BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg944826
Length=4504
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G31570.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prefoldin... 7005 0.0
> AT4G31570.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prefoldin
(InterPro:IPR009053); BEST Arabidopsis thaliana protein match
is: unknown protein (TAIR:AT1G24460.1); Has 194354 Blast
hits to 66887 proteins in 3244 species: Archae - 3688; Bacteria
- 38556; Metazoa - 84828; Fungi - 17265; Plants - 10589;
Viruses - 805; Other Eukaryotes - 38623 (source: NCBI BLink).
| chr4:15297014-15306410 FORWARD LENGTH=8511
Length=8511
Score = 7005 bits (3793), Expect = 0.0
Identities = 4201/4395 (96%), Gaps = 40/4395 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGTTGAGT-AATCAAACGATATGGAGGAACTGACGCAGCGAAGCCTTAATTCCACTTCAC 60
||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3736 TGTCGAGTAAATCAAACGATATGGAGGAAATGACGCAGCGAAGCCTTGATTCCACTTCAC 3795
Query 61 TTCGAGAGTTAGTTGAGAAGATTGAGGGTGTTCTGGAACTTGAAAGTGGAGTGAGTTTTG 120
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3796 TTCGAGAGTTAGTTGAGAAGGTTGAGGGTCTTCTGGAACTTGAAAGTGGAGTGATTTTTG 3855
Query 121 AATCTCCTAGTTCACATGTGGAGTTTCTTGTTTCCCAACTTGTTCAGAAGTTTATAGAGA 180
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3856 AATCTCCTAGTTCACAGGTGGAGTTTCTCGTTTCCCAACTTGTTCAGAAGTTTATAGAGA 3915
Query 181 CTGAGGAATTAGCTAATCTCCTCAGAAAACAGTTAGAGGCCAAGGAGAATGAGTTGATGG 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3916 TTGAGGAATTAGCTAATCTCCTCAGAAAACAGTTAGAGGCCAAGGGGAATGAGTTGATGG 3975
Query 241 AGATTC-AGGAGAGTTTACTGCACCATAAAACTGAAATAGGTGGTCTCAGGGAAAATTTA 299
||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3976 AGA-TCGAGGAGAGTTTACTGCACCATAAGACTAAAATAGCTGGTCTCAGGGAAAGTTTA 4034
Query 300 ACCCAGGCAGAGGAGTCCCTTGTGGCTGTACGATCTGAGTTACAAGATAAATCTGATGAA 359
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4035 ACCCAGGCTGAGGAGTCCCTTGTGGCTGTACGATCTGAGTTACAAGATAAATCTAATGAA 4094
Query 360 CTTGAACAATCAGAGCAGAGGTTATTATCGACTCGAGAGAAGCTTAGCATAGCTGTTACT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4095 CTTGAACAATCAGAGCAGAGGTTATTATCGACTCGAGAGAAGCTTAGCATAGCTGTTACT 4154
Query 420 AAAGGAAAAGGTTTGATTGTTCAACGTGACAATGTCAAGCAAG-CGTTGGCCGAAACCTC 478
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 4155 AAAGGAAAAGGTTTGATTGTTCAGCGTGACAATGTCAAGC-AGTCGTTGGCCGAAGCCT- 4212
Query 479 CT-CTAAACTGCAGAAGTGCTCAGAAGAATTGAATTTGAAGGATGCAAGGCTTGTGGAAG 537
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||
Sbjct 4213 CTGCTAAACTGCAGAAGTGCTCAGAAGAATTGAATTCGAAGGACGCTAGGCTTGTAGAAG 4272
Query 538 TTGAAGAAAAACTTAAGACCTATATTGAGGCAGGTGAACGTGTGGAAGCATTAGAATCTG 597
