BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G02080.1

Length=7461
                                                                      Score        E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)     Value

  Ahg918742 jgi|Araly1|918742|scaffold_100023.1                       1.154e+04  0.0  


> Ahg918742 jgi|Araly1|918742|scaffold_100023.1
Length=7185

 Score = 1.154e+04 bits (6247),  Expect = 0.0
 Identities = 6871/7177 (96%), Gaps = 23/7177 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  157   CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT  216
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  18    CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT  77

Query  217   TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTTGTTGATTTTGGAGTCGAGACT  276
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  78    TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTGGTTGATTTTGGAGTCGAGACT  137

Query  277   AGTATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTGGATTGCTTCACCGCCCGGAGAAGCCATCCTAAT  336
             || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  138   AGCATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTCGATTGCTTCACCGTCCGGAGAAGCCATCCTAAT  197

Query  337   TCGTTGCAGCTTGAGAAAGTTGTATCCTTGCTCTTTAAACATGTGCTCAAGTTGTCAAAC  396
             |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || 
Sbjct  198   TCGTCGCAGCTTGAGAAGGTTGTATCCTTGGTCTTTAAACATGTGCTCAATTTGTCTAAT  257

Query  397   CTTGCCACCCTGCTTCCTCACGCCCTCAATGATTTTGAGCTCACTCAAGAATCCGTGGAT  456
             || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||
Sbjct  258   CTCGCCACCCTGCTTTCTCACGCCCTCAAGGATGTTGAGCTCACTCAAGATTCCGTCCAT  317

Query  457   GATTTGACTACTACTTTGAATTTTTCAATCTCTGAGAATATTGGCTTTGCTCTCGCCCTG  516
             ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| 
Sbjct  318   GATTTGACTACTTGTTTGAATTTTTCTACCTCTGAGAAAATTGGCTTTGCTCTCGCCCTC  377

Query  517   ACCGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACCACTGGACGGAACTTACTGTTGGCTCAGATT  576
             || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||| |||||
Sbjct  378   ACTGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACGGCTGGACGCAACCTACTATTGGCTGAGATT  437

Query  577   GAGCAACTCTGTGCCAATACTGGCCAGATTCTTTCATCTGAGCTAATCCATTCTGTTCTT  636
             |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||   |||||||
Sbjct  438   GAGCAACTCTCTGCCAATACTGGCCAGATTGATTCAACTGAGCAAATTCAGAATGTTCTT  497

Query  637   TCGTTTCTCCGCAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG  696
             | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498   TTGTTTCTCCACAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG  557

Query  697   TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTAACACCTATGCTTGCTCAACAA  756
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct  558   TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTTACACCTATGCTTTCTCAACAA  617

Query  757   GTTCATGAAGCTCCTGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACACTGATTCTGCTGATAACGAC  816
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| 
Sbjct  618   GTTCATGAAGCTCATGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACATTGATTCTGCTGAAAACGAG  677

Query  817   CTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAGTCAGCGTTGGAGATCTCATGGGAGAA  876
              |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  678   TTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAATCAGTGTTGGAGATCTCATGGGAGAA  737

Query  877   TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCAACAATGCAAAGAAATCTTGTCTAGTTTTGCT  936
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  738   TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCTACAATGCAAAGAAATCTTGTCTACTTTTGCT  797

Query  937   CCACTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTGTTGGCAATGTTTCTCGGACCTGTGCTGAT  996
             ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  798   CCATTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTCTTGGCAATGTTTCTCGGACATGTGCTGAT  857

Query  997   CTTGAAGATAATCAAACCACCTTTTCAACGTTTACTGTAGCCCTTGGTTCCTGCATTCCA  1056
             |||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||| |||||| || 
Sbjct  858   CTTGTAGATAATCACACCACCTTTCCAACATTCACTTTAGCCCTTGGTTGCTGCATCCCT  917

Query  1057  ACTGAACTTCCCACGCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG  1116
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918   ACTGAACTTCCCACCCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG  977

Query  1117  CTTCAGGCTCCTGGCATAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT  1176
             |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  978   CTT---GCTCCTGGCACAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT  1034

Query  1177  GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGATCTATAAAGCTGCTTGCAAG  1236
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1035  GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGCTCTATAAAGCTGCTTGCAAG  1094

