BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G19715.3
Length=1925
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg472198 jgi|Araly1|472198|fgenesh2_kg.1__2152__AT1G19715.1 2939 0.0
Ahg335224 jgi|Araly1|335224|fgenesh1_pg.C_scaffold_1001789 2837 0.0
> Ahg472198 jgi|Araly1|472198|fgenesh2_kg.1__2152__AT1G19715.1
Length=2106
Score = 2939 bits (1591), Expect = 0.0
Identities = 1817/1924 (94%), Gaps = 24/1924 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 TGTGTTGCAGTGGTCAGCTATCTGTTTACTCGAGCTTCTTACACTTGCTTTGAGTCTTTA 61
||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGTGTTGCAGTAGTCAGCTCTCTGTGTACTCGAGCTTCTTACACTTGCTTTGAGTCTTTA 60
Query 62 GAGATCATCTTAATCTGAGGATGGTATTAACATCATCTTATAGTGTTGAAGGCAAGCCTG 121
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 61 GAGATCATCTTAATCTGAGGAT-G-----------------AGTGTTGAAGGCAAGCCTG 102
Query 122 CATCACTTGGCCCATGGGGAGGCCAGA-GTGGTCATGCCTGGGATGATGGAATGTACACC 180
||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 103 CATCAGTCGGCCCATGGGGAGGCCA-ATGTGGTCATGCCTGGGATGATGGAATGTACACC 161
Query 181 ACAGTAAAGCAAATAATTATAGCCCATGGTTCTGGAATAGACTCCATACAAATTGAGTAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 162 ACAGTAAAGCAAATAATTATAGCCCATGGTTCTGGAATAGACTCCATACAAGTTGAGTAC 221
Query 241 GACAAAAACGGTAGCTCGGTTTGGTCTGAAAAACGTGGAGGAAAGGGAGGCAAGAAGTTT 300
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GACAAAAACGGTAGCTCTGTTTGGTCTGAAAAACGCGGAGGAAAGGGAGGCAAGAAGTTT 281
Query 301 GATAAGGTCAAATTTGATTACCCACATGAGTATCTGATTTCAGTAAATGGAACCTACGGT 360
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||
Sbjct 282 GATAAGGTCAAACTTGATTACCCACATGAGTATCTGATTTCAATCAATGGAACATACGGT 341
Query 361 AGCTTTGACGTCTGGGGAACTATATGTGTCCGATCACTTACTTTCGAGAGTAACCGCAGA 420
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 342 AGCTTTGACGTCTGGGGAACTTTATGTGTCCGATCACTTACTTTTGAGAGTAACCGCAGA 401
Query 421 AAATATGGACCGTTTGGTGTTGATTCAGGTACATTCTTTGCATTGCCAAAATCAGGATCG 480
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 402 AAATATGGACCATTTGGTGTTGAGTCAGGTACATTCTTCGCATTACCAAAATCAGGGTCA 461
Query 481 AAGATTATTGGGTTCCATGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGATGCTATTGGTGTTCACACT 540
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 462 AAGATTGTTGGGTTCCATGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGATGCTATTGGTGTTCACATT 521
Query 541 CAACCAATTCCTAAAGAGAATAATCCTTCGTCGAAAATCCTTTTGCACTCGCATCAAAGT 600
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 522 CAGCCAGTTCCTAAAGAGAATAATCCTTCGTCGAAAATCCTTTTGCATTCGCATCAAAGT 581
Query 601 TTTTCTCAGGGTGATAAGAAACATGAGTACTCAGTGCTACAAGGAAGTGTAGGGCAAAAC 660
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 TTCCCTCAGGGTGATAAGAAACATGAGTACTCAGTGATACAAGGAAGTGTAGGGCAAAAC 641
