BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G27770.1
Length=3484
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg472987 jgi|Araly1|472987|fgenesh2_kg.1__2941__AT1G27770.1 5193 0.0
Ahg359101 jgi|Araly1|359101|fgenesh1_pg.C_scaffold_9000141 896 0.0
Ahg949914 jgi|Araly1|949914|scaffold_801801.1 580 2e-164
> Ahg472987 jgi|Araly1|472987|fgenesh2_kg.1__2941__AT1G27770.1
Length=3306
Score = 5193 bits (2812), Expect = 0.0
Identities = 3059/3182 (96%), Gaps = 2/3182 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 135 GTAAGCTGAAGAAATGGAGAGCTACTTGAACGAAAACTTCGGCGATGTGAAGCCGAAGAA 194
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 77 GTAAGCTGAAGAAATGGAGAGTTATTTGAACGAAAACTTCGGCGATGTGAAGTCGAAGAA 136
Query 195 CTCGTCCGATGAGGCGTTGCAGCGTTGGAGGAAGCTCTGCTGGATCGTCAAGAATCCTAA 254
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 137 CTCGTCGGATGAGGCGTTGCAGCGTTGGAGGAAGCTCTGCTGGATCGTGAAGAATCCTAA 196
Query 255 AAGGAGATTTAGATTCACTGCTAATCTGTCTAAGCGTTCCGAGGCCGAGGCGATTCGGCG 314
||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 AAGGAGATTCAGATTCACCGCTAACCTCTCCAAGCGTTCCGAGGCCGAGGCGATTCGGCG 256
Query 315 TTCCAATCAGGAAAAATTTCGAGTGGCGGTCTTAGTTTCACAAGCTGCACTTCAGTTCAT 374
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 257 TTCCAATCAGGAAAAGTTTCGAGTGGCCGTCTTAGTTTCGCAAGCTGCACTTCAATTCAT 316
Query 375 TAATAGTTTAAAGTTGTCCAGTGAGTATACACTACCTGAAGAAGTAAGAAAAGCAGGGTT 434
||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 317 TAATAGTTTGAAGTTGTCCAGTGAGTACACAGTACCTGAAGAAGTAAGAAAAGCAGGATT 376
Query 435 TGAGATTTGTCCTGATGAGTTGGGATCAATTGTAGAAGGTCATGATTTGAAAAAGTTGAA 494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 377 TGAGATTTGTCCTGATGAGTTGGGATCAATTGTAGAAGGTCACGATGTGAAAAAGTTGAA 436
Query 495 AATTCATGGTGGAACTGAGGGCCTCACTGAAAAACTTTCCACGTCTATTGCTAGTGGAAT 554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 437 AATTCATGGTGGAACTGAGGGCCTCACTGAAAAACTCTCCACGTCGATTGCTAGTGGAAT 496
Query 555 TAGTACATCTGAAGACCTGCTGAGTGTAAGAAAAGAAATTTATGGAATCAACCAATTCAC 614
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 497 TAGTACATCGGAAGACCTGCTGAGTGTAAGAAAGGAAATTTATGGAATCAACAAATTCAC 556
Query 615 AGAAAGCCCCAGC-CGTGGCTTTTGGTTATTTGTTTGGGAAGCCCTTCAGGATACAACAC 673
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 557 AGAAAGCCCCA-CTCGTGGCTTTTGGTTATTTGTTTGGGAAGCCCTTCAGGATACCACCC 615
Query 674 TTATGATTCTAGCTGCATGTGCGTTTGTTTCACTTATAGTTGGAATACTGATGGAAGGGT 733
| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616 TCATGATTCTAGCTGCATGTGCGTTTGTCTCTCTTATAGTTGGAATACTGATGGAAGGGT 675
Query 734 GGCCTATTGGTGCCCATGACGGACTTGGTATAGTGGCGAGTATTCTGCTTGTTGTGTTTG 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 676 GGCCTATTGGTGCCCATGACGGACTTGGTATAGTGGCGAGTATTCTGCTTGTTGTATTTG 735
