BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg950134
Length=2745
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G54830.1 | Symbols: | DOMON domain-containing protein / dop... 4421 0.0
> AT5G54830.1 | Symbols: | DOMON domain-containing protein / dopamine
beta-monooxygenase N-terminal domain-containing protein
| chr5:22273070-22276301 FORWARD LENGTH=3136
Length=3136
Score = 4421 bits (2394), Expect = 0.0
Identities = 2645/2763 (96%), Gaps = 29/2763 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTAAATCTCTCACCCAACACCATGTGTGATCAAAGACCAAATCTTTTAGGGTCTCTCGTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208 GTAAATCTCTCACCCAACACCATGTGTGATCAAAGACCAAATCTTTTAGGGTCTCTCGTG 267
Query 61 TTGTTGGGTTTCTTCATCTTCTTTGTTAATGGAGAAGAATGCTCAAACTCGAGCTCTTTG 120
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||
Sbjct 268 TTGTTGGGTTTCTTCATCTTCTTTGTAAATGGAGAAGAATGCTCTAATTCGAGCTCATTG 327
Query 121 ATTGGGCACGAGTCTGAGTTCAAGATGTTGCAACACCAGCTTCGTGGGGTTTTCACTGTT 180
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328 ATTGGGCATGAGTCTGAGTTCAAGATGTTGCAACATCAGCTTCGTGGGGTTTTCACTGTT 387
Query 181 GTTGATGATTGTTCGTTTAGGGTTTCTCGTTTCGATATGCTCTCTGGTTCTGATGTTCAT 240
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 388 GTCGATGATTGTTCGTTTAGGGTTTCTCGTTTTGATATGCTCTCTGGTTCCGAGGTTCAT 447
Query 241 TGGTGGGGTGCTATGACTTCTGATTTTGATAATATGACTAATGATGGCTTTGTTATCTCT 300
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 TGGTGGGGTGCTATGTCTTCTGATTTTGATAATATGACTAATGATGGCTTTGTTATCTCT 507
Query 301 GATCAGAAGCTTAATCAAACATTCAAAAACGCATCTTTTATTGTTCGTTTGATAGGTAAT 360
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 508 GATCAGAAGCTTAATCAAACATTCAAAAACTCATCTTTTATTGTTCGGTTGTTGGGTAAT 567
Query 361 GTTACTTGGGATAAGTTAGGTGTGGTTTCTGTGTGGGACTTACCTACTGCTTCTGATTTT 420
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568 GTTACTTGGGATAAGTTAGGTGTGGTTTCGGTTTGGGACTTACCTACTGCTTCTGATTTT 627
Query 421 GGGCATGTTCTGCT-T-T--T------GAATGC-G--A---C----G--GAATCACCTCC 458
||||||||||| || | | | |||| | | | | | ||||| |||||
Sbjct 628 GGGCATGTTCTACTCTCTAATGCGACGGAAT-CAGATACTTCAAAAGCTGAATCTCCTCC 686
Query 459 TTCAGAGGGCAATGATGTTGCTCCAGGGAAATCGAATAACACTGAGCCTTTTAAGGCTCC 518
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 687 TTCAGAGAGCAATGATGTTGCTCCAGGGAAATCGAATAACAGTGAGCCTTTTAAGGCTCC 746
Query 519 AACCATGTTTGATAATTGTAAGAAACTTTCCGATAAGTATAGGCACAGGTGGAGCTTGAA 578
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 747 TACTATGTTTGATAATTGTAAGAAACTTTCGGATAAGTATAGGCTTAGGTGGAGCTTGAA 806
Query 579 TGCAGAGAAAGGTTATGTTGATATTGGTCTAGAGGCTACTACTGGTTTATTGAACTACAT 638
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 TGCAGAGAAAGGTTATGTTGATATTGGTTTAGAGGCTACTACTGGTTTATTGAACTACAT 866
Query 639 GGCGTTTGGTTGGGCTAAACCGAATTCTACATCGAATC-TGATGTTGAATGCTGATGTTG 697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 867 GGCGTTTGGTTGGGCTAAACCGAATTCTACATCGAA-CTTGATGTTGAATGCTGATGTTG 925
Query 698 TGGTTACTGGGATTAGAGAGGATGGCTTCCCGTTTGCTGATGATTTTTATATCACGGAGT 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 926 TGGTTACTGGGATTAGAGAGGATGGCTTCCCGTTTGCTGATGATTTTTATATCACGGAGT 985
Query 758 CTAGTGTGTGCTCTGTGAAGGAAGGTACAGCTACTGGGGTTTGTCCTGACACTGTGTATG 817
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 986 CTAGTGTGTGTTCTGTGAAGGAAGGTACAGCTACTGGGGTTTGTCCTGATACTGTGTATG 1045
