BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg944668 Length=5579 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G32820.2 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 4946 0.0 > AT4G32820.2 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr4:15831576-15841643 REVERSE LENGTH=5911 Length=5911 Score = 4946 bits (2678), Expect = 0.0 Identities = 3085/3274 (94%), Gaps = 57/3274 (2%) Strand=Plus/Plus Query 7 CAGCTTCGAGTATCAAGATGTTTTCAATTGCAGCGATCAATGATACAGAGACCACAGAGA 66 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct 173 CAGCTTCGAGTATCAAGATGTTTTCGATTGCAGCGATCAATGATACGGAGTCCACAGAGA 232 Query 67 AGTGGGAACCTTTAGCTCCTAGCAAAGAAGCTCAGGAGTTTCATCTGTCACAAACATATC 126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 233 AGTGGGAACCTTTAGCTCCTAGCAAAGAAGCTCAGGAGTTTCATCTGTCACAAACATATC 292 Query 127 ATGATGGTCTTCTCAAGCTGCAAGCTAAAGACTATGAAAAGGCTCGGGAGCTGCTAGAAT 186 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 293 ATGATGGTCTTCTCAAGCTGCAAGCTAAAGACTATGACAAGGCTCGGGAGCTGCTAGAAT 352 Query 187 CTATCCTTAAGGATCCTATTATAGCTAACTCCAAAGTGGAGACTATTGCAAACGACAATC 246 |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 353 CTATCCTTAAAGATCCTATTATAACCAACTCCAAAGTGGAGACTATTGCAAACGACAATC 412 Query 247 ATCTCCATCATCTCAGATTTTTGGCTCTGAAGAATCTTGCCACTGTATTTCTTGAGCTTG 306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 413 ATCTCCATCATCTCAGATTTTTGGCTCTGAAGAATCTTGCCACTGTCTTTCTTGAGCTTG 472 Query 307 GTTCAAGTCATTACGAGAGTGCTCTAAACTGTTATCTTCAAGCTATAGACTTAGACGCAA 366 |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 473 GTTCAAGTCACTACGAGAATGCTCTAAACTGTTATCTTCAAGCTATAGACTTAGATGCAA 532 Query 367 AAGATTCTGTCCTGTGGAACCATCTTGGAACCCTATCATGTTCTATGGGATTACTGAGTA 426 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 533 AAGATTCTGTGCTCTGGAACCATCTTGGAACCCTATCATGTTCTATGGGATTACTGAGTA 592 Query 427 TCTCACGATGGGCATTTGAACAGGGACTTCTCTGCAGCCCCAATAATTGGAACTGCATGG 486 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 593 TTTCACGATGGGCATTTGAACAGGGACTTCTCTGCAGCCCCAATAACTGGAACTGCATGG 652 Query 487 AGAAACTTCTAGAAGTTCTCATTGCTATAGGTGATGAAGTTTCCTGTCTCTCAGTTGCAA 546 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 653 AGAAACTTCTAGAAGTTCTCATTGCCGTAGGTGATGAAGTTTCCTGTCTTTCAGTTGCAA 712 Query 547 ATCTGATTTTAAGGCATTGGCCATCACATTCTCGTGCTTTGCATGTTAAACATTGTATTG 606 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 713 ATCTGATTTTAAGGCATTGGCCATCACATTCTCGTGCTTTGCATGTTAAACATTGTATTG 772 Query 607 AAGCA-ACAGATTCAGCTCCTTTTGCGCCCAAGGGTATAGATAAACTTGAACCTCAGCAC 665 ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 773 AAG-ACACAGATTCAGCTCCTTTTGCTCCCAAGGGTATAGATAAACTTGAACCTCAGCAC 831 Query 666 GTCCGGCTCAAATTTCTTGGCAAAAGAAAGGTGTCTGACATGAATCAGGACATGGATGCT 725 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 832 