BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G05380.1 Length=4115 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg470539 jgi|Araly1|470539|fgenesh2_kg.1__493__AT1G05380.2 5884 0.0 > Ahg470539 jgi|Araly1|470539|fgenesh2_kg.1__493__AT1G05380.2 Length=4075 Score = 5884 bits (3186), Expect = 0.0 Identities = 3850/4153 (93%), Gaps = 116/4153 (3%) Strand=Plus/Plus Query 1 CCGTTTTGGTTTCCTCATC--TTT-TTGTACCGCTCCGTTGCG-C-CTCTCTCT-T-CTT 53 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||| Sbjct 1 CCGTTTTGGTTTCCTCATCATTTTGTTGTACCGCTCCGTTGCGCCTCTCTCTCTCTCCTT 60 Query 54 CCCTTCCTCTCTCTAGCGGCGGAGTTACATTGTCGGCCGCCGGGGAAACCGGCGACAGTG 113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 61 CCCTTCCTCTCTCTAGCGGCGGAGTTACATTGTCGGCCGCCGAGGAAACCGGCGACAGTG 120 Query 114 GATTCTCTAAACTCTTAAACTCGCT-ACGTCGATTC-TTAAAGGATTCATCGCCGATAAC 171 | | | ||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 121 G------T-ATCTC-TAAGCTCG-TCACGTCGATTCTTTAAAGGATTCATCGCCG---A- 167 Query 172 TTTTATACCTCCTTCTTTTCCGATAGGATCGGGACTCATTTTGTTTC-CAACACCCCGGA 230 || | || || |||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||| Sbjct 168 ---TA-A-CT--TT-TTTTCCGATAGGATCGTGACTCATCTCGTTTCTC-ACACCCCGGA 218 Query 231 TCCGGTGATTTAGGGCGCTTTTTGATGCTTATCGATG-ATC-G-TTTATGGA---AG-GA 283 |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | | | ||||| || || || Sbjct 219 TCCGGTGATTTAAGGCGCTTTTTGATGCTTTTCGA-GTAACGGATTTATCGATTTAGTGA 277 Query 284 --GGTGGTGGTTC-TGGT-GAGCGTTCACGGATTGCTTCGAATACTCCTC-GAAGCTTGA 338 | | ||| | ||| | | |||| ||| |||| |||||||||||| | | |||| Sbjct 278 TCGTTTATGGAACGGGGTGGTG-GTTC-CGG--TGCTGCGAATACTCCTCTG-ATTTTGA 332 Query 339 AGGAGAAGAGCGATGGGGTTGGTAGGACTGTGTCTTCTACTGAAACTAGGCAGAATTATC 398 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || | | Sbjct 333 AGGAGAAGAGCGATGGGGTTGCTAGGACTGTGTCTTCTACTGGACCT----AG----A-C 383 Query 399 AGAAGAGATCCAGAATGGTTGTTAGTGATTCGGAATCAAGTGATGAGTTTATGAAACCAC 458 ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 384 AGAAGAGATCCAGAATGATTGTTAGTGATTCCGAATCAAGTGATGAGTTTATGAAACCAC 443 Query 459 CTCCACGTAGAAGTGGCGTTGACCGCAAAACCCTTGGAGCAAAAGAGAAGTTTGTTCGGA 518 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 444 CTCCACGTACAAGTGGCGTTGACCGCAAAACCCTTGGGGCAAAAGAAAAGTTTGTT---- 499 Query 519 AGAGGGATAGGGTTGAGCATGATCGAAATGGGTATGTGAGGAGGAACAACGAGGCGTCAG 578 |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 500 ---GGGA-A-----GAG--GGATCGAAATGGGTTTGTGAGGAGGAACAAAGAGGCGTCAG 548 Query 579 GAAGTTTTATGAAGATGAACAAGTTAGATATTTTTGAGTTTGATGAATACGATGGGTTTG 638 ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 549 GAAGTTTTATGAAGAGGGACAAGTTAGATGTTTTTGAGTTTGATGAATACGATGGGTTTG 608 Query 639 ATAGCGCCAATTTGATGAGGAAACGCTTTGATAATGGCAGTGTTGGTGTTAGAGGAAGAA 698 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 609 ATAGCGCCAATTTGATGAGAAAACGCTTTGATAATGGCACTGTTGGTGTTAGCGGAAGAA 668 Query 699 GCTCTTTTGCATCCAGAAGGGTTGATAGTAGTGTGGGAAGGTCTGGATCAGGCAGGGAGG 758 