BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G02080.1
Length=7461
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg918742 jgi|Araly1|918742|scaffold_100023.1 1.154e+04 0.0
> Ahg918742 jgi|Araly1|918742|scaffold_100023.1
Length=7185
Score = 1.154e+04 bits (6247), Expect = 0.0
Identities = 6871/7177 (96%), Gaps = 23/7177 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 157 CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT 77
Query 217 TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTTGTTGATTTTGGAGTCGAGACT 276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 78 TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTGGTTGATTTTGGAGTCGAGACT 137
Query 277 AGTATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTGGATTGCTTCACCGCCCGGAGAAGCCATCCTAAT 336
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 138 AGCATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTCGATTGCTTCACCGTCCGGAGAAGCCATCCTAAT 197
Query 337 TCGTTGCAGCTTGAGAAAGTTGTATCCTTGCTCTTTAAACATGTGCTCAAGTTGTCAAAC 396
|||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 198 TCGTCGCAGCTTGAGAAGGTTGTATCCTTGGTCTTTAAACATGTGCTCAATTTGTCTAAT 257
Query 397 CTTGCCACCCTGCTTCCTCACGCCCTCAATGATTTTGAGCTCACTCAAGAATCCGTGGAT 456
|| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 258 CTCGCCACCCTGCTTTCTCACGCCCTCAAGGATGTTGAGCTCACTCAAGATTCCGTCCAT 317
Query 457 GATTTGACTACTACTTTGAATTTTTCAATCTCTGAGAATATTGGCTTTGCTCTCGCCCTG 516
|||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 318 GATTTGACTACTTGTTTGAATTTTTCTACCTCTGAGAAAATTGGCTTTGCTCTCGCCCTC 377
Query 517 ACCGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACCACTGGACGGAACTTACTGTTGGCTCAGATT 576
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||
Sbjct 378 ACTGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACGGCTGGACGCAACCTACTATTGGCTGAGATT 437
Query 577 GAGCAACTCTGTGCCAATACTGGCCAGATTCTTTCATCTGAGCTAATCCATTCTGTTCTT 636
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||
Sbjct 438 GAGCAACTCTCTGCCAATACTGGCCAGATTGATTCAACTGAGCAAATTCAGAATGTTCTT 497
Query 637 TCGTTTCTCCGCAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG 696
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 TTGTTTCTCCACAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG 557
Query 697 TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTAACACCTATGCTTGCTCAACAA 756
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 558 TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTTACACCTATGCTTTCTCAACAA 617
Query 757 GTTCATGAAGCTCCTGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACACTGATTCTGCTGATAACGAC 816
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 618 GTTCATGAAGCTCATGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACATTGATTCTGCTGAAAACGAG 677
Query 817 CTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAGTCAGCGTTGGAGATCTCATGGGAGAA 876
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 678 TTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAATCAGTGTTGGAGATCTCATGGGAGAA 737
Query 877 TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCAACAATGCAAAGAAATCTTGTCTAGTTTTGCT 936
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 738 TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCTACAATGCAAAGAAATCTTGTCTACTTTTGCT 797
Query 937 CCACTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTGTTGGCAATGTTTCTCGGACCTGTGCTGAT 996
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 798 CCATTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTCTTGGCAATGTTTCTCGGACATGTGCTGAT 857
Query 997 CTTGAAGATAATCAAACCACCTTTTCAACGTTTACTGTAGCCCTTGGTTCCTGCATTCCA 1056
|||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||| |||||| ||
Sbjct 858 CTTGTAGATAATCACACCACCTTTCCAACATTCACTTTAGCCCTTGGTTGCTGCATCCCT 917
Query 1057 ACTGAACTTCCCACGCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG 1116
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 ACTGAACTTCCCACCCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG 977
Query 1117 CTTCAGGCTCCTGGCATAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT 1176
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 978 CTT---GCTCCTGGCACAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT 1034
Query 1177 GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGATCTATAAAGCTGCTTGCAAG 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGCTCTATAAAGCTGCTTGCAAG 1094
Query 1237 GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGGTTCTGTCTGGAAAAATATGGATGGTCAATTA 1296
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1095 GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGCTTCTGTCTGGAAAAATATGGAAGGTCAAGTA 1154
Query 1297 TCCTTTCTTAAGCACGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA 1356
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 TCCTTTCTTAAGCATGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA 1214
Query 1357 AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCAAGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT 1416
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215 AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCATGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT 1274
Query 1417 CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCTTGGATGTACTGTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT 1476
|||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCCTGAATGTGCTTTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT 1334
Query 1477 GCTGTTTTAGTTAGTTCGTTACTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT 1536
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 GCTGTTTTAGTTAGCTCGTTGCTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT 1394
