BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G04810.1
Length=3311
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg470466 jgi|Araly1|470466|fgenesh2_kg.1__420__AT1G04810.1 5127 0.0
Ahg482209 jgi|Araly1|482209|fgenesh2_kg.4__1269__AT2G32730.1 3288 0.0
Ahg315425 jgi|Araly1|315425|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000458 1351 0.0
Ahg949799 jgi|Araly1|949799|scaffold_801686.1 93.5 9e-18
> Ahg470466 jgi|Araly1|470466|fgenesh2_kg.1__420__AT1G04810.1
Length=3177
Score = 5127 bits (2776), Expect = 0.0
Identities = 3021/3142 (96%), Gaps = 6/3142 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 111 TTCCGATTAGGATAATGGCCGCCGCCATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGC 170
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTCCGATTAGGATAATGGCCGCCGCGATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGC 60
Query 171 TCAACGAACCCCATCCTTCCTTGAAACTTCACGCTCTCTCATATCTCATCAGATTGGTTG 230
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 61 TCAACGAACCCCATCCTTCTTTGAAACTTCACGCTCTCTCATATCTCAACAGATTGGTTG 120
Query 231 ACCAATTTTGGCCCGAGATCTCCACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATG 290
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACCAATTTTGGCCTGAGATCTCCACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATG 180
Query 291 AAGAGTTTGATCAGCATCAAAGACAGCTTGCTGCCTTGTTGGCCTCCAAGGTTTTCTATT 350
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 181 AAGAGTTTGATCAGCATCAAAGACAGCTTGCTGCGTTGTTGGTCTCCAAGGTTTTCTATT 240
Query 351 ACTTGGGTGAGCTTAACGATTCCTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCCTTGTTTGATG 410
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 241 ACTTGGGTGAGCTTAACGATTCCTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCCTTATTTGATG 300
Query 411 TGTCAGAGGATTCTGATTATATTCATACTCTTCTATCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTA 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGTCAGAGGATTCTGATTATATTCATACTCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTA 360
Query 471 TTCTCAGATCAAAGGCAGTCGAGTCAAGTGAGG-TGGTGGAAATTGACCCGAGATTGGTG 529
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 361 TTCTCAGATCAAAGGCAGTCGAGTCAAGTGAGGAT-GTGGAAATTGACCCGAGATTGGAG 419
Query 530 GCCATTGTTGAACGAATGCTAGACAAATGTATCACTGACGGAAAGTATCAACAAGCCATG 589
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 420 GCCATTGTTGAACGAATGCTAGAAAAATGTATCACTGACGGGAAGTATCAACAAGCCATG 479
Query 590 GGCATTGCTATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCATAAAGAGTGAG 649
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 480 GGCATTGCTATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCATAAAGAGCGAA 539
Query 650 AATGTGCAGGGAACATTATCTTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAATCAAAGA 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 540 AATGTGCAGGGAACATTATCTTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAACCACAGA 599
Query 710 GAATATAGACATGAGGTTCTTCGGTTACTTGTTAATGTTTACCAGAAGCTGGCTTCTCCT 769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 600 GAATATAGACATGAGGTTCTTCGGTTACTTGTTAATGTCCACCAGAAGCTGGCTTCTCCT 659
Query 770 GATTATTTGAGCATTTGCCAATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGCGTTGCAAGC 829
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 660 GATTATTTGAGCATTTGCCAATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGTGTTGCAAGC 719
Query 830 ATATTGGAGAAGCTTCTTCGTTCAGAGAACAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTCCAAATC 889
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 720 ATATTGGAGAAGCTTCTTCGTTCAGAGAGTAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTGCAAATC 779
Query 890 TCTTTCGATCTTGTACAGAATGAGCACCAGGCATTCCTCATGAGTGTTAGAGATCGCCTT 949
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 780 GCTTTCGATCTTGTAGAGAATGAGCACCAGGCATTTCTCATGAGTGTAAGAGACCGCCTT 839
Query 950 CCAGCGCCCAAGACCCGTCCTGTAGAAGCAATTCAAGCTGTTGAAACCTCTACTGCTCAG 1009
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CCAGCGCCCAAGACCCGTCCTGTAGAAGCAGTTCAAGCTGTTGAAACCTCTACTGCTCAG 899
Query 1010 AATGAGAACACTGCAGGGGATGTTCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTG 1069
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 AATGAGAACACTGAAGGGGATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTG 959
Query 1070 CATGAAACAGATCCTGTTGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGCTAAGGGGATT 1129
