BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G09620.1
Length=3720
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg471060 jgi|Araly1|471060|fgenesh2_kg.1__1014__AT1G09620.1 5694 0.0
Ahg314419 jgi|Araly1|314419|fgenesh1_pm.C_scaffold_1003199 3445 0.0
Ahg342141 jgi|Araly1|342141|fgenesh1_pg.C_scaffold_3001904 346 7e-94
> Ahg471060 jgi|Araly1|471060|fgenesh2_kg.1__1014__AT1G09620.1
Length=3685
Score = 5694 bits (3083), Expect = 0.0
Identities = 3507/3708 (95%), Gaps = 43/3708 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGAAGGTAGTCTTAAAGAAAAACCCTAG-AAACCATTACTTATCTCTC-CCACTGGCT 58
||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||||||
Sbjct 1 GAAGAAGTTAATCTTAAAGAAAAACCCTAGAAAATCATTCCTTATCTCTCTCAACTGGCT 60
Query 59 CTGTCTCTGTCAAATCTCGGATCGATTTCGCGGTGGGCTCGATTCGTGATTCCTCAAAGT 118
||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTGTCTCCGTCAAATCTCGGATTGTTTTCGCGGTGGGCTCGATTCGTGATTCCTCAAAGT 120
Query 119 TCATCATCCCTAAGGCACTGTCACTTAATGGCATCGGAATCGAAAAGCTACGCTAGGAGA 178
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||
Sbjct 121 TCATCATCCCTAAGGCATTGTCACTTAATGGCATCTGATTCGAAAAGCTTCGCGAGGAGA 180
Query 179 GATCGTCTTCTTGAGATTGAGGCCA-CTGTTCGAAAGTGGTGGGAAGACGAGGATGTATT 237
|||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 181 GATCGTCTTCTTGAGATTGAGG-TAGCGGTTCGCAAGTGGTGGGAAGATGAGGAAGTATT 239
Query 238 C-AGAGCCGAATCTTGTGAGAATCTTCCAAAACCAGGAGAAAAGTTTTTCTCAACCTTCC 296
| || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 240 CAAG-GCTGAATCTCGTGAGAATCTTCCAAAACCTGGAGAAAAGTTCTTCTCAACCTTCC 298
Query 297 CTTTCCCGTATATGAATGGTTATCTACACATTGGGCATGCCTTTTCATTGTCCAAGGTTG 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 CTTTCCCGTATATGAATGGTTATCTACACATTGGGCATGCCTTTTCATTGTCCAAGGTTG 358
Query 357 ATTTTGCTTCTGCTTACCATAGGCTAAGAGGAGCTAATGTGCTTCTTCCATTTGGTTTCC 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 359 ATTTTGCTTCTGCTTACCATAGGCTAAGAGGAGCTAATGTGCTTCTTCCCTTTGGTTTCC 418
Query 417 ATTGTACTGGTATGCCAATTAAGGCTTCTGCGGATAAGC-TTCGTCGTGAGATTGAACAG 475
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||
Sbjct 419 ATTGTACTGGTATGCCTATTAAGGCATCTGCGGATAAGCTTTC-TCGTGAGATTCAACAG 477
Query 476 TTTGGTAACCCTCCTGTGTTTACTGCTGAAGACACCACCAAAGTTCCTGAAGTTCAGGAG 535
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 TTTGGTAACCCTCCTGTGTTCACTGCTGAAGACAACACCAAAGTTCCTGAAGTTCAGGAG 537
Query 536 GAGAGCAGTGATACTATAGCTTTACCGATTCCGGGTCAGTTCAAGGGAAAGAAGTCTAAG 595
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 GAGAGCAGTGATACTATAGCTTTACC---T---GGTCAGTTCAAGGGAAAGAAGTCTAAG 591
Query 596 GTTGCTGCCAAAGCTGGTGGACAGGTTTATCAGTGGGAGATTATGCGCAGTTTTGGTCTT 655
|| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GTGGCTGCGAAATCTGGTGGACAGGTTTATCAGTGGGAGATTATGCGCAGTTTTGGTCTT 651
Query 656 ACTGACAGTGAGATTGCAAATTTCCGAGAGCCTTCTGAATGGTTGTATTACTTTCCCCCT 715
|||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 ACTGACAGTGAGATTGCAAAGTTCCAAGATCCTTATGAATGGTTGTATTACTTTCCCCCT 711
Query 716 TTGGCTGTTGAAGATCTAAGGGCATATGGATTGGGTTGTGATTGGAGACGCTCGTTTGTG 775
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 712 TTGGCTGTTGAAGATCTCAGGGCATATGGATTGGGTTGTGATTGGAGACGCTCCTTTGTG 771
Query 776 ACCACTGATGTTAATCCCTTTTTCGATGCCTTTGTGAGGTGGCAGATGAGGAAGTTGAAA 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 ACCACTGATGTTAATCCCTTTTTCGATGCCTTTGTGAGGTGGCAGATGAGGAAGTTGAAA 831