Query 1537 CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTGGTTTCTGCT 1596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1395 CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTAGTTTCTGCT 1454
Query 1597 ATTCTGCCAGTGATAATAACGAGTCCCCAGGATAGTGGTTTTATCCATAATCTCTGGCAT 1656
||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1455 ATTCTTCCAGTGATAATAACGAATTCCCAGGATAGTGGTTTTATCCTTAATCTCTGGCAT 1514
Query 1657 CAAAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTATAGATGCCCAACATCTCAAAGCAGACAGC 1716
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1515 CAGAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTTTAGATGCCCAAAATCTTAAAGCAGACAGC 1574
Query 1717 ATGCTCCGAATAATTGAAATCTGCCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA 1776
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1575 TTGCTCCGAATAATTGAAATCTGTCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA 1634
Query 1777 GTTCCAGTCTCATCCAGTATCAGATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC 1836
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 GTTCCAGTCTCATTCAGTATCAAATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC 1694
Query 1837 ATTGAGAACTGGTTGCCTAACTGCTTGTATATGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGC 1896
||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 ATTGAGAACTGGTTGCCAAACTGCCTGTATGTGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGT 1754
Query 1897 CTCAAATTTGTCAAAAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTCAGGGCCAAAATTTTT 1956
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||
Sbjct 1755 CTCAAATTTGTCAAGAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTTACTGCCAAAAGTTTT 1814
Query 1957 CATCCTTCTGATCCATTATCAGATCTTCATTTGGAAGCAACAACTTCCCTTTTAAAAGTT 2016
|||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||
Sbjct 1815 CATCCTTCAGATCCTTTATCAGATCTTCATCTGGATGCAACAACTTCCCTAATGAAAGTT 1874
Query 2017 TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTGGTCGAGGAGATTGAAAAAGTC 2076
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1875 TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTAGTCGAGGAGATTGAAAAGGTC 1934
Query 2077 AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAGCTGCAGAATGGTGAGGCTAAAGATTCATCA 2136
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1935 AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAACTGCAGAATGGCGAGGCTAAAGATTCATCA 1994
Query 2137 GCTCCCAA-TGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAGGCAAACGCATATTTTCATCAAAT 2195
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1995 GC-ATCAACTGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAAGCAAACGCCTATTTCCATCAAAT 2053
Query 2196 GTTTTCTAGTCATTTGAGTGTTGACGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGAATC 2255
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2054 GTTTTCTAGTCAGTTGAGTGTTGATGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGACTC 2113
Query 2256 TTTGGTTCCAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAATA 2315
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114 TTTGGTTCAAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAATA 2173
Query 2316 TCGGTTTTTCCCCAAGTATCCTGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTTC 2375
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 TCGGTTTTTCCCCAAGTATCCCGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTTC 2233
Query 2376 TGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCGCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTAGTGTT 2435
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2234 TGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCCCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTTGTGTT 2293
Query 2436 GGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGGA 2495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 GGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGGA 2353
Query 2496 ACAGTTTGTGAATCGTCTGGTTGAATTGCCTCAATACTGTAACCATATTTTGCAAATATC 2555
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 ACAGTTCGTGAATCGTCTTGTTGAATTGCCTCAATACTGCAACCATATTTTGCAAATATC 2413
Query 2556 TCATCTGCGTAGTACTCACCCGGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGAT 2615
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 TCATCTGCGTAGCACTCACCCTGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGAT 2473
Query 2616 ATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCACACCCTGGTCCCTCACAATCTTT 2675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2474 ATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCGCACCCTGGGCCCTCACAGTCTTT 2533
Query 2676 CCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAACCTGCATTACAGCTTTCTTC 2735
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
Sbjct 2534 CCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAATCTGCATTACAGC-TTCAAC 2592
Query 2736 -------TCCCCTACAGCTTCA--ACAGAAAAATGAAGTGCCAAGTGTGCCATCTAACGA 2786
| | || || | || | | | ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2593 AGAAAAATGAAGTGCATATTGATGACCGCAGCA--AAGTGCCAAATGTGCCATCTAACGA 2650
Query 2787 GGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACTACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTAA 2846
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2651 GGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACCACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTAA 2710
Query 2847 GAATCCTGGCATTCCAACTTCTTCATCAACCTCAACTGGTTTTGTTCGTCCAGCTCGTGC 2906
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2711 GAATCCTGGCATTTCAACTTCTTCATCAACCTCCGCTGGTTTTGTTCGCCCAGCTCGTGC 2770
Query 2907 AACCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAGA 2966
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2771 AGCCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAGA 2830
