BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G24340.1 Length=2457 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg894724 jgi|Araly1|894724|Al_scaffold_0006_2720 3507 0.0 Ahg921752 jgi|Araly1|921752|scaffold_103033.1 3506 0.0 > Ahg894724 jgi|Araly1|894724|Al_scaffold_0006_2720 Length=2130 Score = 3507 bits (1899), Expect = 0.0 Identities = 2056/2133 (96%), Gaps = 6/2133 (0%) Strand=Plus/Plus Query 208 ATGGCGATTCTAGGGCTTATCAAGAGGGTTACACGAATAA-CCGTAAACAATTCGAGGGT 266 |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCGATTCTAGGGCGGATCACGAGGGTAACACGAATAAGCAG-AAACAATTCGAGGGT 59 Query 267 CAGAGTGTACCCAGTGAGGTACTTCCAAAGGAAGGACCTTTCAAGCACAAA-TCTATTCA 325 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct 60 CAGAGTGTGCCCAGTGAGGTACTTCCAAAGCAAGGACCTTTCAAATACAAATTC-ATTCA 118 Query 326 ATGGTGAAGATGCTGCTAAGCTTCCTGTTCTGATCGTCGGCGCTGGACCGGTGGGACTCG 385 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 119 ATGGCGAAGATGCTGCTAAGCTTCCTGTTCTGATCGTCGGCGCTGGACCGGTGGGCCTCG 178 Query 386 TTTTATCCATCCTTCTCACCAAACTAGGAGTGAAATGTGCTGTTGTTGACAAAGCCACAA 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 179 TTTTATCCATCCTTCTCACCAAACTAGGAGTGAAATGTGCTGTTGTGGACAAAGCTACAA 238 Query 446 GCTTCTCGAAACATCCACAAGCACACTTTATCAACAACCGATCAATGGAGATCTTCCGTG 505 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 GCTTCTCGAAACACCCACAAGCACATTTTATCAACAACCGATCAATGGAGATCTTCCGTG 298 Query 506 AATTGGATGGATTAGCTGAGGAGATTGAAAGATCACAGCCTCCTGTAGATTTGTGGAGAA 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 CATTGGATGGATTAGCTGAGGAGATTGAAAGATCACAGCCTCCTGTAGATTTGTGGAGAA 358 Query 566 AATTTATTTACTGTACATCTCTCTCCGGCTCAACACTAGGCACAGTTGATCACATGCAGC 625 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 359 AATTTATTTACTGTACATCTCTCTCCGGCTCAACTCTAGGCACAGTGGATCACATGCAGC 418 Query 626 CTCAAGATTTTGAGAAAGTTGTCAGCCCGGCTTCTGTTGCTCACTTCTCCCAGTACAAAT 685 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 CTCAAGATTTTGAGAAAGTTGTCAGCCCGGCTTCCGTTGCTCACTTCTCCCAGTACAAAT 478 Query 686 TGACAAATTTATTGCTTAAGCGGTTGGAAGACCTCGGCTTTCATGTTCGTGGTTCCAAAG 745 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 479 TGACAAATTTATTGCTGAAGCGGTTGGGAGACCTCGGCTTTCATGTTCGAGGTTCCAAAG 538 Query 746 AGTCGGATGGTCTTGAGGCTGACTCTGTGGTTGCGAGGCAAATTCTTATGGGTCATGAGT 805 |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 AGTCGGATGGTCTTGAGGTTGACGCTGTGGTTGCGAGGCAAATTCTTATGGGTCATGAGT 598 Query 806 GTGTGGGGATTGATGCTAACAAGGACAGTATTACTGCAACTGTTTCTTTTCTCAAAGGAG 865 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 599 GTGTGGCGATTGATGCTAACAAGGACAGTATTACTGCAACTGTTTCTTATCTCAAAGGAG 658 Query 866 GCAAGCATATGAAAAGAAACATTCAATGTAGTCTACTGGTTGGTGCTGATGGTGCTGGGA 925 |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 659 GCAAGCATATGAAAAGAAACATCCAATGTAGTATACTGGTTGGTGCTGATGGGGCTGGGA 718 Query 926 GTGCAGTAAGAAAGCTCACAGTAATAGAAATGCGAGGGGAAAGAGATCTACAGAAGCTTG 985 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct 719 GTGCAGTAAGAAAGCTCACAGCAATAGAAATGCGAGGGGAAAGGGATCTGCAAAAGCTTG 778 Query 986 TTAGTGTCCATTTCATGAGTAGAGAGCTCGGTGAGTACCTGATCAGTA-ACAGACCAGGG 