GTTCGGCTCAAATTTCTTGGCAAAAGAAAGGTGTCTGACATGAATCAGGACATGGATGCT 891 Query 726 GCCTCCAAGAAGTTGaa-aaaaaGAGTGCAAGTTAAACTTCCTGAAGCTTCATGGGTGGC 784 ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 892 ACCTCCAAGAAGTT-AAGAAAAAGAGTGCAATTTAAACTTCCTGAAGCTTCATGGGTGGC 950 Query 785 ACTGATAAATATTCTAATTGGGATAGTGCATCCTTCGCGTGAAACTGTGGGCATATCAGC 844 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 951 ACTGCTAAATATTCTAATTGGGATAGTGCATCCTTCGCGTGAAACTGTGGGCATATCAGC 1010 Query 845 TGATATACCAATAACCATTGAACTAGCCCTTAGTACTGAGGCTGTTATGCAAGGTCTGAA 904 ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 1011 TGATATACCGATAACCATTGAATTATCCCTTAGTACAGAGGCTGTTATGCAAGGTATGAA 1070 Query 905 AAAGAAGGATCATTGTGTGGATTCAGATTCAAGTAATGTGTCTGTTAAGGATTGTAACAT 964 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1071 AAAGAAGGATCATTGTGTGGATTCAGATTCAAGTAATGTGTCTGTTAAGGATTGCAACAT 1130 Query 965 CGAAAGAGAAAGTGGTGGTTCTGTAAAAGAAAAAGAGCCTGTGTTTTCTGAAGAACACCC 1024 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1131 CGAGAGAGAAAGTGGTGGTTCTGTAAAAGAAAAAGAGCCTGTGTTTTCTGAAGAACACCC 1190 Query 1025 CCAAGAGAGGCGGAGTACTCGTCTTGAACGGCTTCGGAACCAGAAACCTGAGAAGGAAGA 1084 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1191 CCAAGAGAGGCGGAGTACTCGTCTTGAACGGCTTCGGAACCAGAAACCTGAGAAGGAAGG 1250 Query 1085 GTTAGAATTTGATAATAGCAAGGATCCTAGCAGTGACATCCTTCAATATCTTGAAAAATT 1144 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1251 GTTAGAATTTGATAACAGTAAGGATCCTAGCAGTGACATCCTTCAATATCTTGAGAAATT 1310 Query 1145 TGTCCTTACGAGGGAATTCAACAGAGTTTCTGCTGGTTCTTTCTGCCTTGAGGAATCTGA 1204 |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 1311 TGTCCTTAAAAGGGGTTTTGACAGAGAGTCTGCTGGTTCTTTCTGCAATGAAGAATCTGA 1370 Query 1205 TCCAATTTCTGAACACGCTGTCGTTTCTAATTTTGTGAAGGAAAATTCAGAAAATTATGG 1264 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1371 TCCAATTTCTGAACACGCCGTCGTTTCTAATTTTGTGAAGGAAAATTTAGAAAATTATGG 1430 Query 1265 TGCGTATCATATGGGTCACTTGCTTCTAGAATATATTGCTAGTAAATGTGAACATATATT 1324 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 1431 TGCGTATCATATGGGTCACTTGCTTCTAGAATATATTGCTAATAAATGTGAACATGTATT 1490 Query 1325 GAGTCGTGATG-CTGCCTTGAAAATTTTGGAGTTAGAAAAGCTAACAAGACATTGGGGCC 1383 ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1491 GAGTCGTGA-GACTGCCTTGAAAATTTTGGAGTTAGAAAAGCTTACAAGACATTGGGGCC 1549 Query 1384 GAGATCGGAAACCTGAATGCAGTCTTTTTCTCGCCGAGCTGTACCATGACTTTGACTCTA 1443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1550 GAGATCGGAAACCTGAATGCAGTCTTTTTCTCGCCGAGCTGTACCATGACTTTGACTCTA 1609 Query 1444 AAGGTTCAGATATTCCTGATGACCGATCATGCATGGTTGAAATAACATACCATCTCTCTA 1503 || | |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct 1610 AACGATCAGATATCCCTGATGCCCCATCATGCATGGTAGAAGTAACATACCATCTCTCTA 1669 Query 1504 AGATAATTGAATCTGTCTCCCTTGATTATGCTATCGACTTTACGCCTAGTTCTTGGGGGG 1563 