BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G24300.1
Length=4638
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg472916 jgi|Araly1|472916|fgenesh2_kg.1__2870__AT1G24300.1 5267 0.0
Ahg472946 jgi|Araly1|472946|fgenesh2_kg.1__2900__AT1G27430.1 5051 0.0
> Ahg472916 jgi|Araly1|472916|fgenesh2_kg.1__2870__AT1G24300.1
Length=4300
Score = 5267 bits (2852), Expect = 0.0
Identities = 3294/3501 (94%), Gaps = 55/3501 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1076 CTGAGTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGGTGACAATG 1135
|||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 845 CTGACTCAGGTGAAACAAAAGTTGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTGTTAATGGTGACAATG 904
Query 1136 GCTCCATGAAAAATAATGATTCC-GGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTCTGGGGGCA 1194
| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 905 GTTCCATGCAAAATAGTGA-TCCTGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGATCTGGGGGGT 963
Query 1195 GCTTCTAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTTTTGGAGCT 1254
||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 964 GCTCCAAGCGTCTCAAGATTAAATTCTGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTTTTGGAACT 1023
Query 1255 GGTTA-TCAAGTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTTTTACTAAGTCCCC 1313
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1024 GG-TATTCAAGTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTCTTACTAAGTCCTC 1082
Query 1314 TGTGTTGGATGGGAGCGAATCTGTTGTTGGGTCGTTCGAGCAAGATTATATGGGCAAGCT 1373
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1083 TGTGTTGGATGGGAGTGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGATTACATGGGCAAGCT 1142
Query 1374 GCAGCAACCAGATGTTGAAGTGGATCAGTCAGAAGCGGCTATGCCACCTGAGGA-TTTCT 1432
||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1143 GCAGCAACCAGATATTGAAGTAGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAGTTT-T 1201
Query 1433 TATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTCTGACATTA 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 TATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTCTGACATTA 1261
Query 1493 TTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTGCGCTTGGCAAATGCTC 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1262 TTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAATGCTC 1321
Query 1553 CAGAAGGAACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCG 1612
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 CAGAAGAAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCG 1381
Query 1613 CCCATGCCCATATCAGTAACCAAGAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAAAGCAAATT 1672
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382 CCCATGCCCATATCAGTAACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAAAGCAAATT 1441
Query 1673 CAGACACTGGTTTATCAATTGCACCAGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTCTATGAATG 1732
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1442 CAGACACTGGTTTATCAATTGCACCTGTAGCAGAATCAAATGATTCATCCTC------T- 1494
Query 1733 GCACGTCTCGTTCGTTTTCAGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTTTCAAAGAA 1792
||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1495 ---CGT-TCG-T--TTTT-GGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTTTCAGAGAA 1546
Query 1793 AGTCTGAGTCAGAATTTTATGCGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTTCTTGGACT 1852
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 AGTCTGAGTCAGAAGTTTATGGGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTTCTTGGACT 1606
Query 1853 TCTCTACTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTATGCGT 1912
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1607 TCTCTGCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTATGCAT 1666
Query 1913 CAGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTTATGGAAGTTTCTGGCCAGTCTGCTA 1972
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1667 CAGTAAATTCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGGCCAGTCTGCTA 1726
Query 1973 TTCCTGTTGAATCCACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGCATGAGAATAAGCTGCATCCGT 2032
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1727 TTCCTGTTGAATCAACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGAATGAGAATAAGCTGCACCCGT 1786
