BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg949937
Length=6667
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G53460.1 | Symbols: GLT1 | NADH-dependent glutamate synthase... 1.102e+04 0.0
> AT5G53460.1 | Symbols: GLT1 | NADH-dependent glutamate synthase
1 | chr5:21700518-21710066 FORWARD LENGTH=7064
Length=7064
Score = 1.102e+04 bits (5967), Expect = 0.0
Identities = 6425/6652 (97%), Gaps = 8/6652 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 22 ATGTCGGCAGCTTCTTCTAGCTCCGTTCTTCACCTCCGAACCAACCAACAATTGTTGTCA 81
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 1 ATGTCGGCAGCTTCTTCTAGCTCCGTTCTTCACCTCCGAACCAACCAACAACTGTTATCA 60
Query 82 CTCCGATCTCTCAAAAATTCCACCTCCGTTGCATCTCAATTGGCCGTTACGTCTGGTGTT 141
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTCCGATCTCTCAAAAATTCCACCTCCGTTGCTTCTCAATTGGCCGTTACGTCTGGTGTT 120
Query 142 AGCCGTAGAAGGTCGTGTACGGCGCGATGTTCTGTGAAGAAACCGGTGGCTCCAGAGAGT 201
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 121 AGCCGTAGAAGATCGTGTACGGCGCGATGCTCTGTGAAGAAACCGGTGATTCCTGAGAGT 180
Query 202 CCTTTCTTAGGGACTCGTGTGCGGAGATCCGGATCCGAGACGCTTCAGTTCTGGAGATCG 261
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCTTTCCTAGGGACTCGTGTGCGGAGATCCGGATCCGAGACGCTTCAGTTCTGGAGATCA 240
Query 262 GATGGTCCTGGACGGTCTGCGAAGCTCCGAACGGTGGTTAAGTCGTCATTTTCCGGTGTT 321
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 241 GATGGTCCTGGACGGTCTGCGAAGCTTCGAACGGTGGTTAAATCGTCATTTTCCGCTGTT 300
Query 322 CCGGAGAAGCCTCTCGGTCTTTATGATCCTTCCTATGATAAAGACTCTTGTGGTGTCGGT 381
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 301 CCGGAGAAGCCTCTTGGTCTTTATGATCCTTCCTATGATAAAGACTCTTGTGGTGTTGGT 360
Query 382 TTTGTAGCAGAGTTATCCGGCGAGACCAGTCGCAAAACGGTGACTGATTCGTTGGAGATG 441
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTTGTAGCAGAGTTGTCCGGCGAGACCACCCGCAAAACGGTGACTGATTCGTTGGAGATG 420
Query 442 TTGATAAGGATGACTCATAGAGGTGCTTGTGGTTGTGAAAGCAACACTGGTGACGGCGCT 501
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTGATACGGATGACTCATAGAGGTGCTTGTGGTTGTGAGAGCAACACTGGTGACGGCGCT 480
Query 502 GGGATTCTTGTTGGTCTGCCTCACGATTTCTATGCAGAGGCTGCGACAGAGCTTGGCTTT 561
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGGATTCTTGTTGGTCTGCCTCATGATTTCTATGCAGAGGCTGCGACAGAGCTTGGCTTT 540
Query 562 GTGCTTCCTCCTGCGGGAAAATATGCTGTTGGTATGTTCTTCTTGCCAACTGTTGAAAGC 621
|| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GTACTTCCTTCTGCTGGAAATTATGCTGTTGGTATGTTCTTCTTGCCAACTGTTGAAAGC 600
Query 622 CGGAGAGAAGAAAGCAAGAATGTTTTCACTAAGGTTGCTGAATCACTTGGCCATTCGGTT 681
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 601 AGGAGAGAAGAAAGCAAGAATGTTTTCACTAAGGTTGCTGAATCACTTGGCCACTCGGTT 660
Query 682 CTTGGATGGAGATTAGTGCCTACCGATAATTCCGGGCTGGGAAATTCCGCTTTGCAGACG 741
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 661 CTTGGATGGAGATTAGTGCCTACCGATAATTCTGGACTGGGAAACTCCGCTTTGCAGACT 720
Query 742 GAACCGATAATTGCGCAAGTTTTCCTTACTCCTACAACTAAATCTAAAGCTGACTTTGAG 801