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| Sbjct 1670 AGATAATTGAATCTGTTTCCCTTGATTATGCTATCGACTCTACACCTAGTTCTCGAGGGA 1729 Query 1564 AAA-GATTTTCTGACTCCTCATT----------CAAGG--------CTGCTAAAGAGGTG 1604 ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| Sbjct 1730 AAATG-TTTTCTGACTCCTCATTTAAGAGTTTTCAAGGTGATGAGGCTGCTAAGGAGGTG 1788 Query 1605 TTAGATTATGAGAAAAGATCTTTCTGGGCTCAATATTTCTGGCTGAGTGCACGGTTATCA 1664 ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1789 TTAGATTATGATACAAGATCTTTCTGGGCTCGATATTTCTGGCTGAGTGCACGGTTATCA 1848 Query 1665 ATTTTGGAGGATAATAAAGCTAAAGCACTTGAAGAATTTCTTAGATGTTTGTCATTGTTG 1724 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| Sbjct 1849 ATTTTGGAGGATAATAAAGCTAAAGCACTTGAAGAATATCTCAGGTGTTTGTCATTGTTG 1908 Query 1725 GACAAGGAAGGTATCGGAGAAGCTCCTGTCTTAATTCAGCTACCTCATTGCAGAAGAATT 1784 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || Sbjct 1909 GGCAGGGAAGGTATCGGAGAAGCTCCTGTCTTAATTCAGCGACCTCATTGCAGAAGAGTT 1968 Query 1785 CGAGAGCTGAACATTAATAGAATCATTCATGAAATAAATCTGCTTAAGACTGATTTCTTG 1844 |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || Sbjct 1969 CGAGAGCTGACCATCAATAGAATCATTCATGAAATTAATCTGCTTAAGATTGATTTCCTG 2028 Query 1845 TTGGAAAATACCATACCTGAGATGATGGAGAAAGAATTTTATTCGGAGTGTGTAAATTTA 1904 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2029 TTGGAAAATAACATACCTGAGATGATGGAGAAAGAATTTTATTCGGAGTGTGTAAATTTA 2088 Query 1905 CTGGCACCTCTTTTATTTCCAAATAAAGACATGTTGCCTGCATACGCTGTAAAAACGGAA 1964 |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2089 CTGGCACCTCTTTTGTTTCCAGATAAAGACATCTTGCCTGCATACGCTGTAAAAACGGAA 2148 Query 1965 GAAGGGATCTCCTCTGTTGAGTTATCAGCACTTGACGTTTTAATAAAAGCCTGCCAGAAG 2024 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2149 GAAGGGATCTCCTCTGTTGAGTTATCGGCACTTGAGGTTTTAATAAAAGCATGCCAGAAG 2208 Query 2025 AGTAAGCCTATAGATGTGGAGGTTTATATGAACTGTCATAGAAGAAAGTTGCAAGTTCTC 2084 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2209 AGTAAGCCTATAGATGTAGAGGTTTATATGAACTGTCATAGAAGAAAGTTGCAAGTTCTC 2268 Query 2085 TTGGAATCAACTGGTACGGGAGAATCTGTTGTGACACCTAAAAAGC-CGTATAAAAATTC 2143 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| Sbjct 2269 TTAGATTCAACTGGTACGGGAGAATCTGTTGTGACACCTAAAAC-CTCGTCCAAAAATTC 2327 Query 2144 AAATGAGAGTTGGGATCACTTGGTGGCGGAGGAAGTCAAGGCAATTCTTCTCTGTATCTC 2203 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2328 AAGTGAGAGTTGGGATCACTTGGTGGCGGAGGAAGTCAAGGCAATTCTTCTCTGTATCTC 2387 Query 2204 TCAAGTGAAGAACTCCCTTGACCAGTCAGGAAACTCTAATGACATGGTTGCCCCAAAATA 2263 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | Sbjct 2388 TCAAGTGAAGAACTCCCTTGACCAGTCAGGAAACTCTGATGACATGGTTGCCCCAAGAGA 2447 Query 2264 TTGTGTAGCTGGTATACAAGCTCTGCTTTTGAGAGTTATGTCAAATATCATGAGGCATTT 2323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2448 TTGTGTAGCTGGTATACAAGCTCTGCTTTTGAGAGTTATGTCAAATATCGTGAGGCATTT 