAAATCTGCTTCCTCTTCTTCTTCTCCGTCTCCATCACCTTCA 140
||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 61 ATCACCTCCTTCTTTGGGAAATCTGCTTCATCATCTTCTTCTCCGTCTCCATCTCCTTCA 120
Query 141 CCATCTCTCTCCAATAAGAAAACCCCCAAACCT---AACCCTAACCCTAATTCTCCGTCT 197
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 CCATCTCTCTCCAATAAGAAAACCCCCAAATCTAACAACCCTAACCCTAAATCTCCGTCT 180
Query 198 CCGTCACCATCTCCGCCTAAGAAAACCCCTAAATTGAATCCTAACCCTAGTTCTGATCCT 257
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |
Sbjct 181 CCGTCACCATCTCCGCCTAAGAAAACCCCCAAATTGAACCCTAACCCTAGTTCTAATCTT 240
Query 258 CCTGCTCGTAGTCCTAGCCCTGGTCCTGCGACGCCTTCTCCTGTACAGTCCAAGTTTAAG 317
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCTGCTCGTAGTCCTAGCCCTGGTCCTGATACTCCTTCTCCTGTACAGTCCAAGTTTAAG 300
Query 318 AAGCCCCTTCTCGTCATCGGACAAACACCTTCGCCTCCTCAATCGGCGGTAATTACTTAC 377
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 301 AAGCCCCTTCTCGTCATCGGACAGACACCTTCGCCTCCTCAATCGGTGGTAATTACTTAC 360
Query 378 GGTGAGGAGGTGGTGGGGAAGCAAGTTAGGGTTTATTGGCCGTTGGATAAGAAATGGTAT 437
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 361 GGTGACGAGGTGGTGGGGAAGCAAGTTAGGGTTTATTGGCCTTTGGATAAAAAATGGTAT 420
Query 438 GATGGGAGCGTGACGTTTTATGATAAGGGTGAGGGTAAGCATGTGGTTGAGTATGAAGAT 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GATGGGAGCGTGACGTTTTATGATAAGGGTGAGGGTAAGCATGTGGTTGAGTATGAAGAT 480
Query 498 GGGGAAGAAGAGTCTTTGGATTTGGGGAAGGAGAAGATTGAGTGGGTGGTCGGGGAAAAA 557
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 481 GGGGAAGAAGAGTCTTTGGATTTGGGAAAGGAGAAGACTGAGTGGGTGGTTGGGGAAAAA 540
Query 558 TCAGGAGATAGGTTTAAGCGATTGAGACGAGGCGCTTCAGCTCTCAGAAAAGTTGTGACG 617
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct 541 TCAGGAGATAGGTTTAATCGATTGAAACGAGGCGCTTCGGCTTTGAGAAAAGTTGTGACG 600
Query 618 GATGA-TGATGATGATGTGGAGATGGGTAATGTGGAAAAAGAGAAAGGAGATAAAAGTGA 676
||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||
Sbjct 601 GAT-AGTGATGATGATGTGGAGATGGGTAATGTGG----A-AG--A--AGATAAAAGTGA 650
Query 677 CGGTGATGATTCTAGCGATGAAGATTGGGGAAAGAATGTGGGGAAGCAGGTATGCGAGAG 736
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||
Sbjct 651 CGGTGATGATTCTAGCGATGAGGATTGGGGAAAGAATGTTGGGAAGGAGGTTTGTGAGAG 710
Query 737 CGAAGAAGACGATGTGGAGTTGGTTGATGAGAATGAGATGGATGAAGATGAGCTGGTGGA 796
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 711 TGAAGAAGATGATGTGGAGTTGGTTGATGAGAATGAAATGGATGAAGAAGAGTTGGTGGA 770
Query 797 AGAGAAAGATGAAGAAACTCCTAAAG-GAAGTAAAGTTTCCAAAACTGACTCTAGAAAGC 855
||||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 AGAGAAAGATGAAGAAACTTCTAAAGTTAA-TAGAGTATCCAAAACTGACTCTAGAAAGC 829
Query 856 GGAAGACAAGTGAAGTAACGAAATCAGGTGGTGAGAAGAAAAGCAGGACTGATAAAGACA 915
