BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G14650.1
Length=2789
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg313937 jgi|Araly1|313937|fgenesh1_pm.C_scaffold_1002717 3637 0.0
Ahg911261 jgi|Araly1|911261|Al_scaffold_0001_1515 2695 0.0
Ahg922541 jgi|Araly1|922541|scaffold_103822.1 420 3e-116
Ahg940094 jgi|Araly1|940094|scaffold_600638.1 204 3e-51
> Ahg313937 jgi|Araly1|313937|fgenesh1_pm.C_scaffold_1002717
Length=2337
Score = 3637 bits (1969), Expect = 0.0
Identities = 2240/2366 (95%), Gaps = 37/2366 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 160 ATGTTCAGCTCGATGCAGATACTGCCACTGGAGGCTCCTCCTACGGATGGGAAGTTAGGT 219
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTGAGCTCGATGCAGATACTGCCACTGGAGGCTCCTCCTACCGACGGGAAGTTAGGT 60
Query 220 CCACTTCCTCCGTCGCAATTAACAGATCAGGAAGTCGAAGAGAGGGAGTTGCAAGCAGAG 279
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 CCACTTCCTCCGTCGCAATTAACTGATCAGGAAGTCGAAGAGATGGAGTTGCAAGCAGAG 120
Query 280 CAAAATAATTCAAATCTAGCTCCTCCGGCGGCTGTTGCTACTCACACGAGGACTATCGGA 339
||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 121 CAAAACAATTCAAATCAAG---CTCCGGCGGCTGTTGCGACTCACACAAGGACTATTGGA 177
Query 340 ATCATTCATCCACCTCCAGATATCAGAACTATTGTTGAGAAAACGGCTCAGTTTGTCTCC 399
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 178 ATTATTCATCCACCTCCAGATATCAGAACTATTGTTGAGAAAACGGCTCAGTTTGTTTCC 237
Query 400 AAAAACGGTTTGGAGTTTGAAAAGAGGATTATTGTTAGTAATGAAAAGAATGCTAAGTTC 459
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 238 AAAAACGGGTTGGAGTTTGAAAAGAGGATTATTGTTAGTAATGAAAAGAATGCCAAGTTC 297
Query 460 AACTTTTTGAAGAGCTCAGATCCTTATCATGCCTTTTACCAGCACAAGCTCACTGAATAC 519
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 AACTTTTTGAAGAGCTCAGATCCTTATCATGCCTTTTACCAGCACAAGCTCACTGAATA- 356
Query 520 CGTGCTCAGAATAAAGACGGAGCTCAGGGTACTGATGATTCAGATGGTACTACAGATCCC 579
| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 357 ----C-C-G--T---------GCTCAGGGTACTGATGATTCAGATGG---TACAGATCTT 396
Query 580 CAACTTGATACTGGAGCTGCTGATGAGTCTGAAGCTGGTGATACACAACCCGACCTTCAG 639
||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 397 CAACTTGATACTGCTGCTGCTGATGAGTCTGAGGCAGGTGATGCACAACCCGATCTTCAG 456
Query 640 GCTCAATTTAGGATTCCTTCTAAGCCTTTGGAAGCTCCGGAACCTGAGAAGTATACAGTT 699
||||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 457 GCTCAGTTTAGGATTCCTCCTAAGCCTCTAGAACCTCCGGAGCCTGAGAAGTATACAGTT 516
Query 700 AGACTTCCTGAAGGGATCACGGGTGAAGAGCTTGATATTATTAAGCTCACAGCACAGTTT 759
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 517 AGACTTCCTGAAGGGATCACGGGCGAGGAGCTTGATATTATTAAGCTTACAGCACAGTTT 576
Query 760 GTGGCACGGAATGGGAAATCGTTTCTAACGGGATTGTCGAATAGAGAGAA-CAACAATCC 818
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||
Sbjct 577 GTGGCACGGAATGGGAAATCGTTTTTAACGGGATTGACGAGTAGAGA-AATCAACAATCC 635
Query 819 TCAGTTTCATTTTATGAAGCCAACACACAGCATGTTCACtttttttACTTCTCTGGTTGA 878
