BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg944613
Length=4610
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G33200.1 | Symbols: XI-I, ATXI-I, XI-15 | myosin, putative |... 7862 0.0
AT1G04160.1 | Symbols: XIB, ATXIB, XI-8, XI-B | myosin XI B | c... 187 8e-46
> AT4G33200.1 | Symbols: XI-I, ATXI-I, XI-15 | myosin, putative
| chr4:16002529-16014968 REVERSE LENGTH=4984
Length=4984
Score = 7862 bits (4257), Expect = 0.0
Identities = 4479/4590 (98%), Gaps = 0/4590 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCGAGCTCTTCACGAGTTCATGAGAAATTGTCTTCCAATGGAATTGAATCTGCGCAAGG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 GTCGAGCTCTTCACGAGTTCATGAGAAATTGTCTTCCAATGGAATTGAATCTGCGCAAGG 216
Query 61 GGGACAAGGTTTGGGTCGAAGATAAGGATTTGGCTTGGATTGCTGCTGATGTGCTCGATT 120
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 217 GCGACAAGGTTTGGGTCGAAGATAAGGATTTGGCTTGGATTGCTGCTGATGTCCTCGATT 276
Query 121 CTTTTGATAACAAGCTCCATGTTCAAACTTCTACTGGGAAGAAGGTTTTTGTTTCCCCGG 180
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 CTTTTGATAACAAACTCCATGTTGAAACTTCTACTGGGAAGAAGGTTTTTGTTTCCCCGG 336
Query 181 AAAAGCTATTTCGGAGGGATCCCGATGATGAAGAGCATAATGGAGTGGATGATATGACCA 240
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 AAAAGCTATTTCGGAGGGATCCTGACGATGAAGAGCATAATGGAGTGGATGATATGACCA 396
Query 241 AACTGACATACTTGCACGAAGCTGGTGTGCTTTATAATCTACAGAGGAGATACGCTCTGA 300
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 397 AACTGACATACTTGCACGAAGCTGGTGTTCTTTATAATCTACAGAGGAGATATGCTCTGA 456
Query 301 ATGATATATATACATACACTGGAAGCATTCTGATCGCTGTAAATCCATTTAAAAAGCTTC 360
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 457 ATGATATCTATACATACACTGGAAGCATTCTGATCGCTGTTAATCCATTCAAAAAGCTTC 516
Query 361 CACATCTCTACAATGGGCACATGATGGAGCAGTACAAGGGAGCACCATTCGGTGAGCTCA 420
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 CACATCTCTACAATGGGCACATGATGGAACAGTACATGGGAGCACCATTCGGTGAGCTCA 576
Query 421 GTCCTCATGTTTTTGCAGTTTCTGATGTTGCATACAGAGCAATGATTGACGACAGTCGAA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 GTCCTCATGTTTTTGCAGTTTCTGATGTTGCATACAGAGCAATGATTGACGACAGTCGAA 636
Query 481 GTCAGTCAATACTTGTTAGCGGTGAAAGTGGAGCTGGAAAAACTGAGACAACCAAACTAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 GTCAGTCAATACTTGTTAGCGGTGAAAGTGGAGCTGGAAAAACTGAGACAACCAAACTAA 696
Query 541 TCATGCAGTATCTTACATTTGTTGGGGGACGTGCTACTGACGATAATAGAAGTGTTGAGC 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 697 TCATGCAGTATCTTACATTTGTTGGGGGACGTGCTACTGACGATGATAGAAGTGTTGAGC 756
Query 601 AGCAAGTCCTTGAATCAAATCCTCTCTTGGAAGCATTTGGCAATGCAAAAACAGTTAGAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 AGCAAGTCCTTGAATCAAATCCTCTCTTGGAAGCATTTGGCAATGCAAAAACAGTTAGAA 816
Query 661 ATGATAATTCCAGCCGTTTTGGAAAGTTTGTCGAAATCCAGTTTGACACAAATGGTAGAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 ATGATAATTCCAGCCGTTTTGGAAAGTTTGTCGAAATCCAGTTTGACACAAATGGTAGAA 876