Query 2033 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAACGTACCAGTTAACCTGTTACCAAACA 2092
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1787 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAATGCACCAGTTAACCTGTTCCCAAACA 1846
Query 2093 GGTCCTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTGCAATAGACAATCGGCCCATTGATTCCC 2152
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 1847 GGTCTTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGAAAATTGGCCCATTGATTCCC 1906
Query 2153 GAAGAAATACACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGGTCTGGCTTCTAACCGGATGT 2212
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 GAAGAAATAAACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGCTCTGGCTTCTAACCGGATGT 1966
Query 2213 CGCAGTTTGAACATCTTTCCAACCGCTTTAACCTTGGGGATCAACTTTCATCAAATCAAC 2272
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 CGCAGTTTGAACATGTTTCCAACCGCTTTAGCCTTGGGGATCAACTTTCATCAAATCAAC 2026
Query 2273 ATAACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATATAGGTGATCAAG 2332
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027 ATCACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATATAGGTGATCAAG 2086
Query 2333 CTCAGGATCTGGATTATTTAATAACTCTCcagttgcagcagcaacaaaagattcagttgc 2392
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2087 CTCAGGATCTTGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAGCAACAGAAGATTCAGTTGC 2146
Query 2393 aacagcagcagaagattcaattgcagcagcagcagaagattcagttgcaacagcagcaga 2452
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2147 AACAGCAGCAGAAGATTCAGTTGCAACAGCAGCAGAAGATGCAGCTGCAACAGCA----- 2201
Query 2453 agatgcagctgcaacagcaTCAACTAGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2512
| || | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 ---T-CA-----A-C----T-A----GAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2242
Query 2513 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGGCAATTACATTATCAACAGATTCTACAAGGACAGA 2572
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2243 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGACAATTGCATTTTCAACAGATTCTACAAGGACAGA 2302
Query 2573 CTCCTGATTCAAGGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGA 2632
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2303 CTCCTGATTCAAGGTTTGGGCAGTCCCATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGA 2362
Query 2633 TGTTGTTAGAACACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAA 2692
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2363 TGTTGTTAGAGCACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAATTCTGGTCATCCGTCACAAA 2422
Query 2693 ATTTTGCACCATACATTGAGCAACTTGCCGCTGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAG 2752
|||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2423 ATTTTGCACCATACCTTGAGCAACTTGCTGCAGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAG 2482
Query 2753 GCCATCAGAGGGAACTACTTGAACAGCTACTTTCAACAAAAATGCAATCTCAATATGGAC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2483 GCCATCAGAGGGAACTACTTGAACAGCTACTTTCAACAAAAATGCAATCTCAATATGGAC 2542
Query 2813 CAATGCAATCTCCATACGGACAACTGCAATCTGAACCAACTCGGTCTTTGGAGTACCAAC 2872
|||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2543 CAATGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAACTCGGTCTTTGGAGTACCAAC 2602
Query 2873 TGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGAGTGAGGCACAATACACTATTGG 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2603 TGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGAGTGAGGCACAATACACTATTGG 2662
Query 2933 AGGAACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAATGATCAGCTTCTAAGAA 2992
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2663 AGGAACAGAGACATATTGATCCTCTGTGGCCATCTGACCATAATGATCAGCTTCTAAGAA 2722
Query 2993 GTCATCCTGGGATCCAACGTTCGCGATCCTCTACAGGATTTAGACAACTAGACTTTCATC 3052
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2723 ATCATCCTGGGATCCACCGTTCGCGGTCCTCTACAGGATTTAGACCACTAGACTTTCATC 2782
Query 3053 AACAGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGGTCAACTTGAGCGGAACCTTTTAT 3112
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783 AACATCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGGTCAACTTGAGCGGAACCTTTTAT 2842
Query 3113 ATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTCGAGCAGGGTCTGCCATTTGAGCGATCAGCAT 3172