Query  1237  GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGGTTCTGTCTGGAAAAATATGGATGGTCAATTA  1296
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct  1095  GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGCTTCTGTCTGGAAAAATATGGAAGGTCAAGTA  1154

Query  1297  TCCTTTCTTAAGCACGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA  1356
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1155  TCCTTTCTTAAGCATGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA  1214

Query  1357  AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCAAGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT  1416
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1215  AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCATGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT  1274

Query  1417  CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCTTGGATGTACTGTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT  1476
             |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1275  CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCCTGAATGTGCTTTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT  1334

Query  1477  GCTGTTTTAGTTAGTTCGTTACTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT  1536
             |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1335  GCTGTTTTAGTTAGCTCGTTGCTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT  1394

Query  1537  CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTGGTTTCTGCT  1596
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1395  CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTAGTTTCTGCT  1454

Query  1597  ATTCTGCCAGTGATAATAACGAGTCCCCAGGATAGTGGTTTTATCCATAATCTCTGGCAT  1656
             ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  1455  ATTCTTCCAGTGATAATAACGAATTCCCAGGATAGTGGTTTTATCCTTAATCTCTGGCAT  1514

Query  1657  CAAAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTATAGATGCCCAACATCTCAAAGCAGACAGC  1716
             || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct  1515  CAGAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTTTAGATGCCCAAAATCTTAAAGCAGACAGC  1574

Query  1717  ATGCTCCGAATAATTGAAATCTGCCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA  1776
              |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1575  TTGCTCCGAATAATTGAAATCTGTCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA  1634

Query  1777  GTTCCAGTCTCATCCAGTATCAGATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC  1836
             ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1635  GTTCCAGTCTCATTCAGTATCAAATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC  1694

Query  1837  ATTGAGAACTGGTTGCCTAACTGCTTGTATATGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGC  1896
             ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1695  ATTGAGAACTGGTTGCCAAACTGCCTGTATGTGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGT  1754

Query  1897  CTCAAATTTGTCAAAAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTCAGGGCCAAAATTTTT  1956
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||
Sbjct  1755  CTCAAATTTGTCAAGAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTTACTGCCAAAAGTTTT  1814

Query  1957  CATCCTTCTGATCCATTATCAGATCTTCATTTGGAAGCAACAACTTCCCTTTTAAAAGTT  2016
             |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||
Sbjct  1815  CATCCTTCAGATCCTTTATCAGATCTTCATCTGGATGCAACAACTTCCCTAATGAAAGTT  1874

Query  2017  TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTGGTCGAGGAGATTGAAAAAGTC  2076
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct  1875  TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTAGTCGAGGAGATTGAAAAGGTC  1934

Query  2077  AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAGCTGCAGAATGGTGAGGCTAAAGATTCATCA  2136
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1935  AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAACTGCAGAATGGCGAGGCTAAAGATTCATCA  1994

Query  2137  GCTCCCAA-TGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAGGCAAACGCATATTTTCATCAAAT  2195
             ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  1995  GC-ATCAACTGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAAGCAAACGCCTATTTCCATCAAAT  2053

Query  2196  GTTTTCTAGTCATTTGAGTGTTGACGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGAATC  2255
             |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2054  GTTTTCTAGTCAGTTGAGTGTTGATGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGACTC  2113

Query  2256  TTTGGTTCCAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAATA  2315
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2114  TTTGGTTCAAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAATA  2173

Query  2316  TCGGTTTTTCCCCAAGTATCCTGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTTC  2375
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2174  TCGGTTTTTCCCCAAGTATCCCGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTTC  2233

Query  2376  TGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCGCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTAGTGTT  2435
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2234  TGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCCCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTTGTGTT  2293

Query  2436  GGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGGA  2495
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2294  GGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGGA  2353

Query  2496  ACAGTTTGTGAATCGTCTGGTTGAATTGCCTCAATACTGTAACCATATTTTGCAAATATC  2555
             |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2354  ACAGTTCGTGAATCGTCTTGTTGAATTGCCTCAATACTGCAACCATATTTTGCAAATATC  2413

Query  2556  TCATCTGCGTAGTACTCACCCGGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGAT  2615
             |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2414  TCATCTGCGTAGCACTCACCCTGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGAT  2473

Query  2616  ATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCACACCCTGGTCCCTCACAATCTTT  2675
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct  2474  ATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCGCACCCTGGGCCCTCACAGTCTTT  2533

