BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G25350.2 Length=2602 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg472840 jgi|Araly1|472840|fgenesh2_kg.1__2794__AT1G25350.1 4135 0.0 Ahg893903 jgi|Araly1|893903|Al_scaffold_0006_1899 1339 0.0 Ahg908402 jgi|Araly1|908402|Al_scaffold_0002_1483 259 7e-68 > Ahg472840 jgi|Araly1|472840|fgenesh2_kg.1__2794__AT1G25350.1 Length=2597 Score = 4135 bits (2239), Expect = 0.0 Identities = 2472/2582 (96%), Gaps = 26/2582 (1%) Strand=Plus/Plus Query 4 AAACCCTAAGGTGGTCTCACTT-TCGTTTCTGTTACTTTGTCAGTTTCGTCGCCATGGTT 62 ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1 AAACCCTAAGGAGGTCTCATTTCTCGTTTCTGTTACTTTGTCAGCTTCGTCGCCATGGTT 60 Query 63 CTCAAAGACGATAACTCCGAGAAATCTATTGAGCTCTTCATTAGTATTGGTTTGGACGAG 122 |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 61 CTCAAAGACGATAACTCCGACAAATCTGTCGAGCTCTTCCTTAGCATTGGTTTGGACGAG 120 Query 123 AAAACAGCTCGTAATACCATCAATAATAACAAGGTCACCGCCAATCTCACCGCCGTTATC 182 |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAAACAGCTCGTAATACCATTAACAACAACAAGGTCACCGCCAATCTCACCGCCGTTATC 180 Query 183 CACGAGGCTGCTGTTACTGATGGGTGCGATCGAAATACTGGCAATCTGTTATACTCGGTC 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| Sbjct 181 CACGAGGCTGCTGTTACTGATGGGTGCGATCGAAATACTGGAAATCTTTTGTACTCGGTC 240 Query 243 GCTACTAAGTTCCCTACAAATGCTCTTGTGCATCGCCCTACATTGCTCAAGTACATTGTT 302 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GCTACTAAGTACCCTGCAAATGCTCTTGTGCATCGTCCTACATTGCTCAAGTACATTGTT 300 Query 303 AACTCTAAGATTAAAACTCCAGCCCAATTGGAAGCTGCATTTGCCTTTTTTGCCAGTACC 362 | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 301 ACCTCTAAGATTAAGACTCCAGCCCAATTGGAAGCTGCATTTGCCTTTTTTGCCAATACC 360 Query 363 GGTCCTGAGGACTTTAAGCTGAATGAGTTTGAAGAGGCATGTGGTGTTGGGATTGAAGTT 422 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGTTCTGAGGACTTTAAGCTGAATGAGTTTGAAGAGGCATGTGGTGTTGGGATTGAAGTT 420 Query 423 TCCCCAGAAGATATTGAGAAAGCAGTTAAAGGAATCTTTGAAGAGAATAAGAAAACAATA 482 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct 421 TCCCCAGAAGATATTGAGAAAGCAGTTAAGGGAATCTTTGAAGACAATAAGACAACAATA 480 Query 483 TTGGAGCAGCGCTATCGAACTAATGTGGGTGAATTATTTGGACATGTCCGGAAAAGTTTG 542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 481 TTGGAGCAGCGCTATCGAACTAATGTGGGTGAATTATTTGGACATGTCCGGAAAATTTTG 540 Query 543 CCATGGGCCGATCCTAAGATTGTAAAGAAACTCATAGATGAGAAAATGTATGAGCTGCTT 602 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 541 CCATGGGCAGATCCTAAGATTGTAAAGAAACTCATAGATGAAAAAATGTATGAACTGCTT 600 Query 603 GGTGAGAAAACCGCTGCTGATAATgaaaaacctacaaaaaagaaggagaagaaggagaag 662 