Query 794 TCACTGCCACTAGTGATTATAGGCAATCCCTGCAATTCAAGGACCTGGATGCAGAGAAGA 853
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 TCACTGCCACTAGTGATTATAGGCAATCTCTGCAATTCAAGGACCTGGATGCAGAGAAGA 795
Query 854 AAAAGATTGTGGTTCAGGTTACGAGAGACAAACTGAGGCAAAAAATCTCAATATATGATC 913
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 AAAAGATTGTGGTTCAGGTTACCAGAGACAAGCTGAGGCAAAAAATCTCAATATATGATC 855
Query 914 TACTCCCTGGAGATGTTGTTCATCTTGGCATTGGAGACCAGATTCCAGCAGATGGGCTTT 973
|||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 856 TACTGCCTGGCGATGTTGTTCACCTTGGCATTGGAGACCAGATTCCGGCTGATGGGCTTT 915
Query 974 TTATCTCAGGGTTTTCTGTTCTGATAAATGAATCGAGCTTGACTGGAGAAAGTGAACCGG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 TTATCTCAGGGTTTTCTGTTCTGATAAATGAATCGAGCTTGACTGGAGAAAGTGAACCGG 975
Query 1034 TTAGTGTCAGTGTGGAACACCCGTTTCTTCTCTCTGGTACCAAGGTTCAGGATGGATCTT 1093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 TTAGTGTCAGTGTGGAACACCCGTTTCTTCTCTCTGGTACCAAGGTTCAGGATGGATCTT 1035
Query 1094 GCAAAATGTTGGTGACTACAGTTGGAATGAGGACTCAATGGGGTAAACTGATGGCTACAC 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GCAAAATGTTGGTGACTACAGTTGGAATGAGGACTCAGTGGGGTAAACTGATGGCTACAC 1095
Query 1154 TAAGTGAAGGCGGTGATGATGAGACACCGTTGCAAGTAAAACTTAATGGTGTGGCAACCA 1213
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096 TAAGTGAAGGCGGCGATGATGAGACACCTTTGCAAGTAAAACTTAATGGTGTGGCAACCA 1155
Query 1214 TCATTGGTAAAATAGGTCTATTTTTTGCTGTCATTACGTTTGCTGTTTTGGTTCAAGGAT 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 TCATTGGTAAAATAGGTCTATTTTTTGCTGTCATTACGTTTGCTGTTTTGGTTCAAGGAT 1215
Query 1274 TGGCTAATCAGAAGCGCCTAGATAATTCTCACTGGATCTGGACTGCTGATGAATTGATGG 1333
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1216 TGGCTAATCAGAAGCGCCTCGATGGTTCTCACTGGATCTGGACTGGTGATGAATTGATGG 1275
Query 1334 CGATGCTAGAATATTTTGCTGTTGCTGTAACAATTGTTGTGGTTGCAGTTCCGGAGGGTC 1393
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||
Sbjct 1276 CAATGCTGGAATATTTTGCTGTTGCTGTAACAATTGTTGTGGTTGCGGTCCCAGAGGGTC 1335
Query 1394 TGCCGTTGGCTGTGACATTAAGTCTTGCTTTTGCCATGAAAAAGATGATGAATGACAAAG 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 TGCCGTTGGCTGTGACATTAAGTCTTGCTTTTGCCATGAAAAAGATGATGAATGACAAAG 1395
Query 1454 CGCTAGTGCGCAATCTTGCTGCTTGTGAGACAATGGGATCTGCAACAACTATTTGTAGTG 1513
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 CGCTAGTGCGCAATCTAGCTGCTTGTGAGACAATGGGATCTGCAACAACTATTTGTAGTG 1455
Query 1514 ACAAAACTGGAACTCTTACAACAAATCACATGACAGTTGTAAAAGCCTGCATCTGTGAAC 1573
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1456 ACAAGACTGGAACTCTTACAACAAATCACATGACAGTTGTAAAAGCCTGCATCTGTGAGC 1515
Query 1574 AAGCCAAAGAGGTTAATGGTCCTGATGCTGCTATGAAATTTGCCTCTGGTATCCCTGAGT 1633