Query 721 TATCTGGTGCCGCAATCAGAACCTATCTTCTGGAGAGATCACGTGTAGTCCGGATAACAG 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 877 TATCTGGTGCCGCAATCAGAACCTATCTTCTGGAGAGATCACGTGTTGTCCGGATAACAG 936
Query 781 ACCCCGAGAGGAATTATCATTGTTTTTATCAATTGTGCGCTTCGGGGAATGACGCTGAGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 ACCCCGAGAGGAATTATCATTGTTTTTATCAATTGTGCGCTTCGGGGAATGACGCTGAGA 996
Query 841 AATATAAACTAAGCAACCCTCGTCAATTTCATTATTTAAATCAAAGCAAGACCTATGAAC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 AATATAAACTAAGCAACCCTCGTCAATTTCATTATCTAAATCAAAGCAAGACCTATGAAT 1056
Query 901 TAGAAGGAGTCAGCAGCGCAGAAGAGTATAAGAATACAAGGAGGGCAATGGATATTGTGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 TAGAAGGAGTCAGCAGCGCAGAAGAGTATAAGAATACAAGGAGGGCAATGGATATTGTGG 1116
Query 961 GCATAAGTCATGATGAGCAGGAAGGGATATTCCGCACACTTGCTGCGATTCTACATCTTG 1020
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 GCATAAGTCAGGATGAGCAGGAAGGGATATTTCGCACACTTGCTGCGATTCTACATCTTG 1176
Query 1021 GAAATGTTGAGTTTTCCTCAGGGAGAGAGCACGACTCTTCAGTGGTAAAGGATCTGGAAT 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1177 GAAATGTTGAGTTTTCCTCAGGGAGAGAGCACGACTCTTCAGTGGTAAAGGATCCGGAAT 1236
Query 1081 CTAGACATCATCTGCAGATGGCTGCTGATCTTTTCAAGTGTGATGCAAATCTTTTGCTGG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 CTAGACATCATCTGCAGATGGCTGCTGATCTTTTCAAGTGTGATGCAAATCTTTTGCTGG 1296
Query 1141 CTTCTCTCTGCACACGTTCAATTCTGACCCGTGAAGGTATCATTATCAAAGCACTCGACC 1200
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1297 CTTCGCTCTGCACACGTTCAATTCTGACCCGTGAAGGTATCATTATCAAAGCACTTGACC 1356
Query 1201 CTAATGCTGCTGTTGCTAGCCGAGATACCCTCGCGAAGACCGTTTACGCCCATCTGTTTG 1260
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1357 CTAATGCTGCTGTTACTAGCCGGGATACCCTCGCGAAGACTGTTTACGCCCATCTATTTG 1416
Query 1261 ACTGGCTGGTTGATAAGATCAATAAGTCTGTTGGGCAAGATCCAGAATCTCGTTTTCAAA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417 ACTGGCTGGTTGATAAGATCAATAAGTCTGTTGGGCAAGATCCAGAATCTCGTTTTCAAA 1476
Query 1321 TAGGAGTCCTGGACATTTATGGCTTTGAATGTTTTAAGAATAACAGTTTTGAACAATTTT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TAGGAGTCCTGGACATTTATGGCTTTGAATGTTTTAAGAATAACAGTTTTGAACAATTTT 1536
Query 1381 GCATCAACTTTGCAAATGAAAAGCTGCAGCAACATTTCAATGAGCATGTATTCAAGATGG 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1537 GCATCAACTTTGCAAATGAAAAGCTGCAGCAACATTTCAACGAGCATGTATTCAAGATGG 1596
Query 1441 AGTAGGATGAGTACAGAAAAGAAGAAATTAATTGGAGTTATATCGAGTTTATTGACAACC 1500
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 AGCAGGATGAGTACAGAAAAGAAGAAATTAATTGGAGTTATATCGAGTTTATTGACAACC 1656
Query 1501 AAGATGTCTTGGACCTTATTGAGAAGAAGCCTATTGGGGTAATTGCACTCTTGGATGAAG 1560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1657 AAGATGTCTTGGACCTTATTGAGAAGAAGCCTATTGGGGTGATTGCACTCTTAGATGAAG 1716
Query 1561 CTTGCATGTTTCCTAGATCAACTCATGAGTCATTTTCAATGAAGCTGTTTCAGAACTTTA 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717 CTTGCATGTTTCCTAGATCAACTCATGAGTCATTTTCAATGAAGCTGTTTCAGAACTTTA 1776
