BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg944668
Length=5579
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G32820.2 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 4946 0.0
> AT4G32820.2 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr4:15831576-15841643 REVERSE LENGTH=5911
Length=5911
Score = 4946 bits (2678), Expect = 0.0
Identities = 3085/3274 (94%), Gaps = 57/3274 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 CAGCTTCGAGTATCAAGATGTTTTCAATTGCAGCGATCAATGATACAGAGACCACAGAGA 66
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 173 CAGCTTCGAGTATCAAGATGTTTTCGATTGCAGCGATCAATGATACGGAGTCCACAGAGA 232
Query 67 AGTGGGAACCTTTAGCTCCTAGCAAAGAAGCTCAGGAGTTTCATCTGTCACAAACATATC 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233 AGTGGGAACCTTTAGCTCCTAGCAAAGAAGCTCAGGAGTTTCATCTGTCACAAACATATC 292
Query 127 ATGATGGTCTTCTCAAGCTGCAAGCTAAAGACTATGAAAAGGCTCGGGAGCTGCTAGAAT 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 ATGATGGTCTTCTCAAGCTGCAAGCTAAAGACTATGACAAGGCTCGGGAGCTGCTAGAAT 352
Query 187 CTATCCTTAAGGATCCTATTATAGCTAACTCCAAAGTGGAGACTATTGCAAACGACAATC 246
|||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 CTATCCTTAAAGATCCTATTATAACCAACTCCAAAGTGGAGACTATTGCAAACGACAATC 412
Query 247 ATCTCCATCATCTCAGATTTTTGGCTCTGAAGAATCTTGCCACTGTATTTCTTGAGCTTG 306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 413 ATCTCCATCATCTCAGATTTTTGGCTCTGAAGAATCTTGCCACTGTCTTTCTTGAGCTTG 472
Query 307 GTTCAAGTCATTACGAGAGTGCTCTAAACTGTTATCTTCAAGCTATAGACTTAGACGCAA 366
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 473 GTTCAAGTCACTACGAGAATGCTCTAAACTGTTATCTTCAAGCTATAGACTTAGATGCAA 532
Query 367 AAGATTCTGTCCTGTGGAACCATCTTGGAACCCTATCATGTTCTATGGGATTACTGAGTA 426
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 AAGATTCTGTGCTCTGGAACCATCTTGGAACCCTATCATGTTCTATGGGATTACTGAGTA 592
Query 427 TCTCACGATGGGCATTTGAACAGGGACTTCTCTGCAGCCCCAATAATTGGAACTGCATGG 486
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 593 TTTCACGATGGGCATTTGAACAGGGACTTCTCTGCAGCCCCAATAACTGGAACTGCATGG 652
Query 487 AGAAACTTCTAGAAGTTCTCATTGCTATAGGTGATGAAGTTTCCTGTCTCTCAGTTGCAA 546
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 653 AGAAACTTCTAGAAGTTCTCATTGCCGTAGGTGATGAAGTTTCCTGTCTTTCAGTTGCAA 712
Query 547 ATCTGATTTTAAGGCATTGGCCATCACATTCTCGTGCTTTGCATGTTAAACATTGTATTG 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 ATCTGATTTTAAGGCATTGGCCATCACATTCTCGTGCTTTGCATGTTAAACATTGTATTG 772
Query 607 AAGCA-ACAGATTCAGCTCCTTTTGCGCCCAAGGGTATAGATAAACTTGAACCTCAGCAC 665
||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 AAG-ACACAGATTCAGCTCCTTTTGCTCCCAAGGGTATAGATAAACTTGAACCTCAGCAC 831
Query 666 GTCCGGCTCAAATTTCTTGGCAAAAGAAAGGTGTCTGACATGAATCAGGACATGGATGCT 725
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 GTTCGGCTCAAATTTCTTGGCAAAAGAAAGGTGTCTGACATGAATCAGGACATGGATGCT 891