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2843 ATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTTGAGCAGGGTCTGCCATTTGAGCGATCAGCAT 2902
Query 3173 CCTTACCTGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATCCAGTAAATGGTCTTGGACTCTCTC 3232
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2903 CCTTACCCGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTTGGACTCTCTC 2962
Query 3233 AAGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTACCCACATGCAGATTGGGAATTCTACTCTGGGTT 3292
| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2963 AGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCCACTGCCCACATGCAGATTGGGAATTCTACTCTGGGTT 3022
Query 3293 TTAATCATCAGAATCCCCGTATACCAATAGGTGAACCTCATTTTTCACAGTTGGAATCAA 3352
| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3023 TCAGTCATCAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAACCTCATTTTTCACAGTTGGAACCAA 3082
Query 3353 TGGAAGGACGTTGGTCTGGAGCTGACACACAGGTTGTTGGTGACTGGGCCGAATCTCAAC 3412
| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3083 TAGAAGGACGCTGGTCTGGAGCTGATACACAGGTTGTTGGTGAGTGGGCCGAATCTCAAT 3142
Query 3413 TTCATAGATCAAATATTGATGCTGAACATCATAAAATGAGGTCAGAAAGTAGGAGAATGG 3472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3143 TTCATAGATCAAATATTGATGCTGAACATCATAAAATAAGGTCAGAAAGTAGGAGAATGG 3202
Query 3473 GTGAAGATTCCAACTCATGGATGTTAGGTGGGACTACAGAAGACAGGTCAAAACAGCTAT 3532
|||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3203 GTGAGGATTCCAACTCATGGATGGTAGGTGGAACTACAGAAGACAGGTCAAAACAGCTAT 3262
Query 3533 TTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATCTGCTGAATCACCAAGCATGAACC 3592
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3263 TTTTGGAGTTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATCTGCTGAATCACCAAGCATGAACC 3322
Query 3593 GTGGGCAATCCTTTGACAGGATGGCTCCTTCTGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACACTTG 3652
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3323 GTGGGGAATCCTATGACAGGATGGCTCCTTCTGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACACTTG 3382
Query 3653 GCGGC-TATTCAGATCATGGTGGTAGTCATAACGCTCCTTCAACTTTTGGTGCTCGAGCA 3711
||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 3383 GCGGCCT-TTCAGACCATGGTGGTAGTCTTAACGCTCCATCTACTTTTGGGGCTCGAGCA 3441
Query 3712 TTTTCTGATGAACAGATCAACAGATCATCCGGAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCAC 3771
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3442 TTTTCTGATGAACAGATCAACAGATCATCAGGAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCAC 3501
Query 3772 CGTAATAATTCCTTGCTTTCTGGAATTATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAACT 3831
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3502 CGTAACAGTTCCTTGCTTTCTGGAATTATTGATGGTGGGCGGTCAAATCAGAATGAAAGT 3561
Query 3832 CAAGCCTTCAGTAATATGTATGCTATGAACAAAGACGCGAATGACATCAAAACTTGGAAC 3891
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||
Sbjct 3562 CAAGCCTTCAGTAATATGTTTGCTATGAACAAGGACACAAACGACATCAAAACTTGGAAC 3621
Query 3892 AATGTGCCGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATGATGTCATTTGAAGCCCAAGATAGA 3951
|| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 3622 AACGTGCCGCTTAAAAATGATGGAATGGGAAGGATGATGTCATATGAAGCCCAAGACAGA 3681
Query 3952 ATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCACTGGTTCATGGGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCT 4011
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3682 ATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGGTTCAAGAGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCT 3741
Query 4012 GGCCAACAGTCTTCTTTAAATATCTCTGACCAATACAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGAT 4071
|| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3742 GGTCAACATTCTTCTTTCAATATCTCTGACCAGTACAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGAT 3801
Query 4072 AGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGGACA-GAATTCAGTATTGTTAAAAAG 4130
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||
Sbjct 3802 AGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGGACATGA-TCCAGTTTTGTTAAAAAG 3860
Query 4131 GCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAGGATTGATAGAGCGTATCTCTGACAC 4190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||
Sbjct 3861 GCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAGGAGTGCTCGAGCGTATGTCTGACAC 3920
