BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg949937

Length=6667
                                                                      Score        E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)     Value

  AT5G53460.1 | Symbols: GLT1 | NADH-dependent glutamate synthase...  1.102e+04  0.0  


> AT5G53460.1 | Symbols: GLT1 | NADH-dependent glutamate synthase 
1 | chr5:21700518-21710066 FORWARD LENGTH=7064
Length=7064

 Score = 1.102e+04 bits (5967),  Expect = 0.0
 Identities = 6425/6652 (97%), Gaps = 8/6652 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  22    ATGTCGGCAGCTTCTTCTAGCTCCGTTCTTCACCTCCGAACCAACCAACAATTGTTGTCA  81
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct  1     ATGTCGGCAGCTTCTTCTAGCTCCGTTCTTCACCTCCGAACCAACCAACAACTGTTATCA  60

Query  82    CTCCGATCTCTCAAAAATTCCACCTCCGTTGCATCTCAATTGGCCGTTACGTCTGGTGTT  141
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CTCCGATCTCTCAAAAATTCCACCTCCGTTGCTTCTCAATTGGCCGTTACGTCTGGTGTT  120

Query  142   AGCCGTAGAAGGTCGTGTACGGCGCGATGTTCTGTGAAGAAACCGGTGGCTCCAGAGAGT  201
             ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||
Sbjct  121   AGCCGTAGAAGATCGTGTACGGCGCGATGCTCTGTGAAGAAACCGGTGATTCCTGAGAGT  180

Query  202   CCTTTCTTAGGGACTCGTGTGCGGAGATCCGGATCCGAGACGCTTCAGTTCTGGAGATCG  261
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  181   CCTTTCCTAGGGACTCGTGTGCGGAGATCCGGATCCGAGACGCTTCAGTTCTGGAGATCA  240

Query  262   GATGGTCCTGGACGGTCTGCGAAGCTCCGAACGGTGGTTAAGTCGTCATTTTCCGGTGTT  321
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct  241   GATGGTCCTGGACGGTCTGCGAAGCTTCGAACGGTGGTTAAATCGTCATTTTCCGCTGTT  300

Query  322   CCGGAGAAGCCTCTCGGTCTTTATGATCCTTCCTATGATAAAGACTCTTGTGGTGTCGGT  381
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  301   CCGGAGAAGCCTCTTGGTCTTTATGATCCTTCCTATGATAAAGACTCTTGTGGTGTTGGT  360

Query  382   TTTGTAGCAGAGTTATCCGGCGAGACCAGTCGCAAAACGGTGACTGATTCGTTGGAGATG  441
             |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   TTTGTAGCAGAGTTGTCCGGCGAGACCACCCGCAAAACGGTGACTGATTCGTTGGAGATG  420

Query  442   TTGATAAGGATGACTCATAGAGGTGCTTGTGGTTGTGAAAGCAACACTGGTGACGGCGCT  501
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  421   TTGATACGGATGACTCATAGAGGTGCTTGTGGTTGTGAGAGCAACACTGGTGACGGCGCT  480

Query  502   GGGATTCTTGTTGGTCTGCCTCACGATTTCTATGCAGAGGCTGCGACAGAGCTTGGCTTT  561
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GGGATTCTTGTTGGTCTGCCTCATGATTTCTATGCAGAGGCTGCGACAGAGCTTGGCTTT  540

Query  562   GTGCTTCCTCCTGCGGGAAAATATGCTGTTGGTATGTTCTTCTTGCCAACTGTTGAAAGC  621
             || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   GTACTTCCTTCTGCTGGAAATTATGCTGTTGGTATGTTCTTCTTGCCAACTGTTGAAAGC  600

Query  622   CGGAGAGAAGAAAGCAAGAATGTTTTCACTAAGGTTGCTGAATCACTTGGCCATTCGGTT  681
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  601   AGGAGAGAAGAAAGCAAGAATGTTTTCACTAAGGTTGCTGAATCACTTGGCCACTCGGTT  660

Query  682   CTTGGATGGAGATTAGTGCCTACCGATAATTCCGGGCTGGGAAATTCCGCTTTGCAGACG  741
             |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| 
Sbjct  661   CTTGGATGGAGATTAGTGCCTACCGATAATTCTGGACTGGGAAACTCCGCTTTGCAGACT  720

