BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G02990.3
Length=4379
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg909961 jgi|Araly1|909961|Al_scaffold_0001_215 6191 0.0
> Ahg909961 jgi|Araly1|909961|Al_scaffold_0001_215
Length=3864
Score = 6191 bits (3352), Expect = 0.0
Identities = 3706/3872 (96%), Gaps = 43/3872 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 215 ATGATTTTGGTGAGTAGTAGCGATGCTAGAAGCGAATTAGGGTTAGGGTTTGGTGGATTA 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATTTTGGTGAGTAGTAGCGATGCTAGAAGCGAATTAGGGTTAGGGTTTGGTGGATTA 60
Query 275 GGTGAAGAAATCATGCAAGATTGTGACTTTGAGGAAGAAAGTACACATTCTTATGTTTCT 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGTGAAGAAATCATGCAAGATTGTGACTTTGAGGAAGAAAGCACACATTCTTATGTTTCT 120
Query 335 TGCGTTGACCCAGATGTTGCTCTCTCTTACATTGATGAGAAACTCGAAAACGTCTTGGGA 394
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 TGCGTTGACCCAGATGTTGCTCTCTCTTATATCGATGAGAAACTTGAAAACGTCTTGGGA 180
Query 395 CATTTTCAGAAAGATTTTGAAGGTGGAGTTTCTGCTGAAAATTTGGGTGCAAAGTTTGGT 454
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CATTTTCAGAAAGATTTTGAAGGTGGAGTTTCAGCTGAAAATTTGGGTGCAAAGTTTGGT 240
Query 455 GGCTATGGTTCCTTTTTGTCTATGTATCAGAGATCTCCTGTTTGTTCACGTCCTAAGACT 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 241 GGCTATGGTTCCTTTTTGTCTATGTATCAGAGATCTCCTGTTTCTTCACGTCCTAAGACT 300
Query 515 TCACCAGAAGTTCAACAAAACCAATTGGGTGGTCGATCTAATTGCTCAGCTTCATCACTA 574
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCACCAGATGTTCAACAAAACCAATTGGGGGGTCGATCTAATTGCTCAGCTTCATCACTT 360
Query 575 GTACCTCAACTATCAATATCCGGATCCGCTTCAAAACCTCCTGCTTCTGATGTTTTGGTC 634
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 361 GTACCTCAACTATCAATATCCGGATCCTCTTCGAAACCTCCTGCCTCTGATGTTTTCGTC 420
Query 635 AAATTAAACAAGTTTGTCAAATCAAGTCATATAGGGACACCTGATAGCAAACACATGTCT 694
|||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 421 AAATTAAAAAAGTTCGTCAAATCAAGTAATATAGGGACACCTGATAGCAAACAAAAACCT 480
Query 695 GACGCAAAAACTTCTTCTTCTGCTCCATCAAATCATAAGACTCTCAGGTTTCGTATAAAA 754
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 481 GACACAAAAATTTCTTCTTCTGCTCCATCAAATCATAAGACTCTCAGACTTCGTATAAAA 540
Query 755 GTTGGTTCAAGTGACCTCTCGTCACTCAAAAACGTTTCTACCTTTACTAAAGAAGGCCTC 814
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 541 GTTGGTTCGAGTGACCTCTCTTCACTCAAAAACGTTTCTACCTATACTAAAGAAGGCCTC 600
Query 815 AATATGCTACCATCAGCATCGCGGGTGAATTGCCTCTCAGAAGTTGAACAAGATTTACTG 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 601 AATATGCTACCATCAGCATCGCGGGTGAATTGCCTTTCAGAAGTTGAACAAGACTTACTG 660
Query 875 AATGGGATTTGTGATTCGCCCACTAAAATTCTTATGGCTATGGTGTCATTCCCTTTGCAT 934
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AATGGGATTTGTGATTCACCGACTAAAATTCTTATGGCTATGGTGTCATTCCCTTTGCAT 720
