BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg952160
Length=1596
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-... 2567 0.0
AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-... 2218 0.0
AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-... 2119 0.0
> AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-12535399
FORWARD LENGTH=3324
Length=3324
Score = 2567 bits (1390), Expect = 0.0
Identities = 1529/1597 (96%), Gaps = 5/1597 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGGTAGGGTCGGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATCTTGCAG 60
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||
Sbjct 1454 TTGGCAGGGTCGGTAATCGAATGATGGAAGGAGGTACGGGTCACCCGTCACATCTTGCAG 1513
Query 61 ACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 ACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTA 1573
Query 121 ATGACCCTTCAATGGACAGGAGCTATATGGGTAATTCATACATGAATATGCTTGAACTTC 180
||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1574 ATGACCCTTCAATGGACAGGAAC--TAT-GGTAATTCATACATGAATATGCTTGAAATTC 1630
Query 181 AGAGGGCTTATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTC 240
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1631 AGAGGGCTTATCTCGGATCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGCC 1690
Query 241 CTAACAGCCATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCA 300
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 CTAACAGCCATAGCTATTATGGCAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCA 1750
Query 301 GCCCATTGGCTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGAC 360
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1751 GCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTACAGCCCTATGAGAC 1810
Query 361 GAGGTGAAGTTAATATGCGATAT-CCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATG 419
|||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1811 GAGGTGAAGTAAATATGCGATATCCCG-CTGCAACAAGAAACTATACTGGAGGGGTAATG 1869
Query 420 GGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAG 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 GGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGATTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAG 1929
Query 480 TTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAG 539
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1930 TTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGGTTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAG 1989
Query 540 TTCAGTTCGGATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACT 599
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 TTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACT 2049
Query 600 GATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGAC 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2050 GATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAAAAGCTCTTGCCCTGATGACTGAC 2109
Query 660 GTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGGAGA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2110 GTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGAAGA 2169
Query 720 GAATTGGGCGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGT 779
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170 GAATTGGGAGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGT 2229
Query 780 CGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 2230 CGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATCCAAATGGTCAAA 2289
Query 840 GAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAA 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2290 GAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAA 2349
Query 900 AAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGC 959
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2350 AAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGC 2409
Query 960 CATGTTGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGTTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAA 1019
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2410 CATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAA 2469
Query 1020 CACTGCCATGACCCTGATACGCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCTACTGTTAGT 1079
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2470 CACTGCCATAACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCCACTGTTAGT 2529
Query 1080 ATGTTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAGCATGGAAAG 1139
||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2530 ATGCTGACCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAGCATGGAAAG 2589
Query 1140 CCTGATGAGCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAG 1199
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 CCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTAGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAA 2649
Query 1200 CAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2650 CAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGG 2709
Query 1260 GAATTGCTCGTGAATGAGATGCTTGGCACAACTGATGAAAATGAGCCTCTTCAGGCGATG 1319
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2710 GAATTGCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATG 2769
Query 1320 ATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTTGAGACATGCGATGACCAA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2770 ATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTGGAGACATGTGATGACCAA 2829
Query 1380 CAGCGTGAACTGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACT 1439
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||
Sbjct 2830 CAGCGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATCTGAATGCTCTAAAGAAATACACT 2889
Query 1440 TATGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTTGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATG 1499
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2890 TACGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATG 2949
Query 1500 GCTTTGCAGTCATTAACCCAGCCTCTGGTGGCTTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAA 1559
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 2950 GCTTTGCAGTCATTACCCCAGCCTCTGGTGGCGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAA 3009
Query 1560 CTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 1596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010 CTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 3046
> AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-12553433