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 TCAGTTTCAGTTTATGAAGCCAACACATAGCATGTTCACTTTTTTTACTTCTCTGGTTGA 695
Query 879 TGCGTATTCGGAAGTATTAATGCCTCCCAAAGATTTGAAAGAAAAGCTGAGAAAGAGTGC 938
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 TGCGTATTCAGAAGTTTTAATGCCTCCCAAAGATTTGAAAGAAAAGCTGAGAAAGAGTGT 755
Query 939 TGCTGATTTGACGACTGTTCTTGAGCGTTGTTTGCATCGT-TTGGAATGGGATCGTTCCC 997
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
Sbjct 756 TGCTGATTTGACTACTGTTCTTGAGCGTTGTTTGCATCGTCTT-GAATGGGATCGTTCTC 814
Query 998 AGGAGCAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGGATGAGAAAGAGCTTGAGCGAGTGCAGATGGCTA 1057
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGAGCAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGGATGAGAAAGAGCTGGAGCGAGTGCAGATGGCTA 874
Query 1058 TGATTGATTGGCATGATTTTGTGGTTGTTGAGTCGATAGATTTTGCGGACGAGGAAGATG 1117
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 TGATTGATTGGCATGATTTTGTGGTGGTTGAGTCGATAGATTTTGCGGACGAGGAAGATG 934
Query 1118 AAGAGTTGCCACCGCCTATGACACTTGACGAGGTTATAAGGAGGAGCAAAGCATCAGCCA 1177
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 AAGAGTTACCACCGCCTATGACACTTGACGAGGTTATAAGGAGGAGCAAAGCATCAGCCA 994
Query 1178 TGGAAGAAGATGAAATTGTTGAGCCTGGAAAGGAGGTCGAAATGGAAATGGACGAAGAAG 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 TGGAAGAAGATGAAATTGTTGAGCCTGGAAAGGAGGTCGAAATGGAAATGGACGAAGAAG 1054
Query 1238 AAGTTAAGCTTGTTGCAGAAGGAATGAGAGCAGCAAACCTAGAAGAGAATGTTAAGATTG 1297
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 AAGTTAAGCTTGTCGCAGAAGGAATGAGAGCAGCAAACCTAGAAGAGAATGTTAAGATTG 1114
Query 1298 AAAATGTACATGATGAAGAAGCACCTATGAGAATTGTTAAGAACTGGAAGAGGCCAGAAG 1357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 AAAATGTACATGATGAAGAAGCACCTATGAGAATTGTTAAGAACTGGAAGAGGCCAGAAG 1174
Query 1358 ACAGGATCCCAACAGAGAGAGATCCAACTAAAGTTGTTATATCACCAATTACTGGAGAGC 1417
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1175 ACAGGATCCCAACAGAGAGAGATCCAACTAAAGTTGTTGTATCACCAATTACTGGCGAGC 1234
Query 1418 TGATTCCCATTAACGAGATGTCTGAGCACATGAGGATTTCTCTTATTGATCCTAAGTTCA 1477
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235 TGATTCCCATCAACGAGATGTCTGAGCACATGAGGATTTCTCTTATTGATCCTAAGTTCA 1294
Query 1478 AAGAACAGAAGGATCGGATGTTTGCTAAGATTCGTGAGACCACTCTTGCACAAGATGATG 1537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 AAGAACAGAAGGATCGGATGTTTGCTAAGATTCGTGAAACCACTCTTGCACAAGATGATG 1354
Query 1538 AGATTGCTAAAAACATAGTCGGGTTGGCCCGCCTGCGTCCTGATATCTTTGGAACAACCG 1597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1355 AGATTGCTAAAAACATAGTCGGGTTGGCCCGCCTGCGTCCGGATATCTTTGGAACAACAG 1414
Query 1598 AAGAAGAAGTCTCAAATGCTGTAAAAGCAGAGATTGAGAAGAAGAAAGATGAGCAGCCCA 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 AAGAAGAAGTCTCAAATGCTGTAAAAGCAGAGATTGAGAAGAAGAAAGATGAGCAGCCCA 1474
Query 1658 AGCAAGTGATATGGGATGGTCACACAGGAAGTATTGGTCGCACAGCAAACCAAGCCTTGA 1717
