BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg948632
Length=3796
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G33390.1 | Symbols: ATFAS4, FAS4 | RNA helicase family prote... 5773 0.0
> AT1G33390.1 | Symbols: ATFAS4, FAS4 | RNA helicase family protein
| chr1:12099482-12104601 REVERSE LENGTH=4066
Length=4066
Score = 5773 bits (3126), Expect = 0.0
Identities = 3586/3798 (94%), Gaps = 71/3798 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 9 ATTTGTACAATTATGGCGAGTCTGATGGGAGATGATTGCAATTTAGATATAATGCCGCCT 68
||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 85 ATTGGTACGATTATGGCAAGTGTGGTGGGAGATGATTGCAATTTAGATGTAATGCCTCCT 144
Query 69 A-G--GAAGAAGAATAAGGGATCCAAT---A---AGGATAAGCTGAATTCAAATAAGAAG 119
| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 145 AGGAAGAAGAAGAATAAAGGATCCAATAAGATGCAGGATAAGCTGAATTCAAATAATAAC 204
Query 120 ACGGTTTC-AAGCAGATGTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAA--TAAGGACACCGTAGTG 176
|||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |
Sbjct 205 ACGGGATCGAAG-AAATCTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAATGTAA--ACACGGTAGCG 261
Query 177 AGCAAATCTCAGAAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCATC 236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 262 TGCAAATCTCAGAAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCCTC 321
Query 237 TTTGCAAAAACTGCCGAGTTGTTAGACAAGTACAAAATTTCTGAGGATGTATCATCGCTA 296
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 322 TTTTCAAAAACTGCCGAGTTGTTAGACAAGTACAAAATATCTGAGGATGTATCGTCGCTA 381
Query 297 TTACAATCTTCAAAAGTTATAGGAAGATCAGCAACTAAGCTGGAAAAACGAAGGAGAGCA 356
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 382 TTACAATCATCAAAAGTTATAGGAAGATCAGCTACTAAGCTGGAAAAAAGAAGGAGAGCA 441
Query 357 ATGCAACTTTCTAAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGATGAATCAGTCGAGCAAAAT 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 ATGCAACTTTCTAAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGATGAATCAGTCGAGCAAAAT 501
Query 417 GACGATGATGATTCTTGTATGGACGAACCTACAGCACCAGATATGGACGAACCTACAACA 476
||| | |||| || || | | | | | |||||| ||||||||||||
Sbjct 502 GAC-A--ATGA----TG-AT----G-A--T-----TCTTG-TATGGATGAACCTACAACA 540
Query 477 CCGGAACATGTTGAAATCGAAATC-CCAACTTTTGCAACTGATTCTGAGCAACAGATTCA 535
||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| || | |
Sbjct 541 CCGGAACATGTTGAAATTGAAA-CTCCAACTTTTGTAACTGATTCTGAGCAGCA-A--C- 595
Query 536 TGCCCATGAACTCGGTTCTGATCTAGTGATTTCTGCTGAAGAAACTAGTAGCAAGCTTGT 595
|| | || | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 596 TG-----G--TTC-ATGCTGATCTAATGATTTCTGCTGAAGAAAGTAGTAGCAAGCTTGA 647
Query 596 GGTAGACGACACTGTGGATATGATCCTACAGACAACTTGTCGTGATGATGAAGAAGGCTC 655
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 648 GGTAGACGACACTGTGGATATGATCCCACTGACAACTTGTCGTGATGATGATGAAGACT- 706
Query 656 ACAAAGAATGGATGGGAC-CATTGAGAATGAAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGC 714
| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 -C----AATGGATGGG-CTCATTGAGAATGAAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGC 760
Query 715 CTGCGTTTGTAGTTCATGTTTCAAGACCAGCCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTC 774
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 CCGCGTTTGTAGTTCATGTTTCAAGACCAGCCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTC 820
Query 775 CGATAGTAATGATGGAGCAGGAGATAATGGAAGCTATTAATCGTCACCCTGCGGTTATTA 834
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 821 CAATAGTAATGATGGAGCAGGAGATAATGGAAGCTATTAATCGTCACCCTGCAGTTATTA 880
Query 835 TTTCAGGACAAACCGGGTGTGGTAAAACCACTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTG 894
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TTTCAGGACAAACTGGGTGTGGTAAAACCACTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTG 940
Query 895 GTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAAGTGGGATTATCGGGATTACCCAACCACGCC 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 GTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAAGTGGGATTATCGGGATTACCCAACCACGCC 1000
Query 955 GTGTCGCCGTCCTTGCCACTGCCAAGAGAGTGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTA 1014
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GTGTCGCCGTTCTTGCCACTGCCAAGAGAGTGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTA 1060
Query 1015 AAGAAGTCGGGTTTCAAGTTAGGTATGACAAAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGT 1074
|||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 AAGAGGTTGGGTTTCAAGTTAGGTACGACAAAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGT 1120
Query 1075 TTTTGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGATACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACT 1134
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121 TTATGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGATACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACT 1180
Query 1135 CTGTAATAATTCTCGATGAAGCCCATGAAAGAAGTTTGAACACAGACATTCTAATTGGGA 1194
|||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 CTGTGATTATTCTCGATGAAGCCCATGAAAGAAGCTTGAACACAGACATTCTAATTGGGA 1240
Query 1195 TGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGGAATACTACGAGGAACAACAAAAGAGTCTTC 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 TGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGGAATACTACGAGGAACAACAAAAGAGTCTTC 1300
Query 1255 AATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATACCAAATCACGCCACTTAAGCTTATATTGATGA 1314
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1301 AATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATGCCAAATCACGCCACTTAAACTTATATTGATGA 1360