Query 726 GCCTCCAAGAAGTTGaa-aaaaaGAGTGCAAGTTAAACTTCCTGAAGCTTCATGGGTGGC 784
||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 ACCTCCAAGAAGTT-AAGAAAAAGAGTGCAATTTAAACTTCCTGAAGCTTCATGGGTGGC 950
Query 785 ACTGATAAATATTCTAATTGGGATAGTGCATCCTTCGCGTGAAACTGTGGGCATATCAGC 844
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 ACTGCTAAATATTCTAATTGGGATAGTGCATCCTTCGCGTGAAACTGTGGGCATATCAGC 1010
Query 845 TGATATACCAATAACCATTGAACTAGCCCTTAGTACTGAGGCTGTTATGCAAGGTCTGAA 904
||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1011 TGATATACCGATAACCATTGAATTATCCCTTAGTACAGAGGCTGTTATGCAAGGTATGAA 1070
Query 905 AAAGAAGGATCATTGTGTGGATTCAGATTCAAGTAATGTGTCTGTTAAGGATTGTAACAT 964
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1071 AAAGAAGGATCATTGTGTGGATTCAGATTCAAGTAATGTGTCTGTTAAGGATTGCAACAT 1130
Query 965 CGAAAGAGAAAGTGGTGGTTCTGTAAAAGAAAAAGAGCCTGTGTTTTCTGAAGAACACCC 1024
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 CGAGAGAGAAAGTGGTGGTTCTGTAAAAGAAAAAGAGCCTGTGTTTTCTGAAGAACACCC 1190
Query 1025 CCAAGAGAGGCGGAGTACTCGTCTTGAACGGCTTCGGAACCAGAAACCTGAGAAGGAAGA 1084
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 CCAAGAGAGGCGGAGTACTCGTCTTGAACGGCTTCGGAACCAGAAACCTGAGAAGGAAGG 1250
Query 1085 GTTAGAATTTGATAATAGCAAGGATCCTAGCAGTGACATCCTTCAATATCTTGAAAAATT 1144
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1251 GTTAGAATTTGATAACAGTAAGGATCCTAGCAGTGACATCCTTCAATATCTTGAGAAATT 1310
Query 1145 TGTCCTTACGAGGGAATTCAACAGAGTTTCTGCTGGTTCTTTCTGCCTTGAGGAATCTGA 1204
|||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1311 TGTCCTTAAAAGGGGTTTTGACAGAGAGTCTGCTGGTTCTTTCTGCAATGAAGAATCTGA 1370
Query 1205 TCCAATTTCTGAACACGCTGTCGTTTCTAATTTTGTGAAGGAAAATTCAGAAAATTATGG 1264
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1371 TCCAATTTCTGAACACGCCGTCGTTTCTAATTTTGTGAAGGAAAATTTAGAAAATTATGG 1430
Query 1265 TGCGTATCATATGGGTCACTTGCTTCTAGAATATATTGCTAGTAAATGTGAACATATATT 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 1431 TGCGTATCATATGGGTCACTTGCTTCTAGAATATATTGCTAATAAATGTGAACATGTATT 1490
Query 1325 GAGTCGTGATG-CTGCCTTGAAAATTTTGGAGTTAGAAAAGCTAACAAGACATTGGGGCC 1383
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1491 GAGTCGTGA-GACTGCCTTGAAAATTTTGGAGTTAGAAAAGCTTACAAGACATTGGGGCC 1549
Query 1384 GAGATCGGAAACCTGAATGCAGTCTTTTTCTCGCCGAGCTGTACCATGACTTTGACTCTA 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 GAGATCGGAAACCTGAATGCAGTCTTTTTCTCGCCGAGCTGTACCATGACTTTGACTCTA 1609
Query 1444 AAGGTTCAGATATTCCTGATGACCGATCATGCATGGTTGAAATAACATACCATCTCTCTA 1503
|| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1610 AACGATCAGATATCCCTGATGCCCCATCATGCATGGTAGAAGTAACATACCATCTCTCTA 1669
Query 1504 AGATAATTGAATCTGTCTCCCTTGATTATGCTATCGACTTTACGCCTAGTTCTTGGGGGG 1563
