BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg949543 Length=2191 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G50210.1 | Symbols: QS, OLD5, SUFE3 | quinolinate synthase |... 3437 0.0 > AT5G50210.1 | Symbols: QS, OLD5, SUFE3 | quinolinate synthase | chr5:20442647-20445991 FORWARD LENGTH=2598 Length=2598 Score = 3437 bits (1861), Expect = 0.0 Identities = 2098/2211 (95%), Gaps = 22/2211 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTCAACCTTTAGT---TACTTCCAATGGCGTTAGCTTTCTCCGTCGCACCTTCATCATCG 57 |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || Sbjct 133 TTCAACCTTTTGTAACTGCTTCCAATGGCGTTAGCTCTCTCCGTCGCACCTACATCTTCT 192 Query 58 TCTTCT-TCTTCCCTCCTCTCTCGAAACCCTAACCCTTCTCCCAATTTCAGAACAACCCA 116 |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 193 TCTT-TGTCTTCCCTCCTCTCTCGGACCCCTAACCCTTCTCCTAATTTCAGAACAACTCA 251 Query 117 TCTGAATTTCGGGTCTCAAAGGAGGATTTTCACCATCAATCCTCTTCTTAGATCCTTTAA 176 |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 252 TCTGAATTTCGGTTCTCAAAGGAGGATTTACACAATCAATCCTCTCCTTAGATCCTTTAA 311 Query 177 ATGTCTTCAATCATCATCAAAAGACCTAAATGCGTCACCTTTCTCAATCTCAGCTATTG- 235 ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 312 ATGCCTTCAATCATCTTCAAGAGACGTAAATGCGTCACCTTTCTCAATCTCAGCTATTGC 371 Query 236 --------CTTCATCATCACAAACCACAGAGCTTGTACCAC-ATAAGCTTCAGAGATTAG 286 |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 372 TTCTTCTTCTTCTTCATCACAGACCACAGAGCTTGTACC-CTATAAGCTTCAGAGATTAG 430 Query 287 TCAAGGAATTCAAATCCTTGACAGAGCCAATTGATAGACTCAAATGGGTTCTTCATTACG 346 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct 431 TCAAGGAATTCAAATCCTTGACAGAGCCAATTGATCGACTCAAATGGGTTCTCCATTACG 490 Query 347 CGAGTCTCATTCCTCCGATGCCCGAGTTGTCCAAGACTGAATCAAACCGAGTTATGGGCT 406 | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 491 CTAGTCTCCTTCCTCAAATGCCCGAGTCGTCCAAGACTGAATCAAACAGAGTTATGGGCT 550 Query 407 GCACGGCTCGTGTTTGGCTAGAGGCTGAGTTAGGTCAAGATGGGAAGATGAGGTTTTGGG 466 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 551 GCACAGCTCGTGTTTGGCTAGATGCTGAGTTAGGTCAAGATGGGAAGATGAGGTTTTGTG 610 Query 467 CAGATAGTGATTCAGATGTGTCGAAAGGGATGTGTTCTTGTTTGATTCAAGTTCTTGATG 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 611 CAGATAGTGATTCAGATGTGTCGAAAGGGATGTGTTCTTGTTTGATTCAAGTTCTTGATG 670 Query 527 AGGCTTCTCCTGAAGAAGTTATGGAATTGAAGACTGAGGATTTAGCTGAGCTTAATGTTG 586 |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 671 AGGCTTCTCCTGTAGAAGTTATGGAGTTGAAGACTGAGGATTTAGCTGAGCTTAATGTTG 730 Query 587 GATTGTTGGGTGGAGAGAGATCGAGAGTTAACACTTGGTATAATGTTCTGGTGAGTATGC 646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 731 GTTTGTTGGGTGGAGAGAGATCGAGAGTTAACACTTGGTATAATGTTCTTGTGAGTATGC 790 Query 647 