BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G07670.1 Length=3538 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg470794 jgi|Araly1|470794|fgenesh2_kg.1__748__AT1G07810.1 5184 0.0 Ahg470813 jgi|Araly1|470813|fgenesh2_kg.1__767__AT1G07810.1 5000 0.0 > Ahg470794 jgi|Araly1|470794|fgenesh2_kg.1__748__AT1G07810.1 Length=3235 Score = 5184 bits (2807), Expect = 0.0 Identities = 3107/3252 (96%), Gaps = 19/3252 (1%) Strand=Plus/Plus Query 100 ATGGGGAAAGGAGGTGAAGATTGCGGGAATAAGCAAACTAATAGTTCTGAATTGGTCAAG 159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | Sbjct 1 ATGGGGAAAGGAGGTGAAGATTGCGGGAATAAGCAAACGAATAGTTCTG-A----T--A- 52 Query 160 TCTGATACTTTTCCTGCTTGGGGTAAAGATG-TGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTTGGTGT 218 | | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||||||| Sbjct 53 -C-G-----TTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTG-CGGAATGTGAGGAGAAGTTTGGTGT 104 Query 219 TAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTTT 278 ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 105 TAGTCGTGAGAAAGGGTTGGGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGTTT 164 Query 279 GAATGAATTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTAA 338 |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 165 GAATGAGTTAGAAAAGCCCGAGGGAACTTCTATCTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTTAA 224 Query 339 TGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCTT 398 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 225 TGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTCTT 284 Query 399 TGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTT 458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 285 TGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTT 344 Query 459 TCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGC 518 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 345 TCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGC 404 Query 519 GTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTAA 578 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 405 ATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACTAA 464 Query 579 GGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTGG 638 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 465 GGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTTGG 524 Query 639 TGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCGA 698 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct 525 TGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGACTCGA 584 Query 699 GCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATGA 758 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 585 GCAGGGCTCCTTGACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGATGA 644 Query 759 GAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATGG 818 |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 645 GAATGCCGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTATTTGCAGGAACCACTGTTGTGAATGG 704 Query 819 GAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTC 878 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 705 GAACTGTATATGCTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTC 764 Query 879 ACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGA 938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 765 ACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGA 824 Query 939 GTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCAA 998 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 825 GTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATCAA 884 Query 999 TGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTC 1058 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 885 TGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTC 944 Query 1059 CTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTCC 1118 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 945 CTTCGAGAAGTGCACATACTACTTTGAGATTGCTGTTGCATTGGCGGTTGCTGCAATTCC 1004 Query 1119 AGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCA 1178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1005 TGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCA 1064 Query 1179 GAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGAT 1238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1065 GAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGAT 1124 Query 1239 ATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTGC 1298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1125 ATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTTGTTGC 1184 Query 1299 TATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCC 1358 ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1185 TATGGGTTCTAGGATTGGAACCCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCC 1244 Query 1359 TCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGAT 1418 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1245 TCGAGATGGGAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGAT 1304 Query 1419 TGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTGT 1478 ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| Sbjct 1305 TGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCAGAGCAGCAATTTGT 1364 Query 1479 GTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTCC 1538 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1365 GTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTCCC 1424 Query 1539 CGAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGGAG 1598 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1425 CCAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTGTGGAG 1484 Query 1599 TGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGT 1658 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 TGAACTAGAGCAACGAATTGCCACCCTTGAGTTCGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGT 1544 Query 1659 TATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAATGT 1718 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1545 TATGGTGGATTCGAGCTCAGGAAAGAAGCTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAATGT 1604 Query 1719 ATTGGAAAGGAGTACCCATATTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAATA 1778 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1605 ATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCCATTCGAGAGCTTGACCAATA 1664 Query 1779 CTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGTCT 1838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1665 CTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCTTTAAGATGTCT 1724 Query 1839 CGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGACCA 1898 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1725 CGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGACGGCAGTGAAGACCA 1784 Query 1899 TCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGT 1958 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1785 CCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGT 1844 Query 1959 ATTTGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGC 2018 ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1845 ATTCGCTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGC 1904 Query 2019 AGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGC 2078 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1905 AGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATAGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGC 1964 Query 2079 GGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAG 2138 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1965 GGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAG 2024 Query 2139 CTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACAGG 2198 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2025 CTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTCCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACTGG 2084 Query 2199 AGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTGAA 2258 