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 960 CATGAAACAGATCCTGCTGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGTTAAGGGAATT 1019
Query 1130 TTATCTGGAGAGACATCAATACAACTGACACTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCG 1189
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TTATCTGGAGAGACATCAATACAACTGACCCTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCG 1079
Query 1190 GACCTGCTGATCCTGAAGACAATCAAACAATCTGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCAC 1249
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GACCTGCTGATCCTGAAGACAATCAAACAATCCGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCAC 1139
Query 1250 AGTGCTACAATTTATGCTAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTC 1309
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AGTGCTACAATATATGCTAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTC 1199
Query 1310 AGGGAGAATTTGGATTGGCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCCAAGTTTAGTGCTACAGCA 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AGGGAGAATTTGGATTGGCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCA 1259
Query 1370 GGATTAGGTGTTATTCATAGGGGTCACTTGCAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATAC 1429
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GGATTAGGTGTTATTCATAGGGGTCACTTACAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATAC 1319
Query 1430 TTGCCTCAGGGCGGAGCAGGTGGTGGCGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCTTTATAT 1489
|||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1320 TTGCCTCAAGGAGGAGCAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCGTTATAT 1379
Query 1490 GCTCTCGGCCTTATTCATGCAAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGT 1549
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GCTCTCGGTCTTATTCATGCCAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGC 1439
Query 1550 CTACGCAGCACTAGTGTTGAGGTTATTCAACACGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCT 1609
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CTACGCAGCACTAGTGTTGAGGTTATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCA 1499
Query 1610 GCTCTTGGGACAGCTGATGAAGACATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGAC 1669
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GCTCTTGGGACAGCTGATGAAGATATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGAC 1559
Query 1670 AGTGCTGTTGCTGGTGAAGCTGCCGGCATAAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACAGCA 1729
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1560 AGTGCTGTTGCTGGTGAAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACTGCA 1619
Query 1730 ACTGATAAGGCAAGTGAGATGCTCGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATA 1789
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 ACTGATAAGGCAAGTGAGATGCTTGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATA 1679
Query 1790 AGGGGATTGGCTCTAGGAATAGCTCTCACAGTATATGGAAGAGAAGAGGGAGCAGATACT 1849
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 AGGGGATTGGCTCTAGGAACAGCTCTCACAGTATATGGTAGAGAAGAGGGAGCAGATACA 1739
Query 1850 TTGATTGAGCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCA 1909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 TTGATTGAGCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCA 1799
Query 1910 CTCGCATTGGCTTACAGTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATCCGCCAACTTCTTCACTTT 1969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1800 CTCGCATTGGCTTACAGTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATTCGCCAACTTCTTCACTTT 1859
Query 1970 GCTGTGTCTGATGTCAGTGACGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTC 2029
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 GCTGTGTCTGATGTTAGTGACGATGTCAGGAGGACGGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTC 1919
Query 2030 TTATACTCTGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCCGAGTCGTACAAT 2089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1920 TTATACTCTGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCTGAGTCGTACAAT 1979
Query 2090 CCACATGTCCGCTATGGCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATCTCTTGTGCAGGCACTGGTCTG 2149
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1980 CCACATGTCCGCTATGGCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATATCTTGTGCAGGCACTGGCCTG 2039
Query 2150 AGTGAGGCGATATCTTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTAGACTTTGTTCGTCAA 2209
