BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G07810.1
Length=3499
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg470813 jgi|Araly1|470813|fgenesh2_kg.1__767__AT1G07810.1 5168 0.0
Ahg470794 jgi|Araly1|470794|fgenesh2_kg.1__748__AT1G07810.1 4929 0.0
Ahg943770 jgi|Araly1|943770|scaffold_604314.1 178 3e-43
> Ahg470813 jgi|Araly1|470813|fgenesh2_kg.1__767__AT1G07810.1
Length=3408
Score = 5168 bits (2798), Expect = 0.0
Identities = 3191/3385 (94%), Gaps = 10/3385 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCTGCGATTGCTTGCAGCGGGAAGTTTCTTTCTCTCTAG-CTC-CGGATTTGCTTTG 58
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 1 GTCCCTGCGATAGCTTGCAGCGGGAAGTTTCTTTCTCTCTAGCCCCGCGGATTTGCTTTG 60
Query 59 TCGAAAACCGTAAGCTTTGGCGAGTTTCCGGGAGAATTTGACGAATCTGTTTTGCAACGA 118
|||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 TCGATAACCTTAAGCTTTGGCGATTTTCCGGGAGAATTTGACGAATCTGTTTTGCTACGA 120
Query 119 GTGAGAATTCATGGGGAAAGGATCAGAAGACCTTGTGAAGAAGGAAAGCTTAAATTCTAC 178
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTGGGAATTCATGGGGAAAGGATCAGAAGACCTTGTGGAGAAGGAAAGCTTAAATTCTAC 180
Query 179 ACCTGTAAATTCGGATACGTTTCCTGCTTGGGCTAAAGATGTCGCGGAATGTGAAGAACA 238
||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 181 ACCCGTAAATTCTGATACGTTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTGCGGAATGCGAAGAGCA 240
Query 239 TTTCGTTGTTAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGTAGTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGAT 298
||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TTTCGGTGTTAGTCGTGAGAAAGGGTTGAGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGAT 300
Query 299 CTATGGTTTGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 301 CTATGGTTTGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGTTGATTTTGGA 360
Query 359 GCAGTTTAATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTT 418
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 361 GCAGTTTAATGATACTTTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCCGTTATTTCCTTTGTCTT 420
Query 419 GGCCTTCTTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACTGCATTTGTTGAGCCGCT 478
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 421 GGCCTTCTTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCT 480
Query 479 TGTTATTTTTCTCATCTTAATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGC 538
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGTTATTTTTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGC 540
Query 539 TGAGAAGGCGTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCAACTGTCATGCGTGA 598
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 541 TGAGAAGGCATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGA 600
Query 599 TGGGACTAAGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACT 658
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 601 TGGGACTAAGGTTTCCAGTTTGCCTGCTAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACT 660
Query 659 GAGGGTTGGTGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTT 718
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 661 GAGGGTTGGTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCT 720
Query 719 GAGAGTCGAGCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCA 778
||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GAGGGTCGAGCAAGGTTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCA 780
Query 779 CGTGGATGAGAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGT 838
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGTGGATGAGAACGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGT 840
Query 839 CGTGAATGGGAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAG 898
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TGTGAATGGGAACTGCATATGCTTAGTTACAGACACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAG 900
Query 899 GGTTCACTCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAA 958
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GGTTCACTCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACATGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAA 960
Query 959 ACTTAACGAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTG 1018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 961 ACTTAACGAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTG 1020
Query 1019 GCTCATCAATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTT 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GCTCATCAATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTT 1080
Query 1079 TAAGTTCTCCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGC 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1081 TAAGTTCTCCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTAGCTTTGGCGGTTGC 1140
Query 1139 TGCAATTCCTGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACACGGAA 1198
||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1141 TGCTATTCCAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATCACCACATGTTTGGCTCTTGGTACAAGGAA 1200
Query 1199 GATGGCTCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1201 GATGGCTCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGTTACCCAGTGTAGAGACTCTTGGATGCAC 1260
Query 1259 CACCGTGATATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTCACAACCAATCAGATGGCTGTTTCTAA 1318
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1261 CACCGTAATATGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAA 1320
Query 1319 GCTCGTTGCTATGGGTTCGAGGATCGGTACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTC 1378
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GCTCGTCGCTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTC 1380
Query 1379 GTTTGATCCTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAATGGGTCGGATGGATGCAAATCT 1438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GTTTGATCCTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCT 1440
Query 1439 TCAGATGATTGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTCGAGCAATCTGATCA 1498
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct 1441 TCAGATGATTGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCTGAGCA 1500
Query 1499 GCAATTTGTGTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAAT 1558
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GCAATTTGTGTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAAT 1560
Query 1559 GGGATTTCCCGAAGGATTGAATGAAGCTTC-GTCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTC 1617
||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||
Sbjct 1561 GGGATTTCCTGAAGGATTGAATAAAG-TTCCGTCAAATGACGATGGCTTAAGTTGTAGTC 1619
Query 1618 GGCTATGGAGTGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAAT 1677
