BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G07670.1
Length=3538
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg470794 jgi|Araly1|470794|fgenesh2_kg.1__748__AT1G07810.1 5184 0.0
Ahg470813 jgi|Araly1|470813|fgenesh2_kg.1__767__AT1G07810.1 5000 0.0
> Ahg470794 jgi|Araly1|470794|fgenesh2_kg.1__748__AT1G07810.1
Length=3235
Score = 5184 bits (2807), Expect = 0.0
Identities = 3107/3252 (96%), Gaps = 19/3252 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 100 ATGGGGAAAGGAGGTGAAGATTGCGGGAATAAGCAAACTAATAGTTCTGAATTGGTCAAG 159
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |
Sbjct 1 ATGGGGAAAGGAGGTGAAGATTGCGGGAATAAGCAAACGAATAGTTCTG-A----T--A- 52
Query 160 TCTGATACTTTTCCTGCTTGGGGTAAAGATG-TGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTTGGTGT 218
| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 53 -C-G-----TTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTG-CGGAATGTGAGGAGAAGTTTGGTGT 104
Query 219 TAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTTT 278
||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 105 TAGTCGTGAGAAAGGGTTGGGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGTTT 164
Query 279 GAATGAATTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTAA 338
|||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 165 GAATGAGTTAGAAAAGCCCGAGGGAACTTCTATCTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTTAA 224
Query 339 TGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCTT 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 225 TGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTCTT 284
Query 399 TGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTT 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 TGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTT 344
Query 459 TCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGC 518
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 TCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGC 404
Query 519 GTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTAA 578
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 405 ATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACTAA 464
Query 579 GGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTGG 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 465 GGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTTGG 524
Query 639 TGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCGA 698
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 525 TGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGACTCGA 584
Query 699 GCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATGA 758
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 585 GCAGGGCTCCTTGACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGATGA 644
Query 759 GAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATGG 818
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 645 GAATGCCGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTATTTGCAGGAACCACTGTTGTGAATGG 704
Query 819 GAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTC 878
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 GAACTGTATATGCTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTC 764
Query 879 ACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGA 938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 ACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGA 824
Query 939 GTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCAA 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 825 GTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATCAA 884
Query 999 TGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTC 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 TGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTC 944
Query 1059 CTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTCC 1118
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 945 CTTCGAGAAGTGCACATACTACTTTGAGATTGCTGTTGCATTGGCGGTTGCTGCAATTCC 1004
Query 1119 AGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCA 1178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 TGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCA 1064
Query 1179 GAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGAT 1238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 GAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGAT 1124
Query 1239 ATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTGC 1298
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1125 ATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTTGTTGC 1184
Query 1299 TATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCC 1358
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TATGGGTTCTAGGATTGGAACCCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCC 1244
Query 1359 TCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGAT 1418
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 TCGAGATGGGAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGAT 1304
Query 1419 TGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTGT 1478
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||
Sbjct 1305 TGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCAGAGCAGCAATTTGT 1364
Query 1479 GTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTCC 1538
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1365 GTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTCCC 1424
Query 1539 CGAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGGAG 1598
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1425 CCAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTGTGGAG 1484
Query 1599 TGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGT 1658
||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 TGAACTAGAGCAACGAATTGCCACCCTTGAGTTCGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGT 1544
Query 1659 TATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAATGT 1718
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1545 TATGGTGGATTCGAGCTCAGGAAAGAAGCTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAATGT 1604
Query 1719 ATTGGAAAGGAGTACCCATATTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAATA 1778
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1605 ATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCCATTCGAGAGCTTGACCAATA 1664
Query 1779 CTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGTCT 1838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1665 CTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCTTTAAGATGTCT 1724
Query 1839 CGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGACCA 1898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1725 CGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGACGGCAGTGAAGACCA 1784
Query 1899 TCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGT 1958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 CCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGT 1844
Query 1959 ATTTGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGC 2018
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 ATTCGCTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGC 1904
Query 2019 AGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGC 2078
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 AGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATAGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGC 1964
Query 2079 GGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAG 2138
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 GGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAG 2024
Query 2139 CTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACAGG 2198
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2025 CTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTCCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACTGG 2084
Query 2199 AGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTGAA 2258