Query 836 TCTATGGGAAAGATTGTTAAAGACCGCAGGTACACTATATTCTCACCTTTAGATGGCCAG 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 832 TCTATGGGAAAGATTGTTAAAGACCGCAGGTACACAATATTCTCACCGTTAGATGGCCAG 891
Query 896 CCTTGTGCTGATCACGACCGTGCTACTGGGGAAGGTGTTCAGCCTCAAGAGTATACACTC 955
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 892 CCTTGTGCTGATCACGACCGTGCTACTGGCGAAGGTGTTCAGCCTCAAGAGTACACACTC 951
Query 956 ATAAAGATGGAAGTAGTCAAGCCATTCCCTCTGAAACTGGGTCCTTTGGAAGGCAAGAGA 1015
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 952 ATTAAGATGGAAGTAGTCAAGCCATTTCCTCTGAAACTGGGTCCTTTGGAAGGTAAGAGA 1011
Query 1016 GTGTTTTTGGCTGCAGCTACTTTGAGGCCTGAGACCATGTATGGACAAACAAACGCATGG 1075
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 GTTTTTTTGGCTGCAGCTACTTTGAGACCTGAGACCATGTATGGACAAACAAACGCATGG 1071
Query 1076 GTACTACCTGATGGGAAATATGGAGCTTATGAAATCAGCGAAACTGAGGTCTTCATCCTT 1135
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1072 GTACTACCTGATGGGAAATATGGGGCTTATGAAATCAGTGAAACTGATGTCTTCATCCTT 1131
Query 1136 ACTGAGAGAGCTGCGCTCAACCTTGCGTACCAGAACTTTTCGAAGAACCCTCAGGAGCCT 1195
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||
Sbjct 1132 ACTGAGAGAGCTGCACTCAACCTTGCGTACCAGAACTTCTCAAAGATCCCTCAGAAGCCT 1191
Query 1196 TCCTGCTTGGTTGAGTTGACCGGGTATGATCTGATTGGACTCCCTTTGAGGTCTCCTCTG 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 TCCTGCTTGGTTGAGTTGACCGGGTATGATCTGATTGGACTCCCTTTGAGGTCTCCTCTG 1251
Query 1256 TCAGTCAACGAGATCATCTATGCTCTGCCCATGTTGACCATTCTGACCAACAAAGGTACT 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 TCAGTCAACGAGATCATCTATGCTCTGCCCATGTTGACCATTCTGACCAACAAAGGTACT 1311
Query 1316 GGCATTGTCACCAGTGTGCCTAGTGATGCTCCTGATGATTACATGGCTTTACAAGATTTA 1375
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 GGCATTGTCACCAGTGTGCCGAGTGATGCTCCTGATGATTACATGGCTTTACAAGATTTA 1371
Query 1376 ATCAAAAAGCCTGCTCTTCAAGATAAGTATGGTGTGAAAACGGAATGGTTGCCCACTGAA 1435
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1372 ATCAAAAAGCCTGCTCTTCAAGATAAGTATGGTGTGAAAACGGAATGGGTGCCCACTGAA 1431
Query 1436 ATCATACCGATCATCAACATTCCGGAATTTGGGGATAAAGCTGCTGAAAAGGTCTGCTTG 1495
||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1432 ATCATTCCGATTATCAACATCCCGGAATTTGGGGATAAGGCTGCTGAAAAGGTCTGCTTG 1491
Query 1496 GATCTGAAAATTAAAAGCCAAAACGATAAGGAAAAGCTTGCAGAGGCTAAGAGGTTGACT 1555
||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 GATCTGAAAATTAAAAGTCAAAATGATAAGGACAAGCTTGCAGAGGCTAAGAGGTTGACT 1551
Query 1556 TACCTGAAAGGATTTACCGAAGGAACCATGCTTATTGGAGAGTTTTTTGGTAGGAAAGTT 1615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1552 TACCTGAAAGGATTTACCGAAGGAACCATGCTTATTGGAGAGTTTGTTGGTAGGAAAGTT 1611
Query 1616 CAAGAAATTAAGCCCATTATCAAGACAAAGCTCATAGAGACTGGCGAGGCAATCATATAC 1675
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 CAAGAAATCAAGCCCATTATTAAGACAAAGCTCATAGAGACTGGCGAGGCAATCATATAC 1671
Query 1676 AGTGAACCCGAGAAGCCGGTGATGTCAAGATCGGGTGATGAATGTGTTGTGGCTCTTACA 1735
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 AGTGAACCTGAGAAGCCGGTGATGTCAAGATCGGGTGATGAATGTGTTGTGGCTCTTACA 1731
Query 1736 GATCAGTGGTACATAACATACGGCGAATCAGAATGGCGGAAAATTGCTGAGGAATGCCTA 1795
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 1732 GATCAGTGGTACATAACGTACGGCGAATCAGAATGGAGGAAAATGGCTGAGGAATGCTTA 1791
Query 1796 TCAAAGATGAATCTCTACTCTGATGAAACAAGGCATGGCTTTGAGCACACTTTGAGCTGG 1855
||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 TCAAAAATGAATCTCTATTCTGAAGAAACAAGGCATGGCTTTGAGCACACTTTGAGCTGG 1851
Query 1856 CTCAATCAGTGGGCTTGCTCACGATCTTTTGGTTTAGGAACTCGTATTCCCTGGGATGAA 1915