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2040 AGTGAGGCGATATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTGGTAGACTTTGTTCGTCAA 2099
Query 2210 GGTGCTCTGATTGCCATGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGC 2269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 GGTGCTCTGATTGCCATGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGC 2159
Query 2270 GTTGGAGCATTTAGGCGTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATG 2329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GTTGGAGCATTTAGGCGTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATG 2219
Query 2330 AGCAAGATGGGAGCAATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACG 2389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 AGCAAGATGGGAGCAATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACG 2279
Query 2390 ATAAGACTGCTGTCTAAGACAAAACATGACAAAGTCACTGCAGTCATTGGCCTTACTGTC 2449
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||
Sbjct 2280 ATAAGACTGCTTTCTAAGACAAAACATGACAAAGTCACTGCGGTCATTGGACTTGCTGTC 2339
Query 2450 TTCAGCCAGTTTTGGTATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCGTTTTCACCC 2509
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2340 TTCAGCCAATTTTGGTATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCATTTTCACCA 2399
Query 2510 ACCGCCTTCATCGGTTTGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTTGAATTCATGTCACAC 2569
|| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2400 ACTGCGTTCATTGGTTTGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTCGAATTCATGTCGCAT 2459
Query 2570 GCAAAACCATCGTTGTTTGAGTATCCAAAACCAACTACGGTTGCTACTGCCAACACCGCT 2629
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GCAAAACCATCTTTGTTTGAGTATCCAAAACCAACCACGGTTGCTACTGCCAACACCGCC 2519
Query 2630 GCCAAATTACCAACTGCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAAGGCTAAGAAA 2689
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2520 GCGAAATTACCAACAGCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAA 2579
Query 2690 GAAGCAGAGCAGAAAGCTAAAGCTGAAAACTCTGGCAATGAAGCTGGAAAAGCCAATGCA 2749
||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct 2580 GAAGCAGAGCAGAAAACTAATGCCGAAAAGTCTGGCAACGAAGCTGGAAAAGCAAAAGCA 2639
Query 2750 GCGTCAGATGAGAAGGAAGCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTACAACGGTGGAG 2809
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 GCTTCAGATGAGAAGGAACCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTACAACGGTGGAG 2699
Query 2810 AAGAAGGTTGAGCCAGAAGCAACGTTTGAGATTCTAGTCAATCCTGCGCGTGTAGTCCCT 2869
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 2700 AAGAAGGTTGAGCCAGAAGCAACGTTTGAGATTCTAGTGAATCCAGCTCGTGTAGTCCCT 2759
Query 2870 TCACAGGAGAAATACATCAAATTGATGGAGGATAGCCGATATGTACCGATGAAGCTAGCT 2929
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2760 TCACAGGAGAAATACATCAAATTGATGGAGGAAAGCAGATATGTACCGGTGAAGCTAGCT 2819
Query 2930 CCATCAGGGTTTGTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCGCATGAGCCTGAAGTTCTGTCTCTG 2989
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2820 CCATCAGGGTTTGTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCTCATGAGCCTGAGGTTCTGTCTCTG 2879
Query 2990 ACCGATGCACCGACTTCAACAGCATCCCCTGCAGTGGGTGCAGAAGCTGCAGGACAAGCC 3049
||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2880 ACCGATGCACCAACTTCAACAGCATCTCCTGCAGGGGGTGCAGCAGCTGCAGGACAAGCC 2939
Query 3050 CAACAAGCAGCCACCACCTCTGCTATGGCCATAGATGACGAGCCACAACCTCCGCAGGCC 3109
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2940 CAACAAGCATCCACCACCTCTGCTATGGCCGTAGATGACGAGCCACAACCTCCACAGGCC 2999
Query 3110 TTTGAATACGCTTCTCCATGATTTTGTAATTTGATCAGTTGCCATTTTGTTTTCTGTTAA 3169
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 3000 TTTGAATACGCTTCTCCATGATTTTGTTTTTTGATTAGTGGCCAATTTGTTTTCTGTTAA 3059
Query 3170 TTAAACAGAGAAACAGTTCTCCTTTTTT----GAACTTGGAGACTAGTACTTATTGCATT 3225
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 TTAAACAGAGAAACAGTTCTCTTTTTTTTTTTGAACTTGGAGACTAGTACTTATTGCATT 3119
Query 3226 GGTTCCGACTTGTTCTTGTGTT 3247
||||| |||||||| ||||||
Sbjct 3120 CGTTCCCACTTGTTCATGTGTT 3141
> Ahg482209 jgi|Araly1|482209|fgenesh2_kg.4__1269__AT2G32730.1
Length=3302
Score = 3288 bits (1780), Expect = 0.0
Identities = 2638/3045 (87%), Gaps = 87/3045 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 135 CCATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGCTCAACGAACCCCATCCTTCCTTGA 194