Query  742   GAACCGATAATTGCGCAAGTTTTCCTTACTCCTACAACTAAATCTAAAGCTGACTTTGAG  801
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   GAACCGATTATTGCGCAAGTTTTCCTTACTCCTACAACTAAATCTAAAGCTGACTTTGAG  780

Query  802   CAACAGATGTATATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTT  861
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   CAACAGATGTATATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTT  840

Query  862   CAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTATATCTGTTCTTTGTCTTCTAGGACTATTGTCTAC  921
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  841   CAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTACATCTGTTCGTTGTCTTCTAGGACTATCGTCTAC  900

Query  922   AAAGGACAATTGAAGCCGGATCAACTGAAGGACTATTATTACGCAGATCTTGGGAGTGAA  981
             ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct  901   AAAGGACAATTGAAGCCTGATCAACTAAAGGACTATTACTATGCGGATCTTGGGAGTGAA  960

Query  982   AGGTTTACGAGCTACATGGCCCTGGTTCATTCTCGGTTCTCTACCAATACATTTCCCAGC  1041
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   AGGTTTACGAGCTACATGGCCCTGGTTCATTCTCGGTTCTCTACCAATACATTTCCCAGC  1020

Query  1042  TGGGATCGTGCTCAGCCGATGCGTGTTTTGGGCCACAATGGGGAGATCAATACACTCAGG  1101
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  TGGGATCGTGCTCAGCCGATGCGTGTTTTGGGCCACAATGGGGAGATCAATACACTCAGG  1080

Query  1102  GGAAACGTGAACTGGATGAGGGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTA  1161
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  GGAAACGTGAACTGGATGAGGGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTA  1140

Query  1162  TCAAAGAAGGAATTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGT  1221
             |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1141  TCAAAGAAAGAGTTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGT  1200

Query  1222  GCTTTTGATGGTGTTCTTGAGCTTCTTGTCCGAGCTGGCAGAAGTCTTCCTGAAGCTGTT  1281
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1201  GCTTTTGATGGTGTTCTTGAGCTTCTTGTCCGAGCTGGTAGAAGTCTTCCTGAAGCTGTT  1260

Query  1282  ATGATGATGATCCCTGAAGCATGGCAAAATGACAAAAACATAGATCCAAGCAGGAAAGAG  1341
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1261  ATGATGATGATCCCTGAAGCATGGCAAAATGACAAAAACATTGATCCAAGCAGGAAAGAG  1320

Query  1342  TTTTATGAATACTTATCTGCTCTGATGGAGCCATGGGATGGACCTGCCCTCATTTCATTC  1401
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1321  TTTTATGAATACTTATCTGCTCTAATGGAGCCATGGGATGGACCTGCCCTCATATCATTC  1380

Query  1402  ACTGATGGTCGATACTTGGGTGCCACATTGGACCGTAATGGGCTTCGTCCTGGTAGGTTT  1461
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
Sbjct  1381  ACTGATGGTCGCTACTTGGGTGCCACATTGGACCGTAATGGACTTCGTCCTGGTAGGTTC  1440

Query  1462  TACATAACCCACAGTGGAAGGGTTATCATGGCTAGTGAAGTTGGGGTAGTTGATGTACCA  1521
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1441  TACATAACCCACAGTGGAAGGGTTATCATGGCTAGTGAAGTTGGGGTAGTGGATGTACCA  1500

Query  1522  CCTGAAGATGTGATGAGGAAAGGAAGACTTAACCCGGGTATGATGCTTCTTGTCGATTTT  1581
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1501  CCTGAAGATGTGATGAGGAAAGGAAGACTTAACCCGGGTATGATGCTTCTTGTCGATTTT  1560

Query  1582  GAGAAGCATATTGTTGTTGATGACGATGCCTTGAAACAACAATATTCACTGGCAAGGCCT  1641
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct  1561  GAGAAGCATATTGTTGTTGATGACGATGCCTTGAAGCAGCAGTATTCACTGGCAAGGCCT  1620

Query  1642  TATGGCGAGTGGCTTAAAAGGCAAAAGATTGAACTTAAAGACATCATCGAGTCAGTTCCG  1701
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1621  TATGGTGAGTGGCTTAAAAGGCAAAAGATTGAACTTAAAGACATCATTGAGTCAGTTCCG  1680