Query 4191 AGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCGTATAGTGGAATTGAAGGCGGTGTGAGACGGGAATC 4250
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3921 AGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTATAGTGGAATTGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATC 3980
Query 4251 AGGAGCAGCGGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGGC-GACATCGTTCAGTGAGATGTTGA 4309
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3981 AGGAGCAGCGGGAAATAAAGGGTCAACGTCAGAGGCAG-CATCGTTCAGTGAGATGTTGA 4039
Query 4310 AGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCGGCAGAGTCAAATGATGTAACAGAAGGAAGCA 4369
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||
Sbjct 4040 AGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCAGCAGAGTCATCTGATGCAACCGAAGGAAGCA 4099
Query 4370 AAGGTGGTGGCGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAGGCAGATCGATCCAGCTCTTCTTG 4429
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 4100 AAGGTGGCGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAGGCAGATAGATCCAGCTCTTCTCG 4159
Query 4430 GTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATT---ATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGAttttt 4486
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4160 GTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATTCTTATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGATTTTT 4219
Query 4487 aactcttt-ttttctttttGTACAAAATCTTTACATGTAAAGATTAGCTTCTCAAGCTTA 4545
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4220 AACTCTTTGTTTTCTTTTTGTACAAAATCTTTACATGTAAAGATTAGCTTCTCAAGCTTA 4279
Query 4546 GGCGTATAGGTTTTTTACAGA 4566
|||||||||||||||||||||
Sbjct 4280 GGCGTATAGGTTTTTTACAGA 4300
Score = 1218 bits (659), Expect = 0.0
Identities = 780/839 (93%), Gaps = 5/839 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCCTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCGTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAATGGCTTTACACGAAA 120
Query 121 TCAAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTATGCCCATGGGAAATCCAAGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAGT 180
Query 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCCGAAGACAAAAAAGACTGGAAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATACACCCGAAGACAAAAAGGACTGGAGG 240
Query 241 AAAATTGTGTCTGAGAATGAAACTAATCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAATTGTGCCTGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
Query 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGCATTGACAATGTCTCA 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCATTGACTCTGTCTCA 360
Query 361 AGCAGAGAAACTGGTGA-AGTTAAAACTACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
|||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGCAGAGATACTGGTGACAATAAAAA-TACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGTCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGCGCTGCTGTAAACGAACCCCGCCGCGACAATAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCCCGTTGTGAGAAGGTAGAGATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAATATCAAGGACAAGGAGGA 539
Query 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTTGTTAGCAATGTCCGTGCAACTTCTGAACGGGACTC 599
||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 540 GCCACTGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAGCGGGACTC 599
Query 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCGCAGTCTGGTGTGCCTAC 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
Query 660 TTCTTATCGTACTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCTGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCACTGTTGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
||||||| |||| ||||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCTCTGTGGGCCGAGGAAGGGCAAATGCAACTCGGAGGAGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGT--A-GTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGC 835
||||||||||||| | |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGTGCATGTGCGTCTGCCTCTATGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGC 838
> Ahg472946 jgi|Araly1|472946|fgenesh2_kg.1__2900__AT1G27430.1
Length=4636
Score = 5051 bits (2735), Expect = 0.0
Identities = 3659/4087 (90%), Gaps = 135/4087 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCCTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCGTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACCAAA 120
