BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G08420.1
Length=3740
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg919586 jgi|Araly1|919586|scaffold_100867.1 5251 0.0
Ahg481616 jgi|Araly1|481616|fgenesh2_kg.4__676__AT2G27210.1 3491 0.0
> Ahg919586 jgi|Araly1|919586|scaffold_100867.1
Length=3095
Score = 5251 bits (2843), Expect = 0.0
Identities = 3004/3083 (97%), Gaps = 5/3083 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 180 tttGATAATGGATGAAGATTCGTCTATGGTGGCTGACAACGATCAGGATCGTGAGTTTCA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 14 TTTGATAATGGATGAAGATTCGTCTATGGTGGCTGACAACGATCAGGATCGGGAGTTTCA 73
Query 240 GAGCCTTGATGGAGGCCAATCTCCTTCGCCTATGGAAAGAGAAACGCCTCAGCAGATGAA 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 74 GAGCCTTGATGGAGGCCAATCTCCTTCGCCTATGGAGAGAGAGACGCCTCAGCAGATGAA 133
Query 300 CGACCAATCACCTCCTCCTGAAGGCGGATCGGTGCCTA-CGCCGCCGCCTTCGGATCCTA 358
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 134 CGACCAATCA---CCTCCTGAAGGCGGATCGGTGCC-AGCGCCGCCGCCTTCGGATCCTA 189
Query 359 ATCCGGCAACTTCTCAGCAGCAAGCGGCTGCGGTTGTTGGACAAGAGCAGCAGCCGGCGC 418
||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 ATCCGACGAGTTCTCCGCAGCAAGCGGCTGCGGTTGTTGGACAAGAGCAGCAGCCGGCGC 249
Query 419 TAGTTGTTGGTCCGAGGTGTGCACCTACGTATTCGGTGGTGGATGCTATGATGGATAAAA 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 250 AAGTTGTTGGTCCGAGGTGTGCACCTACGTATTCGGTGGTCGATGCTATGATGGATAAAA 309
Query 479 AAGAGGATGGGCCTGGCCCTAGGTGTGGTCACACCTTGACGGCTGTGCCTGCTGTTGGTG 538
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 AAGAGGATGGCCCTGGCCCTAGGTGTGGTCACACGTTGACGGCTGTGCCTGCTGTTGGTG 369
Query 539 ATGAAGGAACGCCTGGTTATATTGGTCCTCGTCTTGTATTGTTTGGTGGTGCGACGGCTC 598
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 ATGAAGGAACGCCTGGTTACATTGGTCCTCGTCTTGTATTGTTTGGTGGTGCGACGGCTC 429
Query 599 TTGAGGGAAATTCTGGTGGCACCGGAACTCCTACTTCAGCTGGAAGTGCCGGCATTCGGC 658
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 TTGAGGGTAATTCTGGTGGCACCGGAACTCCAACTTCAGCTGGAAGTGCCGGCATTCGGC 489
Query 659 TAGCTGGGGCAACTGCTGATGTTCATTGTTATGATGTACTTTCTAATAAGTGGACTAGGC 718
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 TAGCTGGTGCAACTGCTGATGTTCATTGTTATGATGTACTTTCTAATAAGTGGACTAGGC 549
Query 719 TTACACCTTTTGGAGAACCACCAACCCCGAGGGCCGCACATGTTGCAACTGCAGTCGGGA 778
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 550 TTACACCCTTTGGAGAACCACCAACCCCGAGGGCCGCACATGTTGCCACTGCAGTCGGGA 609
Query 779 CCATGGTAGTTATTCAGGGTGGAATTGGTCCTGCTGGTTTATCGGCTGAAGACCTTCATG 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 CCATGGTAGTTATTCAGGGTGGAATTGGTCCTGCTGGTTTATCGGCTGAAGACCTTCATG 669
Query 839 TTCTTGATCTCACTCAACAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGGTCCTGGAC 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 TTCTTGATCTCACTCAACAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGGTCCTGGAC 729
Query 899 CAGGACCTCGTTATGGACATGTCATGGCACTCGTGGGGCAAAGGTATCTCATGGCAATTG 958
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 CAGGACCGCGTTATGGACATGTCATGGCACTCGTGGGACAAAGGTATCTCATGGCAATTG 789
Query 959 GTGGAAATGATGGAAAACGTCCACTTGCTGATGTATGGGCCTTGGATACTGCCGCCAAGC 1018
