BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G02080.1 Length=7461 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg918742 jgi|Araly1|918742|scaffold_100023.1 1.154e+04 0.0 > Ahg918742 jgi|Araly1|918742|scaffold_100023.1 Length=7185 Score = 1.154e+04 bits (6247), Expect = 0.0 Identities = 6871/7177 (96%), Gaps = 23/7177 (0%) Strand=Plus/Plus Query 157 CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT 216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 18 CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT 77 Query 217 TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTTGTTGATTTTGGAGTCGAGACT 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 78 TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTGGTTGATTTTGGAGTCGAGACT 137 Query 277 AGTATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTGGATTGCTTCACCGCCCGGAGAAGCCATCCTAAT 336 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 138 AGCATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTCGATTGCTTCACCGTCCGGAGAAGCCATCCTAAT 197 Query 337 TCGTTGCAGCTTGAGAAAGTTGTATCCTTGCTCTTTAAACATGTGCTCAAGTTGTCAAAC 396 |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 198 TCGTCGCAGCTTGAGAAGGTTGTATCCTTGGTCTTTAAACATGTGCTCAATTTGTCTAAT 257 Query 397 CTTGCCACCCTGCTTCCTCACGCCCTCAATGATTTTGAGCTCACTCAAGAATCCGTGGAT 456 || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || Sbjct 258 CTCGCCACCCTGCTTTCTCACGCCCTCAAGGATGTTGAGCTCACTCAAGATTCCGTCCAT 317 Query 457 GATTTGACTACTACTTTGAATTTTTCAATCTCTGAGAATATTGGCTTTGCTCTCGCCCTG 516 |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 318 GATTTGACTACTTGTTTGAATTTTTCTACCTCTGAGAAAATTGGCTTTGCTCTCGCCCTC 377 Query 517 ACCGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACCACTGGACGGAACTTACTGTTGGCTCAGATT 576 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||| Sbjct 378 ACTGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACGGCTGGACGCAACCTACTATTGGCTGAGATT 437 Query 577 GAGCAACTCTGTGCCAATACTGGCCAGATTCTTTCATCTGAGCTAATCCATTCTGTTCTT 636 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||| Sbjct 438 GAGCAACTCTCTGCCAATACTGGCCAGATTGATTCAACTGAGCAAATTCAGAATGTTCTT 497 Query 637 TCGTTTCTCCGCAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG 696 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 498 TTGTTTCTCCACAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG 557 Query 697 TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTAACACCTATGCTTGCTCAACAA 756 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct 558 TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTTACACCTATGCTTTCTCAACAA 617 Query 757 GTTCATGAAGCTCCTGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACACTGATTCTGCTGATAACGAC 816 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct 618 GTTCATGAAGCTCATGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACATTGATTCTGCTGAAAACGAG 677 Query 817 CTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAGTCAGCGTTGGAGATCTCATGGGAGAA 876 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 678 TTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAATCAGTGTTGGAGATCTCATGGGAGAA 737 Query 877 TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCAACAATGCAAAGAAATCTTGTCTAGTTTTGCT 936 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 738 TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCTACAATGCAAAGAAATCTTGTCTACTTTTGCT 797 Query 937 CCACTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTGTTGGCAATGTTTCTCGGACCTGTGCTGAT 996 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 798 CCATTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTCTTGGCAATGTTTCTCGGACATGTGCTGAT 857 Query 997 CTTGAAGATAATCAAACCACCTTTTCAACGTTTACTGTAGCCCTTGGTTCCTGCATTCCA 1056 |||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||| |||||| || Sbjct 858 CTTGTAGATAATCACACCACCTTTCCAACATTCACTTTAGCCCTTGGTTGCTGCATCCCT 917 Query 1057 ACTGAACTTCCCACGCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG 1116 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 918 ACTGAACTTCCCACCCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG 977 Query 1117 CTTCAGGCTCCTGGCATAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT 1176 ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 978 CTT---GCTCCTGGCACAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT 1034 Query 1177 GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGATCTATAAAGCTGCTTGCAAG 1236 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1035 GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGCTCTATAAAGCTGCTTGCAAG 1094 Query 1237 GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGGTTCTGTCTGGAAAAATATGGATGGTCAATTA 1296 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct 1095 GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGCTTCTGTCTGGAAAAATATGGAAGGTCAAGTA 1154 Query 1297 TCCTTTCTTAAGCACGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA 1356 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1155 TCCTTTCTTAAGCATGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA 1214 Query 1357 AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCAAGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT 1416 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1215 AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCATGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT 1274 Query 1417 CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCTTGGATGTACTGTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT 1476 |||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1275 CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCCTGAATGTGCTTTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT 1334 Query 1477 GCTGTTTTAGTTAGTTCGTTACTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT 1536 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1335 GCTGTTTTAGTTAGCTCGTTGCTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT 1394 Query 1537 CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTGGTTTCTGCT 1596 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1395 CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTAGTTTCTGCT 1454 Query 1597 ATTCTGCCAGTGATAATAACGAGTCCCCAGGATAGTGGTTTTATCCATAATCTCTGGCAT 1656 ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1455 ATTCTTCCAGTGATAATAACGAATTCCCAGGATAGTGGTTTTATCCTTAATCTCTGGCAT 1514 Query 1657 CAAAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTATAGATGCCCAACATCTCAAAGCAGACAGC 1716 || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct 1515 CAGAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTTTAGATGCCCAAAATCTTAAAGCAGACAGC 1574 Query 1717 ATGCTCCGAATAATTGAAATCTGCCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA 1776 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1575 TTGCTCCGAATAATTGAAATCTGTCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA 1634 Query 1777 GTTCCAGTCTCATCCAGTATCAGATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC 1836 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1635 GTTCCAGTCTCATTCAGTATCAAATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC 1694 Query 1837 ATTGAGAACTGGTTGCCTAACTGCTTGTATATGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGC 1896 ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1695 ATTGAGAACTGGTTGCCAAACTGCCTGTATGTGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGT 1754 Query 1897 CTCAAATTTGTCAAAAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTCAGGGCCAAAATTTTT 1956 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| Sbjct 1755 CTCAAATTTGTCAAGAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTTACTGCCAAAAGTTTT 1814 Query 1957 CATCCTTCTGATCCATTATCAGATCTTCATTTGGAAGCAACAACTTCCCTTTTAAAAGTT 2016 |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| Sbjct 1815 CATCCTTCAGATCCTTTATCAGATCTTCATCTGGATGCAACAACTTCCCTAATGAAAGTT 1874 Query 2017 TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTGGTCGAGGAGATTGAAAAAGTC 2076 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 1875 TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTAGTCGAGGAGATTGAAAAGGTC 1934 Query 2077 AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAGCTGCAGAATGGTGAGGCTAAAGATTCATCA 2136 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1935 AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAACTGCAGAATGGCGAGGCTAAAGATTCATCA 1994 Query 2137 GCTCCCAA-TGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAGGCAAACGCATATTTTCATCAAAT 2195 || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| Sbjct 1995 GC-ATCAACTGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAAGCAAACGCCTATTTCCATCAAAT 2053 Query 2196 GTTTTCTAGTCATTTGAGTGTTGACGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGAATC 2255 |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2054 GTTTTCTAGTCAGTTGAGTGTTGATGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGACTC 2113 Query 2256 TTTGGTTCCAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAATA 2315 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2114 TTTGGTTCAAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAATA 2173 Query 2316 TCGGTTTTTCCCCAAGTATCCTGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTTC 2375 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2174 TCGGTTTTTCCCCAAGTATCCCGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTTC 2233 Query 2376 TGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCGCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTAGTGTT 2435 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2234 TGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCCCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTTGTGTT 2293 Query 2436 GGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGGA 2495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2294 GGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGGA 2353 Query 2496 ACAGTTTGTGAATCGTCTGGTTGAATTGCCTCAATACTGTAACCATATTTTGCAAATATC 2555 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2354 ACAGTTCGTGAATCGTCTTGTTGAATTGCCTCAATACTGCAACCATATTTTGCAAATATC 2413 Query 2556 TCATCTGCGTAGTACTCACCCGGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGAT 2615 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2414 TCATCTGCGTAGCACTCACCCTGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGAT 2473 Query 2616 ATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCACACCCTGGTCCCTCACAATCTTT 2675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| Sbjct 2474 ATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCGCACCCTGGGCCCTCACAGTCTTT 2533 Query 2676 CCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAACCTGCATTACAGCTTTCTTC 2735 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | Sbjct 2534 CCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAATCTGCATTACAGC-TTCAAC 2592 Query 2736 -------TCCCCTACAGCTTCA--ACAGAAAAATGAAGTGCCAAGTGTGCCATCTAACGA 2786 | | || || | || | | | ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2593 AGAAAAATGAAGTGCATATTGATGACCGCAGCA--AAGTGCCAAATGTGCCATCTAACGA 2650 Query 2787 GGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACTACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTAA 2846 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2651 GGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACCACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTAA 2710 Query 2847 GAATCCTGGCATTCCAACTTCTTCATCAACCTCAACTGGTTTTGTTCGTCCAGCTCGTGC 2906 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2711 GAATCCTGGCATTTCAACTTCTTCATCAACCTCCGCTGGTTTTGTTCGCCCAGCTCGTGC 