BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G14790.1
Length=3807
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg471669 jgi|Araly1|471669|fgenesh2_kg.1__1623__AT1G14790.1 5258 0.0
Ahg493674 jgi|Araly1|493674|fgenesh2_kg.7__3107__AT1G14790.1 4405 0.0
> Ahg471669 jgi|Araly1|471669|fgenesh2_kg.1__1623__AT1G14790.1
Length=3655
Score = 5258 bits (2847), Expect = 0.0
Identities = 3279/3484 (94%), Gaps = 44/3484 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTCTTTCGATAATTATTGTACTTGGTTCTTTGTTCTCAGTGTAAATGAAAGTGAGAA 60
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTCTTTAGATAATTATTGTACTGGGGTCTTTGTTCCCATTGTAAATGAAAGTGAGAA 60
Query 61 TCCAAAGGCTATCATCGGAAACTGAGGGAACAGAGATCATTCATCGCCGC-G---G---T 113
||||||||| |||| | ||||||| | ||||| |||||||||| | | |
Sbjct 61 TCCAAAGGC---CATC----A--GAGGGAAGATCGATCAGTCATCGCCGCGGTAAGTCAT 111
Query 114 -TGATATAGAGAAAGATGGGGAAGACAATTCAAGTGTTTGGATTCCCTAATGGTGTGAGC 172
|| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 112 CTGTTATAGAG-AAGATGGGGAAGACAATTCACGTGTTTGGATTCCCGAATGGTGTGAGC 170
Query 173 GCAGAAGAAGTTAAGAAGTTTCTTGAAAGACTCACTGGTTCAGGCACTGTTTACGCAATC 232
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 171 GCAGAGGAAGTTAAGAAATTTCTTGAAAGACTCACTGGTTCAGGCACTGTTTACGCTATC 230
Query 233 AAAGTTAGACAACCAAAGAAAGGTGGTCCAAGAGTCTATGCCATTGTTCAATTCACATCT 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 231 AAAGTTAGACAACCAAAGAAAGGTGGTCCAAGAGTCTTTGCCATTGTTCAATTCACAAAT 290
Query 293 GAGAGACATACGAGGCTGATCATCACTGCG-GCAGCAGAA---CGTCTTTACTATGGAAG 348
|||| | || | |||| ||||||||| | | || |||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 291 GAGATATATGCAAGGCAGATCATCAC-GGGTGCCGCAGAACGTCGTCTTTATTATGGGAG 349
Query 349 ATCTTATCTCAAGGCTTTTGAAGTTGAACAAGACATTGTTCCAAAGCCAAGAGCTTCATT 408
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 ATCTTATCTCAATGCTTTTGAAGTGGAACAAGACATTGTTCCAAAGCCAAGAGCTTCATT 409
Query 409 ACACACCATCTCTGGTTTAAAGATGT-TCTTTGGATGTCAAGTCTCGACTAAGAAGTTTT 467
|||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| | |||
Sbjct 410 GCACAACATCTCTGGTTTAAAGATGTAT-TTTGGATGTCAAGTCTCAACTCAGACGCTTT 468
Query 468 TAACTCTATGGAGTGCTCAAGATGTTTGTGTCTCGTTTGGAATTGGGATGAGGAAACTGC 527
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 TAACTCTCTGGAGTGCTCAAGATGTTTCTGTCTCGTTTGGAATTGGGATGAGGAAACTGC 528
Query 528 ATTTTTCGTTTTCTTGGTATCAAAAGGATTATCGTCTTGAGCTTTCGTATGAGAATATAT 587
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 ATTTTTCGTTTTCTTGGTATCAAAAGGACTATCGTCTTGAGCTTTCGTATGAGAATATAT 588
Query 588 GGCAGATTGATTTGCATTCTCCGCAAGGACGATCATCGAAGTTTCTTGTGATTCAGGTGA 647
||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 GGCAGATCGATTTGCATTCCCCGCAAGGACGGGCGTCGAAGTTTCTTGTGATTCAGGTGA 648
Query 648 TTGGTGCTCCTAAAATATTTGAGAAAGAGGATCAACCTATCAATCTTTTGTTTGGAATAA 707
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 649 TTGGTGCTCCTAAAATCTTTGAGAAAGAGGATCAACCTATCAATCTTTTGTTTGGAATGA 708
Query 708 TGGATTTTTACAGTGATGGGTCTGATGAGCAATGGATTAGAACTACAGATTTCACTTCAT 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 709 TGGATTTTTACAGTGATGGGTCTGATGAGCAATGGATAAGGACTACAGATTTCACTTCAT 768