Query  2676  CCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAACCTGCATTACAGCTTTCTTC  2735
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |
Sbjct  2534  CCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAATCTGCATTACAGC-TTCAAC  2592

Query  2736  -------TCCCCTACAGCTTCA--ACAGAAAAATGAAGTGCCAAGTGTGCCATCTAACGA  2786
                    |    | ||  || |  || | |  |  ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2593  AGAAAAATGAAGTGCATATTGATGACCGCAGCA--AAGTGCCAAATGTGCCATCTAACGA  2650

Query  2787  GGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACTACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTAA  2846
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2651  GGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACCACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTAA  2710

Query  2847  GAATCCTGGCATTCCAACTTCTTCATCAACCTCAACTGGTTTTGTTCGTCCAGCTCGTGC  2906
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2711  GAATCCTGGCATTTCAACTTCTTCATCAACCTCCGCTGGTTTTGTTCGCCCAGCTCGTGC  2770

Query  2907  AACCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAGA  2966
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2771  AGCCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAGA  2830

Query  2967  AAGAAGGGAAAACGCAATCGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCGTTCAT  3026
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2831  AAGAAGGGAAAACGCAATTGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCTTTCAT  2890

Query  3027  AATCAATAATATCTCTACAACAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTTT  3086
             ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2891  AATTAATAATATCTCTACAGCAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTTT  2950

Query  3087  GCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCGA  3146
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2951  GCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCGA  3010

Query  3147  GCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGCTGTT  3206
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3011  GCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGTTGTT  3070

Query  3207  TAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGCTCAGAGCTCAT  3266
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3071  TAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGTTCAGAGCTCAT  3130

Query  3267  AAAGTCGAGTTCTGAAGAGCGTTCTCTTCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAGGTT  3326
             |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  3131  AAAGTCAAGTTCAGAAGAGCGATCTCTGCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAAGTT  3190

Query  3327  GACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTGT  3386
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3191  GACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTGT  3250

Query  3387  GGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCAGTCATTCCGTTCACTTCAAAGGTTCTGGA  3446
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3251  GGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCGGTCATTCCATTCACTTCAAAGGTTCTGGA  3310

Query  3447  GCCATGCCAAAACAGTATTGCTTATCAACCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTAGG  3506
             ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  3311  GCCATGCCAAAACAGTATTGCGTATCAGCCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTTGG  3370

Query  3507  GTTGCTTGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAGA  3566
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3371  GTTGCTCGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAGA  3430

Query  3567  GGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAAATGAAGGAAGTAGTGCCAACTTCCCTTCTAAA  3626
             |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  3431  GGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAGGTGAAGGAAGTAGCGCCAACTTCCCTTCTAAA  3490

Query  3627  GGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGCAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCCTGGAGTAAC  3686
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3491  GGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGGAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCTTGGAGTAAC  3550

Query  3687  ACAGATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAACAAAT  3746
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  3551  ACAAATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAGCAAAT  3610

Query  3747  TGACCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCGCCTAATACAGATGTTCCCTCGAAGTTATTATC  3806
              || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3611  CGATCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCACCTAATACAGACGTTCCCTCGAAGTTATTATC  3670

Query  3807  ACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGAGGAGAAAGTAGC  3866
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct  3671  ACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGACGAGAAAGTGGC  3730

Query  3867  AACTCTTGGCTTGCCAGAACAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCATC  3926
             |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3731  AACTCTAGGCTTGCCTGAGCAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCATC  3790

Query  3927  GCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAATATTGGAAATCATGTTGT  3986
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3791  CCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAACATTGGAAATCATGTTGT  3850

Query  3987  TATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAAAGAGTGGTACCACT  4046
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3851  TATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAGAGAGTGGTACCACT  3910

Query  4047  TGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTAT  4106
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3911  TGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTAT  3970

Query  4107  TGCATGCCAAACAACAAAGGAGCTTGTGCTAAAGGATTACGCCCTGGAACCCGATGAGTC  4166
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3971  TGCATGCCAAACAACAAAAGAGCTTGTGCTAAAGGATTATGCCCTGGAACCCGATGAGTC  4030

Query  4167  ACGTATTTATAATGCAGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATGT  4226
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4031  ACGTATTTATAATGCCGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATGT  4090

Query  4227  GACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTTCAGGG  4286
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4091  GACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTCCAGGG  4150

Query  4287  TCTGAATATTTCAAATGATGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACCAATGACAACCT  4346
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  4151  TCTGAATATTTCAAATGACGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACAAATGACAACCT  4210