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4273 TTGAAAAAAAACTGAAGACCTATATTGAGGCAGGTGAACGTGTGGAAGCATTAGAATCTG 4332
Query 598 AGCTTTCATACATCCGAAACTCAGCTACTGCACTGCGAGAATCTTTTCTTCTCAAAGACT 657
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 4333 AGCTGTCATACATCCGAAACTCAGCTACTGCATTGCGAGAATCGTTTCTTCTGAAAGACT 4392
Query 658 CTCTGCTTCACAGAATTGAAGAAATTTTGGAAGATTTGGATCTCCCAGAGCATTTTCATG 717
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4393 CTCTGCTTCATAGAATTGAAGAAATTTTGGAAGATTTGGATCTCCCAGAGCATTTTCATG 4452
Query 718 CTCGAGATATATTGGAAAAGGTGGAGTGGTTAGCAAGATCAGCTAACGGCAACTCTAT-G 776
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4453 CCCGAGATATATTGGAAAAGGTGGAGTGGTTAGCAAGATCAGCTAACGGCAACTCT-TCG 4511
Query 777 CGTCCCTCTGATTGGGATCAGAAGAGTTCTGATGGAGGTGCAGGATTTGTTCTATCAGAG 836
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 4512 CGCCCCTCTGGTTGGGATCAGAAGAGTTCTGATGGAGGTGCGGGATTTGTTCTCTCAGAG 4571
Query 837 CCGTGGAGGGAGGATGTACAAACTAACACAAGTTCTGAGGATGAATTAAGGATCAAGTTT 896
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 4572 CCCTGGAGGGAGGATGTACAAACTGGCACAAGTTCTGAGGATGACTTGAGGATCAAGTTT 4631
Query 897 GAGGAGCTCAAAGGGAAGTTTTATGGATTGGCTGAACAGAATGAAATGCTGGAGCAGTCC 956
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4632 GAGGAGCTCAAAGGAAAGTTTTATGGATTGGCTGAACAGAATGAAATGCTGGAGCAGTCC 4691
Query 957 TTGATGGAAAGGAATACCTTGGTTCAGAGATGGGAAAAAATCCTAGAAAATATTGATATA 1016
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 4692 TTGATGGAAAGGAATACTTTGGTTCAGAGATGGGAAAAACTCCTGGAAAATATTGATATC 4751
Query 1017 CCTCCACAGCTACAGTCCATGGAAGTGGAAAACAAGATTGAATGGCTTGCAAGTACAATT 1076
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4752 CCTCCACAGCTACACTCCATGGAAGTGGAAAACAAGATTGAATGGCTTGCAAGTACAATT 4811
Query 1077 ACAGAGGCTACACATGACAGGGATAATCTCCTACAGAAGATTGATAACCTTGAAGTCTAT 1136
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4812 ACAGAGGCTACACATGACCGGGATAATCTCCAACAGAAGATTGATAACCTTGAAGTCTAT 4871
Query 1137 TGTCAATCACTAACTGCTGATTTGGAAGTCTCACGAAAGCAAGTAAGTGATGTCGAGGCA 1196
||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 4872 TGTCAATCAGTAACTACTGATTTGGAAGTCTCACAAAAGCAAGTAGGTGATGTCGAGGGA 4931
Query 1197 AATCTACAATCGTGTGTTAGTGAGAGGGTGAATCTTTCTGAAAGACTGGAAAGTTTGATT 1256
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4932 AATCTTCAATCATGTGTTAGTGAGAGGGTGAATCTTTCTGAAAGGCTGGAAAGTTTGATT 4991
Query 1257 GGTGATCATGAAAGTCTTTCTGCAAGGGGCATTCACGTTGAAGTTGAGAATGAGAAACTG 1316
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4992 GGTGATCATGAGAGTCTTTCTGCAAGGGGCATTCACCTTGAAGTTGAGAATGAGAAACTG 5051
Query 1317 CAGAATCAAGTGAAAGATTTGCATGAAAAATTGGTTGAGAAACTTGGGAATGAAGAACAT 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5052 CAGAATCAAGTGAAAGATTTGCATGAAAAATTGGTTGAGAAACTTGGGAATGAAGAACAT 5111
