BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G05910.1
Length=3942
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg470606 jgi|Araly1|470606|fgenesh2_kg.1__560__AT1G05910.1 6263 0.0
> Ahg470606 jgi|Araly1|470606|fgenesh2_kg.1__560__AT1G05910.1
Length=3887
Score = 6263 bits (3391), Expect = 0.0
Identities = 3702/3847 (96%), Gaps = 42/3847 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 19 aaa-aaaaaaaaaGAGGGAGAAGAGCAACGAAGACGGACCTGCAAATTCTGCAGTCTCCA 77
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AAACAAAAAAAAAGAGGGAGAAGAGCAACGAAGACGGACCTGCAAATTCTGCAGTCTCCA 60
Query 78 CTGACACTTTCGATCTTTCTCTCTGTCCACTTTCTTCAATCCTCAGTTGTTTATGGAAGG 137
||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 61 CTGACACTTTCGATCATTCTCTCTGTTCACCTTCTTCAATCCTCAGGTGTTTATGGAAGG 120
Query 138 AGATAACCATCAGAGGTAGCATTTATCCATGCATCCCAAGCGATCAAGTCAAGGAGATGG 197
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGATAATCATCAGAGGTAGCATTTCTCCATGCATCCTAAGCGATCAAGTCAAGGAGATGG 180
Query 198 TTCAGTTACTAAGCCAGTTAGAACCAGTGATAGGCTTAGGAGGAGGCCCAAATTGCATGG 257
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 181 GTCAGTTACTAAGCCAGTTAGAAGCAGTGATAGGCTTAGGAGGAGGCCCAAATTGTATAA 240
Query 258 TCGCTCATACTTGTACTACT-CTTCACCAAACATGTTACATAATCGGAAAAGAAACACAA 316
|||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 241 TCGCTCATAC--GTA-TACTAC-TCACCAAACATATTACATAATAGGAAAAGAAACACAA 296
Query 317 AGACAAGAACGGCAGCCTCTCAGATCGCAAAGATGCTGCACAAAGGAAACCGTCCAGCGA 376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 297 AGACAAGAACGGCAGCCTCTCAGATCGCAAAGATGCTGCACAAAGGGAGCCGTCCAGCGA 356
Query 377 GGGCATCAAATGCCGCGCCAATTGCATCTGATCTCCGGCGTTCCACGAGGAAGAGAAGAA 436
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GGGCATCAAATGCCACGCCAATTGCATCTGATCTCCGGCGTTCCACGAGGAAGAGAAGAA 416
Query 437 TTTCTGTAAACCTGGAGGACTATACAGACAGTTCTGGAGCGGAGGATGAGGATATGATGA 496
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 417 TTTCTGTAAACCTTGAGGACTATACAGACAGTTCTGGAGCGGAGGATGAAGATATGATGA 476
Query 497 GTCCAGCATATCGAACTTTGA-G-G-AG-G------A--GAGTTCATAAAAACTT-CTCA 543
||||||||||||||||||||| | | || | | ||||||||||||| || ||||
Sbjct 477 GTCCAGCATATCGAACTTTGAGGAGTAGAGTTTATAATGGAGTTCATAAAAA-TTACTCA 535
Query 544 ACTTCAAAAAGTAGAAAGGACATGGATGCTGAATTGGCACCACGTCGTGAGGGTCTCCGT 603
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 536 ACTTCAAAAAGTAGAAAGGACATGGATGCTGAATTGGCACCACGTCGTGAAGGTCTCCGT 595
Query 604 CCTCGTCGTTCAACAACAATTGCTAATAAACGACTGAAAACAGAATCTGGCGCTGACCAA 663
|||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 596 CCTCGTCGTT------C-A-----AATAAACGACTGAAAACAGAATCTGGTACTGACCAA 643
