BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G06950.1 Length=3314 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg470715 jgi|Araly1|470715|fgenesh2_kg.1__669__AT1G06950.1 5221 0.0 Ahg919422 jgi|Araly1|919422|scaffold_100703.1 1491 0.0 Ahg919409 jgi|Araly1|919409|scaffold_100690.1 353 4e-96 > Ahg470715 jgi|Araly1|470715|fgenesh2_kg.1__669__AT1G06950.1 Length=3191 Score = 5221 bits (2827), Expect = 0.0 Identities = 3064/3176 (96%), Gaps = 26/3176 (1%) Strand=Plus/Plus Query 14 TCTTCTTCCGTTGTCTACTGTTTTTCGTTAAACCCTACGATTCTTCtttttttCAACGAC 73 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| Sbjct 1 TCTTCTTCCCTTGTCTACTGTTTTTCGTTAAACCCTAC---T-TTC------T--ACGAC 48 Query 74 TGCTCGGATCTTTCTCAGTAGAGGGAACCATGAATCCCTCACTCGTCACCGCCATTAACG 133 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 49 TGCTCGGATCCTTCTCAGTAGAGGGAACCATGAATCCCTCACTCGTCACCGCCATTAACG 108 Query 134 CTCCAATTTCACCTTCTCCTCGGTCTCCTCTTCTTTCTCACTTCCTACCTACTTTACCTC 193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 109 CTCCAATTTCACCTTCTCCTCGGTCTCCTCTTCTTTCTCACTTCCTACCTTCTTTACCTC 168 Query 194 ACCGTTTCTCCAAGTCTGAGTGTCT-ATCTCGCCGTCGTTATCGAGTTTCGTTCCCTCGT 252 ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 169 ACCGTTTCTCCAAGTCTGAGTGTCTGA-CTCGCCGTCGTTATCGAGTTTCGTTACCTCGT 227 Query 253 AGCTCAGCTGCTTCCTCCGACCAACTATCAGTATCTACGCAGGCGAAGAATCCCGGTATC 312 |||||||||||||||||||||| | | | || | |||||||||||||||||||| || Sbjct 228 AGCTCAGCTGCTTCCTCCGACC-A--A-C--TA--T-CGCAGGCGAAGAATCCCGGTTTC 278 Query 313 CATGGGA-ATAAGAAGGAGCTCACTGGATTGCAACCGATTGTTGAGAAAATGACACCGCC 371 ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 279 CAT-GGAGATAAGAAGGAGCTCACTGGATTGCAACCGATTGTTGAGAAAATGACGCCGCC 337 Query 372 GGTGAGGCTAGCGACTTCAGCTGTTGTATTAGCGGCGTCTTTAGCTACTGGTTACGGCCT 431 |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 338 GGTGAGGCTAGCCACTTCAGCTGTTGTTTTAGCGGCGTCTTTAGCTACTGGTTACGGTCT 397 Query 432 TGGGCTCCGTTTAGCCGGCTCCAGGAATATTGCCTTTGGTGGGGCTGCTGTTGCTGGAGC 491 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 398 TGGGCTTCGTTTAGCCGGCTCCAGGAATATTGCCTTTGGTGGGGCTGCTGTTGCTGGAGC 457 Query 492 CGCCGGTGGAGCTGTCGTATATGCGTTGAACTCTGCTGTACCGGAGGTAGCTGCTATCAG 551 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 458 CGCTGGTGGAGCTGTCGTGTATGCGTTGAACTCTGCTGTACCGGAGGTGGCTGCTATCAG 517 Query 552 TTTGCATAATTATGTTGCCGAATTCGAAGATCCTGCCTCTGTGACGAAAGATGATGTAGA 611 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 518 TTTGCATAATTATGTTGCCGACTTCGAAGATCCTGCCTCTGTCACGAAAGATGATGTAGA 577 Query 612 AAAGATCGCTGATAGGTACGGTGTCAACAAAGGAGACGAAGCATTCCAGGCTGAGATTTG 671 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 578 AAAGATTGCTGATAGGTATGGTGTCAACAAAGGAGACGAAGCATTCCAGGCTGAGATTTG 637 Query 672 TGATATTTATTGCCGGTATGTAACTTCCGTGCTTCCAACTGAAGGACAGTCTCTTAAAGG 731 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 638 TGATATCTATTGCCGGTATGTAACTTCCGTGCTTCCAACTGAAGGACAGTCTCTTAAAGG 697 Query 732 