BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg947845 Length=2289 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G39710.1 | Symbols: EMB2745 | Tetratricopeptide repeat (TPR)... 3518 0.0 > AT5G39710.1 | Symbols: EMB2745 | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr5:15895729-15897972 FORWARD LENGTH=2244 Length=2244 Score = 3518 bits (1905), Expect = 0.0 Identities = 2136/2249 (95%), Gaps = 10/2249 (0%) Strand=Plus/Plus Query 25 ATGTTTCTCTCTAAAACCCTAATTCGACGATCTCTCTCAACCTTCACTTCTTCTCCTTCA 84 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1 ATGTTTCTCACTAAAACCCTAATTCGACGATCTCTCTCAACCTTCGCTTCTTCTCCTTCA 60 Query 85 GATTCACTTCTCGCCGATAAAGCTTTAACCTTTCTCAAACGTCATCCATATCAACTTCAT 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 61 GATTCACTTCTCGCCGATAAAGCTTTAACCTTTCTCAAACGCCATCCATACCAACTTCAT 120 Query 145 CATCTCTCTGCAAATTTCACTCCAGAAGCAGCTTCAAATCTCCTTCTCAAATCTCAAAAC 204 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 121 CATCTCTCTGCAAATTTCACACCAGAAGCAGCTTCAAATCTCCTCCTCAAATCTCAAAAC 180 Query 205 AATCAAGAACTAATCCTCAAGTTCCTAACTTGGGCAAACCCACATCAATTCTTCACTCTC 264 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GATCAAGCACTAATCCTCAAGTTCCTAAATTGGGCAAACCCACATCAATTCTTCACTCTC 240 Query 265 CGTTGCAAATGCATCACTCTTCACATCCTCA-CAAGATTCAAACTCTACAAAACAGCTCA 323 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CGTTGCAAATGCATCACTCTTCACATCCTCACCAA-ATTCAAACTCTACAAAACAGCTCA 299 Query 324 AACCCTCGCCGAAGATGTCGCAGCCAAAACCCTAGACGACGAAGACGCTTCTCTCGTCTT 383 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 300 AATCCTCGCCGAAGATGTCGCAGCCAAAACCCTAGACGACGAATACGCTTCTCTCGTCTT 359 Query 384 CCGTTCGT-TACAAGAGACTTACGATTTGTGTAATTCAACTTCCTCTGTTTTCGATTTGG 442 | || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 360 CAAATC-TCTACAAGAGACTTACGATTTGTGTTATTCAACTTCCTCTGTTTTCGATTTAG 418 Query 443 TAGTGAAATCTTACTCTCGTTTGTGTTTGATTGATAAGGCTTTGAGTATTGTTCATTTAT 502 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 419 TAGTGAAATCTTACTCTCGTTTGAGTTTGATTGATAAGGCTTTAAGCATTGTTCATTTAG 478 Query 503 CTCAAGCTCATGGCTTTATGCCTGGAGTTTTGTCGTACAATGCGGTGTTAGATGCTACGA 562 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 CTCAAGCTCATGGCTTTATGCCTGGAGTTTTGTCTTACAATGCGGTGTTAGATGCTACGA 538 Query 563 TTAGATCTAAGAGGAACATTAGTTTTGCTGAGAATGTGTTTAAAGAAATGTTGCAAAGCC 622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| Sbjct 539 TTAGATCTAAGAGGAACATTAGTTTTGCTGAGAATGTGTTCAAAGAAATGTTGGAGAGCC 598 Query 623 AAGTTTCTCCTAATGTGTTTACTTACAATATCTTGATTAGAGGGTTTTG-TTTAGCTGGG 681 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 599 AAGTTTCTCCTAATGTGTTTACTTACAATATCTTGATTAGAGGGTTTTGCTTT-GCTGGG 657 Query 682 AATTTAGATGTTGCTTT-GCGGTTTTTCGATCGAATGGAGAAGAAAGGTTGTTTACCTAA 740 ||| ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 658 AATATAGATGTTGCTTTAAC-GTTATTCGATAAAATGGAGACGAAAGGTTGTTTACCAAA 716 Query 741 TGTTGTTACTTACAATACTTTGATTCATGGGTTTTGTAAGTTGCGTAAGATTGATGATGG 800 ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 TGTTGTTACTTACAACACTTTGATTGATGGGTATTGTAAGTTGCGTAAGATTGATGATGG 776 Query 801 GTTTGAGCTTTTGAGATCAATGGCGTTAAAAGGTTTGGAGCCGAATTTGATTTCGTATAA 860 |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 777 GTTTAAGCTTTTGAGATCAATGGCGTTAAAGGGTTTGGAGCCTAATTTGATTTCGTATAA 836 Query 861 TGTCGTTATTAACGGGTTATGTAGAGAAGGGAGGATGAAGGAGATAAGTTTTGTGCTTAC 920 ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct 837 TGTTGTTATCAACGGGTTATGTAGAGAAGGGAGGATGAAGGAGGTAAGTTTTGTTCTTAC 896 Query 921 GGAGATGAATAAGAGAGGGTATTCGCTTGATGAAGTTACGTATAATACGCTTATTAAAGG 980 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 897 GGAGATGAATAGGAGAGGGTATTCGCTTGATGAAGTTACTTATAATACTCTTATTAAAGG 956 Query 981 TTATTGTAAAGAAGGTAATTTTCATCAAGCTCTTGTGATGCATGCGGAGATGCTGAGACA 1040 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct 957 TTATTGTAAAGAAGGTAATTTTCATCAAGCTCTTGTGATGCATGCTGAGATGTTGAGACA 1016 Query 1041 TGGGTTGTCACCTAGTGTTATTACTTATACTTCGTTGATACATAGTATGTGTAAGGCTGG 1100 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 TGGGTTGACACCTAGTGTTATTACTTATACTTCGTTGATACATAGTATGTGTAAGGCTGG 1076 Query 1101 GAATATGAACCGGGCTACT-GAGTTTCTTGATCAGATGCGGGTTAGAGGGCTTTGTCCGA 1159 |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 GAATATGAACAGGGCTA-TGGAGTTTCTTGATCAGATGCGGGTTAGAGGGCTTTGTCCGA 1135 Query 1160 ATGAGCGTACATACACGACGTTGGTTGATGGGTTTTCTCAAAAGGGGTATATGAATGAAG 1219 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1136 ATGAGCGTACTTACACGACGTTGGTTGATGGGTTTTCTCAAAAGGGGTATATGAATGAAG 1195 Query 1220 CCTATCGGGTTTTGAAAGAGATGATTGATAACGGGTTTTCTCCTTCGGTTGTGACTTATA 1279 | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1196 CTTATCGGGTTTTGAGAGAGATGAATGATAACGGGTTTTCTCCTTCGGTTGTGACTTATA 1255 Query 1280 ATGCTTTAATTAATGGTCATTGTATCGCTGGGAAAATGGAAGATGCGAGAGCAGTTCTCG 1339 ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1256 ATGCTTTGATTAATGGTCATTGTGTTACTGGGAAAATGGAAGATGCGATAGCAGTTCTCG 1315 Query 1340 AAGATATGAAGGAGAAAGGTTTGACTCCGGATGTAGTGAGTTACAGCACGGTATTATCTG 1399 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 1316 AAGATATGAAGGAGAAAGGTTTGAGTCCGGATGTAGTGAGTTATAGCACGGTATTATCCG 1375 Query 1400 GGTTTTGTAGAAGTTATGATGTTGATGAGGCGCTTAGAGTCAAAAGGAAAATGGTTGCAA 1459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || Sbjct 1376 GCTTTTGTAGAAGTTATGATGTTGATGAGGCGCTTAGAGTCAAGAGGGAAATGGTTGAAA 1435 Query 1460 AAGGTATTAAACCTGATACAATCACCTACTCATCACTAATCCAAGGGTTTTGTGAGCAGA 1519 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 1436 AAGGTATCAAACCTGATACAATCACCTACTCATCTCTGATCCAAGGGTTTTGTGAACAGA 