Query 2967 AAGAAGGGAAAACGCAATCGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCGTTCAT 3026
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2831 AAGAAGGGAAAACGCAATTGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCTTTCAT 2890
Query 3027 AATCAATAATATCTCTACAACAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTTT 3086
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2891 AATTAATAATATCTCTACAGCAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTTT 2950
Query 3087 GCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCGA 3146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2951 GCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCGA 3010
Query 3147 GCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGCTGTT 3206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3011 GCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGTTGTT 3070
Query 3207 TAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGCTCAGAGCTCAT 3266
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3071 TAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGTTCAGAGCTCAT 3130
Query 3267 AAAGTCGAGTTCTGAAGAGCGTTCTCTTCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAGGTT 3326
|||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3131 AAAGTCAAGTTCAGAAGAGCGATCTCTGCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAAGTT 3190
Query 3327 GACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTGT 3386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3191 GACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTGT 3250
Query 3387 GGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCAGTCATTCCGTTCACTTCAAAGGTTCTGGA 3446
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3251 GGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCGGTCATTCCATTCACTTCAAAGGTTCTGGA 3310
Query 3447 GCCATGCCAAAACAGTATTGCTTATCAACCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTAGG 3506
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3311 GCCATGCCAAAACAGTATTGCGTATCAGCCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTTGG 3370
Query 3507 GTTGCTTGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAGA 3566
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3371 GTTGCTCGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAGA 3430
Query 3567 GGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAAATGAAGGAAGTAGTGCCAACTTCCCTTCTAAA 3626
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3431 GGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAGGTGAAGGAAGTAGCGCCAACTTCCCTTCTAAA 3490
Query 3627 GGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGCAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCCTGGAGTAAC 3686
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3491 GGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGGAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCTTGGAGTAAC 3550
Query 3687 ACAGATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAACAAAT 3746
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3551 ACAAATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAGCAAAT 3610
Query 3747 TGACCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCGCCTAATACAGATGTTCCCTCGAAGTTATTATC 3806
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3611 CGATCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCACCTAATACAGACGTTCCCTCGAAGTTATTATC 3670
Query 3807 ACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGAGGAGAAAGTAGC 3866
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3671 ACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGACGAGAAAGTGGC 3730
Query 3867 AACTCTTGGCTTGCCAGAACAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCATC 3926
|||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3731 AACTCTAGGCTTGCCTGAGCAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCATC 3790
Query 3927 GCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAATATTGGAAATCATGTTGT 3986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3791 CCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAACATTGGAAATCATGTTGT 3850
Query 3987 TATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAAAGAGTGGTACCACT 4046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3851 TATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAGAGAGTGGTACCACT 3910
Query 4047 TGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTAT 4106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3911 TGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTAT 3970
Query 4107 TGCATGCCAAACAACAAAGGAGCTTGTGCTAAAGGATTACGCCCTGGAACCCGATGAGTC 4166
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3971 TGCATGCCAAACAACAAAAGAGCTTGTGCTAAAGGATTATGCCCTGGAACCCGATGAGTC 4030
Query 4167 ACGTATTTATAATGCAGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATGT 4226
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4031 ACGTATTTATAATGCCGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATGT 4090
Query 4227 GACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTTCAGGG 4286
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4091 GACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTCCAGGG 4150
Query 4287 TCTGAATATTTCAAATGATGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACCAATGACAACCT 4346
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4151 TCTGAATATTTCAAATGACGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACAAATGACAACCT 4210
Query 4347 GGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCTGCTACAGAAAAGGCAATACAAACAATTGA 4406
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4211 TGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCGGCTACAGAGAAGGCAATACAAACAATTGA 4270