Query  1702  GCGGCTGAACGGATTGCTCCTTCAATTTCTGGGGTTGTACCGGCCTCTAATGATGATGAC  1761
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1681  GAGGCTGAACGGATTGCTCCTTCAATTTCTGGGGTTGTACCGGCCTCTAATGATGATGAC  1740

Query  1762  TCGATGGAGAGCATGGGCATTCATGGTTTATTGTCTCCACTAAAAGCCTTTGGTTACACA  1821
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1741  TCAATGGAGAGCATGGGCATTCATGGTTTATTGTCTCCACTAAAAGCCTTTGGCTACACA  1800

Query  1822  GTTGAGGCCTTGGAGATGCTGCTGCTTCCGATGGCTAAAGATGGCTCTGAAGCACTTGGT  1881
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1801  GTTGAGGCCTTGGAGATGTTGCTGCTTCCGATGGCTAAAGATGGCTCTGAAGCACTTGGT  1860

Query  1882  TCTATGGGAAATGATACCCCTCTAGCTGTAATGTCAAACAGAGAGAAATTATGCTTTGAG  1941
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1861  TCTATGGGAAATGATACCCCTCTAGCTGTAATGTCAAACAGAGAAAAATTATGCTTTGAG  1920

Query  1942  TACTTCAAGCAAATGTTTGCTCAAGTAACAAATCCTCCAATTGATCCAATTCGTGAGAAA  2001
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1921  TACTTCAAGCAAATGTTTGCTCAAGTAACAAATCCTCCAATTGATCCTATTCGTGAGAAA  1980

Query  2002  ATTGTTACTTCGATGGAGTGCATGATAGGTCCAGAAGGTGATCTAACCGAAACAACTGAA  2061
             |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1981  ATTGTTACATCAATGGAGTGCATGATCGGTCCAGAAGGCGATCTAACCGAAACAACTGAA  2040

Query  2062  GAGCAATGTCACCGTCTTTCCCTTAAAGGTCCTCTTTTGAAAATCGAAGAGATGGAAGCT  2121
             ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2041  GAGCAATGTCACCGTCTCTCCCTAAAAGGTCCTCTTTTGAAAATCGAAGAGATGGAAGCC  2100

Query  2122  ATCAAGAAAATGAATTACAGAGGCTGGCGGACTAAAGTTCTTGATATAACTTATGCAAAA  2181
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2101  ATCAAGAAAATGAACTACAGAGGCTGGCGGACTAAAGTTCTGGATATAACTTATGCAAAA  2160

Query  2182  GAACGAGGTACAAAAGGGTTAGAGGAGACCTTGGACCGAATTTGTGATGAAGCAAATGAA  2241
             ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2161  GAAAGAGGTACAAAAGGGTTAGAGGAGACTTTGGACCGAATTTGTGATGAAGCAAATGAA  2220

Query  2242  GCGATAAAGGAGGGCTACACATTACTGGTTTTGTCTGATCGAGCTTTCTCTGCAACCCGT  2301
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2221  GCAATAAAGGAGGGCTACACATTACTGGTTTTGTCTGATCGAGCTTTCTCTGCAACACGT  2280

Query  2302  GTTGCTGTGAGCTCCCTCATGGCTGTTGGTGCCGTTCATCACCACCTGGTTAAGACACTT  2361
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2281  GTTGCTGTGAGCTCCCTCATGGCTGTTGGTGCCGTTCATCACCACCTGGTTAAGACACTT  2340

Query  2362  GCGCGCACCCAGGTTGGGTTGGTAGTGGAATCTGCTGAACCACGTGAAGTGCATCATTTC  2421
             ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2341  GCGCGCACCCAAGTTGGTTTGGTAGTGGAATCTGCTGAACCACGTGAAGTGCATCATTTC  2400

Query  2422  TGCACACTTGTCGGATTCGGAGCAGATGCTATCTGCCCATATTTGGCTGTGGAGGCCGTT  2481
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  2401  TGCACACTTGTCGGATTTGGAGCAGATGCTATCTGCCCATATTTGGCTGTAGAGGCCGTT  2460

Query  2482  TATAGATTACAGGTTGATGGCAAGATACCACCCAAATCCAACGGGGAATTCCATTCCAAA  2541
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct  2461  TATAGATTACAGGTTGATGGCAAAATACCACCCAAATCTAATGGGGAATTCCATTCCAAA  2520