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 CTCAATCAGTGGGCTTGCTCACGGTCTTTTGGTCTAGGAACTCGTATTCCCTGGGATGAA 1911
Query 1916 CAGTTCCTAGTGGAATCCTTATCTGATTCATCTCTTTATATGGCCTATTACACAGTTGCC 1975
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 CAGTTCCTTGTGGAATCCTTATCTGATTCATCTCTTTATATGGCCTATTACACAGTTGCC 1971
Query 1976 CATATCTTTCACGATGGAGACATGTATAAAGGTAGCAAGTCTCTGATCCGCCCTCAGCAG 2035
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1972 CATATCTTTCACGATGGAGACATGTATAAAGGTAGCAAGTCTTTGATCCGCCCTCAGCAG 2031
Query 2036 ATGAATGATGAAGTTTGGGAGTATCTCTTCTGTGATGGCCCGTACCCTAAATCATCTGAT 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2032 ATGAATGATGAAGTTTGGGAGTATCTCTTCTGTGATGGCCCGTACCCAAAATCATCTGAT 2091
Query 2096 ATTCCATCAGCTGTCTTAAGTGAGATGAAGCAGGAATTTGACTACTGGTACCCGCTAGAT 2155
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2092 ATTCCATCAGCTGTCTTAAGCAAGATGAAGCAGGAATTTGATTACTGGTACCCGCTAGAT 2151
Query 2156 CTTCGAGTTTCAGGAAAGGATCTTATTCAGAATCATTTGACATTTTTCATCTACAACCAC 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 CTTCGAGTTTCAGGAAAGGATCTTATTCAGAATCATTTGACATTTTTCATCTACAACCAC 2211
Query 2216 ACTGCACTAATGGCGAATCGTAACTGGCCACGTGGGATCAGATGTAATGGTCATATCATG 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2212 ACTGCACTAATGGCGAATCGTAACTGGCCACGTGGCATCAGATGTAATGGTCACATAATG 2271
Query 2276 CTGAATTCTGAAAAGATGTCAAAGTCTACTGGAAATTTCAGAACCCTGCGCCAGTCTATT 2335
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2272 CTGAATTCTGAAAAGATGTCAAAGTCAACCGGAAATTTCAGAACCTTGCGCCAGGCTATT 2331
Query 2336 GAAGAATTCTCTGCCACTGGTACAAGGTTTTGTTTGGCTGATGCTGGTGATGGTGTTGAT 2395
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 GAAGAATTCTCTGCCACTGCTACAAGGTTTTCTTTGGCTGATGCTGGTGATGGTGTTGAC 2391
Query 2396 GATGCAAATTTTGCATTTGAAACTGCAAATGCTGCAATTTTGCGGTTGACAAAAGAGCTC 2455
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2392 GATGCTAATTTTGTATTTGAAACTGCAAATGCTGCAATTTTGCGGCTGACAAAAGAGCTC 2451
Query 2456 ACATGGATGGAAGAAGTTCTGGATG-TCGAATCCTCTTTAAGAACGGGACCTCCATCTAC 2514
|||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2452 ACATGGATGGAAGAAGTTCTGGCTGCT-GAATCCTCTTTAAGAACTGGCCCTCCATCTAC 2510
Query 2515 ATATGCTGATAAAGTGTTTGAAAATGACATGAACATTGCTCTCAGATTGACTGAAAGAGC 2574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2511 ATATGCTGATAAAGTGTTTGAAAATGACATGAACATTGCTATCAGATTGACTGAAAGAGC 2570
Query 2575 GTACAAAGATTGTCTGTTTAGGGAGGCACTTAAAAATGGGTTTTACGACTTACAAGCTGC 2634
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 GTACAAAGATTGTTTGTTTAGGGAGGCACTTAAAAATGGGTTTTACGACTTACAAGCTGC 2630
Query 2635 TCGGGATGAGTATAGACTCTCTTGTGGAACTGGAGGCATGCACCATGACTTGCTACTGAA 2694
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2631 TCGGGATGAGTATAGACTCTCTTGTGGAACTGGAGGCATGAACCATGACTTGATACTGAC 2690
Query 2695 ATTTATGGATGTGCAAACACGCCTCATTGTACCAATCTGTCCCCATTTTGCAGATTATGT 2754
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2691 ATTTATGGATGTGCAAACACGCCTCATTGAACCAATCTGTCCCCAGTTTGCAGAATATGT 2750
Query 2755 TTGGAGGAAAGTTTTGAATAAGGAAGGTTGTGT-GCTCACAGCAGGCTGGCCACCATCAA 2813
|||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2751 TTGGAGGAAACTTTTGAAGAAGGAAGGTTGTGTAG-TAACAGCAGGCTGGCCACCATCAA 2809
Query 2814 ATGAGCCAGATTTGGTGCTCAAGAGTGCAAACAAATATTTGCAAGATTCTATTGTGTTAA 2873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2810 ATGAGCCAGATTTGGTGCTCAAGAGTGCAAACAAATATTTGCAAGATTCTATTGTTTTAA 2869
Query 2874 TGAGAAAGCTTCTTCAAAAACAACTCTCAGGTTCCAAGAAGGGTGCTAAGAAAGGTGCTC 2933
