BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G06490.1 Length=5991 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg470669 jgi|Araly1|470669|fgenesh2_kg.1__623__AT1G06490.1 9461 0.0 Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006 76.8 2e-12 > Ahg470669 jgi|Araly1|470669|fgenesh2_kg.1__623__AT1G06490.1 Length=5814 Score = 9461 bits (5123), Expect = 0.0 Identities = 5592/5820 (96%), Gaps = 26/5820 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCGAGTACTAGTAGTGGTGGAAGAGGCGAAGATGGGCGGCCGCCGCAAATGCAGCCA 60 ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCGAGTAC---TAGTGGTGGTAGAGCCGAAGATGGGCGGCCGCCGCAAATGCAGCCA 57 Query 61 GTTCGGTCTATGTCTCGGAAGATGACACGAGCTGGTACGATGATGATTGAGCATCCTAAT 120 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| Sbjct 58 GTTCGGTCTATGTCTCGGAGGATGACACGAGCTGGGACCATGATGATTGATCATCCTAAT 117 Query 121 GAAGATGAAAGAC-CAATTGACAGCGAGCTTGTTCCTTCTTCTCTCGCTTCCATTGCTCC 179 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 118 GAAGATGAAAG-CGCAATTGACAGCGAGCTTGTTCCTTCTTCTCTCGCTTCCATTGCTCC 176 Query 180 TATTCTTCGAGTTGCTAATGATATTGACCAAGATAACGCAAGGGTTGCTTACCTTTGTCG 239 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 177 CATTCTTCGTGTTGCTAATGATATTGAAGAAGATAACCCAAGGGTTGCTTACCTTTGTCG 236 Query 240 CTTCCATGCATTTGAGAAGGCTCATCGAATGGATCCAACATCAAGCGGACGAGGCGTTCG 299 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 237 CTTCCATGCATTTGAGAAGGCTCATAGAATGGATCCAACATCAAGTGGACGAGGCGTTCG 296 Query 300 TCAATTTAAGACTTATCTATTGCACAAGCTAGAGGAGGAGGAAGAGATTACAGAACATAT 359 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 297 TCAATTTAAGACCTATCTATTGCACAAGCTAGAGAAGGAGGAAGAGATTACAGAACCCAT 356 Query 360 GTTGGCGAAGAGTGACCCAAGAGAAATTCAGCTCTACTATCAGACGTTCTATGAGAATAA 419 |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 357 GTTGGCGAAGAGTGACCCGAGAGAAATTCAGTTGTACTATCAGACCTTCTATGAGAATAA 416 Query 420 TATACAAGATGGAGAAGGGAAAAAGACACCGGAGGAGATGGCCAAGCTTTACCAGATAGC 479 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 417 TATACAAGAAGGAGAAGGGAAAAAGACACCGGAGGAGATGGCCAAGCTTTACCAGATAGC 476 Query 480 GACAGTCTTGTATGATGTTTTAAAGACAGTGGTTCCTCAAGCAAGAATTGACGACAAGAC 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 477 GACAGTCTTGTATGATGTTTTAAAGACAGTGGTTCCTCAAGCAAGAATTGACGAGAAGAC 536 Query 540 CCTTAGGTATGCCAAAGAAGTTGAAAGAAAGAAAGAACAGTATGAACACTACAACATTCT 599 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 CCTTAGATATGCCAAAGAAGTTGAAAGAAAGAAAGAACAGTATGAACACTACAACATTCT 596 Query 600 TCCGCTGTACGCTTTAGGGGCTAAAACTGCAGTAATGGAACTCCCTGAGATTAAGGCGGC 659 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 597 TCCGCTGTACGCTTTAGGAGCTAAAACTGCAGTAATGGAACTCCCTGAGATTAAGGCGGC 656 Query 660 AATTCTTGCTGTCTGCAATGTGGACAATCTTCCTCGACCAAGATTCCATTCAGCCTCAGC 719 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 AATTCTTGCTGTCTGCAATGTTGACAATCTTCCTCGGCCAAGATTCCATTCAGCCTCAGC 716 Query 720 TAACCTGGATGAAGTGGATAGAGAAAGAGGCAGATCTTTTAATGATATTCTCGAGTGGCT 779 