Query 1621 AATTTCATCCGAGATTGGAGAAGGAAAAATTTTCAGAGACGGATTTTACTCTCTCTCATT 1680
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GATTTCATCCGAGATTGGAGAAGCCAAAATTTTCAGAGACGGATTTTACTCTCTCTCATT 1836
Query 1681 ATGCTGGCAAGGTTACTTATCAAACTGAATCCTTTTTGGATAAAAACCGTGATTATACTA 1740
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 ATGCTGGCAAGGTTACTTATCAAACTGAAGCCTTTTTGGATAAAAACCGTGATTATACTA 1896
Query 1741 TAGTGGAGCATTGCAATCTGCTGTCTTCCTCCAAATGCCCTTTCGTTGCTGGACTTTTCC 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1897 TAGTGGAGCATTGCAATCTGCTGTCTTCCTCCAAATGCCCTTTTGTTGCTGGAATTTTCC 1956
Query 1801 CCTCAGCCCCAGAGGAGTCTACCAGATCTTCTTACAAATTTTCTTCTGTGTCTTCCAGAT 1860
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1957 CCTCAGCCCCGGAGGAGTCTACCAGATCTTCTTACAAATTTTCTTCTGTATCTTCCAGAT 2016
Query 1861 TTAAGCAACAACTTCAAGCCCTCATGGAAACTCTCAGCAAAACAGAGCCTCACTATGTTC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2017 TTAAGCAACAACTTCAAGCCCTCATGGAAACTCTCAGCAAAACAGAGCCTCACTATGTTC 2076
Query 1921 GGTGTGTGAAGCCAAACTCACTCAACAGACCTCAAAAATTTGAGAGTCTTAGTGTTTTAC 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077 GGTGTGTGAAGCCAAACTCACTCAACAGACCTCAAAAGTTTGAGAGTCTTAGTGTTTTAC 2136
Query 1981 ATCAACTTCGTTGTGGGGGTGTACTGGAAGCTGTTCGGATTAGTCTAGCAGGGTATCCCA 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 ATCAACTTCGTTGTGGGGGTGTACTGGAAGCTGTTCGGATTAGTCTAGCAGGGTATCCCA 2196
Query 2041 CTCGAAGGAATTATTCAGACTTCGTGGATCGTTTTGGTCTGCTAGCTCCAGAATTCATGG 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197 CTCGAAGGAATTATTCAGACTTCGTGGATCGTTTTGGTCTGCTAGCTCCAGAATTCATGG 2256
Query 2101 ATGAGAGCAATGATGAGCAGGCACTAACTGAGAAAATCTTGAGTAAATCAGGTCTTGGGA 2160
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2257 ATGAGAGCAATGATGAGCAGGCACTGACTGAGAAAATCTTGAGTAAATTAGGTCTTGGGA 2316
Query 2161 ATTATCAGCTAGGAAGGACAAAAGTGTTCCTAAGAGCTGGTCAAATTGGCATTTTGGACT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2317 ATTATCAGCTAGGAAGGACAAAAGTGTTCCTAAGAGCTGGTCAAATTGGCATTTTGGACT 2376
Query 2221 CTAGGCGGACTGAAGTGCTTGATGCTTCTGCAAGACTCATTCAGCGAAGACTGAGAACAT 2280
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377 CTAGGCGGGCTGAAGTCCTTGATGCTTCTGCAAGACTTATTCAGCGAAGACTGAGAACAT 2436
Query 2281 TTGTTACACATCAGAACTTCATCTCTGTGCGGGCTTCTGCAATTTCAATTCAGGCATATT 2340
|||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2437 TTGTAACGCATCAGAACTTCATCTCTGCACGGGCTTCTGCAATTTCAATTCAGGCATACT 2496
Query 2341 GTAGAGGATGCCTGTCTCGAAATGCTTATGCCACCAGAAGGAATGCTGCGGCAGCGGTCT 2400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2497 GTAGAGGATGCCTGTCTCGAAATGCTTATGCCACCAGAAGGAATGCGGCGGCAGCTGTCT 2556
Query 2401 TGGTCCAAAAGCATGTACGCAGGTGGCTGTCAAGATGTGCATTTGTAAAGCTTGTATCAG 2460
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2557 TGGTCCAAAAGCATGTGCGCAGGTGGCTGTCAAGATGTGCATTTGTAAAACTTGTATCAG 2616
Query 2461 CTGGCATTGTAATGCAGTCTTGCATCCGTGGTGACTCAACTCGTTTAAAGTTTTCACATC 2520