Query  2542  GAAGAGCTGGTGAAGAAGTATTACAAGGCAAGTAACTACGGAATGATGAAGGTTCTTGCC  2601
             |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2521  GAAGAGTTGGTCAAGAAGTATTACAAGGCAAGTAACTATGGAATGATGAAGGTTCTTGCC  2580

Query  2602  AAAATGGGAATTTCTACTCTGGCCTCATACAAGGGTGCTCAGATATTTGAAGCTCTTGGA  2661
             |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2581  AAAATGGGAATTTCTACTCTAGCCTCATACAAAGGTGCTCAGATATTTGAAGCTCTTGGG  2640

Query  2662  CTTTCATCTGAAGTAATTCAGAAATGTTTTGCGGGCACCCCAAGCAGGGTGGAAGGAGCA  2721
             |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||
Sbjct  2641  CTTTCATCTGAAGTAATTCAGAAATGTTTTGCCGGTACCCCAAGCCGAGTGGAAGGAGCA  2700

Query  2722  ACATTTGAGATGCTTGCTCGAGATGGACTTCAATTGCATGAGTTGGCCTTTCCAACCCGT  2781
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2701  ACATTTGAGATGCTTGCACGAGATGGACTTCAATTGCATGAGTTGGCCTTTCCAACCCGT  2760

Query  2782  GGCTATGCCCCTGGAAGTGCAGAAGCCTCAGCACTTACCAACCCTGGGAACTATCACTGG  2841
             ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2761  GGCTATGCCCCAGGAAGTGCAGAAGCTTCAGCACTTACCAACCCTGGAAACTATCACTGG  2820

Query  2842  AGGAAAAATGGAGAGATTCATCTCAACGATCCCCTTGCTATTG-CAAAGTTACAAGAGGC  2900
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||
Sbjct  2821  AGGAAAAATGGAGAGATTCATCTCAACGATCCTCTTGCAATAGCCAAA-TTACAAGAGGC  2879

Query  2901  TGCACGGACTAACAGTGTGGCCGCCTACAAGGAATACTCAAAGCGTATCAATGAACTGAA  2960
              |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2880  AGCACGGACCAACAGTGTGGCCGCCTACAAGGAATACTCAAAGCGTATCAATGAATTGAA  2939

Query  2961  CAAGCAAAGTAATTTGCGTGGGCTCATGAAGTTTAAAGACGCAGATGTGAAAATTCCACT  3020
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2940  CAAGCAAAGTAATTTGCGTGGGCTCATGAAGTTTAAAGACGCAGATGTGAAAATTCCACT  2999

Query  3021  TGATGAAGTAGAGCCTGCCAGTGAAATTGTTAAGCGATTCTGCACTGGTGCCATGAGTTA  3080
              |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  3000  AGATGAAGTCGAGCCTGCCAGTGAAATTGTTAAGCGGTTCTGCACTGGTGCCATGAGTTA  3059

Query  3081  TGGATCAATATCTCTGGAGGCGCATACAACCCTTGCAATGGCCATGAACAAGCTTGGAGG  3140
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3060  TGGATCAATTTCTCTGGAGGCGCATACAACCCTTGCAATGGCCATGAACAAGCTTGGAGG  3119

Query  3141  AAAATCGAATACAGGTGAGGGAGGGGAACTGCCATCCCGTATGGAGCCTCTTGCGGATGG  3200
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3120  AAAGTCGAATACAGGTGAGGGAGGGGAACTGCCATCCCGTATGGAGCCTCTTGCGGATGG  3179

Query  3201  TTCAAGGAACCCCAAAAGAAGTTCGATCAAACAAATTGCTAGTGGAAGATTTGGAGTTTC  3260
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3180  TTCAAGGAACCCCAAAAGAAGTTCGATCAAACAAATTGCTAGTGGAAGATTTGGAGTTTC  3239

Query  3261  GAGCTACTATCTTACAAATGCTGATGAGCTGCAGATAAAGATGGCTCAGGGTGCCAAACC  3320
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3240  TAGCTACTATCTTACAAATGCTGATGAGCTGCAGATAAAGATGGCTCAGGGTGCCAAACC  3299

Query  3321  TGGGGAAGGCGGGGAGCTACCAGGCCACAAGGTCATAGGAGACATTGCTATAACCAGAAA  3380
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3300  TGGGGAAGGTGGGGAGCTACCAGGCCACAAGGTCATAGGAGACATTGCTATAACCAGAAA  3359