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||
Sbjct 1670 AGATAATTGAATCTGTTTCCCTTGATTATGCTATCGACTCTACACCTAGTTCTCGAGGGA 1729
Query 1564 AAA-GATTTTCTGACTCCTCATT----------CAAGG--------CTGCTAAAGAGGTG 1604
||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1730 AAATG-TTTTCTGACTCCTCATTTAAGAGTTTTCAAGGTGATGAGGCTGCTAAGGAGGTG 1788
Query 1605 TTAGATTATGAGAAAAGATCTTTCTGGGCTCAATATTTCTGGCTGAGTGCACGGTTATCA 1664
||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 TTAGATTATGATACAAGATCTTTCTGGGCTCGATATTTCTGGCTGAGTGCACGGTTATCA 1848
Query 1665 ATTTTGGAGGATAATAAAGCTAAAGCACTTGAAGAATTTCTTAGATGTTTGTCATTGTTG 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 1849 ATTTTGGAGGATAATAAAGCTAAAGCACTTGAAGAATATCTCAGGTGTTTGTCATTGTTG 1908
Query 1725 GACAAGGAAGGTATCGGAGAAGCTCCTGTCTTAATTCAGCTACCTCATTGCAGAAGAATT 1784
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 1909 GGCAGGGAAGGTATCGGAGAAGCTCCTGTCTTAATTCAGCGACCTCATTGCAGAAGAGTT 1968
Query 1785 CGAGAGCTGAACATTAATAGAATCATTCATGAAATAAATCTGCTTAAGACTGATTTCTTG 1844
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1969 CGAGAGCTGACCATCAATAGAATCATTCATGAAATTAATCTGCTTAAGATTGATTTCCTG 2028
Query 1845 TTGGAAAATACCATACCTGAGATGATGGAGAAAGAATTTTATTCGGAGTGTGTAAATTTA 1904
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 TTGGAAAATAACATACCTGAGATGATGGAGAAAGAATTTTATTCGGAGTGTGTAAATTTA 2088
Query 1905 CTGGCACCTCTTTTATTTCCAAATAAAGACATGTTGCCTGCATACGCTGTAAAAACGGAA 1964
|||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 CTGGCACCTCTTTTGTTTCCAGATAAAGACATCTTGCCTGCATACGCTGTAAAAACGGAA 2148
Query 1965 GAAGGGATCTCCTCTGTTGAGTTATCAGCACTTGACGTTTTAATAAAAGCCTGCCAGAAG 2024
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2149 GAAGGGATCTCCTCTGTTGAGTTATCGGCACTTGAGGTTTTAATAAAAGCATGCCAGAAG 2208
Query 2025 AGTAAGCCTATAGATGTGGAGGTTTATATGAACTGTCATAGAAGAAAGTTGCAAGTTCTC 2084
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 AGTAAGCCTATAGATGTAGAGGTTTATATGAACTGTCATAGAAGAAAGTTGCAAGTTCTC 2268
Query 2085 TTGGAATCAACTGGTACGGGAGAATCTGTTGTGACACCTAAAAAGC-CGTATAAAAATTC 2143
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 2269 TTAGATTCAACTGGTACGGGAGAATCTGTTGTGACACCTAAAAC-CTCGTCCAAAAATTC 2327
Query 2144 AAATGAGAGTTGGGATCACTTGGTGGCGGAGGAAGTCAAGGCAATTCTTCTCTGTATCTC 2203
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328 AAGTGAGAGTTGGGATCACTTGGTGGCGGAGGAAGTCAAGGCAATTCTTCTCTGTATCTC 2387
Query 2204 TCAAGTGAAGAACTCCCTTGACCAGTCAGGAAACTCTAATGACATGGTTGCCCCAAAATA 2263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
Sbjct 2388 TCAAGTGAAGAACTCCCTTGACCAGTCAGGAAACTCTGATGACATGGTTGCCCCAAGAGA 2447
Query 2264 TTGTGTAGCTGGTATACAAGCTCTGCTTTTGAGAGTTATGTCAAATATCATGAGGCATTT 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2448 TTGTGTAGCTGGTATACAAGCTCTGCTTTTGAGAGTTATGTCAAATATCGTGAGGCATTT 2507