Query 661 TTTGATATAGTTGTTACCCTCAGAAAGAAAGATCCAACTTTGCCTTCTTTTGAGTCCCGA 720
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 642 TTTGATATAGTTGTTGCCCTCAGAAAGAAAGATCCAACTTTGCCTTCTTTTGAATCCCGG 701
Query 721 GATTCCGCAGGAGCCGAGGTCACCAAACATAAGTTGGTGACAGATACTGAGAAGTCACAG 780
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GATTCCGCAGGTGCCGAGATCACCAAACATAAGTTGGTGACAGATACTGAGAAGTCACAG 761
Query 781 TCAAAAATTGAAGGTGGCGCGAAAACATATGGACCATGGGGCGGAACCGGTGGAATCATG 840
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 762 TCAAAAGTTGAAGGTGGCGCGAAAACATATGGACCATGGGGTGGAACCGGTGGTATCATG 821
Query 841 TTTGACGATGGGATTTATACCGGTATTC-GACAAATCAATTTGTCACGCAATGTCGGGAT 899
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 822 TTTGACGATGGGATTTATACCGGTA-TCAGACAAATCAATTTGTCACGTAGTGTCGGGAT 880
Query 900 TGTGTCGATGAAGGTCTGTTATGATTTTAGAGGACAAGCTGTGTGGGGAAGCAAACATGG 959
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TGTGTCGATAAAGGTCTGTTATGATTTTAGAGGACAAGCTGTGTGGGGAAGCAAACATGG 940
Query 960 TGGCGTGGGAGGATTCAAACATGATAAGATTGTATTTGACTACCCTTCAGAGGTTTTAAC 1019
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 941 TGGCATGGGAGGATTCAAACATGATAAGATTGTATTTGACTACCCATCAGAGGTTTTAAC 1000
Query 1020 ACATGTAACGGGAACATATGGGCCGCTGATGTATATGGGACCTAATGTGATAAAGTCACT 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 ACATGTAACGGGAACATATGGGCCGCTGATGTACATGGGACCTAATGTGATAAAGTCACT 1060
Query 1080 GACTTTCCGCACCAACAGAGGAAAGCATGGACCTTATGGAGAAGAACAAGGACCGTCTTT 1139
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1061 GACTTTCCGCACCAACAGAGGAAAACATGGACCTTATGGAGAAGAACAAGGTCCTTCTTT 1120
Query 1140 TACACATCAAATGGACGAGGGTAAAGTTGTTGGATTCCTTGGAAGAGAGGGTTTATTTCT 1199
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1121 TACACATCAAATTGATGAGGGTAAAGTTGTTGGATTCCTTGGAAGAGAGGGTTTGTTTCT 1180
Query 1200 TGATTCCATAGGTGTTCATGTTATGGAATGCAAAATAAGTTCCCTTAAGCCATCATCTCC 1259
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1181 TGATTCCATTGGTGTTCATGTTATGGAATGCAAGATAAGTTCCCTTAAGCCAGCATCTCC 1240
Query 1260 TCACAATGCAATTGTTCCTCATAATAACTCCGGCACTGCGCAAATAGAAAATTCCCCATG 1319
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1241 TAACAATTCAATTGTTCCTCATAATAACTCCGGCACTGCGCAAATCGAAAATTCCCCATG 1300
Query 1320 GGCTAATAAGCTAGTCCTTGCAGCAAACGGCCATGGCGAAGAGGTTGATCGTGGAGTCGT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 GGCTAATAAGCTAGTCCTTGCAGCAAACGGCCATGGCGAAGAGGTTGATCGTGGAGTCGT 1360
Query 1380 CAAAGAACCAACACCGAGCGGGCCTGGACCGTGGGGAGGTGACGGAGGTCAAGCTTGGGA 1439
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1361 CAAAGAACCAACACCGAGCGGTTCTGGACCGTGGGGAGGCGACGGAGGTCAAGCTTGGGA 1420