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 717 TAACCTGGATGAAGTGGGTAGAGAAAGAGGCAGATCCTTTAATGACATTCTCGAGTGGCT 776 Query 780 TGCTTTGGTTTTCGGTTTTCAGCGAGGAAATGTAGCTAATCAGAGGGAGCATCTTATACT 839 | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 777 TTCTTTGGTTTTTGGTTTTCAGCGAGGAAATGTAGCTAATCAGAGGGAGCATCTCATACT 836 Query 840 GCTACTTGCCAACATCGATGTGAGGAAGAGGGATCTCGAGAATTATGTCGAGATAAAGCC 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 837 GCTACTTGCCAACATCGATGTGAGGAAGAGGGATCTTGAGAATTATGTTGAGCTAAAGCC 896 Query 900 TAGCACCGTGCGGAAATTGATGGAAAAATACTTCAAGAATTACAATTCATGGTGCAAGTA 959 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 897 TAGCACCGTGCGGAAGTTGATGGAAAAATACTTCAAGAATTACAGGTCATGGTGCAAGTA 956 Query 960 TTTGCGGTGTGACTCATATTTGAGGTTTCCTGCAGGTTGTGATAAGCAACAACTGAGCCT 1019 |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 957 TTTGCGGTGTGAGTCATATTTGAGATTTCCTCCAGGTTGCGATGAGCAACAACTGAGCCT 1016 Query 1020 TCTGTATATCGGCCTTTATCTTCTCATATGGGGAGAAGCATCAAATGTCCGCTTCATGCC 1079 | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 TTTGTATATCAGCCTTTATCTTCTCATATGGGGTGAAGCATCAAATGTCCGCTTCATGCC 1076 Query 1080 TGAATGCCTTTGCTACATTTTCCACAATATGGCCAATGAAGTCCATGGAATTCTGTTTGG 1139 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1077 TGAATGTCTTTGCTACATTTTCCACAATATGGCCAATGAAGTTCATGGAATTCTGTTTGG 1136 Query 1140 CAATGTGTACCCTGTAACTGGGGACACATATGAGGCAGGTGCACCGGACGAAGAAGCATT 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1137 AAATGTGTACCCTGTAACTGGGGACACATATGAGGCAGGTGCACCTGACGAAGAGGCATT 1196 Query 1200 CTTAAGGAATGTTATAACACCAATCTACCAGGTCTTACGCAAGGAAGTCAGGAGAAACAA 1259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 1197 CTTAAGGAATGTTATAACACCAATCTACCAGGTCTTACGTAAGGAAGTCAGGAGAAAC-A 1255 Query 1260 AAAT-GGAAAGGCAAGCCATTCAAAATGGAGAAACTATGATGATCTGAATGAGTACTTTT 1318 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1256 AAATGGGAAAGGCAAGCCATTCAAAATGGAGAAACTATGATGATCTGAATGAGTACTTTT 1315 Query 1319 GGGATAAGAGGTGTTTTAGGCTGAAATGGCCAATGAACTTTAAGGCAGATTTTTTCATCC 1378 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1316 GGGATAATAGGTGTTTTAGGCTGAAATGGCCAATGAACTCTAAGGCAGATTTTTTCATCC 1375 Query 1379 ACACTGATGAGATCTCGCAAGTTCCGAATCAGAGACATGACCAAGTGTCTCATGGAAAAA 1438 |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1376 ACACTGATGAGATCTCACCACTTCCGAATGAGAGACATGACCAAGTATCTCATGGAAAAA 1435 Query 1439 GGAAACCTAAAACTAATTTTGTTGAAGCTCGCACGTTTTGGAACCTCTATCGAAGTTTCG 1498 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1436 GGAAACCTAAAACTAATTTTGTTGAAGCCCGCACGTTTTGGAACCTCTATCGAAGTTTCG 1495 Query 1499 ACCGAATGTGGATGTTCCTTGTATTGTCTCTACAGACTATGATAATAGTTGCATGGCACC 1558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1496 ACCGAATGTGGATGTTCCTTGTATTGTCTCTACAGACTATGATAATAGTTGCATGGCATC 1555 Query 1559 CGTCAGGATCTATTCTTGCCA-TTTTTACTGAGGATGTCTTTAGAAACGTGTTGACCATT 1617 | |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1556 CATCAGGATCCATTCTTGCCATTTTTTA-TAAGGATGTCTTTAGAAACGTGTTAACCATT 1614 Query 1618 