2507 Query 2324 TCTTTCTAAGAGATATTCAGATTCTCAAAATGCTGATGGGATTGAAGAAGAGAAGAAGTT 2383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2508 TTTTTCTAAGAGATATTCAGATTCTCAAAATGCTGATGGGATTGAAGAAGAGAAGAAGTC 2567 Query 2384 TTGCTTTCTCGATGCAGCTATTGGATTCTGTAAACTTCAACACCTTGATGCTACCATGTC 2443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || Sbjct 2568 TTGCTTTCTCGATGCAGCTATTGGATTCTGTAAACTTCAGCACCTTGATGCTACTATATC 2627 Query 2444 TACCAAATACCAAGTTGA----GTT--G--A-TCA-T-------AG--G-TC-T----C- 2477 ||| ||||||||| |||| ||| | | || | || | || | | Sbjct 2628 TACTAAATACCAATTTGACATAGTTAAGCGAGTCTGTTTGGTTGAGTTGATCATAAGACT 2687 Query 2478 C-ATGATTTGCTTGCTGAATATGGGCTCTGCTGTGCTGGTAAAAATTGTTCGGGGGAGGA 2536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2688 CCATGATTTGCTTGCTGAATATGGGCTCTGCTGTGCTGGTAAAAATTGTGCGGGGGAGGA 2747 Query 2537 AGGAGCTTTTCTTAGATTTGCGATTAAGCATTTATTGGCTGTGGACATGAAAGTCAAATC 2596 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2748 AGGAGCTTTTCTTAGATTTGCGATTAAGCATTTATTGGCAGTGGACATGAAAGTCAAATC 2807 Query 2597 CAGTATTAACTCCCCAGATGGTCTTGGACATGATATGGCACTGCCTGACAAATTATGCAG 2656 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2808 CAGTATTAACTCCCCAGATGGTCTTGGACATGATATGGGACTGCCTGACAAATTATGCAG 2867 Query 2657 AAATGAAATAAAATCATTTCTC-ACAGAGGTGCATATTAAGAATAACGAAACCAACAAAA 2715 ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||| |||||||| Sbjct 2868 AAATGAAGTAAAATCATTTCTCGA-AGAGGTGCATGTTGAGAAAAACGAAAACAACAAAA 2926 Query 2716 CTGATTCTAAGAAGGATGGTTCTGAAGAACAAGTTGGTTATAGGGAAAAAGAACAGTCAG 2775 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2927 CTGAGTCTAAGAAGGATGGTTCTGAAGAACAAGTTGGTTATAGGGAGAAAGAACAGTCAG 2986 Query 2776 AACAAGAAAGCAAACAGATTACAGAACACACAGAAGTGGTTGCGGAAGAAGAAAAAGATG 2835 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 2987 AACAACAAAGCAAACAGATTCCAGAACACACAGAAGAAGTTGCTGAAGAAGAAAAAGATG 3046 Query 2836 AACCTGAGTTGTTAATCAACAACGCTTTAGATCAATGttttttttGCCTTTATGGTCTAA 2895 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 3047 AACTTGAGTTGTTAATCAACAACGCTTTAGATCAATGCTTTTTTTGCCTGTATGGTCTAA 3106 Query 2896 ATCTTAGAGTCGATGGTTCCTACGAAGATGAGCTCGCTGTGCACAAAAACACTAGCCGGG 2955 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3107 ATCTGAGAGTCGATGGTTCCTACGAAGATGAGCTTGCTGTGCACAAAAACACTAGCCGCG 3166 Query 2956 GAGATTATCAGACCAAGGAACAATGTGTTGATGTCTTCCAGTACATACTACCCTATGCCA 3015 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3167 GAGATTATCAGACCAAGGAACAATGTGTTGATGTCTTCCAGTACATACTACCCTATGCCA 3226 Query 3016 AAGCTTCATCTAGAACTGGACTAGTTAAACTCCGAAGAGTCTTGAGAGCAATAAAAAAGC 3075 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3227 AAGCTTCATCTAGAACTGGACTAGTTAAACTCCGGAGAGTCTTGAGAGCAATAAAAAAGC 3286 Query 3076 ATTTTGCACAACCACCAGATGATCTCCTAATTGGCAATGTGATAGAGAAATTCTTAGATG 3135 