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 GTGGAAATGACGGAAAACGTCCACTCGCTGATGTATGGGCCTTGGATACTGCCGCCAAGC 849
Query 1019 CTTATGAATGGCGTAAGTTGGAACCAGAAGGGGAAGGTCCACCTCCCTGCATGTATGCAA 1078
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 CTTATGAATGGCGTAAGCTGGAACCAGAAGGGGAAGGTCCACCTCCCTGCATGTATGCAA 909
Query 1079 CTGCAAGTGCGCGCTCCGATGGTCTTCTTCTCCTCTGTGGTGGAAGGGATGCAAACAGTG 1138
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 CTGCAAGTGCGCGTTCCGATGGTCTTCTTCTCCTCTGTGGTGGAAGGGATGCAAACAGTG 969
Query 1139 TGCCTCTGGCCAGTGCATATGGACTTGCGAAGCACAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCA 1198
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 TGCCTCTGGCCAGTGCATATGGACTTGCGAAGCATAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCA 1029
Query 1199 TAGCCCCTGGTGTCTCACCATCTTCCAGATATCAGCATGCAGCAGTCTTTGTAAATGCAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 TAGCCCCTGGTGTCTCACCATCTTCCAGATATCAGCATGCAGCAGTCTTTGTAAATGCAA 1089
Query 1259 GACTTCATGTGTCCGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTTGAAGACTCATCCAGTG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 GACTTCATGTGTCCGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTTGAAGACTCATCCAGTG 1149
Query 1319 TTGCAGTATTGGATACTGCAGCAGGTGTATGGTGTGATACAAAATCAGTTGTTACTAGTC 1378
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1150 TTGCAGTATTGGATACTGCAGCAGGTGTATGGTGTGATACGAAATCAGTTGTTACTAGTC 1209
Query 1379 CTAGAACTGGTAGGTATAGTGCCGATGCAGCTGGTGGCGATGCTTCGGTTGAGCTGACTA 1438
||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 CTAGAACCGGCAGGTATAGTGCCGATGCAGCTGGTGGTGATGCTTCGGTTGAGCTGACTA 1269
Query 1439 GGCGGTGTAGGCATGCTGCTGCTGCAGTCGGTGATTTGATATTTATCTACGGTGGTTTAC 1498
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1270 GGCGTTGTAGGCATGCTGCTGCTGCAGTCGGTGATTTGATATTTATCTACGGCGGTTTAC 1329
Query 1499 GTGGAGGGGTGTTACTCGATGACTTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCGGAAACAA 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GTGGAGGGGTGTTACTCGATGACTTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCGGAAACAA 1389
Query 1559 CATATGCTGCTTCTCATGCTGCTGCAGCTGCGGCAACAAATTCTCCACCAGGTCGATTAC 1618
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1390 CATATGCTGCTTCTCATGCTGCCGCAGCTGCGGCAACAAATTCCCCACCAGGTCGATTAC 1449
Query 1619 CTGGAAGGTATGGTTTTTCAGATGAAAGGAACAGGGAGTTATCTGAATCAGCTGCTGATG 1678
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1450 CTGGAAGGTATGGTTTTTCAGATGAAAGGAACAGGGAGTTATCTGAATCAGCCGCTGATG 1509
Query 1679 GCGCTGTGGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGCATACTGATA 1738
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 GCGCTGTTGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGCATACTGATA 1569
Query 1739 TTAGCCCTGAAAATGCATTACTTCCAGGAACTCGGAGAACGAATAAGGGTGTGGAGTATC 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 TTAGCCCTGAAAATGCATTACTTCCAGGAACTCGGAGAACGAATAAGGGTGTGGAGTATC 1629
Query 1799 TTGTTGAAGCATCAGCAGCGGAAGCTGAGGCGATCAGTGCGACGTTGGCTGCTGCCAAGG 1858
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1630 TTGTTGAAGCATCAGCAGCGGAAGCTGAGGCGATCAGTGCTACGTTGGCTGCTGCCAAGG 1689
Query 1859 CAAGACAAGTCAATGGTGAAGTTGAACTCCCTGATAGGGATTGTGGTGCAGAGGCTACAC 1918
