BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G15750.1
Length=3829
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg471773 jgi|Araly1|471773|fgenesh2_kg.1__1727__AT1G15750.2 6185 0.0
Ahg927456 jgi|Araly1|927456|scaffold_203017.1 2555 0.0
> Ahg471773 jgi|Araly1|471773|fgenesh2_kg.1__1727__AT1G15750.2
Length=3851
Score = 6185 bits (3349), Expect = 0.0
Identities = 3588/3700 (97%), Gaps = 29/3700 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 57 GAGATGCGAAGTTTCTGGATAATTATTCAGATATAGATCTGGTGATAG-TTTGGTTAGTT 115
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
Sbjct 171 GAGATGCGAAGTTTCTGGATATTTTTTCAGATATAGATCTGGTGATAGTTTTGG-TAGGT 229
Query 116 GTTGTGCATCTGAGTTAGAAAAAAGTCTTTTAAGGAAGTGAG-AGAAAACATGTCTTCTC 174
|||||| ||| | | | |||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 230 GTTGTGAATC-----T-G-----A----TTTAAGGAAGTGAGAAAAAAACATGTCTTCTC 274
Query 175 TTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTCGATGAAGAGAAGTTTAAAGAGA 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 TTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTTGATGAAGAGAAGTTTAAAGAGA 334
Query 235 CTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTATTTTGAGGATG 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 CTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTATTTTGAGGATG 394
Query 295 AGGTTCACAATGGAAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTTTCACTAAAGTAG 354
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 AGGTGCACAATGGTAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTTTCACTAAAGTAG 454
Query 355 ATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGAAGTATCTCGAGG 414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 ATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGAAGTATCTCGAGG 514
Query 415 CTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGGATTTGAAAGTGT 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 CTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGGATTTGAAAGTGT 574
Query 475 TTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACACAGCTCTTGACATTGGAGAACT 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 575 TTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACGCAGCTCTTGACATTGGAGAACT 634
Query 535 TCCGGGAGAATGAACAGTTATCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAAGAGCGATCATGT 594
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 635 TCCGGGAGAATGAACAGTTGTCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAAGAGCTATAATGT 694
Query 595 TGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCTTTATTCCGTGATAAATTGCAGTTCC 654
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 695 TGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCGTTGTTCCGTGATAAATTGCAGTTCC 754
Query 655 CTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAAATTGGCAACACC 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 755 CTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAAATTGGCAGCATC 814
Query 715 AGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATCAAGACTCTTTTTGTGGATCACTCTT 774
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATAAAGACTCTTTTTGTGGATCACTCTT 874
Query 775 GTGGCCCTCCAAATGGCGCACGAGCTCCATCTCCTGTGAACAATCCACTGCTTGGAGGGA 834
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 875 GTGGCCCTCCAAATGGCGCACGGGCTCCATCGCCTGTGAACAATCCTCTGCTTGGAGGAA 934
Query 835 TACCAAAGGCTGGAGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTTCAACCAACGGCGT 894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 935 TACCAAAGGCTGGAGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTTCAACCAACGGCAT 994
Query 895 CACCTGTTCCAACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTCTGTCCCACATCCAG 954
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 CACCCGTTCCAACGCCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTCTGTCCCACATCCAG 1054
Query 955 CTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGCGGCGTTGAAGCACC 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1055 CTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGCGGCATTGAAGCACC 1114
Query 1015 CGAGAACTCCTCCAACTAATGCTTCTTTAGACTACCCGTCAGCAGATTCTGAACATGTCT 1074
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 CGAGAACTCCTCCAACTAATGCTGCTTTAGACTACCCGTCAGCAGATTCTGAACATGTCT 1174
Query 1075 CAAAAAGAACAAGACCAATGGGAATCTCTGACGAGGTGAATCTAGGCGTGAACATGTTAC 1134
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 CAAAAAGAACAAGGCCAATGGGAATTTCTGACGAGGTGAATCTAGGCGTGAACATGTTAC 1234
Query 1135 CGATGTCATTTTCAGGGCAGGCCCATGGTCATTCTCCGGCTTTCAAAGCACCTGACGACT 1194
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1235 CGATGTCATTTTCAGGGCAGGCCCATGGTCATACTCCGGCTTTCAAAGCACCTGATGACT 1294
Query 1195 TGCCCAAGACAGTTGCGAGAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCATGAGCATGGATTTCC 1254
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 TGCCCAAGACAGTTGCGCGAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCATGAGCATGGATTTCC 1354
Query 1255 ATCCAATTAAACAGACCCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTGATATCGGGCTGTGGG 1314
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 ATCCAATTAAACAGACTCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTGATATCGGGCTGTGGG 1414
Query 1315 AAGTTGGTTCTCGCGAAAGATTAGTACAGAAGACGTTCAAAGTCTGGGATTTGAGTAAAT 1374
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 AAGTTGGTTCTCGCGAAAGATTAGTACAGAAGACCTTCAAAGTCTGGGATTTGAGTAAAT 1474
Query 1375 GTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCTGTCAACCGTGTGA 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 GTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCTGTCAACCGTGTGA 1534
Query 1435 TATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGACATATTGTACAACTAT 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1535 TATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGACATATTGTGCAACTAT 1594
Query 1495 ACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTGATGCTCATGTTGGTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 ACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTGGAGATTGATGCTCATGTTGGTG 1654
Query 1555 GTGTGAATGATATTTCCTTCTCGACTCCAAACAAGCAACTATGTGTAATAACTTGTGGTG 1614
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 GTGTGAACGATATTTCCTTCTCGACTCCGAACAAGCAACTATGTGTAATAACTTGTGGTG 1714
Query 1615 ATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAAAGGCATACTTTTGAAG 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 ATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAAAGGCATACTTTTGAAG 1774
Query 1675 GCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGAAAACATTCAGTTCATAT 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 GCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGAAAACATTCAGTTCATAT 1834
Query 1735 TTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCTTGGTTGTATGATAATATGGGTTCCCGAG 1794
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835 TTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCATGGTTGTATGATAATATGGGTTCCCGAG 1894
Query 1795 TTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTATAGTGCCGATGGTACTA 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895 TTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTATAGTGCCGATGGTACTA 1954
Query 1855 GGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCATTGTTGAGTGGAATGAAA 1914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1955 GGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCATTGTTGAGTGGAATGAAA 2014
Query 1915 GCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCTCTAGGTGTTGTGC 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 GCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCTCTAGGTGTTGTGC 2074
Query 1975 AGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGATTTCTCCATCAAGTTCT 2034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2075 AGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGACTTCTCCATCAAGTTCT 2134
Query 2035 GGGATATGGACGCTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGCGATGGAGGCCTCCAGGCAA 2094
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 GGGATATGGACACTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGCGATGGAGGCCTCCAGGCAA 2194
Query 2095 GCCCGCGTATCCGGTTCAACAAGGAAGGCTCTCTCCTGGCCGTGTCTGGCAACGAGAATG 2154
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2195 GCCCGCGTATCCGGTTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCGTGTCTGGAAACGAGAATG 2254
Query 2155 TGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGCACACTTTTGAGAACATAT 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2255 TGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGCACACTTTTGAGAACATAT 2314
Query 2215 CATCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATAAACAGCATAGCAGCGGCAGCGGCAGCTGCTGCAA 2274
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2315 CATCTGAATCCTCTAAGCCTGCAATAAACAGCATTGCAGCGGCAGCGGCAGCTGCTGCAA 2374
Query 2275 CAAGTGCTGGTCACGCAGATCGATCAGCCAATGTAGTTTCCATCCAAGGAATGAATGGAG 2334
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2375 CGAGTGCTGGTCACGCAGATCGATCAGCCAATGTAGTTTCCATCCAAGGAATGAATGGAG 2434
Query 2335 ATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAGTGATCACAGAAGAATCAAATGATAAGTCTA 2394
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 ATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAGTGATTACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTA 2494
Query 2395 AGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGCCTTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTG 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2495 AGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGCCTTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTG 2554
Query 2455 AGAATCTGAGAGTAGCCAAGATATCAAGATTGATTTTCACGAATTCGGGAAATGCTATTT 2514
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2555 AGAATCTGAGAGTCGCCAAGATATCAAGATTGATTTTCACGAATTCGGGAAACGCTATTT 2614
Query 2515 TGGCTCTGGCATCAAACGCAATTCATCTTCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACG 2574