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 830 GGAAGACTAGTGAAGTAACGAAATCAGGTGGTGAGAAGAAAAGCAAGACTGATACAGGCA 889
Query 916 CTATTTTGAAAGGTTTTAAGGCTTCTGTTGTGGAGCCTCCTATGAAGATTGGAGAAGCTG 975
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||
Sbjct 890 CTATCTTGAAAGGTTTTAAGGCTTCTGTTGTGGAGCCTGCGAAGAAGATTGGACAAGCTG 949
Query 976 ATAGGGTGGTCAAGAATTTGGAAGATAACATATTGGATGGAGATGCTCTTGCTAGATTTG 1035
|||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 950 ATAGGGTGGTCAAGGGTTTGGAAGATAACGTGTTGGATGGGGATGCTCTTGCTAGATTTG 1009
Query 1036 GTGCTCGTGAATCTGAGAAATTCCGCTTCCTGGGAGTAGACCGAAGGGATGCTAAAAGGA 1095
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 GTGCTCGTGATTCTGAGAAATTCCGCTTTTTGGGAGTAGACCGAAGGGATGCTAAAAGGA 1069
Query 1096 GACGCCCTACTGATGAGAATTATGATCCAAGGACACTATACCTTCCGCCTGATTTTGTGA 1155
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1070 GACGCCCTACTGATGAGAATTATGATCCGAGGACACTCTACCTCCCTCCTGATTTTGTGA 1129
Query 1156 AAAAATTAACAGGGGGCCAGAGACAATGGTGGGAGTTTAAATCAAAGCATATGGACAAAG 1215
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1130 AAAAATTAACTGGAGGCCAGAGACAATGGTGGGAGTTTAAAGCAAAGCATATGGACAAAG 1189
Query 1216 TTGTATTCTTCAAGATGGGTAAATTCTATGAGCTTTTTGAGATGGATGCACATGTAGGAG 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1190 TTGTATTCTTCAAGATGGGTAAATTCTATGAGCTTTTTGAGATGGATGCACATGTCGGAG 1249
Query 1276 CTAAGGAACTGGATATACAGTACATGAAGGGAGAACAACCTCATTGTGGATTTCCGGAGA 1335
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CTAAGGAACTGGATATACAATACATGAAGGGAGAGCAACCTCATTGTGGATTTCCGGAGA 1309
Query 1336 AGAATTTCTCTGTAAACATTGAGAAATTAGTTAGAAAGGGCTATCGGGTTTTAGTTGTGG 1395
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1310 AGAATTTTTCTGTAAACATTGAGAAATTAGTTAGAAAGGGCTATCGGGTTTTAGTTGTCG 1369
Query 1396 AGCAAACAGAAACACCTGATCAGCTGGAGCAACGCCGGAAAGAGACAGGCTCCAAGGATA 1455
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1370 AACAAACAGAAACACCTGATCAGCTGGAGCAACGCCGAAAAGAGACAGGTTCCAAGGATA 1429
Query 1456 AAGTTGTGAAGCGCGAAATATGTGCAGTTGTTACGAAAGGAACGCTGACAGATGGGGAGA 1515
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1430 AAGTTGTGAAGCGCGAAGTATGTGCAGTTGTTACAAAAGGCACGCTGACAGATGGGGAGA 1489
Query 1516 TGCTATTAACTAATCCGGATGCATCTTATCTAATGGCCTTGACTGAAGGAGGAGAAAGTT 1575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 TGCTATTAACTAATCCGGATGCATCTTATCTAATGGCCTTGACTGAAGGAGGAGAAAGTT 1549
Query 1576 TAACTGATCAGACAGCAGAGCACAATTTTGGTGTCTGTTTGGTTGATGTTGCGACAAAGA 1635
||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1550 TAACTAATCCTACAGCAGAGCACAATTTTGGTGTATGTTTGGTTGATGTTGCGACACAGA 1609
Query 1636 AGATAATGCTGGGCCAGTTCAAGGATGATCAAGACTGCAGTGCATTATCTTGCCTGCTAT 1695