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 CACGACAAGTCAATGGTGAAGTTGAACTCCCAGATAGGGATTGTGGTGCAGAGGCTACAC 1749
Query 1919 CCAGTGGGAAACCTACATTTTCGCTAATCAAGCCAGATTCTATGGGCTCAATGAGTGTTA 1978
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1750 CTAGTGGGAAACCTACATTTTCGCTAATCAAGCCAGATTCTATGGGATCAATGAGTGTTA 1809
Query 1979 CACCTGCAGGGATTCGTCTTCATCATAGAGCTGTGGTGGTTGCTGCTGAAACTGGTGGCG 2038
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1810 CTCCTGCAGGGATTCGTCTTCATCATAGAGCCGTGGTGGTTGCTGCAGAAACTGGTGGCG 1869
Query 2039 CCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCCATTGATCAATTTGAAAATGAGGGACGGCGTG 2098
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 CCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCTATTGATCAATTTGAAAATGAGGGACGGCGTG 1929
Query 2099 TCAGTTATGGGACACCAGAAAGTGCAACAGCAGCAAGGAAACTATTAGATCGACAAATGT 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1930 TCAGTTATGGGACACCAGAAAGTGCAACAGCAGCAAGGAAACTATTAGATCGACAGATGT 1989
Query 2159 CAATCAACAGTGTTCCAAAGAAGGTTATAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGTGGTTGGAAGC 2218
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1990 CAATCAATAGTGTTCCAAAGAAGGTTATAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGTGGGTGGAAGC 2049
Query 2219 CTCCTGTTCGACGGCAGTTTTTCCTAGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTGTGATAGTG 2278
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2050 CTCCTGTTCGACGCCAGTTTTTCCTAGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTGTGATAGTG 2109
Query 2279 CAGAACGTATCTTCGCAAGTGAACCGACTGTATTACAGCTTAAAGCTCCTATCAAAATAT 2338
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110 CAGAACGTATCTTCGCAAGTGAACCAACTGTATTACAGCTTAAAGCTCCTATCAAAATAT 2169
Query 2339 TTGGTGATCTGCATGGGCAGTTTGGGGATCTTATGCGCCTTTTTGATGAATATGGTTCAC 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170 TTGGTGATCTGCATGGGCAGTTTGGGGATCTTATGCGCCTTTTTGATGAATATGGTTCAC 2229
Query 2399 CATCTACAGCTGGAGACATATCATATATCGACTACCTCTTCTTAGGGGACTATGTTGATC 2458
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2230 CATCTACAGCTGGAGACATATCATACATCGATTACCTCTTCTTAGGGGACTATGTTGATC 2289
Query 2459 GGGGTCAACACAGTCTAGAAACAATCTCCCTTCTACTTGCACTAAAGGTTGAGTACCAGC 2518
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 2290 GGGGTCAACACAGTCTAGAAACAATTTCCCTTCTACTTGCATTAAAGGTGGAGTACCAGC 2349
Query 2519 ATAATGTACACTTAATTCGGGGAAACCATGAAGCTGCAGATATCAATGCCCTTTTTGGCT 2578
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2350 ATAACGTACACTTAATTCGGGGAAACCATGAAGCTGCGGATATTAATGCCCTTTTTGGCT 2409
Query 2579 TCCGGATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGTGATGGAATCTGGGTGTGGCACCGAA 2638
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2410 TCCGAATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGCGATGGAATCTGGGTGTGGCACCGAA 2469
Query 2639 TAAATCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTTGCTGCATCGATTGAGAAGAAAATTATCTGTA 2698
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2470 TAAATCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTTGCCGCATCAATTGAGAAGAAAATTATATGTA 2529
Query 2699 TGCATGGGGGTATTGGTCGTTCTATAAATCATGTGGAGCAGATAGAAAATATTCAACGTC 2758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2530 TGCATGGGGGTATTGGTCGTTCTATAAATCATGTGGAGCAGATAGAAAATATTCAACGTC 2589