||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| |
Sbjct 136 CCATGGTTAGTTCGGCTGGAGGGTTACTAGCAATGCTCAACGAGCCTCATCC-TGCTTTA 194
Query 195 AA-CTTCACGCTCTCTCATATCTCATCAGA-TTGGTTGACCAATTTTGGCCCGAGATCTC 252
|| ||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 195 AAGCTTCATGCGCTCTCTTATCTCAACA-ATTTGGTTGACCAATTCTGGCCTGAGATCTC 253
Query 253 CACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATGAAGAGTTTGATCAGCATCAAAG 312
|||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct 254 CACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATTCGATCTGCATCAAAG 313
Query 313 ACAGCTTGCTGCCTTGTTGGCCTCCAAGGTTTTCTATTACTTGGGTGAGCTTAACGATTC 372
|||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 314 ACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGGCGAGCTTAATGATTC 373
Query 373 CTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCCTTGTTTGATGTGTCAGAGGATTCTGATTATAT 432
||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 374 ATTGTCTTATGCCCTTGGAGCTGGGCCCTTATTTGATGTTTCAGAGGATTCTGATTATGT 433
Query 433 TCATACTCTTCTATCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTATTCTCAGATCAAAGGCAGTCGA 492
|||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||
Sbjct 434 TCATACGCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAATATGCCAGTCTCAGATCAAAAGCAGTTGA 493
Query 493 GTCAAGTGAGGTGGTGGAAATTGA-CCCGAGATTGGTGGCCATTGTTGAACGAATGC-TA 550
||||| |||| ||||||| ||||| ||| || ||| ||| ||||||||| |||||| |
Sbjct 494 GTCAAATGAGATGGTGGACATTGATCCC-AGGCTGGAGGCGATTGTTGAAAGAATGCTTG 552
Query 551 GACAAATGTATCACTGACGGAAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCTATAGAATGCCGG 610
|| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 553 GA-AAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCGATAGAATGCCGG 611
Query 611 AGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCA-TAAAGAGTGAGAATGTGCAGGGAACATTATC 669
||||||||||||||||| || || |||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||
Sbjct 612 AGATTGGATAAGTTGGAAGAGGCTATCACT-AAGAGCGATAATGTTCAGGGAACTTTATC 670
Query 670 TTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAATCAAAGAGAATATAGACATGAGGTTCT 729
|| |||||||||||||| || || |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 671 ATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTTAACCGCAGAGAGTATAGACATGAGGTGCT 730
Query 730 TCGGTTACTTGTTAATGTTTACCAGAAGCTGGCTTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGCCA 789
| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 731 TAGTTTACTTGTTAAAGTCTACCAGAAGCTGCCTTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGTCA 790
Query 790 ATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGCGTTGCAAGCATATTGGAGAAGCTTCTTCG 849
|||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 791 ATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATTTTGGAGAAGCTTCTTCG 850
Query 850 TTCAGAGAACAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTCCAAATCT-C-TTTCGATCTTGTACAG 907
|| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| | | ||| ||||||||| ||
Sbjct 851 CTCGGAGAGCAAGGATGATGCTTTATTGGCGTTGCAAAT-TGCATTT-GATCTTGTAGAG 908
Query 908 AATGAGCACCAGGCATTCCTCATGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCGCCCAAGACCCGT 967
|| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 909 AACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCCCAAAACACGT 968
Query 968 CCTGTAGAAGCAATTCAAGCTGTTGAAACCT-CTACTGCTCAGAATGAGAACACTGCAGG 1026
||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| || | ||
Sbjct 969 CCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAA-CTACTACTGCTCCGAATGAGAACCCTTCGGG 1027
Query 1027 GGATGTTCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTGCATGAAACAGATCCTGT 1086
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 1028 GGATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCACGAGACAGATCCAGT 1087
Query 1087 TGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGCTAAGGGGATTTTATCTGGAGAGACATC 1146
||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 TGATGCTACATATGCTGAGAGGTTGACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGGAGAGACATC 1147
Query 1147 AATACAACTGACACTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCGGACCTGCTGATCCTGAA 1206
|| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1148 TATTCAGCTGACACTTCAATTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCTGATACTGAA 1207
Query 1207 GACAATCAAACAATCTGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCACAGTGCTACAATTTATGC 1266
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1208 GACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTACAATATATGC 1267
Query 1267 TAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTCAGGGAGAATTTGGATTG 1326
|||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 1268 TAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAATTTGGATTG 1327
Query 1327 GCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCCAAGTTTAGTGCTACAGCAGGATTAGGTGTTATTCA 1386
| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1328 GTTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCGGGATTAGGTGTTATTCA 1387
Query 1387 TAGGGGTCACT-TGCAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATACTTGCCTCAGGGCGGAG 1445
|| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1388 CAGAGGTCA-TCTGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCAGGGAGGAG 1446
Query 1446 CAGGTGGTGGCGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCTTTATATGCTCTCGGCCTTATTC 1505
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1447 CAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCCCTTGGCCTTATTC 1506
Query 1506 ATGCAAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGTCTACGCAGCACTAGTG 1565
|||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 1507 ATGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAGCACTAATG 1566
Query 1566 TTGAGGTTATTCAACACGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCTGCTCTTGGGACAGCTG 1625
||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||
Sbjct 1567 TTGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGCTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGGGACAGCTG 1626
Query 1626 ATGAAGACATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGACAGTGCTGTTGCTGGTG 1685
||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1627 ATGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGATAGTGCAGTTGCTGGTG 1686
Query 1686 AAGCTGCCGGCATAAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACAGCAACTGATAAGGCAAGTG 1745
||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 1687 AAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAAGGCAAGTG 1746
Query 1746 AGATGCTCGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAG 1805
||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747 AGATGCTTGCTTATGCTCATGAGACACAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAG 1806
Query 1806 GAATAGCTCTCACAGTATATGGAAGAGAAGAGGGAGCAGATACTTTGATTGAGCAGATGA 1865
|||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1807 GAATAGCTCTTACAGTATACGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGAGCAGATGA 1866
Query 1866 CTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCACTCGCATTGGCTTACA 1925
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||
Sbjct 1867 CTAGAGATCAGGATCCTATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATTGGCTTACA 1926
Query 1926 GTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATCCGCCAACTT-CTTCACTTTGCTGTGTCTGATGTC 1984
||||||| ||||||||||| || || || ||| || || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1927 GTGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAA-TTGCTGCACTTTGCTGTATCTGATGTC 1985
Query 1985 AGTGACGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTCTGATCCA 2044
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1986 AGTGATGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTCTGATCCA 2045
Query 2045 GAGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCCGAGTCGTACAATCCACATGTCCGCTAT 2104
||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2046 GAGCAGACTCCCCGTATTGTATCTCTGCTTTCTGAGTCGTACAATCCACATGTTCGCTAT 2105
Query 2105 GGCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATCTCTTGTGCAGGCACTGGTCTGAGTGAGGCGATATCT 2164
|| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||
Sbjct 2106 GGTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGCGATATCC 2165
Query 2165 TTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTAGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTCTGATTGCC 2224
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2166 TTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTTGATTGCA 2225
Query 2225 ATGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGCGTTGGAGCATTTAGG 2284
||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2226 ATGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGCATTTAGG 2285
Query 2285 CGTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCA 2344
|| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 CGCCAACTTGAGAAGATTATACTCGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCA 2345
Query 2345 ATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACGATAAGACTGCTGTCT 2404
||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||
Sbjct 2346 ATTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATCAGACTACTCTCT 2405
Query 2405 AAGACAAAACATGACAAAGTCACTGCAGTCATTGGCCTTACTGTCTTCAGCCAGTTTTGG 2464
||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 2406 AAGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCAATTTTGG 2465
Query 2465 TATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCGTTTTCACCCACCGCCTTCATCGGT 2524
|||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2466 TATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTTCATCGGT 2525
Query 2525 TTGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTTGAATTCATGTCACACGCAAAACCATCGTTG 2584
||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2526 TTGAATTACGACCTTAAGGTCCCCAAGTTTGAGTTCATGTCACACGCAAAACCGTCTTTG 2585
Query 2585 TTTGAGTATCCAAAACCAACTACGGTTGCTACTGCCAACACCGCTGCCAAA-TTACCAAC 2643
|||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||
Sbjct 2586 TTTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCTGTGAAACTT-CCAAC 2644
Query 2644 TGCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAAGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAGAA 2703
||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2645 CGCTGTTCTCTCAACCTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAAAA 2704
Query 2704 AGCTAAAGCTGAAAA--C-TCTGG-C---AA-----TG--AA-G---------CTGGAAA 2739
||||| |||||||| | ||||| | || || || | |||||||
Sbjct 2705 AGCTATTGCTGAAAAAACATCTGGTCCTGAAAAACCTGTCAATGAAAGTGGATCTGGAAA 2764
Query 2740 AGCCAATGCAGCGTCAGA-TGAGAAGGAAGCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTA 2798
|| || ||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |
Sbjct 2765 AGGAAAAGCA---TCA-ACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC-A 2819
Query 2799 CAACGGTGGAGAAGAAGG-T--TGAGCCAGAAGCAA-CGTTTGAGATTCTAGTCAATCCT 2854
|||| |||||||| | | ||||||||| || | | |||||||||||||| || ||
Sbjct 2820 G--CGGTCGAGAAGAAAGCTGCTGAGCCAGA-GCCAGCATTTGAGATTCTAGTGAACCCA 2876
Query 2855 GCGCGTGTAGTCCCTTCACAGGAGAAATACATCAAA-TTGA-TGGAGGATAGCCGATATG 2912
|| || |||||||| | || ||||||||||| ||| || | | || || ||| ||||||
Sbjct 2877 GCTCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACAT-AAAGTT-ACTTGAAGACAGCAGATATG 2934
Query 2913 TACC-GATGAAGCTAGCTCCATCAGGGTTT-GTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCGCATGA 2970
|||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 2935 TACCAG-TGAAGCTAGCTCCGTCAGG-TTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTCAACACGA 2992
Query 2971 GCCTGAAGTTCTGTCTCTGACCGATGCACCGACTTCAACAGCATCCCCTGCAG-TGGGTG 3029
||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||| ||
Sbjct 2993 GCCAGAGGTTCTCTCTCTGACCGATGCCCCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGG-TG 3051
Query 3030 CAGAAGCTGCAGGACAAGCCCAACAAGCAGCCACCACCTCTGCTATGGCCATAGATGACG 3089
||| | ||| |||| ||| | ||||| || ||||||||| ||||||| |
Sbjct 3052 CAGC-G--GCA---CAAGG--AACCA-CAGCC------TCGGCTATGGCCGTAGATGATG 3096
Query 3090 AGCCACAACCTCCGCAGGCCTTTGAATACGCTTCTCCATGATTTT 3134
||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3097 AGCCACAACCTCCACAAGCCTTTGAATACGCTTC---ATGATTTT 3138
> Ahg315425 jgi|Araly1|315425|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000458
Length=2637
Score = 1351 bits (731), Expect = 0.0
Identities = 1076/1237 (87%), Gaps = 46/1237 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1738 GGCAAGTGAGATGCTCGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATT 1797
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| | |
Sbjct 1356 GGCAAATGAGATGCTCGCTTATGCTCACAAGACTCAGCATGCG-A-A-AAT-A----A-- 1405
Query 1798 GGCTCTAGGAATAGCTCTCACAGTATATGGAAGAGAAGAGGGAGCAGATACTTTGATTGA 1857
| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 ---T-AAGGAATAGCTCTCACAGTATAT-GTAGAGAAGAGGGAGCAGATACTTTGATTGA 1460
Query 1858 GCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCACTCGCATT 1917
|| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1461 GCGGATGACTAGAGATCAGGATCCTATAATTCGTTATGGTGGAATGTATGCACTGGCATT 1520
Query 1918 GGCTTACAGTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATCCGCCAACTTCTTCACTTTGCTGTGTC 1977
||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1521 GGCTTACAGAGGAACCGCAAACAGCAAAGCCATCCGCCAACTTCTGCACTTTGCTGTCTC 1580
Query 1978 TGATGTCAGTGACGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTC 2037
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 TGATGTCAGTGACGATGTCAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTC 1640
Query 2038 TGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCCGAGTCGTACAATCCACATGT 2097
||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||
Sbjct 1641 TGATCCAGAGCAGACTCCCTGTGTTGTTTCCCTGCTTTCCCAGTCATACAATCCGCATGT 1700
Query 2098 CCGCTATGGCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATCTCTTGTGCAGGCACTGGTCTGAGTGAGGC 2157
|||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1701 CCGCTATGGCGCGGCTCTTGCCGTAGGCATCTCCTGTGCAGGCACTGGCCTGAGTGAGGC 1760
Query 2158 GATATCTTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTAGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTCT 2217
||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1761 TATATCCTTGCTGGAGCCACTTACATCAGATGTGGTTGACTTTGTTCGACAAGGTGCTCT 1820
Query 2218 GATTGCCATGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGCGTTGGAGC 2277
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1821 GATTGCCATGGCGATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGAATCTCGCGTTGGAGC 1880
Query 2278 ATTTAGGCGTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGAT-ACAATGAGCAAGA 2336
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | ||| |||||||
Sbjct 1881 GTTTAGGCGCCAACTTGAGAAGATAATACTCGACAAGCGTGCAGATGA-AATAAGCAAGA 1939
Query 2337 TGGGAGCAATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACGATAAGAC 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1940 TGGGAGCAATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGCAGAAGGAATGTGACAATACGAC 1999
Query 2397 TGCTGTCTAAGACAAAACATGACAAAGTCACTGCAGTCATTGGCCTTACTGTCTTCAGCC 2456
| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2000 TTCTCTCTAAGACAAAACATGACAAAGTTACTGCGGTCATTGGCCTTGCTGTCTTCAGCC 2059
Query 2457 AGTTTTGGTATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCGTTTTCACCCACCGCCT 2516
||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2060 AGTCTTGGTATTGGCACCCGCTGATTTACTTCATCAGCTTGGCGTTTTCACCGACCGCGT 2119
Query 2517 TCATCGGTTTGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTTGAATTCATGTCACACGCAAAAC 2576
| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2120 TTATTGGTTTGAACTATGATCTCAAATTCCCAAAGTTTGAATTCATGTCGCATGCAAAAC 2179
Query 2577 CATCGTTGTTTGAGTATCCAAAACCAACTACGGTTGCTACTGCCAACACCGCTGCCAAAT 2636
|||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | || |||||||
Sbjct 2180 CATCTTTGTTTGAGTATCCAAAACCAACTTCGGTTGTTACTGCCTACTCGGCCGCCAAAT 2239
Query 2637 TACCAACTGCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCA--AAG-CTAAGGCTAAGAAAGAAG 2693
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||| ||||
Sbjct 2240 TACCAACTGCTGTGCTCTCAACCTCAGCAAAAGCCATTAAATCTAGGGATAAGAACGAAG 2299
Query 2694 CAGAGCAGAAAGCTAAAGCTGAAAACTCTGGCAATGAAGCTGGAAAAGCCAATGCAGCGT 2753
||| |||||||| || ||| |||| | | || || || || | | |||| |
Sbjct 2300 CAGGGCAGAAAGTTATCGCTCAAAAAGCAGCCAGTGCCGC---AAC-GTCT-TGCAATGA 2354
Query 2754 CAGATGAGAAGGAAGCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTACAACGGTGGAGAAGA 2813
||| || || | | || |||||| ||| ||||||||||| | | | |||||||||
Sbjct 2355 CAG-TG-GA-G-A--CA----CTATGCTGGTCGATAGCACAGCAATA-C--TGGAGAAGA 2401
Query 2814 AGGTTGAGCCAGAAGCAACGTTTGAGATTCTAG-TCAATCCTGCGCGTGTAGTCCCTTCA 2872
||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | || || || || ||| ||||| ||
Sbjct 2402 AGGCTGAGTCAGAAGCAATGTTTGAGATTCTAGCT-AACCCCGCACGGGTACTCCCTGCA 2460
Query 2873 CAGGAGAAATACATCAA-ATTGATGGAGGATAGCC-GATATGTACCGATGAAGCTAGCTC 2930
|||||||||||||| || || ||| ||| | | | |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2461 CAGGAGAAATACATAAAGAT-GATAGAG-AGCGGCAGATACGTACCGATGAAGCTAGCTT 2518
Query 2931 CATCAGGGTTTGTCCTTCTCAGAG-ACTTGCGTCCGC 2966
|||||||||| |||||||||| || |||||| |||||
Sbjct 2519 CATCAGGGTTCGTCCTTCTCA-AGGACTTGCATCCGC 2554
Score = 920 bits (498), Expect = 0.0