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GAACCGATTATTGCGCAAGTTTTCCTTACTCCTACAACTAAATCTAAAGCTGACTTTGAG 780
Query 802 CAACAGATGTATATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTT 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CAACAGATGTATATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTT 840
Query 862 CAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTATATCTGTTCTTTGTCTTCTAGGACTATTGTCTAC 921
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 841 CAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTACATCTGTTCGTTGTCTTCTAGGACTATCGTCTAC 900
Query 922 AAAGGACAATTGAAGCCGGATCAACTGAAGGACTATTATTACGCAGATCTTGGGAGTGAA 981
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 901 AAAGGACAATTGAAGCCTGATCAACTAAAGGACTATTACTATGCGGATCTTGGGAGTGAA 960
Query 982 AGGTTTACGAGCTACATGGCCCTGGTTCATTCTCGGTTCTCTACCAATACATTTCCCAGC 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AGGTTTACGAGCTACATGGCCCTGGTTCATTCTCGGTTCTCTACCAATACATTTCCCAGC 1020
Query 1042 TGGGATCGTGCTCAGCCGATGCGTGTTTTGGGCCACAATGGGGAGATCAATACACTCAGG 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGGGATCGTGCTCAGCCGATGCGTGTTTTGGGCCACAATGGGGAGATCAATACACTCAGG 1080
Query 1102 GGAAACGTGAACTGGATGAGGGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTA 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGAAACGTGAACTGGATGAGGGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTA 1140
Query 1162 TCAAAGAAGGAATTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGT 1221
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 TCAAAGAAAGAGTTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGT 1200
Query 1222 GCTTTTGATGGTGTTCTTGAGCTTCTTGTCCGAGCTGGCAGAAGTCTTCCTGAAGCTGTT 1281
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GCTTTTGATGGTGTTCTTGAGCTTCTTGTCCGAGCTGGTAGAAGTCTTCCTGAAGCTGTT 1260
Query 1282 ATGATGATGATCCCTGAAGCATGGCAAAATGACAAAAACATAGATCCAAGCAGGAAAGAG 1341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1261 ATGATGATGATCCCTGAAGCATGGCAAAATGACAAAAACATTGATCCAAGCAGGAAAGAG 1320
Query 1342 TTTTATGAATACTTATCTGCTCTGATGGAGCCATGGGATGGACCTGCCCTCATTTCATTC 1401
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1321 TTTTATGAATACTTATCTGCTCTAATGGAGCCATGGGATGGACCTGCCCTCATATCATTC 1380
Query 1402 ACTGATGGTCGATACTTGGGTGCCACATTGGACCGTAATGGGCTTCGTCCTGGTAGGTTT 1461
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1381 ACTGATGGTCGCTACTTGGGTGCCACATTGGACCGTAATGGACTTCGTCCTGGTAGGTTC 1440
Query 1462 TACATAACCCACAGTGGAAGGGTTATCATGGCTAGTGAAGTTGGGGTAGTTGATGTACCA 1521
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1441 TACATAACCCACAGTGGAAGGGTTATCATGGCTAGTGAAGTTGGGGTAGTGGATGTACCA 1500
Query 1522 CCTGAAGATGTGATGAGGAAAGGAAGACTTAACCCGGGTATGATGCTTCTTGTCGATTTT 1581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CCTGAAGATGTGATGAGGAAAGGAAGACTTAACCCGGGTATGATGCTTCTTGTCGATTTT 1560
Query 1582 GAGAAGCATATTGTTGTTGATGACGATGCCTTGAAACAACAATATTCACTGGCAAGGCCT 1641