Query 768 CTTCTTGTATTGGTCAATCAACAGCGTTTTGTTTAGAGCTTCCTGTTCATCTTAATGTTC 827
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 CTTCTTGTATCGGTCAATCAACAGCCTTCTGTTTAGAGCTTCCTGTTCATCTTAATGTTC 828
Query 828 CTGATTTCAGAGAGAATTTTGCCAACTATGCAGAGCACAGAGCCAGCTCTTTTCTCATTG 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 829 CTGATTTCAGAGAGAATTTTGCCAACTATGCAGAGCACAGAGCCAGCACTTATCTCATTG 888
Query 888 AATCTGGTTCTAGCTATTCATCTAATGCTAACACA-CTTGTTCCTGTTGTTGATCCTCCT 946
|||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 889 AATCCGGTTCTAGCTATTCATCTAACGCGAACA-AGCTTGTTCCGGTTGTTGATCCTCCT 947
Query 947 CCAGGGTTTAG-TTTGCCTTTTGAGATCTTGTTTAAACTTAACACATTGGTGCAGAACGC 1005
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 948 CCAGGGTTT-GATTTGCCTTTTGAGATCTTGTTTAAACTTAATACATTGGTGCAGAACGC 1006
Query 1006 GTGTCTCTCCGGGCCAGCTCTTGATCTTGACT-TTTATCGGTTGCTTAAT--CAGAAAAA 1062
||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||
Sbjct 1007 GTGTCTCCCCGGGCCAGCTCTTGATCTTGA-TGTTTATCAGTTGCTTAATCCCA-AAAAA 1064
Query 1063 ATATGATAGAGCTCTCATAGATCACTGTCTTGAAAAACTCTTTCACCTTGGAGAATGTTG 1122
|| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||
Sbjct 1065 AT-TGACAGAGCTCTCATAGATCACTGTCTTGAGAAACTCTTTTACCTTGGGGAATCTTG 1123
Query 1123 CTATGAGCCTGCTCATTGGCTTCGCGATGAGTACAAGAAGTGGATATCGAAAGGAAAGCT 1182
|||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||
Sbjct 1124 CTATGAGCCTGCTCGTTGGCTTCGCAAACAGTACAAGGAGTTGAGCTCGAAAGGAAAGCT 1183
Query 1183 TCCACTGTCTCCTACAATATCTCTTGATGATGGACTTGTTTATATGTATCGCGTTCAAGT 1242
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TCCACTGTCTCCTACGATATCTCTTGATGATGGACTTGTTTATATGTATCGCGTTCAAGT 1243
Query 1243 TACACCAGCAAGAGTCTATTTCTCTGGACCGGAGGTGAATGTTTCTAATCGTGTGCTTCG 1302
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1244 TACACCAGCAAGAGTCTATTTCTCTGGACCAGAGGTGAATGTTTCGAATCGTGTGCTTCG 1303
Query 1303 ACATTACTCCAAGTATATCAACAACTTCCTCAGGGTCTCATTTGTTGATGAAGATCTTGA 1362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 ACATTACTCCAAGTATATCAACAACTTCCTCAGGGTATCATTTGTTGATGAAGATCTTGA 1363
Query 1363 AAAGGTTCGTTCCATGGATCTATCTCCACGCTCTTCTACTCAAAGAAGAACCAAGTTATA 1422
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364 AAAAGTTCGTTCCATGGATCTGTCTCCACGCTCTTCTACTCAAAGAAGAACCAAGTTATA 1423
Query 1423 CGACAGGATATATTCTGTTCTTCGCGATGGGATTGTCATAGGCGATAAGAAGTTTGAGTT 1482
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424 CGACAGGATATACTCTGTCCTTCGCGATGGGATTGTCATAGGCGATAAGAAGTTTGAGTT 1483
Query 1483 TCTCGCCTTTTCTTCCAGCCAGTTGCGGGAGAACTCTGCTTGGATGTTTGCACCAATAGA 1542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1484 TCTCGCCTTTTCTTCCAGCCAGTTGCGGGAGAACTCTGCTTGGATGTTTGCACCGATAGA 1543
Query 1543 TCGGATTACAGCAGCACATATCAGAGCTTGGATGGGTGATTTTGACCATATAAGAAATGT 1602
|| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 GGGGCTAACATCAGCACACATCAGAGCTTGGATGGGTGATTTTGACCATATAAGAAATGT 1603
Query 1603 AGCTAAATATGCTGCAAGGCTTGGTCAATCTTTTAGCTCTTCAAGAGAGACACTTAATGT 1662
