BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G27430.1
Length=4613
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg472946 jgi|Araly1|472946|fgenesh2_kg.1__2900__AT1G27430.1 5904 0.0
Ahg472916 jgi|Araly1|472916|fgenesh2_kg.1__2870__AT1G24300.1 4370 0.0
> Ahg472946 jgi|Araly1|472946|fgenesh2_kg.1__2900__AT1G27430.1
Length=4636
Score = 5904 bits (3197), Expect = 0.0
Identities = 3769/4041 (93%), Gaps = 55/4041 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCTTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 CTCAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACCAAA 120
Query 121 TCAAGCGAGTA-CAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTTCCCATGGGAAATCCAAG 179
|| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCAGCGAG-AGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAG 179
Query 180 TGACCCAAATCCGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAA 239
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TGACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAG 239
Query 240 GAAAATTGTGCATGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GAAAATTGTGCCTGAGAATGAAATTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
Query 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGTATTGACAGTGTCTC 359
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAATTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCGTTGACAATGTCTC 359
Query 360 AAGCAGAGAAACTGGTGACATTAAAAATGCTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AGGCAGAGAAACTGGTGACAATAAAAATACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGTGCTGCTGTAAATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCTCGTTGTGAGAAGGTAGATATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAACATCAAGGACAAGGAAGA 539
Query 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAATGTCCGTGCAACCTCTGAACGGGACTC 599
||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 540 GCCACAGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAACGGGACTC 599
Query 600 TGACACTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCTTC 659
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 600 CGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCTCGTCATAGGATGGAATCTCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
Query 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTTATCCCCTGTGTTTCGTTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
Query 840 CATGTATAGAAAACAGAAGCCTGATTCTTCCCTAGGTAGGATTTTGACTGAAATGGATGA 899
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 840 CATGTATAGAGAACAGAAGCCTGATCCTTCCCTAGGTAGGATACCGACTGAAATGGATGA 899
Query 900 AGTTGCCTCCATAACGCAAGTGGCTCTGATTGAACCTCTTGCTTTTATTGCACCTGATGC 959
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 900 GGTTGCCTCCATAACTCAAGTGGCTCTGATCGAACCTCTTTCTTTTATCCCACCTGATGC 959
Query 960 CGAAGAAGAGGCAAACCTTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGCGAAGTTTA 1019
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CGAAGAAGAGGCAAGCCTTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGCGAAGTTTA 1019
Query 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAGTCCTTAGGTGGAAACAGTCTGTTGAAATGCCGCATTCCTGA 1079
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||
Sbjct 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAATCCTTAGGTGAAAACAGTCTGGTGAAATACCGCATACCTGA 1079
Query 1080 GTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGGTGACAATGGTTC 1139
|||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||
Sbjct 1080 CTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGC-TT-C----------GAATGGTGACAATAGTTC 1127
Query 1140 CATGAAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTCTGGGGGCTGCTTC 1199
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||
Sbjct 1128 CCTGCAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAGTGGAGGTTTAGGGGCTGCTTC 1187
Query 1200 TAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTGGTGGAGCTGGTTA 1259
|| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1188 TAACGTCTCAAGATTGAATTTAGTGGCTTCTGAAAGTTGTGGATCTGTTGGAGCTGGTTA 1247
Query 1260 TC-AGCTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCAGTTTTTACTAAGTCCTCTGTGT 1318
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 1248 TCAAGC-TTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCTGCGTTTACTAAGTCCTCTGTGT 1306