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 669 GCTCTTTTGCATCCAGAAGGGTTGATAGTAGTGTGGGAAGGTCTGGATCAGGCAGGGACC 728 Query 759 GTCTATTTGATA-GA--AGAAGAAACACATTTGTAAATGGCACATGTAGTGCGAGCTCAC 815 |||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 729 GTCTATTTTATAGGAGGAGGAGACACACATTTGTAAATGGCACAGGTAGTACGAGCTCAC 788 Query 816 AGGAAGATTCGAGTAGTGAATCTGATTCTGATGAACCAATGAGGGTGCAAGGGATAAACG 875 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 789 AGGAGGATTCGAGTAGTGAATCTGATTCTGATGAACAAATGAGGGTGCAAGGGAGAAACG 848 Query 876 GTGTTCTGAAGGTGAAGGTCAACAATAAGACAAACACTCTTGCTGCCTCAATCAACCCCC 935 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || Sbjct 849 GTGTTCTGAAGGTGAAGGTCAACAATAAGACAAGCACTCTTGCTGCTTCAATCAACCACC 908 Query 936 GGGATGCAGAGATATATGAGAGACCGCCT-TCCTCCAGGAAGGCACAAAGGCGTGAGAAT 994 ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 AGGACGCAGAAATATATGAGAGACC-TCTCTCCTCTAGGAAGGCACAAAGGCGTGAGAAT 967 Query 995 GTTGTAGTTAAACCACCCTTTAGGAAATCAAATAATGTAGACAATAATTCAGAGTCAGAA 1054 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| Sbjct 968 GTTGTAGTTAAACCAACCTTTAGGAAATCAAATAATGTGGAGAGTAATTCAGAGTCAGAA 1027 Query 1055 GAGAGCGACATGTCGAGGAAGTCAAAAAGGAAGAAATCAGAGTATAGTAAGCCCAAAAAG 1114 ||||||||| || | | || |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1028 GAGAGCGAC--GT-------G-C-----CGAGGAAATCAGAGTATAGTAAACCCAAAAAG 1072 Query 1115 GAGTTCAATACCAAATCAAAATCAACCTTTCCTGAATTGGTGAATCCTGATGTGAGAGAG 1174 ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct 1073 GAGATCAATACCAAATCAAAATCAAACTTTCCTGAATCGGTGAAACCTGATGTGAGAGAG 1132 Query 1175 GAAAGAAGAGGAAGGCGTGGTGGTGGAACAGACAAGCAAAGATTACGTGAGCGAATTAAG 1234 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1133 GAAAGAAGAGGAAGGCGTGGTGGTGGAACAGAGAAGCAAAGATTACGTGAGCGAATTAAG 1192 Query 1235 GGAATGCTAACTGATGCAGGATGGACGATAGACTATAAACCTAGGAGAAATCAAAGTTAT 1294 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| Sbjct 1193 GGAATGCTTACTGATGCAGGATGGACGATAGACTATAAACCTAGGAGGAACCAAAGTTAT 1252 Query 1295 CTGGATGCTGTATATGTAAACCCCTCAGGAACAGCATATTGGTCAATAATTAAGGCATAT 1354 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1253 CTGGATGCTGTATATGTAAACCCCTCAGGGACAGCATATTGGTCAATAATTAAAGCATAT 1312 Query 1355 GATGCACTTCTAAAGCAGTTAAAAGACGAGGGAGTTGATGCCAGGCCTAGGAAAGATACT 1414 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1313 GATGCACTTTTAAAGCAGTTAAAAGACGAGGGAGTTGATGCCAGGCCTAGGAAAGATACT 1372 Query 1415 GCTGCCGTTGCTTCAGTATCTGAGGAAATTGTGAACAAGTTAGCAAGGAAGGCAAAGAAG 1474 ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1373 GCTGCAGTTGCTTCAGTATCGGAGGATATTGTGAACAAGTTAGCAAGGAAGGCAAAGAAG 1432 Query 1475 ACCCGGTCTGAGATGAC-AAAGAAATGGAAACAAAATTCCAGTGGTAGTGATAGTGAAAA 1533 |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1433 ACCCGGACTGAGATGACGAAA-AAATGGAAAAAAAATTCCAGTGGTAGTGAAAGTGAAAA 1491 Query 1534 CAAAAGTGAGGGAGGAGCCTACACTGATACCTCTGAAGAGAGGATACGTTCATCCATAAA 1593 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1492 CAAAAGTGATGGAGGAGCCTACACTGATACCTCTGAAGAGAGGATACGTTCATCCATAAA 