BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G08620.1

Length=4288
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg334149 jgi|Araly1|334149|fgenesh1_pg.C_scaffold_1000714          5795    0.0  


> Ahg334149 jgi|Araly1|334149|fgenesh1_pg.C_scaffold_1000714
Length=3630

 Score = 5795 bits (3138),  Expect = 0.0
 Identities = 3477/3641 (95%), Gaps = 22/3641 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  305   ATGGGGACAGAGCTAATGAGAATCTGTGTGAAAGAAGATAGTGATGATTTGCCATCTGTT  364
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGGGGACAGAGCTAATGAGAATCTGTGTGAAAGAAGATAGTGATGATTTGCCATCTGTT  60

Query  365   CCTCCTGGTTTTGAATCATATGCAACTTTTACCTTAAAAAGAGTAGTCCCTGCTACTACT  424
             |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||
Sbjct  61    CCTCCTGGGTTTGAATCTTATGCTACTTTTACCTTAAAAAGAGTAGTCCC--C-GGTACT  117

Query  425   TCTGATAAAGCCAAGACTCCTGCAATTGAAAGTGTTTCTGCAACCGAACAAGCTAAGATG  484
             |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118   TCTGATCAAGCCAAGACTGCTGCAATTGAAAGTGTTTCTGCAACCGAACAAGCTAAGATG  177

Query  485   GAAGTTGAATCTGATGAAGCCAAAGCTGCTCGGGCTCTACGCCGTAGACCTTGGATTAAT  544
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct  178   GAAGTTGAATCCGATGAAGCCAAAGCTGCTCGGGCTGTACGCCGTAGGCCTTGGATTAAT  237

Query  545   CATAGCGGATGTGATGATGATGGTGATTG-TGCTGCAAACAATGACAATGCTGCATCTCA  603
             |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| || |||||||||||||||||
Sbjct  238   CATAGCGGATGTGATGATGATGATGA-TGATGGTGCAAAAAACGACAATGCTGCATCTCA  296

Query  604   AAATCCTGATCAAAATTGTGA-TGTGAAGCCAG-CTCTTCCAAAGGGTGTGGTCAGGGGA  661
             |||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297   AAATCCTGATCAAAGTTGT-ACTGCGAAGCC-GTCTCTTCCAAAGGGTGTGGTCAGGGGA  354

Query  662   TGTGAAGAATGTAAAGATTGTCAGAAGGTAACTGCGAGATGGCATCCAGATGAAGCTCGT  721
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  355   TGTGAAGAATGTAAAGATTGCCAGAAGGTAACTGCGACATGGCATCCAGATGAAGCTCGT  414

Query  722   AGGCCTGACCTTGAGGACGCCCCTGTATTCTACCCGAGCGAAGAGGAGTTTGAAGACACT  781
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  415   AGGCCTGACCTTGAAGACGCCCCTGTATTCTACCCGACCGAAGAGGAGTTTGAAGACACT  474

Query  782   TTAAATTATATCGCTAAAATAAGACCGGAGGCTGAAAAGTATGGAATCTGTCGCATTGTT  841
             || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  475   TTGAATTATATAGCTAAAATAAGACCGGAGGCTGAAAAGTATGGAATCTGTCGCATTGTT  534

Query  842   CCTCCTCCTTCCTGGAAACCGCCGTGCCCACTGAAAGAAAAGCAAGTATGGGAGGGTTCT  901
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  535   CCTCCTCCTTCCTGGAAACCGCCGTGCCCACTGAAAGAAAAGCAATTATGGGAGGGTTCT  594

Query  902   AAATTTACAACACGTGTCCAAAGAGTTGATAAACTTCAGAATCGGAGTTCAATGAAGAAG  961
             |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  595   AAATTTACGACGCGTGTCCAAAGAGTTGATAAACTTCAGAATCGTAGTTCAATGAAGAAG  654