Query 1377 CTTCAGACTATTGAAGGAGACTTATTAAGTTTGAGGTACATGATTAATGATGTTATACAG 1436
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5112 TTTCAGACTATTGAAGGAGACTTGTTAAGTTTGAGGTACATGATTGATGATGTTATACAG 5171
Query 1437 GAAGATGGCTTGCAGGATTTGGCTTTAGCAAGTAATTCTGAGAACTTGGATGGACTACTG 1496
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 5172 GAAGATGGCTTGCAAGATTTGGCTTTAGCAAGTAATTCTGAGAACTTGGATGGAGTGCTG 5231
Query 1497 AGAAAACTGATAGACTATTATAAGAATTTGGTGAAATCTAGTTTGCCACTTGAAACCAAT 1556
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 5232 AGAAAGCTGATAGACTATTATAAGAATTTGGTGAAATCTAGTTTGCCAGGTGAAACCGAT 5291
Query 1557 GACAACGTCTGTGAAACTCGCCCATCAGATGCTGATGTTAGAAGCGGAGAGCCATCT-GG 1615
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 5292 GACAACGTCTGTGAAACTCGTCCATCAGATGCTGATGTTAGAAGCGGAGAGTCAT-TGGG 5350
Query 1616 CGCACATGAAGCAACTTCTCATGGGCACCATTTTGAATTGTCTGATTCTAATATAGATGA 1675
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 5351 TGCACATGGAGCAACTTCTCATGGGCAACATTTTGAATTGTCTGATTCTAATGTAGTTGA 5410
Query 1676 AGCAACAAGTAGAGACATAGCAGTCGTAGAGACACCTGATGTAGCTTCCCTAACAAAAGA 1735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5411 AGCAACAAGTAGAGACATAGCAGTCGTAGAGACACCTGATGTAGCTTCCCTAACAAAAGA 5470
Query 1736 TCTGGATCAGGCACTGCATGTTCAAAAGCTGACAAGGGAAGAAAGAGATTTGTACATGGC 1795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5471 TCTGGATCAGGCACTGCATGTTCAAAAGCTGACAAGGGAAGAAAGAGATTTGTACATGGC 5530
Query 1796 AAAACAACAATCCTTGGTTGCTGAAAATGAGGCACTTGATAAGAAAATAATAGAACTGCA 1855
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5531 AAAACAACAATCCTTGGTTGCGGAAAATGAGGCACTTGATAAGAAAATAATAGAACTGCA 5590
Query 1856 GGAGTTTCTTAAACAAGAAGAGCAGAAGTCAGCTTCTGCAAGGGAGAAGTTAAATGTAGC 1915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5591 GGAGTTTCTTAAACAAGAAGAGCAGAAGTCAGCTTCTGTAAGGGAGAAGTTAAATGTAGC 5650
Query 1916 TGTTAGGAAAGGGAAAGCTTTGGTCCAGCAAAGGGATAGCCTGAAGCAAACTATTGAAGA 1975
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5651 TGTTAGGAAAGGGAAGGCTTTGGTCCAGCAAAGGGATAGCCTGAAGCAAACTATTGAAGA 5710
Query 1976 GATGAACGCTGAGCTTGGTCGCCTGAAATCGGAGATTATCAACAGAGATGAAAAGCTCTT 2035
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5711 GGTGAACGCTGAGCTTGGTCGCCTGAAATCAGAGATTATCAAAAGAGATGAAAAGCTCTT 5770
Query 2036 GGAAAATGAAA-GTAAATTTAGGGAGTTGGAATCTTATTCTGTGAGGGTAGAATCCCTAG 2094
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5771 GGAAAATGAAAAG-AAATTTAGGGAGTTGGAATCTTATTCTGTGAGGGTAGAATCCCTAG 5829
Query 2095 AGTCTGAGTGCCAATTGTTGAAAATCCATTCGCAAGAAACAGAATATCTTTTGCAGGAAA 2154
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5830 AGTCTGAGTGCCAATTGTTGAAAATTCATTCGCAAGAAACAGAATATCTTTTACAGGAAA 5889
Query 2155 GAAGTGGTACATT-GAGCATGACGTTGAATGCTTTAAATAGCATTGATATTGGTGTTGAA 2213