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2615 TGGCTTTGGCATCAAACGCCATTCATCTTCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACG 2674
Query 2575 CAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACCGCCTCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATCC 2634
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2675 CAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACCGCCTCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATAC 2734
Query 2635 TCATGACTAACGATGTTGCTGAAACCAAT-C--CCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTT 2691
| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735 TAATGACTAACGACGTTGCTGAAACCAATACTACCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTT 2794
Query 2692 TATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAGCCTCCGGAGGAAAGATATCCTTATTTAACA 2751
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2795 TATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAGCCTCCGGAGGAAAGATCTCCTTATTTAACA 2854
Query 2752 TGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTCATGCCCCCACCACCGGCTGCTACTTTTCTTG 2811
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 2855 TGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTTATGCCCCCACCGCCGGCTGCAACTTTTCTTG 2914
Query 2812 CTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATCGCTATTGGGATGGATGATAGCACGATTCAGA 2871
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2915 CTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATTGCTATCGGAATGGATGATAGCACGATTCAGA 2974
Query 2872 TTTATAATGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGAGTAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAA 2931
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2975 TTTATAACGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGAGTAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAA 3034
Query 2932 CTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAACGTGTTGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGC 2991
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAATGTGTTGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGC 3094
Query 2992 TTTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAAAAGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCAC 3051
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3095 TCTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAAAAGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCAC 3154
Query 3052 AGGGAAGACCAAACAGTGCACCTTCAGATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCTC 3111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3155 AGGGAAGACCAAACAGTGCACCTTCAGATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCTC 3214
Query 3112 ACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGCAACTTGCTATATACGAAACTACCAAGCTCGAATGCA 3171
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3215 ACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGCAGCTCGCTATATACGAAACGACCAAGCTCGAATGCA 3274
Query 3172 TGAAACAGTGGGCTGTTCGAGAATCATTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCG 3231
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3275 TGAAACAGTGGGCTGTACGAGAATCATTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCG 3334
Query 3232 ATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTTTTATGGATGCAACAGTTTGTGTATTTAGCTCTGCAA 3291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3335 ATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTTTTATGGATGCAACAGTTTGTGTATTTAGCTCTGCAA 3394
Query 3292 ATCTACGGCTGCGTTGCCGGGTCAACCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATT 3351
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3395 ATCTAAGATTGCGTTGCCGGGTCAACCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATT 3454
Query 3352 CAAACGTACATCCACTAGTGATTGCTGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCAGTTG 3411
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455 CAAACGTACATCCACTAGTGATTGCGGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCAGTTG 3514
Query 3412 GTCTCTCAGACGGGGGAGTGCACATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAG 3471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515 GTCTCTCAGACGGGGGAGTGCACATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAG 3574
Query 3472 TCGCTCCACCGGCTGAGAACGGGTCGGCTAGCGGTGCA-CCAACTGCACCTTCCGTTGGA 3530
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 3575 TCGCTCCACCTGCTGAGAACGGGTCGGCTAGCGGGGCAGCCA-CTGCACCTTCCGTTGGA 3633
Query 3531 GCCTCTGCATCTGATCAGCCTCAGAGATGATCTGATCCGAGAGCCACCTACCTCTCTGAT 3590
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3634 GCCTCTGCATCTGATCAGCCTCAGAGATGATCTGAGCCGAGAGTCACCTACCTCTCTGAT 3693
Query 3591 TCCCTTTCTTCTATTTAAAAGTCTTT-TCTTTCTT--AtttttttGGTAGAAAAATTTAT 3647
|||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3694 TCCCTTTCTTCTTTTTAAAAGTCTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTGGTAGAAAGATTTAT 3753
Query 3648 GACCCAGAGATTCTTAACATTTAGATGTAACATATT-TTCACAGTAATTCAGTAGTGAAG 3706
