BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G28420.1

Length=5430
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg473061 jgi|Araly1|473061|fgenesh2_kg.1__3015__AT1G28420.1        8401    0.0  


> Ahg473061 jgi|Araly1|473061|fgenesh2_kg.1__3015__AT1G28420.1
Length=5394

 Score = 8401 bits (4549),  Expect = 0.0
 Identities = 5155/5438 (95%), Gaps = 79/5438 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  28    ttttggatcagggtttgtttgttcaatagaaagccctagtttttgtttttgtgttctttg  87
             ||| ||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     TTTGGGATCAGGGTTTGTTTG-T---T-GAAAGCCCTAGTTTTTGTTTTTGTGTTCTTTG  55

Query  88    attcttcttgcggccgtttctgggtttcttcttcttcttctctttcCATGGAGATGGGTT  147
             |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  56    A---TTCTTGCGGCCGTTTCTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTC-TTCCATGGAGATGGGTT  111

Query  148   CTGA-CG-G-TGAAGATCAGAAGATCAGGAGCG-TCGT--TGGTGATGCTAATCTTAATA  201
             ||||  | | ||||||||   |||||||||||| | ||  || || || ||||| |  ||
Sbjct  112   CTGATGGAGATGAAGATC---AGATCAGGAGCGTTGGTGATGTTGGTGGTAATCATCTTA  168

Query  202   ATAAGAAGAAGAAGATTGATAATAATTCCTCCTCTAAGGA---TGGTCGTGTCAAGCCTA  258
             ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||
Sbjct  169   ATAAGAAGAAGAAGATTG---ATAATTCCTCCTCCAAGGATGGTGGTCGTGTTAAGCCTA  225

Query  259   AACGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA  318
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  226   AGCGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA  285

Query  319   AGTATCCGTCGGAGGCGACGAGGGCTGAGTTATCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC  378
              |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286   CGTATCCTTCGGAGGCCACGAGGGCTGACTTGTCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC  345

Query  379   AATTACAGATGTGGTTTTGTCATAGACGGTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCTAATA  438
             ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  346   AATTACAGATGTGGTTTTGCCATAGACGCTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCCAAGA  405

Query  439   AACCGGTGAAATCATCGGTTGC--T-G-C-GGTTCAATCGGCTTCGGTTAACGAGTTACC  493
             |||| | ||||||| ||||| |  | | | | ||  | || |||| ||| ||||||||||
Sbjct  406   AACCCGCGAAATCAGCGGTT-CAATCGTCTGCTT-TAGCGTCTTCCGTTCACGAGTTACC  463

Query  494   GGCTGCTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGTTCTGAGTCTGG  553
              ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct  464   -GC--CTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGCTCTGAGTCAGG  520

Query  554   TTGCAGTCCTTATTCCAACTCTAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGC  613
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521   TTGCAGTCCTTATTCCAACTCAAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGC  580

Query  614   TGAATTGGATGAATATGAGACAATGGGAAAGCCGAGTTATGAGTCGCGGTTGTCGACAAT  673
             ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  581   TGAATTGGATGAATACGAGACAATGGGAAAGGCGAGTTATGAGTCACGGTTGTCGACAAT  640

Query  674   GGTGCATAGAGCTATTGTCTGTATTGAGGCTCAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGG  733
             ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641   GGTGCGTAGAGCTATTGTCTGCATTGAGGCACAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGG  700

Query  734   ACCTATTCTTGGCATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCGTTTGGAACACCTATAGC  793
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct  701   ACCTATTCTTGGTATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCATTCGGAACACCTATAGC  760

Query  794   GATGCAGAAACACCTACTTCATCCCTATGAGAGCGATCTGTATGAGCGACATGATCCCCG  853
             |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct  761   GATGCAGAAACACCTAGTTCATCCGTATGAGAGCAATGTGTATGAGCGATATGATGCCCG  820

Query  854   ACCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATCC  913
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  821   ACCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATTC  880

Query  914   GTCTTCTTTTACACCTAATATGTATGAACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGA  973
             |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881   GTCTTCTTTTACACCTGAGATGTATGGACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGA  940

Query  974   CTATGAAGTTGCACGTTCTAGAATTTCATCATTTATGCACGCGAATGGACCTGTACCAAG  1033
             ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct  941   CTATGAAATTGCACGTTCTAGGAGTTCATCATTTATGCACGCGAATGGGCCTTTACCAAG  1000