||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 AGATAATACTGGGCCAGTTTAAGGATGATCAAGATTGCAGTGCATTATCTTGCCTGCTAT 1669
Query 1696 CTGAGATGAGGCCGGTGGAAATTATTAAACCAGCTAAGGTGTTGAGTTCTGCAACAGAGA 1755
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1670 CTGAGATGAGGCCGGTGGAAATTATTAAACCAGCTAAGGTGTTGAGTTATGCAACAGAGA 1729
Query 1756 GAACAATAGTTAGACAAACCCGAAATCCCTTAGTAAATAATCTGGTCCCACTTTCTGAAT 1815
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1730 GAACAATAGTTAGACAAACCAGAAATCCCTTAGTAAATAATCTCGTTCCACTTTCTGAAT 1789
Query 1816 TTTGGGATTCAGAGAAGACCATACATGAAGTTGGAATTTTCTACAAGCGAATCAGTTGTC 1875
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 1790 TTTGGGATTCGGAGAAGACCATATATGAAGTTGGAATTATCTACAAGCGAATCAATTGTC 1849
Query 1876 AACCGTCTTCTGCTTATTCTAGTGAAGGAAAGATTCCAGGTGATGGTTCAAGCTTCCTTC 1935
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1850 AACCGTCTTCTGCTTATTCTAGTGAGGGAAAGATTCTAGGTGATGGTTCAAGCTTTCTTC 1909
Query 1936 CAAAAATGTTGTCTGAATTAGCAACTGAAGATAAGAATGGTAGCCTAGCACTCTCTGCTC 1995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1910 CAAAAATGTTGTCTGAATTAGCAACTGAAGATAAGAATGGTAGCCTGGCACTCTCTGCTC 1969
Query 1996 TTGGTGGTGCCATTTACTACCTGCGACAAGCATTCTTGGATGAGAGTCTGCTTAGATTTG 2055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 TTGGTGGTGCCATTTACTACCTGCGACAAGCATTCTTGGATGAGAGTCTGCTTAGATTTG 2029
Query 2056 CCAAGTTTGAATCCCTGCCTTGCTGTGATTTCAGCAACGTTAATGAGAAACAGCACATGG 2115
| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2030 CAAAGTTTGAATCCCTGCCTTACTGTGATTTCAGCAACGTTAATGAGAAGCAGCACATGG 2089
Query 2116 TTCTTGATGCTGCTGCTCTTGAAAACCTTGAAATATTTGAAAACAGTAGAAATGGAGGCT 2175
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 TTCTTGATGCTGCTGCTCTTGAAAACCTTGAGATATTTGAAAACAGTAGAAATGGAGGCT 2149
Query 2176 ATTCGGGAACGCTGTATGCTCAACTGAATCAATGTGTCACTGCATCTGGGAAACGGTTAC 2235
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 ATTCAGGAACGCTGTATGCTCAACTGAATCAATGTATCACTGCATCTGGGAAACGGTTAC 2209
Query 2236 TTAAAACATGGCTGGCGAGACCTTTATATAATCCGAAACTGATCAAGGAACGACAAGATG 2295
| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 TGAAAACATGGCTGGCAAGACCTTTATATAATACGGAACTGATCAAGGAACGACAAGATG 2269
Query 2296 CTGTAGCAATTCTGCGGGGTGAAAATCTTCCGTACTCACTGGAATTTCGGAAGGCGTTGT 2355
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2270 CTGTAGCAATTCTGCGGGGTGAAAATCTTCCGTACTCACTGGAATTCCGGAAGTCGTTGT 2329
Query 2356 CCAGACTTCCGGACATGGAACGGTTGATTGCACGTATGTTTTCTAGCATTGAAGCTAGTG 2415
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 CCAGACTTCCAGACATGGAACGGTTGATTGCACGTATGTTTTCTAGCATTGAAGCTAGTG 2389
Query 2416 GAAGAAATGGCGATAAAGTGGTGTTATATGAAGATACGGCAAAGAAGCAGGTACAAGAAT 2475
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 2390 GAAGAAATGGCGATAAAGTGGTGCTATATGAAGATACAGCTAAGAAGCAGGTACAGGAAT 2449