1551 Query 1594 GCTGGGTGGGAAATCCACCAAAAAGGGAAGAAATGGAGCCGATTGGGATGAGTTACACAA 1653 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | Sbjct 1552 GCTGGGTGGGAAATCGACCAAAAAGGGAAGAAATGGAACTGATTGGGATGAGTTACAC-A 1610 Query 1654 GAAA-AGTAAAAGATCATTATATTATAATAA-TGCAAGGCCATCATGTGGATCAGATTCA 1711 ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 1611 CAAAGAGTAAAAGATCATTATATTATAA-AAGTGCAAGGCCATCCTCTGGATCAGATTCA 1669 Query 1712 CATTATCTACATGGACGaaaaaccaaaaaaaTTGGAAGATGTACTTTGTTGGTGCGTAGT 1771 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1670 CATTATCTACATGGACGAAAAAGCAAAAAAATTGGAAGATGTACTTTGTTGGTGCGTAGT 1729 Query 1772 TCTAAGGATAAAAAGAATCCAGCGATTAATGGGTTCAATCCATACTCTGGAAAAAGGACA 1831 ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1730 TCTAAGGATAAAAAGAATCCAGCGATTGACGGGTTCAATCCATACTCTGGAAAACGGACA 1789 Query 1832 TTGCTCTCTTGGTTGATTGAATCTGGAGTTGTCCAACTAAGACAAAAAGTGCAATACATG 1891 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 1790 TTGCTCTCTTGGTTGATTGAATCTGGAGTTGTCCAACTCAGACAAAAGGTGCAATACATA 1849 Query 1892 AGGCGTCGAGGTGCAAAGGTGATGCTGGAGGGATGGATAACAAGAGAGGGGATTCATTGT 1951 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1850 AAGCGTCGAGGTGCAAAGGTGATGCTGGAGGGATGGATAACAAGAGAGGGGATTCATTGT 1909 Query 1952 GATTGCTGCAGTAAAATACTCACAGTCTCCAGGTTTGAGATTCATGCTGGGAGCAAGTCA 2011 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1910 GATTGCTGCAGTAAAATTCTCACAGTCTCCAGGTTTGAGATTCATGCTGGGAGCAAGTCA 1969 Query 2012 TGTCAGCCTTTCCAAAATATTTATCTGGAATCTGGCGCTTCTCTTCTTCAATGCCAAGTC 2071 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1970 TGTCAGCCTTTCCAAAATATTTATCTGGAATCTGGCGCTTCTCTTCTTCAATGCCAAGTC 2029 Query 2072 AGAGCGTGGAATATGCAGAAAGATGCTACGAATCTTGCTCTCCATCAAGTGGACACTGAC 2131 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2030 AGAGCGTGGAATATGCAGAAAGATGCTACGAATGTTGGTCTCCATCAAGTGGACACTGAC 2089 Query 2132 GGGGATGATCCAAATGATGATGCTTGTGGTATATGCGGTGATGGTGGAGATTTGATTTGC 2191 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2090 GGGGATGATCCAAATGATGATGCTTGTGGTATCTGCGGAGATGGTGGAGATTTGATTTGC 2149 Query 2192 TGTGATGGTTGTCCATCAACATATCATCAAAACTGCCTTGGTATGCAGGTGCTTCCTTCG 2251 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2150 TGTGATGGTTGTCCATCAACATATCATCAAACCTGCCTAGGTATGCAGGTGCTTCCTTCG 2209 Query 2252 GGTGATTGGCATTGTCCAAATTGCACATGCAAGTTTTGTGATGCAGCTGTGGCTTCTGGT 2311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2210 GGTGATTGGCATTGTCCAAATTGCACATGCAAGTTTTGTGATGCAGCTGTGGCTTCTGGT 2269 Query 2312 GGCAAGGACGGGAATTTTATATCATTACTTTCCTGCGGCATGTGTGAGAGAAGATATCAC 2371 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2270 GGCAAGGACGGAAATTTTTTATCATTACTTTCCTGCAGCATGTGTGAGAGAAGATATCAC 2329 Query 2372 CAGTTATGCCTGAATGATGAAGCTCACAAGGTTCAATCTTTTGGTTCAGCTTCTTCGTTT 2431 || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2330 CAATTATGCCTGAGTGATGAAGCTCAGAAGGTTCAATCTTTTGGTTCAGCTTCTTCATTT 2389 Query 2432 TGTGGGCCTAAGTGCTTAGAGCTCTTCGAAAAGTTACAGAAGTATCTTGGTGTCAAAACT 