BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G04700.1

Length=3886
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg470456 jgi|Araly1|470456|fgenesh2_kg.1__410__AT1G04700.1         5337    0.0  


> Ahg470456 jgi|Araly1|470456|fgenesh2_kg.1__410__AT1G04700.1
Length=3696

 Score = 5337 bits (2890),  Expect = 0.0
 Identities = 3138/3255 (96%), Gaps = 27/3255 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  395   AATTTGGGGAGTTGAAGAACA-GA--AATTGGTTACTCAGAATCTGTGATACAAGAGATT  451
             ||||||||||||||||||| | ||    |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298   AATTTGGGGAGTTGAAGAATAGGACTTGTTGGTTCCTCAGAATCTGTGATACAAGAGATT  357

Query  452   GTGCAGAAGAAAGAATAAAGCGTTTTTGGTTCTTGAGAACATGAGAATGGAGTTTCCTGG  511
             ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358   GTGCACAAGAAAGAATAAGGC-TTTTTGGTTCTTGAGAACATGAGAATGGAGTTTCCTGG  416

Query  512   CAGCTCCAATCAGCATTTAGGTAGGGATAGGTTCAATGGAGAAGTTGGT--T-----GC-  563
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |     || 
Sbjct  417   CAGCTCCAATCAGCATTTAGGTAGGGATAGGTTCAATGGGGAAGTCGGTAATAACACGCG  476

Query  564   -G--G-TAATAACTGTTCTCAGACAGGAGAGGAATTTTCAAATGAGTTTTTGAGGGATTT  619
              |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477   TGATGATAATATCTGTTCTCAGACAGGAGAGGAATTTTCAAATGAGTTTTTGAGGGATTT  536

Query  620   TGGTGCTCAACGAAGACTACAACATGGTGGTGTTAACAGAAATGTTGAGGGTAATTATAA  679
             |||||||||||||||| |   ||| |||||||| |  |||||| |||||||||| |||||
Sbjct  537   TGGTGCTCAACGAAGAGT---ACAGGGTGGTGTGAGTAGAAATATTGAGGGTAACTATAA  593

Query  680   TAATCGCCATCTTGTTTACGAGGATTTCAACAGAATTCTTGGCCTTCAAAGAGTTGATTC  739
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  594   TAATCGCCATCTTGTTTATGAGGATTTCAACAGAATTCTTGGGCTTCAAAGAGTTGATTC  653

Query  740   CAACATGTCAGAAGGTATTAATTCCTCGAATGGTTACTTTGCTGAGTCAAATGTTGCAGA  799
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654   CAACATGTCAGAAGGTATTAATTCCTCGAGTGGATACTTTGCTGAGTCAAATGTTGCAGA  713

Query  800   CTCACCTCGGAAGATGTTTCAAACTGCAATATCAGATGTTTATTTGCCTGAAGTATTGAA  859
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  714   CTCACCTCGGAAGATGTTTCAAACTGCAACATCAGATGTTTATTTGCCAGAAGTATTGAA  773

Query  860   GCTTCTTTGTAGCTTCGGGGGAAGGATCTTACAGCGGCCTGGTGATGGCAAGCTTAGATA  919
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct  774   GCTTCTTTGTAGTTTCGGGGGAAGGATCTTACAGAGACCTGGTGATGGCAAGCTTAGATA  833

Query  920   CATTGGAGGGGAGACTCGGATTATCTCAATACGCAAACATGTTGGATTAAACGAATTGAT  979
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834   CATTGGAGGGGAGACTCGGATTATCTCAATACGAAAACATGTTGGATTAAACGAATTGAT  893

Query  980   GCACAAGACTTATGCTTTGTGCAACCATCCGCATACAATCAAGTATCAATTACCAGGAGA  1039
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894   GCACAAGACTTATGCTTTGTGCAACCATCCGCATACAATCAAGTATCAATTACCAGGAGA  953