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1604 AGCAAAATATGCTGCAAGGCTTGGTCAATCATTTAGCTCGTCAAGAGAGACACTCAATGT 1663
Query 1663 TAGGAGTGATGAGATTGAAGTGATTCCTGATGTTGAGATTATATCTTTAGGGACACGCTA 1722
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664 TAGGAGTGATGAGATCGAAGTGATTCCTGATGTTGAGATTATATCTTTAGGGACACGCTA 1723
Query 1723 TGTGTTTTCCGATGGAATAGGAAAGATATCAGCTGAATTTGCTAGAAAGGTAGCGAGGAA 1782
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || | |||
Sbjct 1724 TGTGTTTTCTGATGGAATAGGAAAGATCTCAGCTGAATTTGCTAGACGGGTGGCTAAGAA 1783
Query 1783 ATGTGGTCTTACAGAGTTTTCTCCATCTGCTTTTCAAATCCGTTATGGCGGTTATAAAGG 1842
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1784 ATGTGGCCTCACAGAGTTTTCTCCATCTGCTTTTCAAATCCGTTATGGCGGTTATAAAGG 1843
Query 1843 AGTGGTGGCTGTTGATCCAAACTCATCAAAGAAACTGTCTCTGAGGAAGAGTATGAGCAA 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1844 AGTGGTGGCTGTTGATCCAAACTCATCAAAGAAACTGTCTCTGAGGAAGAGTATGAGCAA 1903
Query 1903 ATTCGAATCGGAGAACACCAAGCTTGATGTTCTGGCGTGGAGCAAGTACCAACCTTGTTA 1962
|||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1904 ATTCGAGTCGGAGAACACGAAGCTTGATGTTTTGGCATGGAGCAAGTACCAACCTTGTTA 1963
Query 1963 TATGAACAGACAACTGATTACACTTTTGTCTACTCTTGGAGTT-ACGGACAGTGTGTTTG 2021
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||
Sbjct 1964 TATGAACAGACAACTGATTACACTTTTGTCTACTCTCGGAGTTGA-GGACAGTGTATTTG 2022
Query 2022 AGAAGAAACAAAGGGAAGTTGTGGATCGTCTCGACGCAATCTTGACTCATCCTTTGGAAG 2081
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |
Sbjct 2023 AGAAGAAACAAAGGGAAGTTGTGGATCGGCTCGACGCAATCTTAACTGATCCTTTGGAGG 2082
Query 2082 CTCACGAGGCTCTTGGTTTAATGGCTCCAGGGGAAAACACAAATATTCTCAAGGCATTGA 2141
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083 CTCACGAGGCTCTTGGTTTAATGGCTCCAGGGGAGAACACAAATATTCTCAAGGCATTGA 2142
Query 2142 TCTTGTGTGGCTATAAACCTGACGCTGAACCTTTCCTTTCAATGATGCTTCAGAATTTCA 2201
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 TCTTGTGTGGCTATAAACCTGACGCCGAACCTTTCCTTTCAATGATGCTTCAGAATTTCA 2202
Query 2202 GGGCATCTAAGTTGTTGGAACTACGGACAAAAACAAGGATTTTCATTTCTGGTGGAAGAT 2261
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2203 GGGCATCTAAGTTGTTAGAACTACGGACAAAAACAAGGATTTTCATTTCTGGTGGAAGAT 2262
Query 2262 CTATGATGGGATGCCTAGACGAGACCAGAACACTGGAGTATGGTCAGGTAGTAGTGCAGT 2321
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2263 CTATGATGGGATGCCTAGATGAGACCAGAACATTGGAGTACGGTCAGGTAGTAGTGCAGT 2322
Query 2322 ATTCAGATCCCATGAGGCCGGGAAGGCGATTCATCATCACCGGACCTGTTGTTGTTGCCA 2381
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2323 ATTCAGATCCCATGAGGCCGGGAAGGCGATTCATCATCACCGGACCTGTTGTTGTTGCGA 2382
Query 2382 AAAACCCATGCCTGCATCCTGGTGACGTGCGTGTTCTTCAAGCTGTCAATGTCCCAGCTT 2441
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2383 AAAACCCTTGCTTGCATCCTGGTGACGTGCGTGTTCTTGAAGCTGTCAATGTCCCAGCTT 2442
Query 2442 TAAATCATATGGTGGACTGCGTTGTGTTCCCGCAAAAGGGCTTGAGGCCACACCCAAATG 2501
| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2443 TGAATCACATGGTGGACTGCGTTGTTTTCCCGCAAAAGGGATTGAGGCCACACCCAAACG 2502