Query 664 GATACATCAGAAGAGAAAGATGGCCAAGATGAAACTGAGAATGGGAATGAATTAGATGAT 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 GATACATCAGAAGAGAAAGATGGCCAAGATGAAACCGAGAATGGGAATGAATTAGATGAT 703
Query 724 GCGGATGATGGTGAAAATGAGGTTGAGGCTGAAGACGAGGGTAatggagaagatgaaggc 783
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 704 GCGGATGATGGTGAAAATGAGGTTGAGGCTGAAGACGAGGGTAATGGAGAAGATGAAGGT 763
Query 784 gatggcgaagatgagggagaagaagatggtgatgatgatgaagagggtgatgaagaacaa 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 GATGGCGAAGATGAGGGAGAAGAAGATGGTGATGATGATGAAGAGGGTGATGAAGAACAA 823
Query 844 gagggaaggaagagatatgatCTGCGAAACCGTGCTGAAGTCCGGAGAATGCCTACGGGA 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |
Sbjct 824 GAGGGAAGGAAGAGATATGATCTGCGAAACCGTGCTGAAGTGCGGAGGATGCCTACAGAA 883
Query 904 GAAATCAACAAGCAACAACAACCTAGATCTCCTCGGAGAGTATTGCATCAGGGCATGGGC 963
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 884 GAAATCAACAAGCAACAACAACCTAGATCTCCTCGGAGAGTATTGCATCAAGGCATGGGC 943
Query 964 ACCAGGGTTGGAAGAG-ATGGTAGGAGAGGTGGGTCTCGGCCTCACAAGCGCCATCGCTT 1022
|||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 944 ACCAGGGTTGGAAG-GCATGTTAGGAGAGGTGGGTCTCGGCCTCACAAGCGCCATCGTTT 1002
Query 1023 TACAAGAACAGATGATTCAGATGATTCTCTTCTTGTGGACGAGTTGGACCAGGGCCCTGC 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 TACAAGAACAGATGATTCAGATGATTCTCTTCTTGTGGACGAGTTGGACCAGGGCCCTGC 1062
Query 1083 AATTCCCTGGGCTCGAGGTGGAAACAGATCTGGAGCACCTTGGCTATTTGGGGGTTTGGA 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 AATTCCCTGGGCTCGAGGTGGAAACAGATCTGGAGCACCTTGGCTATTTGGGGGTTTGGA 1122
Query 1143 CACGTATGGGTCAAGTTCATTGGGGTTGAACGTTGGAGCTTCTGGTTGGGGTCACCAGAG 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 CACGTATGGGTCAAGTTCATTGGGGTTGAACGTTGGAGCTTCTGGTTGGGGTCACCAGAG 1182
Query 1203 TGATGGTTTGGCTGCATTAACTTCTGGTGTTCAGACTGCTGGCCCAAGCTCTAAAGGAGG 1262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1183 TGATGGTTTGGCTGCATTAACTTCTGGTGTTCAGACTGCTGGGCCAAGCTCTAAAGGAGG 1242
Query 1263 TGCAGATATCCAGCCACTGCAGATTAATGAGGATATAAATTTTGATGACATTGGTGGGCT 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 TGCAGATATCCAGCCACTGCAGATTAATGAGGATATAAATTTTGATGACATTGGTGGGCT 1302
Query 1323 GTCCGAATACATTAATGATTTGAAGGAAATGGTTTTCTTTCCGTTGCTGTATCCAGAGTT 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 GTCCGAATACATTAATGATTTGAAGGAAATGGTTTTCTTTCCGTTGCTGTATCCAGAGTT 1362
Query 1383 CTTTGCAAGTTACAGCATTACTCCTCCCAGAGGTGTACTGCTGTGTGGTCCTCCAGGCAC 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 CTTTGCAAGTTACAGCATTACTCCTCCCAGAGGTGTACTGCTGTGTGGTCCTCCAGGCAC 1422
Query 1443 TGGTAAAACACTGATTGCTCGAGCATTAGCATGTGCTGCTTCAAAAGCTGGACAGAAAGT 1502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 TGGTAAAACACTGATTGCTCGAGCATTAGCATGTGCTGCTTCAAAAGCTGGACAGAAAGT 1482