Query 2476 TCATATCAACTCTACGTGGTTGTGAAACAATGGCAGAAGCATGCTCTTCTCTCCGTGCTA 2535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450 TCATATCAACTCTACGTGGTTGTGAAACAATGGCAGAAGCATGCTCTTCTCTCCGTGCTA 2509
Query 2536 TCTTGAAGCACGATAAATCCAGGCGGCTGTTTCATTTACTAACTCCTGGTCAAATTCTTC 2595
|||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2510 TCTTGAAGCATGATACATCCAGGCGGCTGCTTCATTTACTAACTCCTGGTCAAAGTCTTC 2569
Query 2596 CGAACATATCTTCCTCCATTAAGTATTTCAAGGATGCTTTTGACTGGGTAGAAGCTCACA 2655
| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 CAAATATATCATCCTCCATAAAGTATTTCAAGGATGCTTTTGACTGGGTAGAAGCTCACA 2629
Query 2656 ATTCTGGTCGTGTAATACCCCATGAAGGAGCTGATGAAGAGTATGATTGTGCCTGCAAAA 2715
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 ATTCTGGACGTGTAATACCCCATGAAGGAGCAGATGAAGAGTATGATTGTGCCTGCAAAA 2689
Query 2716 CAGTAGAAGAATTTGAGTCCAGTTTGAAAAAACATCTGAAAGAGCAACGGAAATTACTCG 2775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 CAGTAGAAGAATTTGAGTCCAGTTTGAAAAAACATCTGAAAGAGCAACGGAAATTACTCG 2749
Query 2776 GAGATCCATCTATAAACTATGTTACTGTTGGAAAAGATGAATACCTCTTGGAAGTTCCTG 2835
||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 GAGATGCATCAATAAACTATGTTACAGTTGGAAAAGATGAATACCTCTTGGAAGTTCCTG 2809
Query 2836 AAATTTTAAGTGGGAGTGTTCCTCGTGATTATGAATTATGCTCATCGAAAAAGGGTGTCT 2895
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 AAAGTTTAAGTGGGAGTGTTCCTCATGATTATGAATTATGCTCATCGAAAAAGGGTGTCT 2869
Query 2896 CTCGATATTGGACTCCTACCATAAAGAAATTATTAAAAGAGCTATCACAAGCAAAATCTG 2955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 CTCGATATTGGACTCCTACCATAAAGAAATTATTAAAAGAGCTATCACAAGCAAAATCTG 2929
Query 2956 AAAAAGAGTCGGCTCTGAAGAGCATTTCACAGAGATTGATTGGACGTTTCTGTGAGCATC 3015
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2930 AAAAAGAGTCGGCCCTGAAGAGCATTTCACAGAGATTGATTGGACGTTTCTGCGAGCATC 2989
Query 3016 AAGAAAAATGGAGACAATTGGTTTCTGCAACAGCTGAGCTGGACGTGTTGATCAGCCTCG 3075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 AAGAAAAATGGAGACAATTGGTTTCTGCAACAGCTGAGCTGGACGTGTTGATCAGCCTCG 3049
Query 3076 CTTTTGCAAGTGATTCTTATGAAGGAGTAAGATGCCGCCCAGTAATATCAGGTTCTACAT 3135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3050 CTTTTGCAAGTGATTCTTATGAAGGAGTAAGATGCCGCCCAGTAATATCTGGTTCTACAT 3109
Query 3136 CTGATGATGTTCCACACTTGTCTGCCACTGGTCTAGGGCATCCAGTTCTAAGGGGTGATA 3195
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 CTGATGGTGTTCCACACTTGTCTGCCACTGGTCTAGGGCATCCAGTTCTAAGGGGTGATT 3169
Query 3196 C-TCTAGGCAGAGGTTCTTTTGTACCAAATAATGTAAAGATAGGTGGTGCTGAGAAAGCC 3254
| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 CGT-TAGGCAGAGGCTCTTTTGTACCAAATAATGTAAAGATAGGTGGTGCTGAGAAAGCC 3228