GGATGAAGTGGCGAAGATAGTCAAGTTCAAAAATGCTTTAGGGATAGACGAACCTGATGC 791 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 698 GGATGAAGTGGCGAAGATAATCAAGTTCAAAAATGCTTTAGGGATAGACGACCCTGATGC 757 Query 792 AGCTGCCATGCACATGGAGATTGGTCGCAGGATTTTTAGGCAAAGGCTTGAGACTGGGGA 851 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 758 AGCTGCCATGCACATGGAGATTGGCCGCAGGATTTTTAGGCAAAGGCTAGAGACTGGGGA 817 Query 852 GCGTGAAGGTGATGCAGAACAGCGTCGGGCATTTATGAGGCTTGTATATGTTTCAGCTCT 911 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 818 ACGTGAAGGTGATGCAGAACAGCGTCGGGCATTTATGAGGCTTGTATATGTTTCAGCTCT 877 Query 912 TGTGTTTGGAGATGCTTCATCCTTCCTTCTACCTTGGAAGCGAGTATTGAAGGTCACAGA 971 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 878 TGTGTTTGGAGATGCTTCATCCTTCCTTTTGCCTTGGAAGCGAGTATTGAAGGTCACAGA 937 Query 972 TGCTCAGGTTGAGATTGCTATTCGTGAAAATGCAAAGCAGCTGTATGCCGAACGGTTAAA 1031 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 938 TGCTCAGGTTGAGATTGCTATTCGTGAAAATGCAAAGCAGCTGTATGCCGAACGGTTAAA 997 Query 1032 ATTAGTTGGTAGAGATATTAACGTAGAAAACCTTGTGGACCTTAGAAAATCACAACTATC 1091 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 998 ATTAGTTGGTAGAGCTATTAACGTAGAAAACCTTGTGGACCTTAGAAAAGCACAACTATC 1057 Query 1092 ATTCAAGCTCTCTGATGAGCTTGCTGAAGACCTGTTTAGAGAGCATACGAGAAAAGTAGT 1151 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1058 ATTCAAGCTTTCTGATGAGCTTGCTGAAGACCTGTTTAGAGAGCATACGAGAAAGGTAGT 1117 Query 1152 CGTAGAGAACATTTCATCGGCACTCAGCATACTCAAATCCCGCACACGAGCAGCGAAGAG 1211 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1118 CGTAGAGAACATTTCATCGGCACTCAGCATACTAAAATCCCGCACACGAGCAGTGAAGAG 1177 Query 1212 TTTGGCATCTGTCGTGGAAGAGCTTGAAAAAGTACTGGAGTTTAACAACCTGCTAGTTTC 1271 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1178 TTTGGCATCTGTCGTGGAAGAGCTTGAAAAAGTACTGGAGTTTAATAACCTGCTGGTTTC 1237 Query 1272 CTTGAAAAGTCATTCAGAGGCAGATCAATTTGCACGCGGGGTTGGCCCTATTTCTTTGAT 1331 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1238 CTTGAAAAGTCATTCAGAGGCAGATCAATTTGCACGCGGGGTTGGCCCTATTTCTTTGAT 1297 Query 1332 AGGTGATGAGTCTGATTTTGAGAGGAGAATGGATGATTTAAAGCTCCTTTATAGAGCATA 1391 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1298 AGGTGATGAGTCTGATTTTGAGAGGAGAATGGATGATTTGAAGCTCCTTTATAGAGCATA 1357 Query 1392 TGTTACAGATGCTTTATCTGGTGGGCGCTTAGAAGAAAATAAGCTCGTGGCAATGAGCCA 1451 |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1358 TGTTACCGATGCTTTAGCTGGTGGGCGCTTAGAAGAAAATAAGCTCGTGGCAACGAGCCA 1417 Query 1452 ACTTAGAAACATACTCGGTCTGGGAAAACGAGAGGCTGAAGCTATTAGTGTTGATGTTAC 1511 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1418 ACTTAGAAACATACTCGGACTGGGAAAACGAGAAGCTGAAGCTATTAGTGTTGATGTTAC 1477 Query 1512 GTCCAAGTCTTACCGTAAAAGACTTGCTAACGCTGTTTCTAGTGGTGACCTTGAAGCACA 1571 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1478 GTCCAAGGCTTACCGTAAAAGACTTGCTAACGCTGTCTCTAGTGGTGATCTTGAAGCACA 1537 Query 1572 AGACAGTAAAGCAAAATACCTTCAAAAGCTCTGCGAAGAGCTGCACTTTGATGCACAGAA 1631 