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 AGCAAGTGATATGGGATGGTCACATAGGAAGTATTGGTCGCACAGCAAACCAAGCCTTGA 1534
Query 1718 GTCAGAACGCTAATGGAGAGGAGCAAGGTGATGGCGTTTACGGAGATCCCAATAGCTTCC 1777
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 CTCAGAACGCTAATGGAGAGGAGCAAGGTGATGGCGTTTACGGAGATCCCAATAGCTTCC 1594
Query 1778 CTGGTCCAGCTGCTCTTCCACCTCCTCGACCAGGTGTCCCAATAGTCCGACCATTGCCAC 1837
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1595 CTGGTCCAGCTGCTCTTCCTCCTCCTCGACCAGGTGTCCCAATAGTCCGACCATTACCAC 1654
Query 1838 CACCTCCTAATCTCGCCTTGAACCTCCCTCGTCCTCCCCCTTCTGCTCAGTACCCCGGTG 1897
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 CCCCTCCTAATCTCGCCCTGAACCTCCCTCGTCCTCCCCCTTCTGCTCAGTACCCCGGTG 1714
Query 1898 CACCAAGGCCACTAGGTGTTCCGATGATGCAGCCCATGCATCAACAACACCAGCTCACAA 1957
||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | |
Sbjct 1715 CACCAAGGCCATTAGGTGTTCCGATGATGCAACCTATGCATCAACAACACCAGTTCTCGA 1774
Query 1958 TGCCAGGGCCACCAGGACACCCGCAGATGATGATGAACCGACCACCACAGATG----CA- 2012
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1775 TGCCGGGGCCACCAGGACAGCCGCAGATGATGATGAACCGACCACCACAGATGATGGCAC 1834
Query 2013 -GCCTGGTATGCATGTGCCACCTCCACCGGGATCTCAGTTTGCTCATCATATGCAAATTC 2071
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1835 AGCCTGGTATGCATGTGCCACCTCCACCGGGATCTCAGTTTGCTC--C-TATGCAAATTC 1891
Query 2072 CTAGACCTTATGGTCAGCTTCCACCATCTGCAATGGGGATGATGCAACCACCACCTATGC 2131
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 CTAGACCTTATGGTCAGCTTCCACCGTCTGCAATGGGGATGATGCAACCACCACCTATGC 1951
Query 2132 CTGGGATGGCTCCTCCTCCACCACCCGAGGAGGCTCCACCACCTCTTCCTGAGGAACCAG 2191
|||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1952 CTGGGATGGCTCCTCCTCCACCTCATGAGGAGGCACCACCTCCTCTTCCTGAGGAACCAG 2011
Query 2192 AGGCAAAGAGACAAAAGTTCGATGAGTCAGCCCTTGTTCCAGAAGACCAGTTTCTTGCTC 2251
|| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2012 AGCCAAAGAGACAAAAGTTCGACGAGTCAGCCCTTGTTCCAGAAGACCAGTTTCTTGCTC 2071
Query 2252 AGCATCCGGGTCCGGCTACAATCAGGGTTTCTAAGCCAAACGAGAATGATGGACAATTTA 2311
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| | |
Sbjct 2072 AGCATCCGGGTCCGGCTACAATCAGGGTTTCTATGCCAAACGTGGATGATGGGCAAGTCA 2131
Query 2312 TGGAGATCACAGTGCAGTCGTTATCTGAAAACGTGGGAAGTTTGAAGGAGAAAATAGCTG 2371
| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 TTGAGATCACAGTGCAGTCATTATCCGAAAACGTGGGAAGTTTGAAGGAGAAAATAGCTG 2191
Query 2372 GGGAGATTCAAATCCCAGCAAACAAACAGAAGTTGAGTGGAAAAGCAGGGTTCTTAAAGG 2431
||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2192 GGGAGATACAAATTCCAGCAAACAAACAGAAGATAAGTGGAAAAGCTGGGTTCTTAAAGG 2251
Query 2432 ACAACATGTCGCTTGCACATTACAATGTCGGAGCAGGAGAAATCCTAACATTGTCTTTGA 2491
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2252 ACAACATGTCGCTTGCGCATTACAATGTCGGAGCAGGAGAAATCCTAACATTGTCTTTGA 2311
Query 2492 GGGAACGTGGTGGGAGAAAGAGATAG 2517
| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 GAGAACGTGGTGGGAGAAAGAGATAG 2337
> Ahg911261 jgi|Araly1|911261|Al_scaffold_0001_1515
Length=2337
Score = 2695 bits (1459), Expect = 0.0
Identities = 2096/2392 (88%), Gaps = 89/2392 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 160 ATGTTCAGCTCGATGCAGATACTGCCACTGGAGGCTCCTCCTACGGATGGGAAGTTAGGT 219
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||
Sbjct 1 ATGTTCAATTCGATGCAGATACTGCCACTGGAGGCTCCTCCTGCTGACGGTAACCTAGGT 60
Query 220 CCACTTCCTCCGTCGCAATTAACAGATCAGGAAGTCGAAGAGAGGGAGTTGCAAGCAGAG 279
||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||| ||||||||| |||||
Sbjct 61 CCACTTCCTCCGTCGCAATTAACGGATGAAGAAATCAAAGAGAAAGAGTTGCAAACAGAG 120
Query 280 CAAAATAATTCAAATCTAGCTCCTCCGGCGGCTGTTGCTACTCACACGAGGACTATCGGA 339
|||| | ||||| || |||| | | ||||| |||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 121 AAAAACATTTCAATTCAAGCT-C-AC-ATAGCTGTGGCTACTCATACGAAGACTATCGGA 177
Query 340 ATCATTCATCCACCTCCAGATATCAGAACTATTGTTGAGAAAACGGCTCAGTTTGTCTC- 398
|||||| |||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| ||
Sbjct 178 ATCATTTATCCACCTCCTGATATCAGAAAAATCGTCGAGACAACGGCTCATTTTGTTTCG 237
Query 399 CAAAAACGGTTTGGAGTTTGAAAA-GAGGATT-ATTGTTAGTAATGAAAAGAATGCTAAG 456
| |||||||||| ||||||||||| | | || | || || | || || ||||
Sbjct 238 C-AAAACGGTTTAGAGTTTGAAAACAAAG-TTAAAACAGAG-AAAGCCAATAACCCTAAT 294
Query 457 TTCAACTTTTTGAAGAGCTCA-GATCCTTATCATGCCTTTTACCAGCACAAGCTCACTGA 515
|||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 295 TTCAACTTTTTGAAAAG-TGATAATCCTTATCATGCCTTTTACCAGCACAAGATCGCTGA 353
Query 516 ATACCGTGCTCAGAATAAAGACGGAGCTCAGGGTACTGATGATTCAGATGGTACTA-CAG 574
||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||| ||| | ||
Sbjct 354 GTACTGTGCTCAGATTCGAGACGGAGCTCAAGGTACTGAT--TT-TGATGATAC-AGAAG 409
Query 575 ATCCCCAACTTGATACTGGAGCTGCTGATGAGTCTGAAGCTGGTGATACACAACCCGACC 634
|||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || || | | || || |||| ||||
Sbjct 410 ATCCCCAACTTGATCCTGCTGCTTCTGCTGA---TG-AG-T-CTCATGCAAAACCTGACC 463
Query 635 TTCAGGCTCAATTTAGGATTCCTTC-TAAGCCTTTGGAAGCTCCGGAACCTGAGAAGTAT 693
|||||| |||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 464 TTCAGGATCAATTTAGGGTTCC-TCGTAAGACTTTAGAAGCTCCTGAACCTGACAAGTAT 522
Query 694 ACAGTTAGACTTCCTGA-AGGGATCACGG-GTGAAGAGCTTGATATTATTAAGC-TCACA 750
||||||||||||||| | |||||||| || | || ||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 523 ACAGTTAGACTTCCT-ATAGGGATCATGGAG-GAGGAGCTTGATATTATTAAGCAT-ACA 579
Query 751 GCACAGTTTGTGGCACGGAATGGGAAATCGTTTCTAACGGGATTG-TCGAATAGAGAGAA 809
|| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||| | || ||||||||
Sbjct 580 GCGCAGTTTGTGGCGCGGAATGGGGAATCCTTTTTAAGGGGATTGAT-GAGTAGAGAGAT 638
Query 810 CAACAATCCTCAGTTTCATTTTATGAAGCCAACACACAGCATGTTCACtttttttACTTC 869