1044 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 779 TTAGTGTCCACTTCATGAGTAGAGAGCTCGGTGAGTACCTGATCAGTAGA-AGACCAGGG 837 Query 1045 ATGCTAttttttatttttAACACCGATGGTATAGGAGTTCTTGTTGCCCATGATCTTCTA 1104 ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 ATGTTATTTTTCATTTTTAACACCGATGGTATAGGAGTTCTTGTTGCCCATGATCTTCTA 897 Query 1105 CAAGGAGAATTTGTTTTGCAGATTCCATACTATCCACCTCAACAGAGTCTATCTGATTTT 1164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 CAAGGAGAATTTGTTTTGCAGATTCCATACTATCCACCTCAACAGAGTCTATCTGATTTT 957 Query 1165 AGTCCTGAGATGTGCAAGATGCTGATATTCAATTTGGTGGGACATGAGCTTTCAGACTTG 1224 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 AGTCCTGAGATGTGCAGGATGCTGATATACAATTTGGTGGGACATGAGCTTTCAGACTTG 1017 Query 1225 GATGTAGCTGATATTAAGCCATGGGTCATGCATGCTGAAGTCGCCGAGAAATTCATGTGT 1284 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 GATGTAGCTGATATTAAGCCATGGGTCATGCATGCTGAAGTCGCCGAGAAATTCATGTGC 1077 Query 1285 TGTGAGAACAGAGTGATACTTGCTGGTGATGCTGCTCACCGGTTCCCGCCTGCTGGAGGT 1344 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1078 TGTGAGAACAGAGTGATACTTGCTGGTGATGCTGCTCACCGGTTCCCACCTGCTGGAGGT 1137 Query 1345 TTTGGAATGAACACTGGAATTCAGGATGCTCATAATCTTGCATGGAAAATAGCAGCTCTT 1404 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1138 TTTGGAATGAACACTGGAATTCAGGATGCTCATAATCTTACATGGAAAATAGCAGCTCTT 1197 Query 1405 GTTCAGGGTTCTGCAAACTCTTCAATTCTTAAAACTTATGAAACAGAACGTAGGCCGATT 1464 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 GTTCAGGGTTCTGCAAAATCTTCGATTCTTAAAACTTATGAAACAGAACGTAGGCCGATT 1257 Query 1465 GCCCTTTCCAATACTTCACTCAGTGTTCAAAACTTCAGAGCAGCTATGTCAGTTCCTTCA 1524 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1258 GCCCTTTCCAATACTTCACTCAGTGTTCAGAACTTCAGAGCAGCTATGTCTGTTCCTTCA 1317 Query 1525 GCGCTAGGCCTTGACCCAACAGTTGCAAACTCAGTGCATAGGTTTATAAACAAAACAGTT 1584 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 GCGCTAGGCCTTGACCCGACAGTTGCAAACTCAGTGCATAGGTTTATAAACAAAACAGTT 1377 Query 1585 GGTTCGATCCTTCCAACTGGGCTGCAAAAGGCAATCTTGGATAATGTCTTTGCACTAGGT 1644 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1378 GGTTCCATCCTTCCAACTGGGCTACAAAAGGCAATCTTGGATAATGTCTTTGCACTAGGT 1437 Query 1645 CGTGCACAGCTTTCAGAATCTCTGTTGAATGAGAGCAATCCACTGGGAAATCAGAGACTT 1704 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1438 CGTGCACAGCTTTCAGAATCTCTGTTGAATGAGAGCAATCCTCTGGGAAATCAGAGACTT 1497 Query 1705 AGCAGACTAAAGAGTATCTTCGAAGGAGGAAAAAGCCTTCAACTACAGTTTCCTGCAGAA 1764 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1498 AGAAGACTAAAGAGTATCTTCGAACGAGGAAAAAGCCTTCAACTACAGTTTCCTGCAGAA 1557 Query 1765 GATCTTGGTTTCAGGTATTTAGAGGGAGCCATTGTTCCTGATAACGAGTCTGAAGCTGGT 1824 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 GATCTTGGTTTCAGGTATTTAGAGGGAGCCATTGTTCCTGATAACGAGTCTGAAGCTGGT 1617 Query 1825 GATCCCGAAGTACCGAGTGGTCGTAGAAGAGACTATGTCCCTTGTGCTGAACCAGGTTCA 1884 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1618 GATCCCGAACTACCGAGTGGTCGTAGAAGAGACTATGTACCTTGTGCTGAACCAGGTTCA 1677 Query 1885 AGACTGCCTCATATGTATGTGAAAATACTGTCAGATTCCACAAGAGAGGTTATTGTTTCT 