REVERSE LENGTH=3622
Length=3622
Score = 2218 bits (1201), Expect = 0.0
Identities = 1465/1590 (92%), Gaps = 27/1590 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 13 GTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATCTTGCAGACCCGATGTATC 72
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||| |
Sbjct 1563 GTAATCGAATGATGGGAGGAGGTGCTGGTCTCCAGTCACATATGGTAGACCCAATG--T- 1619
Query 73 ATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAA 132
|| | || | | | | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1620 AT-A--AT-C-A-G-----T----ATGCTGATTCACTTGATCTTCTCAATGATCCTTCCA 1664
Query 133 TGGACAGGAGCTATATGGGT-AAT--TCATACATGAATATGCTTGAACTTCAGAGGGCTT 189
|||| |||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1665 TGGATAGGAACTTTATGGGTGGTTCATCATACATGGATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTT 1724
Query 190 ATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTCCTAACAGCC 249
|||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1725 ATCTTGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCC 1784
Query 250 ATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGG 309
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 ATAGCTATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGG 1844
Query 310 CTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACGAGG-TGAA 368
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1845 CTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACG-GGATGAA 1903
Query 369 GTTAATATGCGATATCCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATGGGTTCTTGG 428
||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1904 GTTAATATGCGATTTCCTTCTGCAACAAGAAATTATTCGGGAGGGTTAATGGGTTCTTGG 1963
Query 429 CACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGT 488
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1964 CACATGGATGCTAGTTTTGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGT 2023
Query 489 AACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCG 548
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2024 AACAAAACAAGAGGATTTGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTGGAGTTCAGTTCG 2083
Query 549 GATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAA 608
|||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2084 GATCAATATGGAAGCCGCTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAA 2143
Query 609 AACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGA 668
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 AACATGGTCTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTTGTCCTGATGACTGACGTTTTTGGA 2203
Query 669 AACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGGAGAGAATTGGGC 728
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2204 AACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCACAGAGGAGAGAATT-GGC 2262
Query 729 -GAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCAT 787
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2263 AGAGAAACTCTTTGACCATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGCCGTGTCAT 2322
Query 788 CCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGA 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2323 CCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGA 2382
Query 848 TGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTAT 907
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2383 TGGACATGTAATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTAT 2442
Query 908 CGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGCCATGTTGT 967
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2443 TGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGT 2502
Query 968 GACCCTCTCCACTCACCCATACGGTTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCA 1027
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 GACCCTCTCCACTCACCCATATGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCA 2562
Query 1028 TGACCCTGATACGCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCTACTGTTAGTATGTTGGC 1087
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2563 TGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCCACTGTTAGTATGCTGGC 2622
Query 1088 CCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAGCATGGAAAGCCTGATGA 1147
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 CCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGA 2682
Query 1148 GCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTT 1207
|||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2683 GCGCACTGTGATAATCAAAGAATTGGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTT 2742
Query 1208 TGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGGGAATTGCT 1267
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 2743 CGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGAGAATTGCT 2802
Query 1268 CGTGAATGAGATGCTTGGCACAACTGATGAAAATGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGA 1327
|||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803 TGTGAATGAGATGCTGGGAACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGA 2862
Query 1328 TCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTTG-AGACATGCGATGACCAACAGCGTG 1386
|||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 2863 TCAGTTCGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTT-TTGGAGACCTGTGATGACCAACAACGTG 2921
Query 1387 AACTGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACTTATGGAA 1446
| |||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 2922 AGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTACTGCTTTAAAAAAGTACACTTATGGAA 2981
Query 1447 AGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTTGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGC 1506
||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 AGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGC 3041
Query 1507 AGTCATTAACCCAGCCTCTGGTGGCTTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAACTAGGGT 1566
|||| |||||||||| | | ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3042 AGTCCCTAACCCAGCCCCAGATGGCTTAAGACCTTAAGTAATGTACAGCTTAACTAGGGT 3101
Query 1567 GGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 1596
|||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 3102 GGATGGGGCTGCCGTAGCGTTTTGAGAATT 3131
> AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-12548494
REVERSE LENGTH=3703
Length=3703
Score = 2119 bits (1147), Expect = 0.0