AGAAGAAGACTCGACGATTAGTAGCGGAGAGGGAAGGTAAAGTTCCGTCCTTTGAGCCAT 706 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 791 AGAAGAAGACTCGACGATTAGTAGCGGAGAGGGAAGGTAAAGTTCCTTCCTTTGAGCCAT 850 Query 707 TTCCTTCACTTGTGTTAACGGCTCATGGCATTGAAGCTAAAGGAAGCTTCGCTGAAGCTC 766 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 851 TTCCTTCACTTGTGTTAACGGCTCATGGCATTGAAGCTAAAGGAAGCTTTGCTCAAGCTC 910 Query 767 AGGCGAAATATTTGTTTCCGGAGGAGACACGGGTTGAAGAACTTGTCAATGTGTTGAAAG 826 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 911 AGGCGAAATATTTGTTTCCGGAGGAGTCACGGGTTGAAGAACTTGTCAATGTGTTGAAGG 970 Query 827 AAAAGAAGATAGGAGTGGTTGCTCATTTCTATATGGATCCAGAAGTGCAAGGGGTCTTGA 886 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 971 AAAAGAAGATAGGAGTGGTTGCTCATTTCTATATGGATCCAGAAGTGCAAGGGGTCTTGA 1030 Query 887 CTGCTGCTCAAAAGCATTGGCCACATATCTCTATATCTGATTCTCTTATCATGGCGGATT 946 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | Sbjct 1031 CTGCTGCTCAAAAGCATTGGCCACATATCTCTATATCTGATTCTCTTGTCATGGCAGACT 1090 Query 947 CAGCTGTCACGATGGCTAAAGCTGGATGTCAGTTTATAACAGTTCTTGGTGTTGATTTCA 1006 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1091 CAGCTGTCACGATGGCTAAAGCTGGATGTCAGTTTATAACAGTTCTTGGTGTTGATTTCA 1150 Query 1007 TGTCTGAAAATGTCCGAGCCATCCTAGATCAAGCTGGATTTGAAGAGGTTGGTGTATACA 1066 |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| Sbjct 1151 TGTCCGAAAATGTTCGTGCCATCCTAGATCAAGCTGGGTTTGAAAAGGTTGGTGTGTACA 1210 Query 1067 GGATGTCAGATGAGACCATTGGTTGTTCACTGGCTGATGCTGCTTCTGCTCCTGCTTACT 1126 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1211 GGATGTCAGATGAGACCATTGGTTGTTCACTTGCTGACGCTGCTTCTGCTCCTGCTTACT 1270 Query 1127 TGAATTATCTTGAAGCTGCTTCTCTTTCACCTCCTTCATTGCATGTTGTTTATATAAATA 1186 |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1271 TGAATTATCTTGAAGCTGCTTCTCGTTCTCCTCCTTCACTGCATGTTGTTTATATAAATA 1330 Query 1187 CATCTTTGGAGACAAAAGCTTTTGCTCACGAGCTTGTACCCACCATTACTTGCACCTCAT 1246 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 1331 CATCTTTGGAGACAAAAGCTTTTGCTCATGAGCTTGTACCTACCATTACTTGCACTTCAT 1390 Query 1247 CTAATGTTGTACAGACGATTTTGCAGGCGTTTGCTCAAATGCCGGAGTTAACTGTTTGGT 1306 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1391 CTAATGTTGTACAGACGATTCTGCAGGCGTTTGCTCAAATGCCAGAGTTAACTGTTTGGT 1450 Query 1307 ATGGTCCTGATTCTTACATGGGAGCGAATATTGTAAAGTTATTCCAGCAGATGACATTGA 1366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1451 ATGGTCCTGATTCTTACATGGGAGCGAATATTGTAAAGTTATTCCAGCAGATGACATTGA 1510 Query 1367 TGACTGATGAAGAAATCGCCAATATTCACCCTAAACACAGCTTAGATTCCATTAAATCAT 1426 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1511 TGACTAATGAAGAAATCGCCAATATTCACCCTAAACACAGCTTAGATTCCATTAAATCAT 1570 Query 1427 TGCTTCCCCGTCTTCACTATTTCCAGGAAGGAACTTGCATTGTACATCATCTTTTCGGTC 1486 