TTCATAACTTCAGCTTTTCTCAATCTTCTACAAGCGACACTGGATTTAGTTCTTAGTTTT 1677 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1615 TTCATCACTTCAGCTTTTCTTAATCTTCTACAAGCGACACTGGATTTAATTCTTAGTTTT 1674 Query 1678 GGTGCTTGGAAGAGCCTAAAGTTTTCCCAAATTATGCGGTACATCACAAAATTTTTAATG 1737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1675 GGTGCTTGGAAGAGCCTAAAGTTTTCCCAAATTATGCGATACATCACAAAATTTTTAATG 1734 Query 1738 GCAGCCATGTGGGCCATCATGTTGCCAATTACTTACTCGAAGTCAGTCCAGAATCCTACT 1797 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1735 GCAGCCATGTGGGCCATCATGTTGCCAATTACTTACTCGAAGTCAGTCCAGAATCCAACT 1794 Query 1798 GGACTAATAAAGTTCTTCAGCAGCTGGGTTGGGAGTTGGCTTCACCGGTCGTTATACGAC 1857 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || Sbjct 1795 GGACTAATAAAGTTCTTCAGCAGCTGGGTTGGGAGTTGGCTTCACCAGTCATTATACAAC 1854 Query 1858 TATGCTATTGCCTTGTATGTCTTACCAAATATTTTGGCTGCTGTGTTTTTCTTACTTCCA 1917 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1855 TATGCTATTGCCTTATATGTCTTACCAAATATTTTGGCTGCTGTGTTTTTCTTACTTCCA 1914 Query 1918 CCTCTGCGGAGAATCATGGAGCGATCAAACATGCGGATTGTCACACTTATCATGTGGTGG 1977 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1915 CCTCTGCGGAGAATCATGGAGCGATCAAACATGCGAATTGTCACACTTATCATGTGGTGG 1974 Query 1978 GCTCAGCCAAAATTGTATATTGGTAGAGGAATGCATGAAGAAATGTTTGCACTTTTCAAG 2037 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1975 GCTCAGCCTAAATTGTATATTGGTAGAGGAATGCATGAAGAAATGTTTGCACTTTTCAAG 2034 Query 2038 TATACATTCTTTTGGGTCATGCTGTTACTTAGCAAGCTCGCTTTCAGCTACTATGTGGAG 2097 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2035 TATACATTCTTTTGGGTCATGCTGTTACTAAGCAAGCTCGCTTTCAGCTACTATGTGGAG 2094 Query 2098 ATATTACCACTTGTCAACCCAACTAAGTTAATATGGGATATGCATGTCGTAAATTACGAG 2157 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2095 ATATTACCACTTGTCAACCCAACGAAGTTAATATGGGATATGCATGTCGTAAATTACCAG 2154 Query 2158 TGGCATGAGTTCTTTCCAAATGCCACTCATAACATTGGGGTAATCATCGCCATATGGGGT 2217 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2155 TGGCACGAGTTCTTTCCAAATGCCACTCATAACATTGGGGTAATCATCTCCATATGGGGT 2214 Query 2218 CCAATTGTCTTGGTTTACTTTATGGATACGCAAATATGGTATGCCATATTCTCTACTCTT 2277 ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2215 CCAATCGTCTTGGTTTATTTTATGGATACACAAATATGGTATGCCATATTCTCTACTCTA 2274 Query 2278 TTTGGAGGGATATATGGAGCCTTCAGCCATCTCGGGGAGATACGCACACTTGGAATGTTG 2337 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2275 TTTGGTGGGATATATGGAGCTTTCAGCCATCTCGGGGAGATACGCACACTTGGAATGTTG 2334 Query 2338 CGGTCCAGATTTAAAGTTGTTCCATCTGCTTTCTGT-TCTAAACTTACACCGTTACCTCT 2396 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 2335 CGGTCCAGATTTAAACTTGTTCCATCTGCTTTCTGTAT-TAAACTTACACCGTTACCTCT 2393 Query 2397 AGGTCATGCAAAGAGAAAGCACTTGGACGAAACGGTGGACGAAAAAGACATTGCGAGGTT 2456 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2394 CGGTCATGCAAAGAGAAAGCACTTGGACGACACAGTGGACGAAGAAGACATTGCGAGGTT 2453 Query 2457 CTCACAGATGTGGAATAAGTTCATACATACTATGCGGGATGAAGATCTGATCAGCGATAG 2516 ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2454 CTCACAGGTGTGGAATAAGTTCATACTTACTATGCGGGATGAAGATCTGATCAGCGATAG 2513 Query 2517 GGAAAGAGATTTGCTACTTGTACCTTCGTCTTCTGGAGATGTTACTGTTGTGCAATGGCC 2576 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2514 AGAAAGAGATTTGCTACTTGTACCTTCGTCTTCTGGAGATGTTTCTGTTGTGCAATGGCC 2573 Query 2577 TCCTTTCTTGCTTGCTAGCAAGATTCCAATAGCATTAGACATGGCTAAAGATTTCAAGGG 2636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2574 TCCTTTCTTGCTTGCTAGCAAGATTCCAATAGCATTAGACATGGCTAAAGATTTCAAGGG 2633 Query 2637 AAAAGAGGACGTTGACTTATTCAAGAAAATCAAAAGCGAATACTATATGCATTACGCAGT 2696 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2634 AAAAGAGGACGTTGACTTATTCAAGAAAATTAAAAGCGAATACTACATGCATTACGCAGT 2693 Query 2697 GGTTGAGGCTTATGAAACCGTGAGAGACATAATATATGGCCTTCTTCAAGATGAATCTGA 2756 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2694 GGTTGAGGCTTATGAAACCGTGAGAGACATAATATATGGCCTTCTTCAAGATGAATCTGA 2753 Query 2757 TAAGAGGATTGTAAGGGAGATTTGCTACGAAGTAGATATTAGCATCCAACAACACAGATT 2816 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct 2754 TAAGAGGATTGTAAGGGAGATTTGCTATGAAGTAGATGTTAGCATCCAACAACATAGATT 2813 Query 2817 TTTAAGTGAATTCCGGATGACTGGTATGCCTTTGCTCAGTGACAAGCTAGAGAAATTCTT 2876 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2814 TTTAAGTGAATTCCGGATGACTGGTATGCCTTTGCTCAGTGACAAGCTAGAGAAATTCTT 2873 Query 2877 AAAAATCCTGCTAAGTGATTATGAGGAAGATGA---TTACAAGTCTCAGATTATCAATGT 2933 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2874 AAAAATCCTGCTAAGTGATTACGAGGAAGATGAAACTTACAAGTCTCAGATAATCAATGT 2933 Query 2934 TCTCCAGGATATTATTGAAATCATCACCCAGGATGTCATGGTTAACGGTCACGAAATCCT 2993 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2934 TCTCCAGGATATTATTGAAATCATCACGCAAGATGTTATGGTTAACGGTCACGAAATCCT 2993 Query 2994 TGAAAGGGCTCATTTACAGAGTGGTGATATTGAAAGCGACAAGAAAGAACAA-------A 3046 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 2994 TGAAAGGGCTCATTTTCAAAGTGGTGATATTGAAAGCGACAAGAAACAACAACGGTTTGA 3053 Query 3047 -----GGTTTGAAAAGATAGATCTTAGTTTGACTCAGAACATATCCTGGAGGGAAAAGGT 3101 |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct 3054 ACAACGGTTTGAAAAGATAGATCTTCGTCTGACTCAGAACGTATCTTGGAGGGAAAAGGT 3113 Query 3102 TGTAAGACTTTTGTTACTTTTGACTGTTAAAGAATCCGCAATAAATATCCCTCAAAGTTT 3161 ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3114 TGTAAGACTTTTGTTACTTCTGACCGTTAAAGAATCCGCAATAAATATCCCACAAAGTTT 3173 Query 3162 GGAAGCTCGTCGTCGTATGACATTCTTTGCAAATTCCTTATTCATGAATATGCCAGATGC 3221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3174 GGAAGCTCGTCGTCGTATGACATTCTTTGCAAATTCCTTATTCATGAATATGCCAGATGC 3233 Query 3222 TCCCCGAGTTCGTGACATGTTATCCTTTAGTGTCTTAACTCCTTATTACAAAGAGGATGT 3281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3234 TCCCCGAGTTCGTGACATGTTATCCTTTAGTGTCTTAACTCCTTATTACAAAGAGGATGT 3293 Query 3282 TCTCTATTCGGAGGAAGAACTGAACAAGGAAAACGAAGATGGAATAACTATTTTGTTTTA 3341 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3294 TCTCTATTCGGAGGAAGAACTGAACAAGGAAAATGAAGATGGAATAACTATTTTGTTTTA 3353 