2770 Query 2907 AACCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAGA 2966 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2771 AGCCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAGA 2830 Query 2967 AAGAAGGGAAAACGCAATCGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCGTTCAT 3026 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2831 AAGAAGGGAAAACGCAATTGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCTTTCAT 2890 Query 3027 AATCAATAATATCTCTACAACAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTTT 3086 ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2891 AATTAATAATATCTCTACAGCAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTTT 2950 Query 3087 GCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCGA 3146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2951 GCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCGA 3010 Query 3147 GCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGCTGTT 3206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3011 GCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGTTGTT 3070 Query 3207 TAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGCTCAGAGCTCAT 3266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3071 TAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGTTCAGAGCTCAT 3130 Query 3267 AAAGTCGAGTTCTGAAGAGCGTTCTCTTCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAGGTT 3326 |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3131 AAAGTCAAGTTCAGAAGAGCGATCTCTGCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAAGTT 3190 Query 3327 GACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTGT 3386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3191 GACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTGT 3250 Query 3387 GGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCAGTCATTCCGTTCACTTCAAAGGTTCTGGA 3446 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3251 GGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCGGTCATTCCATTCACTTCAAAGGTTCTGGA 3310 Query 3447 GCCATGCCAAAACAGTATTGCTTATCAACCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTAGG 3506 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3311 GCCATGCCAAAACAGTATTGCGTATCAGCCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTTGG 3370 Query 3507 GTTGCTTGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAGA 3566 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3371 GTTGCTCGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAGA 3430 Query 3567 GGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAAATGAAGGAAGTAGTGCCAACTTCCCTTCTAAA 3626 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3431 GGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAGGTGAAGGAAGTAGCGCCAACTTCCCTTCTAAA 3490 Query 3627 GGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGCAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCCTGGAGTAAC 3686 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3491 GGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGGAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCTTGGAGTAAC 3550 Query 3687 ACAGATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAACAAAT 3746 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3551 ACAAATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAGCAAAT 3610 Query 3747 TGACCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCGCCTAATACAGATGTTCCCTCGAAGTTATTATC 3806 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3611 CGATCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCACCTAATACAGACGTTCCCTCGAAGTTATTATC 3670 Query 3807 ACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGAGGAGAAAGTAGC 3866 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 3671 ACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGACGAGAAAGTGGC 3730 Query 3867 AACTCTTGGCTTGCCAGAACAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCATC 3926 |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3731 AACTCTAGGCTTGCCTGAGCAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCATC 3790 Query 3927 GCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAATATTGGAAATCATGTTGT 3986 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3791 CCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAACATTGGAAATCATGTTGT 3850 Query 3987 TATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAAAGAGTGGTACCACT 4046 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3851 TATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAGAGAGTGGTACCACT 3910 Query 4047 TGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTAT 4106 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3911 TGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTAT 3970 Query 4107 TGCATGCCAAACAACAAAGGAGCTTGTGCTAAAGGATTACGCCCTGGAACCCGATGAGTC 4166 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3971 TGCATGCCAAACAACAAAAGAGCTTGTGCTAAAGGATTATGCCCTGGAACCCGATGAGTC 4030 Query 4167 ACGTATTTATAATGCAGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATGT 4226 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4031 ACGTATTTATAATGCCGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATGT 4090 Query 4227 GACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTTCAGGG 4286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4091 GACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTCCAGGG 4150 Query 4287 TCTGAATATTTCAAATGATGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACCAATGACAACCT 4346 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4151 TCTGAATATTTCAAATGACGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACAAATGACAACCT 4210 Query 4347 GGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCTGCTACAGAAAAGGCAATACAAACAATTGA 4406 