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2870 TGAGAAAGCTTCTACAAAAACAACTCTTAGGTTCCAAGAAGGCTGCTAAGAAAGGTGCTC 2929
Query 2934 AAGTAACAGCTGTGCCAGAGGGGAAGCTAAAAGGCCTAGTATATGTGAATGAGCAATTTG 2993
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 AAGTAACAGCTGTGCCAGAGGAGAATTTAAAAGGCCTAGTATATGTGAATGAGCAATTTG 2989
Query 2994 ATGGATGGAGAGCTCACTGCCTGCGGATTCTGCAAAGTAGATTTGACCAGCAAACCTGTA 3053
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 ATGGATGGAGAGCTCACTGCCTGAGGATTCTGCAAAGTAGATTTGACCAGCAAACCTGTC 3049
Query 3054 GTTTCCCCCCGGATACAGAGATGCTTGCAGAACTAA-GTGCA-ACATTGTTGCAGGAGGG 3111
|||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| | | | | |||| |||||||||
Sbjct 3050 GTTTTGACCCGGATGCAGTGATACTTGCAGAACTAAAG-G-AGATATTGCAGCAGGAGGG 3107
Query 3112 A-A-A-A-AA--CTTGAAAGCCA-TTCAAAAGGTTTGCATGCCTTTCCTTAAATTCAAGA 3164
| | | | || ||| ||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 ACATACAGAAAACTTCAAA-CAAATTCAGAAGGTTTGCATGCCTTTCCTTAAATTCAAGA 3166
Query 3165 AGGACGAGGCAATATCTATTGGCACTCAGGCTCTGAACTTGAGGTTACCTTTTGGAGAGA 3224
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3167 AGGACGAGGCAATAGCTATTGGCACTCAGGCTCTAAATTTGAGGTTGCCTTTTGGAGAGA 3226
Query 3225 TCGAAGTCCTTCAGAGTAACAAGGACTTGATCAGGCGGCAACTTGGTCTTGAAGAGGTTG 3284
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 TCGAAGTCCTTCAGAGTAACATGGACTTGATCAGGCGGCAACTTGGTCTTGAAGAGGTTG 3286
Query 3285 AAATATATTCTGCAAGTGACCCTGATGATGTTTCAATAGCTGGTCCACATGCTTCGCTGC 3344
||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 3287 AAATATATTCTGCAAGTAACCCTGATGATGTTTTAAAAGCTGGTCCACTTGCTTCACTGC 3346
Query 3345 TG-ACGCAGAATCCTCCATCTCCAGGCAGCCCAACTGCCATCTTTGTGACCAGCACAAGT 3403
|| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3347 TGCA-GCAGAATCCTCCATCTCCTGGCAGCCCAACCGCCATCTTTGTGACCAGCACAAGT 3405
Query 3404 GTCTGCCCTCCATCCTAAAAGCGTTGTTCAAAAGAAAAGCGTGGGACAAGTTTCAACTAC 3463
|||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3406 GTCTGCCCTCCAGCCTAAAAGTGTTGTTCAAAGGAAAAGCGTGGGACAAGTTTCAACTAC 3465
Query 3464 TAGTCAAGAAGTTTGCAGGattttt-ggtattttatacaagttggactatttt-gacttc 3521
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||
Sbjct 3466 TAGTCAAGAAGTTTGCAGGATTTTTTGGTATTTTATACAAGTTAGACTTTTTTTG-CTTC 3524
Query 3522 tttgctgagtttttctcttttatttCTGGTATTGTGTAGTAAT-ATCATCTGTTCTCTCT 3580
||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 3525 TTTGCTGAGTTTTCCCCTTTTATTCCTGGTATTGTGTAGTAAAGATCATCTGTTCTTTCT 3584
Query 3581 TATTGATTCAACAATATCCTTGTTTCAACTTTCAAGTTTGCTTATATGTTCTGCTCTTTT 3640
||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||
Sbjct 3585 TATCGATACAACAATATCCTTGTTTCAA-------GTTTGCTTATTTGTTCTACTATTTT 3637
Query 3641 CTCCTGATCAGCTTTCTAGATTTCTTTACTGGGCTGAAACAAAGTTAA 3688
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3638 CTCCTGATCAGCTTTCTAGATTTATTTACTGGGCTGAAACAAAGTTAA 3685
> Ahg314419 jgi|Araly1|314419|fgenesh1_pm.C_scaffold_1003199
Length=3186
Score = 3445 bits (1865), Expect = 0.0
Identities = 2476/2766 (90%), Gaps = 61/2766 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 648 TTGGTCTTACTGACAGTGAGATTGCAA-ATTTCCGAGAGCCTTCTGAATGGTTGTATTAC 706
||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || | ||||||||||||||||
Sbjct 461 TTGGTCTTACTGACAGTGAGATTGCAAGATTT-CAAGATCCATATGAATGGTTGTATTAC 519
Query 707 TTTCCCCCTTTGGCTGTTGAAGATCT-AAGGGCATATGGATTGGGTTGTGATTGGAGACG 765
||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 TTTCCTCCTTTAGCTGTTGAAGATCTCAA-GGCTTATGGATTGGGTTGTGATTGGAGACG 578