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1620 GGCTATGGAGTGAACTAGAGCAACGGATTGCCACTCTTGAGTTTGACCGCGATCGGAAAT 1679
Query 1678 CAATGGGAGTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAACAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGG 1737
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 CAATGGGAGTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGG 1739
Query 1738 TAGAAAATGTATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCAAAACGAGAGC 1797
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |
Sbjct 1740 TAGAAAATGTATTGGAAAGGAGTACACGTATTCAGTTACTTGATGGTTCTGTTCAAGAAC 1799
Query 1798 TTGACCAATACTCAAGGGATCTGATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCAT 1857
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TTGACCAATACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCAT 1859
Query 1858 TAAGATGTCTCGGATTTGCTTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCA 1917
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 1860 TAAGATGTCTTGGATTTGCGTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTACCACTTACGATGGCA 1919
Query 1918 GTGAAGACCATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGT 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||
Sbjct 1920 GTGAAGACCATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCGTCCAATTATTCTTCTATCGAGT 1979
Query 1978 CCAATCTAATATTCGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTC 2037
||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1980 CCAATCTAACATTCGCTGGCTTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCGAGGAAAGAGGTGCGCC 2039
Query 2038 AAGCCATTGCAGATTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATTACTGGAGACAACA 2097
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2040 AAGCCATTGCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATCACCGGAGACAACA 2099
Query 2098 AGAGCACAGCGGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCT 2157
||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2100 AGAACACAGCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATTT 2159
Query 2158 CCTCAAGAAGCTTGACGGGAATAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTAC 2217
|||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 CCTCGAGAAGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTAA 2219
Query 2218 GACAGACTGGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCA 2277
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GACAGACTGGAGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCA 2279
Query 2278 GGTTACTGAAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGACGGAGTCAATGATGCTC 2337
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2280 GGTTACTTAAAGAAGATGGAGAAGTAGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTC 2339
Query 2338 CTGCTCTGAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAA 2397
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 CTGCCCTGAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAA 2399
Query 2398 AGGAGGCATCTGACATGGTTTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTAG 2457
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2400 AGGAGGCATCTGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTG 2459
Query 2458 GTGAAGGCAGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCA 2517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GTGAAGGCAGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCA 2519
Query 2518 ACATCGGCGAGGTTGCATCGATATTTTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGA 2577
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2520 ACATCGGCGAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTGGGAATCCCAGAAGGCATGA 2579
Query 2578 TCCCGGTTCAGCTTCTGTGGGTAAATCTCGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGG 2637
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2580 TCCCGGTTCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGG 2639
Query 2638 GGTTCAACCCCCCTGACAAAGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCGC 2697
| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2640 GATTCAATCCCCCTGACAAAGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTC 2699
Query 2698 TTATCACTGCCTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTCTGTACGTGGGAGTAGCAA 2757
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 2700 TTATAACTGCCTGGATCCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAA 2759
Query 2758 CGGTGGGAGTATTCATCATATGGTACACACACAGTAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCC 2817
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2760 CGGTGGGAGTATTCATCATATGGTACACTCACAACAGCTTCATGGGAATAGACTTGAGCC 2819
Query 2818 AAGACGGTCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCAT 2877
|||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |
Sbjct 2820 AAGATGGCCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTTGCACACTGGGACCAATGCTCTTCGT 2879
Query 2878 GGGAAGGCTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAA 2937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2880 GGGAAGGCTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAA 2939
Query 2938 ACCCTTGCGACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCGTCCACACTCTCCCTCTCGGTGT 2997
|||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 ACCCATGCGAGTATTTCCAGCAGGGTAAAATCAAAGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGT 2999
Query 2998 TGGTGGCCATTGAAATGTTCAACTCCCTGAACGCACTCTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAA 3057
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 TGGTGGCCATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTTTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAA 3059
Query 3058 CGATGCCGCCGTGGGTGAACCCGTGGTTACTCCTGGCTATGGCTGTCTCATTCGGGCTCC 3117
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3060 CGATGCCACCGTGGGTGAACCCGTGGTTGCTCCTGGCAATGGCGGTCTCATTCGGGCTCC 3119
Query 3118 ACTTTGTGATACTGTACGTGCCATTCCTGGCTCAGGTATTTGGGATAGTGCCACTGAGCT 3177
||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||
Sbjct 3120 ACTTTGTGATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCT 3179
Query 3178 TGAACGAGTGGCTGCTGGTACTGGCTGTTTCGCTTCCAGTGATTCTT-ATAGACGAAGTG 3236
|||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||| || ||||| ||||||
Sbjct 3180 TGAACGAGTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTGATT-TTGATAGATGAAGTG 3238
Query 3237 CTCAAGTTTGTAGGAAGGTGTACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCTTTCCACG 3296
|| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
Sbjct 3239 CTTAAGTTTGTAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCT 3298
Query 3297 AAGCAAAAGGAGGAGTAAGAAA-TAAATCAAAAG-CATTATATTATTAGACTCTTAGTTT 3354
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||