Query  1034  GTCCTATGTTACCCCTGGACATGCGTCTCGTAACTGTTCGACATCTCAACAAGACATGCC  1093
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1001  GTCCTATGTTACCCCTGGACATGTGTCTCGTAACTGTTCTACATCTCAACAAGACATGCC  1060

Query  1094  AAGCCCCATTGAATCAGCGCATCATGGTGATAGATTCCTGCTGGAGAAGGACTCATCAGT  1153
             || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  1061  AATCCCCATTGAATCAGCTCATCGTGGTGATAGATTCCTGCTGGAAAAGGATTCATCAGT  1120

Query  1154  CCTTGGTACAGAAGATCCATATTTGTTACCTGATGGAGTGCGTAAGAGTAGTGATGTGCA  1213
             ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1121  CCTCGGTACAGAAGATCCATATTTGTTGCCTGATGGGGTGCGTAAGAGTAATGATGTGCA  1180

Query  1214  TAGAAAGGGAAAGATTAACGATGGTAGACTTGGAAGAGGGAGTGAAACCCGAGAGAATCA  1273
             | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct  1181  TCGGAAGGGAAAGATTAACGATGATAGACTTGGAAGAGGAAGTGAAATCCGAGAGAATCA  1240

Query  1274  TGGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGAAAAAGAATGAAGAACGCATGAG  1333
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1241  TGGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGAAAAAAAATGAAGAACGCATGAG  1300

Query  1334  AAAAGAGATGGAAAGGAACGAGCGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGA  1393
             |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1301  AAAAGAAATGGAAAAGAACGAACGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGA  1360

Query  1394  AAGAATAAAAGAAGAGGAAAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTgaagtagaaagaagaga  1453
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  1361  AAGAATAAAAGAAGAGGAGAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTGAAATAGAAAGAAGAGA  1420

Query  1454  aaaattcttacagagagaaaatgaaagggctgagaaaaagaagcaaaaagacgagattcg  1513
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1421  AAAGTTCTTACAGAGAGAAAATGAAAGGGCGGAGAAAAAGAAGCAAAAAGACGAGATTCG  1480

Query  1514  tcgagagaaagaCGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAAT  1573
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1481  CCGAGAGAAAGACGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAAT  1540

Query  1574  TGCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTAATGGAATTGGCTGC  1633
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1541  TGCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTGATGGAATTGGCTGC  1600

Query  1634  TATTAGCAAAGGATTACCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAGAATCTTGA  1693
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1601  TATTAGCAAAGGATTGCCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAAAATCTTGA  1660

Query  1694  GGTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTT  1753
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1661  AGTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTT  1720

Query  1754  TGCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAG  1813
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1721  TGCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAG  1780

Query  1814  ATTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTAT  1873
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1781  ATTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTAT  1840

Query  1874  TCAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGCTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAG  1933
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1841  TCAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGTTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAG  1900

Query  1934  ATCAATAATACGAGATGTCGAAGATGTTGCTAGAACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAA  1993
             |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1901  ATCAATAATACGAGATATCGAAGATGTTGCTAGGACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAA  1960

Query  1994  CCAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGC  2053
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1961  CCAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGC  2020

Query  2054  ATGGGGTTTTGACATTCGTAGTTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAAT  2113
             |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2021  ATGGGGCTTTGACATTCGTAGCTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAAT  2080

Query  2114  ACTGCGACAATTAGCGCTCTCTGCTGGATTTGGACCTAAGCTGAAGAAAAAACATTCCCG  2173
             |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2081  ACTGCGACAATTGGCACTCTCTGCTGGATTTGGGCCTAGGCTGAAGAAAAAACATTCCCG  2140

Query  2174  ATTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATGTCATTTCTACTAT  2233
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2141  ATTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATATCATTTCTACTAT  2200

Query  2234  CCGAAATGGTACAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTGCTCGC  2293
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2201  CCGAAATGGTTCAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTACTCGC  2260

Query  2294  TCCTCGCAAGTCGAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTTGCAGCCTTTCATGT  2353
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2261  TCCTCGCAAGTCAAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTCGCAGCCTTTCATGT  2320

Query  2354  TCTATCTCTTGAAGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAA  2413
              ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2321  ACTATCTCTTGAGGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAA  2380