1944 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1678 AGACTGCCACATATGTATGTGAAAATACTGTCAGATTCCACAAGAGAGGTTATTGTTTCT 1737 Query 1945 ACACTGGATCTTGTTTCGACAGAGAAAGTGGAGTTTCTACTTATAATATCGCCATTACAA 2004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1738 ACACTGGATCTTGTTTCGACAGAGAAAGTGGAGTTTCTACTTATAATATCACCATTACAA 1797 Query 2005 GAGTCCTATGAGCTAGCTCATGCTACATTCAAAGTCGCAAAAGAGTTTATGGCTAGTGTA 2064 |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1798 GAGTCCTATGAGTTAGCTCGTGCTACATTCAAAGTCGCAAAAGAGTTTATGGCTAATGTA 1857 Query 2065 AAAGTATGCGTGGTCTGGCCTAGTAGTGATGATGGTCTTGAAAGGAAGAGCAATTCAGCA 2124 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1858 AAAGTATGTGTGGTCTGGCCTAGTAGTGATGAAGGTCTTGAAAGGGAGAGCAATTCAGCA 1917 Query 2125 TTAGCTCCATGGGAAAATTATGTCGATGTTATGGAAGTTAAAAAACAAAATGGTGAAGGA 2184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 1918 TTAGCTCCATGGGAAAATTATGTCGATGTTATGGAAGTTATAAGACAAAATGGTGAAGGA 1977 Query 2185 ACTTCGTGGTGGAGTATTTGTAAAATGTCAGAGAGAGGATCTATTTTAGTCCGTCCCGAC 2244 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1978 ACTTCTTGGTGGAGTATTTGTAAAATGTCGGAGAGAGGATCTATTTTAGTCCGTCCTGAC 2037 Query 2245 CAACACATTGCTTGGCGAGCAAAGTCTGGTATTACTTTGGATCCTACTCTGCACATGAGA 2304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2038 CAACACATTGCTTGGCGAGCAAAGTCTGGTATTACTTTGGATCCTACTCTGCACATGAGA 2097 Query 2305 GATGTCTTCACCATCATACTAGGGAAACAATGA 2337 || | |||| |||||||||| || ||||||||| Sbjct 2098 GAAGCCTTCTCCATCATACTTGGTAAACAATGA 2130 > Ahg921752 jgi|Araly1|921752|scaffold_103033.1 Length=2174 Score = 3506 bits (1898), Expect = 0.0 Identities = 2086/2178 (96%), Gaps = 8/2178 (0%) Strand=Plus/Plus Query 184 GGTTTAAGG-TTTAGCTTCTCGACTATGGCGATTCTAGGGCTTATCAAGAGGGTTACACG 242 ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| Sbjct 1 GGTTT-AGGATTTAGATTCTCGACCATGGCGATTCTAGGGCTGATCACGAGGGTAACACG 59 Query 243 AATAACCGTAAACAATTCGAGGGTCAGAGTGTACCCAGTGAGGTACTTCCAAAGGAAGGA 302 ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct 60 AATAAGCATAAACAATTCGAGGGTCAGAGTGTACCCAGTGAGGCACTTCCAAAGCAAGGA 119 Query 303 CCTTTCAAGCACAAA-TCTATTCAATGGTGAAGATGCTGCTAAGCTTCCTGTTCTGATCG 361 ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 CCTTTCAAGTACAAATTC-ATTCAATGGCCAAGATGCTGCTAAGCTTCCTGTTCTGATCG 178 Query 362 TCGGCGCTGGACCGGTGGGACTCGTTTTATCCATCCTTCTCACCAAACTAGGAGTGAAAT 421 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 179 TCGGCGCTGGACCGGTGGGCCTCGTTTTATCCATTCTTCTCACCAAACTAGGAGTGAAAT 238 Query 422 GTGCTGTTGTTGACAAAGCCACAAGCTTCTCGAAACATCCACAAGCACACTTTATCAACA 481 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 239 GTGCTGTTGTTGACAAAGCCACAAGCTTCTCCAAACATCCACAAGCACATTTTATCAACA 298 Query 482 ACCGATCAATGGAGATCTTCCGTGAATTGGATGGATTAGCTGAGGAGATTGAAAGATCAC 541 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 ACCGATCAATGGAGATCTTCCGTGCATTGGATGGATTAGCTGAGGAGATTGAAAGATCAC 358 Query 542 AGCCTCCTGTAGATTTGTGGAGAAAATTTATTTACTGTACATCTCTCTCCGGCTCAACAC 601 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 359 AGCCTCCTGTAGATTTGTGGAGAAATTTTATTTACTGTACATCTCTCTCCGGCTCAACTC 