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GAGAAGCATATTGTTGTTGATGACGATGCCTTGAAGCAGCAGTATTCACTGGCAAGGCCT 1620
Query 1642 TATGGCGAGTGGCTTAAAAGGCAAAAGATTGAACTTAAAGACATCATCGAGTCAGTTCCG 1701
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1621 TATGGTGAGTGGCTTAAAAGGCAAAAGATTGAACTTAAAGACATCATTGAGTCAGTTCCG 1680
Query 1702 GCGGCTGAACGGATTGCTCCTTCAATTTCTGGGGTTGTACCGGCCTCTAATGATGATGAC 1761
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GAGGCTGAACGGATTGCTCCTTCAATTTCTGGGGTTGTACCGGCCTCTAATGATGATGAC 1740
Query 1762 TCGATGGAGAGCATGGGCATTCATGGTTTATTGTCTCCACTAAAAGCCTTTGGTTACACA 1821
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1741 TCAATGGAGAGCATGGGCATTCATGGTTTATTGTCTCCACTAAAAGCCTTTGGCTACACA 1800
Query 1822 GTTGAGGCCTTGGAGATGCTGCTGCTTCCGATGGCTAAAGATGGCTCTGAAGCACTTGGT 1881
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 GTTGAGGCCTTGGAGATGTTGCTGCTTCCGATGGCTAAAGATGGCTCTGAAGCACTTGGT 1860
Query 1882 TCTATGGGAAATGATACCCCTCTAGCTGTAATGTCAAACAGAGAGAAATTATGCTTTGAG 1941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1861 TCTATGGGAAATGATACCCCTCTAGCTGTAATGTCAAACAGAGAAAAATTATGCTTTGAG 1920
Query 1942 TACTTCAAGCAAATGTTTGCTCAAGTAACAAATCCTCCAATTGATCCAATTCGTGAGAAA 2001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1921 TACTTCAAGCAAATGTTTGCTCAAGTAACAAATCCTCCAATTGATCCTATTCGTGAGAAA 1980
Query 2002 ATTGTTACTTCGATGGAGTGCATGATAGGTCCAGAAGGTGATCTAACCGAAACAACTGAA 2061
|||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 ATTGTTACATCAATGGAGTGCATGATCGGTCCAGAAGGCGATCTAACCGAAACAACTGAA 2040
Query 2062 GAGCAATGTCACCGTCTTTCCCTTAAAGGTCCTCTTTTGAAAATCGAAGAGATGGAAGCT 2121
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GAGCAATGTCACCGTCTCTCCCTAAAAGGTCCTCTTTTGAAAATCGAAGAGATGGAAGCC 2100
Query 2122 ATCAAGAAAATGAATTACAGAGGCTGGCGGACTAAAGTTCTTGATATAACTTATGCAAAA 2181
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2101 ATCAAGAAAATGAACTACAGAGGCTGGCGGACTAAAGTTCTGGATATAACTTATGCAAAA 2160
Query 2182 GAACGAGGTACAAAAGGGTTAGAGGAGACCTTGGACCGAATTTGTGATGAAGCAAATGAA 2241
||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 GAAAGAGGTACAAAAGGGTTAGAGGAGACTTTGGACCGAATTTGTGATGAAGCAAATGAA 2220
Query 2242 GCGATAAAGGAGGGCTACACATTACTGGTTTTGTCTGATCGAGCTTTCTCTGCAACCCGT 2301
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2221 GCAATAAAGGAGGGCTACACATTACTGGTTTTGTCTGATCGAGCTTTCTCTGCAACACGT 2280
Query 2302 GTTGCTGTGAGCTCCCTCATGGCTGTTGGTGCCGTTCATCACCACCTGGTTAAGACACTT 2361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 GTTGCTGTGAGCTCCCTCATGGCTGTTGGTGCCGTTCATCACCACCTGGTTAAGACACTT 2340
Query 2362 GCGCGCACCCAGGTTGGGTTGGTAGTGGAATCTGCTGAACCACGTGAAGTGCATCATTTC 2421
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 GCGCGCACCCAAGTTGGTTTGGTAGTGGAATCTGCTGAACCACGTGAAGTGCATCATTTC 2400
Query 2422 TGCACACTTGTCGGATTCGGAGCAGATGCTATCTGCCCATATTTGGCTGTGGAGGCCGTT 2481
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2401 TGCACACTTGTCGGATTTGGAGCAGATGCTATCTGCCCATATTTGGCTGTAGAGGCCGTT 2460