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2085 AGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTTAA 2144
Query 2259 AGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTGAA 2318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2145 AGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTTAATGATGCTCCTGCTTTGAA 2204
Query 2319 GTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATC 2378
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 GTTGGCTGATATTGGTGTGGCAATGGGCATTTCCGGTACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATC 2264
Query 2379 TGACTTGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAG 2438
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 TGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACTATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAG 2324
Query 2439 GTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGA 2498
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 GTCCATCTATAATAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGA 2384
Query 2499 GGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCG-TTC 2557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 2385 GGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGAT-CCCGGTTC 2443
Query 2558 AACTTCTGTGGGTGAATCTCGTAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAACC 2617
| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |
Sbjct 2444 AGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAATC 2503
Query 2618 CCCCTGACAAGGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCACTG 2677
||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2504 CCCCTGACAAGGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATCACTG 2563
Query 2678 CGTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAG 2737
| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 CCTGGATTCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAG 2623
Query 2738 TATTCATCATATGGTACACACACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGGTC 2797
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2624 TATTCATTATATGGTACACACACAACAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCCAAGACGGTC 2683
Query 2798 ACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGGCT 2857
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2684 ACAGCCTTGTGAGCTATTCGCAGCTCGCACATTGGGGCCAGTGCTCTTCATGGGAAGGCT 2743
Query 2858 TCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTGCG 2917
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2744 TCAAAGTGTCTCCTTTCACGGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCTTGCG 2803
Query 2918 ACTATTTTCAGCAGGGTAAAATCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCA 2977
||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 ACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCATCGACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCA 2863
Query 2978 TTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCAC 3037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2864 TTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCAC 2923
Query 3038 CCTGGGTTAACCCGTGGCTGCTCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGTGA 3097
| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2924 CATGGGTGAATCCGTGGCTGCTCCTTGCAATGGCGGTCTCATTTGGGCTCCACTTTGTGA 2983
Query 3098 TATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGAGT 3157
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2984 TATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGAAT 3043
Query 3158 GGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTTTG 3217
|||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3044 GGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCTCTACCGGTGATTTTGATAGATGAAGTGCTCAAGTTTG 3103
Query 3218 TAGGAAGGTGCACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAAGG 3277
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 3104 TAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAAAGG 3163
Query 3278 AGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGAAATTA 3337
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3164 AGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGAAATTA 3223
Query 3338 ACTTTGTTGCTT 3349
||||||||||||
Sbjct 3224 ACTTTGTTGCTT 3235
> Ahg470813 jgi|Araly1|470813|fgenesh2_kg.1__767__AT1G07810.1
Length=3408
Score = 5000 bits (2707), Expect = 0.0
Identities = 3033/3194 (95%), Gaps = 8/3194 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 160 TCTGATACTTTTCCTGCTTGGGGTAAAGATG-TGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTT-GGTG 217
|||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||
Sbjct 191 TCTGATACGTTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTG-CGGAATGCGAAGAGCA-TTTCGGTG 248
Query 218 TTAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTT 277
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 249 TTAGTCGTGAGAAAGGGTTGAGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGTT 308
Query 278 TGAATGAATTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTA 337
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 309 TGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTTA 368
Query 338 ATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCT 397
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 369 ATGATACTTTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCCGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTCT 428
Query 398 TTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTT 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 TTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTT 488
Query 458 TTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGG 517
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 TTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGG 548
Query 518 CGTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTA 577
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 549 CATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACTA 608
Query 578 AGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTG 637
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 609 AGGTTTCCAGTTTGCCTGCTAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTTG 668
Query 638 GTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCG 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||
Sbjct 669 GTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGGGTCG 728
Query 698 AGCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATG 757
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 729 AGCAAGGTTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGATG 788
Query 758 AGAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATG 817
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 789 AGAACGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTTGTGAATG 848
Query 818 GGAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACT 877
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 GGAACTGCATATGCTTAGTTACAGACACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACT 908
Query 878 CACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACG 937
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 CACAGATCCAGGAAGCTGCACAACATGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACG 968
Query 938 AGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCA 997
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 969 AGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATCA 1028
Query 998 ATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCT 1057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 ATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCT 1088
Query 1058 CCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTC 1117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||
Sbjct 1089 CCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTAGCTTTGGCGGTTGCTGCTATTC 1148
Query 1118 CAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTC 1177
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1149 CAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATCACCACATGTTTGGCTCTTGGTACAAGGAAGATGGCTC 1208