Query 935 AAAGATCAGCTGTTATCACCTCTCTCTGATGATCTTATTCAGTTGGGATCGAAAGAAAAG 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 721 AAAGATCAGCTGTTATCACCTCTCTCTGATGATCTTATTTTGTTGGGATCGAAAGAAAAG 780
Query 995 ATTTTGAAAGATGCTGGATATGGTTCTACAAACAAGACGGA-TGCAAAAAGTACACCCGA 1053
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||
Sbjct 781 ATTTTCAAAGATGCTGGATATGGTTCTGCAAACAAGTCGGACT-CAAAAAGTACACCCGA 839
Query 1054 TGGTTTAGTTGTTTCTGATTCACAAAAGCGTGCTGGTAAG-TTTCCTATTGGGAAGAAGG 1112
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 840 TGATTTGGTTGTTTCTGATTCACAAAAGCGTGCTGGTAAGTTTTCC-ATTGGGAAGAAGG 898
Query 1113 AAAAGTTAAGGGATAGGGTAAAGTATAGGCCACCGTCAAACAAGCTTGACAGAAATCATA 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 899 AAAAGTTAAGGGATAGGGTAAAGTATAGGCCACCGTCAAACAAGCGTGACAGAAATCATA 958
Query 1173 CCGTATCCAATACTGAAAAAGAGGCTGACAAAGAGTCCTGTGAGGAGCTTGTTTCCAAGA 1232
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 959 CTGTATCCAATACTGAAAAAGAGGCTGACAAAGAGTCCTGCGAGGAGCTTGTTTCCAAGA 1018
Query 1233 CTATGAAGCTTCCACTTTTATCCTGTCTATCACCTTCATATATCCACCCGGCAAAAGAGA 1292
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1019 CTATGAAGCTTCCACTTTTATCCTGTCTATCACCGTCATATATCCACCCAGCAAAAGAGA 1078
Query 1293 TTGATAACGTATCAGATTCTAATGTGGAGAG-TATATTAAGAGGAACGAACAAAGATGCA 1351
||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TTGATAAAGTATCAGATTCTAATGTGGAG-GTTATATCAAGAGGAACGAACAAAGATGCA 1137
Query 1352 GCTTTGATGGGTTCAAAGCCGGAACTAGAAGATAATGTAGTGGCATTTTCAGATCGAAGT 1411
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 GCTTTGATGGGTTCAAAGCCGGAACTAGAAGATAATGTAGTGGCATTTTCAGATCGAAGC 1197
Query 1412 GTTAAGGAAACTGAAAGTATTAACGTAAGAAAAGACGTGTACCTGATAAAAGGTGAACCT 1471
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 GTTAAGGAAACTGAAAGTATTAACGTAAGAAAAGACGTTTACCTGATAAAAGGTGAACCT 1257
Query 1472 CTAAACTCATTGGAAAGTAATCCCAAGCGGGAGAAAGCTCCAAGTATTGAACATGTAGAT 1531
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CTAAACTCATTGGAAAGTAATTCCAAGAGGGAGAAAGCTCCAAGTATTGAACATGTAGAT 1317
Query 1532 TATTCTTCTGTGGTTAAGGGTACTCAGAGTGAGACAAGGAATGAAGAGCAAATTTTAAAG 1591
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 TATTCTTCTGTGGTTAAGGGTAGTCAGAGTGAGACAAGGAATGAAGAGCAAATTTTAAAG 1377
Query 1592 TCAAAACTGCCTAAAGTACAGAGGTCACAAAAAGGTTCAAGCTCCATTGTTACCATGAAT 1651
|||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1378 TCAAAACTGCCTAAAGCACAGAAGTCACAAAAAAGTTCAAGCTCCATTGTTTCCATGAAT 1437
Query 1652 AGTCAGAGAGGCAAGGACGCTGCTGTAAATATAATTAAGAAGAATGTACCAGATAAATTG 1711
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 AGTCTGAGAGGCAAGGACGCGGCTGTAAATATAATTAAGAAGAATGTACCAGATAAATTG 1497
Query 1712 CAGGAAGATATTGAAGAATCCGAACACATGTGTAAGGGATTCTTTGGTGATTCGAAAGAA 1771