Query 2502 AATGTTCTGGGAGTGATTTAGATGGAGATATTTACTTTGTATGTTGGGATCAAGAATTGG 2561
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 AATGTTCTGGGAGTGATTTAGATGGAGATATATACTTTGTATGTTGGGATCAAGAATTGA 2562
Query 2562 TTCCGCCAAGAACGTCTGAACCAATGGACTACACTCCTGAACCAACTCAAATCTTGGATC 2621
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2563 TTCCACCAAGAACGTCTGAACCAATGGACTACACTCCTGAACCTGCTCAAATTTTGGATC 2622
Query 2622 ATGATGTCACAATTGAGGAAGTTGAAGAGTACTTTGCGAACTACATTGTGAATGATAGTT 2681
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 ATGATGTCACAATTGAGGAAGTTGAAGAGTACTTCGCAAACTACATTGTGAATGATAGTT 2682
Query 2682 TAGGGATCATCGCGAATGCTCATACCGCCTTTGCGGATAAGGAACCACTCAAGGCGTTTA 2741
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2683 TAGGTATCATCGCGAACGCTCATACCGCCTTTGCGGATAAGGAACCACTCAAGGCGTTTA 2742
Query 2742 GTGACCCATGCATTGAGCTTGCAAAGAAGTTTTCAACTGCGGTAGATTTCCCAAAAACTG 2801
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2743 GTGACCCATGCATTGAGCTTGCAAGGAAGTTTTCAGTTGCGGTAGATTTCCCAAAAACTG 2802
Query 2802 GTGTTGCAGCTGTGATACCGCAACATCTTTACGTGAAAGAGTATCCTGATTTCATGGAGA 2861
||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803 GTGTTGCCGCAGAGATACCGCAACATCTTTACGTGAAAGAGTATCCTGATTTCATGGAGA 2862
Query 2862 AACCGGATAAGCCAACATATGAGTCGAAGAACGTGATTGGTAAGCTTTTTAGAGAGGTAA 2921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2863 AACCGGATAAGCCAACATATGAGTCGAAGAACGTGATCGGTAAGCTTTTTAGAGAGGTAA 2922
Query 2922 AAGAGCGAGCTCCACCGTTGATCTCGATCAAATCATTCACGCTTGATGTGGCCTCAAAGT 2981
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||
Sbjct 2923 AAGAGCGAGCTCCACCGCTGATCTCGATCAAATCATTTACTCTTGATGTGGCCTTAAAGT 2982
Query 2982 CTTATGATAAAGACATGGAAGTTGACGGATTTGAGGAGTATGTTGATGAAGCTTTCTACC 3041
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2983 CTTATGATAAAGACATGGAAGTTGACGGATTTGAGGAGTATGTTGATGAAGCTTTCCACT 3042
Query 3042 AGAAGGCGAATTATGATTTCAAGTTAGGTAATTTGATGGATTACTATGGGATTAAGACTG 3101
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3043 ACAAGGCGAATTATGATTTCAAGTTAGGTAATTTAATGGATTACTATGGGATTAAGACTG 3102
Query 3102 AGGCTGAGATTCTTAGTGGTGGTATAATGAGGATGTCAAAGTCATTCACCAAGAGACGAG 3161
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3103 AGGCTGAGATACTTAGTGGTGGTATCATGAGGATGTCAAAGTCATTCACCAAGAGAAGAG 3162
Query 3162 ATGCAGAATCGATTGGAAGAGCGGTTCGGGCGTTGAGGAAAGAAACTTTGTCGTTGTTCA 3221
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3163 ATGCAGAGTCGATTGGAAGAGCGGTTCGTGCGTTGAGGAAAGAAACTTTGTCGTTGTTCA 3222
Query 3222 ATGCTTCTGAAGAAGAAGAAAATGAGTCAGCAAAGGCTTCGGCTTGGTATCATGTAACGT 3281
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3223 ATGCTTCTGAAGAAGAA-AA--TGAGTCAGCAAAGGCTTCGGCTTGGTATCATATAACGT 3279
Query 3282 ACCACTCAAGTTACTGGGGACTTTATAATGAGGGTTTGAATCGTGACCATTTCTTAAGTT 3341
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3280 ACCACTCAAGTTACTGGGGACTTTATAATGAGGGTTTGAATCGTGACCATTTCTTAAGCT 3339
Query 3342 TTGCGTGGTGCGTTTATGATAAGCTTGTGAGGATCAAGAAGACCAAT-CTTGGGAGGCGT 3400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 3340 TTGCGTGGTGCGTTTATGATAAGCTTGTGAGGATCAAGAAGACCAATGCT-GGGAGGCGT 3398