Query  4347  GGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCTGCTACAGAAAAGGCAATACAAACAATTGA  4406
              ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  4211  TGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCGGCTACAGAGAAGGCAATACAAACAATTGA  4270

Query  4407  TGCGGACATTGCTCAACAATTGTTGTTACGGAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCTC  4466
             |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4271  TGCGGACATTGCACAGCAATTGTTGTTACGCAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCTC  4330

Query  4467  CTTTTTCGATCCAAACATTCTATCACAGAATTCCGTCAGTTTTATACCCGAATCCCTCCG  4526
             |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  4331  CTTTTTTGATCCAAACATTCTAGGACAAAATTCCGTCAGTTTTATACCTGAATCCCTCCG  4390

Query  4527  TCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGAGAGTTTATGAGGACTTTGTTCAACA  4586
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  4391  TCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGCGAGTTTATGAGGATTTTGTTCAACA  4450

Query  4587  TCCTTGGCAAAAGCAGTCGACCCAAACTTCACACGGTTTATCTGCTGCATCAAGCTCATC  4646
             ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  4451  TCCTTGGCAGAAGCAGTCGACCCAAACGTCACACGGTTTATCTACTGCATCAAGCTCATC  4510

Query  4647  TGGTGATGTTGCGCTTGGTAGTGGTTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCTTCTGAATT  4706
             ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  4511  TGGCGATGTTGCGCTTGGTAGTGGGTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCGTCTGAATT  4570

Query  4707  TTTGTCTAATGCTGGAAACGCTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCATCAGATATTTCTGT  4766
             |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  4571  TTTGTCTAGTGCTGGAAACACTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCAACAGATATTTCTGT  4630

Query  4767  GGATGGTTTTGAATCTTCTCCAGTCTCACTTTTGAGCTCACAAGTCGATCCAGCTGGTGA  4826
             |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  4631  GGATGGTTTTGAATCTTCCCCAGTCTCACTTTTAAGCTCACAAGTTGATCCAGCTGGTGA  4690

Query  4827  CTCATCCAGTCTTCAATTTACTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAATC  4886
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4691  CTCATCCAGTCTTCAATTTTCTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAATC  4750

Query  4887  CTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTTCAGCTGCTAC  4946
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||
Sbjct  4751  CTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTT---CTGCTAC  4807

Query  4947  CATGGAACGACTTGGTGCTAGTAATATTACACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCACT  5006
             |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4808  CATGGAACGACTTGGTGGAAATAATATTATACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCACT  4867

Query  5007  GGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAGA  5066
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4868  GGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAGA  4927

Query  5067  TGATGAAATCCAGGCCGTAATTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCAG  5126
             ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4928  TGACGAAATCCAGGCCGTAGTTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCAG  4987

Query  5127  AGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCTCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTACGAGAATGCATC  5186
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  4988  AGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCCCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTATGAGAATGCATC  5047

Query  5187  AAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATCCGTGATGTTTGCAA  5246
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  5048  AAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATTCGTGATGTTTGCAA  5107

Query  5247  GCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTGATTTATTCAGAGGAGGATCGGAAGCTCAA  5306
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  5108  GCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTTATTTATTCAGAGGAGGAGCGGAAGCTCAA  5167

Query  5307  CAAAGATATTACTATTGGTCTTATCCAGCGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATGT  5366
             ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5168  CAAAGATATTACTATTGGTCTAATCCAACGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATGT  5227

Query  5367  CCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGACCGCAACTGACTTTGCTATTTC  5426
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  5228  CCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGAGCGCAACTGACTTTGCTATTTC  5287

Query  5427  TCTACTCCAATCCTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTGT  5486
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5288  TCTACTCCAATCTTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTGT  5347

Query  5487  TGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCTTCTGAGTCATTGCAACAGCTAAT  5546
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
Sbjct  5348  TGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCGCCTGAGTCATTGCAACAGCTAAT  5407

Query  5547  TGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAAA  5606
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5408  TGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAAA  5467

Query  5607  TGATAACAACGATAGGCAAAAGGATGAGAAGGTTGCGTGC-A-A-CACCACTAACACAGA  5663
             ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct  5468  TGACAACAATGATAGGCAAAAGGATGAAAAGGTTGCGTGCAATATCACCACTAACACAGA  5527