Query 766 CTCGTTTGTGACCACTGATGTTAATCCCTTTTTCGATGCCTTTGTGAGGTGGCAGATGAG 825
||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 579 CTCATTCGTGACTACTGATGTTAATCCCTTTTTCAATGCCTTTGTAAGGTGGCAGATGAG 638
Query 826 GAAGTTGAAATCTATGGGAAAGATTGTTAAAGACCGCAGGTACACTA-TATTCTCACCTT 884
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || | ||||||||||||
Sbjct 639 GAAGTTGAAATCTATGGGAAAGATTGTCAAAGACTGTAGGTATAC-AGTATTCTCACCTT 697
Query 885 TAGATGGCCAGCCTTGTGCTGATCACGACCGTGCTACTGGGGAAGGTGTTCAGCCTCAAG 944
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 698 TAGATGGTCAGCCTTGTGCTGATCACGACCGTGCTACTGGTGAAGGTGTTCAGCCTCAAG 757
Query 945 AGTATACACTCATAAAGATGGAAGTAGTCAAGCCATTCCCTCTGAAACTGGGTCCTTTGG 1004
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 758 AGTATACTCTCATAAAGATGGAAGTAGTGAAGCCATTTCCTCTGAAACTGGGTTCTTTGG 817
Query 1005 AAGGCAAGAGAGTGTTTTTGGCTGCAGCTACTTTGAGGCCTGAGACCATGTATGGACAAA 1064
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 AAGGAAAGAGAGTGTTTTTGGCTGCAGCTACGCTGAGGCCTGAGACCATGTATGGACAAA 877
Query 1065 CAAACGCATGGGTACTACCTGATGGGAAATATGGAGCTTATGAAATCAGCGAAACTGAGG 1124
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 878 CAAACGCTTGGGTACTACCTGATGGGAAATATGGAGCTTATGAAATCA--G----TGA-- 929
Query 1125 TCTTCATCCTTACTGAGAGAGCTGCGCTCAACCTTGCGTACCAGAACTTTTCGAAGAACC 1184
| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||
Sbjct 930 -----A-----ACTGATAGATCTGCACTCAACCTTGCCTACCAGAACTTCTCAAAGATCC 979
Query 1185 CTCAGGAGCCTTCCTGCTTGGTTGAGTTGACCGGGTATGATCTGATTGGACTCCCTTTGA 1244
||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 980 CTCAGAAGCCATCCTGCTTGGTCGAGTTGACCGGGTATGATCTGATTGGACTCCCTCTGA 1039
Query 1245 GGTCTCCTCTGTCAGTCAACGAGATCATCTATGCTCTGCCCATGTTGACCATTCTGACCA 1304
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1040 GGTCTCCTCTGTCAGTGAATGAGATCATCTATGCTCTGCCCATGTCAACGATTCTGACCA 1099
Query 1305 ACAAAGGTACTGGCATTGTCACCAGTGTGCCTAGTGATGCTCCTGATGATTACATGGCTT 1364
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1100 ACAAAGGTACCGGTATTGTCACCAGTGTGCCTAGTGATGCCCCTGATGATTACATGGCTT 1159
Query 1365 TACAAGATTTAATCAA-AAAGCCTGCTCTTCAAG-ATAAGTATGGTGTGAAA-ACGGAAT 1421
|||| || |||| || |||||||| | || || | ||||||||||||||| | || |
Sbjct 1160 TACATGAGTTAA-AAACAAAGCCTGATAGTCGAGCA-AAGTATGGTGTGAAAGA-TGAGT 1216
Query 1422 GGTTGCCCACTGAAATCATACCGATCATCAACATTCCGGAATTTGGGGATAAAGCTGCTG 1481
|| | ||| |||| ||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1217 GGGTACCCTCTGATATCGTACCGGTTATCAGCATTCCAGAATTTGGGGATAAGGCTGCAG 1276
Query 1482 AAAAGGTCTGCTTGGATCTGAAAATTAAAAG-CCAAAACGATAAGGAAAAGCTTGCAGAG 1540
||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||| |||
Sbjct 1277 AAAAGGTCTGCTTAGATCTGAAAATTCAAAGTCC-AAATGATAAGGACAAGCTTGTAGAA 1335
Query 1541 GCTAAGAGGTTGACTTACCTGAAAGGATTTACCGAAGGAACCATGCTTATTGGAGAGTTT 1600
|| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1336 GCGAAGAGGTTGATTTACCTGAAAGGATTCACTGAAGGAACAATGCTTGTTGGAGAGTTT 1395
Query 1601 TTTGGTAGGAAAGTTCAAGAAATTAAGCCCATTATCAAGACAAAGCTCATAGAGACTGGC 1660
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |
Sbjct 1396 GTTGGTAGGAAAGTTCAAGAAATCAAGCCCATTATCAAGAAAAAGCTCATAGAGTCTAAC 1455
Query 1661 GAGGCAATCATATACAGTGAACCCGAGAAGCCGGTGATGTCAAGATCGGGTGATGAATGT 1720
||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1456 GAGGCTATCATATACAGAGAACCTGAGAAGTCAGTGATGTCAAGATCCGGTGATGAATGT 1515
Query 1721 GTTGTGGCTCTTACAGATCAGTGGTACATAACATACGGCGAATCAGAATGGCGGAAAATT 1780