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GGTGAGAAAACTGCTGCTGATAACGAAAAACCTACAAAAAAGAAGGAGAAGAAGGAGAAG 660 Query 663 cctgccaaagtcgaggaaaagaaagCTGTGGTGGAAACTACCGCAGAGCCATCTGAAGAG 722 ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CCTACCAAAGTCGAGGAAAAGAAAGCTGTTATGGAAACTACCGCAGAGCCATCTGAAGAG 720 Query 723 GAGCTTAATCCATATACTATATTCCCTCAGCCAGAACAAAATTTTATGGTTCACACAGAA 782 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GAGCTTAATCCATATACTATATTCCCTCAGCCAGAGCAAAATTTTATGGTTCACACAGAA 780 Query 783 GTGTTTTTCAGTGATGGCTCTATTCTCAGATGTAGCAATACAAAGGAAGTACTTGACAAA 842 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 781 GTGTTTTTCAGTGATGGCTCTATTCTCAGATGTAGCAATACAAAGGAAGTGCTTGACAAA 840 Query 843 CATCTCAAGGTGACTGGAGGGAAAGTTTATACTCGGTTCCCCCCTGAACCAAATGGGCTA 902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 841 CATCTCAAGGTGACTGGAGGGAAAGTTTATACTCGGTTCCCCCCTGAACC-AA------A 893 Query 903 TGGTTTTATGTTCGTTTCCAATGCTTGTAC-TTCC-AGGCTATGTTTGTTGATTTTGGTC 960 ||| ||| || | | || ||| || | || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 894 TGG--TTA---TC---TAC-AT-ATTGGACATGCCAAGGCTATGTTTGTTGATTTTGGTC 943 Query 961 TTGCAAAGGAGCGAGGGGGTTGCTGTTATCTAAGGTATGATGATACAAATCCAGAGGCAG 1020 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 944 TTGCAAAGGAGCGAGGGGGCTGCTGTTATCTAAGGTATGATGATACAAATCCAGAGGCAG 1003 Query 1021 AAAAGGAAGAGTATATTAATCATATTGAAGAAATTGTTAAG-TGGATGGGTTGGGAACCC 1079 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 1004 AAAAGGAAGAGTATATTAATCACATTGAAGAAATTGTT-AGCTGGATGGGTTGGGAACCC 1062 Query 1080 TTCAAGATTACATACACCAGTGATTATTTCCAGGAACTGTATGATTTGGCAGTGGAGTTG 1139 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1063 TTCAAGATTACATACGCCAGTGATTATTTCCAGGAACTGTATGATTTGGCAGTGGAGTTA 1122 Query 1140 ATTCGGAGAGGTCATGCTTATGTTGATCATCAGACT-GCTGATGAGATAAAAGAGTACAG 1198 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 1123 ATTCGGAGAGGTCGTGCTTATGTTGATCATCAGACTGGC-GATGAGATAAAAGAGTACAG 1181 Query 1199 AGAGAAGAAAATGAACAGCCCCTGGAGGGACAGACCTATTGAAGAATCTCTAAAACTTTT 1258 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1182 AGAGAAGAAAATGAACAGCCCCTGGAGGGACAGGCCTATTGAAGAATCTCTAAAACTTTT 1241 Query 1259 TGATGAAATGAGACGAGGCATCATTGAGGAAGGGAAGGCAACCCTAAGAATGAAGCAAGA 1318 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1242 TGACGAAATGAGACGAGGCATGATTGAGGAAGGGAAGGCAACCCTAAGAATGAAGCAAGA 1301 Query 1319 TATGCAGAGTGACAATTTTAATATGTATGATCTTATTGCCTATCGAATAAAGTTCGCACC 1378 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1302 TATGCAGAGTGACAATTTTAATATGTATGACCTTATTGCCTATCGAATAAAGTTCGCACC 1361 