Query 2759 CAATTACAATGGAAGCTGGCTCCATTGTTCTTATGGATTTATTATGGTCGGATCCAACTG 2818
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 CAATTACAATGGAAGCTGGCTCCATTGTGCTTATGGATTTATTATGGTCGGATCCAACTG 2649
Query 2819 AAAATGACAGTGTCGAAGGTTTAAGGCCCAATGCTAGAGGCCCTGGATTGGTTACTTTTG 2878
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2650 AAAATGACAGTGTCGAAGGTTTAAGGCCCAATGCTAGAGGTCCTGGATTGGTTACTTTTG 2709
Query 2879 GGCCTGACCGTGTCATGGAGTTCTGCAACAACAACGATCTTCAGTTGATTGTACGAGCAC 2938
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2710 GGCCTGACCGTGTCATGGAGTTCTGCAACAACAATGATCTTCAGTTGATTGTACGAGCAC 2769
Query 2939 ACGAATGCGTAATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCTCAGGGGCATTTGATAACGCTCTTTT 2998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2770 ACGAATGCGTAATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCTCAAGGACATTTGATAACGCTCTTTT 2829
Query 2999 CTGCTACAAACTATTGTGGTACTGCAAACAATGCTGGGGCTATCTTGGTACTAGGGAGAG 3058
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2830 CTGCTACAAACTATTGTGGTACTGCAAACAACGCTGGGGCTATCTTGGTATTAGGGAGAG 2889
Query 3059 ATCTTGTAGTGGTACCTAAGCTCATTCATCCGTTACCTCCAGCACTTTCATCGCCTGAAA 3118
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2890 ATCTTGTAGTGGTTCCTAAGCTCATTCATCCGTTACCTCCAGCTCTTTCATCGCCTGAAA 2949
Query 3119 CTTCACCAGAAAGACATATAGAAGACACATGGATGCAGGAGCTGAACGCAAATAGGCCAG 3178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2950 CTTCACCAGAAAGACATATAGAAGACACATGGATGCAGGAGCTGAATGCGAATAGGCCAG 3009
Query 3179 CGACGCCAACCCGAGGACGCCCACAAAATTCAAATGACCGAGGAGGTTCTCTGGCTTGGA 3238
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010 CGACGCCAACCAGAGGACGCCCACAAAATTCAAATGACCGAGGAGGTTCTCTGGCTTGGA 3069
Query 3239 TGTGAGGCAGATAAAGAGGCACT 3261
||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3070 TGTGAGGCAGACAAAGAGGCACT 3092
> Ahg481616 jgi|Araly1|481616|fgenesh2_kg.4__676__AT2G27210.1
Length=3670
Score = 3491 bits (1890), Expect = 0.0
Identities = 2522/2830 (89%), Gaps = 31/2830 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 424 GTTGGTCCGAGGTGTGCACCTACGTATTCGGTGGTGGATGCTATGATGGATAAAAAAGAG 483
||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || |||||
Sbjct 428 GTTGGTCCGAGATGTGCGCCAACGTATTCGGTTGTGAATGCTATAATAGAGAAGAAAGAA 487
Query 484 GATGGGCCTGGCCCTAGGTGTGGTCACACCTTGACGGCTGTGCCTGCTGTTGGTGATGAA 543
||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| |||
Sbjct 488 GATGGTCCTGGTCCTAGATGTGGACATACGTTGACGGCGGTTCCGGCGGTTGGTGAGGAA 547
Query 544 GGAACGCCTGGTTATATTGGTCCTCGTCTTG-TATTGTTTGGTGGTGCGACGGCTCTTGA 602
|| ||| ||||||||||||| || | | || | |||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 548 GGGACGTCTGGTTATATTGGACCGAGAC-TGATTTTGTTTGGTGGTGCTACTGCTCTTGA 606
Query 603 GGGAAATTCTGGTGGCACCGGAACTCCTACTTCAGCTGGAAGTGCCGGCATTCGGCTAGC 662
||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 607 GGGTAATTCTGGAGGAACAGGAACACCTACTTCAGCTGGAAGTGCCGGCATTCGACTAGC 666
Query 663 TGGGGCAACTGCTGATGTTCATTGTTATGATGTACTTTCTAATAAGTGGACTAGGCTTAC 722
||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||
Sbjct 667 TGGTGCAACGGCTGATGTTCATTGTTATGATGTTCTTACTAATAAGTGGTCGAGGCTTAC 726