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1516 GTTGTGGCTCTTACAGATCAGTGGTACATAACGTACGGCGAAGCAGAATGGCGGAAAATG 1575
Query 1781 GCTGAGGAATGCCTATCAAAGATGAATCTCTACTCTGATGAAACAAGGCATGGCTTTGAG 1840
|||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1576 GCTGAGGAATGCTTATCAAAAATGAACCTCTACTCTGAAGAAACAAGGCATGGCTTTGAG 1635
Query 1841 CACACTTTGAGCTGGCTCAATCAGTGGGCTTGCTCACGATCTTTTGGTTTAGGAACTCGT 1900
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1636 CACACTTTAAGCTGGCTCAATCAGTGGGCTTGCTCACGGTCTTTTGGTCTAGGAACTCGT 1695
Query 1901 ATTCCCTGGGATGAACAGTTCCTAGTGGAATCCTTATCTGATTCATCTCTTTATATGGCC 1960
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1696 ATTCCTTGGGATGAACAGTTCCTTGTGGAATCCTTATCTGATTCATCACTTTATATGGCC 1755
Query 1961 TATTACACAGTTGCCCATATCTTTCACGATGGAGACATGTATAAAGGTAGCAAGTC-TCT 2019
|| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |
Sbjct 1756 TACTATACAGTTGCCCATATCTTTCACGACGGTGACATGTATAAAGGCAGCAAGTCGT-T 1814
Query 2020 GATCCGCCCTCAGCAGATGAATGATGAAGTTTGGGAGTATCTCTTCTGTGATGGCCCGTA 2079
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1815 GATCCGTCCTGAGCAGATGAATGATGAAGTTTGGGAGTATCTCTTCTGTGATGGTCCGTA 1874
Query 2080 CCCTAAATCATCTGATATTCCATCAGCTGTCTTAAGTGAGATGAAGCAGGAATTTGACTA 2139
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 TCCAAAATCATCTGATATTCCATCAGCTGTTTTAAGTAAGATGAAGCAGGAATTTGACTA 1934
Query 2140 CTGGTACCCGCTAGATCTTCGAGTTTCAGGAAAGGATCTTATTCAGAATCATTTGACATT 2199
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 CTGGTACCCGCTAGATCTTCGAGTTTCAGGGAAGGATCTTATTCAGAATCATTTGACATT 1994
Query 2200 TTTCATCTACAACCACACTGCACTAATGGCGAATCGTAACTGGCCACGTGGGATCAGATG 2259
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1995 TTTCATCTACAACCACACTGCACTAATGGAGAGTCGTAACTGGCCACGTGGTATCAGATG 2054
Query 2260 TAATGGTCATATCATGCTGAATTCTGA-AAAGATGTCAAAGTCTACTGGAAATTTCAGAA 2318
||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2055 TAATGGTCACATTATGCTCAATTCTGAGAAA-ATGTCAAAGTCCACTGGAAATTTCAGAA 2113
Query 2319 CCCTGCGCCAGTCTATTGAAGAATTCTCTGCCACTGGTACAAGGTTTTGTTTGGCTGATG 2378
||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2114 CCCTGCGCCAGGCTATCGAAGAGTTCTCTGCCACTGCTACAAGGTTTTCTTTGGCTGATG 2173
Query 2379 CTGGTGATGGTGTTGATGATGCAAATTTTGCATTTGAAACTGCAAATGCTGCAATTTTGC 2438
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 CTGGTGATGGTGTTGACGATGCAAATTTTGTATTTGAAACTGCAAATGCTGCAATTTTGC 2233
Query 2439 GGTTGACAAAAGAGCTCACATGGATGGAAGAAGTTCTGGATG-TCGAATCCTCTTTAAGA 2497
|| ||| | | || ||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||
Sbjct 2234 GGCTGATGACACAGTTCAAATGGATGGAAGATGTTCTGGCTGCT-GAATCCTCTTTGAGA 2292
Query 2498 ACGGGACCTCCATCTACATATGCTGATAAAGTGTTTGAAAATGACATGAACATTGCTCTC 2557
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2293 ACCGGACCTCCATCTACGTATGCTGATAAAGTGTTTGAGAATGACATGAAAATTGCTATC 2352
Query 2558 AGATTGACTGAAAGAGCGTACAAAGATTGTCTGTTTAGGGAGGCACTTAAAAATGGGTTT 2617
||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2353 AGATTGACTGAAAAAGCTTACAAAGATTGTTTGTTTAGGGAGGCACTTAAGAATGGGTTT 2412
Query 2618 TACGACTTACAAGCTGCTCGGGATGAGTATAGACTCTCTTGTGGAACTGGA-GGCA-T-- 2673
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | || | || | |
Sbjct 2413 TACGACTTACAAGCTGCTCGAGATGAGTATACACTCTCCTGTGGCAGTG-ACGGAAATAT 2471
Query 2674 GCACCATGACTTGCTACTGAAATTTATGGATGTGCAAACACGCCTCATTGTACCAATCTG 2733
| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2472 GAACCATGACTTGATACTGAACTTCATGGATGTGCAAACACGCCTCATTGAACCAATATG 2531