Query 1319 TGGATGGGAGCGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGCTTATACGGGCAAGCTGCAGC 1378
|||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 TGGATGGGAGTGAATCCGTTCTTGCTTCTTTCGAGCAAGATTATACGGGCAAGCTGCAGC 1366
Query 1379 AACCAGATACTGAAGTGGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAG-TTCTTATTC 1437
||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 1367 AACCAGATATTGAAGTGAATCACCCGGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAGTTTC-TGTTC 1425
Query 1438 TTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTCATTGGTTCTGACATTATTTCA 1497
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 TTGTATATTGACCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTTATTGGTTCTGACATTATTTCA 1485
Query 1498 TGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAGTGCTCCAGAA 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1486 TGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAATGCTCCAGAA 1545
Query 1558 GGGACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATATAAAGGCAGAAAGCGTACAT 1617
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||
Sbjct 1546 GGAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCGTTCAT 1605
Query 1618 GCCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGTTTAAAAGCAAATTCAGAG 1677
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1606 GCCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTATTTTAAAAGCAAATTCAGAG 1665
Query 1678 GCTGGTGGATCAGTTGCACATGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTCTTTGACTGGCATA 1737
||||||| |||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1666 GCTGGTGTATCAATTGCACCTGTTGCAGGAGCTAATGATTCATCCTCGTTGACTGGCATG 1725
Query 1738 TCTCGTTCATTTTCTGTGTATAACAACCCTTCAGGTCAGGATAATTTTCAGAGAAAGTCT 1797
||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1726 TCTCGTTCATTCTCTGGGTATGATAACCCTTCAGCTCAGGATAATTTTCTGCGAAAGTCT 1785
Query 1798 GAGTCCGAAGTTTATGGAAGACCACCACATGCCGAGGACCAAAGTTTCTTGGACTTCTCT 1857
||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1786 GAGTCAGAAGTTTATGTAAGACCACCAAATGCCGAGGACCAAAGTTTCTTGGACTTTTCT 1845
Query 1858 GCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTAGAGTTTCTGGTTATGCA-TCGTC 1916
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||
Sbjct 1846 GCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTGTG-AGTCGTC 1904
Query 1917 TGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGGCCACTCTGATAT 1976
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 TGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATACTTTTATGGAATTTTCTGGCCACTCTGATAT 1964
Query 1977 CCCTGTTGAAGT-AACTACGGCTGCTACTCGAAATCAGAATGAGAATAAGCTGCACCCAT 2035
|||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 CCCTGTTGAA-TCAACTAAGGC-G--GCTCGAAATCAGAATGAGAATAAGCTGCACCCAT 2020
Query 2036 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTAGTACACCAGTTAACCCGTTACCAAACA 2095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 2021 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTAGTACACCAGTTAACCCG-T--CAAACA 2077
Query 2096 GATCTTCTGGTGCAATGGGAGAGCCTAGTTGTTCAATAGAAAACCGTCCCATTAATTCCC 2155
|||||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2078 GATCTTATGGTGCGATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGACAACCGTCCCATTAATTCCC 2137
Query 2156 GAAGAAATTCTCAAATTGACCCCAACATATCCCTCGATGCTTTGTCTGGTAACCGGATGT 2215
|||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| |||||||||||
Sbjct 2138 GAAGAAATACACAAATTGACCCCAGCATGTCCCTCGATACTCTGACTGCTAACCGGATGT 2197
Query 2216 CACAATTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCATGGGGATCAGCTTCCATCAAATCAAC 2275
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 2198 CACAGTTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCAT-GGG----G----------ATCAAC 2242
Query 2276 ATCACCAACAGCATTTCCAAAATCGGGATATGCTGTCACATTTACATATAGGTGATC-A- 2333
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 2243 ATCACCAACAGCATTTCCAGAATCGGGATATGCTGTCGCATTTACATATAGGTGATCAAG 2302
Query 2334 ---A-GATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTgcagcaacaacagaagattcagatgc 2389
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 2303 CTCAGGATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAGCAACAGAAGATTCAGTTGC 2362