Query  3381  TTCCACTGCTGGTGTAGGGCTTATCAGTCCACCTCCTCATCATGACATCTACTCTATCGA  3440
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3360  TTCCACTGCTGGTGTAGGACTTATCAGTCCACCTCCTCATCATGATATCTACTCTATCGA  3419

Query  3441  GGATCTTGCCCAGCTAATTCACGATCTTAAGAATGCCAATCCTGGGGCACGTATTAGTGT  3500
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3420  GGATCTTGCCCAGCTAATTCACGATCTTAAGAATGCCAATCCTGGCGCACGTATTAGTGT  3479

Query  3501  TAAGCTTGTATCTGAAGCTGGTGTTGGAGTTATTGCTAGCGGCGTGGTGAAGGGGCATGC  3560
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3480  TAAGCTTGTATCTGAAGCTGGTGTTGGAGTTATTGCTAGCGGTGTGGTGAAGGGGCATGC  3539

Query  3561  TGACCATGTTCTGATAGCAGGTCATGATGGAGGTACTGGTGCATCTCGCTGGACCGGTAT  3620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3540  TGACCATGTTCTGATAGCAGGTCATGATGGAGGTACTGGTGCATCTCGCTGGACCGGTAT  3599

Query  3621  TAAAAATGCTGGTCTTCCATGGGAACTGGGTCTAGCTGAGACACACCAAACTCTTGTTGC  3680
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3600  TAAAAATGCTGGTCTTCCATGGGAACTGGGTCTAGCTGAGACACACCAAACTCTTGTTGC  3659

Query  3681  CAATGACCTTCGTGGCCGCACTGTTCTTCAGACAGATGGCCAGCTAAAAACTGGCAGAGA  3740
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3660  CAATGACCTTCGTGGCCGTACTGTTCTTCAGACAGATGGCCAGCTAAAAACTGGCAGAGA  3719

Query  3741  TGTTGCAGTTGCAGCGCTTCTTGGTGCAGAAGAGTTTGGTTTTAGTACTGCACCCCTTAT  3800
              ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3720  CGTTGCAGTTGCTGCACTTCTTGGTGCAGAAGAATTTGGTTTTAGTACTGCACCCCTTAT  3779

Query  3801  CACACTAGGGTGTATCATGATGAGAAAATGCCACAAGAACACCTGCCCTGTGGGAATTGC  3860
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3780  CACACTAGGGTGTATCATGATGAGAAAGTGCCACAAGAACACCTGCCCTGTGGGAATTGC  3839

Query  3861  TACTCAAGATCCAGTTCTCCGTGAAAAATTTGCTGGGGAACCTGAACATGTTATTAACTT  3920
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3840  TACCCAAGATCCAGTTCTCCGTGAAAAATTTGCTGGGGAGCCTGAACATGTTATTAACTT  3899

Query  3921  CTTCTTTATGCTTGCTGAGGAAGTTAGGGAGATCATGTCTGGACTTGGTTTTAGAACTAT  3980
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  3900  CTTCTTTATGCTTGCTGAGGAAGTTAGGGAGATCATGTCTGGACTTGGTTTTAGAACTGT  3959

Query  3981  AACTGAGATGATTGGTCGTGCAGATATGCTTGAACTTGACAGGGAAGTTGTCAAGAACAA  4040
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3960  AACTGAGATGATTGGTCGTGCGGATATGCTTGAACTTGATAGGGAAGTTGTCAAGAACAA  4019

Query  4041  CGATAAGCTGGAGAACATTGACCTCTCTCTTTTGCTCAGACCTGCTGCTGAGATTCGTCC  4100
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4020  CGATAAGCTGGAGAACATTGACCTATCTCTTTTGCTCAGACCTGCTGCTGAGATTCGTCC  4079

Query  4101  TGGGGCAGCTCAGTACTGTGTCCAGAAACAAGATCACGGTTTAGACATGGCTTTGGATCA  4160
             |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4080  TGGGGCTGCTCAGTACTGTGTTCAGAAACAAGATCATGGTTTAGACATGGCTTTGGATCA  4139

Query  4161  AGAGCTGATTGCATTGTCTAAATCTGCTCTAGAGAAATCTCTTCCAGTGTACATTGAAAC  4220
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  4140  AGAGCTGATTGCATTGTCTAAATCTGCTCTGGAGAAATCTCTTCCGGTGTACATTGAAAC  4199