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 CAGGAAGATATTGGAGAATCCGAACACATGTATAAGGGATTCTTTGGTGATTCGAAAGAA 1557
Query 1772 TCAAAAGAAGAAAAACAAATTAGTCCCG-TACTTAAAGCTGAGAAAGAAAAGCTTTCAGA 1830
||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1558 TCAAAAGAAGAAAAACAAAGTAGT-CCGATACTTAAAGCTGAAAAAGCAAAGCTTTCAGA 1616
Query 1831 AGAAAATGCATTGG-GCGAGAGTTTCAACAGTGTTAAAAATGATGAAGAGGCTTGTGATC 1889
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1617 AGAAAATGCATTGGAG-GAGAGTTTCAACAGTGTTAAAAATGATGAAGAGGCTTGTGACC 1675
Query 1890 ATCTAAATTTGGTATGTGAACCTGATTTGAAACACCTTATTAAGCCGAGTGACTTGAATG 1949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 ATCTAAATTTGGTATGTGAACCTGATTTGAAACACCTTATTAAGCCGAGTGACTTGAATG 1735
Query 1950 AAGATAGGCACACCACCAAGCAGAGTGTTAGACGGGAAGTGAAAAATAAGCATTCTCTTG 2009
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 AAGATAGGCACACCACTAAGCAGAGTGTTAGACGGGAAGTGAAAAATAAGCATTCTCTTG 1795
Query 2010 AAGGAGGAATGGAGAATATGGGAATGGAATCTGAAAGGGAACTTTCTGGGGTTTCTAAGA 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 AAGGAGGAATGGAGAATATGGGAATGGAATCTGAAAGGGAACTTTCTGGGGTTTCTAAGA 1855
Query 2070 AACCAAAGACTGGAAAATCACGATTTTCCGCTGTAGATCAACCTGGATCCAACAAATCCA 2129
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 AACCAAAGACTGGAAAATCACGATTTTCCACTTTAGATCAACCTGGATCCAACAAATCCA 1915
Query 2130 ACCAAATTCTGGAAGTTTTAGATACTAACAAAACTATGATTACTCAAGCCTTAGCCGAAA 2189
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1916 ACCAAATTCTGGACGTTTTAGATACTAACAAAACTATGATTACTCAAGCCTCAGCCGAAA 1975
Query 2190 ATGTCAAGGATTTTGCTAAGGCTTCCTCGCATGGCGAACGTGATGACAGAAAGAGGAAAC 2249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 ATGTCAAGGATTTTGCTAAGGCTTCCTCGCATGGCGAACGTGATGACAGAAAGAGGAAAC 2035
Query 2250 TGAAGGAAAATGAGGAAAGTGGAGATTGTATGAGACTTAGAGAAGCTGCAGTAATGGAAT 2309
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |
Sbjct 2036 TGAAGGAAAATGAAGAAAGTGGAGATTGTATGAGACCTAGAGAAGCTGCAGTAATAGAGT 2095
Query 2310 CAAGTGGAGAGAACGTTAGAAAGAGAAAGAGGCTTAAAGGTTCAAGTTGTGATGAAAAAG 2369
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 CAAGTGGAGAGAACGTTAGAAAAAGTAAGAGGCTTAAAGGTTCAAGTTGTGATGAAAAAG 2155
Query 2370 AGTTGCCTTTTAGTAGTGAAAGCTGTGATAAGGAAAGAAGTGTTAGTCAAGAAAATGGTA 2429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2156 AGTTGCCTTTTAGTAGTGAAAGCTGTGATAAGGAAAGAAGAGTTAGTCAAGAAAATGGTA 2215
Query 2430 GAGATAGTGCTTCTCATCTACCTTCTACA-CTGTCCTCTCCGAGTTTGTGTAAGGATTTG 2488
||||| ||||||| |||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2216 GAGATTGTGCTTCCCATCTACCTTTTATAGC-GTCCTCTCCGATTTTGTGTAAGGATTTG 2274
Query 2489 GGCTCTGAAATTATCAAAAATAATGTCCGCGAAAGT-AAAGGTTCACTAGTTGAATCAGT 2547