Query 4407 TGCGGACATTGCTCAACAATTGTTGTTACGGAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCTC 4466
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4271 TGCGGACATTGCACAGCAATTGTTGTTACGCAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCTC 4330
Query 4467 CTTTTTCGATCCAAACATTCTATCACAGAATTCCGTCAGTTTTATACCCGAATCCCTCCG 4526
|||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4331 CTTTTTTGATCCAAACATTCTAGGACAAAATTCCGTCAGTTTTATACCTGAATCCCTCCG 4390
Query 4527 TCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGAGAGTTTATGAGGACTTTGTTCAACA 4586
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4391 TCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGCGAGTTTATGAGGATTTTGTTCAACA 4450
Query 4587 TCCTTGGCAAAAGCAGTCGACCCAAACTTCACACGGTTTATCTGCTGCATCAAGCTCATC 4646
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4451 TCCTTGGCAGAAGCAGTCGACCCAAACGTCACACGGTTTATCTACTGCATCAAGCTCATC 4510
Query 4647 TGGTGATGTTGCGCTTGGTAGTGGTTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCTTCTGAATT 4706
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4511 TGGCGATGTTGCGCTTGGTAGTGGGTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCGTCTGAATT 4570
Query 4707 TTTGTCTAATGCTGGAAACGCTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCATCAGATATTTCTGT 4766
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4571 TTTGTCTAGTGCTGGAAACACTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCAACAGATATTTCTGT 4630
Query 4767 GGATGGTTTTGAATCTTCTCCAGTCTCACTTTTGAGCTCACAAGTCGATCCAGCTGGTGA 4826
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4631 GGATGGTTTTGAATCTTCCCCAGTCTCACTTTTAAGCTCACAAGTTGATCCAGCTGGTGA 4690
Query 4827 CTCATCCAGTCTTCAATTTACTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAATC 4886
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4691 CTCATCCAGTCTTCAATTTTCTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAATC 4750
Query 4887 CTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTTCAGCTGCTAC 4946
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4751 CTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTT---CTGCTAC 4807
Query 4947 CATGGAACGACTTGGTGCTAGTAATATTACACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCACT 5006
||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4808 CATGGAACGACTTGGTGGAAATAATATTATACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCACT 4867
Query 5007 GGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAGA 5066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4868 GGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAGA 4927
Query 5067 TGATGAAATCCAGGCCGTAATTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCAG 5126
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4928 TGACGAAATCCAGGCCGTAGTTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCAG 4987
Query 5127 AGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCTCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTACGAGAATGCATC 5186
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4988 AGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCCCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTATGAGAATGCATC 5047
Query 5187 AAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATCCGTGATGTTTGCAA 5246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5048 AAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATTCGTGATGTTTGCAA 5107
Query 5247 GCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTGATTTATTCAGAGGAGGATCGGAAGCTCAA 5306
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5108 GCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTTATTTATTCAGAGGAGGAGCGGAAGCTCAA 5167
Query 5307 CAAAGATATTACTATTGGTCTTATCCAGCGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATGT 5366
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5168 CAAAGATATTACTATTGGTCTAATCCAACGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATGT 5227
Query 5367 CCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGACCGCAACTGACTTTGCTATTTC 5426
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5228 CCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGAGCGCAACTGACTTTGCTATTTC 5287
Query 5427 TCTACTCCAATCCTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTGT 5486
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5288 TCTACTCCAATCTTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTGT 5347
Query 5487 TGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCTTCTGAGTCATTGCAACAGCTAAT 5546
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5348 TGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCGCCTGAGTCATTGCAACAGCTAAT 5407
Query 5547 TGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAAA 5606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5408 TGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAAA 5467
Query 5607 TGATAACAACGATAGGCAAAAGGATGAGAAGGTTGCGTGC-A-A-CACCACTAACACAGA 5663
||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 5468 TGACAACAATGATAGGCAAAAGGATGAAAAGGTTGCGTGCAATATCACCACTAACACAGA 5527
Query 5664 AGAGAGTACCAGCTTGGATTATGTGGAATCAGATCCTGCGGGTTTCCAGAATCGGGTGTC 5723
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5528 AGAGAATACCAGCTTGGATTATGTGGAATTAGATCCTGCGGTTTTCCAGAATCGGGTGTC 5587
Query 5724 CACGCTATTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCATG 5783
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5588 CACGCTTTTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCTTG 5647
Query 5784 TTCACAATATGTCCTGCATTTGCACCAGACTGGATTACTTAAGGGAGATGATACAACAGA 5843
||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5648 TTCACAATACGTCTTGCATTTGCATCAGACTGGACTACTTAAGGGAGATGATACAACAGA 5707