Query 2324 TCTTTCTAAGAGATATTCAGATTCTCAAAATGCTGATGGGATTGAAGAAGAGAAGAAGTT 2383
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 TTTTTCTAAGAGATATTCAGATTCTCAAAATGCTGATGGGATTGAAGAAGAGAAGAAGTC 2567
Query 2384 TTGCTTTCTCGATGCAGCTATTGGATTCTGTAAACTTCAACACCTTGATGCTACCATGTC 2443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 2568 TTGCTTTCTCGATGCAGCTATTGGATTCTGTAAACTTCAGCACCTTGATGCTACTATATC 2627
Query 2444 TACCAAATACCAAGTTGA----GTT--G--A-TCA-T-------AG--G-TC-T----C- 2477
||| ||||||||| |||| ||| | | || | || | || | |
Sbjct 2628 TACTAAATACCAATTTGACATAGTTAAGCGAGTCTGTTTGGTTGAGTTGATCATAAGACT 2687
Query 2478 C-ATGATTTGCTTGCTGAATATGGGCTCTGCTGTGCTGGTAAAAATTGTTCGGGGGAGGA 2536
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2688 CCATGATTTGCTTGCTGAATATGGGCTCTGCTGTGCTGGTAAAAATTGTGCGGGGGAGGA 2747
Query 2537 AGGAGCTTTTCTTAGATTTGCGATTAAGCATTTATTGGCTGTGGACATGAAAGTCAAATC 2596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 AGGAGCTTTTCTTAGATTTGCGATTAAGCATTTATTGGCAGTGGACATGAAAGTCAAATC 2807
Query 2597 CAGTATTAACTCCCCAGATGGTCTTGGACATGATATGGCACTGCCTGACAAATTATGCAG 2656
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 CAGTATTAACTCCCCAGATGGTCTTGGACATGATATGGGACTGCCTGACAAATTATGCAG 2867
Query 2657 AAATGAAATAAAATCATTTCTC-ACAGAGGTGCATATTAAGAATAACGAAACCAACAAAA 2715
||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2868 AAATGAAGTAAAATCATTTCTCGA-AGAGGTGCATGTTGAGAAAAACGAAAACAACAAAA 2926
Query 2716 CTGATTCTAAGAAGGATGGTTCTGAAGAACAAGTTGGTTATAGGGAAAAAGAACAGTCAG 2775
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2927 CTGAGTCTAAGAAGGATGGTTCTGAAGAACAAGTTGGTTATAGGGAGAAAGAACAGTCAG 2986
Query 2776 AACAAGAAAGCAAACAGATTACAGAACACACAGAAGTGGTTGCGGAAGAAGAAAAAGATG 2835
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2987 AACAACAAAGCAAACAGATTCCAGAACACACAGAAGAAGTTGCTGAAGAAGAAAAAGATG 3046
Query 2836 AACCTGAGTTGTTAATCAACAACGCTTTAGATCAATGttttttttGCCTTTATGGTCTAA 2895
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3047 AACTTGAGTTGTTAATCAACAACGCTTTAGATCAATGCTTTTTTTGCCTGTATGGTCTAA 3106
Query 2896 ATCTTAGAGTCGATGGTTCCTACGAAGATGAGCTCGCTGTGCACAAAAACACTAGCCGGG 2955
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3107 ATCTGAGAGTCGATGGTTCCTACGAAGATGAGCTTGCTGTGCACAAAAACACTAGCCGCG 3166
Query 2956 GAGATTATCAGACCAAGGAACAATGTGTTGATGTCTTCCAGTACATACTACCCTATGCCA 3015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3167 GAGATTATCAGACCAAGGAACAATGTGTTGATGTCTTCCAGTACATACTACCCTATGCCA 3226
Query 3016 AAGCTTCATCTAGAACTGGACTAGTTAAACTCCGAAGAGTCTTGAGAGCAATAAAAAAGC 3075
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 AAGCTTCATCTAGAACTGGACTAGTTAAACTCCGGAGAGTCTTGAGAGCAATAAAAAAGC 3286
Query 3076 ATTTTGCACAACCACCAGATGATCTCCTAATTGGCAATGTGATAGAGAAATTCTTAGATG 3135
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3287 ATTTTTCACAACCACCAGATGATCTCCTAATTGGCAATGTGATAGATAAATTCTTAGATG 3346