Query 1379 TCATCCTAAGGCTGGTGACAAGTGGTGTATCTATCCGAGTTATGATTATGCCCACTGCAC 1438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1362 TCATCCTAAGGCTGGTGACAAGTGGTGTATCTATCCGAGTTATGATTATGCCCACTGCAC 1421 Query 1439 TGTTGATTCTCTTGAGAATATAACGCATTCGCTCTGTACTCTTGAATTTGAAACCCGGCG 1498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1422 TGTTGATTCTCTTGAGAATATAACGCATTCGCTCTGTACTCTTGAATTTGAAACCCGGCG 1481 Query 1499 TGCTTCATACTATTGGCTGTTACATTCCCTGAGTCTCTACATGCCATATGTGTGGGAATA 1558 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1482 TGCTTCATACTATTGGCTGTTACATTCTCTGAGTCTCTACATGCCATATGTGTGGGAATA 1541 Query 1559 TTCACGGTTGAATGTGACAAACACTGTAATGTCCAAGCGTAAGTTGAATTACATAGTGAC 1618 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1542 TTCACGGTTGAATGTGACAAATACTGTAATGTCCAAGCGTAAGTTGAATTACATAGTGAC 1601 Query 1619 AAACAAGTATGTTGATGGTTGGGATGATCCACGTCTTTTGACACTTTCTGGTTTGAGACG 1678 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1602 AAACAAGTATGTTGATGGTTGGGATGATCCACGTCTTTTGACACTTTCTGGTTTGAGGCG 1661 Query 1679 GAGGGGTGTGACTTCAACTGCGATTAATGCATTTGTACGAGGCATTGGGATTACTAGAAG 1738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 1662 GAGGGGTGTGACTTCAACTGCGATTAATGCATTTGTACGAGGAATTGGGATTACCAGAAG 1721 Query 1739 TGATGGTAGCATGATACACGTAAGTCGTCTTGAGCATCATATTAGAGAGGAATTGAATAA 1798 |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1722 TGATGGTAGCATGATACATGTGAGTCGTCTTGAGCACCATATTAGAGAGGAATTGAATAA 1781 Query 1799 AACAGCCCCTCGCACCATGGTGGTGCTTAATCCTCTTAAAGTGGTCATCACCAATTTGGA 1858 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1782 AACAGCTCCTCGCACTATGGTGGTGCTTAATCCTCTTAAAGTGGTCATCACCAATTTGGA 1841 Query 1859 ATCAGACAAGCTTATAGAGCTTGATGCCAAAAGGTGGCCTGATGCTCAGAACGATGATCC 1918 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1842 ATCAGACAAGGTTATAGAGCTTGATGCCAAAAGGTGGCCTGATGCTCAGAACGATGATCC 1901 Query 1919 CTCAGCATTCTACAAGGTACCGTTCTCTAGAGTTGTATACATTGACCAATCTGACTTCCG 1978 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1902 CTCGGCATTCTACAAGGTACCGTTCTCGAGAGTTGTATACATTGATCAATCTGACTTCCG 1961 Query 1979 AATGAAGGATTCAAAAGATTATTATGGGCTCGCCCCTGGTAAATCTGTTTTGCTAAGATA 2038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct 1962 AATGAAGGATTCAAAAGATTATTATGGGCTCGCCCCTGGTAAATCTATCTTGCTAAGATA 2021 Query 2039 TGCTTTCCCAATCAAGTGCACCAATGTTGTCTTTGCTGATGACAATGAAACCGTTCGTGA 2098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2022 TGCTTTCCCAATCAAGTGCACCAATGTTGTCTTTGCTGATGACAATGAAACCGTTCGTGA 2081 Query 2099 GATTCATGCGGAATATGACCCCGAGAAAAAGTCAAAGCCAAAGGGGGTTCTACACTGGGT 2158 ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2082 