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 639 GAACAATACTCAGTTTCAGTTTATGAAGCCAACACATAGTATGTTCACTTTTTTCACTTC 698
Query 870 TCTGGTTGATGCGTATTCGGAAGTATTAATGCCTCCCAAAGATTTGAAAGAAAAGCTGAG 929
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 699 TCTGGTTGATGCGTATTCAGAAGTTTTAATGCCTCCCAGAGACTTGAAAGAAAAGCTGAG 758
Query 930 AAAGAGTGCT-GCTGATTTGACGACTGTTCTTGAGCGTTGTTTGCATC-GTTTGGAATGG 987
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||
Sbjct 759 AAAGAGTG-TGGCTGATTTGACGACTGTTCTTGAGCGTTGTTTGAATCGGCTT-GAATGG 816
Query 988 GATCGTTCCCAGGAGCAGCAGAAGAAGAAAGAAGAGGATGAGAAAGAGCTTGAGCGAGTG 1047
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 817 GATCGTTCCCAGGAGGAGGAGAGGAAGAAAGAAGAGGATGAGAAAGAGAAGGAGAGAGTG 876
Query 1048 CAGATGGCTATGATTGATTGGCATGATTTTGTGGTTGTTGAGTCGATAGATTTTGCGGAC 1107
|| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 877 CATATGGCTTTGATTGATTGGCATGATTTTGCAGTTGTTGAGTCGATAGATTTTGTAGAC 936
Query 1108 GAGGAAGATGAAGAGTTGCCACCGCCTATGACACTTGACGAGGTTATAAGGAGGAGCAAA 1167
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 937 GAGGAAGATGAAGAGATGCCAATGCCTATGACACTTGAGGAGGTTATAAGGAGGAGCAAA 996
Query 1168 GCATCAGCCATGGAAGAAGATGAAATTGTTGAGCCTGGAAAGGAGGTCGAAATGGAAATG 1227
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 997 GTATCAGCCATGGAAGAAGATGAAATTGTTGAGCCTGGAAAGGAGGTTGAAATGGAAATG 1056
Query 1228 GACGAAGAAGAAGTTAAGCTTGTTGCAGAAGGAATGAGAGCAGCAAACCTAGAAGAG-A- 1285
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1057 GATGAAGAAGAAGTTAAGCTTGTTGCAGAAGGAATGAGAGCAGCAAACCTAGAAGAGTAT 1116
Query 1286 -AT-G---T-T-AAGATTGAAAATGTACA-TGATGAAGAAGCACCTATGAGAATTGTTAA 1337
| | | | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1117 GTTGGCTCTGTGGAGATTGAAAATGTACACTG-TGAAGAAGCACCAATGAGAATTGTTAA 1175
Query 1338 GAACTGGAAGAGGCCAGAAGACAGGATCCCAACAGAGAGAGATCCAACTAAAGTTGTTAT 1397
||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| | | ||||||||||||
Sbjct 1176 GAACTGGAAGAGGCCAGAAGATAGGTTTCTGACAGAGAGAGATTCGAGTAAAGTTGTTAT 1235
Query 1398 ATCACCAATTACTGGAGAGCTGATTCCCATTAAC-GAGATGTCTGAGCACATGAGGATTT 1456
||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1236 ATCACCAATCACTGGTGAGCTCATTCCCATT-ACAGAGATGTCTGAGCACATGCGGATTT 1294
Query 1457 CTCTTATTGATCCTAAGTTCAAAGAACAGAAGGATCGGATGTTTGCTAAGATTCGTGAGA 1516
| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 CACTTATCGATCCTAAGTTCAAAGAGCAGAAAGATCGGATGTTTGCTAAGATTCGTGAGA 1354
Query 1517 CCACTCTTGCACAAGATGATGAGATTGCTAAAAACATAGTCGGGTTGGCCCGCCTGCGTC 1576
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1355 CCACACTTGCACAAGATGATGAGATTGCTAAAAACATAGTCGGGTTGGCCCGTCTGCGTC 1414
Query 1577 CTGATATCTTTGGAACAACCGAAGAAGAAGTCTCAAATGCTGTAAAAGCAGAGATTGAGA 1636
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 CTGATATCTTTGGAACAACGGAAGAAGAAGTCTCAAATGCTGTAAAAGCAGAGATTGAGA 1474
Query 1637 AGAAGAAAGATGAGCAGCCCAAGCAAGTGATATGGGATGGTCACACAGGAAGTATTGGTC 1696