Query 3136 ACCCTGATTTATGTGAAGACAAACTCTCATATGAGGCTGGTTCTGAAGGTTTCCTTGAAA 3195
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3347 ACCCTGAATTATGTGAAGACAAACTCTCATATGAGGCTGGTTCTGAAGGTTTCCTTGAAA 3406
Query 3196 CCATAACTAAATGTCTAATTCCCAGCAAAACTCT 3229
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3407 CTATAACTAAATGTCTAATTCCCAGCAGAACTCT 3440
Score = 3275 bits (1773), Expect = 0.0
Identities = 2027/2148 (94%), Gaps = 23/2148 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3232 CTCAGTCTGAAGAAGTTAGTGCTAGTGATAAATGGCCCGGCTTTGTTCTGACGAAGGAAG 3291
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 3518 CTCAATCCGAAGAAGTTAGTGCTAGTGATAAATGGCCCGGTTTTGTTCTGACAAAGGAAG 3577
Query 3292 GAGAAGAGTTTGTACAGCAGAATACAAATCTGTTCAAATATGATCTGATCTATAATCCTC 3351
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3578 GAGAAGAGTTTGAACAGCAGAATACAAATCTGTTCAAATATGATCTGCTCTATAATCCTC 3637
Query 3352 TGCGCTTTGAGAGTTGGGAAAAGCTTGGCAATATATACGACGAGGCAAGT-TCTTTCATT 3410
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||
Sbjct 3638 TCCGCTTTGAGAGTTGGGAAAAGCTTGGCAATATATACGACGAGG-AAGTAGATTT-GTT 3695
Query 3411 CATTCTTGTTGTTACTGTTTTTCTG-AAATTTTACCTTCAAATAGCAGATGGAGGAAAAA 3469
| || || | || | | | | | | || ||| |||||||||| ||
Sbjct 3696 -A--CTAAATG--A-TGGGAGTAAGCACA-TAAATGTT---GTAG--GATGGAGGAAGAA 3743
Query 3470 TTCCGCTCTTTCGCAAAGAGTTGAGACAAGCAGAAGAAGAAGCAGACGTTGCCTGCTAAT 3529
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3744 TTCCGCTCTTTCGCAAAGAGTTGAGACAAGTAGAAGAAGAAGCAGACGTTGCCTGCTAAT 3803
Query 3530 GAGTTTGGCATTGGCAAAATCACCAGATCAACAGTCTGAGATACATGAGTTTTTGGCGCT 3589
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3804 GAGTTTGGCATTGGCAAATTCACCAGATCAACAGTCTGAGATACATGAGCTTTTGGCGCT 3863
Query 3590 GGTATACTATGACAGTCTTCAGAGTGTTGTGCCGTTTTATGATCAGCGGTCTGTGCTACC 3649
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3864 GGTCTACTATGACAGCCTTCAGAGTGTTGTGCCGTTTTATGATCAGCGGTCTGTGCTTCC 3923
Query 3650 CTCCAAGGATGCAACATGGACAAGATTTTGTGAGAACTCAATGAAGCATTTCAACAAAGC 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3924 CTCCAAGGATGCAACATGGACAAGATTTTGTGAGAACTCAATGAAGCATTTCAACAAAGC 3983
Query 3710 CTTTGCACATCGACAAGATTGGTCACATGCATTCTACATGGGAAAAATCAGTGAGAAGCT 3769
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3984 CTTTTCACATCGACAAGATTGGTCACATGCATTCTACATGGGAAAACTCAGTGAGAAGCT 4043
Query 3770 TGGGCACTCATATGAAATTTCTTTATCCTATTATAAGCAAGCCATGACATTAAATCCGTC 3829
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4044 TGGGCACTCGTATGAAATTTCTTTATCCTATTATAAGCAAGCCATGACATTGAATCCGTC 4103
Query 3830 AGCCGTAGATCCTGTGTATAGAATGCATGCTTCTCGTTTGAAGCTGCTAAATGCATGTGG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4104 AGCCGTAGATCCTGTGTATAGAATGCATGCTTCTCGTTTGAAGCTGCTAAATGCATGCGG 4163