Identities = 1446/1587 (91%), Gaps = 33/1587 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 13 GTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATCTTGCAGACCCGATGTATC 72
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||| |
Sbjct 1760 GTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTTCAGTCACATATGGCAGATCCAATG--T- 1816
Query 73 ATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAA 132
||| || | | | | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1817 ATC---AT-C-A-G-----T----ATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCCA 1861
Query 133 TGGACAG-GAGCTATATGGGTAATTCATACATGAATATGCTTGAACTTCAGAGGGCTTAT 191
||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1862 TGGAC-GTGAACTTTATGGGTAATTCATACATGAATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTAT 1920
Query 192 CTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTCCTAACAGCCAT 251
|| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1921 CTTGGAGCACAGAAATCACAGTACGGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCAC 1980
Query 252 AGCTATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCT 311
| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 ACCGATTATGGGAGTCCAACATTT-GG--------GTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCT 2031
Query 312 CATCCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTT 371
|||| | | |||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 CATCATCTTCTGCCTAATTCTCTTGTGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTT 2091
Query 372 AATATGCGATATCCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATGGGTTCTTGGCAC 431
|||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2092 AATATGCGATATCCCTCTGCAACAAGAAACTACGCAGGAGGGGTAATGGGTTCCTGGCAC 2151
Query 432 ATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAAC 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 ATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAAC 2211
Query 492 AAAACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGAT 551
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 AAAACAAGAGGATTCGAACTTGCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGAT 2271
Query 552 CAATACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAAC 611
|| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2272 CAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAAGTGATGAGAAAAAC 2331
Query 612 ATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAAC 671
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 ATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACACGCTCTTGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAAC 2391
Query 672 TATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGGAGAGAATTGGGC-GA 730
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||
Sbjct 2392 TATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGAAGAGAATTGG-CAGA 2450
Query 731 GAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCA 790
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2451 TAAACTCTTTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCCTACAGATGTATGGTTGTCGTGTTATTCA 2510
Query 791 GAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGG 850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2511 GAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTCGATGG 2570
Query 851 ACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGA 910
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2571 ACATGTGATGCGATGCGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGA 2630
Query 911 ATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGCCATGTTGTGAC 970
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2631 ATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAATTTATTATTTCCACCTTCTTTGGCAATGTTGTGAC 2690
Query 971 CCTCTCCACTCACCCATACGGTTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGA 1030
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2691 CCTCTCCACTCACCCATATGGGTGCCGAGTTATTCAGAGGGTATTGGAGCACTGCCATGA 2750
Query 1031 CCCTGATACGCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCTACTGTTAGTATGTTGGCCCA 1090
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||
Sbjct 2751 CCCTGATACTCAGAGTAAGGTTATGGATGAAATCATGTCAACTATTAGTATGCTGGCCCA 2810
Query 1091 AGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCG 1150
||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2811 AGATCAGTATGGAAACTATGTTATTCAGCATGTATTGGAACACGGAAAGCCTGATGAGCG 2870
Query 1151 CACCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGC 1210
|| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2871 TACTGTGATTATCAAGGAATTAGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAACAGAAGTTTGC 2930
Query 1211 ATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGGGAATTGCTCGT 1270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2931 TTCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGGGAATTTCTGGT 2990
Query 1271 GAATGAGATGCTTGGCACAACTGATGAAAATGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCA 1330
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2991 AAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCA 3050
Query 1331 GTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTT-GAGACATGCGATGACCAACAGCGTGAAC 1389
|||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3051 GTTTGCCAACTATGTAGTGCAAAAAGTT-TTAGAGACATGTGATGACCAACAGCGTGAGC 3109
Query 1390 TGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACTTATGGAAAGC 1449
|||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3110 TGATCCTTGGTCGTATTAAAGTGCATCTCAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGC 3169
Query 1450 ATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTTGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGT 1509
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3170 ATATCGTTGCTCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGGATGGCTTTGCAGT 3229
Query 1510 CATTAACCCAGCCTCTGGTGGCTTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGA 1569
| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3230 CCCTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGA 3289
Query 1570 TGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 1596
||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3290 TGGCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATT 3316
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 78814855650
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5