Query 2482 TATAGATTACAGGTTGATGGCAAGATACCACCCAAATCCAACGGGGAATTCCATTCCAAA 2541
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2461 TATAGATTACAGGTTGATGGCAAAATACCACCCAAATCTAATGGGGAATTCCATTCCAAA 2520
Query 2542 GAAGAGCTGGTGAAGAAGTATTACAAGGCAAGTAACTACGGAATGATGAAGGTTCTTGCC 2601
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 GAAGAGTTGGTCAAGAAGTATTACAAGGCAAGTAACTATGGAATGATGAAGGTTCTTGCC 2580
Query 2602 AAAATGGGAATTTCTACTCTGGCCTCATACAAGGGTGCTCAGATATTTGAAGCTCTTGGA 2661
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 AAAATGGGAATTTCTACTCTAGCCTCATACAAAGGTGCTCAGATATTTGAAGCTCTTGGG 2640
Query 2662 CTTTCATCTGAAGTAATTCAGAAATGTTTTGCGGGCACCCCAAGCAGGGTGGAAGGAGCA 2721
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2641 CTTTCATCTGAAGTAATTCAGAAATGTTTTGCCGGTACCCCAAGCCGAGTGGAAGGAGCA 2700
Query 2722 ACATTTGAGATGCTTGCTCGAGATGGACTTCAATTGCATGAGTTGGCCTTTCCAACCCGT 2781
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 ACATTTGAGATGCTTGCACGAGATGGACTTCAATTGCATGAGTTGGCCTTTCCAACCCGT 2760
Query 2782 GGCTATGCCCCTGGAAGTGCAGAAGCCTCAGCACTTACCAACCCTGGGAACTATCACTGG 2841
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2761 GGCTATGCCCCAGGAAGTGCAGAAGCTTCAGCACTTACCAACCCTGGAAACTATCACTGG 2820
Query 2842 AGGAAAAATGGAGAGATTCATCTCAACGATCCCCTTGCTATTG-CAAAGTTACAAGAGGC 2900
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||
Sbjct 2821 AGGAAAAATGGAGAGATTCATCTCAACGATCCTCTTGCAATAGCCAAA-TTACAAGAGGC 2879
Query 2901 TGCACGGACTAACAGTGTGGCCGCCTACAAGGAATACTCAAAGCGTATCAATGAACTGAA 2960
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2880 AGCACGGACCAACAGTGTGGCCGCCTACAAGGAATACTCAAAGCGTATCAATGAATTGAA 2939
Query 2961 CAAGCAAAGTAATTTGCGTGGGCTCATGAAGTTTAAAGACGCAGATGTGAAAATTCCACT 3020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 CAAGCAAAGTAATTTGCGTGGGCTCATGAAGTTTAAAGACGCAGATGTGAAAATTCCACT 2999
Query 3021 TGATGAAGTAGAGCCTGCCAGTGAAATTGTTAAGCGATTCTGCACTGGTGCCATGAGTTA 3080
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 AGATGAAGTCGAGCCTGCCAGTGAAATTGTTAAGCGGTTCTGCACTGGTGCCATGAGTTA 3059
Query 3081 TGGATCAATATCTCTGGAGGCGCATACAACCCTTGCAATGGCCATGAACAAGCTTGGAGG 3140
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 TGGATCAATTTCTCTGGAGGCGCATACAACCCTTGCAATGGCCATGAACAAGCTTGGAGG 3119
Query 3141 AAAATCGAATACAGGTGAGGGAGGGGAACTGCCATCCCGTATGGAGCCTCTTGCGGATGG 3200
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 AAAGTCGAATACAGGTGAGGGAGGGGAACTGCCATCCCGTATGGAGCCTCTTGCGGATGG 3179
Query 3201 TTCAAGGAACCCCAAAAGAAGTTCGATCAAACAAATTGCTAGTGGAAGATTTGGAGTTTC 3260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 TTCAAGGAACCCCAAAAGAAGTTCGATCAAACAAATTGCTAGTGGAAGATTTGGAGTTTC 3239
Query 3261 GAGCTACTATCTTACAAATGCTGATGAGCTGCAGATAAAGATGGCTCAGGGTGCCAAACC 3320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 TAGCTACTATCTTACAAATGCTGATGAGCTGCAGATAAAGATGGCTCAGGGTGCCAAACC 3299
