BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G10130.1
Length=3478
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg471128 jgi|Araly1|471128|fgenesh2_kg.1__1082__AT1G10130.1 5666 0.0
Ahg919766 jgi|Araly1|919766|scaffold_101047.1 178 3e-43
Ahg896650 jgi|Araly1|896650|Al_scaffold_0005_616 115 2e-24
> Ahg471128 jgi|Araly1|471128|fgenesh2_kg.1__1082__AT1G10130.1
Length=3464
Score = 5666 bits (3068), Expect = 0.0
Identities = 3357/3490 (96%), Gaps = 45/3490 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GAAGCCTACCCGCTAATTCATGT-AAAGTGTATCT------CAGCACTTGACTTTCA-GT 53
||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |
Sbjct 1 GAAGCCTACCCGCTAATTCATCTAAAAGTGTTTCTCAGCAGCAGCACTTGACTTTCACTT 60
Query 54 CTCAGCGATCGGAGACGGAGAAGCTCATGGAA---GCTGCTGGCGTTACAAGTTCTCATC 110
| |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 61 C-CAGCGATC-G-GACGGAGAAGCTCATGAAAGCTGCTGCTGGCGTTACAAGTTGTCATC 117
Query 111 TTCTCTAGTCTTTTACATTTCACCTCCCTTTCGTCGGCGACCCAAATCCACGTTTTGGGA 170
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 118 TTCTCTAGTCTTTTCCATTTCACCTCATTTTCGTCGGCGACCC-AATCGACGTTTTGGGA 176
Query 171 ATTCCTCCCTAAAAATCAGAAACCCTTGGCTTT-TCCAACATGGAAGACGCCTACGCCAG 229
||| ||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 177 ATTTCTCCCCCAAAATCAGACACCCTAGG-TTTCTCCAACATGGAAGACGCCTATGCCAG 235
Query 230 ATCTGTCTCAGAGGTGCTTGATTTCTTTGGGGTAGACCCAACAAAGGGTCTTTCTGATTC 289
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 236 ATCTGTCTCTGAGGTCCTTGATTTCTTTGGGGTAGACCCAACAAAGGGTCTTTCCGATTC 295
Query 290 TCAGGTTGTTCATCATTCCAGGCTTTATGGCAGGAATGTACTGCCTGAAGAGAAAAGAAC 349
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | | ||||
Sbjct 296 TCAGGTTGTTCATCATTCTAGGCTTTATGGCAGG-A---A-----T-----G----GAAC 337
Query 350 GCCATTCTGGAAACTGGTTCTGAAACAGTTTGATGATTTACTTGTCAAGATATTGATTGT 409
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 TCCATTCTGGAAACTGGTTCTGAAACAATTCGATGATTTACTTGTCAAGATATTGATTGT 397
Query 410 GGCTGCAATTGTTTCTTTCGTATTGGCTTTGGCTAATGGAGAGACTGGTTTAACAGCATT 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 GGCTGCAATTGTTTCTTTCGTATTGGCTTTGGCTAATGGAGAGACTGGTTTAACAGCATT 457
Query 470 TCTGGAGCCTTTTGTCATTCTGCTGATATTGGCTGCAAATGCGGCAGTGGGGGTGATCAC 529
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 TCTGGAGCCTTTTGTAATTCTGCTGATATTGGCTGCAAATGCGGCAGTGGGGGTGATCAC 517
Query 530 GGAGACTAATGCTGAGAAGGCTCTTGAGGAGCTACGTGCCTACCAAGCAAATATAGCTAC 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GGAGACTAATGCTGAGAAGGCTCTTGAGGAGCTACGCGCCTACCAAGCAAATATAGCTAC 577
Query 590 AGTGTTGCGAAATGGGTGCTTCTCTATCCTACCAGCAACAGAGCTGGTTCCAGGCGACAT 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 AGTGTTGCGAAATGGGTGCTTCTCTATCCTACCAGCAACAGAGCTGGTTCCAGGCGACAT 637