Query 1440 CGATGGAGTATTTTCAGGGATCAAGCAGATATTTGTGACAAGAGGAAATGATGCTATCAC 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 1421 TGATGGAGTATTTTCAGGGATCAAGCAGATATTTGTGACAAGAGGAAATGATGTTATCTC 1480
Query 1500 TTCAATACAAATTGAGTACGATAGGAATGGACAATCTGTTTGGTCCATTAAACATGGTGG 1559
|||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1481 TTCAATACAAGTCGAGTACGATAGAAATGGACAATCTGTTTGGTCCACTAAACATGGTGG 1540
Query 1560 TGACAGCAATGGAGTCGCTACACACAGAATTAAATTTGAGTATCCAGATGAATCGATCAC 1619
||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||
Sbjct 1541 TGATAACAATGGAGTCGCCACACACAGAATTAAACTTGAGTATCCAAACGAAACGATCAC 1600
Query 1620 CTGCATTTCAGGGTATTACGGACCTCTGAACAATTCAGACCGATATAATGTTGTCAAGTC 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1601 CTGCATTTCAGGGTATTACGGACCTCTGAACAATTCAGACAGATATAATGTTGTCAAGTC 1660
Query 1680 TCTGAGTTTCTACACGAGCCGTGGGAGGTACGGGCCATACGGTGAAGAAACCGGGACGTT 1739
||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 TCTGAGTTTTTACACGAGCCGTGGGAAGTATGGTCCATACGGTGAAGAAACCGGGACGTT 1720
Query 1740 TTTCACTTCGACTACAACACAAGGAAAAGTTTTGGGGTTCCATGGAAGGAGTAGCTTTCA 1799
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1721 TTTCACTTCAACTACAACACAAGGAAAAGTTTTGGGGTTCCATGGAAGGAGTAGCTCGCA 1780
Query 1800 CTTGGACGCCATTGGAGTGCATATGCAGCATTGGCTTGGCAACAATAAGTCTTATTACAG 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1781 CTTGGACGCCATTGGAGTGCATATGCAGCATTGGCTTGGCAACAATAAGCCTTATTACAG 1840
Query 1860 CAGGGCTAGTTGTTTCAAGCTCTTCTGATAATCTTCTCTGCGCA-A-CAAGAAAACATCT 1917
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||
Sbjct 1841 CAGGGCTAGTTGTTTCAAGCTCTTCTCATAATCTTATCTGCGCACAACAAGAAAACATCT 1900
Query 1918 AACC 1921
||||
Sbjct 1901 AACC 1904
> Ahg335224 jgi|Araly1|335224|fgenesh1_pg.C_scaffold_1001789
Length=4473
Score = 2837 bits (1536), Expect = 0.0
Identities = 1706/1790 (95%), Gaps = 4/1790 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 103 AGTGTTGAAGGCAAGCCTGCATCACTTGGCCCATGGGGAGGCCAGA-GTGGTCATGCCTG 161
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2686 AGTGTTGAAGGCAAGCCTGCATCAGTCGGCCCATGGGGAGGCCA-ATGTGGTCATGCCTG 2744
Query 162 GGATGATGGAATGTACACCACAGTAAAGCAAATAATTATAGCCCATGGTTCTGGAATAGA 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 GGATGATGGAATGTACACCACAGTAAAGCAAATAATTATAGCCCATGGTTCTGGAATAGA 2804
Query 222 CTCCATACAAATTGAGTATGACAAAAACGGTAGCTCGGTTTGGTCTGAAAAACGTGGAGG 281
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2805 CTCCATACAAGTTGAGTACGACAAAAACGGTAGCTCTGTTTGGTCTGAAAAACGCGGAGG 2864
Query 282 AAAGGGAGGCAAGAAGTTTGATAAGGTCAAATTTGATTACCCACATGAGTATCTGATTTC 341
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 AAAGGGAGGCAAGAAGTTTGATAAGGTCAAACTTGATTACCCACATGAGTATCTGATTTC 2924
Query 342 AGTAAATGGAACCTACGGTAGCTTTGACGTCTGGGGAACTATATGTGTCCGATCACTTAC 401
| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2925 AATCAATGGAACATACGGTAGCTTTGACGTCTGGGGAACTTTATGTGTCCGATCACTTAC 2984
Query 402 TTTCGAGAGTAACCGCAGAAAATATGGACCGTTTGGTGTTGATTCAGGTACATTCTTTGC 461
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2985 TTTTGAGAGTAACCGCAGAAAATATGGACCATTTGGTGTTGAGTCAGGTACATTCTTCGC 3044
Query 462 ATTGCCAAAATCAGGATCGAAGATTATTGGGTTCCATGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGA 521
||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3045 ATTACCAAAATCAGGGTCAAAGATTGTTGGGTTCCATGGGAAGGCTGGTTGGTATTTGGA 3104
Query 522 TGCTATTGGTGTTCACACTCAACCAATTCCTAAAGAGAATAATCCTTCGTCGAAAATCCT 581
||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3105 TGCTATTGGTGTTCACATTCAGCCAGTTCCTAAAGAGAATAATCCTTCGTCGAAAATCCT 3164
Query 582 TTTGCACTCGCATCAAAGTTTTTCTCAGGGTGATAAGAAACATGAGTACTCAGTGCTACA 641
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3165 TTTGCATTCGCATCAAAGTTTCCCTCAGGGTGATAAGAAACATGAGTACTCAGTGATACA 3224
Query 642 AGGAAGTGTAGGGCAAAACTTTGATATAGTTGTTACCCTCAGAAAGAAAGATCCAACTTT 701
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3225 AGGAAGTGTAGGGCAAAACTTTGATATAGTTGTTGCCCTCAGAAAGAAAGATCCAACTTT 3284
Query 702 GCCTTCTTTTGAGTCCCGAGATTCCGCAGGAGCCGAGGTCACCAAACATAAGTTGGTGAC 761
|||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3285 GCCTTCTTTTGAATCCCGGGATTCCGCAGGTGCCGAGATCACCAAACATAAGTTGGTGAC 3344
Query 762 AGATACTGAGAAGTCACAGTCAAAAATTGAAGGTGGCGCGAAAACATATGGACCATGGGG 821
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3345 AGATACTGAGAAGTCACAGTCAAAAGTTGAAGGTGGCGCGAAAACATATGGACCATGGGG 3404
Query 822 CGGAACCGGTGGAATCATGTTTGACGATGGGATTTATACCGGTATTC-GACAAATCAATT 880
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3405 TGGAACCGGTGGTATCATGTTTGACGATGGGATTTATACCGGTA-TCAGACAAATCAATT 3463
Query 881 TGTCACGCAATGTCGGGATTGTGTCGATGAAGGTCTGTTATGATTTTAGAGGACAAGCTG 940
||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 TGTCACGTAGTGTCGGGATTGTGTCGATAAAGGTCTGTTATGATTTTAGAGGACAAGCTG 3523
Query 941 TGTGGGGAAGCAAACATGGTGGCGTGGGAGGATTCAAACATGATAAGATTGTATTTGACT 1000
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3524 TGTGGGGAAGCAAACATGGTGGCATGGGAGGATTCAAACATGATAAGATTGTATTTGACT 3583
Query 1001 ACCCTTCAGAGGTTTTAACACATGTAACGGGAACATATGGGCCGCTGATGTATATGGGAC 1060
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3584 ACCCATCAGAGGTTTTAACACATGTAACGGGAACATATGGGCCGCTGATGTACATGGGAC 3643
Query 1061 CTAATGTGATAAAGTCACTGACTTTCCGCACCAACAGAGGAAAGCATGGACCTTATGGAG 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3644 CTAATGTGATAAAGTCACTGACTTTCCGCACCAACAGAGGAAAACATGGACCTTATGGAG 3703
Query 1121 AAGAACAAGGACCGTCTTTTACACATCAAATGGACGAGGGTAAAGTTGTTGGATTCCTTG 1180