AATTCATGTGGAATATGACCCTGAGAAAAAGTCAAAGCCAAAGGGGGTTCTACACTGGGT 2141 Query 2159 CGCTGAATCTTCCCCAGGAGAAGAGCCCATAAAGGTGGAAGTCCGATTATTTGAGAAACT 2218 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2142 CGCTGAATCTTCCCCAGGAAAAGAGCCCATAAAGGTTGAAGTCCGATTATTTGAGAAACT 2201 Query 2219 CTTTAACTCCGAGAACCCGGCTGAACTCAATGATGCTTGGCTCACTGACATTAACCCAAA 2278 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2202 CTTTAACTCCGAGAACCCGGCTGAACTCAATAATGATTGGCTCACCGACATTAACCCAAA 2261 Query 2279 CTCTAAAATGGTAATTTCTGGTGCCTATGCTGTATCAACCCTTAAAGATGCTGCAGTTGG 2338 ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2262 CTCCAAAGTGGTAATTTCTGGTGCCTATGCTGTATCAACCCTTAAAGATGCTGCAGTCGG 2321 Query 2339 GGACAGATTCCAATTCGAGAGGCTAGGTTATTACGCGGTGGACAAGGACTCTGAGCCAGG 2398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2322 GGACAGATTCCAATTCGAGAGGCTAGGTTATTACGCGGTGGACAAGGACTCTGAGCCAGG 2381 Query 2399 AAAGCTTGTGTTCAACCGGACGGTCACACTCAGAGACAGCTACGGGAAAGGTGGAAAGTA 2458 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2382 AAAGCTTGTGTTTAACCGGACGGTCACGCTCAGAGACAGCTATGGGAAAGGTGGAAAGTA 2441 Query 2459 AAACACTCCACCCATATTAACATTTTGTTGGTCAAAATTCCCCCGAAAGGGTTTTATAAC 2518 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||| Sbjct 2442 AAACACTCCACCCATATTAACACTTTGTTGGTGAAAACTCCCCC-AAAGGGGTT-ATAAC 2499 Query 2519 AACAGTAAATGAAATCGTTTGGTTTGATACGCACATTGTACAACAGTTGGTTTTTTATTT 2578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 2500 AACAGTAAATGAAATCGTTTGGTTTGATACGCACATTGTGCAACAGTTAGTTTTTTATTT 2559 Query 2579 CT 2580 || Sbjct 2560 CT 2561 > Ahg893903 jgi|Araly1|893903|Al_scaffold_0006_1899 Length=2358 Score = 1339 bits (725), Expect = 0.0 Identities = 971/1091 (89%), Gaps = 11/1091 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1371 TTCGCACCTCATCCTAAGGCTGGTGACAAG-TGGTGTATCTATCCGAGTTATGATTATGC 1429 ||| |||| |||||| | |||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1270 TTCACACCCCATCCTCATACTGGTGAC-AGATGGCGTATCTATCCGACCTATGATTATGC 1328 Query 1430 CCACTGCACTGTTGATTCTCTTGAGAATATAACGCATTCGCTCTGTACTCTTGAATTTGA 1489 |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1329 CCACTGCATTGTTGATTCTCTTGAAAATATAACACATTCGCTCTGCACTCTTGAATTTGA 1388 Query 1490 AACCCGGCGTGCTTCATACTATTGGCTGTTACATTCCCTGAGTCTCTACATGCCATATGT 1549 ||| | |||||||| ||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| Sbjct 1389 GACCAGACGTGCTTCTTACTATTGGTTATTACACTCGCTGGGTCTCTACATGCCGTATGT 1448 Query 1550 GTGGGAATATTCACGGTTGAATGTGACAAACACTGTAATGTCCAAGCGTAAGTTGAATTA 1609 |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || Sbjct 1449 