||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2617 CTGCCATTGTATTACAGTCTTGCATCCGTGCTGACTCAACTCGCTTAAAGTTTTCACATC 2676
Query 2521 AGAAAGAGCATCGAGCAGCTTCTCTAATTCAGGCTCATTGGAGAATCCATAAGTTTCGCT 2580
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2677 AGAAAGAGCATCGAGCTGCTTCTCTAATTCAGGCTCATTGGAGAATCCATAAGTTTCGCT 2736
Query 2581 CAGCATTCAGGCACCGTCAGTCATCTATTATTGCTATTCAGTGTCGTTGGCGACAGAAGC 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2737 CAGCATTCAGGCACCGTCAGTCATCTATTATTGCTATTCAGTGTCGTTGGCGACAGAAGC 2796
Query 2641 TTGCGAATAGAGAGTTCAGAAAACTTAAACAGGCTGCTAATGAAGCAGGTGCTTTGCGGT 2700
||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2797 TTGCGAAGAGAGAGTTTAGAAAACTTAAACAGGTTGCTAATGAAGCAGGTGCTTTGCGAT 2856
Query 2701 TAGCTAAAACGAAACTTGAAAAACGGTTAGAAGATCTTGAATGGCGGTTGCAGCTTGAGA 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2857 TAGCTAAAACGAAACTTGAAAAACGGTTAGAAGATCTTGAATGGCGGTTGCAGCTTGAGA 2916
Query 2761 AACGATTGAGAACAAGTGGTGAGGAGGCCAAGTCAAGTGAAATATCCAAGCTTCAGAAAA 2820
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2917 AACGATTGAGAACAAGTGGTGAAGAGGCCAAGTCAAGTGAAATATCCAAGCTTCAGAAAA 2976
Query 2821 CATTGGAATCCTTCAGCCTCAAACTAGACGCAGCTAGGCTGGCTACCATTAATGAGTGCA 2880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2977 CATTGGAATCCTTCAGCCTCAAACTAGACGCAGCTAGGCTGGCTACCATTAATGAGTGCA 3036
Query 2881 ATAAAAATGCGGTACTTGAAAAGCAACTAGACATATCCATGAAGGAGAAGTCTGCTGTTG 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3037 ATAAAAATGCGGTACTTGAAAAGCAACTAGACATATCCATGAAGGAGAAGTCTGCTGTTG 3096
Query 2941 AAAGAGAGCTTAATGGAATGGTTGAACTAAAAACAGATAACGCCTTGTTGAAGAATTCGA 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3097 AAAGAGAGCTTAATGGAATGGTTGAACTAAAAAAAGATAACGCCTTGCTGAAGAATTCGA 3156
Query 3001 TGAACTCCTTGGAAAAGAAGAATCTGGTTCTGGAGAAGGAGCTTCTCAATGCTAAAACCG 3060
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3157 TGAACTCCTTGGAAAAGAAGAATCGGGTTCTTGAGAAGGAGCTTCTCAATGCTAAAACCA 3216
Query 3061 ATTGCAATAACACACTACAGAAGTTGAAGGAAGCTGAAATAAGATGTTCTGAACTCCAGA 3120
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 3217 ATTGCAATAATACACTACAGAAGTTGAAGGAAGCTGAAAAAAGGTGTTCTGAACTCCAGA 3276
Query 3121 CGAGTATTCAAAGTCTTGAGGAGAAACTCTCTCATCTGGAAAACGAGAACCATGTCTTGA 3180
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3277 CGAGTGTTCAAAGTCTTGAGGAGAAACTCTCTCATCTGGAAAACGAGAACCAGGTCTTGA 3336
Query 3181 GGCAAAAGACGCTAATCACATCCCCAGAGAGAATAGGACAGGTACTTGGTGAAAAACACG 3240
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3337 TGCAAAAGACGCTAATTACATCCCCAGAGAGAATAGGACAGATACTTGGTGAAAAACACT 3396
Query 3241 CTAGTGCTGTTGTACCAGCCCAAAATGACAGGAGATCTGTATTTGAGACACCAACACCTT 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3397 CTAGTGCTGTTGTACCAGCCCAAAATGACAGGAGATCTGTATTTGAGACACCAACACCTT 3456
Query 3301 CAAAGCACATCATGCCATTTTCACATAGCCTGTCAGAGTCACGTAGATCCAAATTCACTG 3360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
Sbjct 3457 CAAAGCACATCATGCCATTTTCACATAGCCTGTCAGAGTCGCGTAGATCCAAATTAACCG 3516