Query 3401 CAGCGGCAGGAGACGCTCGAGCGGTTAGACCATGTTCTGCGTTTCG-GTTGAtttttttt 3459
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |
Sbjct 3399 CAGAGGCAGGAGACGCTCGAGCGGTTAGGCCATGTTCTGCGTTT-GAGTTGATTTTTTAT 3457
Query 3460 tttt 3463
||||
Sbjct 3458 TTTT 3461
> Ahg493674 jgi|Araly1|493674|fgenesh2_kg.7__3107__AT1G14790.1
Length=3491
Score = 4405 bits (2385), Expect = 0.0
Identities = 2661/2793 (95%), Gaps = 23/2793 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 681 AACCTATCAATCTTTTGTTTGGAATAATGGATTTTTACAGTGATGGGTCTGATGAGCAAT 740
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 AACCTATCAATCTTTTGTTTGGAATGATGGATTTTTACAGTGATGGGTCTGATGAGCAAT 589
Query 741 GGATTAGAACTACAGATTTCACTTCATCTTCTTGTATTGGTCAATCAACAGCGTTTTGTT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 590 GGATTAGAACTACAGATTTCACTTCATCTTCTTGTATCGGTCAATCAACAGCCTTCTGTT 649
Query 801 TAGAGCTTCCTGTTCATCTTAATGTTCCTGATTTCAGAGAGAATTTTGCCAACTATGCAG 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 TAGAGCTTCCTGTTCATCTTAATGTTCCTGATTTCAGAGAGAATTTTGCCAACTATGCAG 709
Query 861 AGCACAGAGCCAGCTCTTTTCTCATTGAATCTGGTTCTAGCTATTCATCTAATGCTAACA 920
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 710 AGCACAGAGCCAGCCCTTTTCTCATTGAATCCGGTTCTAGCTATTCATCTAATGCGAACA 769
Query 921 CA-CTTGTTCCTGTTGTTGATCCTCCTCCAGGGTTTAG-TTTGCCTTTTGAGATCTTGTT 978
| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 770 -AGCTCGTTCCGGTTGTTGATCCTCCTCCAGGGTTT-GATTTGCCTTTTGAGATCTTGTT 827
Query 979 TAAACTTAACACATTGGTGCAGAACGCGTGTCTCTCC-GGGCCAGCTCTTGATCTTGACT 1037
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |
Sbjct 828 TAAACTTAATACATTGGTGCAGAACGCATGTCTC-CCAGGGCCAGCTCTTGATCTTGA-T 885
Query 1038 -TTTATCGGTTGCTTAAT--CAGAAAAAATATGATAGAGCTCTCATAGATCACTGTCTTG 1094
|||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 GTTTATCAGTTGCTTAATCCCA-AAAAAAT-TGACAGAGCTCTCATAGATCACTGTCTTG 943
Query 1095 AAAAACTCTTTCACCTTGGAGAATGTTGCTATGAGCCTGCTCATTGGCTTCGCGATGAGT 1154
| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||
Sbjct 944 AGAAACTCTTTTACCTTGGGGAATCTTGCTATGAGCCTGCTCGTTGGCTTCGCAAACAGT 1003
Query 1155 ACAAGAAGTGGATATCGAAAGGAAAGCTTCCACTGTCTCCTACAATATCTCTTGATGATG 1214
||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1004 ACAAGGAGTTGAGCTCGAAAGGAAAGCTTCCACTGTCTCCTACGATATCTCTTGATGATG 1063
Query 1215 GACTTGTTTATATGTATCGCGTTCAAGTTACACCAGCAAGAGTCTATTTCTCTGGACCGG 1274
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1064 GACTTGTTTATATGTATCGCGTTCAAGTTACACCAGCAAGAGTCTATTTCTCTGGACCAG 1123
Query 1275 AGGTGAATGTTTCTAATCGTGTGCTTCGACATTACTCCAAGTATATCAACAACTTCCTCA 1334
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 AGGTGAATGTTTCGAATCGTGTGCTTCGACATTACTCCAAGTATATCAACAACTTCCTCA 1183
Query 1335 GGGTCTCATTTGTTGATGAAGATCTTGAAAAGGTTCGTTCCATGGATCTATCTCCACGCT 1394
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1184 GGGTATCATTTGTTGATGAAGATCTTGAAAAAGTTCGTTCCATGGATCTGTCTCCACGCT 1243
Query 1395 CTTCTACTCAAAGAAGAACCAAGTTATACGACAGGATATATTCTGTTCTTCGCGATGGGA 1454