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 AAGCCAAAGAGGTTAATGTTTCTGATGCTGCTATGAAATTTGCCTCTGGTATCCCTGAGT 1575
Query 1634 CTGCTGTTAAACTTCTACTGCAATCTATATTTACTAACACTGGTGGTGAGATTGTTGTGG 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1576 CTGCTGTTAAACTTCTACTGCAATCTATATTTACTAACACTGGTGGTGAGATTGTAGTGG 1635
Query 1694 GCAAAGGAAACAAAACCGAGATACTGGGAACTCCTACAGAAACTGCTCTGTTAGAATTTG 1753
|||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1636 GCAAAGGAAACAAAACTGAGATACTGGGAACACCCACAGAAACTGCTCTGTTAGAATTTG 1695
Query 1754 GGTTGTCACTCGGAGGGGACTTCCAAGAAGTAAGGCAAGCCTCAAATGTTGTGAAAGTTG 1813
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 GGTTGTCACTCGGAGGAGACTTCCAAGAAGTAAGACAAGCCTCAAATGTTGTGAAAGTTG 1755
Query 1814 AGCCCTTTAACTCTACAAAGAAAAGAATGGGAGTTGTCATTGAGCTGCCTGAAAGACATT 1873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1756 AGCCCTTTAACTCTACAAAGAAAAGAATGGGAGTTGTCATTGAGCTGCCTGAAAGACATT 1815
Query 1874 TCCGGGCACATTGTAAGGGTGCTTCAGAGATAGTTTTAGATTCTTGTGATAAGTACATCA 1933
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1816 TCCGGGCGCATTGTAAGGGTGCTTCTGAGATAGTTTTAGATTCTTGTGATAAGTACATCA 1875
Query 1934 ACAAAGATGGTGAAGTTGTTCCTCTCGATGAAAAATCGACCAGTCACCTGAAGAACATAA 1993
||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 1876 ACAAAGATGGTGAAGTTGTCCCTCTTAATGAAGAATCTACCGGTCACCTAAAGAACATAA 1935
Query 1994 TTGAGGAATTTGCTAGCGAAGCACTTCGAACTCTTTGCCTAGCGTATTTCGAAATTGGTG 2053
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1936 TTGAGGAATTTGCTAGTGAAGCACTTCGAACTCTTTGCCTAGCTTATTTCGAAATTGGTG 1995
Query 2054 ATGAATTCTCATTAGAGGCTCCTATTCCAAGTGGTGGATACACTTGTATAGGTATTGTGG 2113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 ATGAATTCTCATTAGAGGCTCCTATTCCAAGTGGTGGATACACTTGTATAGGTATTGTGG 2055
Query 2114 GCATCAAAGACCCTGTACGCCCTGGTGTCAAGGAGTCTGTTGCGATTTGTAAATCTGCTG 2173
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2056 GTATCAAAGACCCTGTACGCCCTGGTGTCAAGGAGTCTGTTGCGATTTGTAAATCCGCTG 2115
Query 2174 GCATCACTGTCAGAATGGTGACTGGAGATAACCTTACTACTGCGAAGGCCATAGCCAGGG 2233
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116 GCATCACTGTCAGAATGGTGACCGGAGATAACCTTACTACTGCGAAGGCCATAGCCAGGG 2175
Query 2234 AGTGTGGCATATTGACTGATGATGGCATAGCTATCGAAGGTCCTGAATTCCGGGAGAAAA 2293
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2176 AGTGTGGCATATTGACTGATGGTGGCATAGCTATCGAAGGTCCTGAGTTCCGGGAGAAAA 2235
Query 2294 GTGATGAGGAACTGCTCAAGCTAATCCCAAAATTGCAGGTGATGGCACGATCCTCGCCCA 2353
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2236 GTGATGAGGAACTGCTCAAGCTAATCCCAAAATTACAGGTGATGGCACGATCGTCGCCTA 2295
Query 2354 TGGATAAGCATACTTTGGTGAGACTCCTCCGCACAATGTTTCAGGAAGTCGTTGCAGTGA 2413
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2296 TGGATAAGCATACTTTGGTGAGACTCCTCCGTACAATTTTTGAGGAAGTCGTTGCAGTGA 2355