|||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3704 AAGAACAAGGTCCTTCTTTTACACATCAAATTGATGAGGGTAAAGTTGTTGGATTCCTTG 3763
Query 1181 GAAGAGAGGGTTTATTTCTTGATTCCATAGGTGTTCATGTTATGGAATGCAAAATAAGTT 1240
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3764 GAAGAGAGGGTTTGTTTCTTGATTCCATTGGTGTTCATGTTATGGAATGCAAGATAAGTT 3823
Query 1241 CCCTTAAGCCATCATCTCCTCACAATGCAATTGTTCCTCATAATAACTCCGGCACTGCGC 1300
||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3824 CCCTTAAGCCAGCATCTCCTAACAATTCAATTGTTCCTCATAATAACTCCGGCACTGCGC 3883
Query 1301 AAATAGAAAATTCCCCATGGGCTAATAAGCTAGTCCTTGCAGCAAACGGCCATGGCGAAG 1360
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3884 AAATCGAAAATTCCCCATGGGCTAATAAGCTAGTCCTTGCAGCAAACGGCCATGGCGAAG 3943
Query 1361 AGGTTGATCGTGGAGTCGTCAAAGAACCAACACCGAGCGGGCCTGGACCGTGGGGAGGTG 1420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 3944 AGGTTGATCGTGGAGTCGTCAAAGAACCAACACCGAGCGGTTCTGGACCGTGGGGAGGCG 4003
Query 1421 ACGGAGGTCAAGCTTGGGACGATGGAGTATTTTCAGGGATCAAGCAGATATTTGTGACAA 1480
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4004 ACGGAGGTCAAGCTTGGGATGATGGAGTATTTTCAGGGATCAAGCAGATATTTGTGACAA 4063
Query 1481 GAGGAAATGATGCTATCACTTCAATACAAATTGAGTACGATAGGAATGGACAATCTGTTT 1540
|||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4064 GAGGAAATGATGTTATCTCTTCAATACAAGTCGAGTACGATAGAAATGGACAATCTGTTT 4123
Query 1541 GGTCCATTAAACATGGTGGTGACAGCAATGGAGTCGCTACACACAGAATTAAATTTGAGT 1600
|||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4124 GGTCCACTAAACATGGTGGTGATAACAATGGAGTCGCCACACACAGAATTAAACTTGAGT 4183
Query 1601 ATCCAGATGAATCGATCACCTGCATTTCAGGGTATTACGGACCTCTGAACAATTCAGACC 1660
||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4184 ATCCAAACGAAACGATCACCTGCATTTCAGGGTATTACGGACCTCTGAACAATTCAGACA 4243
Query 1661 GATATAATGTTGTCAAGTCTCTGAGTTTCTACACGAGCCGTGGGAGGTACGGGCCATACG 1720
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||
Sbjct 4244 GATATAATGTTGTCAAGTCTCTGAGTTTTTACACGAGCCGTGGGAAGTATGGTCCATACG 4303
Query 1721 GTGAAGAAACCGGGACGTTTTTCACTTCGACTACAACACAAGGAAAAGTTTTGGGGTTCC 1780
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4304 GTGAAGAAACCGGGACGTTTTTCACTTCAACTACAACACAAGGAAAAGTTTTGGGGTTCC 4363
Query 1781 ATGGAAGGAGTAGCTTTCACTTGGACGCCATTGGAGTGCATATGCAGCATTGGCTTGGCA 1840
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4364 ATGGAAGGAGTAGCTCGCACTTGGACGCCATTGGAGTGCATATGCAGCATTGGCTTGGCA 4423
Query 1841 ACAATAAGTCTTATTACAGCAGGGCTAGTTGTTTCAAGCTCTTCTGATAA 1890
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 4424 ACAATAAGCCTTATTACAGCAGGGCTAGTTGTTTCAAGCTCTTTTCATAA 4473
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 72333375255
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5