Query 3890 GAAACAGAACTTAGAAGCCTTAAAGGTCCTCGCCTCTTATTGCTTTGATGAATCTATAAA 3949
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4164 GAAACAAAACTTAGAAGCCTTAAAGGTCCTCGCTTCTTATTGCTTTGATGAATCTATAAA 4223
Query 3950 GGATACTGCTATGACAATCATTGGTACAACGACTTTTGGATCCTCTCGTACACTGGAAGA 4009
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4224 GGATACGGCTATGACAATCATTGGCACAACGACTTTTGGATCCTCTCGTACACTGGAAGA 4283
Query 4010 AGCTCAAGATGGAAACTTGGAAGCATGTTATGCTAAAACTGGAGAGGGATCAATTCAGAT 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 4284 AGCTCAAGATGGAAACTTGGAAGCATGTTATGCTAAATCTGGAGAGGGGTCAATTCAGAT 4343
Query 4070 GGAAGGGGTATGGCATATGCTCTACAACGACAGCCTTTCTGCACTGGGAATTTGTGTTGA 4129
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 4344 GGAAGGGGTATGGCATATGCTCTACAACGACAGCCTCTCTGCACTTGGAATTTGTGTAGA 4403
Query 4130 AGGAGATCTTAAACACTTTCATAAGGCGAGATACATGCTTGCCCAAGGACTGTACAGAAG 4189
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 4404 AGGAGATCTTAAACACTTTCATAAGGCGAGATACATGCTTGCTCAAGGTCTGTACAGAAG 4463
Query 4190 GGGTGGGAGCAGTGATCTGCAAAGAGCAAAAGAAGAACTTTCTTTTTGTTTCAAATCATC 4249
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4464 GGGTGGGAGCAGTGATCTGCAAAGAGCAAAGGAAGAACTTTCCTTTTGTTTCAAATCATC 4523
Query 4250 CCGGTCAAGTTTTACGATCAATATGTGGGAGATTGATGGCATGGTTAAGAAGGGAAGGCG 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4524 ACGGTCAAGTTTTACGATCAATATGTGGGAGATTGATGGCATGGTTAAAAAGGGAAGGCG 4583
Query 4310 GAAAACTCCAGGTTTGGCGGGGAACAAGAAGGCTCTTGAAGTTAACCTGCCAGAAAGTTC 4369
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4584 AAAAACTCCAGGTTTGGCTGGGAACAAGAAGGCTCTTGAAGTTAACCTGCCAGAAAGTTC 4643
Query 4370 ACGGAAATTCATTACCTGCATTCGCAAATACTTACTGTTCTATCTGAGACTATTGGAGGA 4429
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4644 ACGGAAATTCATAACTTGCATTCGCAAATACTTACTGTTCTATTTGAGACTATTGGAGGA 4703
Query 4430 AACTGGAGATGTCAACACACTAGAACGAGCCTTTAATTCTCTTCGATCAGATAAGAGGTT 4489
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4704 AACTGAAGATGTCAACACACTAGAACGAGCCTTTAATTCTCTTCGATCAGATAAGAGGTT 4763
Query 4490 CTCTCTATGCATTGAAGACCTTGTACCAATTGCAATAGGAAGATACATAAATGCACTGGT 4549
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 4764 CTCTCTATGCGTTGAAGACCTTGTACCAGTTGCAATAGGAAGATACGTAAAAGCACTGGT 4823
Query 4550 TTCCTCGATGAGCCGGGTTGAGTCTGCAGGAGCAAAT-ATCAACCCTGATAGTCAGCTAG 4608
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4824 TTCCTCGATGAGTCGGGTTGAGTCTGCAGGAGC-AATAATCAACCCTGATAGCCAGCTAG 4882
Query 4609 AGAAAATATTTTCCCTCTTTATAGAACAAGGAAGCATATGGCCGGACATATGCAATTTCC 4668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 4883 AGAAAATATTTTCCCTCTTTATAGAACAAGGAAGCATATGGCCAGACATATGCAATTTTC 4942
Query 4669 CTGAAATAAGAGGTCCAGAAACCTCAGAAAGCAGCTTATACAGATATCTACATCAATACA 4728