GTGGGAGTATTCGCGGTTGAATGTCACAAACACTGTTATGTCCAAGCGTAAGCTGAACTA 1508 Query 1610 CATAGTGACAAACAAGTATGTTGATGGTTGGGATGATCCACGTCTTTTGACACTTTCTGG 1669 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 1509 CATTGTGACAAACAAGTATGTTGATGGTTGGGATGATCCACGTCTTTTAACACTTGCTGG 1568 Query 1670 TTTGAGACGGAGGGGTGTGACTTCAACTGCGATTAATGCATTTGTACGAGG-CATTGGGA 1728 |||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| | Sbjct 1569 TTTGAGGCGGAGAGGTGTAACTCCTACTGCGATTAATGCATTTGTACGAGGAC-TTGGAA 1627 Query 1729 TTACTAGAAGTGATGGTAGCATGATACACGTAAGTCGTCTTGAGCATCATATTAGAGAGG 1788 |||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1628 TTACCAGAAGTGATGGTAGCCTGATACATGTGAGTCGTCTTGAGCATCATATTAGAGAGG 1687 Query 1789 AATTGAATAAAACAGC-CCCTCGCACCATGGTGGTGCTTAATCCTCTTAAAGTGGTCATC 1847 | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1688 AGTTGAATAAAACAGCTCCC-CGCACCATGGTGGTGCTGAATCCTCTTAAGGTGGTTATC 1746 Query 1848 ACCAATTTGGAATCAGACAAGCTTATAGAGCTTGATGCCAAAAGGTGGCCTGATGCTCAG 1907 |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 1747 ACCAATTTGGAAGCAGACAAGGTTATGGAGCTTGATGCTAAAAGATGGCCTGATGCTCAG 1806 Query 1908 AACGATGATCCCTCAGCATTCTACAAGGTACCGTTCTCTAGAGTTGTATACATTGACCAA 1967 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| Sbjct 1807 AACGATGATCCCTCAGCATTCTACAAGGTTGCGCTCTCTAGAGTTATATACATTGAGCAA 1866 Query 1968 TCTGACTTCCGAATGAAGGATTCAAAAGATTATTATGGGCTCGCCCCTGGTAAATCTGTT 2027 |||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| | Sbjct 1867 TCTGACTTCCAAAAGGAGGATTCAAAAAATTATTTTGGACTTGCCCCTGGTAAATCAGCC 1926 Query 2028 TTGCTAAGATATGCTTTCCCAATCAAGTGCACCAATGTTGTCTTTGCTGATGACAATGAA 2087 ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| Sbjct 1927 TTGCTTCGATACGCTTTCCCAATCAAGTGCACCAACGTTGTCTTTGCTAATGACACTGAA 1986 Query 2088 ACCGTTCGTGAGATTCATGCGGAATATGACCCCGAGAAAAAG-TCAAAGCCAAAGGGGGT 2146 |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| || Sbjct 1987 ACCGTTTGTGAGATTCATGTGGAGTATGATCCTGAGAAAAAGAT-AAAGCCAAAGGGTGT 2045 Query 2147 TCTACACTGGGTCGCTGAATCTTCCCCAGGAGAAGAGCCCATAAAGGTGGAAGTCCGATT 2206 ||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || Sbjct 2046 TCTACACTGGGTCCCTGCATCTTCACCAGGAAAAGAGCCCATTAAGGTTGAAGTCCG-TT 2104 Query 2207 -ATTTGAGAAACTCTTTAACTCCGAGAACCCGGCTGAACTCAATGATGCTTGGCTCACTG 2265 ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct 2105 CATTTGAGAACCTCTTTAATTCCGAGAACCCAGCTGAACTCAATGATGATTGGCTCACCG 2164 Query 2266 ACATTAACCCAAACTCTAAAATGGTAATTTCTGGTGCCTATGCTGTATCAACCCTTAAAG 2325 |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 2165 ACATTAACCCCAACTCCAAAGTGGTAGTTTCTGATGCCTATGCTTTATCAACCATTAAAG 