Query 3255 AGTTTCATCCTCCTCACAGGCCCTAATATGGGTGGAAAATCAACCCTACTTCGCCAAGTT 3314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3229 AGTTTCATCCTCCTCACAGGCCCTAATATGGGTGGAAAATCAACCCTTCTTCGCCAAGTT 3288
Query 3315 TGCTTGGCTGTAATCTTGGCTCAGATTGGAGCAGATGTCCCAGCAGAAACCTTTGAGGTT 3374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3289 TGCTTGGCTGTAATCTTGGCTCAGATTGGAGCAGATGTCCCAGCAGAAACCTTTGAGGTT 3348
Query 3375 TCGCCTGTTGACAGAATTTGTGTCCGGATGGGTGCAAAAGATCATATTATGGCAGGACAA 3434
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3349 TCGCCTGTTGACAAAATTTGTGTCCGGATGGGTGCAAAAGATCATATCATGGCAGGACAA 3408
Query 3435 AGCACGTTCTTAACAGAACTTTCAGAAACTGCGGTAATGTTGACATCAGCTACCCGAAAC 3494
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3409 AGCACGTTTTTAACAGAACTTTCAGAAACTGCGGTAATGTTGACATCAGCCACCCGAAAC 3468
Query 3495 TCTCTGGTGGTACTAGATGAGCTTGGACGAGGAACAGCCACATCAGATGGACAAGCCATT 3554
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3469 TCGCTGGTGGTGCTAGATGAGCTTGGACGAGGAACAGCCACATCAGATGGGCAAGCCATT 3528
Query 3555 GCGGAATCCGTACTTGAGCACTTCATAGACAAGGTGCAGTGTAGAGGATTGTTCTCTACT 3614
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3529 GCGGAATCCGTACTTGAGCACTTCATAGAAAAGGTGCAGTGTAGAGGATTCTTCTCTACT 3588
Query 3615 CATTATCATCGTCTATCTGTGGATTATCAAACCAATCCAAAGGTCTCACTTTGCCATATG 3674
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 CATTATCATCGTCTCTCTGTGGATTATCAAACCAATCCAAAGGTCTCACTTTGCCATATG 3648
Query 3675 GCATGTCAAGTAGGAGAAGGAATTGGTGGAGTAGAAGAAGTGACATTTCTCTATAGACTG 3734
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 3649 GCATGTCAAATAGGAGAAGGAATCGGTGGAGTAGAAGAAGTTACATTTCTCTATAGATTG 3708
Query 3735 ACGCCTGGTGCATGTCCTAAAAGCTATGGAGTTAATGTTGCTCGGCTAGCTGGTCTTCCA 3794
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3709 ACTCCTGGTGCATGTCCTAAAAGTTATGGAGTTAACGTTGCTCGGTTAGCTGGTCTTCCA 3768
Query 3795 GATTACGTACTTCAGAGAGCCGTGATAAAATCCCAAGAATTTGAGGCCTTGTATGGTAAA 3854
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 3769 GATTACGTACTCCAGAGAGCCGTGATAAAATCCCAAGAATTCGAGGCTTTGTACGGTAAA 3828
Query 3855 AAACAGAGAAAAACTGATCATAAAATGGCAGCAGTGATAAAGCAGATCATCAGCAGTGTT 3914
|| || |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3829 AACCATAGAAAAACCGATCATAAATTAGCAGCAATGATAAAGCAGATCATCAGCAGTGTT 3888
Query 3915 GCATCAGATTCTGATTACTCAGCTTCAAAAGACTCATTGTCTGAGCTACACTCCATGGCC 3974
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3889 GCATCAGATTCTGATTACTCAGCTTCAAAGGACTCATTGTGTGAGCTACACTCCATGGCC 3948
Query 3975 AATACATTTCTCCGGTTGACCAACT 3999
||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3949 AATACATTTCTCCGGTTAACCAACT 3973
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 200416937285
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5