Query 1178 AGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGA 1237
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1209 AGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGTTACCCAGTGTAGAGACTCTTGGATGCACCACCGTAA 1268
Query 1238 TATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTG 1297
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1269 TATGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTCG 1328
Query 1298 CTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATC 1357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATC 1388
Query 1358 CTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGA 1417
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 CTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGA 1448
Query 1418 TTGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTG 1477
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 1449 TTGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCTGAGCAGCAATTTG 1508
Query 1478 TGTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTC 1537
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 TGTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTC 1568
Query 1538 CCGAAGGATTGAATGAAGCTTCA-TCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGG 1596
| |||||||||||| ||| ||| || ||| | ||| |||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1569 CTGAAGGATTGAATAAAG-TTCCGTCAAATGACGATGGCTTAAGTTGTAGTCGGCTATGG 1627
Query 1597 AGTGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGA 1656
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1628 AGTGAACTAGAGCAACGGATTGCCACTCTTGAGTTTGACCGCGATCGGAAATCAATGGGA 1687
Query 1657 GTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAAT 1716
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1688 GTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAAT 1747
Query 1717 GTATTGGAAAGGAGTACCCATATTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAA 1776
||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||
Sbjct 1748 GTATTGGAAAGGAGTACACGTATTCAGTTACTTGATGGTTCTGTTCAAGAACTTGACCAA 1807
Query 1777 TACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGT 1836
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1808 TACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGT 1867
Query 1837 CTCGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGAC 1896
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1868 CTTGGATTTGCGTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTACCACTTACGATGGCAGTGAAGAC 1927
Query 1897 CATCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTA 1956
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1928 CATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCGTCCAATTATTCTTCTATCGAGTCCAATCTA 1987
Query 1957 GTATTTGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATT 2016
||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1988 ACATTCGCTGGCTTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCGAGGAAAGAGGTGCGCCAAGCCATT 2047
Query 2017 GCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACA 2076
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2048 GCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATCACCGGAGACAACAAGAACACA 2107
Query 2077 GCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGA 2136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2108 GCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATTTCCTCGAGA 2167
Query 2137 AGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACA 2196
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 AGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACT 2227
Query 2197 GGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTG 2256
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2228 GGAGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTT 2287
Query 2257 AAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTG 2316
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288 AAAGAAGATGGAGAAGTAGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTG 2347
Query 2317 AAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCA 2376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2348 AAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAAAGGAGGCA 2407
Query 2377 TCTGACTTGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGC 2436
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2408 TCTGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGC 2467
Query 2437 AGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGT 2496
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2468 AGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGC 2527
Query 2497 GAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCG-T 2555
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 2528 GAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTGGGAATCCCAGAAGGCATGAT-CCCGGT 2586
Query 2556 TCAACTTCTGTGGGTGAATCTCGTAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAA 2615
||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2587 TCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAA 2646
Query 2616 CCCCCCTGACAAGGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCAC 2675
||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2647 TCCCCCTGACAAAGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATAAC 2706
Query 2676 TGCGTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2735
||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2707 TGCCTGGATCCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2766
Query 2736 AGTATTCATCATATGGTACACACACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGG 2795
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||
Sbjct 2767 AGTATTCATCATATGGTACACTCACAACAGCTTCATGGGAATAGACTTGAGCCAAGATGG 2826
Query 2796 TCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGG 2855
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 2827 CCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTTGCACACTGGGACCAATGCTCTTCGTGGGAAGG 2886
Query 2856 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTG 2915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2887 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCATG 2946
Query 2916 CGACTATTTTCAGCAGGGTAAAATCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 2975
||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2947 CGAGTATTTCCAGCAGGGTAAAATCAAAGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 3006
Query 2976 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCC 3035
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3007 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTTTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAACGATGCC 3066
Query 3036 ACCCTGGGTTAACCCGTGGCTGCTCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGT 3095
||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 3067 ACCGTGGGTGAACCCGTGGTTGCTCCTGGCAATGGCGGTCTCATTCGGGCTCCACTTTGT 3126
Query 3096 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGA 3155
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3127 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGA 3186
Query 3156 GTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTT 3215
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3187 GTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTGATTTTGATAGATGAAGTGCTTAAGTT 3246
Query 3216 TGTAGGAAGGTGCACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAA 3275
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 3247 TGTAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAAA 3306
Query 3276 GGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGAAAT 3335
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3307 GGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGAAAT 3366
Query 3336 TAACTTTGTTGCTT 3349
||||||||||||||
Sbjct 3367 TAACTTTGTTGCTT 3380
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 133620138803
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5