2224 Query 2326 ATGCTGCAGTTGGGGACAGATTCCAATTCGAGAGGCTAGGTTATTACGCGGTGGACAAGG 2385 ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct 2225 ATGCTGCCGTTGGGGACACATTCCAGTTCGAGAGGCTAGGTTATTACACGGTTGACAAGG 2284 Query 2386 ACTCTGAGCCAGGAAAGCTTGTGTTCAACCGGACGGTCACACTCAGAGACAGCTACGGGA 2445 ||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| || Sbjct 2285 ACTCTAAACCGGGAAAGCTTGTGTTTAACCGGACGGTCACGCTCAAAGACGGCTACAAGA 2344 Query 2446 AAGGTGG-AAA 2455 ||||||| ||| Sbjct 2345 AAGGTGGGAAA 2355 Score = 1042 bits (564), Expect = 0.0 Identities = 838/965 (87%), Gaps = 39/965 (4%) Strand=Plus/Plus Query 415 TTGAAGTTTCCCCAGAAGATATTGAGAAAGCAGTTAAAGGAATCTTTGAAGAGAATAAGA 474 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| || Sbjct 305 TTGAAGTTTCCCCAGAAGATATTGAGAAAACAGTCAAACAAATCTTTGAAGAAAATATGA 364 Query 475 AAACAATATTGGAGCAGCGCTATC-GAACTAATGTGGGTGAATTATTTGGACATGTCCGG 533 ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 365 AAACAATATTGGAGCAGCGGT-CCAGAACTAGTGTGGGTAAATTAACCGGACATGTCCGG 423 Query 534 AAAAGTTTGCCATGGGCCGATCCTAAGATTGTAAAGAAACTCATAGATGAGAAAA-TGTA 592 ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | || | ||||||| || |||| |||| Sbjct 424 AAAAGTTTGCCATGGGCAGATCCTGAGACTGTTAGGAGAGTCATAGAAGA-AAAACTGTA 482 Query 593 TG-AGCTGCTTGGTGAGAAAACCGCTGCTGATAATgaaaaacctacaaaaaagaaggaga 651 || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 483 TGCA-TTGCTTGGCGAGAAAACAGCTGCTGACAATGAGAAACCTACAAAAAAGAAGGAGA 541 Query 652 agaaggagaagcctgccaaagtcgaggaaaagaaagCTGTGGTGGAAACTA-CCGCAGAG 710 |||| |||||||| ||||||| | | |||||||||| ||||| ||| || || | Sbjct 542 AGAAAGAGAAGCCCACCAAAGT--A-G---AGAAAGCTGTTTTGGAAGCTATCC-CACAT 594 Query 711 CCATCTGAAGAGGAGCTTAATCCATATACTATATTCCCTCAGCCAGAA-CAAAATTTTAT 769 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct 595 CCATCTGAAGAGGAGCTTAATCCATATTCTATATTCCCTCAGCCA-AAGGAAAATCTTAA 653 Query 770 GGTTCACACAGAAGTGTTTTTCAGTGATGGCTCTATTCTCAGATGTAGCAATACAAAGGA 829 |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||| Sbjct 654 GGTTCACACAGAAGTGCTTTTCAGTGACGGCTCTGTGCTCATATGTAGCAATACCAAGGA 713 Query 830 AGTACTTGACAAACATCTCAAGGTGACTGGAGGGAAAGTTTATACTCGGTTCCCCCCTGA 889 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 714 AGTGCTTGACAAACATCTCAAGGTGACTGGAGGGAAAGTTTATACCCGGTTCCCTCCTGA 773 Query 890 ACCAAATGGGCTATGGTTTTATGTTCGTTTCCAATGCTTGTAC-TTC-CAGGCTATGTTT 947 ||| || |||| ||| || ||| || | | || | | ||||||||| | Sbjct 774 ACC-AA------ATGG--TTA---TC---TCC-AT-ATAGGACATGCAAAGGCTATGTCT 816 Query 948 GTTGATTTTGGTCTTGCAAAGGAGCGAGGGGGTTGCTGTTATCTAAGGTATGATGATACA 1007 