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1538 AGACAGTAAAGCAAAATACCTTCAAAAGCTCTGCGAAGAGCTGCACTTTGATGCACAGAA 1597 Query 1632 GGCAGGCGCAATCCATGAAGAAATCTATCGGCAGAAGCTTCAACAGTGTGTTACTGATGG 1691 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1598 GGCAGGCGCAATCCATGAAGAAATCTATCGGCAGAAGCTTCAACAGTGTGTTACTGATGG 1657 Query 1692 AGAGCTGAGCGATGACAATGTTGCTGCTTTATTAAGGTTAAGAGTTATGTTGTGTATTCC 1751 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1658 AGAGCTGAGCGATGACAATGTTGCTGCTTTATTAAGGTTAAGAGTTATGCTGTGTATTCC 1717 Query 1752 CCAGCAAACTGTTGATACAGCTCATGCAGAAATCTGTGGAACCATATTTGAAAAGGTTGT 1811 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1718 CCAGCAAACTGTTGAGACAGCTCATGCAGAAATCTGTGGAACTATATTTGAAAAGGTTGT 1777 Query 1812 CAGGGATGCCATTTCTTCTGGAGTGGATGGTTATGATGCTGAAACTCGCAAATCAGTTAG 1871 ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1778 CAGGGATGCAATCTCTTCTGGAGTGGATGGCTATGATGCTGAAACTCGCAAATCAGTAAG 1837 Query 1872 AAAGGCTGCACATGGTCTTCGGTTATCCAGAGAGACTGCCATGTCTATTGCTAGCAAAGC 1931 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1838 AAAGGCTGCACATGGTCTTCGGTTATCCAGAGAGACTGCCATGTCTATTGCTAGCAAAGC 1897 Query 1932 TGTCCGTAGGGTTTTCACAAACTATATCAGACGAGCAAGAGCAGCCGAGAACCGTACTGA 1991 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1898 TGTCCGTAGGGTTTTCACAAACTATATCAGACGAGCAAGAGCAGCCGAGAACCGTACTGA 1957 Query 1992 TTCAGCAAAGGAGCTCAAGAAGATGATTGCTTTCAACACGTTGGTTGTGACTGAAATGGT 2051 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1958 GTCAGCAAAGGAGCTCAAGAAGATGATTGCTTTCAACACGTTAGTTGTGACTGAAATGGT 2017 Query 2052 GGCTGATATCAAGGGAGAATCTTCTGATAAGGCACCTGAGGAGGACCCTGTTCaagagaa 2111 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2018 GGCTGACATTAAGGGAGAATCTTCTGATAAGGCACCTGAGGAGGACCCTGTTGAAGAGAA 2077 Query 2112 agaagaagatgatgaagatgaagaaTGGGGATCCCTTGAATCGCTCAGAAAGACAAGACC 2171 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2078 AGAAGAAGATGGTGAAGATGAGGAATGGGGATCCCTTGAATCGCTCAGAAAGACAAGACC 2137 Query 2172 CGACAAGGAACTCGCTGAGAAAATGGGAAAGCCTGGCCAGACTGAGATAACTCTCAAAGA 2231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2138 CAACAAGGAACTCGCTGAGAAAATGGGAAAGCCTGGCCAGACTGAAATAACTCTCAAAGA 2197 Query 2232 TGACCTTCCCGACAGGGACAGAATAGATCTCTACAAAACATACTTGCTCTACTGTGTAAC 2291 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2198 TGACCTTCCCGACAGGGACAGAATAGATCTTTACAAAACATACTTGCTCTACTGTGTAAC 2257 Query 2292 TGGAGAGGTAACAAGAATCCCTTTTGGCGCCCAGATCACAACAAAGAGAGACGATTCAGA 2351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2258 TGGAGAGGTAACAAGAATCCCTTTTGGCGCCCAGATCACAACAAAGAGAGACGATTCAGA 2317 Query 2352 GTACTTGCTTCTAAATCAGCTTGGTGGGATTCTCGGATTGAGTTCGAAAGAAATAGTCAA 2411 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2318 GTACTTGCTTCTGAATCAGCTTGGTGGGATTCTCGGATTGAGTTCGAAAGAAATAGTCAA 2377 Query 2412 CATTCACGTAGGTTTAGCCGAGCAGGCTTTTAGGCAACAAGCTGAAGTGATTTTAGCTGA 2471 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2378 