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1244 CTTCTACTCAAAGAAGAACCAAGTTATACGACAGGATATACTCTGTTCTTCGCGATGGGA 1303
Query 1455 TTGTCATAGGCGATAAGAAGTTTGAGTTTCTCGCCTTTTCTTCCAGCCAGTTGCGGGAGA 1514
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 TTGTCATCGGCGATAAGAAGTTTGAGTTTCTCGCTTTTTCTTCCAGCCAGTTGCGGGAGA 1363
Query 1515 ACTCTGCTTGGATGTTTGCACCAATAGATC-GGATTACAGCAGCACATATCAGAGCTTGG 1573
|||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1364 ACTCTGCTTGGATGTTTGCACCGATAGA-CGGGCTAACATCAGCACATATCAGAGCTTGG 1422
Query 1574 ATGGGTGATTTTGACCATATAAGAAATGTAGCTAAATATGCTGCAAGGCTTGGTCAATCT 1633
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 ATGGGTGATTTTGACCATATAAGAAATGTAGCAAAATATGCTGCAAGGCTTGGTCAATCT 1482
Query 1634 TTTAGCTCTTCAAGAGAGACACTTAATGTTAGGAGTGATGAGATTGAAGTGATTCCTGAT 1693
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1483 TTTAGCTCGTCAAGAGAGACACTCAATGTTAGGAGTGATGAGATCGAAGTGATTCCTGAT 1542
Query 1694 GTTGAGATTATATCTTTAGGGACACGCTATGTGTTTTCCGATGGAATAGGAAAGATATCA 1753
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1543 GTTGAGATTATATCTTTAGGGACACGCTATGTGTTTTCTGATGGAATAGGAAAGATCTCA 1602
Query 1754 GCTGAATTTGCTAGAAAGGTAGCGAGGAAATGTGGTCTTACAGAGTTTTCTCCATCTGCT 1813
||||||||||||||| ||| || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 GCTGAATTTGCTAGACGGGTGGCTAAGAAATGTGGCCTCACAGAGTTTTCTCCATCTGCT 1662
Query 1814 TTTCAAATCCGTTATGGCGGTTATAAAGGAGTGGTGGCTGTTGATCCAAACTCATCAAAG 1873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 TTTCAAATCCGTTATGGCGGTTATAAAGGAGTGGTGGCTGTTGATCCAAACTCATCAAAG 1722
Query 1874 AAACTGTCTCTGAGGAAGAGTATGAGCAAATTCGAATCGGAGAACACCAAGCTTGATGTT 1933
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1723 AAACTGTCTCTGAGGAAGAGTATGAGCAAATTCGAGTCGGAGAACACGAAGCTTGATGTT 1782
Query 1934 CTGGCGTGGAGCAAGTACCAACCTTGTTATATGAACAGACAACTGATTACACTTTTGTCT 1993
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 TTGGCATGGAGCAAGTACCAACCTTGTTATATGAACAGACAACTGATTACACTTTTGTCT 1842
Query 1994 ACTCTTGG-AGTTACGGACAGTGTGTTTGAGAAGAAACAAAGGGAAGTTGTGGATCGTCT 2052
||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1843 ACTCTCGGGA-TTAAAGACAGTGTATTTGAGAAGAAACAAAGGGAAGTTGTGGATCGGCT 1901
Query 2053 CGACGCAATCTTGACTCATCCTTTGGAAGCTCACGAGGCTCTTGGTTTAATGGCTCCAGG 2112
|||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 CGACGCAATCTTAACTGATCCTTTGGAGGCTCACGAGGCTCTTGGTTTAATGGCTCCAGG 1961
Query 2113 GGAAAACACAAATATTCTCAAGGCATTGATCTTGTGTGGCTATAAACCTGACGCTGAACC 2172
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1962 GGAGAACACAAATATTCTCAAGGCATTGATCTTGTGTGGCTATAAACCTGACGCCGAACC 2021
Query 2173 TTTCCTTTCAATGATGCTTCAGAATTTCAGGGCATCTAAGTTGTTGGAACTACGGACAAA 2232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2022 TTTCCTTTCAATGATGCTTCAGAATTTCAGGGCATCTAAGTTGTTAGAACTACGGACAAA 2081
Query 2233 AACAAGGATTTTCATTTCTGGTGGAAGATCTATGATGGGATGCCTAGACGAGACCAGAAC 2292
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2082 AACAAGGATTTTCATTTCTGGTGGAAGATCTATGATGGGATGCCTAGATGAGACCAGAAC 2141