Query 3361 CAGAAAGAAACCGGGAGAACTACGAATTGCTCTCCAGGTGTATAAAGGAAAATTTGGGAT 3420
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3517 CAGAAAGAAACCTGGAGAACTACGAATTGCTCTCCAGGTGTATAAAGGAAAATTTGGGAT 3576
Query 3421 TCAATGATGATAAGCCACTGGCTGCTTGTGTAATATACAAATGTCTTCTGCAGTGGCATG 3480
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 3577 TCAATGATGATAAGCCACTGGCTGCCTGTGTAATATACAAATGTCTTCTGCACTGGCGTG 3636
Query 3481 CCTTTGAATCTGAGAGCACAGCCATATTTAACATCATTATTGAGGGAATCAATGAAGCCC 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3637 CCTTTGAATCTGAGAGCACAGCCATATTTAACATCATTATTGAGGGAATCAATGAAGCCC 3696
Query 3541 TGAAGGGCGGAGATGAAAACGGTGTATTACCATATTGGCTCTCAAACGCTTCAGCACTTC 3600
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3697 TGAAGGGCGGAGATGAGAACGGTGTATTACCATATTGGCTCTCAAACGCTTCAGCACTTC 3756
Query 3601 TATGCCTCTTGCAGAGAAATCTGCGGTCAAATAGTTTTCTAAATGCTAGTGCTCAGCGTT 3660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3757 TATGCCTCTTGCAGAGAAATCTGCGGTCAAATAGTTTTCTAAATGCAAGTGCTCAGCGTT 3816
Query 3661 CTGGGAGGGCTGCATATGGAGTAAGGTCTCCTTTTAAACTTCATGGACCTGACGATGGTG 3720
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3817 CTGGGAGGGCTGCATATGGAGTAAAGTCTCCTTTTAAACTTCATGGACCTGATGATGGTG 3876
Query 3721 CTTCGCATATAGAAGCTAGATATCCAGCATTATTATTTAAACAGCAGCTGACAGCATGTG 3780
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3877 CTTCGCATATAGAAGCAAGATATCCAGCATTATTATTTAAACAGCAGCTGACAGCATGTG 3936
Query 3781 TGGAGAAGATTTATGGTTTAATTCGTGATAATTTGAAAAAGGAATTATCACCGCTTCTGG 3840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3937 TGGAGAAGATTTATGGTTTAATTCGTGATAATTTGAAAAAAGAATTATCACCGCTTCTGG 3996
Query 3841 GATCATGCATTCAGGCACCCAAAGCTTCACGAGGGATTGCTGGAAAATCTAGATCACCAG 3900
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 GATCATGCATTCAGGCACCGAAAGCTTCACGAGGGATTGCTGGAAAATCTAGATCACCAG 4056
Query 3901 GTGGTGTGCCGCAGCAATCACCGAGTAGTCAATGGGAAAGTATACTCAAATTCTTGGATT 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4057 GTGGTGTGCCGCAGCAATCACCGAGTAGTCAATGGGAAAGTATACTCAAATTCTTGGATT 4116
Query 3961 CTCTTATGTCCCGCCTACGCGAAAATCATGTACCCTCGTTCTTCATTCGCAAACTTGTGA 4020
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4117 CTCTCATGTCTCGCCTACGCGAAAATCATGTACCCTCGTTCTTCATTCGCAAACTTGTGA 4176
Query 4021 CTCAGGTTTTCTCATTTATCAACCTATCACTTTTCAACAGTCTGCTTCTTCGTCGTGAAT 4080
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4177 CTCAGGTTTTCTCATTCATCAACCTATCACTTTTCAACAGTCTTCTTCTTCGTCGTGAAT 4236
Query 4081 GTTGCACATTTTCAAATGGGGAATATGTGAAATCTGGGATTTCAGAATTGGAGAAGTGGA 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4237 GTTGCACATTTTCAAATGGGGAATATGTGAAATCTGGGATTTCAGAATTGGAGAAGTGGA 4296
Query 4141 TAGCCAATGCGACGGAGGAGTTTGCAGGAACATCTTGGCACGAGTTAAATTACATTAGAC 4200
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4297 TAGCTAATGCGAAGGAGGAGTTTGCAGGAACATCTTGGCACGAGTTAAATTACATAAGAC 4356
Query 4201 AAGCTGTTGGATTTTTGGTTATACACCAGAAAAGAAAGAAATCATTGGATGAAATCAGGC 4260