Query  2414  ATCTGGACTTCGGGACTTGACCACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATT  2473
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2381  ATCTGGACTTCGGGACTTGACAACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATT  2440

Query  2474  GACAAGAGATGTGAAACTCTTTGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCC  2533
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2441  GACAAGAGATGTGAAACTCTTCGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCC  2500

Query  2534  TTATGTGAAGGATCCTAAGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATACG  2593
             ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2501  TTATGTGAAGGATCCTGCGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATAAG  2560

Query  2594  GGCTTTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGA  2653
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2561  GGCATTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGA  2620

Query  2654  CTTCGAAATTGATATTGATGAGGATCCCGAGGTTGATGATTTAGCTACACTGGCAAGTGC  2713
              || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2621  ATTTGAAATTGATATTGATGAGGATCCTGAGGTTGATGATTTAGCTACTCTGGCAAGTGC  2680

Query  2714  ATCAAAAAGTGCCGTTCTTGGAGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGTAGATACAAT  2773
             |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||
Sbjct  2681  ATCAAAAAGTGCCGTTCTAGGTGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGGAAATACTAT  2740

Query  2774  GTTCTGTGATGTTAAAGCAGATGTAAAGAGTGAGCTTGAGAAGGAGTTTTCATCTCCTCC  2833
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2741  GTTCTGTGATGTTAAAGCTGATGTAAAGAGTGAGCCTGAGAAGGAGTTTCCATCTCCTCC  2800

Query  2834  TCCAAGCACTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGCATAAAAATACAGTGGT  2893
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||
Sbjct  2801  TCCAAGCAGTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGTTTAAAGATACAGTGGT  2860

Query  2894  TGGCGGCGTGGATGCCGTAATTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCT  2953
             |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2861  TGGCTGCGTGGATACCGTGGTTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCT  2920

Query  2954  TACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTT  3013
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2921  TACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTT  2980

Query  3014  AGTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAACAGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGC  3073
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2981  AGTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAGCTGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGC  3040

Query  3074  AGCAAATGCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAG  3133
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3041  AGCAAATTCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAG  3100

Query  3134  AGATGTACTTAAGCTTGATCTTCAAAACTTAGCAAGCAGCAAAACTGAATCAACGATAGG  3193
             ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct  3101  AGATGTACTTAAGCTTGATTTTCAAAACCTAGCAAGCAGCAAAACCGAATCAACGATGGG  3160

Query  3194  CCTACCAATCATTCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTTGATAGAGACCCTTCTCA  3253
              ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3161  TCTACCAATCATCCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTCGATAGAGACCCTTCTCA  3220

Query  3254  ACTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGAAGATCTTTCGAACGATCTTCATAAATCATCTGC  3313
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3221  ACTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGATGATCTTTCGAACAATCTTCATAAATCATCTGC  3280

Query  3314  TGAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATT---------A--T  3362
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |  |
Sbjct  3281  TGAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATTGTTCTTCCCAACT  3340

Query  3363  -G------CTTCAAAGAGATCACGCTCCCAATTAAAGTCATATATAGGCCACAAAGCAGA  3415
              |      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  3341  TGGATATGCTTCAAAGAGATCACGCTCACAATTAAAATCATATATAGGCCACAAAGCAGA  3400

Query  3416  AGAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTG  3475
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3401  AGAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTG  3460

Query  3476  GCATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGTTCGAGGCTCTTATTTGTTGAGCT  3535
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3461  GCATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGCTCGGGGCTCTTATTTGTTGAGCT  3520

Query  3536  ACATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATC  3595
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3521  ACATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATC  3580

Query  3596  ATTGGATATGCGTGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGG  3655
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3581  ATTGGATATGCGCGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGG  3640

Query  3656  ATCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAGATATAAAGCTAGCTAGAAACCCTTTCTTGACGGA  3715
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct  3641  ATCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAAATATAAAGCTAGATAGAAACCCTTTCTTGAAGGA  3700

Query  3716  AAAGAGTGTTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCCATCGTCCAGTGCTATATC  3775
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
Sbjct  3701  AAAGAGTATTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCC---GTCCAGTGCTATATC  3757

Query  3776  AGGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGATTTAGGTAGAAA  3835
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3758  AGGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGAGTTAGGTAGAAA  3817

Query  3836  TGACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGGTTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGAC  3895
              ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3818  CGACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGATTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGAC  3877