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3754 GACCCAAAGATTCT-AACATTTAGATGTAACATATTATTCACAGTAATTCAGTAGTAAAG 3812
Query 3707 TTTGGATAAAAACAGTGACTGATGTTGTTTCTCTCTCTTT 3746
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3813 TT-GGATAAAAACAGTGACTGATGTTGTTTCTCTCTCTTT 3851
> Ahg927456 jgi|Araly1|927456|scaffold_203017.1
Length=3406
Score = 2555 bits (1383), Expect = 0.0
Identities = 1859/2093 (89%), Gaps = 16/2093 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 164 CATGTCTTCTCTTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTCGATGAAGAGAA 223
|||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||
Sbjct 23 CATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTGTTCTTGATCTTACAGTTTTTAGACGAAGAGAA 82
Query 224 GTTTAAAGAGACTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTA 283
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 GTTCAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTA 142
Query 284 TTTTGAGGATGAGGTTCACAATGGAAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTTT 343
||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 143 TTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAGGTATCTCTCTGGTTT 202
Query 344 CACTAAAGTAGATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGAA 403
|| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 203 TACCAAAGTTGATGATAATAGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAGAA 262
Query 404 GTATCTCGAGGCTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGGA 463
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||
Sbjct 263 GTATCTCGAGGCCTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGAAATTCTAGTCAAAGA 322
Query 464 TTTGAAAGTGTTTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACACAGCTCTTGAC 523
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 323 TTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTGAC 382
Query 524 ATTGGAGAACTTCCGGGAGAATGAACAGTTATCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAAG 583
|| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 383 CTTAGAAAACTTCCGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCCCG 442
Query 584 AGCGATCATGTTGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCTTTATTCCGTGATAA 643
||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||||||
Sbjct 443 AGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCATTGTTCCGTGATAA 502
Query 644 ATTGCAGTTCCCTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAAA 703
||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||
Sbjct 503 ATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAAATTCACGGCTGAGGACTCTCATTAATCAGAGCTTAAA 562
Query 704 TTGGCAACACCAGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATCAAGACTCTTTTTGT 763
||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 563 TTGGCAACATCAGCTTTGTAAAAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTTGT 622
Query 764 GGATCACTCTTGTGGCCCT-CCAAATGGCGCACGAGCTCCATCTCCTGTGAACAATCCAC 822
|||||| || || ||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 623 GGATCATTCCTGCCGCC-TACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCGC 681
Query 823 TGCTTGGAGGGAT-ACCAAAGGCTGGAGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 881
|||||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 TGCTTGGATC-ATTACCAAAAGCCGGGGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 740
Query 882 CAACCAACGGCGTCACCTGTTCCAACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTCT 941
|||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 741 CAACCAACATCTTCTCCTGTTCCTACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTCT 800
Query 942 GTCCCACATCCAGCTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGCG 1001
||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||
Sbjct 801 GTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGAGCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGCA 860
Query 1002 GCGTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATGCTTCTTTAGACTACCCGTCAGCAGAT 1061
|| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||| |||
Sbjct 861 GCCTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGAT 920
Query 1062 TCTGAACATGTCTCAAAAAGAACAAGACCAATGGGAATCTCTGACGAGGTGAATCTAGGC 1121
|| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 921 TCAGACCATGTCTCAAAGCGAACAAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGGT 980
Query 1122 GTGAACATGTTACCGATGTCATTTTCAGGG-CAGGCCCATGGTCATTCTCCGGCTTTCAA 1180
|| ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||||||| || | |||||
Sbjct 981 GTCAACATGTTACCAATGACATTCCC-GGGACAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAA 1039
Query 1181 AGCACCTGACGACTTGCCCAAGACAGTTGCGA-GAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCA 1239
||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1040 AGCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTAGC-ACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCA 1098
Query 1240 TGAGCATGGATTTCCATCCAATTAAACAGACCCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTG 1299