Query 2414 CAGGTGATGGAACAAATGATGCTCCAGCACTTCATGAAGCTGATATTGGACTCGCAATGG 2473
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2356 CAGGTGATGGAACAAATGATGCTCCAGCACTTCATGAAGCTGATATTGGACTTGCAATGG 2415
Query 2474 GCATTTCCGGAACTGAGGTGGCAAAAGAAAGTGCGGATGTGATTATCCTAGATGATAACT 2533
||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2416 GCATTTCTGGAACTGAGGTGGCAAAAGAGAGTGCCGATGTGATTATCCTAGATGATAACT 2475
Query 2534 TCTCTACGATTGTCACAGTAGCCAAATGGGGCCGTTCTGTGTACATAAATATTCAGAAAT 2593
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2476 TCTCGACGATTGTCACAGTGGCCAAATGGGGCCGTTCTGTGTACATAAACATTCAGAAAT 2535
Query 2594 TTGTCCAGTTCCAGCTGACAGTAAATGTTGTGGCTCTTATTGTCAACTTCTTATCAGCCT 2653
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2536 TTGTCCAGTTCCAGCTGACAGTAAACGTTGTGGCTCTTATTGTCAACTTCTTATCAGCTT 2595
Query 2654 GCCTCACTGGAAACGCGCCTCTGACTGCTGTCCAACTACTGTGGGTTAACATGATAATGG 2713
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2596 GCCTCACTGGAAACGCGCCTCTGACAGCTGTCCAACTACTGTGGGTTAACATGATAATGG 2655
Query 2714 ACACACTTGGAGCACTCGCGCTAGCGACTGAACCACCACAGGACGACCTGATGAAGAGAT 2773
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2656 ACACACTTGGAGCGCTCGCGCTAGCGACTGAACCACCACAGGACGATCTGATGAAGAGAT 2715
Query 2774 CTCCAGTGGGAAGGAAAGGAAACTTCATAAGTAATGTAATGTGGAGGAACATCCTTGGTC 2833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2716 CTCCAGTGGGAAGGAAAGGAAACTTCATAAGTAATGTAATGTGGAGGAACATCCTTGGTC 2775
Query 2834 AGTCACTCTACCAGCTTGTCATCATATGGTGTCTTCAAACAAAGGGAAAGACAATGTTTG 2893
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2776 AGTCACTGTACCAGCTTGTCATCATATGGTTTCTTCAAACAAAGGGAAAGACAATGTTTG 2835
Query 2894 GTCTCGATGGCCCCGACTCTGATCTAACACTCAATACCCTTATTTTCAACATTTTTGTCT 2953
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2836 GTCTTGATGGCCCCGACTCTGATCTAACACTCAATACCCTTATTTTCAACATTTTTGTCT 2895
Query 2954 TCTGCCAGGTATTCAATGAGATAAGCTCGAGGGAAATGGAAAAAATTGATGTGTTCAAGG 3013
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2896 TCTGCCAGGTATTCAATGAAATTAGCTCGAGGGAAATGGAAAAGATTGATGTGTTCAAGG 2955
Query 3014 GGATACTAAAGAACTACGTATTCGTAGCGGTTCTAACATGTACAGTGGTGTTCCAAGTAA 3073
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2956 GGATACTAAAGAACTATGTATTCGTAGCGGTTCTAACATGTACAGTGGTGTTCCAAGTAA 3015
Query 3074 TCATAATCGAGCTGCTGGGTACATTTGCGGATACAACACCATTAAATTTGGGACAATGGT 3133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 3016 TCATAATCGAGCTGCTGGGTACATTTGCGGATACAACACCACTAAGTTTGGGACAATGGT 3075
Query 3134 TGGTTAGCATCATACTCGGGTTCCTTGGCATGCCTGTTGCTGCTGCCTTGAAGATGATCC 3193
||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3076 TGGTTAGCATCATGCTAGGATTCCTTGGCATGCCCGTTGCTGCTGCCTTGAAGTTGATCC 3135