||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5890 GAAGTGGTA-ATTTGAGCATGACGTTGAATGCGTTAAATAGCATTGATATTGGTGATGAA 5948
Query 2214 GGTGACATGAATGACCCAGTCATGAAGCTTCAACGGATCTCACAACTGTTTCAAACTATG 2273
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 5949 GGTGACATAAATGATCCAGTCATGAAGCTTCAACGAATCTCCCAACTGTTTCAAACAATG 6008
Query 2274 GGTACAGCTGTGTCTTCTGCTGAGCAGGAGTCGAGAAAATCTAGAAGAGCAGCTGAGTTG 2333
||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6009 AGTACAACCGTGACTTCTGCTGAGCAGGAGTCGAGAAAATCTAGAAGAGCAGCTGAGTTG 6068
Query 2334 CTACTTGCTGAGTTGAACGAAGTTCAGGAGAGAAACGATAGTCTGCAAGAGGATCTATCA 2393
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6069 CTACTTGCTGAGTTGAACGAAGTTCAGGAGACAAACGATAGTCTGCAAGAGGATCTATCA 6128
Query 2394 AAATTTACATATGAAATCCAGCAACTTTCCAGAGAGAAGGATGCAGCGGAGGCTGCAAAA 2453
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6129 AAATTTACATATGAAATCCAGCAACTTTCCAGAGAGAAGGATGCAGCGGAGGCTGCAAAG 6188
Query 2454 GTTGAAGCCATATCTCGTTTTGAAAATTTATCAGCAGTCAGCAACGAAGAAAAGAATAAG 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6189 GTTGAAGCCATATCTCGTTTTGAAAATTTATCAGCAGTCAGCAACGAAGAAAAGAATAAG 6248
Query 2514 CTATATGCTCAACTGCTGTTATGTCGAACCAGTGTGAACTCTCTAAGGAAAATACTCGCA 2573
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6249 CTATATGCTCAACTGCTATCATGTGGAACCAGTGTGAACTCTCTAAGGAAAATACTCGCA 6308
Query 2574 GGTACCAACAGTTGCCTAGCTGATATATTCACCATGGATATGGAGTTTCTGCATCATCTG 2633
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6309 GGTACCAACAGTTGCCTAGCTGATATTTTCATCATGGATATGGAGTTTCTGCATCATCTG 6368
Query 2634 AAGACAAATATGGAATCATATGCGAAGCAAACTGGTACTAATTTGTCTGGCTTGCCTCAA 2693
||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6369 AAGGCAAATATGGAATTATGTGCGAAGAAAACTGGAACTGATTTGTCTGGCTTGCCTCAA 6428
Query 2694 CTCAGTACAG-GtttttttGTAGACAAGGATTTCTTTGCACGCTTGAGTGCTGCGTGGTC 2752
|||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6429 CTCAGTACAGAGAATCTG-GTAGACAAGGAAATCTTTGCACGCTTGAGTGCTGCTTGGTC 6487
Query 2753 TAACATTAACTTGCATGAGACATCAAGTGGTGGAAACATAACCGAAATTTGTGGTTCTCT 2812
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6488 TAACATTAACTTGCATGAGACATCAAGTGGTGGAAACATAGCCGAAATTTGTGGTTCTCT 6547
Query 2813 CTCCCAAAACCTTGATCAATTTGTGGCTGGTGTTAGCCATCTCGAAGAGAATGTAAGCAA 2872
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6548 CTCCCAAAACCTTGATCAATTTGTGGTTGGTGTTAGCCATCTCGAAGAGAAAGTAAGCAA 6607
Query 2873 GCACTTGGCCACATGGCACGACCAGGTCAATATTGTATCCAACAGTATCGACACCTTTTT 2932
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6608 GCACTTGGCCACATGGCACGACCAGATCAATATTGTATCCAACAGTATCGACACCTTTTT 6667
Query 2933 CAAGTCAATTGGAACAGGAACGGACTCTGAAATTGCCGCTCTTGGTGAAAGAATTGCCTT 2992
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6668 CAAGTCAATTGGAACAGGAACGGACTCTGAAGTTGCCGCTCTTGGTGAAAGAATTGCCTT 6727