418 Query 602 TAGGCACAGTTGATCACATGCAGCCTCAAGATTTTGAGAAAGTTGTCAGCCCGGCTTCTG 661 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 419 TAGGCACAGTGGATCACATGCAGCCTCAAGATTTTGAGAAAGTTGTCAGCCCAGCTTCTG 478 Query 662 TTGCTCACTTCTCCCAGTACAAATTGACAAATTTATTGCTTAAGCGGTTGGAAGACCTCG 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 TTGCTCACTTCTCCCAGTACAAATTGACAAATTTATTGCTTAAGCGGTTGGAAGACCTCG 538 Query 722 GCTTTCATGTTCGTGGTTCCAAAGAGTCGGATGGTCTTGAGGC-TGACTCTGTGGTTGCG 780 ||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||||| Sbjct 539 GCTTTCATGTTCGAGGTTCCAAGGATTCAGATGGTATTGA-GCTTGACTCTGTGGTTGCG 597 Query 781 AGGCAAATTCTTATGGGTCATGAGTGTGTGGGGATTGATGCTAACAAGGACAGTATTACT 840 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 AGGCAAATTCTTATGGGTCATGAGTGTGTGGCGATTGATGCTAACAAGGACAGTATTACT 657 Query 841 GCAACTGTTTCTTTTCTCAAAGGAGGCAAGCATATGAAAAGAAACATTCAATGTAGTCTA 900 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 GCAACTGTTTCTTATCTCAAAGGAGGCAAGCATATGAAAAGAAACATTCAATGTAGTCTA 717 Query 901 CTGGTTGGTGCTGATGGTGCTGGGAGTGCAGTAAGAAAGCTCACAGTAATAGAAATGCGA 960 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 718 CTGGTTGGTGCTGATGGTGCTGGGAGTGCTGTAAGAAAGCTCACAGAAATAGAAATGCGA 777 Query 961 GGGGAAAGAGATCTACAGAAGCTTGTTAGTGTCCATTTCATGAGTAGAGAGCTCGGTGAG 1020 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 778 GGGGAAAAAGATCTACAAAAGCTTGTTAGTGTCCATTTTATGAGTAGAGAGCTCGGTGAG 837 Query 1021 TACCTGATCAGTAACAGACCAGGGATGCTAttttttatttttAACACCGATGGTATAGGA 1080 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 838 TACCTGATCAGTAGCAGACCAGGGATGTTATTTTTTATTTTTAACACCGACGGTATAGGA 897 Query 1081 GTTCTTGTTGCCCATGATCTTCTACAAGGAGAATTTGTTTTGCAGATTCCATACTATCCA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GTTCTTGTTGCCCATGATCTTCTACAAGGAGAATTTGTTTTGCAGATTCCATACTATCCA 957 Query 1141 CCTCAACAGAGTCTATCTGATTTTAGTCCTGAGATGTGCAAGATGCTGATATTCAATTTG 1200 ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 CCTCAACAGAGTCTATCTGATTTCAGTCTTGAGATGTGCAAGATGCTGATATTCAATTTG 1017 Query 1201 GTGGGACATGAGCTTTCAGACTTGGATGTAGCTGATATTAAGCCATGGGTCATGCATGCT 1260 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 GTGGGACATCAGCTTTCAGACTTGGATGTAGCTGACATTAAGCCATGGGTCATGCATGCT 1077 Query 1261 GAAGTCGCCGAGAAATTCATGTG-TTGTGAGAACAGAGTGATACTTGCTGGTGATGCTGC 1319 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 GAAGTCGCCGAGAAATTCATGTGCTT-TGAGAACAGAGTGATACTTGCTGGTGATGCTGC 1136 Query 1320 TCACCGGTTCCCGCCTGCTGGAGGTTTTGGAATGAACACTGGAATTCAGGATGCTCATAA 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 TCACCGGTTCCCGCCTGCTGGAGGTTTTGGAATGAACACTGGAATTCAGGATGCTCATAA 1196 Query 1380 TCTTGCATGGAAAATAGCAGCTCTTGTTCAGGGTTCTGCAAACTCTTCAATTCTTAAAAC 1439 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || Sbjct 1197 TCTTGCATGGAAAATAGCAGCTCTTGTTCAGGGCTCTGCAAAATCTTCGATTCTTAACAC 1256 Query 1440 TTATGAAACAGAACGTAGGCCGATTGCCCTTTCCAATACTTCACTCAGTGTTCAAAACTT 1499 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1257 TTATGAAACAGAACGTAGGCCGATTGCCCTCTCCAATACTTCACTCAGTGTTCAGAACTT 1316 Query 1500 