CATTCACGTAGGTTTAGCTGAGCAGGCTTTTAGGCAACAAGCTGAAGTGATTTTAGCTGA 2437 Query 2472 TGGGCAATTGACAAAGGCTAGAGTAGAGCAGCTAGACGAGTTGCAAAAACAAGTTGGTTT 2531 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2438 TGGGCAATTGACAAAAGCTAGAGTAGAGCAGCTAGACGAGTTGCAAAAACAAGTTGGTTT 2497 Query 2532 GCCTCAGCCACAAGCCGAGAAGGTTATCAAGAATATAACCACCACAAAAATGGCAAACGC 2591 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2498 GCCTCAGCCACAAGCCGAGAAGGTTATCAAGAATATAACCACCACAAAAATGGCAAACGC 2557 Query 2592 GATAGAGACCGCTGTTAACCAAGGAAGACTGAACATAAAGCAGATACGGGAGCTCAAGGA 2651 |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 2558 GATAGAAACTGCTGTTAACCAGGGAAGACTGAACATAAAGCAGATCCGGGAGCTCAAAGA 2617 Query 2652 GGCAAATGTCAGCCTGGACAGCATGATCGCTGTGAGTCTGAGAGAGAAATTATTCAAGAA 2711 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2618 GGCAAACGTCAGCCTGGACAGCATGATCGCTGTGAGTCTGAGAGAGAAATTATTCAAGAA 2677 Query 2712 GACAGTGAGTGACATCTTCTCATCAGGAACTGGTGAATTCGATGAAACCGAAGTCTACCA 2771 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 2678 GACAGTGAATGACATCTTCTCATCAGGAACTGGTGAATTCGATGAAATCGACGTCTACCA 2737 Query 2772 GACAATCCCATCCGATCTCAGTATTGATGTGGAAAAAGCCAAAAGAGTTGTCCATGATCT 2831 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2738 GACAATCCCATCCGATCTCAGCATTGATGTGGAAAAAGCCAAAAGAGTTGTCCATGATCT 2797 Query 2832 CGCTCAGAGTAGATTATCGAATTCGCTGGTCCAAGCCGTGGCATTACTCAGGCAGAGAAA 2891 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2798 CGCTCAGAGTAGATTATCGAATTCGCTGGTCCAAGCCGTGGCATTACTCAGGCAGAGAAA 2857 Query 2892 CTCTAAAGGAGTGGTCTTGTCGCTGAATGATTTGCTTGCATGTGACAAAGCTGTGCCGGC 2951 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2858 CTCTAAAGGAGTGGTCTCCTCGCTGAATGATTTACTTGCATGTGACAAAGCTGTGCCGGC 2917 Query 2952 TGAGCCAATGTCATGGGAGGTCTCAGAGGAATTATCTGATCTATATGCTATTTATTCAAA 3011 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2918 AGAGCCGATGTCATGGGAGGTCTCAGAGGAATTATCCGATCTATATGCTATTTATTCAAA 2977 Query 3012 GAGTGATCCCAAACCCGCACCGGAAAAAGTTTTGAGGCTACAATATCTGCTGGGAATAGA 3071 ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2978 GAGTGATCCCAAACCCGCACCCGAAAAAGTCTCGAGGCTACAATATCTGTTGGGAATAGA 3037 Query 3072 TGATTCAACTGCAACTGCCCTCCGTGAAATGGAAGATGGAGCATTATCTTCTGCTGCAGA 3131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3038 TGATTCAACTGCAACTGCCCTCCGTGAAATGGAAGATGGAGCATTATCCTCTGCTGCAGA 3097 Query 3132 AGAGGGCAATTTCGTCTTTTAAATCTTTGGAGAAATCACTTGAGTTATTATGTATT 3187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| Sbjct 3098 AGAGGGCAATTTCGTCTTTTAAATCTTTGGAGAAATGACTTGAGTTTTT-TGAATT 3152 > Ahg919422 jgi|Araly1|919422|scaffold_100703.1 Length=2461 Score = 1491 bits (807), Expect = 0.0 Identities = 935/993 (94%), Gaps = 24/993 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1109 AGCTTGCTGAAGACCTGTTTAGAGAGCATACGAGAAAAGTAGTCGTAGAGAACATTTCAT 1168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 949 AGCTTGCTGAAGACCTGTTTAGAGAGCATACGAGAAAAGTAGTCGTAGAGAACATTTCAT 1008 Query 1169 CGGCACTCAGCATACTCAAATCCCGCACACGAGCAGCGAAGAGTTTGGCATCTGTCGTGG 