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 GGCTCTGAAATTATCAAAAATAATGTCTGCGAA-GCCAAAGGTTCACTAGTTGAATCAGT 2333
Query 2548 TGCCCCTTTGGCCTTGAGAGTGTTAGACTCAGGTGAGCTTAAATCAGGAAGAATTTCAGA 2607
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2334 TGCCCCTTCGGCCTTGAGAGTGTTAGACTCAGGTGAGCTTAAATCAGGAAGAATTTCAGA 2393
Query 2608 AAGGGATGAGTACCATGATACTGATTATAATGCTGGTGAGACGTTAAAAAGATGCCGAGA 2667
|||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 GAGGGATGAATACCATGATGCTGATTCTAATACTGGTGATACGTTAAAAAGATGCCGAGA 2453
Query 2668 TGGTGAGGCTTATAGTACTATCGATAGACCAGGGACAACAAAGAAGGCTGCAGAAGATTC 2727
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2454 TGGTGAGGCTTATAGCACTATCGATAGACCAGGGACAACAAAGAAGGCTGCAGAAAATTC 2513
Query 2728 CAAGGATAGAGAAAGAGCATATGGGGAGGATTGTTCAATTGAAAACTTAAAACCAAAGAA 2787
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2514 CAAGGATAGAGAAAGAGCATATGGTGAAGATTGTTCAATTGAAAACTTTAAACCAAAGAA 2573
Query 2788 GTCAGGGAGATATCCTGGTGAAAATTGCATAGAGGGTGACTCTAAGCAAAAGAGTAGAGA 2847
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2574 GTCAGGGAGATGTCCTGGTGAAAATTGCATAGAGGGTGGCTCTAAGCAAAAGAGTAGGGA 2633
Query 2848 AGAGGAGTCATCTGCACCTTCGAAAGATAATAACTGGGGTCTGGTGAATAACGTGCAAGA 2907
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2634 AGAGGGGTCATCTGCACCTTCGAAAGAGAATAACTGGGGTCTGGTGAATGACGTGCAAGA 2693
Query 2908 TCTTGGCACTGCTGTTAAAGTAAAAACAAAAGAAAGCAGGAGCAAGAAAAGACCTGCTAG 2967
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 TCTTGGCACTGCTGTTAAAGTAAAAAGAAAAGAAAGCAGGAGCAAGAAAAGACCTGCTAG 2753
Query 2968 AAAAGTGTCTATGGAGTGTAATAAAGAAGACTCAAGGGAATATCAAGATCCTAATACTAA 3027
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2754 AAAAGTGTCTTTGGAGAGTAATAAAGAAGACTCAAGGGAATATCAAGATCCTAATACTAA 2813
Query 3028 GCTAGATAGAAGTGGTAGTCATTTTTCTTCTCGACAGAAACCTGATACAGCAAACACTTC 3087
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2814 GCTAGATAGAAGTAGTAGTCATTTTTCTTCTCGACAGAAACCTGATACAGCAAACACTTC 2873
Query 3088 TCGTGGGAAAAGCAACCCATTGGAAGTGACCACTGAGCAATTAAAGAATAAATCAGCTTC 3147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874 TCGTGGGAAAAGCAACCCATTGGAAGTGACCACTGAGAAATTAAAGAATAAATCAGCTTC 2933
Query 3148 ACCAGCT--CA-AG-T----T-GAAGTCTTGGGTCACGACACTGAGATATCAAATACAAA 3198
||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2934 ACCAGCTGGCACAGATCAGGTTGAAGTCTTGGGTCACGGCACTGAGATATCAAATACAAA 2993
Query 3199 GAAACAGAGACTGCGGAATGATAATCACAGTGTGACCCACGATGAAGGTTCGCGAAACCA 3258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 GAAACAGAGACTGCGGAATGATAATCACAGTGTGACCCACGATGAAGGTTCGCGAAACCA 3053
Query 3259 AAAGCAAAATGGAAGTAGGCATAAGGATCATGTTGGCTTAAGCCCTTTCAAAAAGGAATC 3318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3054 AAAGCAAAATGGAAGTAGGCATAAGGATCATGTTGGCTTAAGCCCTTTGAAAAAGGAATC 3113