Query  1040  AGATCTTGATGCCCTTATATCGGTTTGCTCAGATGAGGATCTTCTTCATATGATTGAAGA  1099
             |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954   AGATCTTGATGCACTAATATCGGTTTGCTCAGATGAGGATCTTCTTCATATGATTGAAGA  1013

Query  1100  GTATCAAGAAGCTGAAACAAAGGCTGGATCCCAGAGGATTAGGGTCTTTCTTGTACCTTC  1159
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1014  GTATCAAGAAGCTGAAACAAAGGCTGGATCCCAGAGGATTAGGGTCTTTCTTGTATCTTC  1073

Query  1160  CACAGAATCATCAGAGAGTCCTAAA-ATTTTCCATGAAAGGAATATGAACATAAACCGAA  1218
              |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1074  AACAGAATCATCAGAGAGTCC-AAAGATTTTCAATGAAAGGAATATGAACATAAACCGAA  1132

Query  1219  ACACGAACCAGCAGACGGATATAGATCATTATCAGTATGTTTCAGCTCTTAATGGTATTG  1278
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||
Sbjct  1133  ACACGAACCAGCAGACTGATATAGATCATTATCAGTATGTTTCAGCTCTTAATAATGTTG  1192

Query  1279  TAGATGTGAGTCCTCAAAAGAGTTCCAGCGGCCAAAGTGGAACAAGTCAGACCACACAAT  1338
             | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct  1193  TGGATGTGAGTCCTCAAAAGAGTTCCAGCGGGCAAAGTGGGACAAGTCAGACAACACAAT  1252

Query  1339  TTGGGAATGCTTCAGAATTTAGCCCTACATTTCATCTTCGAGACTCGCCTACTTCTGTTC  1398
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1253  TTGGGAATGCTTCAGAATTTAGCCCTACATTTCATCTTCGAGACTCGCCTACTTCTGTTC  1312

Query  1399  ATACATGGGAACACAAAGAC-AGCAACAGTCCAACCTTCATGAAACCATATGGGAACACG  1457
             |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1313  ATACATGGGAACACAAAGACTA-CAACAGTCCAACCTTCATGAAACCATATGCGAACACG  1371

Query  1458  AATGCTGTTCATTTTATGCCGAAAATGCAGATTCCCAGGAACTCGTTTGGTCAACAATCT  1517
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1372  AATGCTGTTCATTTTATGCCGAAAATGCAGATTCCGAGGAACTCGTTTGGTCAACAATCT  1431

Query  1518  CCTCCAACATCTCCTTTTTCAGTC-CACAAGAGAGCAAACACCGACGTTCCTTATTTTGC  1576
             |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1432  CCTCCAGCATCTCCTTTTTCAG-CTCACAAGAGAGCAAATACCGACGTTCCTTATTTTGC  1490

Query  1577  CGATCAAAATGGTTTCTTTGACCCTTACTTGGCTGCTCCAAACTTCCCACAGCAAAATAG  1636
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct  1491  TGATCAAAATGGTTTCTTTGACCCTTACTTGGCTGCTCCAAACTTCCCTCAGCAACATAG  1550

Query  1637  GTTCTTTTTTGAGACTACTACACAAAAGCAGAAGCATCCAGAAGTGAATCTTCATGACCG  1696
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1551  GTTCTTTTTTGATACTACTACACAAAAGCAGAAGCATCCAGAAGTGAATCTTCATGACCG  1610

Query  1697  GAGGCCAAGCGATGATATTTACCCCCATGGCCAAGCTTATATCGGAGCCGAGAAAATGAC  1756
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct  1611  GAGGCCAAGCGACGATATTTACCCCCATGGCCAAGCTTATATGGGAGCCGAGAAATTGAC  1670

Query  1757  GCTTAAGAAAAACGCTCTTTCTGATCCGCAGCTGCATGATGAGAGCCAAATCAACAATGG  1816
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1671  GCTTAAGAAAAACGCTCTTTCTGATCCCCAGCTGCATGATGAGAGCCAAATCAACAATGG  1730