Query 3194 CTGTTGGTTCACACTAAGCAACACATTGTATAATGTGATTCCTTGTGCCACAACTTTGGC 3253
||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 3136 CTGTTGGTTCACATTAAGCTACATATTATAAAATGTGATTCGTTGTGCCACAACATTGGC 3195
Query 3254 ATTGAAAGGTACCAATTTTTTCTCCGGCCTTTGGAAGTTTGATATCCCAAGATGGCCTTG 3313
||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3196 TTTGGAAGGTACCAACTTTTTCTCAGGCCTTTGGAAGTTTGATATCCCAAGATGGCCTTG 3255
Query 3314 GA 3315
||
Sbjct 3256 GA 3257
Score = 115 bits (62), Expect = 2e-24
Identities = 75/81 (93%), Gaps = 2/81 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 23 TGTTATATATCATATCTTCTTCGTT-CTCGATTTACGAGATCCTTGATTCTCTCTTTCTC 81
|||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGTTATATATAATATCTTCTTCTTTCCTCGATTTACGAGATCCTTGATTCTCTCTTTCTC 60
Query 82 TAATCTTATCTCATCTG-AAG 101
|||||| |||| ||||| |||
Sbjct 61 TAATCTGATCTAATCTGTAAG 81
> Ahg359101 jgi|Araly1|359101|fgenesh1_pg.C_scaffold_9000141
Length=609
Score = 896 bits (485), Expect = 0.0
Identities = 565/604 (94%), Gaps = 4/604 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1486 ATGGGATCTGCAACAACTATTTGTAGTGACAAAACTGGAACTCTTACAACAAATCACATG 1545
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGGGATCTGCAACAACTATTTGTAGTGACAAGACTGGAACTCTTACAACAGATCACATG 60
Query 1546 ACAGTTGTAAAAGCCTGCATCTGTGAACAAGCCAAAGAGGTTAATGGTCCTGATGCTGCT 1605
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 61 ACAGTTGTAAAAGCCTGCATCTGTGAACAAGCCAAAGAGGTTAATGGTTCTGATGCTGCT 120
Query 1606 ATGAA-ATTTGCCTCTGGTATCCCTGAGTCTGCTGTTAAACTTCTACTGCAATCTATATT 1664
|| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 121 AT-AATATTTGCCTCTAGTATCCCCGAGTCTGCTGTTAAACTCCTATTGCAATCTATATT 179
Query 1665 TACTAACACTGGTGGTGAGATTGTTGTGGGCAAAGGAAACAAAACCGAGATACTGGGAAC 1724
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TACTAACACTGGCGGTGAGATTGTTGTGGGCAAAGGAAACAAAACCGAGATACTGGGAAC 239
Query 1725 TCCTACAGAAACTGCTCTGTTAGAATTTGGGTTGTCACTCGGAGGGGACTTCCAAGAAGT 1784
|| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 240 ACCCACAGAAACTGCTCTGCTAGAATTTGGGTCGTCACTCGGAGGGGACTTCCAGGAAGT 299
Query 1785 AAGGCAAGCCTCAAATGTTGTGAAAGTTGAGCCCTTTAACTCTACAAAGAAAAGAATGGG 1844
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 AAGACAAGCCTCAAATGTTGTGATAGTTGAGCCCTTCAACTCTACAAAGAAAAGAATGGG 359
Query 1845 AGTTGTCATTGAGCTGCCTGAAAGACATTTCCGGGCACATTGTAAGGGTGCTTCAGAGAT 1904
||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 360 AGTTGTCATTGAGGTGCCTGAAGGACATTTCTGGGCGCATTGTAAGGGTGCTTCTGAGAT 419
Query 1905 AGTTTTAGATTCTTGTGATAAGTACATCAACAAAGATGGTGAAGTTGTT-CCTCTCGATG 1963
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||
Sbjct 420 AGTTTTAGATTCTTGTGATAAGTACATCAAGAAAGATGGTGAAGTTGTTTCC-CTTGATG 478