Query 121 TCAAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTATGCCCATGGGAAATCCAAGT 180
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAGT 180
Query 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCCGAAGACAAAAAAGACTGGAAG 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
Sbjct 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAGG 240
Query 241 AAAATTGTGTCTGAGAATGAAACTAATCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAATTGTGCCTGAGAATGAAATTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
Query 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGCATTGACAATGTCTCA 360
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAATTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCGTTGACAATGTCTCA 360
Query 361 AGCAGAGAAACTGGTGA-AGTTAAAACTACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
|||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGCAGAGAAACTGGTGACA-ATAAAAATACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGTCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGTGCTGCTGTAAATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCCCGTTGTGAGAAGGTAGAGATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAACATCAAGGACAAGGAAGA 539
Query 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTTGTTAGCAATGTCCGTGCAACTTCTGAACGGGACTC 599
||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 540 GCCACAGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAACGGGACTC 599
Query 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCGCAGTCTGGTGTGCCTAC 659
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 600 CGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCTCGTCATAGGATGGAATCTCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
Query 660 TTCTTATCGTACTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCTGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCACTGTTGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
Query 840 TATGTATAGAAAACAGAAGCCTGATCCTTCCCTAGGTAGGATACCGACTGAAATGGATGA 899
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CATGTATAGAGAACAGAAGCCTGATCCTTCCCTAGGTAGGATACCGACTGAAATGGATGA 899
Query 900 AGTTGCCTCCATAACGCAAGTGGCTCTGATCGAACCTCTTGCTTTTATCGCACCTGATAC 959
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 900 GGTTGCCTCCATAACTCAAGTGGCTCTGATCGAACCTCTTTCTTTTATCCCACCTGATGC 959
Query 960 CGAAGAAGAGGCAAGCATTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGTGAAGTTTA 1019
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 960 CGAAGAAGAGGCAAGCCTTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGCGAAGTTTA 1019
Query 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAGTCCTTAGGTGAAAACAGTCTGTTGAAATGCCGCATACCTGA 1079
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAATCCTTAGGTGAAAACAGTCTGGTGAAATACCGCATACCTGA 1079
Query 1080 GTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGGTGACAATGGCTC 1139
|||||||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||| | ||
Sbjct 1080 CTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTT--C--G-----A--A-TGGTGACAATAGTTC 1127
Query 1140 CATGAAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTCTGGGGGCAGCTTC 1199
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||
Sbjct 1128 CCTGCAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAGTGGAGGTTTAGGGGCTGCTTC 1187
Query 1200 TAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTTTTGGAGCTGGTTA 1259
|| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1188 TAACGTCTCAAGATTGAATTTAGTGGCTTCTGAAAGTTGTGGATCTGTTGGAGCTGGTTA 1247
Query 1260 TCAAGTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTTTTACTAAGTCCCCTGTGTT 1319
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||
Sbjct 1248 TCAAGCTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCTGCGTTTACTAAGTCCTCTGTGTT 1307
Query 1320 GGATGGGAGCGAATCTGTTGTTGGGTCGTTCGAGCAAGATTATATGGGCAAGCTGCAGCA 1379
||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1308 GGATGGGAGTGAATCCGTTCTTGCTTCTTTCGAGCAAGATTATACGGGCAAGCTGCAGCA 1367
Query 1380 ACCAGATGTTGAAGTGGATCAGTCAGAAGCGGCTATGCCACCTGAGGA-TTTCTTATTCT 1438
||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1368 ACCAGATATTGAAGTGAATCACCCGGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAGTTTCTG-TTCT 1426