Query 2293 ACTGGAGTATGGTCAGGTAGTAGTGCAGTATTCAGATCCCATGAGGCCGGGAAGGCGATT 2352
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 ATTGGAGTACGGTCAGGTAGTAGTGCAGTATTCAGATCCCATGAGGCCGGGAAGGCGATT 2201
Query 2353 CATCATCACCGGACCTGTTGTTGTTGCCAAAAACCCATGCCTGCATCCTGGTGACGTGCG 2412
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2202 CATCATCACCGGACCTGTTGTTGTTGCGAAAAACCCTTGCTTGCATCCTGGTGACGTGCG 2261
Query 2413 TGTTCTTCAAGCTGTCAATGTCCCAGCTTTAAATCATATGGTGGACTGCGTTGTGTTCCC 2472
||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2262 TGTTCTTGAAGCTGTCAATGTCCCAGCTTTGAATCACATGGTGGACTGCGTTGTATTCCC 2321
Query 2473 GCAAAAGGGCTTGAGGCCACACCCAAATGAATGTTCTGGGAGTGATTTAGATGGAGATAT 2532
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 GCAAAAGGGATTGAGGCCACACCCAAACGAATGTTCTGGGAGTGATTTAGATGGAGATAT 2381
Query 2533 TTACTTTGTATGTTGGGATCAAGAATTGGTTCCGCCAAGAACGTCTGAACCAATGGACTA 2592
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 ATACTTTGTATGTTGGGATCAAGAATTGATTCCACCAAGAACGTCTGAACCAATGGACTA 2441
Query 2593 CACTCCTGAACCAACTCAAATCTTGGATCATGATGTCACAATTGAGGAAGTTGAAGAGTA 2652
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 CACTCCTGAACCAGCTCAAATCTTGGATCATGATGTCACTATTGAGGAAGTTGAAGAGTA 2501
Query 2653 CTTTGCGAACTACATTGTGAATGATAGTTTAGGGATCATCGCGAATGCTCATACCGCCTT 2712
||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2502 CTTCGCAAACTACATTGTGAATGATAGTTTAGGTATCATCGCAAATGCTCATACCGCCTT 2561
Query 2713 TGCGGATAAGGAACCACTCAAGGCGTTTAGTGACCCATGCATTGAGCTTGCAAAGAAGTT 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2562 TGCGGATAAGGAACCACTCAAGGCGTTTAGTGACCCATGCATTGAGCTTGCAAGGAAGTT 2621
Query 2773 TTCAACTGCGGTAGATTTCCCAAAAACTGGTGTTGCAGCTGTGATACCGCAACATCTTTA 2832
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
Sbjct 2622 TTCAGTTGCGGTAGATTTCCCAAAAACTGGTGTTGCCGCTGAGATACCGCAACATCTTCA 2681
Query 2833 CGTGAAAGAGTATCCTGATTTCATGGAGAAACCGGATAAGCCAACATATGAGTCGAAGAA 2892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 CGTGAAAGAGTATCCTGATTTCATGGAGAAACCGGATAAGCCAACATATGAGTCGAAGAA 2741
Query 2893 CGTGATTGGTAAGCTTTTTAGAGAGGTAAAAGAGCGAGCTCCACCGTTGATCTCGATCAA 2952
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 CGTGATCGGTAAGCTTTTTAGAGAGGTAAAAGAGCGAGCTCCACCGTTGATCTCGATCAA 2801
Query 2953 ATCATTCACGCTTGATGTGGCCTCAAAGTCTTATGATAAAGACATGGAAGTTGACGGATT 3012
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802 ATCATTCACTCTTGATGTGGCCTTAAAGTCTTATGATAAAGACATGGAAGTTGACGGATT 2861
Query 3013 TGAGGAGTATGTTGATGAAGCTTTCTACCAGAAGGCGAATTATGATTTCAAGTTAGGTAA 3072
||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 TGAGGAGTATGTTGATGAAGCTTTCCACTACAAGGCGAATTATGATTTCAAGTTAGGTAA 2921
Query 3073 TTTGATGGATTACTATGGGATTAAGACTGAGGCTGAGATTCTTAGTGGTGGTATAATGAG 3132
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2922 TTTAATGGATTACTATGGGATTAAGACTGAGGCTGAGATACTTAGTGGTGGTATCATGAG 2981
Query 3133 GATGTCAAAGTCATTCACCAAGAGACGAGATGCAGAATCGATTGGAAGAGCGGTTCGGGC 3192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 GATGTCAAAGTCATTCACCAAGAGACGAGATGCAGAGTCGATTGGAAGAGCGGTTCGGGC 3041