2491 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 2390 TGTGGGCCTAAGTGCTTAGAGCTCTTCGAAAAGTTACAGAAGTATCTTGGTGTGAAAAAT 2449 Query 2492 GAAATAGAAGGTGGCTACTCGTGGTCTCTTATACATAGGGTGGACACTGATTCAGATACA 2551 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2450 GAAATAGAAGGTGGCTACTCGTGGTCTCTTATACATAGGGTGGACACTGATTCAGATCCA 2509 Query 2552 AATTCCCAAATGTCGGCACAAAGGATCGAAAATAATTCAAAGCTAGCTGTCGGGCTGGCT 2611 ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2510 AATTCTCAATTGTCAGCACAAAGGATCGAAAATAATTCAAAGCTAGCTGTCGGGCTGGCT 2569 Query 2612 ATCATGGATGAATGCTTTTTGCCCATAGTTGACAGAAGGAGTGGGGTAGATCTGATTCGC 2671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2570 ATCATGGATGAATGCTTTTTGCCCATAGTTGACAGAAGGAGTGGGGTAAATCTGATTCGC 2629 Query 2672 AATGTCCTTTATAATTGCGGATCCAATTTCAACCGGATAAATTATACTGGCTTCTACACT 2731 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2630 AATGTCCTTTATAATTGTGGATCCAATTTCAACCGGATAAATTATACTGGCTTCTACACT 2689 Query 2732 GCTATCCTAGAGAGAGGAGACGAAATTATATCCGCGGCATCTCTCAGGTTCCATGGTATG 2791 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2690 GCTATCCTAGAGAGAGGAGATGAAATTATATCTGCGGCATCTCTCAGGTTCCATGGTATG 2749 Query 2792 CAATTGGCGGAGATGCCATTTATTGGAACCAGGCACATATATAGGCGACAAGGAATGTGT 2851 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 2750 CAATTGGCGGAGATGCCATTTATTGGAACCAGGCACATATACAGGCGTCAAGGAATGTGT 2809 Query 2852 CGTCGCCTTTTTGATGCGATTGAATCGGCTATGCGTTCTCTGAAGGTTGAGAAATTGGTT 2911 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2810 CGTCGCCTTTTTGATGCGATTGAATCGGCTATGCGTTCTCTCAAGGTTGAGAAATTGGTT 2869 Query 2912 ATCCCTGCCATTCCAGACTTCTTGCATGCATGGACTGGTAACTTTGGATTTACTCCTCTT 2971 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2870 ATCCCTGCCATTCCAGACTTCTTGCATGCATGGACTGGTAACTTTGGATTCACTCCTCTT 2929 Query 2972 GATGACTCAGTTAGAAAAGAGATGAGGTCCCTGAACACATTGGTATTCCCTGGAATAGAC 3031 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2930 GATGACTCAGTTAGAAAAGAGATGAGGTCCCTGAACACATTGGTATTCCCTGGAATAGAC 2989 Query 3032 ATGTTACAGAAACCGCTGCTCCATGAAGAAAACATTATAGCTCCTGCAGCTGCAGGTGAT 3091 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2990 ATGTTACAGAAACCGCTGCTCCATAAAGAAAACATTATAGCTCCTGCAGCTGCAGGTGAT 3049 Query 3092 GCCATGATTTCAGAGGTAGAGACAGAAAAGAAATCAGAATTTACCTCTTCTGTTGAAATT 3151 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 3050 GCCATGATTTCAGAGATAGAGACAGAAAAGAAATCAGAAGTTGCCTCTTCTGTTGAAATT 3109 Query 3152 GGTCCATACGCAGTAGAGGGTGATGAGTTTGTCGCTGATGCTGCAAACTGCTACAAAGAT 3211 ||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct 3110 GGTCCATACTCCGTTGAGGGTGCTGAATTTGTCGCTGGTGCTGCAAACTGCTACAAGGAT 3169 Query 3212 ATTCTTGCTTCTGATGAAGACAATATTCTGGTATCAGTTGAAACAGCCATGGGCACAATT 3271 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3170 ATTCTTGCTTCTGATGAAGACAATATTCTGGTACCAGTTGAAACAGCCATGGGCACGATT 3229 Query 3272 TGCAAGCCAAAGGATGAATTGAGTAGACATTTTCGCGGTGAAGAAAGTGGCATTAGCTCT 3331 | |||| | ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct 3230 