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4357 AAGCTGTTGGATTCTTGGTTATACACCAGAAAAAAAAGAAATCATTGGATGAAATCAGGC 4416
Query 4261 AGGATCTATGCCCGGTATTGACAATAAGGCAAATATATCGAATAAGTACGATGTACTGGG 4320
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4417 AGGATCTATGCCCAGTATTGACTATAAGGCAAATATATCGAATAAGTACGATGTACTGGG 4476
Query 4321 ATGATAAATATGGAACTCAAAGTGTCTCAAATGAGGTGGTTTCTCAAATGAGGGTACTTT 4380
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4477 ATGATAAATATGGAACTCAAAGTGTCTCAAGTGAGGTGGTTTCTCAAATGAGGGTACTTG 4536
Query 4381 TGGACAAGGATAACCAAAAACTAACATCAAATTCGTTCTTGCTGGATGATGATATGAGCA 4440
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4537 TGGACAAGGATAACCAAAAACAAACATCAAATTCGTTCTTGCTGGACGATGATATGAGCA 4596
Query 4441 TTCCTTTCTCCGCAGAAGATATAGACAAGGCTATTCCAGTATTAGACCCATCAGAAATAG 4500
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4597 TTCCTTTCTCTGCAGAAGATATAGACAAGGCTATTCCAGTATTAGACCCATCAGAAATAG 4656
Query 4501 AACCACCAAAATTCGTATCAGAATATACTTGTGCACAGTCCCTTGTGAAGAAACCTTCCA 4560
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4657 AACCTCCAAAATTCGTATCAGAATATACTTGTGCACAGTCCCTTGTGAAGAAACCCTCCA 4716
Query 4561 CAGCTTCAACCTCAAAGCAGATCATTTGAT 4590
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4717 TAGCTTCAACCTCAAAGCAGATCATTTGAT 4746
> AT1G04160.1 | Symbols: XIB, ATXIB, XI-8, XI-B | myosin XI B |
chr1:1086495-1096146 FORWARD LENGTH=4503
Length=4503
Score = 187 bits (101), Expect = 8e-46
Identities = 273/353 (77%), Gaps = 24/353 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 1255 TGTTTGACTGGCTGGTTGATAAGATCAATAAGTCTGTTGGGCAAGATCCAGAATC-TCGT 1313
||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||| |||||||| || || ||
Sbjct 1226 TGTTTGACTGGCTCGTTGAGAAGATTAATACTTCAATTGGTCAAGATCCTGATTCAAAGT 1285
Query 1314 -TTTCAAATAGGAGTCCTGGACATTTATGGCTTTGA-ATGTTTTAAGA-ATAACAGTTTT 1370
|| || || || ||||| || ||||| || || | |||| |||| | |||||||||
Sbjct 1286 ACTT--GATTGGTGTTCTGGATATATATGGATTCGAGA-GTTTCAAGACA-AACAGTTTT 1341
Query 1371 GAACAATTTTGCATCAACTTTG-CAAATGA-AAAGCTGCAGCAACA-TTTCAATGAGCAT 1427
|| |||||||||||||| |||| | ||||| ||| || ||||| || ||| ||| ||||
Sbjct 1342 GAGCAATTTTGCATCAA-TTTGACTAATGAGAAA-CTTCAGCAGCACTTT-AATCAGCAC 1398
Query 1428 GTATTCAAGATGGAGTAGGATGAGTACAGAAAAGAAGAAATTAATTGGAGTTATATCGAG 1487
|| || || |||||| | || ||||| | |||||| || || || ||||| ||||| |||
Sbjct 1399 GTCTTTAAAATGGAGCAAGAGGAGTATAAAAAAGAGGAGATCAACTGGAGCTATATTGAG 1458
Query 1488 TTTATTGACAACCAAGATGTCTTGGACCTT-ATTGAGAAGAAGCCTATTGG-GGTA--AT 1543
||| ||||||| |||||| | || || ||| || || ||||| || || |||| ||
Sbjct 1459 TTTGTTGACAATCAAGATATTTTAGA-CTTAATAGAAAAGAAACC---CGGAGGTATTAT 1514
Query 1544 TGCAC-TCTTGGATGAAGCTTGCATGTTTCCTAGATCAACTCATGAGTCATTT 1595
||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||
Sbjct 1515 TGCTCTTC-TAGATGAAGCTTGCATGTTTCCTAGATCAACACACGAGACATTT 1566
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 229915099769
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5