BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G07920.1
Length=1783
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1 2359 0.0
Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627 2281 0.0
Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1 2061 0.0
> Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1
Length=1522
Score = 2359 bits (1277), Expect = 0.0
Identities = 1446/1525 (95%), Gaps = 22/1525 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 109 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 168
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 60
Query 169 G-AAAGTCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTC 227
| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTAAA-TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 119
Query 228 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 179
Query 288 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 347
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 239
Query 348 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 407
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 240 AAGTTTGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 299
Query 408 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 300 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCC 359
Query 468 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTA 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 360 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 419
Query 528 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 587
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 479
Query 588 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 539
Query 648 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 707
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 540 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 599
Query 708 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 600 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAG 659
Query 768 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 827
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 719
Query 828 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 779
Query 888 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 947
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 780 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 839
Query 948 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 840 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 899
Query 1008 AATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAG 1067
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 900 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 959
Query 1068 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1127
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1019
Query 1128 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1187
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1079
Query 1188 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1139
Query 1248 CCCAAGTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1307
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1140 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATG 1199
Query 1308 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGG 1367
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1200 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGG 1259
Query 1368 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1427
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1319
Query 1428 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGAA--CC-ATCCTCAAAACTCTATCT 1484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||
Sbjct 1320 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGAATTCCCAGCCTCAAAACTATATC- 1378
Query 1485 GCCGCAGGTGAATCAAAGGAC-AGTGTTAGTTTTATT-ACAATAGTTTGGTATTTGGTCG 1542
| |||| |||||| |||||| | | |||||||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct 1379 -C-GCAGATGAATCCAAGGACTATT-TTAGTTTT-TTCACTTTAGTTTGGTATTTGGTCG 1434
Query 1543 CGTGTCTGTGTTCTTGTTTCGTTTTCTCC-CCGTCAGAGCGTTG-TTCTCGTAATTGGGT 1600
| | | | | | | ||||||| || | |||||||||| | ||| || ||||||||
Sbjct 1435 C-T-TAT-TA--CA-GCTTCGTTT-CTTCTCCGTCAGAGC-TCAATTCCCGGAATTGGGT 1486
Query 1601 TCTTGATCGGAGGTGGCGGATCTAC 1625
|||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1487 TCTTGATCGGAGGTGGCGGAGCTAC 1511
> Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627
Length=2856
Score = 2281 bits (1235), Expect = 0.0
Identities = 1316/1356 (97%), Gaps = 2/1356 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 109 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 1561
Query 169 G-AAAGTCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTC 227
| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1562 GTAAA-TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 1620
Query 228 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 287
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1621 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGG 1680
Query 288 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 347
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 1740
Query 348 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 1800
Query 408 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 467
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 1860
Query 468 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTA 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1861 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 1920
Query 528 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 587
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 1980
Query 588 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 2040
Query 648 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 707
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2041 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 2100
Query 708 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 2160
Query 768 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 827
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 2220
Query 828 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 2280
Query 888 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 947
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2281 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 2340
Query 948 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2341 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 2400
Query 1008 AATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAG 1067
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2401 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 2460
Query 1068 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1127
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 2520
Query 1128 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1187
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 2580
Query 1188 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 2640
Query 1248 CCCAAGTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1307
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 2700
Query 1308 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGG 1367
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2701 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGG 2760
Query 1368 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1427
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2761 CAGACTGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAG 2820
Query 1428 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856
Score = 2257 bits (1222), Expect = 0.0
Identities = 1303/1343 (97%), Gaps = 2/1343 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 114 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGG-AAA 172
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60
Query 173 GTCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 232
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 -TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119
Query 233 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179
Query 293 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 352
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239
Query 353 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299
Query 413 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 472
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359
Query 473 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 532
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419
Query 533 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 592
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479
Query 593 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 652
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539
Query 653 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 712
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599
Query 713 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659
Query 773 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 832
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719
Query 833 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779
Query 893 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 952
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839
Query 953 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1012
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899
Query 1013 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1072
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959
Query 1073 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1132
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019
Query 1133 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1192
||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTT 1079
Query 1193 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1139
Query 1253 GTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1312
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1199
Query 1313 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGAC 1372
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGAC 1259
Query 1373 TGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTAC 1432
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTAC 1319
Query 1433 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1455
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342
Score = 182 bits (98), Expect = 1e-44
Identities = 115/123 (93%), Gaps = 2/123 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1491 GGTGAATCAAAGGACAGTGTTAGTTTTATTACAATAGTTTGGTATTTGGTCGCGTGTCTG 1550
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1339 GGTGAATCAAAGGACAATGTTAGTTTTTTTACAATAGTTTGGTATCTGGTCGCTTGTCTG 1398
Query 1551 TGTTCTTGTTTCGTT-TTCTCCCCGTCAGAGCGTTGTTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCG 1609
||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 TGTTCCTGTTTCGTTATT-TCCCCATCAGAGCGTTGTTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCG 1457
Query 1610 GAG 1612
|||
Sbjct 1458 GAG 1460
> Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1
Length=1599
Score = 2061 bits (1116), Expect = 0.0
Identities = 1274/1352 (94%), Gaps = 4/1352 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 114 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 173
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129
Query 174 TCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 232
|||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
Query 233 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 292
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
Query 293 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 352
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308
Query 353 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 412
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368
Query 413 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 472
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
Query 473 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 532
||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
Query 533 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 592
||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548
Query 593 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 652
||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
Query 653 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 712
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668
Query 713 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728
Query 773 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 832
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788
Query 833 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848
Query 893 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 952
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
Query 953 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1012
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
Query 1013 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||
Sbjct 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
Query 1073 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1132
||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
Query 1133 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1192
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
Query 1193 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
Query 1253 GTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1312
||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
Query 1313 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGA 1371
||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327
Query 1372 CTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1431
| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387
Query 1432 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1463
|||||||||| |||||||| || || || |||
Sbjct 1388 CCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGA 1419
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 66924560465
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5