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3287 ATTTTTCACAACCACCAGATGATCTCCTAATTGGCAATGTGATAGATAAATTCTTAGATG 3346 Query 3136 ACCCTGATTTATGTGAAGACAAACTCTCATATGAGGCTGGTTCTGAAGGTTTCCTTGAAA 3195 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3347 ACCCTGAATTATGTGAAGACAAACTCTCATATGAGGCTGGTTCTGAAGGTTTCCTTGAAA 3406 Query 3196 CCATAACTAAATGTCTAATTCCCAGCAAAACTCT 3229 | ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3407 CTATAACTAAATGTCTAATTCCCAGCAGAACTCT 3440 Score = 3275 bits (1773), Expect = 0.0 Identities = 2027/2148 (94%), Gaps = 23/2148 (1%) Strand=Plus/Plus Query 3232 CTCAGTCTGAAGAAGTTAGTGCTAGTGATAAATGGCCCGGCTTTGTTCTGACGAAGGAAG 3291 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 3518 CTCAATCCGAAGAAGTTAGTGCTAGTGATAAATGGCCCGGTTTTGTTCTGACAAAGGAAG 3577 Query 3292 GAGAAGAGTTTGTACAGCAGAATACAAATCTGTTCAAATATGATCTGATCTATAATCCTC 3351 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3578 GAGAAGAGTTTGAACAGCAGAATACAAATCTGTTCAAATATGATCTGCTCTATAATCCTC 3637 Query 3352 TGCGCTTTGAGAGTTGGGAAAAGCTTGGCAATATATACGACGAGGCAAGT-TCTTTCATT 3410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || Sbjct 3638 TCCGCTTTGAGAGTTGGGAAAAGCTTGGCAATATATACGACGAGG-AAGTAGATTT-GTT 3695 Query 3411 CATTCTTGTTGTTACTGTTTTTCTG-AAATTTTACCTTCAAATAGCAGATGGAGGAAAAA 3469 | || || | || | | | | | | || ||| |||||||||| || Sbjct 3696 -A--CTAAATG--A-TGGGAGTAAGCACA-TAAATGTT---GTAG--GATGGAGGAAGAA 3743 Query 3470 TTCCGCTCTTTCGCAAAGAGTTGAGACAAGCAGAAGAAGAAGCAGACGTTGCCTGCTAAT 3529 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3744 TTCCGCTCTTTCGCAAAGAGTTGAGACAAGTAGAAGAAGAAGCAGACGTTGCCTGCTAAT 3803 Query 3530 GAGTTTGGCATTGGCAAAATCACCAGATCAACAGTCTGAGATACATGAGTTTTTGGCGCT 3589 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3804 GAGTTTGGCATTGGCAAATTCACCAGATCAACAGTCTGAGATACATGAGCTTTTGGCGCT 3863 Query 3590 GGTATACTATGACAGTCTTCAGAGTGTTGTGCCGTTTTATGATCAGCGGTCTGTGCTACC 3649 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3864 GGTCTACTATGACAGCCTTCAGAGTGTTGTGCCGTTTTATGATCAGCGGTCTGTGCTTCC 3923 Query 3650 CTCCAAGGATGCAACATGGACAAGATTTTGTGAGAACTCAATGAAGCATTTCAACAAAGC 3709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3924 CTCCAAGGATGCAACATGGACAAGATTTTGTGAGAACTCAATGAAGCATTTCAACAAAGC 3983 Query 3710 CTTTGCACATCGACAAGATTGGTCACATGCATTCTACATGGGAAAAATCAGTGAGAAGCT 3769 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3984 CTTTTCACATCGACAAGATTGGTCACATGCATTCTACATGGGAAAACTCAGTGAGAAGCT 4043 Query 3770 TGGGCACTCATATGAAATTTCTTTATCCTATTATAAGCAAGCCATGACATTAAATCCGTC 3829 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4044 TGGGCACTCGTATGAAATTTCTTTATCCTATTATAAGCAAGCCATGACATTGAATCCGTC 4103 Query 3830 AGCCGTAGATCCTGTGTATAGAATGCATGCTTCTCGTTTGAAGCTGCTAAATGCATGTGG 3889 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4104 AGCCGTAGATCCTGTGTATAGAATGCATGCTTCTCGTTTGAAGCTGCTAAATGCATGCGG 