Query 1439 TGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTCTGACATTATTTCAT 1498
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1427 TGTATATTGACCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTTATTGGTTCTGACATTATTTCAT 1486
Query 1499 GGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTGCGCTTGGCAAATGCTCCAGAAG 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 GGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAATGCTCCAGAAG 1546
Query 1559 GAACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCGCCCATG 1618
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1547 GAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCGTTCATG 1606
Query 1619 CCCATATCAGTAACCAAGAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAAAGCAAATTCAGACA 1678
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1607 CCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTATTTTAAAAGCAAATTCAGAGG 1666
Query 1679 CTGGTTTATCAATTGCACCAGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTC-TATGAATGGCACG 1737
||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| | ||| ||||| |
Sbjct 1667 CTGGTGTATCAATTGCACCTGTTGCAGGAGCTAATGATTCATCCTCGT-TGACTGGCATG 1725
Query 1738 TCTCGTTCGTTTTCAGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTTTCAAAGAAAGTCT 1797
|||||||| || || | |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1726 TCTCGTTCATTCTCTGGGTATGATAACCCTTCAGCTCAGGATAATTTTCTGCGAAAGTCT 1785
Query 1798 GAGTCAGAATTTTATGCGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTTCTTGGACTTCTCT 1857
||||||||| |||||| | ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 1786 GAGTCAGAAGTTTATGTAAGACCACCAAATGCCGAGGACCAAAGTTTCTTGGACTTTTCT 1845
Query 1858 ACTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTATG---CGTCA 1914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1846 GCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTGTGAGTCGTCT 1905
Query 1915 GTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTTATGGAAGTTTCTGGCCAGTCTGCTATT 1974
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||
Sbjct 1906 GTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATACTTTTATGGAATTTTCTGGCCACTCTGATATC 1965
Query 1975 CCTGTTGAATCCACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGCATGAGAATAAGCTGCATCCGTTT 2034
||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||| || |||
Sbjct 1966 CCTGTTGAATCAACTAAGGCGGCT-CG-AAAT-CAGAATGAGAATAAGCTGCACCCATTT 2022
Query 2035 GGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAACGTAC-C-AGTTAACCTGTTACCAAACA 2092
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||| || | |||||
Sbjct 2023 GGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTA--GTACACCAGTTAACCCGT--C-AAACA 2077
Query 2093 GGTCCTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTGCAATAGACAATCGGCCCATTGATTCCC 2152
| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||
Sbjct 2078 GATCTTATGGTGCGATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGACAACCGTCCCATTAATTCCC 2137
Query 2153 GAAGAAATACACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGGTCTGGCTTCTAACCGGATGT 2212
|||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||
Sbjct 2138 GAAGAAATACACAAATTGACCCCAGCATGTCCCTCGATACTCTGACTGCTAACCGGATGT 2197
Query 2213 CGCAGTTTGAACATCTTTCCAACCGCTTTAACCTTGGGGATCAACTTTCATCAAATCAAC 2272
| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |
Sbjct 2198 CACAGTTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCATGGGGATCAAC----ATCA---C--C 2248
Query 2273 ATAACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATATAGGTGATCAAG 2332
| | | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2249 A-A-C-A---GCATTTCCAGAATCGGGATATGCTGTCGCATTTACATATAGGTGATCAAG 2302
Query 2333 CTCAGGATCTGGATTATTTAATAACTCTCcagttgcagcagcaacaaaagattcagttgc 2392
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2303 CTCAGGATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAGCAACAGAAGATTCAGTTGC 2362
Query 2393 aacagcagcagaagattcaattgcagcagcagcagaagattcagttgcaacagcagcaga 2452
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 AACAGCAGCAGAAGATTCAATTGCATCAGCAGCAGAAGATTCAGTTGCAACAGCA----- 2417
Query 2453 agatgcagctgcaacagcaTCAACTAGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2512
| |||||| | | | | | | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2418 ---T-CAGCTG-----G-A--A-C-A-A----GAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2458