Query 5844 GAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATAT 5903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5708 GAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATAT 5767
Query 5904 TAATTCCGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTGA 5963
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5768 TAATTCTGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTGA 5827
Query 5964 TATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCAG 6023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5828 TATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCAG 5887
Query 6024 TAGGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGACACAGTGAGATTTATTCAAAAGGACGC 6083
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5888 CAAGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGCCACAGTGAGATTTATTCACAAGGACGC 5947
Query 6084 AGAAGATAAAAAGACATCACTCAATTCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGCT 6143
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5948 AGAAGATAAAAAGACATCACTCAATCCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGCT 6007
Query 6144 ACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAGC 6203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6008 ACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAGC 6067
Query 6204 TTTTGCCAACGCCTTCCACGCATTGCAGCCTCTTAAGATTCCTGCTTTCAGTTTTGCATG 6263
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 6068 TTTTGCCAACGCCTTCCACGCGTTGCAGCCTCTTAAGATACCTGCTTTCAGCTTTGCATG 6127
Query 6264 GCTAGAACTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGAA 6323
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6128 GCTAGAGCTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGAA 6187
Query 6324 GGGTTGGCCATATGTTCAGCGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTTT 6383
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6188 GGGTTGGCCATATGTTCAACGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTTT 6247
Query 6384 AAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCGGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTATT 6443
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6248 AAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCAGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTGTT 6307
Query 6444 ACTGGTTCTGCTTCATGATTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGA 6503
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6308 ACTGGTGCTGCTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTGA 6367
Query 6504 TGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCACGGAA 6563
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6368 TGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCGCGGAA 6427
Query 6564 CATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTACCTGAGATAGT 6623
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6428 CATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTGCCTGAGATAGT 6487
Query 6624 AGAAGCTCCCTGTATCCTTTCTGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGAA 6683
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6488 AGAAGCTCCCTGTATCCTTTCCGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGAA 6547
Query 6684 TGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAA 6743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6548 TGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGAA 6607
Query 6744 GACAAAGTTACTTCTATCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTACC 6803
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6608 GACAAAGTTACTTCTGTCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTACC 6667
Query 6804 ATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCGG 6863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6668 ATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCGG 6727
Query 6864 TGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACT 6923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6728 TGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAACT 6787
Query 6924 TGATACGGAAGGGCGGTATCTGTTCCTTAATGCAATCGCCAATCAGCTTCGATACCCCAA 6983
|||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6788 TGATACTGAAGGGCGGTACCTGTTCCTAAATGCAATAGCCAATCAGCTTCGATATCCCAA 6847
Query 6984 CAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTATTCTTCGAATCTGATCAGGA 7043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 6848 CAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTGTTCTTCGAATCTGACCAGGA 6907
Query 7044 GATCATACAGGAGCAAATAACTAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCACA 7103
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6908 GATCATACAGGAGCAAATAACAAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCACA 6967
Query 7104 TCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATAGCTTCTG 7163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6968 TCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATGGCTTCTG 7027
Query 7164 GAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTGTTTGAATCGGTAGCCAG 7223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 7028 GAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTCTTTGAATCGGTAGCCAG 7087
Query 7224 ATCCTGTGGTGGCCTGAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTTTCGGGAGGTTGGGTCTCAGA 7283
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 7088 ATCCTGTGGTGGCCTTAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTCTCGGGAGGTTGGGTCTCAGA 7147
Query 7284 CAATTCTCACTAGCTCTTTAGCTTTCAACTTGTATAT 7320
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 7148 CAATTCTCATTAGCTCTCTAGCTTTCAACTTGTATAT 7184
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 282919997682
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5