||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1099 TGAGCATGGATTTCCATCCTAGTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGG 1158
Query 1300 ATATCGGGCTGTGGGAAGTTGGTTCTCGCGAAAGATTAGTACAGAAGACGTTCAAAGTCT 1359
|||| ||||| |||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 1159 ATATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACGACTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTT 1218
Query 1360 GGGATTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1419
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1219 GGGACTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1278
Query 1420 CTGTCAACCGTGTGATATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGAC 1479
|||||||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||| || ||||
Sbjct 1279 CTGTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGATGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCAAGAC 1338
Query 1480 ATATTGTACAACTATACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTG 1539
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1339 ATATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGATATGAGGCAACACCTCGAGATTG 1398
Query 1540 ATGCTCATGTTGGTGGTGTGAATGATATTTCCTTCTCGACTCCAAACAAGCAACTATGTG 1599
||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1399 ATGCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTCTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTG 1458
Query 1600 TAA-TAACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAA 1658
| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 1459 TTACTA-CTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGT-AAA 1516
Query 1659 A-GGCATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGA 1717
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||
Sbjct 1517 ACGGCATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGA 1576
Query 1718 AAACATTCAGTTCATATTTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCTTGGTTGTATGA 1777
||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||||
Sbjct 1577 AAACATTCAGTTCATCTTTTCAACTGCGCTTGACGGGAAAATAAAAGCATGGTTATATGA 1636
Query 1778 TAATATGGGTTCCCGAGTTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTA 1837
|||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 1637 TAATATGGGTTCTCGGGTTGACTATGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTA 1696
Query 1838 TAGTGCCGATGGTACTAGGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCAT 1897
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1697 CAGTGCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCAT 1756
Query 1898 TGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 1957
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 AGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCAGTTAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 1816
Query 1958 TTCTCTAGGTGTTGTGCAGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGA 2017
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1817 TTCTCTTGGTGTTGTGCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGA 1876
Query 2018 TTTCTCCATCAAGTTCTGGGATATGGACGCTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGC-G 2076
|||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |
Sbjct 1877 CTTCTCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACTATACAGCTTTTGACTGCCATTGATG-CTG 1935
Query 2077 ATGGAGGCCTCCAGGCAAGCCCGCGTATCCGGTTCAACAAGGAAGGCTCTCTCCTGGCCG 2136
||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1936 ATGGAGGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCG 1995
Query 2137 TGTCTGGCAAC-GAGAATGTGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTG 2195
| |||| ||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1996 TTTCTG-CAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTTAGGCTATTG 2054
Query 2196 CACACTTTTGAGAACATATCATCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATAAACAGCAT 2248
||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2055 CACACAGTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCAT 2107
Score = 1290 bits (698), Expect = 0.0
Identities = 1082/1268 (85%), Gaps = 24/1268 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2306 TGTAGTTTCCA-TCCAAGGAATGAATGGAGATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAG 2364
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 TGTCGTTTCCATTCC-TGGAATGAATGGAGATTCACGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAG 2190
Query 2365 TGATCACAGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGC 2424
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |
Sbjct 2191 TGATCACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAACTCGGCGAAC 2250
Query 2425 CTTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTGAGAATCTGAGAGT-AGCCAAGATATCAAGA 2483
| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||
Sbjct 2251 CCTCTCAATGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGCCA-CCAAGATATCGAGA 2309
Query 2484 TTGATTTTCACGAATTCGGGAAATGCTATTTTGGC-TCTGGCATCAAACGCAATTCATCT 2542