Query 3319 CACGAGTCAGACTGCCTCCAACTCAATCAAAGAGGCTACAGACTTGAAACACATGGCTGA 3378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 CACGAGTCAGACTGCCTCCAACTCAATCAAAGAGGCTACAGACTTGAAACACATGGCTGA 3173
Query 3379 TCGTCTTAAGAATGCTGTGTCCAATCACGAGAGCACAGGTGTTTACTTTCAGGCAGCGCT 3438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3174 TCGTCTTAAGAATGCTGTGTCCAATCACGAGAGCACAGGTGTTTACTTTCAGGCAGCTCT 3233
Query 3439 TAAGTTTCTTCATGGTGCCTCCCTTTTGGAGTCATCTGGCA---------C--------- 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3234 TAAGTTTCTTCATGGTGCCTCCCTTTTGGAGTCATCTGGCATTGATAATGCTACACATAA 3293
Query 3481 GACCATTGCCAGATCCAAGGATATTTACGGCAGCACAGCCAAACTTTGCGAGTTCTGTGC 3540
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3294 GACCATTGCCAGATCCAAGGATATTTATGGCAGCACAGCAAAACTTTGCGAGTTCTGTGC 3353
Query 3541 TCATGAATACGAGAAAAATAAAGATATGGGGGCTGCTGCTCTGGCTTATAAATGTATGGA 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3354 TCATGAATACGAGAAAAATAAAGATATGGGGGCTGCTGCTCTGGCTTATAAATGTATGGA 3413
Query 3601 AGTAGCTTATCTAAGGATAACATATACCTCCCATGGTAACATAAGAAGATGCAGATATGA 3660
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3414 AGTAGCTTATCTAAGGATAACTTATACCTCCCATGGTAACATAAGAAGATACAGATATGA 3473
Query 3661 GTTGCAAGCAGCTTTGCAAGTGATTCCTTCAGGTGAATCTCCTTCCTTTGCTTCTGATGG 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3474 GTTGCAAGCAGCTTTGCAAGTGATTCCTTCAGGTGAATCTCCTTCCTTTGCTTCTGATGG 3533
Query 3721 TGAAAATTCAAACCACACATTAACAGCGGAAAAGTTTGCTTTGTCCAACACTGTGAGATC 3780
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3534 TGAAAATTCAAACCACACATTGGCAGCGGAAAAGTTTGCTTTGTCCAACAATGTGAGATC 3593
Query 3781 ATCCCCTAGCGTAACCGGAAACCATGTTATCTCTTCAGGAAACAATTCCTCTCTTTCACA 3840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3594 ATCCCCTAGCGTAACCGGAAACCATGTTATCTCTTCAGGAAACAATTCCTCTCTTTCACA 3653
Query 3841 GCTTTTGGCATTTTCGAAAAACGTAAACTAC-GCTATGGAAGCATCAAGAAAAGCGCAGA 3899
|||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3654 GCTTTTGGCATTTTCGCAAAACGTAAGCT-CTGCTATGGATGCGTCAAGAAAAGCGCAGA 3712
Query 3900 TTGCATTAGCAGCTGCAAAGGGAAAATCGTTTGAAACGAGATACAGTAGTAATGGTATAA 3959
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 3713 TTGCATTAGCAGCTGCAAAGGGAAAATCGTATGAAACCAGATACAGTAGTGATGGTATAA 3772
Query 3960 CATGCATCAAAAGGGCTCTTGACTTCAATTTTCAGGACATGGAGAAACTGTTGCATGTGG 4019
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3773 CATGCATCAAAAGGGCTCTTGACTTGAATTTTCAGGACATGGAGAAACTGTTGCATGTGG 3832
Query 4020 TGAGGCTTGCAATGGAATCCATAAACCGGTGA 4051
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3833 TGAGGCTTGCAATGGAATCCATAAACCGGTGA 3864
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 165626557696
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5