Query 723 ACCTTTTGGAGAACCACCAACCCCGAGGGCCGCACATGTTGCAACTGCAGTCGGGACCAT 782
||| | |||||||||||| | || || || || |||||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct 727 ACCATATGGAGAACCACCTAGTCCAAGAGCTGCTCATGTTGCTACTGCTGTTGGGACTAT 786
Query 783 GGTAGTTATTCAGGGTGGAATTGGTCCTGCTGGTTTATCGGCTGAAGACCTTCATGTTCT 842
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||
Sbjct 787 GGTAGTCATTCAGGGTGGAATAGGTCCTGCTGGTTTATCAGCTGAGGATCTTCACGTTCT 846
Query 843 TGATCTCACTCAACAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGGTCCTGGACCAGG 902
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 TGATCTCACTCAGCAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGGTCCTGGACCAGG 906
Query 903 ACCTCGTTATGGACATGTCATGGCACTCGTGGGGCAAAGGTATCTCATGGCAATTGGTGG 962
||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 ACCACGTTATGGACATGTCATGGCACTGGTAGGACAGAGGTATCTCATGGCAATTGGTGG 966
Query 963 AAATGATGGAAAACGTCCACTT-GCTGATGTATGGGCCTTGGATACTGCCGCCAAGCCTT 1021
||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 967 AAATGATGGAAAACGTCCA-TTAGCTGATGTATGGGCTTTGGACACTGCTGCCAAACCTT 1025
Query 1022 ATGAATGGCGTAAGTTGGAACCAGAAGGGGAAGGTCCACCTCCCTGCATGTATGCAACTG 1081
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1026 ATGAATGGCGTAAGCTGGAACCGGAAGGGGAAGGTCCACCTCCATGCATGTATGCAACTG 1085
Query 1082 CAAGTGCGCGCTCCGATGGTCTTCTTCTCCTCTGTGGTGGAAGGGATGCAAACAGTGTGC 1141
|||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||
Sbjct 1086 CAAGTGCGCGGTCTGATGGCCTTCTTCTTCTCTGTGGTGGAAGAGATGCGAATAGTGTGC 1145
Query 1142 CTCTGGCCAGTGCATATGGACTTGCGAAGCACAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCATAG 1201
| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1146 CCCTAGCAAGTGCATATGGACTTGCCAAGCACAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCATTG 1205
Query 1202 CCCCTGGTGTCTCACCATCTTCCAGATATCAGCATGCAGCAGTCTTTGTAAATGCAAGAC 1261
||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 CCCCTGGTGTCTCCCCTTCTGCCAGATACCAGCATGCTGCAGTCTTTGTAAATGCAAGAC 1265
Query 1262 TTCATGTGTCCGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTTGAAGACTCATCCAGTGTTG 1321
| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1266 TCCATGTCTCTGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTAGAAGACTCGTCCAGTGTTG 1325
Query 1322 CAGTATTGGATACTGCAGCAGGTGTATGGTGTGATACAAAATCAGTTGTTACTAGTCCTA 1381
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1326 CAGTGTTGGATACTGCAGCAGGTGTTTGGTGTGATACAAAATCGGTTGTTACTAGTCCTA 1385
Query 1382 GAACTGGTAGGTATAGTGCCGATGCAGCTGGTGGCGATGCTTCGGTTGAGCTGACTAGGC 1441
|||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1386 GAACTGGTAGGTATAGCGCTGACGCAGCTGGTGGTGATGCTTCTGTTGAGCTGACTAGGC 1445
Query 1442 GGTGTAGGCATGCTGCTGCTGCAGTCGGTGATTTGATATTTATCTACGGTGGTTTACGTG 1501
| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||
Sbjct 1446 GTTGCAGGCATGCTGCTGCTGCAGTGGGTGATTTGATATTCATCTATGGTGGTTTGCGTG 1505
Query 1502 GAGGGGTGTTACTCGATGACTTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCGGAAACAACAT 1561
|||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1506 GAGGAGTGTTACTTGATGACCTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCGGCGGAAACAACAT 1565
Query 1562 ATGCTGCTTCTCATGCTGCTGCAGCTGC-G--GCAACAAATTCTCCACCAGGTCGATT-A 1617