Query 2390 aacagcagcagaagattcaattgcaacagcagcagaagaTTCAGTTGCAACAGCATCAGT 2449
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 AACAGCAGCAGAAGATTCAATTGCATCAGCAGCAGAAGATTCAGTTGCAACAGCATCAGC 2422
Query 2450 TGGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAGCAACAGTCCCATGCTC 2509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2423 TGGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAACAACAGTCCCATGCTC 2482
Query 2510 GACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGACTCCTGATACAAGGTTTGGGCAGT 2569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2483 GACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGACTCCTGATACACGGTTTGGGCAGT 2542
Query 2570 CACATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGATGTTGTTAGAGCAGCAGATGCTGA 2629
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||
Sbjct 2543 CACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGATGTTGTTAGAGCGGCAGCTGATGA 2602
Query 2630 ATGAGCTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAAATTTCGCACCATACATTGAGCAAC 2689
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2603 ATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCTTCACAAAATTTCGCACCATATATTGAGCAAC 2662
Query 2690 ACGCCGCAGGAAATTTTGGGCGGTTTACACATGAAGGTCACCAAAGGGAGCTACTTGAAC 2749
|| |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2663 TTGCTGCAGGAAATTTTGGGCAGTTTTCTCATGAAGGCCACCAAAGGGAGCTACTTGAAC 2722
Query 2750 AGCTATTTTCAACACAAATGCAATCTCAGTATGGACAAAAGCAATCTCAATATGGACAAA 2809
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2723 AGCTACTTTCAACACAAATGCAGTCTCAGTATGGACAAAAGCAATCTCATTATGGACAAA 2782
Query 2810 TGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAATCCGGTCTTTGGAGTACCAGCTGC 2869
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783 TGCAATCTCAACACGGACAACTGCAATCTGAAACAATCCGGTCTTTGGAGTACCAGCTGC 2842
Query 2870 TGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGAGTGAGGCACAATACACTATTGGAGG 2929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2843 TGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGAGTGAGGCACAATACACTATTCGAAG 2902
Query 2930 AACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAGTGATCAGCTTTTAAGAACTC 2989
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2903 AACAAAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAGTGATCAGCTTTTAAGGACTC 2962
Query 2990 ATCCTGGGATCCACCGTTCACACTCTTCTGCAGGGTTTAGACCATTAGACTTTCATCAAC 3049
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2963 ATCCTGGGATCCAGCGTTCACACTCTTCTGCAGGGTTTAGACCATTAGACTTTCATCAAC 3022
Query 3050 AGCAGCAGAGGCCACACTTCGAGGATCAGTTTAGTCAACTTGAGCGGAACCGTTCATATC 3109
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 3023 AGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTGGGTCAACTTGAGCGGAATCTTTCATATC 3082
Query 3110 AGCAACAACTTAGACTA-GAATTATTGGAGCACGGTCTTCCATTTGAGAGATCAGCATCG 3168
||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3083 AGCAACAACTTCGAC-AGGAATTATTCGAGCAGGGTCTTCCATTTGAGAGATCAGCATCG 3141
Query 3169 GGGCTGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTTGGTCTCTCCCAGGGTCTGGAGTTGCGGGAT 3228
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3142 GGGCGGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTTGGTCTCTCTCAGGGTCTGGAGTTGCGGGAT 3201
Query 3229 GCTACTGCCCACATGCAATCTTCTGGCAGATTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCAT 3288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3202 GCTACTGCCCACATGCAATCTTCTGGCAGATTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCAT 3261
Query 3289 CAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAATCACATTTTTCACATTTGGAACCAACGGAAGGA 3348
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||
Sbjct 3262 CAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAACCACATTTTTCACAATTAGAACCAATGGAAGGA 3321
Query 3349 CGCTGGTCTGGAGCCGATACACAGCTAGCTGGTGACTGGGCCGAATCTCAATTTCGTAGA 3408
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3322 CGCTGGTCTGGCGCAGATACACAGCTAGCTGGTGACTGGGCTGAATCTCAATTTCGTAGA 3381
Query 3409 TCTAATATGGATACTGAGCATGATAAAATGAGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGAT 3468
|||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3382 TCTAATGTGGATACTGAACATCATAAAATGAGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGAT 3441