Query 3321 TGGGGAAGGCGGGGAGCTACCAGGCCACAAGGTCATAGGAGACATTGCTATAACCAGAAA 3380
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3300 TGGGGAAGGTGGGGAGCTACCAGGCCACAAGGTCATAGGAGACATTGCTATAACCAGAAA 3359
Query 3381 TTCCACTGCTGGTGTAGGGCTTATCAGTCCACCTCCTCATCATGACATCTACTCTATCGA 3440
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3360 TTCCACTGCTGGTGTAGGACTTATCAGTCCACCTCCTCATCATGATATCTACTCTATCGA 3419
Query 3441 GGATCTTGCCCAGCTAATTCACGATCTTAAGAATGCCAATCCTGGGGCACGTATTAGTGT 3500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3420 GGATCTTGCCCAGCTAATTCACGATCTTAAGAATGCCAATCCTGGCGCACGTATTAGTGT 3479
Query 3501 TAAGCTTGTATCTGAAGCTGGTGTTGGAGTTATTGCTAGCGGCGTGGTGAAGGGGCATGC 3560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3480 TAAGCTTGTATCTGAAGCTGGTGTTGGAGTTATTGCTAGCGGTGTGGTGAAGGGGCATGC 3539
Query 3561 TGACCATGTTCTGATAGCAGGTCATGATGGAGGTACTGGTGCATCTCGCTGGACCGGTAT 3620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 TGACCATGTTCTGATAGCAGGTCATGATGGAGGTACTGGTGCATCTCGCTGGACCGGTAT 3599
Query 3621 TAAAAATGCTGGTCTTCCATGGGAACTGGGTCTAGCTGAGACACACCAAACTCTTGTTGC 3680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 TAAAAATGCTGGTCTTCCATGGGAACTGGGTCTAGCTGAGACACACCAAACTCTTGTTGC 3659
Query 3681 CAATGACCTTCGTGGCCGCACTGTTCTTCAGACAGATGGCCAGCTAAAAACTGGCAGAGA 3740
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 CAATGACCTTCGTGGCCGTACTGTTCTTCAGACAGATGGCCAGCTAAAAACTGGCAGAGA 3719
Query 3741 TGTTGCAGTTGCAGCGCTTCTTGGTGCAGAAGAGTTTGGTTTTAGTACTGCACCCCTTAT 3800
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 CGTTGCAGTTGCTGCACTTCTTGGTGCAGAAGAATTTGGTTTTAGTACTGCACCCCTTAT 3779
Query 3801 CACACTAGGGTGTATCATGATGAGAAAATGCCACAAGAACACCTGCCCTGTGGGAATTGC 3860
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3780 CACACTAGGGTGTATCATGATGAGAAAGTGCCACAAGAACACCTGCCCTGTGGGAATTGC 3839
Query 3861 TACTCAAGATCCAGTTCTCCGTGAAAAATTTGCTGGGGAACCTGAACATGTTATTAACTT 3920
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3840 TACCCAAGATCCAGTTCTCCGTGAAAAATTTGCTGGGGAGCCTGAACATGTTATTAACTT 3899
Query 3921 CTTCTTTATGCTTGCTGAGGAAGTTAGGGAGATCATGTCTGGACTTGGTTTTAGAACTAT 3980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3900 CTTCTTTATGCTTGCTGAGGAAGTTAGGGAGATCATGTCTGGACTTGGTTTTAGAACTGT 3959
Query 3981 AACTGAGATGATTGGTCGTGCAGATATGCTTGAACTTGACAGGGAAGTTGTCAAGAACAA 4040
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3960 AACTGAGATGATTGGTCGTGCGGATATGCTTGAACTTGATAGGGAAGTTGTCAAGAACAA 4019
Query 4041 CGATAAGCTGGAGAACATTGACCTCTCTCTTTTGCTCAGACCTGCTGCTGAGATTCGTCC 4100
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4020 CGATAAGCTGGAGAACATTGACCTATCTCTTTTGCTCAGACCTGCTGCTGAGATTCGTCC 4079
Query 4101 TGGGGCAGCTCAGTACTGTGTCCAGAAACAAGATCACGGTTTAGACATGGCTTTGGATCA 4160
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4080 TGGGGCTGCTCAGTACTGTGTTCAGAAACAAGATCATGGTTTAGACATGGCTTTGGATCA 4139
Query 4161 AGAGCTGATTGCATTGTCTAAATCTGCTCTAGAGAAATCTCTTCCAGTGTACATTGAAAC 4220