Query 1315 GTGCGACTTTGCGAGTGAAAGATTTTGTATCAGGGAAAAGGTTATTCCCTAAGATACCTC 1374
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1361 GTGCGACTTTGCGAGTGGAAGATTTTGTATCGGGGAAAAGGTTATTCCCTAATATACCTC 1420
Query 1375 CGCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATCCAGTAACTATTCATTTCTCC-AGAAAGACT 1433
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||
Sbjct 1421 CTCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATCCAGTAACTATACATTTCTCCAAG-AAGACT 1479
Query 1434 GAGATTGTTGATTATATCGGTCAAGCTTATAAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGTTA 1493
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 GAGATTGTTGATTATATAGGTGAAGCTTATAAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGTTA 1539
Query 1494 CCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACTGGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAG 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540 CCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACTGGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAG 1599
Query 1554 AAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTTGTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTG 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600 AAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTTGTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTG 1659
Query 1614 AAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGTGGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 AAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGTGGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCA 1719
Query 1674 TTTGATGATGGCTCCGACAATCAAAATTACAGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCT 1733
|||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1720 TTTGATGATGACTCCAACAATCAAAATTCCAGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCT 1779
Query 1734 GAAATTGGTGATGGTAACTATGATGATGATTTTGAAGAAGAAGACATGTACGAGTCTGAT 1793
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1780 GATATTGGTGATGGTAACTATGATGATGATTTTGAAGAGGAAGACATGTATGAGTCTGAT 1839
Query 1794 GAAGACAGGGACTGGGAAACCGTTGATGACGGCTTCACAAGTTCATTTGTAGAGGAAGGG 1853
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 GAAGACAGGGACTGGGAAACTGTTGATGACGGCTTTGCAAGTTCATTTGTAGAGGAAGGG 1899
Query 1854 AAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAATGGTTTGGCAGACAAAAATGGATCCGTATCT 1913
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1900 AAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAATGCTTTGGCAGACAAAAATGGATCCGTATCT 1959
Query 1914 GCTGAGCCAACAAAGACCATTGCAGCAGAGAATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACACA 1973
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1960 GCTGAGCCGGCAAAGTCCATTGCAGCAGAGAATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACA-A 2018
Query 1974 -TTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCCACTTTATGCGATGCTATCTCCAGCTGCACA 2032
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2019 GTTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCCACTTTATGCTATGCTATCTCCAGCTGCACA 2078
Query 2033 GCTCCGAGTGTTTGAGGAATTTGAGAAAGAAGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGT 2092
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 GCTTCGAGTGTTTGAGGAAGTTGAGAAAGAAGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGT 2138
Query 2093 AGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCCGGTATAAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAA 2152
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139 AGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCTGGTATAAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAA 2198
Query 2153 AGTGAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTATGGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGCCA 2212
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199 AGTAAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTATGGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGCCA 2258
Query 2213 AGCTTCGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGCTGGACGAACCGGACCTGGTCACTGTTATCG 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2259 AGCTTCGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGCTGGACGAACTGGACCTGGTCACTGTTATCG 2318
Query 2273 TCTCTATTCATCTGCGGTTTTTAGCAATATATTTGAGGAATCTTCGCCTCCTGAAATCAC 2332
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2319 TCTCTATTCATCTGCAGTTTTTAGCAATATATTTGAGGAATCTTCGCTTCCTGAAATCAT 2378
Query 2333 AAAAGTTCCTGTTGATGGAGTTGTTCTTATCATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGA 2392
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2379 GAAAGTTCCTGTTGATGGAGTCATTCTTCTCATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGA 2438
Query 2393 GAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGAGCCATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACAATGCTT 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 2439 GAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGAGCCATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACGATGCCT 2498
Query 2453 AAAAGCTTTAGAGGCTCTTGACAGCAACGGACGGTTAACACCATTAGGAAAGGCTATGTC 2512
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2499 AAAAGCTTTAGAGGCTCTAGACAGCAACGGAGGGTTAACACCATTAGGAAAGGCTATGTC 2558
Query 2513 TCACTATCCCATGAGTCCACGTCACTCAAGAATGCTTCTCACAGTCATCCAAATGCTAAA 2572
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2559 TCACTATCCTATGAGTCCACGTCACTCAAGAATGCTTCTAACAGTCATCCAAATGCTAAA 2618
Query 2573 AGAGACCCGGAATTACTCACGCGTGAATCTCGTCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGC 2632