Query  4221  TCCTATCTGCAACGTTAACCGTGCTGTTGGGACGATGCTGAGCCATGAGGTAACTAAACG  4280
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4200  TCCTATCTGCAACGTTAACCGTGCTGTTGGGACAATGCTGAGCCATGAGGTAACCAAACG  4259

Query  4281  TTACCACTTGGCTGGGCTTCCGAAGGATACAATTCATATCAAGTTCACAGGAAGTGCTGG  4340
             |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4260  TTACCACTTGACTGGGCTTCCAAAGGACACAATTCATATCAAGTTCACAGGAAGTGCTGG  4319

Query  4341  GCAGAGTCTTGGAGCTTTCCTGTGTCCAGGAATTATGCTAGAACTTGAGGGCGATAGCAA  4400
             ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct  4320  GCAGAGTCTTGGAGCTTTCTTGTGTCCTGGAATTATGCTAGAACTTGAAGGAGATAGCAA  4379

Query  4401  TGACTATGTTGGAAAAGGGCTCTCAGGAGGTAAAGTTGTTGTCTACCCTCCAAAAGGAAG  4460
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  4380  TGACTATGTTGGAAAAGGGCTCTCTGGAGGTAAAGTTGTTGTTTACCCTCCAAAAGGAAG  4439

Query  4461  CGGCTTTGATCCAAAGGAAAATATCGTTATCGGTAATGTAGCACTTTATGGTGCCACTAG  4520
             | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  4440  CAGCTTTGATCCAAAAGAAAATATCGTTATTGGTAATGTAGCACTTTACGGTGCCACTAG  4499

Query  4521  TGGTGAAGCATACTTCAATGGGATGGCTGCTGAAAGGTTCTCTGTTCGTAATTCTGGTGC  4580
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4500  TGGTGAAGCATACTTCAATGGGATGGCTGCTGAAAGGTTCTCTGTTCGTAATTCTGGTGC  4559

Query  4581  TAAAGCCGTTGTGGAAGGTGTTGGTGATCATGGTTGTGAGTACATGACTGGTGGTACTGT  4640
             |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4560  TAAAGCTGTTGTGGAAGGTCTTGGTGATCATGGTTGTGAGTACATGACTGGTGGTACTGT  4619

Query  4641  AGTGGTGCTTGGAAAGACTGGTAGAAACTTTGCTGCTGGTATGAGTGGGGGTATTGCTTA  4700
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  4620  TGTGGTGCTTGGAAAGACTGGTAGAAACTTTGCTGCTGGTATGAGTGGTGGTATTGCTTA  4679

Query  4701  TGTCCTTGATGTGGACGGAAAGTTCCACACGAGATGCAACCTTGAACTGGTTGATTTGGA  4760
             ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4680  TGTCCTTGATGTGGACGGAAAGTTTAACACCAGATGCAACCTTGAACTGGTTGATTTGGA  4739

Query  4761  TAAAGTTGAAGATGAGGAGGACAAAATGACGCTCAAAATGATGATTCAGCAACATCAACG  4820
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct  4740  TAAAGTTGAAGATGAGGAGGACAAAATGACGCTCAAAATGATGATCCAGCAACATCAAAG  4799

Query  4821  ACACACCAACAGCCAACTTGCTCAAGAAGTTCTTGCAGACTTTGAGAATTTGCTGCCTAA  4880
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  4800  ACACACCAACAGCCAACTTGCTCAAGAAGTTCTTGCAGACTTTGAGAATTTGCTGCCCAA  4859

Query  4881  GTTTATCAAGGTTTTCCCAAGAGATTACAAACGTGTTTTGTCAGCCATGAAACATGAAGA  4940
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct  4860  GTTTATCAAGGTTTTCCCAAGAGATTACAAACGTGTTTTATCAGCCATGAAACACGAAGA  4919

Query  4941  GGTCTCCAAGCAAGCCATAGAGCATGCTTCTGAGGAAGCTGACGA-AATGGAAGAAAAAG  4999
             ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||
Sbjct  4920  GGTCTCCAAGCAAGCAATCGAGCGGGCTTCTGAGGAAGCTGACGAGACT-GAAGAGAAAG  4978