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4140 AGAGCTGATTGCATTGTCTAAATCTGCTCTGGAGAAATCTCTTCCGGTGTACATTGAAAC 4199
Query 4221 TCCTATCTGCAACGTTAACCGTGCTGTTGGGACGATGCTGAGCCATGAGGTAACTAAACG 4280
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4200 TCCTATCTGCAACGTTAACCGTGCTGTTGGGACAATGCTGAGCCATGAGGTAACCAAACG 4259
Query 4281 TTACCACTTGGCTGGGCTTCCGAAGGATACAATTCATATCAAGTTCACAGGAAGTGCTGG 4340
|||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4260 TTACCACTTGACTGGGCTTCCAAAGGACACAATTCATATCAAGTTCACAGGAAGTGCTGG 4319
Query 4341 GCAGAGTCTTGGAGCTTTCCTGTGTCCAGGAATTATGCTAGAACTTGAGGGCGATAGCAA 4400
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 4320 GCAGAGTCTTGGAGCTTTCTTGTGTCCTGGAATTATGCTAGAACTTGAAGGAGATAGCAA 4379
Query 4401 TGACTATGTTGGAAAAGGGCTCTCAGGAGGTAAAGTTGTTGTCTACCCTCCAAAAGGAAG 4460
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4380 TGACTATGTTGGAAAAGGGCTCTCTGGAGGTAAAGTTGTTGTTTACCCTCCAAAAGGAAG 4439
Query 4461 CGGCTTTGATCCAAAGGAAAATATCGTTATCGGTAATGTAGCACTTTATGGTGCCACTAG 4520
| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4440 CAGCTTTGATCCAAAAGAAAATATCGTTATTGGTAATGTAGCACTTTACGGTGCCACTAG 4499
Query 4521 TGGTGAAGCATACTTCAATGGGATGGCTGCTGAAAGGTTCTCTGTTCGTAATTCTGGTGC 4580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4500 TGGTGAAGCATACTTCAATGGGATGGCTGCTGAAAGGTTCTCTGTTCGTAATTCTGGTGC 4559
Query 4581 TAAAGCCGTTGTGGAAGGTGTTGGTGATCATGGTTGTGAGTACATGACTGGTGGTACTGT 4640
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4560 TAAAGCTGTTGTGGAAGGTCTTGGTGATCATGGTTGTGAGTACATGACTGGTGGTACTGT 4619
Query 4641 AGTGGTGCTTGGAAAGACTGGTAGAAACTTTGCTGCTGGTATGAGTGGGGGTATTGCTTA 4700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4620 TGTGGTGCTTGGAAAGACTGGTAGAAACTTTGCTGCTGGTATGAGTGGTGGTATTGCTTA 4679
Query 4701 TGTCCTTGATGTGGACGGAAAGTTCCACACGAGATGCAACCTTGAACTGGTTGATTTGGA 4760
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4680 TGTCCTTGATGTGGACGGAAAGTTTAACACCAGATGCAACCTTGAACTGGTTGATTTGGA 4739
Query 4761 TAAAGTTGAAGATGAGGAGGACAAAATGACGCTCAAAATGATGATTCAGCAACATCAACG 4820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 4740 TAAAGTTGAAGATGAGGAGGACAAAATGACGCTCAAAATGATGATCCAGCAACATCAAAG 4799
Query 4821 ACACACCAACAGCCAACTTGCTCAAGAAGTTCTTGCAGACTTTGAGAATTTGCTGCCTAA 4880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4800 ACACACCAACAGCCAACTTGCTCAAGAAGTTCTTGCAGACTTTGAGAATTTGCTGCCCAA 4859
Query 4881 GTTTATCAAGGTTTTCCCAAGAGATTACAAACGTGTTTTGTCAGCCATGAAACATGAAGA 4940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 4860 GTTTATCAAGGTTTTCCCAAGAGATTACAAACGTGTTTTATCAGCCATGAAACACGAAGA 4919
Query 4941 GGTCTCCAAGCAAGCCATAGAGCATGCTTCTGAGGAAGCTGACGA-AATGGAAGAAAAAG 4999
||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||
Sbjct 4920 GGTCTCCAAGCAAGCAATCGAGCGGGCTTCTGAGGAAGCTGACGAGACT-GAAGAGAAAG 4978
Query 5000 AACTTGAGGAGAAAGACGCCTTTGCAGAGCTGAAGAACATGGCAGCTGCTTCCTCAAAAG 5059