Query  3896  CGAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACT  3955
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3878  CGAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACT  3937

Query  3956  GTTAGCAACATGTGACGCGTGTGTTGCTTCCTATTTGTCTGAGTATACCTTCTGCTCTTC  4015
             ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||
Sbjct  3938  GTTAGCAACATGTGATGCGTGTGTTGCTTCTTATTTGTCTGAGTATACCCACTGCACTTC  3997

Query  4016  TTGTCACCAGAGATTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGGCTGT  4075
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3998  TTGTCACCAGAGACTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGACTGT  4057

Query  4076  GTCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATC  4135
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4058  GTCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATC  4117

Query  4136  TGTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACAGAGGACCAAAGaaaaaaaTGGGGGTT  4195
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||
Sbjct  4118  TGTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACGGAGGACAAAAGAAAAATTTGGGGGTT  4177

Query  4196  TAGGTTGAATACTTCATCATCACCTGGAGAACTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAG  4255
             |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4178  TAGGTTGAATGCTTCATCATCACCTGAAGACCTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAG  4237

Query  4256  TGCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGC  4315
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4238  TGCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGC  4297

Query  4316  TGCTAACGCTGAGGCTGATGATCAGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGAC  4375
             |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4298  TGCTAATGCTGATGCTGATAATCTGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGAC  4357

Query  4376  AGTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCC  4435
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4358  AGTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCC  4417

Query  4436  AGAGAAACCTGAGGTCATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTAGAGA  4495
             ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  4418  AGAGAAACCTGAGCTGATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTGGAGA  4477

Query  4496  TTCACCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAAGACGAGGTTGCTCCAAA  4555
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct  4478  TTCCCCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAACATGAGGTTGTTCCAAA  4537

Query  4556  CCCGGGTAACAGAAA-TAAGAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAA  4614
             | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4538  CTCGGGTAACA-AACGTAATAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAA  4596

Query  4615  AGGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTTGGTAGGAGAAATG  4674
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  4597  AGGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTCGGTAGGAGAAATG  4656

Query  4675  TTGCAGTCAATAGTAACTTAATGGCCGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAA  4734
             ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4657  TTGCAGTCAATAGTAACTTAATGACTGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAA  4716

Query  4735  AGAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATTCCCACCTAGTCAATA  4794
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
Sbjct  4717  AGAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATGACCACCTAGTCAATA  4776

Query  4795  GAATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAG  4854
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4777  GAATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAG  4836

Query  4855  AGCAAACATTCAGAGACATTAATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGG  4914
             ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4837  AGCCAACATTCAGAGACATTGATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGG  4896

Query  4915  AGGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATG  4974
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4897  ACGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATG  4956

Query  4975  AAAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGAAGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGG  5034
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  4957  AAAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGATGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGG  5016

Query  5035  ATTATAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCTAAATGTGGCAATAG  5094
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |
Sbjct  5017  ATTACAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCCAAACGAGGCAAT-G  5075

Query  5095  AGGAAGACGAGGAAGAAGAAGTTGTGGGGGTTGGGCGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCAG  5154
              | | |  ||  | ||||   |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct  5076  -G-A-G--GA--A-GAAG---TTGTTGGTGTTGGGAGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCCG  5124

Query  5155  AAATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATGTACCTGCTAATAATGCAGCAAACAATTACG  5214
             | ||||||||||||||||||||||||||||  | |   ||||||||||||||||||||||
Sbjct  5125  AGATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATG--C-T---AATAATGCAGCAAACAATTACG  5178

Query  5215  ACAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAAGTTGAGATCTAGTAGCTTGTG  5274
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct  5179  ACAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAACTTAAGATCTAGTAGCTTGTG  5238

Query  5275  AAGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGatatatatatatat-TTTT-ATGTAGGAGAAA  5332
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||
Sbjct  5239  AAGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGATATATATATATATATTTTTATATAGGAGAAA  5298

Query  5333  AGAGAGATAGTAGCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTT  5392
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5299  AGAGAGATAGTATCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTT  5358

Query  5393  GGTGCAGTTGTTAAAGCCAAGCCAAGGCATATATTTAG  5430
             |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  5359  GGTGCAGTTA--AAAGCCAAGCCAAGGCATGTATTTAG  5394



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 205625066919


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5