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2619 AGAGACCCGGAATTACTCACGCGCGAATCTCATCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGC 2678
Query 2633 CGCATTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAATGGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAATGAATC 2692
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2679 CGCGTTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAATGGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAACGAGTC 2738
Query 2693 CAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAGCAAGAAGATAAACAACGGAGAAAGGATCGGAAAGA 2752
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2739 CAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAACAAGAAGATAAACAACGGAAAAAGGATCGGAAAGA 2798
Query 2753 GAAAATCAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTCCAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACCGTAGC 2812
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2799 GAAGATTAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTCCAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACTGTAGC 2858
Query 2813 TTATGCATTGCATTCCTTTGAGGTCTCAGAGAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAACGG 2872
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2859 TTACGCATTGCATTCCTTTGAGGTCTCGGAGAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAATGG 2918
Query 2873 TTTGCATTTAAAGACCATGGACGAGATGTCTAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGAGACTTGT 2932
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2919 GTTGCATTTGAAGACCATGGACGAGATGTCTAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGCGACTTGT 2978
Query 2933 TTTCAGCTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGACGACGG-TTTCTCATGGACTCATGGGACTA 2991
||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2979 TTTCAACTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGAAGACAGCTTT-TCATGGACTCATGGGACTA 3037
Query 2992 TACAAGACATAGAGAAGTCATGGAGAATCACCACATTGTCTTCCTCAAAATATCC-TCTT 3050
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||
Sbjct 3038 TACAAGACGTAGAGAAGTCATGGAGAATCACCACATCGACTTCCTCAAAA-ACCCCTCTT 3096
Query 3051 CTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAAGCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTA 3110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3097 CTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAAGCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTA 3156
Query 3111 GCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAAGCTTGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTG 3170
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3157 GCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAAGCATGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTG 3216
Query 3171 CACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACACAGCTCCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTA 3230
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3217 CACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACTCAGCTCCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTA 3276
Query 3231 CTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCGACTCGAGTGAAGCCGGAATGGCTGGTGAAG 3290
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 3277 CTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCGACTCGGGTGAGGCCAGAATGGCTGGTGAAG 3336
Query 3291 CACGCAAAGTCTCTCTGCGTGTTCTCTGCACCACTCAAGGACCCGAAACCATATTACTCG 3350
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3337 CACGCAAAGTCTCTCTGCGTGTTCTCTGCACCGCTCAAGGACCCGAAACCATATTACTCA 3396
Query 3351 AGTGAGGAGGATAGAGCTTTGTGTTGGGTCGTCCCGAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAG 3410
|||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3397 AGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGGTCGTTCCGAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAA 3456
Query 3411 CTGCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATAGAGACCGAGCAGCGGCTTTCGGATGT 3470
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3457 CTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATAGAGACCGAGCAGCGGCTTTCGGATGC 3516
Query 3471 GCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTACCTTGTTTGAAAAGCGTT-AGGACGTTGTTGGCTGG 3529
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||
Sbjct 3517 GCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTAACTTGTTTGAAAAGC-TTCAGGGCTTTGTTGGCTGG 3575
Query 3530 GAAACCTGAAACGTTGTTGGAAAGAGAAGCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGAGTTTGGT 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3576 GAAACCTGAAACGTTGTTGGAAAGAGAAGCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGAGTTTGGT 3635
Query 3590 GATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGATAGTTTAGAGAGTTTGAGAAAGAGTTGGGAACA 3649
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3636 GATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGATACTTTGGAGAGTTTGAGAAAGAATTGGGAACA 3695
Query 3650 GAATCCGAAGGTGCTTTATTCAGAGATTGAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCG 3709
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3696 GAATCCGAATGTGCTTTATTCAGAGATTGAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCG 3755
Query 3710 TGTCAAAGACCTTTGGCAGACAATGCTAAAGGAGGCTCACGTTCAAAGAAGTCAGAGGAG 3769
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 3756 TGTCAAAGACCTTTGGCAGACAATGCTAAAGGAAGCTCACGTTCGAAGAAGTTAGAGGAG 3815
Query 3770 AAGATAAGTGTCTTTAAA 3787
| ||||||| ||||||
Sbjct 3816 A---TAAGTGTGTTTAAA 3830
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189079208167
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5