Query 2734 TCCCCATTTTGCAGATTATGTTTGGAGGAAAGTTTTGAATAAGGAAGGTTGTGTGCTCAC 2793
||| || |||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||
Sbjct 2532 TCCTCAGTTTGCAGAATATATATGGAGGAAACTTTTGAAGAAGGAAGGTTCTGTGGTAAC 2591
Query 2794 AGCAGGCTGGCC-ACCATCAAATGAGCCAGATTTGGTGCTCAAGAGTGCAAACAAATATT 2852
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2592 AGCAGGCTGGCCTAC-ATCAAATGAGCCAGATTTGGTTCTCAAGAGTGCTAACAAATATT 2650
Query 2853 TGCAAGATTCTATTGTGTTAATGAGAAAGCTTCTTCAAAAACAACTCTCAGGTTCCAAGA 2912
|||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2651 TGCAAGATTCTATTGTCCTAATGAGAAAGCTTCTACCAAAACAGCTCTTAGGTTCCAAGA 2710
Query 2913 AGGGTGCTAAGAAAGGTGCTCAAGTAACAGCTGTGCCAGAGGGGAAGCTAAAAGGCCTAG 2972
||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||
Sbjct 2711 AGGCTGCTAAGAAAGGTGCTCAAGTAGCAGCAGTGCCAGCGGGAAAATTAAAAGGCCTAG 2770
Query 2973 TATATGTGAATGAGCAATTTGATGGATGGAGAGCTCACTGCCTGCG-GATTCTGCAAAGT 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2771 TATATGTGAATGAGCAATTTGATGGATGGAGAGCTCACTGCCT-CGAGATTCTGCAAAGC 2829
Query 3032 AGATTTGACCAGCAAACCTGTAGTTTCCCCCCGGATACAGAGATGCTTGCAGAACTAAGT 3091
| |||| |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2830 AAATTTAACCAACAAACCTGTCGTTTTGCCCCTGATGCAGAGATACGGGCAGAACTAAGT 2889
Query 3092 GCA-ACATTGTTGCAGGAGGGAAAAAACTTGAAAGCCATTCAAAAGGTTTGCATGCCTTT 3150
| | | ||| | |||||||| || | || | |||| |||| |||||||||
Sbjct 2890 G-AGATATTACAGAAGGAGGGA-----CT--A--GC-AG--AAAACGTTTACATGCCTTT 2936
Query 3151 CCTTAAATTCAAGAAGGACGAGGCAATATCTATTGGCACTCAGGCTCTGAACTTGAGGTT 3210
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
Sbjct 2937 CGTTAAATTCAAGAAGAACGAGGCAATATCTATTGGCACTCAGGCTCTAAATTTGAGGCT 2996
Query 3211 ACCTTTTGGAGAGATCGAAGTCCTTCAGAGTAACAAGGACTTGATCAGGCGGCAACTTGG 3270
|||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2997 GCCTTTTGGAGAGATTGCAGTCCTTGAGAGTAATAAGGACTTGATCAAGCGGCAAGTTGG 3056
Query 3271 TCTTGAAGAGGTTGAAATATATTCTGCAAGTGACCCTGATGATGTTTCAATAGCTGGTCC 3330
|||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3057 TCTTGAAGAGGTTGAAGTATATTCTGCAAGTAAGCCTGATGATGTTTCAAAAGCTGGTCC 3116
Query 3331 ACATGCTTCGCTGCTGACGCAGAATCCTCCATCTCCAGGCAGCCCAACTGCCATCTTTGT 3390
||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3117 ACATGCTTCACTGCTGAAGAAGAATCCTCCATCTCCGGGCAATCCAACCGCCATCTTTGT 3176
Query 3391 GACCAG 3396
| ||||
Sbjct 3177 GGCCAG 3182
Score = 448 bits (242), Expect = 2e-124
Identities = 399/474 (84%), Gaps = 14/474 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 146 ATGGCATCGGAATCGAAAAGCTACGCTAGGAGAGATCGTCTTCTTGAGATTGAGGCCA-C 204
|||||||| ||||| || |||| | | ||||||||||| ||||| ||||||| | |
Sbjct 1 ATGGCATCTGAATCCAATAGCTTCAAGAAAAGAGATCGTCTACTTGAAATTGAGG-TAGC 59
Query 205 TGTTCGAAAGTGGTGGGAAGACGAGGATGTATTCAGAGCCGAATCTTGTGAGAATCTTCC 264
||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||
Sbjct 60 GGTTCGAAAGTGGTGGGAGGATGAGGATGTTTTCAGGGCTGAATCTCGTGATCATATTCC 119
Query 265 AAAACCAGGAGAAAAGTTTTTCTCAAC-CTTCCCTTTCCCGTATATGAATGGTTATCTAC 323
||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 120 AAAGCCAGGAGAAAAGTTCTTCTCCACTTTTCCTTTTCCC-TATATGAATGGTTATCTTC 178
Query 324 ACATTGGGCATGCCTTTTCATTGTCCAAGGTTGATTTTGCTTCTGCTTACCATAGGCTAA 383
|||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 179 ACATTGGGCATGCCTTCTCCCTCTCCAAGGTTGATTTTGCTTCTGCTTACCATAGACTTA 238
Query 384 GAGGAGCTAATGTGCTTCTTCCATTTGGTTTCCATTGTACTGGTATGCCAATTAAGGCTT 443