Query 3342 CCTACAGAGGATATATCCTGAGGAATGGTCAAACTATTGCGAACGTGTAAATGATTTGAA 3401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3354 CCTACAGAGGATATATCCTGAGGAATGGTCAAACTATTGCGAACGTGTAAATGATTTGAA 3413 Query 3402 ACGCAACTTATCTGAGAAAGACAAGGCAGAGCAACTCCGCCAATGGGTATCTTATAGAGG 3461 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3414 ACGGAATTTATCTGAGAAAGACAAGGCAGAGCAACTCCGCCAATGGGTATCTTATAGAGG 3473 Query 3462 CCAGACTCTTTCAAGGACAGTTAGGGGAATGATGTACTACAGAGTGGCTCTCGAACTTCA 3521 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3474 CCAGACCCTTTCAAGGACAGTTAGGGGAATGATGTACTACAGAGTGGCTCTCGAACTTCA 3533 Query 3522 ATGTTTCCAGGAATACACTGAAGAAAACGCTACCAATGGTGGCTATCTTCCCTCAGAATC 3581 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3534 ATGTTTCCAGGAATACACTGGAGAAAACGCTACCAATGGTGGCTTTCTTCCCTCAGAATC 3593 Query 3582 AAATGAAGATGATCGAAAGGCTTTTAGTGACCGTGCACGAGCTCTTGCAGATTTAAAATT 3641 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3594 AAATGAAGATGATCGAAAGGCTTTTACTGACCGTGCACGAGCTCTTGCAGATTTAAAATT 3653 Query 3642 TACATATGTCGTGTCCTGTCAGGTCTATGGGAACCAGAAAAAGTCAAGTGAAAGCCGAGA 3701 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3654 CACATATGTCGTGTCATGTCAGGTCTATGGGAACCAGAAAAAGTCAAGTGAAAGCCGGGA 3713 Query 3702 CCGGAGTTGTTACAATAACATTTTACAGCTCATGCTAAAGTATCCGTCATTGCGTGTTGC 3761 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3714 CCGTAGTTGTTACAATAACATTTTACAGCTCATGCTAAAGTATCCGTCCTTGCGTGTTGC 3773 Query 3762 CTATATAGATGAAAGGGAGGAGACAGTTAATGGAAAATCACAGAAAGTATTCTACTCTGT 3821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3774 CTATATAGATGAAAGGGAGGAGACAGTTAATGGAAAATCACAGAAAGTATTCTACTCTGT 3833 Query 3822 GCTACTCAAAGGATGTGACAAATTGGATGAGGAAATATATCGTATCAAACTTCCCGGCCC 3881 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3834 GCTGCTCAAAGGATGTGACAAATTAGATGAGGAAATATATCGTATCAAACTTCCCGGCCC 3893 Query 3882 TCCCACTGAAATTGGTGAAGGAAAACCCGAGAATCAAAACCATGCCATCATTTTCACTCG 3941 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3894 TCCCACTGAAATTGGTGAAGGAAAACCTGAGAATCAAAACCATGCCATCATTTTCACTCG 3953 Query 3942 CGGTGAAGCACTCCAGACCATAGACATGAACCAGGACAACTACTTTGAAGAGTGTTTCAA 4001 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3954 CGGTGAAGCACTCCAGACCATAGACATGAACCAGGACAACTACTTTGAAGAGTCTTTCAA 4013 Query 4002 AATGAGAAACGTGCTACAAGAATTTGATGAAGGTCGACGTGGCAAGAGAAATCCTACAAT 4061 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4014 AATGAGAAACGTGCTACAAGAATTTGATGAAGGTCGACGTGGCAAGAGAAATCCTACAAT 4073 Query 4062 TTTGGGTCTTCGTGAACACATATTTACTGGAAGTGTTTCTTCACTTGCTTGGTTCATGTC 4121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4074 TTTGGGTCTTCGTGAACACATATTTACTGGAAGTGTTTCTTCACTTGCTTGGTTTATGTC 4133 Query 4122 GAATCAAGAAACAAGTTTTGTAACCATTGGCCAACGTGTTCTGGCAAATCCTCTGAGGGT 4181 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4134 GAATCAAGAAACAAGTTTCGTAACCATCGGCCAACGTGTTCTGGCAAATCCTCTGAGGGT 4193 Query 4182 GCGTTTCCATTATGGCCATCCTGATATATTTGATAGAATCTTCCACATCACAAGAGGAGG 4241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4194 