Query 1964 AAAAATCGACCAGTCACCTGAAGAACATAATTGAGGAATTTGCTAGCGAAGCACTTCGAA 2023
|| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 479 AAGAATCTACCAGTCACCTAAAGAACATAATCGAGGAATTTGCTAGTGAAGCACTTCGAA 538
Query 2024 CTCTTTGCCTAGCGTATTTCGAAATTGGTGATGAATTCTCATTAGAGGCTCCTATTCCAA 2083
|||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||
Sbjct 539 CTCTTTGCCTTGCTTATTTCGAGATTGGTGATGAATTCTCATTAGAAGCGCGTATACCAA 598
Query 2084 GTGG 2087
||||
Sbjct 599 GTGG 602
> Ahg949914 jgi|Araly1|949914|scaffold_801801.1
Length=550
Score = 580 bits (314), Expect = 2e-164
Identities = 377/408 (92%), Gaps = 2/408 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1681 GAGATTGTTGTGGGCAAAGGAAACAAAACCGAGATACTGGGAACTCCTACAGAAACTGCT 1740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||
Sbjct 117 GAGATTGTTGTGGGCAAAGGAAACAAAACCGAGATACTGGGAACACCCACAAAAACTGCT 176
Query 1741 CTGTTAGAATTTGGGTTGTCACTCGGAGGGGACTTCCAAGAAGTAAGGCAAGCCTCAAAT 1800
||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 177 CTGCTAGAATTTGGGTCGTCACTCGGAGGGGACTTCCAGGAAGTAAGACAAGCCTCAAAT 236
Query 1801 GTTGTGAAAGTTGAGCCCTTTAACTCTACAAAGAAAAGAATGGGAGTTGTCATTGAGCTG 1860
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 237 GTTGTGAGAGTTGAGCCCTTCAACTCTACAAAGAAAAGAATGAGAGTTGTCATTGAGGTG 296
Query 1861 CCTGAAAGACATTTCCGGGCACATTGTAAGGGTGCTTCAGAGATAGTTTTAGATTCTTGT 1920
|||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTGAAGGACATTTCTGGGCGCATTGTAAGGGTGCTTCTGAGATAGTTTTAGATTCTTGT 356
Query 1921 GATAAGTACATCAACAAAGATGGTGAAGTTGTT-CCTCTCGATGAAAAATCGACCAGTCA 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||
Sbjct 357 GATAAGTACATCAACAAAGATGGTGAAGTTGTTTCC-CTTGATGAAGAATCTACCAGTCA 415
Query 1980 CCTGAAGAACATAATTGAGGAATTTGCTAGCGAAGCACTTCGAACTCTTTGCCTAGCGTA 2039
||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||
Sbjct 416 CCTAAAGAACATAATCGAGGAATTTGCTAGTGAAGCACTTCAAACTCTTTGCCTTGCTTA 475
Query 2040 TTTCGAAATTGGTGATGAATTCTCATTAGAGGCTCCTATTCCAAGTGG 2087
|||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||
Sbjct 476 TTTCGAAATTGGTGATGAATTCTCATTAGAACCGCGTATACCAAGTGG 523
Score = 198 bits (107), Expect = 2e-49
Identities = 115/119 (97%), Gaps = 0/119 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1466 ATCTTGCTGCTTGTGAGACAATGGGATCTGCAACAACTATTTGTAGTGACAAAACTGGAA 1525
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1 ATCTAGCTGCTTGTGAGACAATGGGATCTGCAACAACTATTTGTAGTGACAAGACTAGAA 60
Query 1526 CTCTTACAACAAATCACATGACAGTTGTAAAAGCCTGCATCTGTGAACAAGCCAAAGAG 1584
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTCTTACAACAGATCACATGACAGTTGTAAAAGCCTGCATCTGTGAACAAGCCAAAGAG 119
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 131565029861
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5