Query 818 AAGAAGCAGATTCAGTTGGTTCTTCGGTGAATAACACAAAACTGGTTTACGGGCATAGGA 877
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 AAGAGGCAGATTCAGTTGGTTCTTCGGTGAATAATACAAAACTGGTTTACGGGCATAGGA 1105
Query 878 TAGATGGAGTTTCGTTTGTTAGGTATAGGAGACCGTTGAATGATAGTGATAATAAGTTTG 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 TAGATGGAGTTTCGTTTGTTAGGTATAGGAGACCGTTGAATGATAGTGATAATAAGTTTG 1165
Query 938 ATTTTCCTGTGAATTCAACTGAAAATCTGACAGTTATTTGGGCACTTGGGGTGATAAAAC 997
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 ATTTTCCTGTGAATTCAACTGAAAGCCTGACAGTTATTTGGGCACTTGGGGTGATAAAAC 1225
Query 998 CACCAGATGTTATTAATCCTTACTATCTTCCC-GTGAATCACGGCGGTGTGGAATCAGAA 1056
| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1226 CCCCAGATGTTATTAATCCTTACTATC-TCCCTGTGAATCATGGCGGTGTGGAATCAGAA 1284
Query 1057 AACTTTGGGCATTTTTCGCTTAATCTTTCGGATCATGTGGATGAATGTTTGGGACCATTG 1116
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 AACTTTGGACATTTTTCGCTTAATCTTTCGGATCATGTGGATGAATGTTTGGGACCATTG 1344
Query 1117 GATGCAGAAAACAAGTATGATCAAGATGTGATCATTGCTGATGCCCACGCACCTCTTGTT 1176
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1345 GATGCAGACAACAAGTATGATCAAGATGTGATCATTGCTGATGCCCACGCGCCTCTTGTT 1404
Query 1177 GTCACGGCCGGACCATCTGTGCATTATCCAAACCCTCCAAATCCTTCAAAGGTTCTGTAT 1236
|||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 GTCACGGCTGGACCTTCTGTGCATTATCCGAACCCTCCTAATCCTTCAAAGGTTCTGTAT 1464
Query 1237 ATTAACAAGAAAGAAGCGCCGGTACTGAAAGTGGAAAGAGGGGTTCCTGTTAAGTTTTCA 1296
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1465 ATTAACAAGAAAGAAGCGCCGGTATTGAAAGTGGAAAGAGGGGTTCCTGTGAAGTTTTCA 1524
Query 1297 ATAGAAGCAGGACATGACGTTTCTTTCTACATAACTTCAGATTTTCTTGGTGGGAATGCT 1356
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 ATAGAAGCAGGACACGACGTTTCTTTCTACATAACTTCAGATTTTCTTGGTGGGAATGCT 1584
Query 1357 TCTTTAAGGAACAGAACTGAGACAATCTATGCGGGTGGGCAAGAAACTCATGGAGTACTG 1416
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585 TCTCTAAGGAACAGAACTGAGACAATCTATGCGGGTGGGCAAGAAACTCATGGAGTACTA 1644
Query 1417 TCGAGTCCATTGGAGCTGGTTTGGGCTCCTAATAGAAATACACCTGACCAACTGTATTAT 1476
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645 TCGAGTCCGTCAGAGCTGGTTTGGGCTCCTAATAGAAATACACCTGACCAACTGTATTAT 1704
Query 1477 CACTCAATTTTTCAAGAGAAAATGGGTTGGAAGGTTCAGGTTGTTGACGGTGGACTTTCG 1536
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1705 CACTCGATTTTTCAAGAGAAAATGGGTTGGAAGGTTCAGGTTGTTGACGGGGGACTTTCA 1764
Query 1537 GATATGTACAACAACAGTGTTAATCTAGATGATCAGCAAGTTAAGTTCTTTTGGACCATA 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 GATATGTACAACAACAGTGTTAATCTAGATGATCAGCAAGTTAAGTTCTTTTGGACCATA 1824
Query 1597 GTAGGGGATTCAATATCGATTGCAGCTCGTGGTGAGAAGAAAAGTGGGTATCTTGCAATT 1656
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1825 GTAGGGGATTCAATATCGATTGCGGCTCGTGGTGAGAAGAAAAGTGGCTATCTTGCAATT 1884
Query 1657 GGTTTCGGTAGTGAAATGACAAACAGTTATGCTTATGTTGGTTGGTTTGATAGAAATGGA 1716
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1885 GGTTTTGGTAGCGAAATGACAAACAGTTATGCTTATATTGGTTGGTTTGATAGAAATGGA 1944
Query 1717 ACAGGGCATGTAAATACTTACTGGATTGATGGAGAATCCGCTTCGGCTGTGCATCCTACA 1776
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1945 ACAGGGCATGTAAATACTTACTGGATCGATGGAGAATCCGCTTCCGCTGTGCATCCTACA 2004
Query 1777 ACCGAAAATATGACATACGTGAGATGCAAATCTGAAGAGGGAATCATCACACTGGAGTTT 1836