Query 3469 CCCAACTCATGGATGGTAGGTGGATCTACAGACGACAAGTCAAAGCAGCTTTTTATGGAG 3528
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3442 TCCAACTCATGGATGGTAGGTGGGTCTACAGACGACAAGTCAAAACAGCTTTTTATGGAG 3501
Query 3529 TTGCTCCACCAGAGACCTGGCCATCAATCTGCTGAGTCACCAAACATGAACCGTGGGTAT 3588
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3502 TTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATCTGCTGAGTCACCAAGCATGAACCGTGGGTAT 3561
Query 3589 -CCTTATGACAGGATGGTTCCTTCAGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCT 3647
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3562 GCCT-ATGACAGGATGGTTCCTTCAGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCT 3620
Query 3648 TTCAGACCATGGTGGTAATCAAAACGTTTCATCTGCTTTTGGGGATCGTTCATTTTCTGA 3707
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3621 TTCAGACCATGGTGGTAGTCAAAACGTTTCATCTACTTTTGGGGCTCGAGCATTTTCTGA 3680
Query 3708 TGAACAGGTCAACAGAGTACCGGGATATGGGAACAATATGGGATCATTGCACCATAATAG 3767
|||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 3681 TGAACAGGTCAACAGAATGCCGGCAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAATGG 3740
Query 3768 TTCCTTACTTTCTGGAATTATCGATGCTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAACTCAAGCCTT 3827
|||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3741 TTCCTTGCTTTCTGGAATCATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAAGTCAAGCCTT 3800
Query 3828 CAGTAATATGTTTGGTATGAACAAAGACGCGAATGACATCAATACTTGGAACAA-TGTGC 3886
|||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 3801 CAGTAATATGTTTGCTATGAACAAGGACGCAAATGACATCAAAACTTGGAACAACT-TGC 3859
Query 3887 CGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATGATGTCATATGATGCCCAAGACAGAATGGGCA 3946
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3860 CGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATGATGTCATATGAAGCCCAAGACAGAATGGGCA 3919
Query 3947 AGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGATTCAAGAGGAGCTTCCTGTTGGTACGCCTGGTCAAC 4006
| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3920 AACAAGCAGTATTAGACTCCCTGGTTCAAGACGAGCTTCCTGTTGTTACGCGTGGTCAAC 3979
Query 4007 AGTCCTCTTTCAATATCTCTG 4027
|||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3980 AGTCTTCTTTCAATATATCTG 4000
Score = 728 bits (394), Expect = 0.0
Identities = 499/546 (91%), Gaps = 21/546 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4036 AGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGGG 4095
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 4101 AGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGG--A------TAGTTCCATCACATGGA 4152
Query 4096 CA-GAATTCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCTCATTCTTCTTCGTCGCATGAAGG 4154
|| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 4153 CATG-ATCCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAGG 4211
Query 4155 ATTACTCGAGCGTATGTCTGACACAGCTAGCAGGGCAGCAGCAAGTTCCTATAGTGGAAT 4214
||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4212 ATTGCTCGAGCGTATGTCTGATACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTATAGTGGAAT 4271
Query 4215 TGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGGC 4274
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4272 AGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGGC 4331
Query 4275 GGCATCGTTTAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCGGCAGAGTC 4334
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4332 CGCATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGTGGTAGAGTC 4391
Query 4335 AACTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGCGGTGGTAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAG 4394
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4392 ATCTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGTGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAG 4451
Query 4395 GCAAATCGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGAATTCTTATGGGCGA 4454
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4452 GCAGATAGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGTAATCGCATTCTTATGGGCGA 4511
Query 4455 GATCCACCGCGCTGATGATTTTTAGCTTTT-GTTCGTT-TGTACAAAATCTTTACATGTA 4512
||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||