Query 650 TGTTGAAGTTACTGTGGGATGTAAGATTCCAGCTGACCTGAGGATGATTGAGATGTCTAG 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638 TGTTGAAGTTACTGTGGGATGTAAGATTCCAGCTGACCTGAGGATGATTGAGATGTCTAG 697
Query 710 CAATACGTTTCGAGTTGATCAAGCCATTCTAACTGGTGAAAGCTGTTCCGTGGAAAAAGA 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 698 CAATACGTTTCGAGTTGATCAAGCCATTCTAACTGGTGAAAGCTGCTCCGTGGAAAAAGA 757
Query 770 TGTTGACTGTACTTTAACAACAAATGCTGTCTACCAAGACAAGAAAAATATTTTATTTTC 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 TGTTGACTGTACTTTAACAACAAATGCTGTCTACCAAGACAAGAAAAATATTTTATTTTC 817
Query 830 GGGAACTGATGTGGTCGCGGGTAGGGGAAGGGCTGTTGTCATTGGAGTTGGTTCAAACAC 889
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 GGGAACTGATGTGGTCGCGGGTAGGGGGAGGGCTGTTGTCATTGGAGTTGGTTCAAACAC 877
Query 890 CGCAATGGGTAGCATACACGATTCTATGTTGCAGACAGATGATGAGGCAACTCCATTGAA 949
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 CGCGATGGGTAGCATACACGATTCTATGTTGCAGACAGATGATGAGGCAACTCCATTGAA 937
Query 950 AAAGAAGCTGGACGAGTTTGGCAGCTTTTTGGCTAAGGTAATTGCGGGTATTTGTGTACT 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 938 AAAGAAGCTGGACGAGTTTGGCAGCTTTTTGGCTAAGGTTATTGCGGGGATTTGTGTACT 997
Query 1010 TGTGTGGGTTGTCAACATTGGTCACTTCAGTGACCCTTCTCATGGTGGATTTTTTAAAGG 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TGTGTGGGTTGTCAACATTGGTCACTTCAGTGACCCTTCTCATGGTGGATTTTTTAAAGG 1057
Query 1070 CGCAATTCACTATTTTAAGATTGCAGTTGCCCTTGCTGTTGCAGCTATTCCTGAAGGACT 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 CGCAATTCACTATTTTAAGATTGCAGTTGCCCTTGCTGTTGCAGCTATTCCTGAAGGACT 1117
Query 1130 TCCTGCTGTCGTGACAACGTGTTTAGCTCTTGGAACAAAGAAAATGGCTCGTTTGAATGC 1189
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 TCCTGCTGTCGTTACAACGTGTTTAGCTCTTGGAACAAAGAAAATGGCTCGTTTGAATGC 1177
Query 1190 TATTGTACGGTCATTACCATCTGTCGAGACGCTTGGGTGCACTACTGTAATTTGCAGTGA 1249
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1178 TATTGTACGGTCATTGCCATCTGTAGAGACGCTTGGGTGCACCACTGTAATTTGCAGTGA 1237
Query 1250 CAAGACTGGAACATTGACAACCAATATGATGTCGGTGTCTAAGATATGTGTAGTCCAATC 1309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 CAAGACTGGAACATTGACAACCAATATGATGTCGGTGTCTAAGATATGTGTAGTCCAATC 1297
Query 1310 TGCAGAGCATGGTCCTATGATTAATGAATTCACTGTTAGTGGGACAACTTATGCACCAGA 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 TGCAGAGCATGGTCCTATGATTAATGAATTCACTGTTAGTGGGACAACTTATGCACCAGA 1357
Query 1370 AGGTACCGTCTTTGACAGCAATGGGATGCAGCTTGACTTACCTGCTCAGTCACCTTGCCT 1429
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 AGGTACCGTCTTTGACAGCAATGGGCTGCAGCTTGATTTACCTGCTCAGTCACCTTGCCT 1417
Query 1430 TCATCATTTAGCAATGTGTTCATCACTCTGCAATGACTCCATCTTGCAATACAATCCAGA 1489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418 TCATCATTTAGCAATGTGTTCATCACTCTGCAATGACTCCATCTTGCAATACAATCCAGA 1477