4163 Query 3890 GAAACAGAACTTAGAAGCCTTAAAGGTCCTCGCCTCTTATTGCTTTGATGAATCTATAAA 3949 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4164 GAAACAAAACTTAGAAGCCTTAAAGGTCCTCGCTTCTTATTGCTTTGATGAATCTATAAA 4223 Query 3950 GGATACTGCTATGACAATCATTGGTACAACGACTTTTGGATCCTCTCGTACACTGGAAGA 4009 |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4224 GGATACGGCTATGACAATCATTGGCACAACGACTTTTGGATCCTCTCGTACACTGGAAGA 4283 Query 4010 AGCTCAAGATGGAAACTTGGAAGCATGTTATGCTAAAACTGGAGAGGGATCAATTCAGAT 4069 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 4284 AGCTCAAGATGGAAACTTGGAAGCATGTTATGCTAAATCTGGAGAGGGGTCAATTCAGAT 4343 Query 4070 GGAAGGGGTATGGCATATGCTCTACAACGACAGCCTTTCTGCACTGGGAATTTGTGTTGA 4129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct 4344 GGAAGGGGTATGGCATATGCTCTACAACGACAGCCTCTCTGCACTTGGAATTTGTGTAGA 4403 Query 4130 AGGAGATCTTAAACACTTTCATAAGGCGAGATACATGCTTGCCCAAGGACTGTACAGAAG 4189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 4404 AGGAGATCTTAAACACTTTCATAAGGCGAGATACATGCTTGCTCAAGGTCTGTACAGAAG 4463 Query 4190 GGGTGGGAGCAGTGATCTGCAAAGAGCAAAAGAAGAACTTTCTTTTTGTTTCAAATCATC 4249 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4464 GGGTGGGAGCAGTGATCTGCAAAGAGCAAAGGAAGAACTTTCCTTTTGTTTCAAATCATC 4523 Query 4250 CCGGTCAAGTTTTACGATCAATATGTGGGAGATTGATGGCATGGTTAAGAAGGGAAGGCG 4309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4524 ACGGTCAAGTTTTACGATCAATATGTGGGAGATTGATGGCATGGTTAAAAAGGGAAGGCG 4583 Query 4310 GAAAACTCCAGGTTTGGCGGGGAACAAGAAGGCTCTTGAAGTTAACCTGCCAGAAAGTTC 4369 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4584 AAAAACTCCAGGTTTGGCTGGGAACAAGAAGGCTCTTGAAGTTAACCTGCCAGAAAGTTC 4643 Query 4370 ACGGAAATTCATTACCTGCATTCGCAAATACTTACTGTTCTATCTGAGACTATTGGAGGA 4429 |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4644 ACGGAAATTCATAACTTGCATTCGCAAATACTTACTGTTCTATTTGAGACTATTGGAGGA 4703 Query 4430 AACTGGAGATGTCAACACACTAGAACGAGCCTTTAATTCTCTTCGATCAGATAAGAGGTT 4489 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4704 AACTGAAGATGTCAACACACTAGAACGAGCCTTTAATTCTCTTCGATCAGATAAGAGGTT 4763 Query 4490 CTCTCTATGCATTGAAGACCTTGTACCAATTGCAATAGGAAGATACATAAATGCACTGGT 4549 |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct 4764 CTCTCTATGCGTTGAAGACCTTGTACCAGTTGCAATAGGAAGATACGTAAAAGCACTGGT 4823 Query 4550 TTCCTCGATGAGCCGGGTTGAGTCTGCAGGAGCAAAT-ATCAACCCTGATAGTCAGCTAG 4608 |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 4824 TTCCTCGATGAGTCGGGTTGAGTCTGCAGGAGC-AATAATCAACCCTGATAGCCAGCTAG 4882 Query 4609 AGAAAATATTTTCCCTCTTTATAGAACAAGGAAGCATATGGCCGGACATATGCAATTTCC 4668 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 4883 AGAAAATATTTTCCCTCTTTATAGAACAAGGAAGCATATGGCCAGACATATGCAATTTTC 4942 Query 4669 CTGAAATAAGAGGTCCAGAAACCTCAGAAAGCAGCTTATACAGATATCTACATCAATACA 4728 |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4943 CTGAAACAAGAGGTCCAGAAACCTCAGAGAGCAGCTTATACAGATATCTACATCAATACA 5002 Query 4729 TCGTATCTCTTGAGCTAGACAACAAGGTTGAGACCCTGGAAACCATTAATGAAAAGATTC 4788 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5003 TCGTATCTCTTGAGCTAGACAACAAGGTTGAGACCCTGGAAACCATAAATGAAAAGATTC 5062 Query 4789 GAAAGCGTTTCAAGAATCCAAAGTTGTCTAATACTTTTTCGGCAAAAGTTGGCAGACATG 4848 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5063 GAAAGCGTTTCAAGAATCCAAAGTTGTCTAATAGTTTTTCGGCAAAAGTTGGCAGACATG 5122 Query 4849 CTTCTCTTGCTTGGTGCCGAGCTCTGATAATAAGCTTGGCA-TCGATAACCCCCTTGCAG 4907 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| Sbjct 5123 CTTCTCTTGCTTGGTGCCGAGCTCTGATTATAAGCTTGGCACT-GATAACTCCCTTGCAG 5181 Query 4908 CAAGCATCCTCAGAGGAAAGTCCAGCAGTAACTCCATCATTTGGTTTACTGGAAAAAAGA 4967 | || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 5182 CCAGTATCCTCGGAGGAAAGTCAAGCAATAACTCCATCATTTGGTTTACTGGAAAACAGA 5241 Query 4968 CGTGTGCTTTGTGTTGATCTACAGTCAGAATTCTGGAGTTCTTCGTTCGAGGATCCCTTA 5027 || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5242 CGGGTGCTTTGTGTTGATCTCCAGTCTGAATTCTGGAGTTCTTCGTTCGAGGATCCCTTA 5301 Query 5028 GAATCCCAAATGCTTGAGGCAAAATGGCTCCCTGTTCTGTCCAAGATCAAGAACGTACTG 5087 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 5302 GAATCCCAAATGCTTGAGGCAAAATGGCGCCCTGTTCTGTCCAAGATTAAGAACGTACTG 5361 Query 5088 ATTTTCAATAAAGTTTTGGAGGAGAATCTGGAGGTCGCTAATGCCCTACTTAAAAGTTGT 5147 ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct 5362 ATTTTTAATAAAGTTGTGGAGGGGAATTTGGAGATCGCTAATTCCCTACTTAAAAGCTGT 5421 Query 5148 TACAATTTCTTCCGAGAAACTGCCTCGGTGACACTCCCTTCTGATATCAACCTCTATTTC 5207 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5422 TACAATTTCTTCCGAGAAACTGCTTCGGTGACACTCCCTTCTGATATCAACCTCTATTTC 5481 Query 5208 GCACTGCCTCAACTAGCGCCAGCAGGAGAACTTC--C-AGGCAGTGAAGGAGTTGAAGTC 5264 |||||||| | ||| || ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| Sbjct 5482 GCACTGCCCCGACTCGCACCAGCTGGAGAACTTCTTCCAGGCAATGAAGGAGTTGAAGTC 5541 Query 5265 ATTGATGTAAGCATCCCAAGGAAGCTTCTTTTGTGGGCTTACACGTTGGTTCATGGACAT 5324 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5542 ATTGATGTAAGCATCCCAAGGAAGCTTCTTTTGTGGGCTTACACGTTGTTTCATGGACAT 5601 Query 5325 TGTGGAAGCATCTCTCAGGTCGTGAAATATATGGAAGAAAATACCAAG 5372 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5602 TGTGGAAGCATCTCTCAGGTCGTGAAATATATGGAAGAAAATACCAAG 5649 Score = 95.3 bits (51), Expect = 6e-18 Identities = 55/57 (96%), Gaps = 0/57 (0%) Strand=Plus/Plus Query 5406 AGCCAAAAATTAAGAGAGGAGCCTCAACTTCATCAGTGGTTCCTTTGGTTCAATCAG 5462 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5648 AGCCAAAAATGAAGAGAGGAGCCTCAACTTCATCAGTGGTTCCTTCGGTTCAATCAG 5704 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 278526867536 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5