Query 2993 GCTTCATGGAGCATGTTCTAGCGTGTTGGTGGAAATCGAAAGGCGTAAAGCTGAACTTGT 3052
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6728 GCTTCATGGAGCATGTTCTAGCGTGTTGGTGGAAATTGAAAGGCGTAAAGCTGAACTTGT 6787
Query 3053 TGGAAATGACGATTTTAATATGAGTCTCCACCAAGTAGATGAGGATTTTTCGTCCATGGA 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 6788 TGGAAATGACGATTTTAATATGAGTCTCCACCAAGTAGATGAGGACTTTTCGTCTATGGA 6847
Query 3113 ATCTGTCAGGTCCATGGTAAATAGGCTATCGTCAGCTATTAAGGAGCTTGTTGTTGCGAA 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 6848 ATCTGTCAGGTCCATGGTAAATAGGCTATCGTCAGCTGTTAAGGAGCTTGTTGTAGCGAA 6907
Query 3173 CGCTGAGACTGTAGAGAGAAATGAAAAGGAGATGAAGGTAATCATCGCCAATTTGCAAAG 3232
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6908 CGCTGAGACTCTGGAGAGAAATGAAAAGGAGATGAAGGTAATCATCGCCAATTTGCAAAG 6967
Query 3233 GGAGTTACACGAAAAGGACATCCAGAATGATAGGATGTGCAATGAACTTGTGGGTCAAGT 3292
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6968 GGAGTTACACGAAAAGGACATCCAAAATAATAGGACGTGCAATGAACTTGTGGGTCAAGT 7027
Query 3293 TAAGGAAGCCCAGGCTGGTGCTAAAATCTTTGCGGAAGATCTTCAATCTGCAAGTGCCCG 3352
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7028 TAAGGAAGCCCAGGCTGGTGCAAAAATCTTTGCGGAAGATCTTCAATCTGCAAGTGCCCG 7087
Query 3353 AATGCGTGATATGCAAGACCAGCTGGGTATTATGGTGCGGGAACGGGATTCTATGAAGGA 3412
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 7088 GATGCGTGATATGCAAGACCAGCTGGGTATTTTGGTTCGGGAACGGGATTCTATGAAGGA 7147
Query 3413 GAGAGTAAAAGAGCTGCTAGCAGGGCAGGCGTCACACTCAGAATTACAGGAGAAGGTCAC 3472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7148 GAGAGTAAAAGAGCTGCTAGCAGGGCAGGCGTCACACTCAGAATTACAGGAGAAGGTCAC 7207
Query 3473 ATCTCTTAGTGATCTACTAGCTGCGAAAGACTTAGAAATTGAGGCCTTAATGCAAGCGCT 3532
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7208 ATCTCTTAGTGATCTACTAGCTGCGAAAGACCTAGAAATTGAGGCCTTAATGCAAGCGCT 7267
Query 3533 TGACGAGGAAGAGTCTCAGATGGAGGATCTGAAACTCAGAGTTACAGAATTAGAACAGGA 3592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7268 TGACGAGGAAGAGTCTCAGATGGAGGATCTGAAACTCAGAGTTACAGAATTAGAACAGGA 7327
Query 3593 AGTGCAACAGAAGAACCTAGACTTGCAGAGAGCTGAAGCTTCTCGTGGGAAGATTTCCAA 3652
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7328 AGTGCAACAGAAGAACCTAGACTTGCAGAAAGCTGAAGCTTCTCGTGGGAAGATTTCCAA 7387
Query 3653 AAAGCTATCAATTACTGTCGATAAATTCGATGAGCTCCATCATCTCTCTGAAAATCTTCT 3712
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 7388 AAAGCTATCAATTACTGTGGATAAATTCGATGAGCTCCATCACCTCTCTGAAAATCTTCT 7447
Query 3713 CT-CTGAAATAGAGAAACTTCAACAGCAAGTGCAAGATCGGGATACAGAGGTTTCTTTCT 3771
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7448 -TGCTGAAATCGAGAAACTTCAACAGCAAGTGCAAGATCGGGATACAGAGGTTTCTTTCT 7506