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4943 CTGAAACAAGAGGTCCAGAAACCTCAGAGAGCAGCTTATACAGATATCTACATCAATACA 5002
Query 4729 TCGTATCTCTTGAGCTAGACAACAAGGTTGAGACCCTGGAAACCATTAATGAAAAGATTC 4788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5003 TCGTATCTCTTGAGCTAGACAACAAGGTTGAGACCCTGGAAACCATAAATGAAAAGATTC 5062
Query 4789 GAAAGCGTTTCAAGAATCCAAAGTTGTCTAATACTTTTTCGGCAAAAGTTGGCAGACATG 4848
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5063 GAAAGCGTTTCAAGAATCCAAAGTTGTCTAATAGTTTTTCGGCAAAAGTTGGCAGACATG 5122
Query 4849 CTTCTCTTGCTTGGTGCCGAGCTCTGATAATAAGCTTGGCA-TCGATAACCCCCTTGCAG 4907
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 5123 CTTCTCTTGCTTGGTGCCGAGCTCTGATTATAAGCTTGGCACT-GATAACTCCCTTGCAG 5181
Query 4908 CAAGCATCCTCAGAGGAAAGTCCAGCAGTAACTCCATCATTTGGTTTACTGGAAAAAAGA 4967
| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5182 CCAGTATCCTCGGAGGAAAGTCAAGCAATAACTCCATCATTTGGTTTACTGGAAAACAGA 5241
Query 4968 CGTGTGCTTTGTGTTGATCTACAGTCAGAATTCTGGAGTTCTTCGTTCGAGGATCCCTTA 5027
|| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5242 CGGGTGCTTTGTGTTGATCTCCAGTCTGAATTCTGGAGTTCTTCGTTCGAGGATCCCTTA 5301
Query 5028 GAATCCCAAATGCTTGAGGCAAAATGGCTCCCTGTTCTGTCCAAGATCAAGAACGTACTG 5087
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5302 GAATCCCAAATGCTTGAGGCAAAATGGCGCCCTGTTCTGTCCAAGATTAAGAACGTACTG 5361
Query 5088 ATTTTCAATAAAGTTTTGGAGGAGAATCTGGAGGTCGCTAATGCCCTACTTAAAAGTTGT 5147
||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 5362 ATTTTTAATAAAGTTGTGGAGGGGAATTTGGAGATCGCTAATTCCCTACTTAAAAGCTGT 5421
Query 5148 TACAATTTCTTCCGAGAAACTGCCTCGGTGACACTCCCTTCTGATATCAACCTCTATTTC 5207
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5422 TACAATTTCTTCCGAGAAACTGCTTCGGTGACACTCCCTTCTGATATCAACCTCTATTTC 5481
Query 5208 GCACTGCCTCAACTAGCGCCAGCAGGAGAACTTC--C-AGGCAGTGAAGGAGTTGAAGTC 5264
|||||||| | ||| || ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5482 GCACTGCCCCGACTCGCACCAGCTGGAGAACTTCTTCCAGGCAATGAAGGAGTTGAAGTC 5541
Query 5265 ATTGATGTAAGCATCCCAAGGAAGCTTCTTTTGTGGGCTTACACGTTGGTTCATGGACAT 5324
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5542 ATTGATGTAAGCATCCCAAGGAAGCTTCTTTTGTGGGCTTACACGTTGTTTCATGGACAT 5601
Query 5325 TGTGGAAGCATCTCTCAGGTCGTGAAATATATGGAAGAAAATACCAAG 5372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5602 TGTGGAAGCATCTCTCAGGTCGTGAAATATATGGAAGAAAATACCAAG 5649
Score = 95.3 bits (51), Expect = 6e-18
Identities = 55/57 (96%), Gaps = 0/57 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5406 AGCCAAAAATTAAGAGAGGAGCCTCAACTTCATCAGTGGTTCCTTTGGTTCAATCAG 5462
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5648 AGCCAAAAATGAAGAGAGGAGCCTCAACTTCATCAGTGGTTCCTTCGGTTCAATCAG 5704
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 278526867536
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5