|||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 239 GAGGTGCCAATGTGCTTCTTCCTTTTGGTTTCCACTGTACTGGTATGCCGATTAAGGCTT 298
Query 444 CTGCGGATAAGCTT-CGTCGTGAGATTGAACAGTTTGGTAACCCTCCTGTGTTTACTGCT 502
| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 299 CCGCGGATAAGCTTTC-TCGTGAGATCCAACAGTTTGGAAACCCTCCTGTCTTCCCTGCT 357
Query 503 GAAGACACCACCAAAGTTCCTGAAGTTCAGGAGGAGAGCAGTGATACTATAGCTTTACCG 562
|||| | ||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| | | | |
Sbjct 358 CAAGATA--ACCAA-GCTCCTCAAGTTCAGGAGGAGAGTAGTGATAC-ACCGGTGG-CT- 411
Query 563 ATT-CCGGGTCAGTTCAAGGGAAAGAAGTCTAAGGTTGCTGCCAAAGCTGGTGG 615
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||
Sbjct 412 -TTACCGGGTCAGTTCAAGGGAAAGAAGTCTAAGGTGGCTGCAAAATCTGTTGG 464
> Ahg342141 jgi|Araly1|342141|fgenesh1_pg.C_scaffold_3001904
Length=1374
Score = 346 bits (187), Expect = 7e-94
Identities = 286/332 (86%), Gaps = 13/332 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 227 GAGGATGTATTCAGAGC-C-GAATCTTGTGAGAATCTTCCAAAACCAGGAGAAAAGTTTT 284
||||| ||||||| | | | |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |
Sbjct 3 GAGGAAGTATTCA-AACTCTGAATCTCGTGAGAATCTTCCTAAGCCAGAAGAAAAGTTCT 61
Query 285 TCTCAACCTTCCCTTTCCCGTATATGAATGGTTATCTACACATTGGGCATGCCTTTTCAT 344
|||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||
Sbjct 62 TCTCCACTTTTTCTTTCCCTTGTATGAATGGTTATCTACACACTGGCCATGCCTTCTCAC 121
Query 345 TGTCCAAGGTTGATTTTGCTTCTGCTTACCATAGGCTAAGAGGA-GCTAATGTGCTTCTT 403
| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||
Sbjct 122 TCTCTAAGGTTGATTTTGCTTCTGCTTACCATAGACTAAGA-GATGCCAATGTGCTTCTT 180
Query 404 CCATTTGGTTTCCATTGTACTGGTATGCCAATTAAGGCTTCTGCGGATAAGCTT-CGTCG 462
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 181 CCTTTTGGTTTCCACTGTACTGGTATGCCAATTAAGGCTTCTGCGGATAAGCTTTC-TCG 239
Query 463 TGAGATTGAACAGTTTGGTAACCCTCCTGTGTTTACTGCTGAAGAC-A--CCACCAA--A 517
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||| |
Sbjct 240 TGAGATTCAACAGTTTGGTAACCCTCCTGTGTTCACTGCTCAAGATGATACCATCAAGCA 299
Query 518 -GTTCCTGAAGTTCAGGAGGAGAGCAGTGATA 548
| ||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 300 AGCTCCTGAAACTCAGGAGGAGAGTTGTGATA 331
Score = 289 bits (156), Expect = 1e-76
Identities = 243/283 (86%), Gaps = 13/283 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 2993 GATGGATGGAGAGCTCACTGCCTGC-GGATTCTG-CAAAGTAGATTTGACCAGCAAACCT 3050
||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||
Sbjct 744 GATGGATGGAGAGCTCACTGCCT-CAAGATTCTGCCAAAGCAAATTTGTCCAACAAACCT 802
Query 3051 GTAGTTTCCCCCCGGATACAGAGATGCTTGCAGAACTAAGTGCA-ACATTGTTGCAGGAG 3109
|| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||| | | | |||| | |||||
Sbjct 803 GTCGTTTTGCCCCTGATGCAGAGATACTTGCAGAACGAAG-GGAGATATTGCAGAAGGAG 861
Query 3110 GG---A--A-AAAACTTGAAAGC-CATTCAAAAGGTTTGCATGCCTTTCCTTAAATTCAA 3162
|| | | ||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 862 GGACAATCAGAAAACTTTAAA-CAAATTCAGAAGCTTTGCATGCCTTTCCTTAAATTTAA 920
Query 3163 GAAGGACGAGGCAATATCTATTGGCACTCAGGCTCTGAACTTGAGGTTACCTTTTGGAGA 3222
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||
Sbjct 921 GAAGGACGAGGCAATATCTATTGGCCCTCAGGCTCTAAAGTTGAGGTTGCCTTTTGGAGA 980
Query 3223 GATCGAAGTCCTTCAGAGTAACAAGGACTTGATCAGGCGGCAA 3265
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 981 GATCGAAGTCCTTCAGAGTAACATGGACTTGATCAGGCGGCAA 1023
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140546617089
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5