Query 1490 TAAGGATTCTTATGAAAAAATTGGAGAGTCAACTGAAGTTGCTCTTCGAGTTCTTGCAGA 1549
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1478 TAAAGATTCTTATGAAAAAATTGGAGAGTCGACTGAAGTTGCTCTTCGAGTTCTGGCAGA 1537
Query 1550 AAAGGTTGGGCTCCCTGGTTTTGATTCAATGCCTTCTGCTCTAAACATGTTGAGCAAGCA 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1538 AAAGGTTGGGCTCCCTGGTTTTGATTCAATGCCTTCTGCTCTAAACATGCTGAGCAAGCA 1597
Query 1610 TGAACGTGCATCATATTGCAACCATTATTGGGAAAACCAATTCAAAAAGGTTTATGTTTT 1669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598 TGAACGTGCATCATATTGCAACCATTATTGGGAAAACCAATTCAAAAAGGTTTATGTTTT 1657
Query 1670 GGAGTTTACTCGTGACCGAAAAATGATGAGCGTCCTATGTAGCCATAAGCAAATGGATGT 1729
||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658 GGAGTTTACCCGTGATCGCAAAATGATGAGCGTCCTATGTAGCCATAAGCAAATGGATGT 1717
Query 1730 TATGTTCTCAAAGGGTGCTCCAGAGAGTATAATAGCTAGGTGTAATAAAATTCTCTGCAA 1789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1718 AATGTTCTCAAAGGGTGCTCCAGAGAGTATAATAGCTAGGTGTACTAAAATTCTTTGCAA 1777
Query 1790 CGGTGATGGTTCTGTTGTTCCTCTAACTGCTGCTGGCCGTGCAGAGCTTGAGTCGAGGTT 1849
|||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1778 CGGTGATGGTTCTGTTATTCCTCTAACTGCTGCAGCCCGTGCAGAGCTTGAGTCAAGGTT 1837
Query 1850 TTACAGTTTTGGCGATGAAACATTGAGATGCTTAGCATTAGCATTTAAGACCGTGCCCCA 1909
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1838 CCACAGTTTTGGCGATGAAACATTGAGATGCTTAGCATTAGCATTTAAAACCGTGCCCCA 1897
Query 1910 CGGTCAACAAACTATTTCCTATGATAATGAGAACGACCTGACGTTTATTGGGTTGGTGGG 1969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898 CGGTCAACAAACTATTTCCTATGATAATGAGAACGACCTGACGTTTATTGGGTTGGTGGG 1957
Query 1970 AATGCTTGATCCACCAAGAGAAGAAGTGAGAGATGCTATGCTTGCGTGTATGACTGCTGG 2029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1958 AATGCTTGATCCACCAAGAGAAGAAGTGAGAGATGCTATGCTTGCGTGTATGACTGCTGG 2017
Query 2030 GATACGTGTTATAGTTGTTACTGGGGATAACAAGTCCACAGCAGAGTCACTATGTAGAAA 2089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2018 GATACGTGTTATAGTTGTTACTGGGGATAACAAGTCCACAGCAGAGTCACTATGTAGAAA 2077
Query 2090 AATAGGGGCTTTTGACAATCTGGTAGACTTTTCTGGTATGTCCTACACCGCTTCTGAATT 2149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078 AATAGGGGCTTTTGACAATCTGGTAGACTTTTCTGGTATGTCCTACACCGCTTCTGAATT 2137
Query 2150 TGAACGGCTTCCAGCAGTGCAGCAAACTCTAGCATTGCGACGGATGACACTTTTTTCCAG 2209
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138 TGAACGGCTTCCAGCGGTGCAGCAAACTCTAGCACTGCGACGGATGACACTTTTTTCCAG 2197
Query 2210 GGTTGAACCTTCCCACAAAAGGATGCTTGTTGAAGCCCTACAGAAACAAAACGAAGTGGT 2269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2198 GGTTGAACCTTCCCACAAAAGGATGCTTGTTGAAGCCCTACAGAACCAAAACGAAGTGGT 2257