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2085 AGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTTAA 2144 Query 2259 AGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTGAA 2318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 2145 AGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTTAATGATGCTCCTGCTTTGAA 2204 Query 2319 GTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATC 2378 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 GTTGGCTGATATTGGTGTGGCAATGGGCATTTCCGGTACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATC 2264 Query 2379 TGACTTGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAG 2438 |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2265 TGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACTATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAG 2324 Query 2439 GTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGA 2498 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2325 GTCCATCTATAATAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGA 2384 Query 2499 GGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCG-TTC 2557 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct 2385 GGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGAT-CCCGGTTC 2443 Query 2558 AACTTCTGTGGGTGAATCTCGTAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAACC 2617 | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | Sbjct 2444 AGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAATC 2503 Query 2618 CCCCTGACAAGGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCACTG 2677 ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2504 CCCCTGACAAGGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATCACTG 2563 Query 2678 CGTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAG 2737 | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2564 CCTGGATTCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAG 2623 Query 2738 TATTCATCATATGGTACACACACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGGTC 2797 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2624 TATTCATTATATGGTACACACACAACAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCCAAGACGGTC 2683 Query 2798 ACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGGCT 2857 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2684 ACAGCCTTGTGAGCTATTCGCAGCTCGCACATTGGGGCCAGTGCTCTTCATGGGAAGGCT 2743 Query 2858 TCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTGCG 2917 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2744 TCAAAGTGTCTCCTTTCACGGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCTTGCG 2803 Query 2918 ACTATTTTCAGCAGGGTAAAATCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCA 2977 ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2804 ACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCATCGACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCA 2863 Query 2978 TTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCAC 3037 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2864 TTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCAC 2923 Query 3038 CCTGGGTTAACCCGTGGCTGCTCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGTGA 3097 | ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2924 CATGGGTGAATCCGTGGCTGCTCCTTGCAATGGCGGTCTCATTTGGGCTCCACTTTGTGA 2983 Query 3098 TATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGAGT 3157 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 2984 TATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGAAT 3043 Query 3158 GGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTTTG 3217 |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3044 GGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCTCTACCGGTGATTTTGATAGATGAAGTGCTCAAGTTTG 3103 Query 3218 TAGGAAGGTGCACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAAGG 3277 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 3104 TAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAAAGG 3163 Query 3278 AGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGAAATTA 3337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3164 AGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGAAATTA 3223 Query 3338 ACTTTGTTGCTT 3349 |||||||||||| Sbjct 3224 ACTTTGTTGCTT 3235 > Ahg470813 jgi|Araly1|470813|fgenesh2_kg.1__767__AT1G07810.1 Length=3408 Score = 5000 bits (2707), Expect = 0.0 Identities = 3033/3194 (95%), Gaps = 8/3194 (0%) Strand=Plus/Plus Query 160 TCTGATACTTTTCCTGCTTGGGGTAAAGATG-TGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTT-GGTG 217 |||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| |||| Sbjct 191 TCTGATACGTTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTG-CGGAATGCGAAGAGCA-TTTCGGTG 248 Query 218 TTAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTT 277 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 249 TTAGTCGTGAGAAAGGGTTGAGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGTT 308 Query 278 TGAATGAATTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTA 337 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 309 TGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTTA 368 Query 338 ATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCT 397 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 369 ATGATACTTTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCCGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTCT 428 Query 398 TTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTT 457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 429 TTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTT 488 Query 458 TTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGG 517 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 489 TTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGG 548 Query 518 CGTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTA 577 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 549 CATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACTA 608 Query 578 AGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTG 637 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 609 AGGTTTCCAGTTTGCCTGCTAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTTG 668 Query 638 GTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCG 697 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| Sbjct 669 GTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGGGTCG 728 Query 698 AGCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATG 757 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 729 AGCAAGGTTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGATG 788 Query 758 AGAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATG 817 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 789 AGAACGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTTGTGAATG 848 Query 818 GGAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACT 877 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 GGAACTGCATATGCTTAGTTACAGACACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACT 908 Query 878 CACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACG 937 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 CACAGATCCAGGAAGCTGCACAACATGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACG 968 Query 938 AGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCA 997 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 969 AGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATCA 1028 Query 998 ATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCT 1057 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 ATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCT 1088 Query 1058 CCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTC 1117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| Sbjct 1089 CCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTAGCTTTGGCGGTTGCTGCTATTC 1148 Query 1118 CAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTC 1177 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 1149 CAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATCACCACATGTTTGGCTCTTGGTACAAGGAAGATGGCTC 1208 Query 1178 AGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGA 1237 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1209 AGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGTTACCCAGTGTAGAGACTCTTGGATGCACCACCGTAA 1268 Query 1238 TATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTG 1297 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1269 TATGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTCG 1328 Query 1298 CTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATC 1357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATC 1388 Query 1358 CTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGA 1417 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 CTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGA 1448 Query 1418 TTGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTG 1477 |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct 1449 TTGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCTGAGCAGCAATTTG 1508 Query 1478 TGTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTC 1537 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTC 1568 Query 1538 CCGAAGGATTGAATGAAGCTTCA-TCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGG 1596 | |||||||||||| ||| ||| || ||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1569 CTGAAGGATTGAATAAAG-TTCCGTCAAATGACGATGGCTTAAGTTGTAGTCGGCTATGG 1627 Query 1597 AGTGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGA 1656 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 1628 AGTGAACTAGAGCAACGGATTGCCACTCTTGAGTTTGACCGCGATCGGAAATCAATGGGA 1687 Query 1657 GTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAAT 1716 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1688 GTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAAT 1747 Query 1717 GTATTGGAAAGGAGTACCCATATTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAA 1776 ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| Sbjct 1748 GTATTGGAAAGGAGTACACGTATTCAGTTACTTGATGGTTCTGTTCAAGAACTTGACCAA 1807 Query 1777 TACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGT 1836 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1808 TACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGT 1867 Query 1837 CTCGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGAC 1896 || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1868 CTTGGATTTGCGTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTACCACTTACGATGGCAGTGAAGAC 1927 Query 1897 CATCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTA 1956 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| Sbjct 1928 CATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCGTCCAATTATTCTTCTATCGAGTCCAATCTA 1987 Query 1957 GTATTTGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATT 2016 ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1988 ACATTCGCTGGCTTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCGAGGAAAGAGGTGCGCCAAGCCATT 2047 Query 2017 GCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACA 2076 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2048 GCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATCACCGGAGACAACAAGAACACA 2107 Query 2077 GCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGA 2136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2108 GCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATTTCCTCGAGA 2167 Query 2137 AGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACA 2196 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2168 AGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACT 2227 Query 2197 GGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTG 2256 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2228 GGAGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTT 2287 Query 2257 AAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTG 2316 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2288 AAAGAAGATGGAGAAGTAGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTG 2347 Query 2317 AAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCA 2376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2348 AAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAAAGGAGGCA 2407 Query 2377 TCTGACTTGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGC 2436 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2408 TCTGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGC 2467 Query 2437 AGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGT 2496 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2468 AGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGC 2527 Query 2497 GAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCG-T 2555 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 2528 GAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTGGGAATCCCAGAAGGCATGAT-CCCGGT 2586 Query 2556 TCAACTTCTGTGGGTGAATCTCGTAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAA 2615 ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 2587 TCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAA 2646 Query 2616 CCCCCCTGACAAGGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCAC 2675 ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 2647 TCCCCCTGACAAAGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATAAC 2706 Query 2676 TGCGTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2735 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2707 TGCCTGGATCCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2766 Query 2736 AGTATTCATCATATGGTACACACACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGG 2795 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || Sbjct 2767 AGTATTCATCATATGGTACACTCACAACAGCTTCATGGGAATAGACTTGAGCCAAGATGG 2826 Query 2796 TCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGG 2855 |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| Sbjct 2827 CCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTTGCACACTGGGACCAATGCTCTTCGTGGGAAGG 2886 Query 2856 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTG 2915 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 2887 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCATG 2946 Query 2916 CGACTATTTTCAGCAGGGTAAAATCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 2975 ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2947 CGAGTATTTCCAGCAGGGTAAAATCAAAGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 3006 Query 2976 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCC 3035 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 3007 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTTTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAACGATGCC 3066 Query 3036 ACCCTGGGTTAACCCGTGGCTGCTCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGT 3095 ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| Sbjct 3067 ACCGTGGGTGAACCCGTGGTTGCTCCTGGCAATGGCGGTCTCATTCGGGCTCCACTTTGT 3126 Query 3096 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGA 3155 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3127 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGA 3186 Query 3156 GTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTT 3215 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 3187 GTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTGATTTTGATAGATGAAGTGCTTAAGTT 3246 Query 3216 TGTAGGAAGGTGCACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAA 3275 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 3247 TGTAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAAA 3306 Query 3276 GGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGAAAT 3335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3307 GGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGAAAT 3366 Query 3336 TAACTTTGTTGCTT 3349 |||||||||||||| Sbjct 3367 TAACTTTGTTGCTT 3380 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 133620138803 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5