Sbjct 4512 GATCCACCGTGCTGATGATTTTTAGCTTTTTGTTC-TTCTGTACAAAATCTTTACTTGTA 4570
Query 4513 AAGATTAGATTCTCAT----A--C--TTAGGCGTATAGGTCCTTTTCGGACAGATTTCTT 4564
|||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4571 AAGATTAGCTTCTCATTCTTAGGCAGTTAGGCGTATAGGTCCTTCTCGGACAGATTTCTT 4630
Query 4565 ACATCA 4570
|||||
Sbjct 4631 CCATCA 4636
> Ahg472916 jgi|Araly1|472916|fgenesh2_kg.1__2870__AT1G24300.1
Length=4300
Score = 4370 bits (2366), Expect = 0.0
Identities = 3150/3516 (90%), Gaps = 103/3516 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1069 CGCATTC-CTGAGTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGG 1127
||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 838 CGC-TTCTCTGACTCAGGTGAAACAAAAGTTGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTGTTAATGG 896
Query 1128 TGACAATGGTTCCATGAAAAATAATGATTCC-GGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTC 1186
|||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 897 TGACAATGGTTCCATGCAAAATAGTGA-TCCTGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGATC 955
Query 1187 TGGGGGCTGCTTCTAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTG 1246
|||||| |||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 TGGGGGGTGCTCCAAGCGTCTCAAGATTAAATTCTGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTT 1015
Query 1247 GTGGAGCTGGTTA-TC-AGCTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCAGTTTTTAC 1304
|||| |||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 1016 TTGGAACTGG-TATTCAAG-TTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTCTTAC 1073
Query 1305 TAAGTCCTCTGTGTTGGATGGGAGCGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGCTTATAC 1364
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1074 TAAGTCCTCTGTGTTGGATGGGAGTGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGATTACAT 1133
Query 1365 GGGCAAGCTGCAGCAACCAGATACTGAAGTGGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGA 1424
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 GGGCAAGCTGCAGCAACCAGATATTGAAGTAGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGA 1193
Query 1425 GGAGTTCTTATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTCATTGGTTC 1484
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1194 GGAGTTTTTATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTC 1253
Query 1485 TGACATTATTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGC 1544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TGACATTATTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGC 1313
Query 1545 AAGTGCTCCAGAAGGGACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATATAAAGGC 1604
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1314 AAATGCTCCAGAAGAAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGAC 1373
Query 1605 AGAAAGCGTACATGCCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGTTTAAA 1664
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1374 AGAAAGCGCCCATGCCCATATCAGTAACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAA 1433
Query 1665 AGCAAATTCAGAGGCTGGTGGATCAGTTGCACATGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTC 1724
|||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1434 AGCAAATTCAGACACTGGTTTATCAATTGCACCTGTAGCAGAATCAAATGATTCATCCTC 1493
Query 1725 TTTGACTGGCATATCTCGTTCATTTTCTGTGTATAACAACCCTTCAGGTCAGGATAATTT 1784
| | | | ||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1494 --T--C--G----T-TCG-T--TTTT-GGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTT 1538
Query 1785 TCAGAGAAAGTCTGAGTCCGAAGTTTATGGAAGACCACCACATGCCGAGGACCAAAGTTT 1844
|||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 1539 TCAGAGAAAGTCTGAGTCAGAAGTTTATGGGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTT 1598
Query 1845 CTTGGACTTCTCTGCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTAGAGTTTCTGG 1904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1599 CTTGGACTTCTCTGCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGG 1658
Query 1905 TTATGCATCGTCTGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGG 1964
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1659 TTATGCA---TCAGTAAATTCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGG 1715
Query 1965 CCACTCTGATATCCCTGTTGAAGT-AACTACGGCTGCTACTCGAAATCAGAATGAGAATA 2023