|||||| |||||||||||||| || || | |||||||| || ||||| || || || |
Sbjct 1566 CTGCTGCCTCTCATGCTGCTGCTGCAGCAGCAGCAACAAACTCACCACCTGGCCG-TTCA 1624
Query 1618 CCTGGAAGGTATGGTTTTTCAGATGAAAGGAACAGGG-AGTTATCTGAATCAGCTGCTGA 1676
|||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| || || | ||||||||| ||||
Sbjct 1625 CCTGGAAGATATGGATTTTCTGATGAAAG-AACAGGGGAGCTACCAGAATCAGCTCCTGA 1683
Query 1677 TGGCGCTGTGGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGCATACTGA 1736
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1684 ---CTCTGTGGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGTATACTGA 1740
Query 1737 TATTAGCCCTGAAAATGCATTACTTCCAGGAACTCGGAGAACGAAT-AAGGGTGTGGAGT 1795
||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1741 TATAAGCACTGAAAATGCAATGGTTCCAGGAACTCGGAGAAC-AAGCAAGGGTGTGGAGT 1799
Query 1796 ATCTTGTTGAAGCATCAGCAGCGGAAGCTGAGGCGATCAGTGCGACGTTGGCTGCTGCCA 1855
|||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |
Sbjct 1800 ATCTCGTTGAAGCATCTGCTGCGGAAGCCGAGGCTATCAGTGCAACATTAGCTGCTGCGA 1859
Query 1856 AGGCAAGACAAGTCAATGGTGAAGTTGAACTCCCTGATAGGGATTGTGGTGCAGAGGCTA 1915
||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 1860 AGGCACGACAGGTCAACGGTGAAGTTGAACTCCCAGATAGGGATCGTGGTGCTGAGGCTA 1919
Query 1916 CACCCAGTGGGAAACCTACATTTTCGCTAATCAAGCCAGATTCTATGGG-CTC-AATGAG 1973
|||||||||| |||||| |||| || | || ||||| |||||| | | | || ||
Sbjct 1920 CACCCAGTGGAAAACCTTCATTATCATTGATTAAGCCTGATTCTGCAGTAC-CGAAC-AG 1977
Query 1974 TGTTACACCTGCAGG-GATTCGTCTTCATCATAGAGCTGTGGTGGTTGCTGCTGAAACTG 2032
||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 1978 TGTTATTCCTGCAGGCG-TTCGACTGCATCATAGAGCTGTGGTGGTTGCCGCAGAAACAG 2036
Query 2033 GTGGCGCCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCCATTGATCAATTTGAAAATGAGGGAC 2092
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 GTGGAGCCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCCATTGATCAATTTGAAAATGAGGGAC 2096
Query 2093 GGCGTGTCAGTTATGGGACACCAGAAAGTGCAACAGCAGCAAGGAAACTATTAGATCGAC 2152
| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 2097 GCCGTGTTAGTTATGGGACACCCGAAAGTGCAACAGCAGCAAGGAAATTATTAGATCGTC 2156
Query 2153 AAATGTCAATCAACAGTGTTCC-AAAGAAGGTTATAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGTGGT 2211
| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2157 AGATGTCAATCAATAGTGTTCCGAAA-AAGGTTGTAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGGGGG 2215
Query 2212 TGGAAGCCTCCTGTTCGACGGCAGTTTTTCCTAGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTGT 2271
||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TGGAAGCCTCCAGTTCGACGCCAGTTTTTCTTGGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTGC 2275
Query 2272 GATAGTGCAGAACGTATCTTCGCAAGTGAACCGACTGTATTACAGCTTAAAGCTCCTATC 2331
|| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 GACAGTGCAGAACGTATCTTCTCAAGCGAACCTACTGTGTTACAGCTTAAAGCTCCTATT 2335
Query 2332 AAAATATTTGGTGATCTGCATGGGCAGTTTGGGGATCTTATGCGCCTTTTTGATGAATAT 2391
|| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 AAGATATTTGGTGATTTGCATGGTCAGTTTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGATGAATAT 2395
Query 2392 GGTTCACCATCTACAGCTGGAGACATATCATATATCGACTACCTCTTCTTAGGGGACTAT 2451