Query  962   ATTTCAAAGCTTCCTAATCAAATGAGAAAGAAGAAAAGAAAGTGCATGAAAATGGGAATG  1021
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655   ATTTCAAAGCTTTCTAATCAAATGAGAAAGAAGAAAAGAAAGTGCATGAAAATGGGAATG  714

Query  1022  GATTCTGTCACTAATGGTATGGGCGATCCCTGTTCTGCAAGCACTGGAATGAATGAACTT  1081
             |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct  715   GATTCTGTCACTAATGGCGTGAGCGATCCCTGTTCTGTAAGCACTGGAATGAGTGAACTT  774

Query  1082  GAGACGTTTGGGTTTGAACCTGGTCCAGGGTTCACACTAAAAGACTTCCAAAAATATGCT  1141
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775   GAGACGTTTGGGTTTGAACCTGGTCCAGGGTTTACACTAAAAGACTTCCAAAAATATGCT  834

Query  1142  GATGAGTTCAAGGCTCAGTACTTTAAAAAGAGTGAAACTTCTACAGACGATAAATGTAAA  1201
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  835   GATGAGTTCAAGGCTCAGTACTTTAAAAAGAGTGAAACTTCTACAGACGATAAATGTAAA  894

Query  1202  GTTGATAATTCAATAGACTGCTGGGAGCCAGCACTTGAGGATGTTGAAGGTGAATATTGG  1261
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895   GTTGATAATTCAATAGACTGCTGGGAGCCAGCACTTGAGGATGTTGAAGGTGAATATTGG  954

Query  1262  CGGATAGTAGATAAAGCAACTGAAGAGATAGAGGTGCTATATGGTGCTGACCTTGAAACT  1321
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  955   CGTATAGTAGATAAAGCAACTGAAGAGATAGAGGTGCTTTATGGTGCTGATCTTGAAACT  1014

Query  1322  GGGGTATTTGGTAGCGGATTCCCCAAGATATCATCAAGTCACAATGCTTCTTCTTCAGAA  1381
             || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1015  GGTGTATTTGGTAGCGGATTCCCCAAGACATCATCAAGTCACAATGCTTCTTCTTCCGAA  1074

Query  1382  GATAAATATGCAAAATCAGGCTGGAACTTAAATAACTTTCCAAGGCTTCCGGGATCCCTC  1441
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1075  GAAAAATATGCAAAATCAGGCTGGAACTTAAATAACTTTCCAAGGCTTCCGGGATCCCTC  1134

Query  1442  CTTAAGTACGAGGGCAGTGATATTTCCGGTGTCCTTGTGCCGTGGCTGTATATTGGGATG  1501
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1135  CTTAAGTATGAGGGCAGTGATATTTCCGGTGTCCTTGTGCCATGGCTGTATATTGGGATG  1194

Query  1502  TGCTTTTCTTCTTTCTGCTGGCATGTTGAAGATCACCACTTGTATTCGTTGAATTATATG  1561
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1195  TGCTTTTCTTCTTTCTGTTGGCATGTTGAAGATCACCACTTGTATTCGTTGAATTATATG  1254

Query  1562  CACTGGGGTGCACCGAAATTGTGGTATGGTGTTGGGGGGAAGGATGCTGTTAAACTCGAG  1621
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1255  CACTGGGGTGCACCAAAATTGTGGTATGGTGTTGGGGGGAAGGATGCTGTTAAACTCGAG  1314

Query  1622  GAGGCAATGAGGAAGCATTTGCCTGACCTTTTTGAAGAACAGCCTGACTTACTTCATAAG  1681
             ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1315  GAGGCGATGAGAAAGCATTTGCCTGACCTTTTTGAAGAACAGCCTGACTTACTTCATAAG  1374

Query  1682  CTAGTTACACAACTCTCCCCGTCAAAACTGAAAACCGCAGGAGTACCTGTGCACCGTTGC  1741
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1375  CTAGTTACACAACTCTCCCCGTCAAAACTGAAAACCGCAGGAGTACCTGTGCACCGTTGC  1434