|||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4979 AACTCGAGGAGAAAGATGCATTTGCAGAACTGAAGAACATGGCAGCTGCTTCGTCAAAAG 5038
Query 5060 A-G-G-TGTCCGGAAACGGAGTGGCAGCTGAAGCTAAACCTTCTCAGGTAGATAATGCTG 5116
| | | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5039 AGGAGATGTCAGGAAACGGAGTGGCAGCTGAAGCTAGACCTTCTAAGGTAGATAATGCTG 5098
Query 5117 TTAAACACGGTGGTTTCATTGCTTATGAGCGTGAGGGAGTTAAGTACAGGGATCCCAATG 5176
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5099 TTAAAAACGGTGGTTTCATTGCTTATGAGCGTGAGGGAGTTAAGTACAGGGATCCCAATG 5158
Query 5177 TTCGTCTTAATGACTGGAACGAAGTCATGGAGGAATCAAAACCTGGACCACTCCTTACAA 5236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5159 TTCGTCTTAATGACTGGAACGAAGTCATGGAGGAATCAAAACCTGGACCACTCCTTACAA 5218
Query 5237 CTCAGTCAGCTCGTTGCATGGATTGTGGAACTCCATTCTGCCACCAGGAGAATTCTGGGT 5296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5219 CTCAGTCAGCTCGTTGCATGGATTGTGGAACTCCATTCTGCCACCAGGAGAACTCTGGGT 5278
Query 5297 GTCCTCTCGGTAACAAGATCCCTGAATTCAACGAACTTGTCTACCAGAACAGATGGCAAG 5356
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5279 GTCCTCTCGGTAATAAGATCCCTGAATTCAATGAACTTGTCTACCAGAACAGATGGCAAG 5338
Query 5357 AAGCCTTGAATCGTCTACTTGAGACGAACAACTTTCCAGAATTTACTGGGCGAGTATGCC 5416
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5339 AAGCCTTGAATCGTCTACTTGAGACAAACAACTTTCCAGAATTTACTGGGCGAGTATGCC 5398
Query 5417 CTGCACCATGTGAAGGTTCTTGTGTTCTTGGAATAATTGAGAACCCTGTTTCTATCAAAA 5476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5399 CTGCACCATGTGAAGGTTCTTGTGTTCTTGGAATAATTGAGAACCCTGTTTCTATCAAAA 5458
Query 5477 GCATTGAATGTGCTATTATCGATAAAGCCTTTGAGGAAGGGTGGATGGTACCAAGGCCTC 5536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5459 GCATTGAATGTGCTATTATCGATAAAGCCTTTGAGGAAGGGTGGATGGTACCAAGGCCTC 5518
Query 5537 CTCTCAAGAGAACAGGGAAAAAGGTTGCTATTATCGGAAGTGGACCGGCTGGACTAGCTG 5596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5519 CTCTCAAGAGAACAGGGAAAAAGGTTGCTATTATCGGAAGTGGACCGGCTGGGTTAGCTG 5578
Query 5597 CGGCTGACCAGCTGAACAAAATGGGCCACTTAGTAACCGTGTATGAGCGCTCTGACAGAA 5656
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5579 CGGCTGACCAGCTGAACAAAATGGGCCATTTAGTAACCGTGTATGAGCGCTCGGACAGAA 5638
Query 5657 TTGGTGGGCTTATGATGTATGGAGTACCAAACATGAAGACTGACAAAATTGATGTAGTTC 5716
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 5639 TTGGTGGGCTGATGATGTATGGAGTACCAAACATGAAGACTGACAAAATTGACGTCGTTC 5698
Query 5717 AACGGCGGGTTGATCTTATGACCAAAGAAGGTATCAACTTTGTGGTTAATGCCAATATTG 5776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5699 AACGGCGGGTTGATCTTATGACCAAAGAAGGTATCAACTTTGTGGTCAATGCCAATATTG 5758
Query 5777 GAAAGGACCCGTCTTACTCCCTTGATGGACTTAAGGAAGAGAGTGATGCACTCATTCTTG 5836
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||
Sbjct 5759 GAAAGGACCCATCTTACTCCCTTGATGGACTTAAGGAAGAGAATGATGCAATCGTTCTTG 5818
Query 5837 CTGTTGGTTCCACAAAACCAAGAGATCTTCCAGTGCCTGGTCGTGATCTATCTGGTGTTC 5896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5819 CTGTTGGTTCCACAAAACCAAGAGATCTTCCAGTGCCTGGTCGTGATCTATCTGGTGTTC 5878