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4211 TGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCGGCTACAGAGAAGGCAATACAAACAATTGA 4270 Query 4407 TGCGGACATTGCTCAACAATTGTTGTTACGGAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCTC 4466 |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4271 TGCGGACATTGCACAGCAATTGTTGTTACGCAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCTC 4330 Query 4467 CTTTTTCGATCCAAACATTCTATCACAGAATTCCGTCAGTTTTATACCCGAATCCCTCCG 4526 |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4331 CTTTTTTGATCCAAACATTCTAGGACAAAATTCCGTCAGTTTTATACCTGAATCCCTCCG 4390 Query 4527 TCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGAGAGTTTATGAGGACTTTGTTCAACA 4586 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4391 TCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGCGAGTTTATGAGGATTTTGTTCAACA 4450 Query 4587 TCCTTGGCAAAAGCAGTCGACCCAAACTTCACACGGTTTATCTGCTGCATCAAGCTCATC 4646 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4451 TCCTTGGCAGAAGCAGTCGACCCAAACGTCACACGGTTTATCTACTGCATCAAGCTCATC 4510 Query 4647 TGGTGATGTTGCGCTTGGTAGTGGTTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCTTCTGAATT 4706 ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4511 TGGCGATGTTGCGCTTGGTAGTGGGTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCGTCTGAATT 4570 Query 4707 TTTGTCTAATGCTGGAAACGCTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCATCAGATATTTCTGT 4766 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4571 TTTGTCTAGTGCTGGAAACACTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCAACAGATATTTCTGT 4630 Query 4767 GGATGGTTTTGAATCTTCTCCAGTCTCACTTTTGAGCTCACAAGTCGATCCAGCTGGTGA 4826 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4631 GGATGGTTTTGAATCTTCCCCAGTCTCACTTTTAAGCTCACAAGTTGATCCAGCTGGTGA 4690 Query 4827 CTCATCCAGTCTTCAATTTACTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAATC 4886 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4691 CTCATCCAGTCTTCAATTTTCTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAATC 4750 Query 4887 CTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTTCAGCTGCTAC 4946 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4751 CTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTT---CTGCTAC 4807 Query 4947 CATGGAACGACTTGGTGCTAGTAATATTACACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCACT 5006 ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4808 CATGGAACGACTTGGTGGAAATAATATTATACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCACT 4867 Query 5007 GGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAGA 5066 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4868 GGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAGA 4927 Query 5067 TGATGAAATCCAGGCCGTAATTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCAG 5126 ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4928 TGACGAAATCCAGGCCGTAGTTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCAG 4987 Query 5127 AGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCTCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTACGAGAATGCATC 5186 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4988 AGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCCCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTATGAGAATGCATC 5047 Query 5187 AAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATCCGTGATGTTTGCAA 5246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 5048 AAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATTCGTGATGTTTGCAA 5107 Query 5247 GCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTGATTTATTCAGAGGAGGATCGGAAGCTCAA 5306 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5108 GCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTTATTTATTCAGAGGAGGAGCGGAAGCTCAA 5167 Query 5307 CAAAGATATTACTATTGGTCTTATCCAGCGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATGT 5366 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5168 CAAAGATATTACTATTGGTCTAATCCAACGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATGT 5227 Query 5367 CCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGACCGCAACTGACTTTGCTATTTC 5426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 5228 CCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGAGCGCAACTGACTTTGCTATTTC 5287 Query 5427 TCTACTCCAATCCTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTGT 5486 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5288 TCTACTCCAATCTTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTGT 5347 Query 5487 TGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCTTCTGAGTCATTGCAACAGCTAAT 5546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 5348 TGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCGCCTGAGTCATTGCAACAGCTAAT 5407 Query 5547 TGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAAA 5606 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5408 TGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAAA 5467 Query 5607 TGATAACAACGATAGGCAAAAGGATGAGAAGGTTGCGTGC-A-A-CACCACTAACACAGA 5663 ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct 5468 TGACAACAATGATAGGCAAAAGGATGAAAAGGTTGCGTGCAATATCACCACTAACACAGA 5527 Query 5664 AGAGAGTACCAGCTTGGATTATGTGGAATCAGATCCTGCGGGTTTCCAGAATCGGGTGTC 5723 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 5528 AGAGAATACCAGCTTGGATTATGTGGAATTAGATCCTGCGGTTTTCCAGAATCGGGTGTC 5587 Query 5724 CACGCTATTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCATG 5783 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5588 CACGCTTTTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCTTG 5647 Query 5784 TTCACAATATGTCCTGCATTTGCACCAGACTGGATTACTTAAGGGAGATGATACAACAGA 5843 ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5648 TTCACAATACGTCTTGCATTTGCATCAGACTGGACTACTTAAGGGAGATGATACAACAGA 