||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||
Sbjct 2310 TTGATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCAT-TGGCATCAAATGCTATTCATCT 2368
Query 2543 TCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACGCAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACC 2602
|||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2369 GCTATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGAAAGGCAACGGCTTCTTTACC 2428
Query 2603 GCCTCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATCCTCATGACTAACGATGTTGCTGAAACCAA 2662
|||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||| | |||||| ||
Sbjct 2429 TCCTCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGATCTTAATGACAAACGATGTGGTTGAAACTAA 2488
Query 2663 TCCCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTTTATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAGC 2722
||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 2489 TCCAGAAGAAGCCGTACCATGTTTTGCTTTATCCAAAAATGATTCCTACGTAATGTCAGC 2548
Query 2723 CTCCGGAGGAAAGATATCCTTATTTAACATGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTCAT 2782
|| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2549 ATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCTACTTTCAT 2608
Query 2783 GCCCCCACCACCGGCTGCTACTTTTCTTGCTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATCGC 2842
||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2609 GCCGCCGCCCCCTGCTGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAATATCATTGC 2668
Query 2843 TATTGGGATGGATGATAGCACGATTCAGATTTATAATGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGAG 2902
|| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2669 GATCGGGATGGATGATAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAGGTTAAGAG 2728
Query 2903 TAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAACTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAACGT 2962
||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||| |||||||
Sbjct 2729 CAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTACTAAACGT 2788
Query 2963 GT-TGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGCTTTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAAA 3021
| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2789 -TCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGTGTATGGAACACGGATGGATGGGAGA 2847
Query 3022 AGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCACAGGGAAGACCAAACAGT--GCACCT-TCAG 3078
|||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | || || | | ||||
Sbjct 2848 AGCAGAAAAGCAAGGTCCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCGA-C-GTCTGCTC-TGTCAG 2904
Query 3079 ATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCT-CACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGCAA 3137
| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || || || || || ||
Sbjct 2905 ACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAG-TACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACTCAG 2963
Query 3138 CTTGCTATATACGAAACTACCAAGCTCGAATGCATGAAACAGTGGGCTGTTCGAGAATCA 3197
|| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||
Sbjct 2964 CTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAATCA 3023
Query 3198 TTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCGATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTTTT 3257
| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| | |||||
Sbjct 3024 TCAGCTCCAATCACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAACTGATATACACAAGTTTC 3083
Query 3258 ATGGATGCAACAGTT-TGTGTATTTAGCTCTGCAAATCTACGGCTGCGTTGCCGGGTCAA 3316
||||| || || | | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| | |||||
Sbjct 3084 ATGGACGCTAC-GATATGTGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTCAA 3142
Query 3317 -CCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATTCAAACGTACATCCACTAGTGATTG 3375
|||| |||| ||| | |||||| ||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |
Sbjct 3143 TCCCT-CTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAACGTCCATCCGCTGGTGATAG 3201
Query 3376 CTGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCAGTTGGTCTCTCAGACGG-GGGAGTGCAC 3434
| || |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||
Sbjct 3202 CGGCTCATCCGCAAGAATCGAATATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGG-GTCCAT 3260
Query 3435 ATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAGTCGCTCCACCGGCTGAGAACGGG 3494
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||
Sbjct 3261 ATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACCGCCTGAAAATGGC 3320
Query 3495 TCGGCTAGCGGTGC-ACCAACTGCACCTTCCGTTGGAGCCTCTGCATCTGATCAGCCTCA 3553
|| || |||| || || || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3321 TCAGCCAGCGCTGTTACGG-CTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCCTCA 3379
Query 3554 GAGATGAT 3561
||||||||
Sbjct 3380 GAGATGAT 3387
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 144694892546
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5