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2005 ACCGAAAATATGACATACGTGAGATGCAAATCCGAAGAGGGAATCATCACACTGGAATTT 2064
Query 1837 ACCCGTCCCTTGAAACCGTCATGCAGTCATCGAGATAGACCAGAATGTAAGAATATGATA 1896
|||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 ACCCGTCCTTTAAAACCATCATGCAGTCATCGAGATAGACCAGAATGTAAGAATATGATT 2124
Query 1897 GATCCCACAACTCCTCTTAAAGTGATATGGGCAATGGGTGCTAAATGGACAGATGGTCAG 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 GATCCCACAACTCCTCTTAAAGTGATATGGGCAATGGGTGCTAAATGGACAGATGGTCAG 2184
Query 1957 TTGACTGAGAGAAATATGCACTCGGTTACAAGTCAGAGACCTGTCCGTGTAATGTTAACA 2016
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2185 TTGACTGAGAGAAACATGCACTCGGTTACAAGTCAGAGACCTGTCCGTGTAATGTTAACA 2244
Query 2017 CGTGGATCCGCAGAAGCAGATCAAGATCTAAGACCGGTCCTGGGGGTTCATGGATTTATG 2076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2245 CGTGGATCCGCAGAAGCAGATCAAGATCTAAGACCGGTCCTGGGGGTTCATGGATTTATG 2304
Query 2077 ATGTTCCTTGCTTGGGGAATTCTGCTTCCCGGTGGAATATTATCTGCTAGATACCTGAAA 2136
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2305 ATGTTCCTTGCTTGGGGAATTCTGCTTCCAGGTGGAATATTATCCGCTAGATACCTGAAA 2364
Query 2137 CACATAAAAGGCGATGGCTGGTTCAAGATTCATATGTATCTTCAATGTTCTGGACTAGCC 2196
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 CACATAAAAGGTGATGGCTGGTTCAAGATTCATATGTATCTTCAATGTTCTGGACTAGCC 2424
Query 2197 ATTGTCTTCCTCGGCCTCCTCTTCGCAGTAGCTGAGCTTAATGGTTTCAGCTTCAGTTCA 2256
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2425 ATTGTCTTCCTAGGCCTCCTCTTCGCAGTAGCTGAGCTCAACGGTTTCAGCTTCAGTTCA 2484
Query 2257 ACCCACGTCAAGTTCGGTTTCACAGCTATAGTTTTAGCTTGCGCTCAGCCCGTGAACGCT 2316
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485 ACCCACGTAAAGTTCGGTTTCACAGCCATAGTTTTAGCTTGCGCTCAGCCCGTGAACGCT 2544
Query 2317 TGGCTAAGACCTGCGAAACCTGCTCAAGGAGAATTAATCTCTTCAAAGCGGTTAATCTGG 2376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2545 TGGCTAAGACCTGCGAAACCTGCTCAAGGAGAATTAATCTCTTCGAAGCGGTTAATCTGG 2604
Query 2377 GAGTATTCTCATTCGATCATCGGTCAATCAGCTGTTGTAATTGGAGTTGTCGCGCTTTTC 2436
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 2605 GAGTATTCTCATTCGATTGTCGGTCAATCAGCTGTTGTAGTTGGAGTTGTGGCGCTTTTC 2664
Query 2437 ACGGGAATGAAACATCTAGGAGAAAGGAATGGAACTGAAAACGTGGACGGGCTTAACTTG 2496
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACGGGAATGAAACATCTGGGAGAAAGGAATGGAACTGAGAACGTGGACGGGCTTAACTTG 2724
Query 2497 GCCCTGGGGTTATGGGTCTTCCTCTGTGTGGTTACTGTTGCGTATTTGGAGTACCGGGAA 2556
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2725 GCCCTCGGGTTATGGGTCTTCCTCTGTGTGGTTACTGTTGCGTATTTGGAGTACCGGGAA 2784
Query 2557 CGAAGAAGAAGAAAAGCGAGGAATCTAAGCAGAGGGAATTGGGTTTTGGGGAATGTTGAA 2616
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2785 AGAGGAAGAAGAAGAGCGAGGAATCTAAGCAGAGGAAATTGGGTTTTGGGGAATGTGGAA 2844
Query 2617 GAAGATGATTCGATTGATCTAATAGACTCAAGAGGAGGTTTCAGAGATAAAGATGATGAA 2676
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2845 GAAGATGATTCCATTGATCTAATAGACTCAAGAGGAGGTTTCAGAGATAAAGATGATGAA 2904
Query 2677 GATAGAAATGGAGGGAGGATGGAAATTCAGTTAGAGCCGTTGAAATAATAGTA--ttttt 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2905 GATAGAAATGGAGGGAGGATGGAAATTCAGTTAGAGCCGTTGAAATAATAGTAACTTTTT 2964
Query 2735 ttt 2737
|||
Sbjct 2965 TTT 2967
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 136353751074
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5