||| |||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1716 CCAGTCTGCTATTCCTGTTGAA-TCAACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGAATGAGAATA 1774
Query 2024 AGCTGCACCCATTTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTAGTACACCAGTTAACC 2083
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||
Sbjct 1775 AGCTGCACCCGTTTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAATGCACCAGTTAACC 1834
Query 2084 CGTTACCAAACAGATCTTCTGGTGCAATGGGAGAGCCTAGTTGTTCAATAGAAAACCGTC 2143
||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |
Sbjct 1835 TGTTCCCAAACAGGTCTTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGAAAATTGGC 1894
Query 2144 CCATTAATTCCCGAAGAAATTCTCAAATTGACCCCAACATATCCCTCGATGCTTTGTCTG 2203
||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||| || ||
Sbjct 1895 CCATTGATTCCCGAAGAAATAAACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGCTCTGGCTT 1954
Query 2204 GTAACCGGATGTCACAATTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCATGGGGATCAGCTTC 2263
|||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||
Sbjct 1955 CTAACCGGATGTCGCAGTTTGAACATGTTTCCAACCGCTTTAGCCTTGGGGATCAACTTT 2014
Query 2264 CATCAAATCAACATCACCAACAGCATTTCCAAAATCGGGATATGCTGTCACATTTACATA 2323
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 2015 CATCAAATCAACATCACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATA 2074
Query 2324 TAGGTGATC-A----A-GATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTgcagcaacaacaga 2377
||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2075 TAGGTGATCAAGCTCAGGATCTTGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAGCAACAGA 2134
Query 2378 agattcagatgcaacagcagcagaagattcaattgcaacagcagcagaagaTTCAGTTGC 2437
|||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2135 AGATTCAGTTGCAACAGCAGCAGAAGATTCAGTTGCAACAGCAGCAGAAGATGCAGCTGC 2194
Query 2438 AACAGCATCAGTTGGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAGCAAC 2497
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2195 AACAGCATCAACTAGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAACAAC 2254
Query 2498 AGTCCCATGCTCGACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGACTCCTGATACAA 2557
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2255 AGTCCCATGCTCGACAATTGCATTTTCAACAGATTCTACAAGGACAGACTCCTGATTCAA 2314
Query 2558 GGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGATGTTGTTAGAGC 2617
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2315 GGTTTGGGCAGTCCCATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGATGTTGTTAGAGC 2374
Query 2618 AGCAGATGCTGAATGAGCTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAAATTTCGCACCAT 2677
| ||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2375 ACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAATTCTGGTCATCCGTCACAAAATTTTGCACCAT 2434
Query 2678 ACATTGAGCAACACGCCGCAGGAAATTTTGGGCGGTTTACACATGAAGGTCACCAAAGGG 2737
|| ||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||||| || || ||||
Sbjct 2435 ACCTTGAGCAACTTGCTGCAGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAGGCCATCAGAGGG 2494
Query 2738 AGCTACTTGAACAGCTATTTTCAACACAAATGCAATCTCAGTATGGACAAAAGCAATCTC 2797
| ||||||||||||||| |||| | || | || | || ||||||||
Sbjct 2495 AACTACTTGAACAGCTACTTTC-A-AC--A---AA----A--AT--------GCAATCTC 2533
Query 2798 AATATGGACAAATGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAATC-CGGTCTTTG 2856
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2534 AATATGGACCAATGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAA-CTCGGTCTTTG 2592
Query 2857 GAGTACCAGCTGCTGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGAGTGAGGCACAAT 2916
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2593 GAGTACCAACTGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGAGTGAGGCACAAT 2652
Query 2917 ACACTATTGGAGGAACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAGTGATCAG 2976
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2653 ACACTATTGGAGGAACAGAGACATATTGATCCTCTGTGGCCATCTGACCATAATGATCAG 2712
Query 2977 CTTTTAAGAACTCATCCTGGGATCCACCGTTCACACTCTTCTGCAGGGTTTAGACCATTA 3036
||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||| ||
Sbjct 2713 CTTCTAAGAAATCATCCTGGGATCCACCGTTCGCGGTCCTCTACAGGATTTAGACCACTA 2772