Query 1503 TAGCTTTTATATGCGGAAGGGTGCTGATGTTCTTAGTAAGTGGGTTGGCGAGGCTGAGAG 1562
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 TAGCTTTTATATGCGGAAGGGTGCTGATGTTCTTAGCAAGTGGGTTGGCGAGGCTGAGAG 1542
Query 1563 ACAGCTAAAGCTACTCTTTGAGGAGGCTCAGCGAAACCAGCCTTCCATAATCTTTTTTGA 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 ACAGCTAAAGCTACTCTTTGAGGAGGCTCAGCGAAACCAGCCTTCCATAATCTTTTTTGA 1602
Query 1623 TGAAATTGATGGTCTTGCTCCTGTAAGATCTAGCAAGCAGGAACAAATACATAATTCTAT 1682
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 TGAAATTGATGGTCTTGCTCCCGTAAGATCTAGCAAACAGGAACAAATACATAATTCTAT 1662
Query 1683 TGTTTCAACTTTACTGGCGCTGATGGATGGCCTCGATTCTCGTGGTCAAGTTGTTCTCAT 1742
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 TGTTTCAACTTTGCTGGCGCTGATGGATGGCCTCGATTCTCGTGGTCAAGTTGTTCTCAT 1722
Query 1743 TGGAGCAACAAACAGGGTAGATGCAATAGACGGAGCTTTACGCCGCCCTGGCAGATTCGA 1802
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1723 TGGAGCAACAAACAGGGTAGATGCAATAGATGGAGCGTTACGCCGCCCTGGCAGATTCGA 1782
Query 1803 TCGGGAGTTTAATTTTTCCTTACCAGGTTGCGAAGCACGAGCCGAAATATTGGATATTCA 1862
||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 TCGGGAGTTCAATTTTTCTTTACCAGGCTGCGAAGCACGAGCCGAAATATTGGATATTCA 1842
Query 1863 CACTCGTAAATGGAAGCACCCACCTACTAGGGAGCTGAAAGAGGAACTGGCAGCTACTTG 1922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 CACTCGTAAATGGAAGCACCCACCTACTAGGGAGCTGAAAGAGGAACTGGCAGCTACTTG 1902
Query 1923 TGTAGGGTATTGTGGTGCTGATCTAAAAGCTTTGTGCACTGAAGCTGCGATTCGTGCTTT 1982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 TGTAGGGTATTGTGGTGCTGATCTAAAAGCTTTGTGCACTGAAGCTGCGATTCGTGCTTT 1962
Query 1983 TCGTGAGAAATATCCACAAGTTTATACCAGTGATGATAAATACGCCATAGATGTTGGGTT 2042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 TCGTGAGAAATATCCACAAGTTTATACCAGTGATGATAAATACGCCATAGATGTTGGGTT 2022
Query 2043 GGTTAATGTTGAAAAGAGCCACTTTGTAGAGGCAATGTCAGCTATTACTCCTGCTGCCCA 2102
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2023 GGTTAACGTTGAGAAGAGCCACTTTGTAGAGGCAATGTCAGCTATTACCCCTGCTGCCCA 2082
Query 2103 TAGAGGGTCTGTTGTGCAATCCAGACCACTCTCTCCGGTTGTGTTGCCATGTTTACATCG 2162
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2083 TAGAGGGTCTGTTGTGCAATCCAGACCACTCTCTCCGGTTGTATTGCCATGTTTACATCG 2142
Query 2163 ACACCTCCTTGAATCCATGAGTTTAATATCAGATATTTTTCCCTCGTCAGCCACGTCATC 2222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 ACACCTCCTTGAATCCATGAGTTTAATATCAGATATTTTTCCCTCGTCAGCCACGTCATC 2202
Query 2223 GGAGTTGACGAAGCTGTCAATACTTACATTTGGATCTGCAATTCCTCTTGTTTATCGACC 2282
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2203 GGATTTGACGAAGCTGTCAATACTTTCATTTGGATCTGCAATTCCTCTTGTTTATCGACC 2262
Query 2283 TCGACTTTTGCTGCTTGGTGGTGAAGGAGTTGGACTGGATCATCTTGGGCCTGCAATTTT 2342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 TCGACTTTTGCTGCTTGGTGGTGAAGGAGTTGGACTGGATCATCTTGGGCCTGCAATTTT 2322