Query 2270 GGCAATGACTGGTGATGGCGTTAATGATGCCCCTGCATTGAAGAAAGCTGACATTGGGAT 2329
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 GGCAATGACTGGTGATGGCGTCAATGATGCCCCTGCATTGAAGAAAGCTGACATTGGGAT 2317
Query 2330 TGCCATGGGTTCTGGAACAGCTGTAGCAAAGAGTGCTTCAGATATGGTTTTGGCTGATGA 2389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 TGCCATGGGTTCTGGAACAGCTGTAGCAAAGAGTGCTTCAGATATGGTTTTGGCTGATGA 2377
Query 2390 TAATTTTGCTTCAATAGTTGCGGCTGTTGCAGAAGGAAGGGCTATATATAATAACACAAA 2449
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2378 TAATTTTGCTTCAATTGTTGCGGCTGTTGCAGAAGGAAGGGCTATATATAATAACACAAA 2437
Query 2450 GCAATTCATTAGATACATGATTTCTTCAAATATAGGGGAAGTGGTCTGTATATTTGTTGC 2509
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2438 GCAATTCATTAGATACATGATCTCATCAAATATAGGGGAAGTGGTCTGTATTTTTGTTGC 2497
Query 2510 AGCTGTACTGGGAATCCCTGATACCTTGGCACCTGTTCAACTTCTGTGGGTCAATTTGGT 2569
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498 AGCTGTACTGGGAATCCCTGATACCCTGGCACCTGTTCAACTTCTGTGGGTCAATTTGGT 2557
Query 2570 AACAGATGGATTGCCTGCCACTGCCATTGGCTTTAATAAACAAGATTCCGATGTTATGAA 2629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2558 AACAGATGGATTGCCTGCCACTGCCATTGGCTTTAATAAACAAGATTCCGATGTTATGAA 2617
Query 2630 GGCAAAACCCCGAAAGGTTGGTGAAGCAGTGGTCACTGGGTGGTTATTCTTCCGCTATTT 2689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2618 GGCAAAACCCCGAAAGGTTGGTGAAGCAGTGGTCACTGGGTGGTTATTCTTCCGCTACTT 2677
Query 2690 GGTTATCGGAGTTTATGTCGGCCTGGCCACTGTTGCTGGCTTTATATGGTGGTTTGTTTA 2749
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2678 GGTTATCGGAGTTTATGTCGGCCTGGCAACTGTTGCTGGCTTTATATGGTGGTTTGTTTA 2737
Query 2750 CTCTGATGGTGGTCCTAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACTTGCGCACT 2809
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2738 CTCTGATGGTGGCCCTAAACTTACTTACAGTGAACTGATGAACTTTGAAACGTGCGCACT 2797
Query 2810 TAGAGAGACAACTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATCGGCACCCATCTACTGTGGCTAT 2869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 TAGAGAGACAACTTATCCCTGCAGCATATTTGAGGATAGGCACCCATCTACTGTGGCTAT 2857
Query 2870 GACAGTACTTGTTGTTGTCGAGATGTTTAATGCTCTAAATAACCTCAGCGAAAATCAATC 2929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2858 GACAGTACTTGTTGTTGTCGAGATGTTTAATGCTCTAAATAACCTCAGCGAAAATCAATC 2917
Query 2930 CCTTCTGGTTATAACCCCAAGGAGTAACTTATGGCTTGTTGGTTCAATTATCCTGACGAT 2989
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2918 TCTTCTGGTTATAACCCCAAGGAGTAACTTATGGCTTGTTGGTTCAATTATTCTGACAAT 2977
Query 2990 GCTTCTGCACGTGCTAATATTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTATTTTCTGTCACGCC 3049
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2978 GCTTCTGCACGTGCTAATATTATATGTTCATCCACTGGCAGTCTTATTTTCTGTGACGCC 3037
