BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G07930.1
Length=1807
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1 2427 0.0
Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627 2248 0.0
Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1 2050 0.0
> Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1
Length=1522
Score = 2427 bits (1314), Expect = 0.0
Identities = 1452/1520 (96%), Gaps = 4/1520 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 121 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 60
Query 181 G-AAAGTCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTG 239
| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 61 GTAAA-TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 119
Query 240 ATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 299
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 179
Query 300 GTGTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 359
|| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 239
Query 360 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 419
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 AAGTTTGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 299
Query 420 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 300 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCC 359
Query 480 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTC 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 360 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 419
Query 540 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 599
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 479
Query 600 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 539
Query 660 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 719
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 540 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 599
Query 720 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 600 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAG 659
Query 780 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 839
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 719
Query 840 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 779
Query 900 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 959
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 780 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 839
Query 960 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 840 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 899
Query 1020 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAG 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 900 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 959
Query 1080 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1139
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1019
Query 1140 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1199
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1079
Query 1200 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1139
Query 1260 CCCAAATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1319
||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1140 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATG 1199
Query 1320 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGG 1379
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1200 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGG 1259
Query 1380 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1439
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1319
Query 1440 GTTACCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTGCAAAGTGAACTCGAATCCTCAAAACTCTATCC 1499
|||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||
Sbjct 1320 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGAATTCCCAGCCTCAAAACTATATCC 1379
Query 1500 GCAGATGAATCAAAAAACAATATTAGTTTCTTT-ACTTTAGTTTGGTATTTGGTCGCGTG 1558
||||||||||| || || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1380 GCAGATGAATCCAAGGACTATTTTAGTTT-TTTCACTTTAGTTTGGTATTTGGTCGCTTA 1438
Query 1559 TTATAGCTTCGTTTCTTCTCCATCGGAACTCTGTTCCCGGAACTGGGTTCTTGATCGGAG 1618
||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1439 TTACAGCTTCGTTTCTTCTCCGTCAGAGCTCAATTCCCGGAATTGGGTTCTTGATCGGAG 1498
Query 1619 GTGGCGGAGCTACTTTGCAC 1638
||||||||||||||| ||||
Sbjct 1499 GTGGCGGAGCTACTTGGCAC 1518
> Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627
Length=2856
Score = 2248 bits (1217), Expect = 0.0
Identities = 1310/1356 (97%), Gaps = 2/1356 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 121 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 1561
Query 181 G-AAAGTCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTG 239
| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1562 GTAAA-TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 1620
Query 240 ATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 299
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1621 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGG 1680
Query 300 GTGTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 359
|| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 1740
Query 360 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1741 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 1800
Query 420 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 479
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 1860
Query 480 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTC 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1861 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 1920
Query 540 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 599
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 1980
Query 600 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 2040
Query 660 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 719
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2041 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 2100
Query 720 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 2160
Query 780 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 839
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 2220
Query 840 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 2280
Query 900 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 959
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2281 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 2340
Query 960 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2341 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 2400
Query 1020 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAG 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2401 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 2460
Query 1080 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1139
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 2520
Query 1140 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1199
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 2580
Query 1200 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 2640
Query 1260 CCCAAATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1319
||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 2700
Query 1320 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGG 1379
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 2701 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGG 2760
Query 1380 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1439
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2761 CAGACTGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAG 2820
Query 1440 GTTACCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTGCAAAGTGA 1475
|||||||||||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct 2821 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856
Score = 2241 bits (1213), Expect = 0.0
Identities = 1301/1344 (97%), Gaps = 4/1344 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 126 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGG-AAA 184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60
Query 185 GTCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTGATCGA 244
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||
Sbjct 61 -TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119
Query 245 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179
Query 305 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 364
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239
Query 365 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 424
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299
Query 425 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 484
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359
Query 485 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTCCTTGC 544
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419
Query 545 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 604
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479
Query 605 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 664
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539
Query 665 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 724
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599
Query 725 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659
Query 785 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 844
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719
Query 845 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779
Query 905 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 964
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839
Query 965 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1024
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899
Query 1025 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAGGATGA 1084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959
Query 1085 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1144
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019
Query 1145 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAG-TCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1203
||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTC-TCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGT 1078
Query 1204 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1138
Query 1264 AATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 AATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1198
Query 1324 TGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1383
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 1199 TGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGA 1258
Query 1384 CTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1443
|||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1318
Query 1444 CCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTG 1467
|||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1319 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342
> Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1
Length=1599
Score = 2050 bits (1110), Expect = 0.0
Identities = 1274/1354 (94%), Gaps = 8/1354 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 126 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 185
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129
Query 186 TCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTGATCGA 244
||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
Query 245 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 304
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
Query 305 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 364
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308
Query 365 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 424
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368
Query 425 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 484
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
Query 485 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTCCTTGC 544
||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
Query 545 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 604
||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548
Query 605 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 664
||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
Query 665 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 724
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668
Query 725 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728
Query 785 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 844
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788
Query 845 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848
Query 905 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 964
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
Query 965 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1024
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
Query 1025 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAGGATGA 1084
||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
Query 1085 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1144
||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
Query 1145 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAG-TCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1203
||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTC-TCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1147
Query 1204 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1207
Query 1264 AATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1323
| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208 AGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1267
Query 1324 TGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAG 1382
| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 TTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAG 1326
Query 1383 ACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTT 1442
|| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1327 ACCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTC 1386
Query 1443 ACCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTGC-AAAGTGA 1475
|||||||||||||| ||||| || || ||| |||
Sbjct 1387 ACCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAA-TGA 1419
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 67838726345
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5