Query  5664  AGAGAGTACCAGCTTGGATTATGTGGAATCAGATCCTGCGGGTTTCCAGAATCGGGTGTC  5723
             ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  5528  AGAGAATACCAGCTTGGATTATGTGGAATTAGATCCTGCGGTTTTCCAGAATCGGGTGTC  5587

Query  5724  CACGCTATTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCATG  5783
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  5588  CACGCTTTTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCTTG  5647

Query  5784  TTCACAATATGTCCTGCATTTGCACCAGACTGGATTACTTAAGGGAGATGATACAACAGA  5843
             ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5648  TTCACAATACGTCTTGCATTTGCATCAGACTGGACTACTTAAGGGAGATGATACAACAGA  5707

Query  5844  GAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATAT  5903
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5708  GAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATAT  5767

Query  5904  TAATTCCGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTGA  5963
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5768  TAATTCTGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTGA  5827

Query  5964  TATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCAG  6023
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5828  TATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCAG  5887

Query  6024  TAGGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGACACAGTGAGATTTATTCAAAAGGACGC  6083
              | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  5888  CAAGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGCCACAGTGAGATTTATTCACAAGGACGC  5947

Query  6084  AGAAGATAAAAAGACATCACTCAATTCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGCT  6143
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5948  AGAAGATAAAAAGACATCACTCAATCCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGCT  6007

Query  6144  ACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAGC  6203
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6008  ACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAGC  6067

Query  6204  TTTTGCCAACGCCTTCCACGCATTGCAGCCTCTTAAGATTCCTGCTTTCAGTTTTGCATG  6263
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct  6068  TTTTGCCAACGCCTTCCACGCGTTGCAGCCTCTTAAGATACCTGCTTTCAGCTTTGCATG  6127

Query  6264  GCTAGAACTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGAA  6323
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6128  GCTAGAGCTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGAA  6187

Query  6324  GGGTTGGCCATATGTTCAGCGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTTT  6383
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6188  GGGTTGGCCATATGTTCAACGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTTT  6247

Query  6384  AAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCGGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTATT  6443
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  6248  AAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCAGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTGTT  6307

Query  6444  ACTGGTTCTGCTTCATGATTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGA  6503
             |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6308  ACTGGTGCTGCTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGA  6367

Query  6504  TGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCACGGAA  6563
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  6368  TGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCGCGGAA  6427

Query  6564  CATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTACCTGAGATAGT  6623
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  6428  CATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTGCCTGAGATAGT  6487

Query  6624  AGAAGCTCCCTGTATCCTTTCTGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGAA  6683
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6488  AGAAGCTCCCTGTATCCTTTCCGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGAA  6547

Query  6684  TGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAA  6743
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6548  TGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAA  6607

Query  6744  GACAAAGTTACTTCTATCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTACC  6803
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6608  GACAAAGTTACTTCTGTCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTACC  6667

Query  6804  ATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCGG  6863
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6668  ATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCGG  6727

Query  6864  TGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACT  6923
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6728  TGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACT  6787

Query  6924  TGATACGGAAGGGCGGTATCTGTTCCTTAATGCAATCGCCAATCAGCTTCGATACCCCAA  6983
             |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct  6788  TGATACTGAAGGGCGGTACCTGTTCCTAAATGCAATAGCCAATCAGCTTCGATATCCCAA  6847

Query  6984  CAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTATTCTTCGAATCTGATCAGGA  7043
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct  6848  CAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTGTTCTTCGAATCTGACCAGGA  6907

Query  7044  GATCATACAGGAGCAAATAACTAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCACA  7103
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6908  GATCATACAGGAGCAAATAACAAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCACA  6967

Query  7104  TCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATAGCTTCTG  7163
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  6968  TCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATGGCTTCTG  7027

Query  7164  GAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTGTTTGAATCGGTAGCCAG  7223
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  7028  GAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTCTTTGAATCGGTAGCCAG  7087

Query  7224  ATCCTGTGGTGGCCTGAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTTTCGGGAGGTTGGGTCTCAGA  7283
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  7088  ATCCTGTGGTGGCCTTAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTCTCGGGAGGTTGGGTCTCAGA  7147

Query  7284  CAATTCTCACTAGCTCTTTAGCTTTCAACTTGTATAT  7320
             ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  7148  CAATTCTCATTAGCTCTCTAGCTTTCAACTTGTATAT  7184



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 282919997682


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5