Query  5000  AACTTGAGGAGAAAGACGCCTTTGCAGAGCTGAAGAACATGGCAGCTGCTTCCTCAAAAG  5059
             |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  4979  AACTCGAGGAGAAAGATGCATTTGCAGAACTGAAGAACATGGCAGCTGCTTCGTCAAAAG  5038

Query  5060  A-G-G-TGTCCGGAAACGGAGTGGCAGCTGAAGCTAAACCTTCTCAGGTAGATAATGCTG  5116
             | | | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct  5039  AGGAGATGTCAGGAAACGGAGTGGCAGCTGAAGCTAGACCTTCTAAGGTAGATAATGCTG  5098

Query  5117  TTAAACACGGTGGTTTCATTGCTTATGAGCGTGAGGGAGTTAAGTACAGGGATCCCAATG  5176
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5099  TTAAAAACGGTGGTTTCATTGCTTATGAGCGTGAGGGAGTTAAGTACAGGGATCCCAATG  5158

Query  5177  TTCGTCTTAATGACTGGAACGAAGTCATGGAGGAATCAAAACCTGGACCACTCCTTACAA  5236
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5159  TTCGTCTTAATGACTGGAACGAAGTCATGGAGGAATCAAAACCTGGACCACTCCTTACAA  5218

Query  5237  CTCAGTCAGCTCGTTGCATGGATTGTGGAACTCCATTCTGCCACCAGGAGAATTCTGGGT  5296
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  5219  CTCAGTCAGCTCGTTGCATGGATTGTGGAACTCCATTCTGCCACCAGGAGAACTCTGGGT  5278

Query  5297  GTCCTCTCGGTAACAAGATCCCTGAATTCAACGAACTTGTCTACCAGAACAGATGGCAAG  5356
             ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5279  GTCCTCTCGGTAATAAGATCCCTGAATTCAATGAACTTGTCTACCAGAACAGATGGCAAG  5338

Query  5357  AAGCCTTGAATCGTCTACTTGAGACGAACAACTTTCCAGAATTTACTGGGCGAGTATGCC  5416
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5339  AAGCCTTGAATCGTCTACTTGAGACAAACAACTTTCCAGAATTTACTGGGCGAGTATGCC  5398

Query  5417  CTGCACCATGTGAAGGTTCTTGTGTTCTTGGAATAATTGAGAACCCTGTTTCTATCAAAA  5476
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5399  CTGCACCATGTGAAGGTTCTTGTGTTCTTGGAATAATTGAGAACCCTGTTTCTATCAAAA  5458

Query  5477  GCATTGAATGTGCTATTATCGATAAAGCCTTTGAGGAAGGGTGGATGGTACCAAGGCCTC  5536
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5459  GCATTGAATGTGCTATTATCGATAAAGCCTTTGAGGAAGGGTGGATGGTACCAAGGCCTC  5518

Query  5537  CTCTCAAGAGAACAGGGAAAAAGGTTGCTATTATCGGAAGTGGACCGGCTGGACTAGCTG  5596
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
Sbjct  5519  CTCTCAAGAGAACAGGGAAAAAGGTTGCTATTATCGGAAGTGGACCGGCTGGGTTAGCTG  5578

Query  5597  CGGCTGACCAGCTGAACAAAATGGGCCACTTAGTAACCGTGTATGAGCGCTCTGACAGAA  5656
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  5579  CGGCTGACCAGCTGAACAAAATGGGCCATTTAGTAACCGTGTATGAGCGCTCGGACAGAA  5638

Query  5657  TTGGTGGGCTTATGATGTATGGAGTACCAAACATGAAGACTGACAAAATTGATGTAGTTC  5716
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct  5639  TTGGTGGGCTGATGATGTATGGAGTACCAAACATGAAGACTGACAAAATTGACGTCGTTC  5698

Query  5717  AACGGCGGGTTGATCTTATGACCAAAGAAGGTATCAACTTTGTGGTTAATGCCAATATTG  5776
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  5699  AACGGCGGGTTGATCTTATGACCAAAGAAGGTATCAACTTTGTGGTCAATGCCAATATTG  5758

Query  5777  GAAAGGACCCGTCTTACTCCCTTGATGGACTTAAGGAAGAGAGTGATGCACTCATTCTTG  5836
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||
Sbjct  5759  GAAAGGACCCATCTTACTCCCTTGATGGACTTAAGGAAGAGAATGATGCAATCGTTCTTG  5818