Query  1742  GTCCAGCATGCTGGAGAGTTTGTCTTGACTTTTCCTCGGGCATATCATGCTGGATTTAAT  1801
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1435  GTCCAGCATGCTGGAGAGTTTGTCTTGACTTTTCCTCGGGCATATCATGCTGGATTTAAT  1494

Query  1802  TCTGGTTTCAACTGTGCTGAAGCTGTGAATGTAGCACCCGTTGACTGGTTACCTCATGGG  1861
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  1495  TCTGGTTTCAATTGTGCTGAAGCTGTGAATGTAGCACCAGTTGACTGGTTGCCTCATGGG  1554

Query  1862  CAGATTGCCATAGAGTTATACTGTCAACAGGGTAGAAAAACGTCCATCTCGCATGATAAA  1921
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1555  CAGATTGCCATAGAGTTATACTGTCAACAGGGTAGAAAAACGTCCATCTCGCATGATAAA  1614

Query  1922  TTGTTGCTTGGGGCAGCAAGGGAAGTAGTGAAAGCCGACTGGGAGCTGAACTTACTAAGG  1981
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1615  TTGTTGCTTGGGGCAGCAAGAGAAGTAGTGAAAGCCGACTGGGAGCTGAACTTACTAAAG  1674

Query  1982  AAAAATACTGTAGATAACTTAAGGTGGAAAGCATTCAGTGCGAA-GGATGGAATTTTGGC  2040
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct  1675  AAAGATACTGTAGATAACTTAAGGTGGAAAGCATTCAGTG-GAAAGGATGGAATTTTGGC  1733

Query  2041  AAAAACATTAAAGGCACGCATTGACATGGAACGTACGAGAAGAGAATTTCTGTGCAACTC  2100
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1734  AAAAACACTAAAGGCACGCATTGACATGGAACGTACAAGAAGAGAATTTCTGTGCAACTC  1793

Query  2101  TTCACTTGCATTGAAA-ATGCACAGTAATTTCGATGCTACCAACGAGAGAGAGTGCTGTA  2159
             |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1794  TTCACTTGCATT-AAAGATGCACAGTAATTTCGATGCTACCAACGAGAGAGAGTGCTGTA  1852

Query  2160  TATGCTTCTTTGATTTGCACCTGTCTGCTGCTGGCTGTCGTTGTTCCCCGGAGAAGTATT  2219
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1853  TATGCTTCTTTGATTTGCACCTGTCTGCTGCTGGTTGCCGTTGTTCCCCAGAGAAGTATT  1912

Query  2220  CATGTTTGACTCATGTGAAGGAGTTGTGTTCATGTCCATGGGTTACTAAATATTTTCTAT  2279
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1913  CATGTTTGACTCATGTGAAGCAGTTGTGTTCATGTCCATGGGTTACTAAATATTTTCTAT  1972

Query  2280  TTCGCTATGATATCGATGAACTGAATGTTCTTGTTGAGGCAGTGGAAGGAAAACTGAGTT  2339
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1973  TTCGCTATGATATCGATGAACTGAATGTTCTTGTTGAGGCAGTGGCAGGAAAACTGAGTT  2032

Query  2340  CTGTATATAGATGGGCGCGTCAAGATTTAGGATTGGCATTAAGTACAGACGTCTCAGGAA  2399
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||
Sbjct  2033  CTGTATATAGATGGGCGCGTCAAGATTTAGGATTGGCATTAAGTGCACAGGTCTCAGGAA  2092

Query  2400  GCAAGATGGAGATAGATGAAGAAGGAAAAGTCCACAAGGACCCGACTCCACAAACAACTG  2459
             ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||  | |||
Sbjct  2093  GCAAGATGGAGATAGATGAGGAAGAAAAAGTCCACAAGGACCTGAGTCCACAAGTAGCTG  2152