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 817 GTTGATTTTGGTCTTGCAAAGGAGCGAGGGGGCTGGTGTTATCTGAGGTACGATGATACA 876 Query 1008 AATCCAGAGGCAGAAAAGGAAGAGTATATTAATCATATTGAAGAAATTGTTAAGTGGATG 1067 ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 877 AATCCTGAGGCGGAAAAGAAAGAGTATATTAGTCACATTGAAGAAATTGTTAATTGGATG 936 Query 1068 GGTTGGGAACCCTTCAAGATTACATACACCAGTGATTATTTCCAGGAACTGTATGATTTG 1127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 937 GGTTGGGAACCCTTCAAGATTACATACACCAGTGATTATTTCCAAGAATTGTATGATTTG 996 Query 1128 GCAGTGGAGTTGATTCGGAGAGGTCATGCTTATGTTGATCATCAGA-CTGCTGATGAGAT 1186 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| Sbjct 997 GCAGTGGAGTTGATTCGAAGAGGTCACGCTTATGTTGATCATCAGAAC-GCTGAGGAGAT 1055 Query 1187 AAAAGAGTACAGAGAGAAGAAAATGAACAGCCCCTGGAGGGACAGACCTATTGAAGAATC 1246 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 1056 AAAAGAGTACAGAGAGAACAAAATGAACAGCCCCTGGAGGGAAAGGCCTATTGAAGAATC 1115 Query 1247 TCTAAAACTTTTTGATGAAATGAGACGAGGCATCATTGAGGAAGGGAA-GGCAACCCTAA 1305 |||| | |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||| || |||| Sbjct 1116 TCTAGAGCTTTTTGACGAAATGAGACGAGGAATGATCGACGA-GGGAAAGGCCACACTAA 1174 Query 1306 GAATGAAGCAAGATATGCAGAGTGACAATTTTAATATGTATGATCTTATTGCCTATCGAA 1365 || | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 1175 GATTAAAGCAAGACATGAAGAGTGATAATTGTAATATGTATGACCTTATTGCCTATCGTA 1234 Query 1366 TAAAG 1370 ||||| Sbjct 1235 TAAAG 1239 > Ahg908402 jgi|Araly1|908402|Al_scaffold_0002_1483 Length=2166 Score = 259 bits (140), Expect = 7e-68 Identities = 205/236 (87%), Gaps = 6/236 (3%) Strand=Plus/Plus Query 1117 TGTATGATTTGGCAGTGGAGTTGATTCGGAGAGGTCATGCTTATGTTGATCATCAGACTG 1176 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 899 TGTATGACTTGGCAGTGGAGTTGATCCGGAGAGGCCATGCATATGTTGATCACCAGACTG 958 Query 1177 CTGATGAGATAAAAGAGTACAGAGAGAAGAAAATGAACAGCCCCTGGAGGGACAGACCTA 1236 || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct 959 GAGAAGAGGTAAAAGAGTACAGAGAGAAGAAAATGAACAGCCCTTGGAGAGACAGGCCTA 1018 Query 1237 TTGAAGAATCTCTAAAACTTTTTGATGAAATGAGACGAGGCATCATT-GAGGAAGGGAAG 1295 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || || || ||||||||| Sbjct 1019 TTGAAGAATCTCTGAAACTTTTTGACGAAATGAAACGAGG-ATTGTTCGAAGAAGGGAAG 1077 Query 1296 GCAACCCTAAGAATGAAGCAA-GA-TATGCAGAGTGACAATTTTAATATGTATGAT 1349 || || ||| ||||||| || || |||||||| ||| || |||||||| |||||| Sbjct 1078 GCGACGCTACGAATGAA--AATGAATATGCAGAATGATAACTTTAATATCTATGAT 1131 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 98120471120 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5