1495 Query 1520 GAAGGACAAAGGAAGCTTGTGATCTTTTCGATGAAATGCTGAGAGTTGGCCTTCCACCAG 1579 ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1496 GAAGGACTAAGGAAGCGTGTGATCTTTACGAAGAAATGCTGAGAGTTGGTCTTCCACCAG 1555 Query 1580 ATGAATTTACTTACACAGCCTTGATCAATGCTTATTGTATGGAAGGCGATCTGCAAAAAG 1639 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 1556 ATGAGTTTACTTACACAGCCTTGATCAATGCTTATTGTATGGAAGGCGATTTGGAAAAAG 1615 Query 1640 CGCTCCAGTTGCACAACGAAATGGTCGAGAAAGGCGTATTGCCTGATGTCGTCACTTACA 1699 | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1616 CTCTACAGTTGCACAATGAAATGGTCGAGAAAGGAGTATTGCCTGATGTTGTCACTTACA 1675 Query 1700 GTGTCCTGATCAACGGGCTTAACAAACAAGCTCGAACAAGAGAAGCAAAAAGACTTTTGC 1759 | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1676 GCGTGCTGATCAACGGGCTTAACAAACAATCTCGAACAAGAGAGGCAAAAAGACTTTTGC 1735 Query 1760 TCAAGCTGTTCTACGAAGAATCAGTCCCTAGCGACGTCACATATCATACACTCATAGAAA 1819 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1736 TCAAGCTGTTCTACGAAGAATCAGTCCCTAGCGATGTCACATATCACACACTCATAGAAA 1795 Query 1820 ACTGCAGTAACATCGAGTTCAAAAGCGTGGTATCTCTTATTAAAGGATTCTGTATGAAAG 1879 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1796 ACTGCAGTAACATCGAGTTCAAAAGCGTAGTATCTCTTATTAAAGGATTCTGTATGAAAG 1855 Query 1880 GCATGATGACTGAAGCTGATCAAGTTTTCGAATCCATGCTTGAGAAAAACCATAAACCCG 1939 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1856 GAATGATGACTGAAGCTGATCAAGTTTTCGAATCCATGCTTGGGAAAAACCATAAACCCG 1915 Query 1940 ATGGAACAGCATACAACATTATGATCCATGGTCATTGCAGAGGAGGAGATATCCGCAAAG 1999 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1916 ATGGAACAGCATACAACATTATGATTCATGGTCATTGCAGAGCCGGAGATATCCGCAAAG 1975 Query 2000 CATATAGTCTATACAAAGAGATGGTAAAATCCGGATTTCTTCTCCATACTGTGACAGTGA 2059 | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1976 CGTATACTCTATACAAAGAGATGGTAAAATCCGGATTCCTTCTCCATACTGTGACAGTGA 2035 Query 2060 TTGCTCTGGTTAAAGCATTGCACAAGGAAGGGAAGGTTAATGAATTAAATAGTGTGATTG 2119 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2036 TTGCTCTGGTTAAAGCCTTGCACAAGGAAGGGAAAGTTAATGAATTGAATAGTGTGATTG 2095 Query 2120 AGAATGTATTAAGAAGCTGTGAATTGAGCGAAGCAGAGCAAGCCAAAGTGCTTGTGGAGA 2179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2096 TGCATGTATTAAGAAGCTGTGAATTGAGCGAAGCAGAGCAAGCCAAAGTGCTTGTGGAGA 2155 Query 2180 TCAATCATAGAGAAGGGAATATGGATGTGGTTCTTGATGTCCTTGCTGAAATGGCCAAAG 2239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2156 TCAATCATAGAGAAGGGAATATGGATGTGGTTCTTGATGTGCTTGCTGAAATGGCCAAAG 2215 Query 2240 ATGGATTTCTTCCCAACGGCAAAAGTTAA 2268 ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2216 ATGGATTTCTTCCCAACGGCATAAGTTAA 2244 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 113603833335 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5