Query  1817  GTTAGAAGCATTTACCAAACAACCATGGAAAATATTGAGAAAGAATCTACGTGTTGTGGC  1876
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1731  GTTAGAAGCATTTACCAAACAACCATGGAAAATATTGAGAAAGAATCTACATGTTGTGGC  1790

Query  1877  TACATCAAAGTGGGAAGATAGTGATGATATCTATTTCAATAATCCAGAAGGCAAGAGATG  1936
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1791  TACGTCAAAGTGGGAAGATAGTGATGATATCTATTTCAATAATCCAGAAGGCAAGAGAAG  1850

Query  1937  CAAGGAGCTTGAACTCACCAAGGAAGTTCCTAATAGTTGGATCAATCGCGATAATAATCC  1996
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||
Sbjct  1851  CAAGGAGCTTGAACTCACCAAAGAAGTTCCTAATAATTGGATCGATGGCGATCATAATCC  1910

Query  1997  CGATTCTTTTGATCAGGCAACAAAGAAAC-AGGATGGTAGTAACAGTAATAGCTCCTTCA  2055
             || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1911  CGGTTCTTTTGACCAGGCAACAAAGAAACAAGG-TGGTAGTAACAGTAATAGCTCCTTCA  1969

Query  2056  GTCCGAATTATTTCAGTCCGAATCATCAACCAGCTGCTCAGATTACTTCAAGTGATTCAC  2115
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1970  GTCCGAATTATTTCAGTCCGAATCATCAACCAGCTGCTCAGGTTACTTCAAGTGATTCAC  2029

Query  2116  AAGATTCAGGAAGCTCAGTGTTCTCTTTATCAGTTAACACCAACGAAAATTATCTTGATT  2175
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2030  AAGATTCAGGAAGCTCAGTGTTCTCTTTATCAGTTAACACTAACGAAAATTATCTTGATT  2089

Query  2176  GTTCGAGGGAAAAATTTAATGGTTTCCAGCATGACATGTCACTAGATATTCTCATCAGAA  2235
             |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2090  GTTCGAAGGACAAATTCAATGGTTTCCAGCATGACATGTCACTAGATATTCTCATCAGAA  2149

Query  2236  GCCACACTTCAGCTACAGATCAACTATGTAGTACAACCAAGTCAAGTGATAAAGCAGATT  2295
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2150  GCCACACTTCAGCTACAGATCAACTATGTTGTACAACCAAGTCAAGTGATAAAGCAGATT  2209

Query  2296  ACTCCTCACCCAATACAAATTTCCCCGTGGTATTTCTGAGACAGGAACCTATGATTCCGA  2355
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2210  ACTCCTCACCCAATACAAATTTCCCCGTGGAATTTCTGAGACAGGAGCCTATGATTCCGA  2269

Query  2356  GACATGATTTGGAGACAAATAGCGATGATTCAGATACTCAAAAATCTCTTCCTAGAGAAG  2415
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2270  GACATGATTTGGAGACAAATAGCGATGATTCAGATACTCAAAACTCTCTTCCTAGAGAAG  2329

Query  2416  AGAGTATTCACTATAGTGGATTGCCACTTAGGAAGGTGGGAAGTAGAGAAACTACTTTTA  2475
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2330  AGAGTATTCACTATAGTGGATTGCCACTTAGGAAGGTGGGAAGTAGAGAAACTACTTTTA  2389

Query  2476  TGCACACGCAGGGGTCAGATGATTTCTTCAAAAGCAAGCTGCTTGGTCCACAGTTGATAG  2535
             ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2390  TGCACACGCAGGAATCAGATGATTTCTTCAAAAGCAAGCTGCTTGGTCCACAGTTGATAG  2449

Query  2536  TTGAGGATGTGACGAACGAAGTAATTTCAGATAATCTCTTATCAGCTACTATTGTCCCTC  2595
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2450  TTGAGGATGTGACGAACGAAGTAATTTCAGATAACCTCTTATCAGCTACTATTGTCCCTC  2509