Query 3193 GTTGAGGAAAGAAACTTTGTCGTTGTTCAATGCTTCTGAAGAAGAAGAAAATGAGTCAGC 3252
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||
Sbjct 3042 GTTGAGGAAAGAAACTTTGTCGTTGTTCAATGCCACTGAAGAAGAA-AA--TGAGTCAGC 3098
Query 3253 AAAGGCTTCGGCTTGGTATCATGTAACGTACCACTCAAGTTACTGGGGACTTTATAATGA 3312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099 AAAGGCTTCGGCTTGGTATCATGTAACGTACCACTCAAGTTACTGGGGACTTTATAATGA 3158
Query 3313 GGGTTTGAATCGTGACCATTTCTTAAGTTTTGCGTGGTGCGTTTATGATAAGCTTGTGAG 3372
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3159 GGGTTTGAATCGTGACCATTTCTTAAGCTTTGCGTGGTGCGTTTATGATAAGCTTGTGAG 3218
Query 3373 GATCAAGAAGACCAAT-CTTGGGAGGCGTCAGCGGCAGGAGACGCTCGAGCGGTTAGACC 3431
|||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3219 GATCAAGAAGACCAATGCT-GGGAGGCGTCAGAGGCAGGAGACGCTCGAGCGGTTAGGCC 3277
Query 3432 ATGTTCTGCGTTTCG-GTTGAtttttttttttt 3463
||||||||||||| | ||||||||||| |||||
Sbjct 3278 ATGTTCTGCGTTT-GAGTTGATTTTTTATTTTT 3309
Score = 800 bits (433), Expect = 0.0
Identities = 495/524 (94%), Gaps = 7/524 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 125 AAGATGGGGAAGACAATTCAAGTGTTTGGATTCCCTAATGGTGTGAGCGCAGAAGAAGTT 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 AAGATGGGGAAGACAATTCAAGTGTTTGGATTCCCGAATGGTGTGAGCGCAGAGGAAGTT 60
Query 185 AAGAAGTTTCTTGAAAGACTCACTGGTTCAGGCACTGTTTACGCAATCAAAGTTAGACAA 244
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAGAAATTTCTTGAAAGACTCACTGGTTCAGGCACTGTTTACGCAATCAAAGTTAGACAA 120
Query 245 CCAAAGAAAGGTGGTCCAAGAGTCTATGCCATTGTTCAATTCACATCTGAGAGACATACG 304
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 121 CCAAAGAAAGGTGGTCCAAGAGTCTTTGCCATTGTTCAATTCACATATGAGAGACATGCG 180
Query 305 AGGCTGATCATCACTGCG-GCAGCAGAACGT---CTTTACTATGGAAGATCTTATCTCAA 360
|||| ||||||||| | | || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 181 AGGCAGATCATCACGG-GTGCCGCAGAACGTAGTCTTTATTATGGGAGATCTTATCTCAA 239
Query 361 GGCTTTTGAAGTTGAACAAGACATTGTTCCAAAGCCAAGAGCTTCATTACACACCATCTC 420
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 240 TGCTTTTGAAGTGGAACAAGACATTGTTCCAAAGCCAAGAGCTTCATTGCACAACATCTC 299
Query 421 TGGTTTAAAGATGT-TCTTTGGATGTCAAGTCTCGACTAAGAAGTTTTTAACTCTATGGA 479
|||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 300 TGGTTTAAAGATGTAT-TTTGGATGTCAAGTCTCAACTAAGAAGTTTTTAACTCTCTGGA 358
Query 480 GTGCTCAAGATGTTTGTGTCTCGTTTGGAATTGGGATGAGGAAACTGCATTTTTCGTTTT 539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 359 GTGCTCAAGATGTTTGTGTCTCGTTTGGAATTGGGATGAGAAAACTGCATTTTTCGTTTT 418
Query 540 CTTGGTATCAAAAGGATTATCGTCTTGAGCTTTCGTATGAGAATATATGGCAGATTGATT 599
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 419 CTTGGTATCAAAAGGACTATCGTCTTGAGCTTTCGTATGAGAATATATGGCAGATCGATT 478
Query 600 TGCATTCTCCGCAAGGACGATCATCGAAGTTTCTTGTGATTCAG 643
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TGCATTCTCCGCAAGGACGGTCGTCGAAGTTTCTTGTGATTCAG 522
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 143857625940
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5