Sbjct 3299 AAGCAAAAGGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTAT-T-ATTAGACTGTTAGTTT 3356
Query 3355 TAGCTGAAATTAGCGTTGTTACTTA 3379
|||||||||||| | ||||| ||||
Sbjct 3357 TAGCTGAAATTAACTTTGTTGCTTA 3381
> Ahg470794 jgi|Araly1|470794|fgenesh2_kg.1__748__AT1G07810.1
Length=3235
Score = 4929 bits (2669), Expect = 0.0
Identities = 3023/3197 (95%), Gaps = 12/3197 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 188 TTCGGATACGTTTCCTGCTTGGGCTAAAGATGTCGCGGAATGTGA--AGAACATTTCGTT 245
||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |
Sbjct 45 TTCTGATACGTTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTGCGGAATGTGAGGAGAA-GTTT-GGT 102
Query 246 GTTAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGTAGTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGT 305
||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103 GTTAGTCGTGAGAAAGGGTTGGGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGT 162
Query 306 TTGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAGCAGTTT 365
|||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 163 TTGAATGAGTTAGAAAAGCCCGAGGGAACTTCTATCTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTT 222
Query 366 AATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTC 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTC 282
Query 426 TTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACTGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATT 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 TTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATT 342
Query 486 TTTCTCATCTTAATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAG 545
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 TTTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAG 402
Query 546 GCGTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCAACTGTCATGCGTGATGGGACT 605
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 403 GCATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACT 462
Query 606 AAGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTT 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 463 AAGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTT 522
Query 666 GGTGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTC 725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 523 GGTGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGACTC 582
Query 726 GAGCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGAT 785
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 583 GAGCAGGGCTCCTTGACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGAT 642
Query 786 GAGAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAAT 845
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 643 GAGAATGCCGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTATTTGCAGGAACCACTGTTGTGAAT 702
Query 846 GGGAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCAC 905
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 GGGAACTGTATATGCTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCAC 762
Query 906 TCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAAC 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 TCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAAC 822
Query 966 GAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATC 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 823 GAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATC 882
Query 1026 AATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTC 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 AATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTC 942
Query 1086 TCCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATT 1145
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 943 TCCTTCGAGAAGTGCACATACTACTTTGAGATTGCTGTTGCATTGGCGGTTGCTGCAATT 1002
Query 1146 CCTGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCAC-ACGGAAGATGGC 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 1003 CCTGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTA-GGAAGATGGC 1061
Query 1205 TCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGT 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 TCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGT 1121
Query 1265 GATATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTCACAACCAATCAGATGGCTGTTTCTAAGCTCGT 1324
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1122 GATATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTTGT 1181
Query 1325 TGCTATGGGTTCGAGGATCGGTACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGA 1384
|||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 TGCTATGGGTTCTAGGATTGGAACCCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGA 1241
Query 1385 TCCTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAATGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGAT 1444
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 TCCTCGAGATGGGAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGAT 1301
Query 1445 GATTGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTCGAGCAATCTGATCAGCAATT 1504
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 1302 GATTGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCAGAGCAGCAATT 1361
Query 1505 TGTGTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATT 1564
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 TGTGTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATT 1421
Query 1565 TCCCGAAGGATTGAATGAAGCTTCGTCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATG 1624
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1422 CCCCCAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTGTG 1481
Query 1625 GAGTGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGG 1684
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 GAGTGAACTAGAGCAACGAATTGCCACCCTTGAGTTCGACCGTGACCGGAAATCAATGGG 1541
Query 1685 AGTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAACAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAA 1744
||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542 AGTTATGGTGGATTCGAGCTCAGGAAAGAAGCTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAA 1601
Query 1745 TGTATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCAAAACGAGAGCTTGACCA 1804
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1602 TGTATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCCATTCGAGAGCTTGACCA 1661
Query 1805 ATACTCAAGGGATCTGATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATG 1864
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1662 ATACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCTTTAAGATG 1721
Query 1865 TCTCGGATTTGCTTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGA 1924