Query  2596  AAGTAAATAGGGAGTCCGATGATGATCACAAATCCTACACAAGGGAGAAAGAGATTACAA  2655
             | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2510  ATGTACATAGTGAGTCAGATGATGATCACAAATCCTACACAAGGGAGAAAGAGATTACAA  2569

Query  2656  ATGCGGATCATGAATCAGAAATGGAGGAAAAGTACAAGAAAAGCAGAAACACCGATGATT  2715
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2570  ATGCGGATCATGAATCAGAAATGGAGGAAAAGTACAAGAAAAGCAGAAACACCGATGATT  2629

Query  2716  CATTCAGCGAAGCTGCAATGGTTGAAATCGAAGCTGGAATATATGGCTTACAGATAATTA  2775
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2630  CATTCAGCGAAGCTGCAATGGTTGAAATTGAAGCTGGAATATATGGCTTACAGATAATTA  2689

Query  2776  AAAACACTGATCTTGAAGACTTACACGAGCTTGGATCTGGTACATTTGGAACTGTTTACT  2835
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2690  AAAACACTGATCTTGAAGACTTACACGAGCTTGGTTCTGGTACATTTGGAACTGTTTACT  2749

Query  2836  ATGGGAAGTGGAGAGGAACTGATGTTGCTATCAAGAGGATAAAGAATAGTTGTTTCTCTG  2895
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2750  ATGGGAAGTGGAGAGGAACTGATGTTGCTATCAAGAGGATAAAGAATAGTTGCTTCTCTG  2809

Query  2896  GTGGATCATCCGAGCAAGCACGGCAGACTAAAGATTTCTGGAGAGAAGCTCGGATATTGG  2955
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2810  GTGGATCATCCGAGCAAGCACGGCAGACTAAAGATTTCTGGAGAGAAGCTCGGATATTGG  2869

Query  2956  CGAATCTTCACCATCCTAACGTAGTGGCCTTTTATGGAGTTGTACCAGATGGACCTGGTG  3015
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2870  CGAATCTTCACCATCCCAACGTAGTGGCCTTTTATGGAGTTGTACCAGATGGACCTGGTG  2929

Query  3016  GAACAATGGCAACAGTGACTGAGTATATGGTGAACGGATCTTTGAGGCATGTCTTGCAGA  3075
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2930  GAACAATGGCAACAGTGACTGAGTATATGGTGAACGGATCTTTGAGACATGTCTTGCAGA  2989

Query  3076  GAAAAGACAGATTACTTGATAGGCGCAAAAAACTGATGATAACTCTTGATTCTGCATTTG  3135
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2990  GAAAAGACAGATTACTTGATAGGCGCAAAAAACTGATGATAACTCTTGATTCTGCATTTG  3049

Query  3136  GCATGGAGTATCTACATATGAAAAATATTGTTCATTTTGATCTTAAATGCGATAACTTGC  3195
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3050  GCATGGAGTATCTACATATGAAAAATATTGTTCATTTTGATCTTAAATGCGATAACTTGC  3109

Query  3196  TTGTAAACTTGAGGGATCCACAACGACCCATTTGCAAGGTTGGAGATTTCGGATTGTCGA  3255
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3110  TAGTAAACTTGAGGGATCCACAACGACCCATTTGCAAGGTTGGAGATTTCGGATTGTCGA  3169

Query  3256  GAATAAAACGAAACACGCTTGTCTCTGGTGGAGTAAGAGGAACCCTTCCATGGATGGCAC  3315
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct  3170  GAATAAAACGAAACACGCTTGTCTCTGGTGGAGTAAGAGGAACCCTTCCTTGGATGGCTC  3229

Query  3316  CAGAGCTGCTAAACGGAAGCAGCAATCGGGTCTCAGAGAAAGTCGATGTTTTCTCATTTG  3375
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3230  CAGAGCTTCTAAACGGAAGCAGCAATCGGGTCTCAGAGAAAGTCGATGTTTTCTCATTTG  3289