1228 |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1009 CGGCACTCAGCATACTAAAATCCCGCACACTAGCAGC------TTTGGCATCTGTCGTGG 1062 Query 1229 AAGAGCTTGAAAAAGTACTGGAGTTTAACAACCTGCTAGTTTCCTTGAAAAGTCATTCAG 1288 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1063 AAGAGCTTGAAAAGGTACTGGAGTTTAACAACCTGCTGGTTTCCTTGAAAAGTCATTCAG 1122 Query 1289 AGGCAGATCAATTTGCACGCGGGGTTGGCCCTATTTCTTTGATAGGTGATGAGTCTGATT 1348 ||||||||||||||||| || || || | | |||||||||||||||| Sbjct 1123 AGGCAGATCAATTTGCATGC--GG--GG-----------T--T-GGTGATGAGTCTGATT 1164 Query 1349 TTGAGAGGAGAATGGATGATTTAAAGCTCCTTTATAGAGCATATGTTACAGATGCTTTAT 1408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1165 TTGAGAGGAGAATGGATGATTTAAAGCTCCTTTATAGAGCATATGTCACAGATGCTTTAT 1224 Query 1409 CTGGTGGGCGCTTAGAAGAAAATAAGCTCGTGGCAATGAGCCAACTTAGAAACATACTCG 1468 ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1225 CTGGTGGGCGCATAGCAGAAAACAAGCTCGTGGCAATGAGCCAGCTTAGAAACATACTCG 1284 Query 1469 GTCTGGGAAAACGAGAGGCTGAAGCTATTAGTGTTGATGTTACGTCCAAGTCTTACCGTA 1528 | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1285 GACTGGGAAAACGAGAAGCTGAAGCTATTAGTGTTGATGTTACGTCCAAGGCTTACCGTA 1344 Query 1529 AAAGACTTGCTAACGCTGTTTCTAGTGGTGACCTTGAAGCACAAGACAGTAAAGCAAAAT 1588 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1345 AAAGACTTGCTAACGCTGTTTCTAATGGTGACCTTGAAGCACAAGACAGTAAAGCAAAAT 1404 Query 1589 ACCTTCAAAAGCTCTGCGAAGAGCTGCACTTTGATGCACAGAAGGCAGGCGCAATCCATG 1648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1405 ACCTTCAAAAGCTCTGCGAAGAGCTGCACTTTGATGCACAGATGGCAGGCGCAATCCATG 1464 Query 1649 AAGAAATCTATCGGCAGAAGCTTCAACAGTGTGTTACTGATGGAGAGCTGAGCGATGACA 1708 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | Sbjct 1465 AAGAAATCTATCGGCAGAAGCTTCAACAGTGTGTTATTGATGGAGAGCTGAGCGATGATA 1524 Query 1709 ATGTTGCTGCTTTATTAAGGTTAAGAGTTATGTTGTGTATTCCCCAGCAAACTGTTGATA 1768 |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1525 ATGTTGCTGCTTTATTAAGGTTAAGAGTCATGCTCTGTATTCCCCAGCAAACTGTTGAGA 1584 Query 1769 CAGCTCATGCAGAAATCTGTGGAACCATATTTGAAAAGGTTGTCAGGGATGCCATTTCTT 1828 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 1585 CAGCTCATGCAGAAATCTGTGGAACCATATTTGAAAAGGTTGTCAGGGAGGCAATTTCTT 1644 Query 1829 CTGGAGTGGATGGTTATGATGCTGAAACTCGCAAATCAGTTAGAAAGGCTGCACATGGTC 1888 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1645 CTGGAGTGGATGGTTATGATGCTGAAACTCGCAAATCAGTAAGAAAGGCTGCACATGGTC 1704 Query 1889 TTCGGTTATCCAGAGAGACTGCCATGTCTATTGCTAGCAAAGCTGTCCGTAGGGTTTTCA 1948 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 1705 TTCGGTTATCCAGAGAGACTGCCATGTGTATTGCTAGCAAGGCTGTCCGTATGGTTTTCA 1764 Query 1949 CAAACTATATCAGACGAGCAAGAGCAGCCGAGAACCGTACTGATTCAGCAAAGGAGCTCA 2008 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 1765 CAAACTATATCAGACGAGCAAGAGCAGCAGAGAACCGCACTGAGTCAGCAAAGGAGCTCA 1824 Query 2009 AGAAGATGATTGCTTTCAACACGTTGGTTGTGACTGAAATGGTGGCTGATATCAAGGGAG 2068 