5707 Query 5844 GAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATAT 5903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5708 GAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATAT 5767 Query 5904 TAATTCCGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTGA 5963 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5768 TAATTCTGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTGA 5827 Query 5964 TATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCAG 6023 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5828 TATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCAG 5887 Query 6024 TAGGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGACACAGTGAGATTTATTCAAAAGGACGC 6083 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 5888 CAAGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGCCACAGTGAGATTTATTCACAAGGACGC 5947 Query 6084 AGAAGATAAAAAGACATCACTCAATTCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGCT 6143 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5948 AGAAGATAAAAAGACATCACTCAATCCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGCT 6007 Query 6144 ACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAGC 6203 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6008 ACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAGC 6067 Query 6204 TTTTGCCAACGCCTTCCACGCATTGCAGCCTCTTAAGATTCCTGCTTTCAGTTTTGCATG 6263 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 6068 TTTTGCCAACGCCTTCCACGCGTTGCAGCCTCTTAAGATACCTGCTTTCAGCTTTGCATG 6127 Query 6264 GCTAGAACTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGAA 6323 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6128 GCTAGAGCTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGAA 6187 Query 6324 GGGTTGGCCATATGTTCAGCGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTTT 6383 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6188 GGGTTGGCCATATGTTCAACGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTTT 6247 Query 6384 AAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCGGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTATT 6443 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 6248 AAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCAGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTGTT 6307 Query 6444 ACTGGTTCTGCTTCATGATTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGA 6503 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6308 ACTGGTGCTGCTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGA 6367 Query 6504 TGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCACGGAA 6563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 6368 TGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCGCGGAA 6427 Query 6564 CATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTACCTGAGATAGT 6623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 6428 CATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTGCCTGAGATAGT 6487 Query 6624 AGAAGCTCCCTGTATCCTTTCTGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGAA 6683 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6488 AGAAGCTCCCTGTATCCTTTCCGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGAA 6547 Query 6684 TGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAA 6743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6548 TGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAA 6607 Query 6744 GACAAAGTTACTTCTATCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTACC 6803 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6608 GACAAAGTTACTTCTGTCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTACC 6667 Query 6804 ATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCGG 6863 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6668 ATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCGG 6727 Query 6864 TGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACT 6923 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6728 TGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACT 6787 Query 6924 TGATACGGAAGGGCGGTATCTGTTCCTTAATGCAATCGCCAATCAGCTTCGATACCCCAA 6983 |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 6788 TGATACTGAAGGGCGGTACCTGTTCCTAAATGCAATAGCCAATCAGCTTCGATATCCCAA 6847 Query 6984 CAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTATTCTTCGAATCTGATCAGGA 7043 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 6848 CAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTGTTCTTCGAATCTGACCAGGA 6907 Query 7044 GATCATACAGGAGCAAATAACTAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCACA 7103 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6908 GATCATACAGGAGCAAATAACAAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCACA 6967 Query 7104 TCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATAGCTTCTG 7163 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 6968 TCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATGGCTTCTG 7027 Query 7164 GAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTGTTTGAATCGGTAGCCAG 7223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 7028 GAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTCTTTGAATCGGTAGCCAG 7087 Query 7224 ATCCTGTGGTGGCCTGAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTTTCGGGAGGTTGGGTCTCAGA 7283 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 7088 ATCCTGTGGTGGCCTTAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTCTCGGGAGGTTGGGTCTCAGA 7147 Query 7284 CAATTCTCACTAGCTCTTTAGCTTTCAACTTGTATAT 7320 ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 7148 CAATTCTCATTAGCTCTCTAGCTTTCAACTTGTATAT 7184 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 282919997682 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5