|||| | |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1475 AGAA-A--GATGAGCAACCAAAACAAGTAATATGGGATGGTCACACTGGAAGTATTGGTC 1531
Query 1697 GCACAGCAAACCAAGCCTTGAGTCAGAACGCTAATGGAGAGGAGCAAGGTGATGGCGTTT 1756
||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 1532 GCACAGCAAACCAAGCCTTGACTCAGAACTCAAATGGAGAG---CAAGGCGATGGAGTTT 1588
Query 1757 ACGGAGATCCCAATAGCTTCCCTGGTCCAGCTGCTCTTCCACCTCCTCGACCAGGTGTCC 1816
| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1589 ATGGTGATCCCAATAGCTTCCCTGGTCCAGCCGCTCTTCCTCCTCCTCGACCAGGTGTCC 1648
Query 1817 CAATAGTCCGACCATTGCCACCACCTCCTAATCTCGCCTTGAACCTCCCTCGTCCTCCCC 1876
||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1649 CAACAGTCCGGCCATTGCCACCACCTCCTAATCTCGCCTTGAACCTCCCTCGTCCTCCTC 1708
Query 1877 CTTCTGCTCAGTACCCCGGTGCACCAAGGCCACTAGGTGTTCCGATGATGCAGCCCATGC 1936
|||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 1709 CTTCTGTTCAGTACCTTGGTGCACCAAGGCCATTAGGTGATCCGATGATTCAGCCCATGT 1768
Query 1937 ATCAACAACACCAGCTCACAATGCCAGGGCCACCA-GGACACCCG-CAGATGATGATGAA 1994
|||||||||| |||||| | ||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||| |
Sbjct 1769 ATCAACAACATCAGCTCTCGATGCCTGGGCCAC-ATGGACACCCTTC-GATGATGATGCA 1826
Query 1995 -CCGACCACCACAGATGCAGCCTGGTATGCATGTGCCACCTCCACCGGGATCTCAGTTTG 2053
|| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1827 TCC-ACCACCACAAATGCAGCCTGTTATGCATGTGCCGTCTCCACCGGGATCTCAGTTTG 1885
Query 2054 CTCATCATATGCAAATTCCTAGACCTTATGGTCAGCTTCCACC--ATCTGCAATGGGGAT 2111
|||| | | | | | |||||||||||||||| || | | ||||||||
Sbjct 1886 CTCA--A----C-----C-T-----T-ATGGTCAGCTTCCACCGCAT-T-CGATGGGGAT 1925
Query 2112 GATGCA-----ACC-ACCACCTATGCCTGGGATGGCTCCTCCTCCACCACCCGAGGAGGC 2165
|||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1926 GATGCACGTGCACCCACCACCTATGCCTGAAATGCCTCCTCCACCACCACCCGGGGAGGC 1985
Query 2166 TCCACCACCTCTTCCTGAGGAACCAGAGGCAAAGAGACAAAAGTTCGATGAGTCAGCCCT 2225
||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1986 ACCACCGCCTCTTCCTGAGGAGCCAGAGCCAAAGAGACAAAAGTTCGTTGAGTCAGCCCT 2045
Query 2226 TGTTCCAGAAGACCAGTTTCTTGCTCAGCATCCGGGTCCGGCTACAATCAGGGTTTCTAA 2285
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 TGTTCCAGAAGACCAGTTTCTTGCTCAGTATCCGGGTCCGGCTACAATCAGGGTTTCTAA 2105
Query 2286 GCCAAACGAGAATGATGGACAATTTATGGAGATCACAGTGCAGTCGTTATCTGAAAACGT 2345
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2106 GCCAAACGAGAATGATGGACAAGTCATGGAGATCACAGTGCAGTCGTTATCCGAAAATGT 2165
Query 2346 GGGAAGTTTGAAGGAGAAAATAGCTGGGGAGATTCAAATCCCAGCAAACAAACAGAAGTT 2405
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2166 GGGAAGTTTGAAGGAGAAAATAGCTGGAGAGATGCAAATTCCAGCAAACAAACAGAAGTT 2225
Query 2406 GAGTGGAAAAGCAGGGTTCTTAAAGGACAACATGTCGCTTGCACATTACAATGTCGGAGC 2465
||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2226 AAGTGGAAAAGCTGGATTCTTAAAGGACAACATGTCACTTGCACATTACAATGTGGGAGC 2285
Query 2466 AGGAGAAATCCTAACATTGTCTTTGAGGGAACGTGGTGGGAGAAAGAGATAG 2517