Query 2343 ACATGAGCTAGAAAAGTTCCCTATTCATTCTCTGGGACTTCCATCTCTCCTTTCGGATCC 2402
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2323 ACATGAGCTAGAAAAATTCCCTATTCATTCTCTGGGACTTCCATCTCTCCTTTCGGATCC 2382
Query 2403 TGGTGCAAAGACCCCAGAAGAAGCGTTAGTACATATATTTAGTGAAGCTAGAAGAACAAC 2462
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2383 TGGTGCAAAGACCCCGGAAGAGGCGTTAGTACATATATTTAGTGAAGCTAGGAGAACAAC 2442
Query 2463 ACCTTCAATACTTTACATACCAATGTTCAATAATTGGTGGGAAAATGCTCATGAACAGCT 2522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACCTTCAATACTTTACATACCAATGTTCAATAATTGGTGGGAAAATGCTCATGAACAGCT 2502
Query 2523 TAGGGCTGTATTTCTGACTTTGTTAGAAGAATTGCCATCAAATCTACCCATATTATTACT 2582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2503 TAGGGCTGTATTTCTGACTTTGTTAGAAGAATTGCCATCAAATCTACCCATTTTATTACT 2562
Query 2583 TGCTACATCTTATGGTGAATTGTCTGACATGGAAGAGCAGTCAGTATTTGACAATCGATC 2642
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563 TGCTACATCTTATGGTGAATTATCTGACGTGGAAGAGCAGTCAGTATTTGACAATCGATC 2622
Query 2643 TGTCTATACTGTGGACAAACCATCAAGTGAAGACAGGTCTTTGTTCTTTGACCGTTTGAT 2702
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 TGTCTATACTGTGGACAAACCATCAAATGAAGACAGGTCTTTGTTCTTTGACCGTTTGAT 2682
Query 2703 TGAAGCTGCTCTCTCAGTCATTTCTGGCTTAAATGGCAAACC-TGATGGACCACAACCCC 2761
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||
Sbjct 2683 TGAAGCTGCTCTCTCAGTCATTTCTGGCTTAAATGGCAAACCATT-TGGACCACAATCCC 2741
Query 2762 TTCCAGAACTTCCCAAGGTTCCAAAAGAACCTACTGGTCCAAAACCCGCAGAAGTAAAAG 2821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 TTCCAGAACTTCCCAAGGTTCCAAAAGAACCTACTGGTCCAAAACCCGCAGAAGTAAAAG 2801
Query 2822 CCAAGGTGGAAGCAGAGCAGCATGCCCTTCGGCGATTGCGTATGTGTCTCAGAGATGTTT 2881
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802 CCAAGGTGGAAGCAGAGCAGCATGCCCTTCGACGATTGCGTATGTGTCTCAGAGATGTTT 2861
Query 2882 GCAATAGAATACTATATGATAAAAGATTCAGCGCATTCCACTTTCCAGTTACTGACGAGG 2941
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 GCAATAGGATACTATATGATAAAAGATTCAGCGCATTCCACTTTCCAGTTACTGACGAGG 2921
Query 2942 ATGCTCCAAACTATCGCTCAATAATTCAAATTCCAATGGATACGGCTACTCTGCTGCAGC 3001
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2922 ATGCTCCAAACTATCGCTCAATAATTCAAAATCCAATGGATACGGCTACTCTGCTGCAGC 2981
Query 3002 GTGTTGATACTGGGCAGTATCTGACATGTACACCGTTTTTGCAAGATGTGGATCTCATTG 3061
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2982 GTGTTGATACTGGGCAGTATCTGACATGTGCACCGTTCTTGCAAGATGTTGATCTCATTG 3041
Query 3062 TGAGAAATGCCAAGGCTTACAATGGAGATGATTACGCTGGAGCGAGAATTGTCAGTAGAG 3121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042 TGAGAAATGCCAAGGCTTACAATGGAGATGATTACGCAGGAGCGAGAATTGTCAGTAGAG 3101