TCCAAGTCGGAGGATGAGTTGAGTAGGCATTTTTGCGCTGAAGAATGTGGCATTAGCTCT 3289 Query 3332 TCTCCTTGTCAGATCACATTAAAGTCTGGCACTAAGCACGTATTAGGTCATATATGTGAT 3391 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3290 TCTTCTTGTCAGATCACATTAAAGTCTGGCACTAAGCACGTATTAGGTCATATATGTGAT 3349 Query 3392 GATACAGGATCATCATGTGAAGATGGCCTTACGGATGTGAATGTCGAAGCTGATGCTAGC 3451 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3350 GATACAGGATCATCATGTGAAGGTGGCCTTACGGATGTGAATGTCGAAGCTGATACTAGC 3409 Query 3452 TTACTCTCTCAGGAAATCCAACAAGCATCAGCTAGTTTTAAGGTTGAAAACAATCTCTCT 3511 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| Sbjct 3410 TTACTCTCTCAGGAAATCCAACAAGCATCAGCTAATTTTCAGGTTGAAAACAACCTCTCT 3469 Query 3512 TTATCTATTTCTGGTAGAGGATCATCAGATTTGAGCTCTATCTCCCAAGAAGTCAAGAGT 3571 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3470 TTATCTATTTCTGGTAGAGGATCATCAGATTTGAGCTCTATCTCCCAAGAAGCCAAGAGT 3529 Query 3572 GAACAAACCTCATCGAATTTAGACGGGGTTCCTTCATGTAAAGACTATAACATACTTGTT 3631 ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 3530 GAACATACATCTTCGAATTTAGACGGGTTTCCTTCATGTAAAGACTATAACATACTCGGT 3589 Query 3632 CCTGGTGCTAAGTTGGATAAATCAAAAGATGATGCATTCGCGGATGGTTTTCTTTTGTGA 3691 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3590 CCTGGTGCTAAGTTGGATAAATCGAAAGATGATGCATTCGCGGATGGTTTTCTTTTGTGA 3649 Query 3692 GGGGAAAAACCCCTTGCACTCGGGATGAAAATCTGAGCTCTTCATTTCAGTGACAGACCT 3751 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct 3650 GGGGAAAAACCC-TTGTTCTCGGGATGAAAATCTGAGCTCTTCATTTAAGTGTCAGACCT 3708 Query 3752 GTTCTCCTAGAGGAGGTATAG-TAT--C-TC-CC-TGGATTTGTTGGGACATTTGGATTG 3805 |||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3709 GTTCTCCTAGAGGAGGTATAACTATAACATCTCCCTGGATTTGTTTTGACATTTGGATTG 3768 Query 3806 TCATAACAGTCAAGCTGCATTATCCAGCAGTCGAGATTTAGTTTCACATATCCCATATAA 3865 |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 3769 TCATGACTTTCAAGCTGCATTATCCAGCAGTCGAGATTCAGTTTCACATATCCCATA-A- 3826 Query 3866 GAGATTTGTC--GCCCCCCGTCTGAGCTGCTAATGATACTGTAGAATGGAAAAGCATATG 3923 ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || Sbjct 3827 GAGATTTGTGATGCCCCCCCTTTGAGCTGCTAATGATACTGTTGAATGGTAAAGCTTGTG 3886 Query 3924 ATAATATACTGTGGAATTCCAATATCTTTTAAGCCTGAGTGATCTCATATTCAACTCGAT 3983 |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct 3887 ATAATATACTGTGGAATTACAATATCTTTCAAGCCTGAGTGACCTCATATTCAGCTCGAT 3946 Query 3984 TAGTGTGGAAAGAGTCCTGTTGTTGTTGCTGCCTTTGCCTGTATTTATTTTTCACCCAGA 4043 ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||| |||||||||| Sbjct 3947 TAGTGTGGAAAGAGTCCTGTTGTTGTTA-T-C-TTTACTTGTATTTATTATTCACCCAGA 4003 Query 4044 TTCAGGGTTTTACAACATTGTATTATATGAAGTTCCGATTA-TATATATGGGGCCATTCT 4102 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||||| Sbjct 4004 TTCAGGGTTTTACAACATTGTATTATATGAAGTTCC-AGTAATATATTTGGAGCCATTCT 4062 Query 4103 AGTTTTGCATATC 4115 ||||||||||||| Sbjct 4063 AGTTTTGCATATC 4075 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 155579358424 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5