|||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 AGGAGAAATCCTTACACTGTCTTTGAGAGAACGTGGTGGGAGAAAGAGATAG 2337
> Ahg922541 jgi|Araly1|922541|scaffold_103822.1
Length=431
Score = 420 bits (227), Expect = 3e-116
Identities = 360/421 (86%), Gaps = 22/421 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 2102 CAATGGGGATGATGCAACCACCACCTATGCCTGGGATGGCTCCTCCTCCACCACCCGAGG 2161
|||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||
Sbjct 23 CAATGGGGATGATGGACCCACCATCTATGCCTGAAATGCCTCCTCCACCACCACCCGGGG 82
Query 2162 AGGCTCCACCACCTCTTCCTGAGGAACCAGAGGCAAAGAGACAAAAGTTCGATGAGTCAG 2221
|||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 83 AGGCACCACCGCCTCAACCTGAGGAGCCAGAGCCAAAGAGACAAAAGTTAGATGAGTCAG 142
Query 2222 CCCTTGTTCCAGAAGACCAGTTTCTTGCTCAGCATCCGGGTCCGGCTACAATCAGGGTTT 2281
| ||||||||||||||||| |||||| |||| | | ||||| | | |
Sbjct 143 CACTTGTTCCAGAAGACCAATTTCTTTCTCA--A--C--ATCCGG-T----T-A------ 184
Query 2282 CTAAGCCAAACGAGAATGATGGACAAT-TTATGGAGATCACAGTGCAGTCGTTATCTGAA 2340
|||||||||||| | ||||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 185 CTAAGCCAAACGTGGATGATGGAC-ATGACATTGAGATCATAGTGCAGCCGTTATCTGAA 243
Query 2341 AACGTGGGAAGTTTGAAGGAGAAAATAGCTGGGGAGATTCAAATCCCAGCAAACAAACAG 2400
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 244 AACGTGGGAAGTTTGAAGGAGAAAATAGTTGGGGAGATGCAAATTCCAGCAAACAAACAG 303
Query 2401 AAGTTGAGTGGAAAAGCAGGGTTCTTAAAGGACAACATGTCGCTTG-CACATTACAATGT 2459
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||
Sbjct 304 AAGTTAAGTGGAAAAGCTGGGTTCTTAAAGGACAACATGTCGCT-GACACATTACAACGT 362
Query 2460 CGGAGCAGGAGAAATCCTAACATTGTCTTTGAGGGAACGTGGTGGGAGAAAGAGATAGAG 2519
|||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 363 GGGAGCAAGAGAAATCCTTACACTGTCTTTGAGAGAACGTGGTGAGTGAAAGAGATAGAG 422
Query 2520 A 2520
|
Sbjct 423 A 423
> Ahg940094 jgi|Araly1|940094|scaffold_600638.1
Length=826
Score = 204 bits (110), Expect = 3e-51
Identities = 166/193 (86%), Gaps = 4/193 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2297 ATGATGGACAATTTATGGAGATCACAGTGCAGTCGTTATCTGAAAACGTGGGAAGTTTGA 2356
||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 610 ATGATGGGCAACTCGTTGAGATCATAGTGCAGTCTTTATCGGAAAGCGTGGCAAGTTTGA 669
Query 2357 AGGAGAAAATAGCTGGGGAGATTCAAATCCCAGCAAACAAACAGAAGTTGAGTGGAAAAG 2416
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||
Sbjct 670 AGGAGAAAATAGCTGGGGAGATTCAAATTCCAGCAAACACACACAAGATAAGTGGAAAAA 729
Query 2417 CAGG-GTTCTTAAAGGACAACATGTCGCTTGCACATTACAATGTCGGAGCAGGAGAAATC 2475
| || ||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 730 CCGGTGTT-TTAGAGGACAACATATCACTTGCACACTACAATGTGGGAGCAGGAGAGATC 788
Query 2476 CTAACAT-TGTCT 2487
||||| | |||||
Sbjct 789 CTAAC-TCTGTCT 800
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 105243346935
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5