Query 3122 CCTATGAGCTTCGAGATGTAGTGCATGGGATGCTGTCACAGATGGACCCAGCACTGCTAA 3181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3102 CCTATGAGCTTCGAGATGTAGTGCATGGGATGCTGTCACAGGTGGACCCAGCACTGCTAA 3161
Query 3182 CATATTGTGATAAGATCGCAGCTGAAGGTGGTCCTTCACTGATACCAGATGATCTGAGTG 3241
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3162 CACATTGTGATAAGATCGCAGCTGAAGGTGGTCCTTCACAGATACCAGATGATCTGAGTG 3221
Query 3242 GATCAATCCTCGGTTTAGCTCCTGTTGTGCAGATGGGAACTGTTACTAGAACCAGTGCCA 3301
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3222 GATCAATCCTCGGTTTAGCTCCTGTTGTACAGATGGGAACTGTTACTAGAACCAGTGCCC 3281
Query 3302 GACTTCGAAATGTGCAGCCAGAGGTTAATTTAGATCGAGATTATGAAGGTCTTAAAAAGC 3361
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3282 GACTTCGAAATGTGCAGCCAGAGGTCAATTTAGATCGAGATTATGAAGGTCTTAAAAAGC 3341
Query 3362 CCAAGAAAACTACTGATGCTGTCAGTATAGATTCAGCTGCAGACAAATCACAGAACCAAG 3421
||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3342 CCAAGAAAACTACTGATGCTGTCTGTACAGAATCAGCTGCAGACAAATCACAAAACCAAG 3401
Query 3422 ATTCAGGCCAAGAAATGCCATCTCCGGATGCGGCCAACCCACAGTCAGCAGCTCCTTCTC 3481
|||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 3402 ATTCAGGCAAAGAGATACCATCTCCGGAAGCGGCCAACACACAGTCAGCAGATCCTTCTC 3461
Query 3482 CAACAGATGGTGATAGAGAAGACCAAAGCGAGCCACCAAGTAAAGAGGCATCTGCAGAAG 3541
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3462 CAACAGATGGTAATAGAGAAGACCGAAGCGAGCCACCAAGTAAAGAGGCATCTGCAGTAG 3521
Query 3542 ATATGAGTGGTGATTCTTGCAAGGG-TCCTGCGGCCAAGTCGGATAAAGAAATTTCAAGC 3600
|| ||||||||||| ||| || ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3522 ATGTGAGTGGTGATACTTCCA-GGGATTCTGCT---AAGTCGGATGAAGAAATTTCAAGC 3577
Query 3601 CGAACAGAATCTGTAAAGGGAGTATTCATGGAACGTACTGACAACTACAGCATTCCGCAG 3660
||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3578 CGAACAGAATCTGTAAAGGGATTACTCATGGAACGCACTGACAACTACAGCATTCCGCAG 3637
Query 3661 ATGGAGAGGCTTTACACTCGAATCATGAAGGGTGTTCTTGAGACTCTGGACAAAGGGCTT 3720
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 3638 ATGGAGAGGCTCTACACTCGAATCATGAAGGGTGTTCTTGAGACTTTAGACGAAGGGCTT 3697
Query 3721 CGTGATGATGATAATAATCCTAAGCATTCAATTTTGAGATTTTTGTCGGAATTCGCACAG 3780
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3698 CGTGATGATGATAATAACCCTAAGTATTCAATTTTGAGATTTTTGTCGGAATTCGCTCAG 3757
Query 3781 CATCAGGCGAATTTCTGAATCTAAATTTTCTCATATCGGTCACTAGGATAGGTTTGCTAG 3840
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3758 CATCAGGCGAATTTCTGAGGCTAAATTTTCTCATATCGGTCACTAGG-TAGGTTTGCTAA 3816
Query 3841 GAGAAAG 3847
||||||
Sbjct 3817 AAGAAAG 3823
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 148995398295
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5