GCGTTTCCATTATGGCCATCCTGATATATTTGATAGAATCTTCCACATCACAAGGGGAGG 4253 Query 4242 CATTAGCAAGGCTTCAAAGATAATAAACTTAAGCGAAGATATCTTTGCAGGGTACAATTC 4301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4254 CATTAGCAAGGCTTCAAAGATAATAAACTTAAGCGAAGATATCTTTGCAGGGTACAATTC 4313 Query 4302 AACTCTTCGTGGGGGTTACGTCACACATCACGAGTATATTCAAGCAGGGAAAGGTCGTGA 4361 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4314 AACTCTTCGTGGGGGTTATATCACACATCACGAGTATATTCAAGCAGGGAAAGGGCGTGA 4373 Query 4362 TGTAGGGATGAATCAGATTTCGTTTTTTGAAGCCAAAGTTGCGAATGGTAATGGAGAACA 4421 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4374 TGTAGGGATGAATCAGATTTCATTTTTTGAAGCCAAAGTTGCGAATGGTAATGGAGAACA 4433 Query 4422 AACACTAAGTCGTGACGTTTACCGACTTGGACGCCGGTTTGATTTTTACAGGATGCTTTC 4481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 4434 AACACTAAGTCGTGACGTTTACCGACTTGGACGCCGGTTTGATTTCTACAGGATGCTCTC 4493 Query 4482 ATTCTACTTCACCACAGTTGGTTTCTATTTCAGTAGTATGATAACGGTGCTCACGGTATA 4541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4494 ATTCTACTTCACCACAGTTGGTTTCTATTTCAGTAGTATGATAACGGTGCTCACGGTATA 4553 Query 4542 TGTGTTCCTTTATGGGCGTCTTTATCTGGTATTGAGCGGATTAGaaaaaaaCATCCTGCA 4601 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 4554 TGTGTTCCTCTATGGGCGTCTTTATCTGGTATTGAGCGGATTAGAAAAGGAGATCCTGCA 4613 Query 4602 AAGTGCAAGTGTACATGAGTCCAATGCCCTTGAGCAGGCACTAGCAGCCCAATCTGTTTT 4661 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4614 AAGTGCAACTGTACATCAGTCCAATGCCCTTGAGCAGGCATTAGCAGCCCAATCTGTTTT 4673 Query 4662 CCAGTTAGGTTTTCTGATGGTTCTACCAATGGTTATGGAAATTGGCCTAGAAAAAGGGTT 4721 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4674 CCAATTAGGTTTTCTGATGGTTCTACCAATGGTTATGGAAATTGGCCTAGAAAAAGGGTT 4733 Query 4722 TCGCACAGCCTTGGGTGATTTCATCATAATGCAGCTGCAGCTTGCCTCTGTTTTCTTCAC 4781 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4734 TCGCACGGCCTTGGGTGATTTCATCATAATGCAGCTTCAGCTTGCCTCTGTTTTCTTCAC 4793 Query 4782 GTTTCAACTGGGAACGAAAGCGCATTACTTTGGAAGGACGATTTTGCATGGAGGCTCTAA 4841 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4794 GTTTCAGCTTGGAACGAAAGCGCATTACTTTGGAAGGACAATTTTGCATGGAGGCTCTAA 4853 Query 4842 GTACCGAGCAACTGGTCGAGGTTTTGTTGTTTTCCATGCGAAGTTTGCAGAAAACTATAG 4901 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 4854 GTACCGAGCAACTGGTCGAGGGTTTGTTGTTTTCCATGCGAAGTTTGCGGAAAACTACAG 4913 Query 4902 ACTATATTCGCGAAGCCATTTTGTTAAGGGACTGGAGTTGGTCATACTACTAGTTGTGTA 4961 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4914 ACTATATTCGCGAAGCCATTTTGTTAAGGGACTGGAGTTGGTCATACTACTAGTTGTATA 4973 Query 4962 TCAAGTTTATGGAACTTCGTACCGTAGCTCAAGTACTTATATGTACATCACATTTTCAAT 5021 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || Sbjct 4974 TCAAGTTTATGGAACTTCATACCGTAGCTCAAGTACTTATCTATACATCACATTTTCTAT 5033 Query 5022 GTGGTTCCTGGTGACTTCTTGGTTGTTTGCTCCATTTATATTCAACCCATCTGGGTTTGA 5081 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5034 GTGGTTCCTGGTGACTTCCTGGTTGTTTGCTCCATTTATATTCAACCCATCTGGGTTTGA 