Query  2460  CACTTTCAGGGAAGGATTTGCAGTTGAAAGTAACATCGAAAGAAG-T--AAGTAAAGAGT  2516
             ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||
Sbjct  2153  CACTTTCAGGGAAAGATTTGCAGTTGAAAATAACATCGAGAGAAGATCTAAGTAAAGAGT  2212

Query  2517  TAGAAAAGACTAGTAAATTATCTCATGTTAATTTACTTCTGAAAGAAAAGGAGGAGCAAA  2576
             ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| 
Sbjct  2213  TAGAAAAGACTAGTAAATTATCAGATATTAATTTACTTCTGAAAGACAAGGAGGAGCAAT  2272

Query  2577  TAACGTCAAGTCACTGTATGAAGCCTGTCAAAGAAGAAACTGTTTGTGATTCTTCTGATC  2636
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2273  TAACGTCAAGTCACTGTATGAAGCCTGTCAAAGAAGAAACTGTTTATGATTCTTCTGATC  2332

Query  2637  CAAACGTTTCAGCTTGCCAACCATCTGAAGGAGGCATAATCTGTATGACAGCTGTTAAGT  2696
             |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||
Sbjct  2333  CAAACGTTTCAGGTTGCCAACCATCTGAAGAAGGCATAATCTCTGTGACAGCTGCTAAGT  2392

Query  2697  CCGCAAGTGGTAAAAAGAATTCACAGAGTCTACCCAATGATGTGATACTCCTCAGCGATG  2756
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2393  CTGCAAGTGGTAAAAAGAATTCACAGAGTCTACCCAATGATGTGATACTCCTCAGTGATG  2452

Query  2757  ATGAGTATGACATACCTAGGAAACGAGGTTCTGTGAGAAGAGATGCAATTTCTTCTGGCA  2816
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2453  ATGAGCATGACATACCTAGGAAACGAGGTTCTGTGAGAAGAGATGCAATTTCTTCTGGCA  2512

Query  2817  AGAAATTAGAAATACGAGAGAGACCGACCCACGTTTTGGCGTTAGAAGCTTCTGCCAAAA  2876
             || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||
Sbjct  2513  AGCAATTAGAAGTACGAGACAGACCAACCCACGTTTTAGCGTTAGAAGCTTCTGTTAAAA  2572

Query  2877  TTGCTGCTCCAATTTGCCAAAGGGAAGGAGATTCGCTGCGTGATACACGAAACACTATAT  2936
             |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2573  TTGCTGCTCCAATTTGTCATAGGAAAGGAGATTCACTGCGTGATACACGAACCACTATAT  2632

Query  2937  CATTGCCTACTAATGACCAAA-AAACAATGAGAAGGGATGTACCGAGTTCTACTTCGCAC  2995
             ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2633  CATTGCCTACTAATGACCAAAGAAA-AATGAGTAGGGATGTACCGAGTTCTACATCGCAC  2691

Query  2996  GCGGAAGTTAATGCGGAGGCTACTGGGCTTACTCAAGATATATGTAACAGAATGG-CAAC  3054
             ||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |
Sbjct  2692  GCGGAAGTTAAGGCTGAGGCTGCTGGGCTTGCTCAGGATATATGTAATAGAATGGACA-C  2750

Query  3055  TAACAGCCACGGTGGTGGAAAACCTACTAGTTGTAAATCCAAAAACTCTGGAGGTTTGGC  3114
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2751  TAACAGCCACGGTGGTGGAAAACCTACTAGTTGTAAATCCAAAAACTCTGGAGGTGTGGC  2810

Query  3115  TATAGTGGATGTTGTGGATGGGACAAGAAGTAGTTCAGGTACACCGTCTTGTTCGCAAAA  3174
             ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2811  TATAGTGGATGTTGTTGATGGGACAAGAAGTAATTCAGGTACACCGTCTTGCTCGCAAAA  2870