Query 5897 ACTTTGCCATGGAGTTTCTTCATGCAAACACCAAAAGCTTGCTTGATAGCAATCTTGAGG 5956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||
Sbjct 5879 ACTTTGCCATGGAGTTTCTTCATGCAAACACCAAAAGTTTACTTGACAGCAATCATGAGG 5938
Query 5957 ATGGCAATTACATTTCTGCAAAGGGGAAAAAGGTTGTCGTTATTGGTGGAGGTGATACCG 6016
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5939 ATGGCAATTACATTTCTGCAAAAGGGAAAAAGGTTGTTGTTATTGGTGGAGGTGATACCG 5998
Query 6017 GTACAGATTGCATTGGAACATCTATCCGTCATGGATGCACCAACATTGTAAACCTAGAGC 6076
| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 5999 GCACAGATTGCATCGGAACATCTATCCGCCATGGATGTACCAACATTGTAAACCTAGAAC 6058
Query 6077 TTCTTCCTCAGCCACCTTCAACAAGAGCTCCTGGAAACCCTTGGCCACAGTGGCCCCGTG 6136
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6059 TTCTTCCTCAGCCACCCTCAACAAGAGCTCCTGGAAACCCTTGGCCACAGTGGCCTCGTG 6118
Query 6137 TGTTCCGTATTGACTACGGACATCAAGAAGCTACCACCAAATTCGGAAAAGACCCAAGAA 6196
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 6119 TATTCCGTATTGACTACGGACATCAAGAAGCTACCACCAAATTCGGAAAAGACCCTAGGA 6178
Query 6197 CCTATGAGGTCTTAACCAAGAGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAAGGGCTTG 6256
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6179 CCTATGAGGTCTTAACGAAGAGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAGGGGCTTG 6238
Query 6257 AAATTGTGCGAGTGAGTTGGGAGAAGGATGATACCGGGAGGTTCCAGTTCAAGGAAATCG 6316
|| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6239 AACTTGTGCGTGTGAGTTGGGAGAAGGATGAAACCGGGAGGTTCCAGTTCAAGGAGATCG 6298
Query 6317 AAGGCTCTGAGGAAATAATTGAAGCAGACCTCGTTTTCTTGGCCATGGGTTTCCTTGGAC 6376
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6299 AAGGCTCTGAGGAAATCATTGAAGCAGACCTCGTTTTCTTGGCCATGGGTTTCCTTGGAC 6358
Query 6377 CTGAGCCAACACTTGCGGAGAAGCTAGGACTCGAATGTGACAACAGGTCGAACTTTAAGG 6436
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 6359 CTGAGCCAACACTTGCTGAGAAGCTAGGTCTCGAATGTGACAACAGGTCAAACTTTAAGG 6418
Query 6437 CAGAGTATGGCCGGTTTTCCACAACTGTGGAAGGTGTTTTCGCAGCAGGTGATTGTCGGA 6496
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6419 CCGAGTATGGCCGGTTTTCCACAACCGTGGAAGGTGTTTTCGCAGCAGGTGATTGTCGGA 6478
Query 6497 GAGGCCAGTCTTTGGTTGTCTGGGCCATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCAGCTCAGGTCG 6556
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 6479 GAGGCCAGTCTTTGGTTGTCTGGGCTATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCAGATCAGGTAG 6538
Query 6557 ACAAATTCCTCACCAAAACCGATGATGACGAAGACGCCAAGCTACAACAAGACCTTAACC 6616
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6539 ACAAATTCCTCACCAAAACGGATGATGACGAAGACGCCAAGCTACAACAAGACCTTAACC 6598
Query 6617 AGATGAAACACAACACTATCACAAACTGAGGTAAA-GAAAGCCTTACTCATC 6667
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6599 AGATGAAACACAACACTATCACAAACTGAGGTAAAAGAAAGCCTTACTCATC 6650
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 332835250899
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5