Query  5837  CTGTTGGTTCCACAAAACCAAGAGATCTTCCAGTGCCTGGTCGTGATCTATCTGGTGTTC  5896
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5819  CTGTTGGTTCCACAAAACCAAGAGATCTTCCAGTGCCTGGTCGTGATCTATCTGGTGTTC  5878

Query  5897  ACTTTGCCATGGAGTTTCTTCATGCAAACACCAAAAGCTTGCTTGATAGCAATCTTGAGG  5956
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||
Sbjct  5879  ACTTTGCCATGGAGTTTCTTCATGCAAACACCAAAAGTTTACTTGACAGCAATCATGAGG  5938

Query  5957  ATGGCAATTACATTTCTGCAAAGGGGAAAAAGGTTGTCGTTATTGGTGGAGGTGATACCG  6016
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  5939  ATGGCAATTACATTTCTGCAAAAGGGAAAAAGGTTGTTGTTATTGGTGGAGGTGATACCG  5998

Query  6017  GTACAGATTGCATTGGAACATCTATCCGTCATGGATGCACCAACATTGTAAACCTAGAGC  6076
             | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct  5999  GCACAGATTGCATCGGAACATCTATCCGCCATGGATGTACCAACATTGTAAACCTAGAAC  6058

Query  6077  TTCTTCCTCAGCCACCTTCAACAAGAGCTCCTGGAAACCCTTGGCCACAGTGGCCCCGTG  6136
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  6059  TTCTTCCTCAGCCACCCTCAACAAGAGCTCCTGGAAACCCTTGGCCACAGTGGCCTCGTG  6118

Query  6137  TGTTCCGTATTGACTACGGACATCAAGAAGCTACCACCAAATTCGGAAAAGACCCAAGAA  6196
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  6119  TATTCCGTATTGACTACGGACATCAAGAAGCTACCACCAAATTCGGAAAAGACCCTAGGA  6178

Query  6197  CCTATGAGGTCTTAACCAAGAGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAAGGGCTTG  6256
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  6179  CCTATGAGGTCTTAACGAAGAGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAGGGGCTTG  6238

Query  6257  AAATTGTGCGAGTGAGTTGGGAGAAGGATGATACCGGGAGGTTCCAGTTCAAGGAAATCG  6316
             || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  6239  AACTTGTGCGTGTGAGTTGGGAGAAGGATGAAACCGGGAGGTTCCAGTTCAAGGAGATCG  6298

Query  6317  AAGGCTCTGAGGAAATAATTGAAGCAGACCTCGTTTTCTTGGCCATGGGTTTCCTTGGAC  6376
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6299  AAGGCTCTGAGGAAATCATTGAAGCAGACCTCGTTTTCTTGGCCATGGGTTTCCTTGGAC  6358

Query  6377  CTGAGCCAACACTTGCGGAGAAGCTAGGACTCGAATGTGACAACAGGTCGAACTTTAAGG  6436
             |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  6359  CTGAGCCAACACTTGCTGAGAAGCTAGGTCTCGAATGTGACAACAGGTCAAACTTTAAGG  6418

Query  6437  CAGAGTATGGCCGGTTTTCCACAACTGTGGAAGGTGTTTTCGCAGCAGGTGATTGTCGGA  6496
             | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6419  CCGAGTATGGCCGGTTTTCCACAACCGTGGAAGGTGTTTTCGCAGCAGGTGATTGTCGGA  6478

Query  6497  GAGGCCAGTCTTTGGTTGTCTGGGCCATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCAGCTCAGGTCG  6556
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct  6479  GAGGCCAGTCTTTGGTTGTCTGGGCTATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCAGATCAGGTAG  6538

Query  6557  ACAAATTCCTCACCAAAACCGATGATGACGAAGACGCCAAGCTACAACAAGACCTTAACC  6616
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6539  ACAAATTCCTCACCAAAACGGATGATGACGAAGACGCCAAGCTACAACAAGACCTTAACC  6598

Query  6617  AGATGAAACACAACACTATCACAAACTGAGGTAAA-GAAAGCCTTACTCATC  6667
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  6599  AGATGAAACACAACACTATCACAAACTGAGGTAAAAGAAAGCCTTACTCATC  6650



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 332835250899


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5