Query 2513 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGGCAATTACATTATCAACAGATTCTACAAGGACAGA 2572
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2459 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGA 2518
Query 2573 CTCCTGATTCAAGGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGA 2632
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 CTCCTGATACACGGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGA 2578
Query 2633 TGTTGTTAGAACACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAA 2692
|||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2579 TGTTGTTAGAGCGGCAGCTGATGAATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCTTCACAAA 2638
Query 2693 ATTTTGCACCATACATTGAGCAACTTGCCGCTGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAG 2752
|||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || | |||||||
Sbjct 2639 ATTTCGCACCATATATTGAGCAACTTGCTGCAGGAAATTTTGGGCAGTTTTCTCATGAAG 2698
Query 2753 GCCATCAGAGGGAACTACTTGAACAGCTACTTTCAACAAAAATGCAATCTCAATATGGAC 2812
|||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2699 GCCACCAAAGGGAGCTACTTGAACAGCTACTTTCAACACAAATGCAGTCTCAGTATGGAC 2758
Query 2813 -----CAAT--------G--CAA-T-C--TC-CAT-ACGGACAACTGCAATCTGAACCAA 2851
|||| | ||| | | || || |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2759 AAAAGCAATCTCATTATGGACAAATGCAATCTCAACACGGACAACTGCAATCTGAAACAA 2818
Query 2852 CTC-GGTCTTTGGAGTACCAACTGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGA 2910
|| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 2819 -TCCGGTCTTTGGAGTACCAGCTGCTGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGA 2877
Query 2911 GTGAGGCACAATACACTATTGGAGGAACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGAC 2970
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 GTGAGGCACAATACACTATTCGAAGAACAAAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGAC 2937
Query 2971 CATAATGATCAGCTTCTAAGAAGTCATCCTGGGATCCAACGTTCGCGA-TCCTCTACAGG 3029
|||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| | | || ||| ||||
Sbjct 2938 CATAGTGATCAGCTTTTAAGGACTCATCCTGGGATCCAGCGTTCAC-ACTCTTCTGCAGG 2996
Query 3030 ATTTAGACAACTAGACTTTCATCAACAGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGG 3089
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2997 GTTTAGACCATTAGACTTTCATCAACAGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTGGG 3056
Query 3090 TCAACTTGAGCGGAACCTTTTATATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTCGAGCAGGG 3149
||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3057 TCAACTTGAGCGGAATCTTTCATATCAGCAACAACTTCGACAGGAATTATTCGAGCAGGG 3116
Query 3150 TCTGCCATTTGAGCGATCAGCATCCTTACCTGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATCC 3209
||| ||||||||| |||||||||| | | | ||| | | ||||||| |
Sbjct 3117 TCTTCCATTTGAGAGATCAGCATCG------G---G-G---CGG--A--A-TCTGGATGC 3158
Query 3210 AGTAAATGGTCTTGGACTCTCTCAAGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTACCCACATGCA 3269
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3159 AGTAAATGGTCTTGGTCTCTCTCAGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTGCCCACATGCA 3218
Query 3270 -------G--A--TTGGGAA-TTCTACTCTGGGTTTTAATCATCAGAATCCCCGTATACC 3317
| | ||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3219 ATCTTCTGGCAGATTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCATCAGAATCCCCGTATACC 3278
Query 3318 AATAGGTGAACCTCATTTTTCACAGTTGGAATCAATGGAAGGACGTTGGTCTGGAGCTGA 3377
| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 3279 ATTAGGTGAACCACATTTTTCACAATTAGAACCAATGGAAGGACGCTGGTCTGGCGCAGA 3338
Query 3378 CACACAGGTTGTTGGTGACTGGGCCGAATCTCAACTTCATAGATCAAATATTGATGCTGA 3437
|||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| | ||| ||||
Sbjct 3339 TACACAGCTAGCTGGTGACTGGGCTGAATCTCAATTTCGTAGATCTAATGTGGATACTGA 3398
Query 3438 ACATCATAAAATGAGGTCAGAAAGTAGGAGAATGGGTGAAGATTCCAACTCATGGATGTT 3497
|||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3399 ACATCATAAAATGAGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGATTCCAACTCATGGATGGT 3458
Query 3498 AGGTGGGACTACAGAAGACAGGTCAAAACAGCTATTTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACC 3557
||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3459 AGGTGGGTCTACAGACGACAAGTCAAAACAGCTTTTTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACC 3518