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1722 TCTCGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGACGGCAGTGAAGA 1781
Query 1925 CCATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCT 1984
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 CCACCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCT 1841
Query 1985 AATATTCGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCAT 2044
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 AGTATTCGCTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCAT 1901
Query 2045 TGCAGATTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATTACTGGAGACAACAAGAGCAC 2104
|||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||
Sbjct 1902 TGCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATAGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCAC 1961
Query 2105 AGCGGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCAAG 2164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1962 AGCGGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAG 2021
Query 2165 AAGCTTGACGGGAATAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTACGACAGAC 2224
||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2022 AAGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTCCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGAC 2081
Query 2225 TGGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACT 2284
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 TGGAGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACT 2141
Query 2285 GAAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGACGGAGTCAATGATGCTCCTGCTCT 2344
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2142 TAAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTTAATGATGCTCCTGCTTT 2201
Query 2345 GAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAAAGGAGGC 2404
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 GAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCAATGGGCATTTCCGGTACAGAGGTAGCAAAGGAGGC 2261
Query 2405 ATCTGACATGGTTTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTAGGTGAAGG 2464
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2262 ATCTGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACTATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGG 2321
Query 2465 CAGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGG 2524
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 CAGGTCCATCTATAATAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGG 2381
Query 2525 CGAGGTTGCATCGATATTTTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATCCCGGT 2584
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 TGAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATCCCGGT 2441
Query 2585 TCAGCTTCTGTGGGTAAATCTCGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGGTTCAA 2644
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||
Sbjct 2442 TCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAA 2501
Query 2645 CCCCCCTGACAAAGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCGCTTATCAC 2704
||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2502 TCCCCCTGACAAGGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATCAC 2561
Query 2705 TGCCTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTCTGTACGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2764
||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TGCCTGGATTCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2621
Query 2765 AGTATTCATCATATGGTACACACACAGTAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCCAAGACGG 2824
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622 AGTATTCATTATATGGTACACACACAACAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCCAAGACGG 2681
Query 2825 TCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGG 2884
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2682 TCACAGCCTTGTGAGCTATTCGCAGCTCGCACATTGGGGCCAGTGCTCTTCATGGGAAGG 2741
Query 2885 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTG 2944
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2742 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACGGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCTTG 2801
Query 2945 CGACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCGTCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 3004
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802 CGACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCATCGACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 2861
Query 3005 CATTGAAATGTTCAACTCCCTGAACGCACTCTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAACGATGCC 3064
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2862 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCC 2921
Query 3065 GCCGTGGGTGAACCCGTGGTTACTCCTGGCTATGGCTGTCTCATTCGGGCTCCACTTTGT 3124
|| |||||||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2922 ACCATGGGTGAATCCGTGGCTGCTCCTTGCAATGGCGGTCTCATTTGGGCTCCACTTTGT 2981
Query 3125 GATACTGTACGTGCCATTCCTGGCTCAGGTATTTGGGATAGTGCCACTGAGCTTGAACGA 3184
|||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2982 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGA 3041
Query 3185 GTGGCTGCTGGTACTGGCTGTTTCGCTTCCAGTGATTCTT-ATAGACGAAGTGCTCAAGT 3243
|||||||| || |||||||| || || || |||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 3042 ATGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCTCTACCGGTGATT-TTGATAGATGAAGTGCTCAAGT 3100
Query 3244 TTGTAGGAAGGTGTACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCTTTCCACGAAGCAAA 3303
||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||
Sbjct 3101 TTGTAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAA 3160
Query 3304 AGGAGGAGTAAGAAA-TAAATCAAAAG-CATTATATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGA 3361
||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3161 AGGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTAT-T-ATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGA 3218
Query 3362 AATTAGCGTTGTTACTT 3378
||||| | ||||| |||
Sbjct 3219 AATTAACTTTGTTGCTT 3235
> Ahg943770 jgi|Araly1|943770|scaffold_604314.1
Length=3238
Score = 178 bits (96), Expect = 3e-43
Identities = 104/108 (96%), Gaps = 0/108 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 106 TGTTTTGCAACGAGTGAGAATTCATGGGGAAAGGATCAGAAGACCTTGTGAAGAAGGAAA 165
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1 TGTTTTGCTACGAGTGGGAATTCATGGGGAAAGGATCAGAAGACCTTGTGGAGAAGGAAA 60
Query 166 GCTTAAATTCTACACCTGTAAATTCGGATACGTTTCCTGCTTGGGCTA 213
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCTTAAATTCTACACCCGTAAATTCGGATACGTTTCCTGCTTGGGCTA 108
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 132135893456
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5