CAGAGCAGCTATGTCAGTTCCTTCAGCGCTAGGCCTTGACCCAACAGTTGCAAACTCAGT 1559 || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 CAAAGCAGCTATGTCGGTTCCTTCAGCGCTAGGCCTTGACCCAACAGTTGCAAACTCAGT 1376 Query 1560 GCATAGGTTTATAAACAAAACAGTTGGTTCGATCCTTCCAACTGGGCTGCAAAAGGCAAT 1619 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1377 GCATAGGTTTATAAACAAAACAGTTGGTTCCATCCTTCCAACTGGGCTACAAAAGGCAAT 1436 Query 1620 CTTGGATAATGTCTTTGCACTAGGTCGTGCACAGCTTTCAGAATCTCTGTTGAATGAGAG 1679 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct 1437 CTTGGATAATGTCTTTGCACTAGGACGTGCACAGCTTTCAGAATCTATATTGAATGAGAG 1496 Query 1680 CAATCCACTGGGAAATCAGAGACTTAGCAGACTAAAGAGTATCTTCGAAGGAGGAAAAAG 1739 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1497 CAATCCGCTGGGAAATCAGAGACTTAGCAGATTAAAGAGTATCTTCGAAGGAGGAAAAAG 1556 Query 1740 CCTTCAACTACAGTTTCCTGCAGAAGATCTTGGTTTCAGGTATTTAGAGGGAGCCATTGT 1799 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1557 CCTACAGCTACAGTTTCCTGCAGAAGATCTTGGTTTCAGGTATTTAGAGGGAGCCATTGT 1616 Query 1800 TCCTGATAACGAGTCTGAAGCTGGTGATCCCGAAGTACCGAGTGGTCGTAGAAGAGACTA 1859 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1617 TCCTGATAGCAAGTCTGAAGCTGGTGATCCCGAAGTACCGAGTGGTCGTAGAAGAGACTA 1676 Query 1860 TGTCCCTTGTGCTGAACCAGGTTCAAGACTGCCTCATATGTATGTGAAAATACTGTCAGA 1919 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1677 TGTGCCTTGTGCTGAACCAGGTTCAAGACTGCCTCATATGTATATGAAAATACTGTCAGA 1736 Query 1920 TTCCACAAGAGAGGTTATTGTTTCTACACTGGATCTTGTTTCGACAGAGAAAGTGGAGTT 1979 ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 TTCCAAAAGAGATGTTATTGTTTCTACACTGGATCTTGTTTCGACAGAGAAAGTGGAGTT 1796 Query 1980 TCTACTTATAATATCGCCATTACAAGAGTCCTATGAGCTAGCTCATGCTACATTCAAAGT 2039 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1797 TCTACTTATAATATCGCCATTACAAGAGTCTTATGAGCTAGCTCGTGCTACATTCAAAGT 1856 Query 2040 CGCAAAAGAGTTTATGGCTAGTGTAAAAGTATGCGTGGTCTGGCCTAGTAGTGATGATGG 2099 || ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1857 CGGAAAAGAGTTAATGGCTAATGTAAAAGTATGTGTGGTCTGGCCTAGTAGTGATGAAGG 1916 Query 2100 TCTTGAAAGGAAGAGCAATTCAGCATTAGCTCCATGGGAAAATTATGTCGATGTTATGGA 2159 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1917 TCTTGAAAGGGAGAGCAATTCAGCAGTAGCTCCATGGGAAAATTATGTCGATGTTATGGA 1976 Query 2160 AGTTAAAAAACAAAATGGTGAAGGAACTTCGTGGTGGAGTATTTGTAAAATGTCAGAGAG 2219 ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 1977 AGTTATAAGACAAAATGGTGAAGGAACTTCTTGGTGGAGTATATGTAAAATGTCAGACAG 2036 Query 2220 AGGATCTATTTTAGTCCGTCCCGACCAACACATTGCTTGGCGAGCAAAGTCTGGTATTAC 2279 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2037 AGGATCTATTTTAGTCCGTCCTGACCAACACATTGCTTGGCGAGCAAAGTCTGGTATTAC 2096 Query 2280 TTTGGATCCTACTCTGCACATGAGAGATGTCTTCACCATCATACTAGGGAAACAATGATG 2339 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| Sbjct 2097 TTTGGATCCTACTCTGCACATGAGAGATGCCTTCTCCATCATACTTGGTAAACAATGATG 2156 Query 2340 AACATCACAATTTTATTC 2357 |||| | ||||||||||| Sbjct 2157 AACAACGCAATTTTATTC 2174 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 92597385595 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5