Query 3558 CGGCCATCAATCTGCTGAATCACCAAGCATGAACCGTGGGCAAT-CCTTTGACAGGATGG 3616
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||
Sbjct 3519 CGGCCATCAATCTGCTGAGTCACCAAGCATGAACCGTGGGTA-TGCCTATGACAGGATGG 3577
Query 3617 CTCCTTCTGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACACTTGGCGGC-TATTCAGATCATGGTGGT 3675
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 3578 TTCCTTCAGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCT-TTCAGACCATGGTGGT 3636
Query 3676 AGTCATAACGCTCCTTCAACTTTTGGTGCTCGAGCATTTTCTGATGAACAGATCAACAGA 3735
||||| |||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3637 AGTCAAAACGTTTCATCTACTTTTGGGGCTCGAGCATTTTCTGATGAACAGGTCAACAGA 3696
Query 3736 TCAT-CCGG-AGATAGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAATAATTCCTTGCTTTCTG 3793
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3697 --ATGCCGGCAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAATGGTTCCTTGCTTTCTG 3754
Query 3794 GAATTATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAACTCAAGCCTTCAGTAATATGTATG 3853
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3755 GAATCATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAAGTCAAGCCTTCAGTAATATGTTTG 3814
Query 3854 CTATGAACAAAGACGCGAATGACATCAAAACTTGGAACAA-TGTGCCGCCTAAAAATGAG 3912
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 3815 CTATGAACAAGGACGCAAATGACATCAAAACTTGGAACAACT-TGCCGCCTAAAAATGAG 3873
Query 3913 GGAATGGGAAGGATGATGTCATTTGAAGCCCAAGATAGAATGGGCAAGCAAGCAGTATTA 3972
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3874 GGAATGGGAAGGATGATGTCATATGAAGCCCAAGACAGAATGGGCAAACAAGCAGTATTA 3933
Query 3973 GACTCACTGGTTCATGGGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCTGGCCAACAGTCTTCTTTAAAT 4032
||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||
Sbjct 3934 GACTCCCTGGTTCAAGACGAGCTTCCTGTTGTTACGCGTGGTCAACAGTCTTCTTTCAAT 3993
Query 4033 ATCTCTG 4039
|| ||||
Sbjct 3994 ATATCTG 4000
Score = 688 bits (372), Expect = 0.0
Identities = 476/523 (91%), Gaps = 19/523 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4039 GACCAATACAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCA 4098
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 4092 GACCAGTATAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGG--A------TAGTTCCA 4143
Query 4099 TCACATGGACA-GAATTCAGTATTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATC 4157
||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4144 TCACATGGACATG-ATCCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATC 4202
Query 4158 GCATGAAGGATTGATAGAGCGTATCTCTGACACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCGTA 4217
||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4203 GCATGAAGGATTGCTCGAGCGTATGTCTGATACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTA 4262
Query 4218 TAGTGGAATTGAAGGCGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCGGGAAACAAAGGGTCAAC 4277
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4263 TAGTGGAATAGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAAC 4322
Query 4278 GTCAGAGGC-GACATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGG 4336
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4323 GTCAGAGGCCG-CATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGG 4381
Query 4337 CGGCAGAGTCAAATGATGTAACAGAAGGAAGCAAAGGTGGTGGCGGGAAGAAGAAAGGGA 4396
|| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4382 TGGTAGAGTCATCTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGTGGTGGGAAGAAGAAAGGGA 4441
Query 4397 AGAAAGGGAGGCAGATCGATCCAGCTCTTCTTGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATT- 4455
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4442 AGAAAGGGAGGCAGATAGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGTAATCGCATTC 4501
Query 4456 --ATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGAtttttaactctttttttctttttGTACAAAAT 4513
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||
Sbjct 4502 TTATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGATTTTTAGCT-TTTTGTTCTTCT-GTACAAAAT 4559
Query 4514 CTTTACATGTAAAGATTAGCTTCTCAAGCTTAGGC-GTATAGG 4555
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||
Sbjct 4560 CTTTACTTGTAAAGATTAGCTTCTCATTCTTAGGCAGT-TAGG 4601
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 175483469103
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5