Query 3050 ATTATCCTGGGCCGAGTGGACTGCTGTTCTGTATCTTTCGTTTCCAGTTATCATCATCGA 3109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3038 ATTATCCTGGGCCGAGTGGACTGCTGTTCTGTATCTTTCGTTTCCAGTTATCATCATCGA 3097
Query 3110 TGAGCTTCTGAAGTTCCTCTCTAGAAATACAGGCATGAGATTCAGGTTCAGATTGAGGAA 3169
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3098 TGAGCTTCTGAAGTTCCTCTCTAGAAATACAGGGATGAGATTCAGGTTCAGATTGAGGAA 3157
Query 3170 GGCTGATTTACTCCCCAAGGACCGGCGTGACAAGTAGGATAAGAAAGCAAGAGATGGCTT 3229
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3158 GGCTGATTTGCTCCCCAAGGACCGGCGAGACAAGTAGGATAAGAAAACAAGAGATGGCTT 3217
Query 3230 TTTCGTCATACAGAttttttttttGGCTATATAGATACAACAGCACACAGAGAAGGGAAC 3289
|||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3218 TTTCGTCATACAGAGTTTTTTTG-GGAT-TATAGATACAACAACACACAGAGAAGGGAAT 3275
Query 3290 CTTGGGAGATTCTAATTTCAATCCAAAAAGCCCCCAACACCATAAACCATAAAACTCTTT 3349
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3276 CTTGGGAGATTCTAATG-CAATCCAAAAAGCCCCAAACACCATAAACCATAAAACTCTTT 3334
Query 3350 CGCTTTTGATTGTACCAAATTTCACTGTATTCTTACATCAAATCAATGACTAGTGCTCTT 3409
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3335 CGCTTTTGATTGTACCAAATTTCACTGTATGCTTACATCAAATCAATGACTACTGCTCTG 3394
Query 3410 TGTG-T-CA-TG--C-AA-GTGAATCGGAAATTCTAACATTTACAACTTAAAATGTGATT 3462
||| | | || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3395 TGTCATTCTCTGTACCAAAGTGAATCGGAAGTTCTAACATTTACAACTTATAATGTGATT 3454
Query 3463 CGCAGATTAT 3472
||||||||||
Sbjct 3455 CGCAGATTAT 3464
> Ahg919766 jgi|Araly1|919766|scaffold_101047.1
Length=2900
Score = 178 bits (96), Expect = 3e-43
Identities = 108/114 (95%), Gaps = 0/114 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1174 TGGCTCGTTTGAATGCTATTGTACGGTCATTACCATCTGTCGAGACGCTTGGGTGCACTA 1233
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 2755 TGGCTCGTTTGAATGCTATAGTACGGTCATTGCCATCAGTCGAGACGCTTGGTTGCACTT 2814
Query 1234 CTGTAATTTGCAGTGACAAGACTGGAACATTGACAACCAATATGATGTCGGTGT 1287
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2815 CTGTAATTTGCAGTGACAAGACTGGAACATTGACTACCAATATGATGTCGGTGT 2868
> Ahg896650 jgi|Araly1|896650|Al_scaffold_0005_616
Length=1794
Score = 115 bits (62), Expect = 2e-24
Identities = 80/89 (90%), Gaps = 0/89 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1573 ATTCAATGCCTTCTGCTCTAAACATGTTGAGCAAGCATGAACGTGCATCATATTGCAACC 1632
|||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1451 ATTCAATGTCTTGTGCTCTGAACATGTTGAGCAAGCATGAACGTGCATCATACTGCAACA 1510
Query 1633 ATTATTGGGAAAACCAATTCAAAAAGGTT 1661
| | | ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1511 ACTGTCGGGAAAACCAATTGAAAAAGGTT 1539
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 131336684423
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5