Query  3175  TAATAGTCCGGATAGGTTCATCCGCCAAAAGGGTCCCCGCATTGCAAAGGTCGTGAGGAG  3234
             ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2871  TAATAGTCCTGATAAGTTCATCCGCCAAAAGGGTCCCCGTATTGCAAAGGTCGTGAGGAG  2930

Query  3235  AATCAATTGCAATGTAGAGCCTTTAAGTTATGGATGTGTGCTGTCTGGAAAATCATGGTG  3294
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2931  AATCAATTGCAATGTAGAGCCTTTAAGTTATGGATGTGTGCTTTCTGGAAAATCATGGTG  2990

Query  3295  CAGCCGGCGAGCAATTTTTCCTAAAGGATTTCGTAGCCGGGTTAAGTACATAAACATTTT  3354
             || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct  2991  CAACCGGCGAGCAATATTTCCTAAAGGATTTCGTAGCCGGGTTAGGTACATGAACATTTT  3050

Query  3355  GGATCCAACAAATATGTGCTTCTACATTTCAGAAATTCTGGATGCTGGACGCAACAGTCC  3414
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3051  GGATCCAACAAATATGTGCTTCTACATTTCAGAAATTCTGGATGCTGGACGCAACAGTCC  3110

Query  3415  ATTGTTCATGGTTTACTTGGAGAGTAATCCCAGTGAGGTGTTCGTTCATATGTCGCCTAC  3474
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||
Sbjct  3111  ATTGTTCATGGTTTACTTGGAGAGTAATCCCGGTGAGGTTTTCGTTCATTTGTCACCTAC  3170

Query  3475  AAGATGCTGGGAGATGGTAAGAGAGAGAGTAAATCAAGAGATAACTAAGCAGCACAAAGC  3534
             |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3171  AAGATGCTGGGAGATGGTAAAAGATAGAGTAAATCAAGAGATAAGTAAGCAGCACAAAGC  3230

Query  3535  TGGAAAATCAGATCTTCCTCCTTTGCAACCCTCTGGGAGTCCCGACGGTTTTGAAATGTT  3594
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3231  TGGAAAATCAGATCTTCCTCCTTTGCAACCCTCTGGGAGTCCTGACGGTTTTGAAATGTT  3290

Query  3595  TGGATATTCGTCACCCGCAATCGTACAGGCTATCGAAGCATTAGACGTGAATCGAGTTTG  3654
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3291  TGGATATTCGTCACCCGCAATCGTTCAGGCTATCGAAGCATTAGACGTGAATCGAGTTTG  3350

Query  3655  CACAGACTATTGGGATTCCAGGCCTTATTCCCGGCCACAAGTTCAGTTCCCTGCAAATCC  3714
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3351  CACAGACTATTGGGATTCCAGGCCTTATTCACGGCCACAAGTTCAGTTCCCTGCAAATCC  3410

Query  3715  TCTTCTCAGAGAAGCCAACACAAGTGGCAGATCGAATGTGGGAAATCTCCAGCTAAACCC  3774
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct  3411  TCTTCTCAGAGAAGCCAACACAAGTGTCAGATCGGATGTGGCAAAACTCCAGCTAAATCC  3470

Query  3775  TGGACACCATAT-ATCGCCTACTGGAATAAATTCTATTCTTAAAGTTCTGTTCAAGAAAG  3833
             |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3471  TGGACACCAT-TCATTGCCTACTGGAATAAACTCTATTCTCAAAGTTCTGTTCAAGAAAG  3529

Query  3834  CTAGCATGGAGGAACTAAGCTCACTTCAAGAGGTTTTAAGTGAGACTAACTCAGATATGG  3893
             ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct  3530  CTAACCTGGAGGAACTAAGCTCACTTCAACAGGTTTTAAGTGAGACTAACTCAAATTTGG  3589

Query  3894  TGACCGAACTTGTGAAGGAAGAGATCCAGAACCGTCGCTGA  3934
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3590  TGACCGAAATTGTGAAGGAAGAGATCCAGAACCGTCGCTGA  3630



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 162163318553


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5