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 GGTTCACCATCAACAGCTGGAGACATATCATACATCGATTACCTCTTCTTAGGGGACTAT 2455
Query 2452 GTTGATCGGGGTCAACACAGTCTAGAAACAATCTCC-CTTCTACTTGCACTAAAGGTTGA 2510
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2456 GTTGATCGGGGTCAACACAGCCTAGAGACAAT-TACACTTCTGCTTGCGTTAAAGGTTGA 2514
Query 2511 GTACCAGCATAATGTACACTTAATTCGGGGAAACCATGAAGCTGCAGATATCAATGCCCT 2570
||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||
Sbjct 2515 ATACCAACATAACGTACACCTGATTCGTGGAAATCATGAAGCTGCTGACATTAATGCCCT 2574
Query 2571 TTTTGGCTTCCGGATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGTGATGGAATCTGGGTGTG 2630
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2575 TTTTGGTTTCCGGATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGTGATGGGATCTGGGTGTG 2634
Query 2631 GCACCGAATAAATCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTTGCTGCA-TCGATTGAGAAGAAAA 2689
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||
Sbjct 2635 GCACCGAATAAACCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTGGCTGCACT-GATTGAGAAGAAAA 2693
Query 2690 TTATCTGTATGCATGGGGGTATTGGTCGTTCTATAAATCATGTGGAGCAGATAGAAAATA 2749
||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2694 TTATCTGTATGCATGGGGGAATTGGTCGGTCGATAAATCATGTGGAACAGATAGAAAATA 2753
Query 2750 TTCAACGTCCAATTACAATGGAAGCTGGCTCCATTGTTCTTATGGATTTATTATGGTCGG 2809
| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 2754 TCCAACGTCCAATTACGATGGAAGCTGGCTCAATTGTACTTATGGATTTACTATGGTCGG 2813
Query 2810 ATCCAACTGAAAATGACAGTGTCGAAGGTTTAAGGCCCAATGCTAGAGGCCCTGGATTGG 2869
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2814 ATCCAACTGAAAATGACAGTGTTGAAGGTTTAAGACCCAATGCTAGAGGCCCTGGGTTGG 2873
Query 2870 TTACTTTTGGGCCTGACCGTGTCATGGAGTTCTGCAACAACAACGATCTTCAGTTGATTG 2929
|||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2874 TTACCTTCGGGCCTGACCGTGTCATGGAGTTTTGCAACAACAATGATCTTCAATTGATTG 2933
Query 2930 TACGAGCACACGAATGCGTAATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCTCAGGGGCATTTGATAA 2989
|||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||
Sbjct 2934 TACGTGCGCATGAATGCGTGATGGACGGATTTGAGCGTTTCGCCCAAGGTCATTTGATAA 2993
Query 2990 CGCTCTTTTCTGCTACAAACTATTGTGGTACTGCAAACAATGCTGGGGCTATCTTGGTAC 3049
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2994 CGCTCTTTTCGGCAACAAACTATTGTGGTACTGCAAACAATGCCGGGGCTATCTTGGTGT 3053
Query 3050 TAGGGAGAGATCTTGTAGTGGTACCTAAGCTCATTCATCCGTTACCTCCAGCACTTTCAT 3109
| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||| || | |
Sbjct 3054 TGGGGAGAGATCTTGTGGTGGTTCCTAAGCTTATCCATCCATTGCCTCCAGCAATTACCT 3113
Query 3110 CGCCTGAAACTTCACCAGAAAGACATATAGAAGACACATGGATGCAGGAGCTGAACGCAA 3169
| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 3114 CACCTGAAACTTCACCAGAAAGACATATAGAGGATACATGGATGCAGGAGTTAAACGCAA 3173
Query 3170 ATAGGCCAGCGACGCCAACCCGAGGACGCCCACAAAATTCAAATGACCGAGGAGGTTCTC 3229
|||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||
Sbjct 3174 ATAGACCACCAACACCAACAAGAGGACGCCCACAAAATCCAAATGACCGTGGC--T-CTC 3230
Query 3230 TGGCTTGGAT 3239
| ||||||||
Sbjct 3231 TTGCTTGGAT 3240
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 141307768549
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5