Identities = 779/911 (86%), Gaps = 33/911 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 137 ATGGTTAGTTCCGCCG-GTGGGT-TACTGGCAATGCTCAACGAACCCCATCCTTC-CTTG 193
||| |||||| || || || || |||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||
Sbjct 13 ATGATTAGTT-CGGCGAGT-AGTGTACTCGCAATGCTCAACGAAACACATCCTTCAC-TG 69
Query 194 AAACTTCACGCTCTC-TCATATCTCATCAGATTGGTTGACCAATTTTGGCCCGAGATCTC 252
|||||||| || ||| | | |||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||
Sbjct 70 AAACTTCAAGCGCTCAT-AAATCTCAACAGATTTGTTCATCAATTTTGGCCAGAGATCTC 128
Query 253 CACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATGAAGAGTTTGATCAGCATCAAAG 312
| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||
Sbjct 129 CGCTAGCCTCCCAATCTTAGAGTGCTTATATAAAGATGAAAAGTTCAATCAGCATCTAAG 188
Query 313 ACAGCTTGCTGCCTTG-TTGGCCTCCAAGGTTTTCTATTACTTGGGTGAGCTTAACGATT 371
|||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 189 ACAGCTTGCTGCATTGCTT-ATCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGGTGAGCTTAACAATT 247
Query 372 CCTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCCTTGTTTGATGTGTC-AGAGGATTCTGATTA- 429
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || || ||||||||
Sbjct 248 CATTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCTTTGTTTGCTGTG-CTTGATGAATCTGATTAC 306
Query 430 TATTCATACTCTTCTATCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTATTCTCAGATCAAAGGCAGT 489
| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
Sbjct 307 T-TTAATACTCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTAGTCTCAGATGGAAGGCAAT 365
Query 490 CGAG-TCAA-GTGA-GGTGGTGGAAATTGACC-CGAGATTGGTGGCCATTGTTGAACGAA 545
|||| | || | || ||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||||||| ||
Sbjct 366 CGAGTTAAATGAGATGGTGGTGGACATTGACCAC-AGACTGGAGGCTATTGTTGAACAAA 424
Query 546 TGCTAGACAAATGTATCACTGACGGAAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCTATAGAAT 605
|| | || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 TGTTGGAAAAATGTATCAGTGATGGAAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCTATAGAAT 484
Query 606 GCCGGAGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCATAAAGAGTGA-GAATGTGCAGGGAACA 664
|||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| | || ||| ||| ||
Sbjct 485 GCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGCTATAACGAAGAGCAAAGA-TGTTCAGAAAAGT 543
Query 665 TTATCTTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAATCAAAGAGAATATAGACATGAG 724
|||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||
Sbjct 544 TTATCTTATTGCATCAATGTTTCTCACTCTTTTATTAACCGTAGAGAATATAGATTTGAG 603
Query 725 GTTCTTCGGTTACTTGTTAATGTTTACCAGAAGCTGGCTTCTCCTGATTATTTGAGCATT 784
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 604 GTTCTTCGGTTACTTGTTAATGTCTACCAGAAGCTGACTTGTCCTGATTATTTGAGCATT 663
Query 785 TGCCAATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGCGTTGCAAGCATATTGGAGAAGCTT 844
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 664 TGCCAGTGCCTTATGTTCTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATATTGGAGAAACTT 723
Query 845 CTTCGTTCAGAGAACAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTCCAAATCT-CTTTCGATCTTGT 903
|||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| | |||| ||||||||
Sbjct 724 CTTCGTTCGGAGGACAAGGATGATGCTTTACTGGCGTTGCAAAT-TGCTTTTGATCTTGT 782
Query 904 ACAGAATGAGCACCAGGCATTCCTCATGAGTGTTAGAGATC-GCCTTCCAGCGCCCAAGA 962
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||
Sbjct 783 AGAGAACGAGCACCAGGCATTCCTCATGAGTGTTAGAGA-CAGCCTTCCA------ATGA 835
Query 963 CCCGTCCTGTAGAAGCAATTCAAGCTGTTGAAACCTCTACTGCTCAGAATGAGAACACTG 1022
||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 836 CCCTTCCTGTAGTAGCAGTTCAAGCTGCTGAAACCTGTACCGCTCAGAGGGAGAACACTG 895
Query 1023 -CAGGGGATGT 1032
| ||||||||
Sbjct 896 TC-GGGGATGT 905
> Ahg949799 jgi|Araly1|949799|scaffold_801686.1
Length=343
Score = 93.5 bits (50), Expect = 9e-18
Identities = 63/69 (91%), Gaps = 1/69 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2651 CTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAAGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAGAAAGCTAAA 2710
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 221 CTCTCAACCTCAGCTAAAGCCAAAGCTAAGGCTAAGAAAGAAGCAAAGGAGAAAGCTAAT 280
Query 2711 GCTGA-AAA 2718
|||| |||
Sbjct 281 CCTGAGAAA 289
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 124981069732
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5