Query 3772 TAAGACAAGAAGTCACTAGGTGCACCAATGAGGCTCTTGCTGCTTCTCAGATGGGCACTA 3831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7507 TAAGACAAGAAGTCACTAGGTGCACCAATGAGGCTCTTGCTGCTTCTCAGATGGGCACTA 7566
Query 3832 AGAGAGATTCAGAAGAGATGGAAACTGTACTGTCTCTG-TTCGACACGATAGCTTCACTA 3890
||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 7567 AGAGAGATTCAGAAGAGATCCAAACTGTACTGTCT-TGGTTCGACACGATAGCTTCACTA 7625
Query 3891 CTTGGTATAGAAGATTCGCCT-TCCACTGATTCTCACAGTCATATAAACCACTACATGGA 3949
||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7626 CTTGGTATAGAAGATTCGC-TGTCCACTGATGCTGACAGTCATATAAACCACTACATGGA 7684
Query 3950 GACATTTGAGAAAAGGATAGCGTCTATGCTATCTGAAATAGACGAATTACGGTTGGTTGG 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7685 GACATTTGAGAAAAGGATAGCGTCTATGCTATCTGAAATAGACGAATTACGGTTGGTTGG 7744
Query 4010 ACAAAGCAAGGACGAGTTGCTTGAAG-CTGAGAGGAGTAGAGTGGCAGAGCTCAGACAGA 4068
|||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 7745 ACAAAGCAAGGACGTTTTGCTTGAAGGC-GAGAGGAGTAGAGTGGCTGAGCTCAGACAGA 7803
Query 4069 AAGAAGCAACTCTTGAGAAATTCTTACTAGAGAAAGAATCCCAACCAA-ATATGTCAACA 4127
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||
Sbjct 7804 AAGAAGCAACTCTTGAGAAATTCTTACTTGAGAAAGAATCCCAAC-AAGACATTTCAACA 7862
Query 4128 AGCTCAACGTCAGAGATCGTTGAAGTGGAACCTCTGATAAACAAGTGGACGAAAACATCA 4187
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 7863 AGCTCGACGTCAGAGATCGTTGAAGTGGAACCTCTGATAAACAAGTGGACAAAAACATCG 7922
Query 4188 ATCCCATCTCAAGTCCGGAGTTTGCGTAAGGGAAATATGGATCAAGTCGCCATTAGTATA 4247
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7923 ATTCCATCACAAGTCCGGAGTTTGCGTAAGGGAAATATGGATCAAGTCGCCATTAGTATA 7982
Query 4248 GATGCAGATCAAACTGATCAAAGCGGTAGCTTAGAAGAAGATGATGATAAAGCTCATGGT 4307
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 7983 GATGCAGATCAAACTGATCAAAGCGGTAGCTTAGAAGAAGATGATGATAAAG---AT--- 8036
Query 4308 TTCAGATCACTCTCTACGTCAAGAATCATCCCTAGATTCACAAGACCCCTCACTAACATG 4367
|| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 8037 --CA---C--TCTCTACGTCAAGAATCATTCCTAGATTCACAAGACCCATCACTAACATG 8089
Query 4368 GTCGATGGTTTATGG 4382
|||||||||||||||
Sbjct 8090 GTCGATGGTTTATGG 8104
Score = 193 bits (104), Expect = 2e-47
Identities = 112/116 (97%), Gaps = 0/116 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4382 GGTCTCTTGTGATCGGACGCTCATGAGACAACCTGCCTTACGGTTAGGGATAATGATTTA 4441
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 8138 GGTCTCTTGTGATCGGACGCTCATGAGACAACCTGCTTTACGGTTAGGGATCATGCTATA 8197
Query 4442 CTGGGCGATATTGCATGCTCTTTTGGCTGCTTTCGTGGTCTAACCAAACTTCCAAT 4497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8198 CTGGGCGATATTGCATGCTCTTTTGGCTGCTTTCGTGGTCTAACCAAACTTCCAAT 8253
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 224597403811
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5