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1571 TGCTTCCCCGTCTTCACTATTTCCAGGAAGGAACCTGCATTGTACATCATCTATTCGGTC 1630 Query 1487 ACGAGGTTGTGGAGAGAATAAAGTACATGTACTGTGATGCCTTTCTTACCGCGCATCTTG 1546 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| Sbjct 1631 ACGAGGTAGTGGAGAGAATAAAGTACATGTACTGTGACGCCTTTCTTACAGCACATCTTG 1690 Query 1547 AGGTTCCAGGTGAAATGTTTTCACTAGCAATGGAAGCAAAGAAACGAGAGATGGGTGTTG 1606 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1691 AGGTTCCAGGTGAAATGTTTTCACTAGCAATGGAAGCAAAGAAAAGAGAGATGGGTGTTG 1750 Query 1607 TTGGATCAACACAAAACATACTAGACTTCATCAAGCAGAAGGTTCAGGAAGCAGTGGATC 1666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1751 TTGGATCAACACAAAACATACTAGACTTCATCAAGCAGAAGGTTCAGGAAGCAGTGGACC 1810 Query 1667 GGAATGTCGATGACCACCTCCAGTTTGTTCTAGGAACAGAGTCAGGAATGGTAACATCGA 1726 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1811 GGAATGTTGATGACCACCTCCAGTTTGTTCTTGGAACAGAGTCAGGAATGGTAACATCGA 1870 Query 1727 TTGTCGCGGTGATCAGAAGTTTGCTAGGTTCTTCTGTTAACTCGAAATTGAAGGTTGAAG 1786 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 1871 TTGTCGCGGTGATCAGAAGTCTGCTAGGTTCTTCTGCTAACTCGAAATTGAAGGTGGAAG 1930 Query 1787 TAGTGTTTCCTGTATCGTCAGACTCGATGACAAAAACTTCTTCAGATAGTTCAAACTCCA 1846 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1931 TAGTGTTTCCTGTCTCATCAGACTCGATGACAAAAACTTCTTCAGATAGTTCAAACTCCA 1990 Query 1847 TTAAAGTTGGTGATGTGGCACTACCTGTTGTACCGGGAGTAGCAGGTGGTGAAGGCTGCT 1906 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1991 TTAAAGTTGGTGATGTGGCACTACCGGTTGTACCGGGAGTAGCAGGTGGTGAAGGTTGCT 2050 Query 1907 CTATTCATGGTGGATGTGCATCATGTCCATATATGAAGATGAACTCGCTTAGCTCGCTCT 1966 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2051 CTATTCATGGCGGATGTGCATCATGCCCATATATGAAGATGAACTCGCTTAGCTCGCTCT 2110 Query 1967 TGAAAGTTTGCCACAAACTACCTGACCTGGAAAACGTATACGGGGGATTCGTAGCGGAGC 2026 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||||| Sbjct 2111 TGAAAGTTTGCCACAAACTACCTGACTTGGAAAATGTATATGGAGGATTCATAGCGGAGC 2170 Query 2027 GATTTAAAAGACAAACTCCTCAAGGAAAACTCATCGCGGATGTAGGGTGCGAGCCAATAC 2086 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct 2171 GATTTAAAAGACAAACTCCTCAAGGAAAACTCATCGCGGATGTCGGGTGTGAGCCGATAC 2230 Query 2087 TTCACATGAGGCACTTCCAAGCGAATAAGGAGCTACCAGAGAAGCTTGTTCGTCAGGTAT 2146 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 2231 TTCACATGAGGCACTTCCAAGCGAATAAGGAGCTGCCAGACAAGCTTGTTCATCAGGTAT 2290 Query 2147 TAAGTTGTGAGAGCAAGAGATGACCA--A----GTTGCCCTGAAAAGCTAT 2191 |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| Sbjct 2291 TAAGTTGTGAGAGCAAGAGATGACCATGACCAAGTTGCCCTTAAAAGCTAT 2341 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 108684179925 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5