Query 3037 GACTTTCATCAACAGCAGCAGAGGCCACACTTCGAGGATCAGTTTAGTCAACTTGAGCGG 3096
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2773 GACTTTCATCAACATCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGGTCAACTTGAGCGG 2832
Query 3097 AACCGTTCATATCAGCAACAACTTAGACTAGAATTATTGGAGCACGGTCTTCCATTTGA- 3155
|||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2833 AACCTTTTATATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTTGAGCAGGGTCTGCCATTTGAG 2892
Query 3156 -G---AG-A----T---C---A--GCATCGGGGCTGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTT 3198
| || | | | | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2893 CGATCAGCATCCTTACCCGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTT 2952
Query 3199 GGTCTCTCCCAGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTGCCCACATGCAATCTTCTGGCAGA 3258
|| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || | | | |||||
Sbjct 2953 GGACTCTCTCAGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCCACTG-CC-CA--C-A-----T-GCAGA 3001
Query 3259 TTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCATCAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAATCA 3318
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3002 TTGGG-AATTCTACTCTGGGTTTCAGTCATCAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAACCT 3060
Query 3319 CATTTTTCACATTTGGAACCAACGGAAGGACGCTGGTCTGGAGCCGATACACAGCTAGCT 3378
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |
Sbjct 3061 CATTTTTCACAGTTGGAACCAATAGAAGGACGCTGGTCTGGAGCTGATACACAGGTTGTT 3120
Query 3379 GGTGACTGGGCCGAATCTCAATTTCGTAGATCTAATATGGATACTGAGCATGATAAAATG 3438
||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||
Sbjct 3121 GGTGAGTGGGCCGAATCTCAATTTCATAGATCAAATATTGATGCTGAACATCATAAAATA 3180
Query 3439 AGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGATCCCAACTCATGGATGGTAGGTGGATCTACA 3498
||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3181 AGGTCAGAAAGTAGGAGAATGGGTGAGGATTCCAACTCATGGATGGTAGGTGGAACTACA 3240
Query 3499 GACGACAAGTCAAAGCAGCT-TTTTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACCTGGCCATCAATC 3557
|| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3241 GAAGACAGGTCAAAACAGCTATTTT-TGGAGTTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATC 3299
Query 3558 TGCTGAGTCACCAAACATGAACCGT-GGGTATCCTTATGACAGGATGGTTCCTTCAGGCC 3616
|||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 3300 TGCTGAATCACCAAGCATGAACCGTGGGGAATCC-TATGACAGGATGGCTCCTTCTGGCC 3358
Query 3617 TTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCTTTCAGACCATGGTGGTAATCAAAACGTTT 3676
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
Sbjct 3359 TTACCCCAGGGATTCAAACACTTGGCGGCCTTTCAGACCATGGTGGTAGTCTTAACGCTC 3418
Query 3677 CATCTGCTTTTGGGGATCGTTCATTTTCTGATGAACAGGTCAACAGAGT-ACCGGGATAT 3735
||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | | | ||| ||
Sbjct 3419 CATCTACTTTTGGGGCTCGAGCATTTTCTGATGAACAGATCAACAGA-TCATCAGGAGAT 3477
Query 3736 GGGAACAATATGGGATCATTGCACCATAATAGTTCCTTACTTTCTGGAATTATCGATGCT 3795
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |
Sbjct 3478 AGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAACAGTTCCTTGCTTTCTGGAATTATTGATGGT 3537
Query 3796 GGGCGGTCAACTCAGAATGAAACTCAAGCCTTCAGTAATATGTTTGGTATGAACAAAGAC 3855
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 3538 GGGCGGTCAAATCAGAATGAAAGTCAAGCCTTCAGTAATATGTTTGCTATGAACAAGGAC 3597
Query 3856 GCGAATGACATCAATACTTGGAACAATGTGCCGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATG 3915
| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3598 ACAAACGACATCAAAACTTGGAACAACGTGCCGCTTAAAAATGATGGAATGGGAAGGATG 3657
Query 3916 ATGTCATATGATGCCCAAGACAGAATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGATTCAA 3975
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3658 ATGTCATATGAAGCCCAAGACAGAATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGGTTCAA 3717
Query 3976 GAGGAGCTTCCTGTTGGTACGCCTGGTCAACAGTCCTCTTTCAATATCTCTGACCGA-TA 4034
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 3718 GAGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCTGGTCAACATTCTTCTTTCAATATCTCTGACC-AGTA 3776
Query 4035 CAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGG 4094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3777 CAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGG 3836