Query  3376  GTATCGTGATGTGGGAGATCTTGACAGGCGAAGAACCCTATGCGAATCTGCATTGCGGTG  3435
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3290  GTATTGTGATGTGGGAGATCTTGACAGGCGAAGAACCCTATGCGAATCTGCATTGCGGTG  3349

Query  3436  CCATCATTGGTGGAATTGTGAACAATACGTTAAGACCTCCGGTGCCTGAACGGTGTGAAG  3495
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3350  CCATCATTGGTGGAATTGTGAACAATACGTTAAGACCTCCGGTGCCTGAACGGTGTGAAG  3409

Query  3496  CTGAGTGGAGGAAGTTGATGGAGCAATGCTGGTCATTCGATCCAGGAGTACGGCCATCGT  3555
             | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3410  CAGAGTGGAGGAAGCTGATGGAACAATGCTGGTCATTCGATCCAGGAGTACGGCCATCGT  3469

Query  3556  TTACGGAGATTGTTGAACGACTTCGATCAATGACTGTTGCCTTGCAACCCAAGCGAAGAA  3615
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3470  TTACGGAGATTGTTGAACGACTTCGATCAATGACTGTTGCCTTGCAACCCAAGCGAAGAA  3529

Query  3616  CCTAAAAGCCCTCTC  3630
             |||||||||||||||
Sbjct  3530  CCTAAAAGCCCTCTC  3544


 Score =  174 bits (94),  Expect = 4e-42
 Identities = 102/106 (96%), Gaps = 0/106 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3718  TATAGATTTATGAGATTGTGTGGAGTCTGTAAATTAGTATTGAGAAGCATTTACCGGTTT  3777
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3591  TATAGATTTATGAGATTGTGTGGAGTCTGTAAATTAGTATTGAGAGGCATTTACCGGTTT  3650

Query  3778  AGGTAAAAGTTGTATACCAAGAAAGTTGAGGGTCAATTGTGTaaaa  3823
             |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||
Sbjct  3651  AGGTAAAAGTTGTATACCAAAAAAGTTGAAGGTCCATTGTGTAAAA  3696


 Score =  159 bits (86),  Expect = 1e-37
 Identities = 225/283 (80%), Gaps = 45/283 (16%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GCGTTATTTTGAGAGCGCTtctctgcgtctctcttctctctctctctctcGCAAATCAAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GCGTTATTTTGAGAGCGCTTCTCTGCGTCTCTCTTCTTTCTCTCTCTCTCGCAAATCAAA  60

Query  61   AACCTC-AACTTTTGAAAAACTTCAATCTCTAGAAACATTCTTCTCTTTTACCCAAAAAT  119
            |||||| ||| |||| ||||   | |  ||     | |      ||   |  ||| ||| 
Sbjct  61   AACCTCAAAC-TTTG-AAAA--AC-A--TC-----A-A------TC---T--CCAGAAA-  95

Query  120  CTCATCTTTTGTTTGTTTGTTATTCTTCTCCTTCATTGTTAATCTCATTGGCCATTTTTC  179
              ||| |||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct  96   --CAT-TTTTGTTTG--TG-T-TCCTTCTCCTTCATTGTTAATCTCATTGG-CAATTTTC  147

Query  180  CCTAGGGTAATTTCTGGTCTAATTCGTTTGAAT--G---AGA-CTCTGGTCTTTGTTTGA  233
            ||  ||||||  ||    | ||| |||||||||  |   | | ||||||||| |||||||
Sbjct  148  CCCCGGGTAA-GTC----CCAATACGTTTGAATAAGAACAAATCTCTGGTCTCTGTTTGA  202

Query  234  TTTGGTATGATCTTGTAGCAATATACCCTGAAGATGTTTGTTG  276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  203  TTTGGTATGATCTTGTAGCAATATACCCTGAAGATGTTTTTTG  245



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 146864174207


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5