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| Sbjct 1825 AGAAGATGATTGCTTTCAACACGTTAGTTGTGACTGAAATGGTGACTGACATTAAGGGAG 1884 Query 2069 AATCTTCTGATAAGGCACCTGAGGAGGACCCTG 2101 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1885 AATCTTCTGATAAGGCACCTGAGGAGGACCCTG 1917 Score = 171 bits (92), Expect = 4e-41 Identities = 100/104 (96%), Gaps = 0/104 (0%) Strand=Plus/Plus Query 879 GGCATTTATGAGGCTTGTATATGTTTCAGCTCTTGTGTTTGGAGATGCTTCATCCTTCCT 938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 851 GGCATTTATGAGGCTTGTATATGTTTCAGCTCTTGTGTTTGGAGATGCTTCATCCTTCCT 910 Query 939 TCTACCTTGGAAGCGAGTATTGAAGGTCACAGATGCTCAGGTTG 982 | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct 911 TTTGCCTTGGAAGCGAGTATTGAAGGTCACAGATGCCCAGCTTG 954 Score = 119 bits (64), Expect = 2e-25 Identities = 68/70 (97%), Gaps = 0/70 (0%) Strand=Plus/Plus Query 810 GATTGGTCGCAGGATTTTTAGGCAAAGGCTTGAGACTGGGGAGCGTGAAGGTGATGCAGA 869 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 737 GATTGGCCGCAGGATTTTTAGGCAAAGGCTTGAGACTGGGGAACGTGAAGGTGATGCAGA 796 Query 870 ACAGCGTCGG 879 |||||||||| Sbjct 797 ACAGCGTCGG 806 > Ahg919409 jgi|Araly1|919409|scaffold_100690.1 Length=493 Score = 353 bits (191), Expect = 4e-96 Identities = 291/336 (87%), Gaps = 19/336 (6%) Strand=Plus/Plus Query 879 GGCATTTATGAGGCTTGTATATGTTTCAGCTCTTGTGTTTGGAGATGCTTCATCCTTCCT 938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 146 GGCATTTATGAGGCTTGTATATGTTTCAGCTCTTGTGTTTGGAGATGCTTCATCCTTCCT 205 Query 939 TCTACCTTGGAAGCGAGTATTGAAGGTCACAGATGCTCAGGTTGAGATTGCTATTCGTGA 998 | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| | | Sbjct 206 TTTGCCTTGGAAGCGAGTATTGAAGGTCACAGATGCCCAGCTT----TT--T-TTCATCA 258 Query 999 A---AATGCAAAGCAGC-TGTATGCCG-AACG-GT-TAAA-ATTAGTTGGTAGAGATATT 1050 | |||||| | | | | ||| | | | | |||| | | ||| || || |||| Sbjct 259 ACTTAATGCATGGAAACTTACATG--GTTATGTCTCTAAACA-T-GTTCTTACAGCTATT 314 Query 1051 AACGTAGAAAACCTTGTGGACCTTAGAAAATCACAACTATCATTCAAGCTCTCTGATGAG 1110 |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 315 AACGTAGAAAACCTAGTGGACCTTAAAAAAGCACAACTATCATTCAAGCTTTCTGATGAG 374 Query 1111 CTTGCTGAAGACCTGTTTAGAGAGCATACGAGAAAAGTAGTCGTAGAGAACATTTCATCG 1170 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 375 CTTGCTGAAGACCTGTTTAGAGAGCATACGAGAAGAGTAGTCGTAGAGAACATTTCATCG 434 Query 1171 GCACTCAGCATACTCAAATCCCGCACACGAGCAGCG 1206 |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 435 GCACTCAGCATACTAAAATCCCGCACACTAGCAGCG 470 Score = 119 bits (64), Expect = 2e-25 Identities = 68/70 (97%), Gaps = 0/70 (0%) Strand=Plus/Plus Query 810 GATTGGTCGCAGGATTTTTAGGCAAAGGCTTGAGACTGGGGAGCGTGAAGGTGATGCAGA 869 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 32 GATTGGCCGCAGGATTTTTAGGCAAAGGCTTGAGACTGGGGAACGTGAAGGTGATGCAGA 91 Query 870 ACAGCGTCGG 879 |||||||||| Sbjct 92 ACAGCGTCGG 101 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 125095242451 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5