Query 4095 GCA-GAATTCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCTCATTCTTCTTCGTCGCATGAAG 4153
|| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 3837 ACATGA-TCCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAG 3895
Query 4154 GATTACTCGAGCGTATGTCTGACACAGCTAGCAGGGCAGCAGCAAGTTCCTATAGTGGAA 4213
|| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3896 GAGTGCTCGAGCGTATGTCTGACACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTATAGTGGAA 3955
Query 4214 TTGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGG 4273
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3956 TTGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCGGGAAATAAAGGGTCAACGTCAGAGG 4015
Query 4274 CGGCATCGTTTAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCGGCAGAGT 4333
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4016 CAGCATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCAGCAGAGT 4075
Query 4334 CAACTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGCGGTGGTAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGA 4393
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4076 CATCTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGCGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGA 4135
Query 4394 GGCAAATCGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGAATTCTTATGGGCG 4453
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4136 GGCAGATAGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATTCTTATGGGCG 4195
Query 4454 AGATCCACCGCGCTGATGATTTTTAGCT-TTTGTT--CGTTT-GTACAAAATCTTTACAT 4509
|||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||
Sbjct 4196 AGATCCACCGTGCTGATGATTTTTAACTCTTTGTTTTCTTTTTGTACAAAATCTTTACAT 4255
Query 4510 GTAAAGATTAGATTCTCATA-CTTAGGCGTATAGGT 4544
||||||||||| |||||| | |||||||||||||||
Sbjct 4256 GTAAAGATTAGCTTCTCA-AGCTTAGGCGTATAGGT 4290
Score = 1218 bits (659), Expect = 0.0
Identities = 781/840 (93%), Gaps = 7/840 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCTTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 CTCAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAATGGCTTTACACGAAA 120
Query 121 TCAAGCGAGTA-CAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTTCCCATGGGAAATCCAAG 179
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAAGCGAG-AGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAG 179
Query 180 TGACCCAAATCCGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAA 239
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 180 TGACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATACACCCGAAGACAAAAAGGACTGGAG 239
Query 240 GAAAATTGTGCATGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GAAAATTGTGCCTGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
Query 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGTATTGACAGTGTCTC 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCATTGACTCTGTCTC 359
Query 360 AAGCAGAGAAACTGGTGACATTAAAAATGCTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AAGCAGAGATACTGGTGACAATAAAAATACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGCGCTGCTGTAAACGAACCCCGCCGCGACAATAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCTCGTTGTGAGAAGGTAGATATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAATATCAAGGACAAGGAGGA 539
Query 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAATGTCCGTGCAACCTCTGAACGGGACTC 599
||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 540 GCCACTGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAGCGGGACTC 599
Query 600 TGACACTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCTTC 659
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
Query 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
||||||| |||||||||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCTCTGTGGGCCGAGGAAGGGCAAATGCAACTCGGAGGAGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGT--A-GTGCTTTATCCC-CTGTGTTTCGTTATCCAAGGGGTAAGTTGC 835
||||||||||||| | |||| | | || || ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGTGCATGTGCGTC-TGCCTCTATGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGC 838
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 174532029778
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5