5093 Query 5082 GTGGCAAAAGACGGTGGACGATTGGACTGACTGGAAACGTTGGATGGGAAACCGCGGTGG 5141 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 5094 GTGGCAAAAGACCGTGGACGACTGGACTGACTGGAAACGGTGGATGGGAAACCGTGGTGG 5153 Query 5142 CATAGGAATTGTTCTTGACAAAAGTTGGGAATCATGGTGGGATATAGAGCAAGAACATCT 5201 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5154 CATAGGAATCGTTCTTGACAAAAGTTGGGAATCATGGTGGGATATAGAGCAAGAACACCT 5213 Query 5202 CAAGCACACAAATTTAAGAGGAAGGGTTCTAGAGATACTTCTCGCTCTGCGTTTTCTCCT 5261 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct 5214 CAAGCACACAAATATAAGAGGAAGGGTTCTAGAGATACTTCTCGCTTTGCGTTTCCTCCT 5273 Query 5262 TTACCAGTATGGAATTGTCTACCACCTCAACATCGCTCGCCGCCACACAACATTTCTGGT 5321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 5274 TTACCAGTATGGAATTGTCTACCACCTCAACATCGCTCACCGCGACACAACATTTCTGGT 5333 Query 5322 TTATGGACTCTCTTGGGCTATCTTGTTGTCAGTTCTTCTCGTGCTAAAGATGGTATCAAT 5381 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5334 TTATGGACTCTCTTGGGCTGTCTTGTTGTCTGTTCTTCTCGTGCTAAAGATGGTATCAAT 5393 Query 5382 GGGTAGACGGAAGTTTGGTACAGATTTTCAGGTTATGTTCAGGATTCTCAAGGCACTTCT 5441 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 5394 GGGTAGACGGAAGTTTGGTACAGATTTTCAGGTTATGTTCAGGATTCTCAAAGTGCTTCT 5453 Query 5442 CTTCCTTGGTTTCTTGTCAGTCATGACTGTATTATTTGTCGTCTGCGGCCTCACGATCTC 5501 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 5454 CTTCCTTGGTTTCTTGTCAGTCATGACAGTATTATTTGTAGTCTGCGGCCTCACGGTCTC 5513 Query 5502 GGATCTCTTTGCCTCCATCCTCGCTTTCTTACCTACTGGCTGGGCTATTCTTCTTATCGG 5561 |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct 5514 GGATCTCTTTGCTTCCATCCTCGCTTTCTTGCCTACTGGATGGGCTCTTCTTCTTATCGG 5573 Query 5562 GCAAGCGCTGCGTAGCGTGTTCAAAGGATTAGGATTCTGGGACTCGGTGAAAGAGCTAGG 5621 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 5574 GCAAGCGCTGCGTAGCGTATTCAAGGGATTAGGATTCTGGGACTCAGTGAAAGAGCTAGG 5633 Query 5622 GAGAGCTTACGAGTATATAATGGGGCTTGTGATATTCACACCCATTGCTGTCTTATCGTG 5681 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5634 GAGAGCTTATGAGTACATAATGGGGCTTGTGATATTCACACCCATTGCGGTCTTATCGTG 5693 Query 5682 GTTCCCATTTGTGTCTGAGTTCCAAACTAGATTACTGTTTAATCAAGCCTTCAGTCGCGG 5741 ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5694 GTTCCCATTTGTGTCCGAGTTCCAAACCAGACTGTTGTTTAATCAAGCCTTCAGTCGCGG 5753 Query 5742 TCTGCAGATCTCTATGATTCTCGCCGGAAAGAAAGACAAAGAGACACCTTCCACCAAGTA 5801 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5754 TCTGCAGATATCTATGATTCTCGCCGGAAGGAAAGACAAAGATACACCTTCCACCAAGTA 5813 > Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006 Length=5709 Score = 76.8 bits (41), Expect = 2e-12 Identities = 52/57 (91%), Gaps = 2/57 (4%) Strand=Plus/Plus Query 2572 TGGCCTCCTTTCTTGCTT-GCTAGCAAGATTCCAATAGCATTAGACATGGCTAAAGA 2627 |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2560 TGGCCTCCCTTCTT-ATTGGCTAGCAAGATTCCAATAGCATTAGACATGGCAAAAGA 2615 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 226975365372 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5