BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G30400.1
Length=5168
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg473263 jgi|Araly1|473263|fgenesh2_kg.1__3217__AT1G30400.2 8202 0.0
Ahg482430 jgi|Araly1|482430|fgenesh2_kg.4__1490__AT2G34660.1 5195 0.0
> Ahg473263 jgi|Araly1|473263|fgenesh2_kg.1__3217__AT1G30400.2
Length=5079
Score = 8202 bits (4441), Expect = 0.0
Identities = 4735/4882 (97%), Gaps = 0/4882 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 98 GAGGAAGAAGATGGGGTTTGAGCCGTTGGATTGGTATTGCAAGCCGGTGCCGAATGGTGT 157
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGGAAGAAGATGGGGTTTGAGCCGTTGGATTGGTACTGTAAGCCGGTGCCGAATGGTGT 60
Query 158 GTGGACTAAAACTGTGGATTATGCGTTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTATTGACTCTTT 217
|||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTGGACAAAAACAGTGGATTATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTATTGACTCTTT 120
Query 218 TGTGCTTGGTATCTCTCATCTGGTTCTGTTGATTCTGTGTCTTTATCGCTTGTGGCTCAT 277
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 121 TGTGCTTGGCATCTCTCATCTTGTTCTGTTGATTCTGTGCCTTTATCGATTATGGCTCAT 180
Query 278 CACGAAGGATCACAAAGTGGATAAGTTCTGCTTGAGGTCTAAATGGTTTAGCTATTTTCT 337
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||
Sbjct 181 CACAAAGGATCACAAAGTGGATAAGTTCTGCTTGAGGTCTAAATGGTATAACTATTTCCT 240
Query 338 GGCTCTTTTGGCTGCTTATGCTACTGCGGAGCCTTTGTTTAGATTGGTCATGAGGATCTC 397
|||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GGCTCTGTTGGCTGCTTATGGTACTGCTGAGCCTTTGTTTAGATTGGTCATGAGGATCTC 300
Query 398 TGTTTTGGATTTGGATGGAGCTGGGTTTCCTCCCTATGAGGCGTTTATGTTGGTCCTTGA 457
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 301 TGTTTTGGATTTGGATGGAGCTGGGTTTCCTCCGTATGAGGCGTTCATGTTGGTCCTTGA 360
Query 458 GGCTTTTGCTTGGGGTTCTGCTTTGGTCATGACTGTTGTGGAAACTAAAACGTATATCCA 517
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGCTTTTGCTTGGGGTTCTGCATTAGTCATGACTGTTGTGGAAACTAAAACGTATATCCA 420
Query 518 TGAACTCCGTTGGTATGTCAGATTCGCTGTCATTTATGCTCTTGTGGGAGACATGGTGTT 577
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 421 TGAACTCCGTTGGTATGTTAGATTCGCTGTCATTTATGCTCTTGTCGGAGACATGGTGTT 480
Query 578 GTTAAATCTTGTTCTCTCTGTTAAGGAGTACTATGGCAGTTTTAAACTGTATCTTTACAT 637
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GTTAAATCTTGTTCTCTCGGTGAAGGAGTACTATGGCAGTTTTAAACTGTATCTTTACAT 540
Query 638 AAGCGAGGTGGCAGTTCAGGTTGCATTTGGAACCCTCTTGTTTGTGTATTTCCCTAATTT 697
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AAGCGAGGTGGCAGTTCAGGTTGCATTTGGAACTCTCTTGTTTGTGTATTTCCCTAATTT 600
Query 698 GGACCCTTACCCTGGTTACACACCAGTTGGGACTGAAAATTCCGAGGATTACGAGTATGA 757
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 601 GGATCCTTACCCTGGTTACACACCAGTTGGGACTGAAACTTCGGAGGATTACGAGTATGA 660
Query 758 AGAGCTTCCTGGAGGAGAAAATATATGTCCTGAGAGGCATGCAAATTTATTTGACAGTAT 817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AGAGCTTCCTGGAGGAGAAAATATATGTCCTGAGAGGCATGCAAATTTATTTGACAGTAT 720
Query 818 CTTCTTCTCATGGTTGAACCCATTGATGACTCTGGGATCAAAACGACCTCTCACCGAGAA 877
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 721 CTTCTTCTCATGGTTGAATCCATTGATGACTCTGGGATCGAAACGGCCTCTCACGGAGAA 780
Query 878 GGATGTATGGCATCTGGACACTTGGGATAAAACTGAAACTCTTATGAGGAGCTTCCAGAA 937
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 781 GGATGTATGGCATTTGGACACTTGGGATAAAACTGAAACTCTCATGAGGAGCTTCCAGAA 840
Query 938 GTCCTGGGATAAGGAACTAGAAAAGCCCAAACCGTGGCTTTTGAGAGCACTGAACAACAG 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTCCTGGGATAAGGAACTAGAAAAGCCCAAACCGTGGCTCTTGAGAGCACTGAACAACAG 900
Query 998 CCTTGGGGGAAGGTTTTGGTGGGGTGGCTTTTGGAAGATTGGGAATGACTGTTCACAGTT 1057
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 901 CCTTGGGGGAAGGTTTTGGTGGGGTGGCTTCTGGAAGATTGGGAATGACTGTTCACAATT 960
Query 1058 CGTGGGGCCTCTTCTACTGAATGAGCTCTTAAAGTCAATGCAACTTAATGAACCAGCGTG 1117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 961 CGTGGGGCCTCTTCTACTGAATGAGCTCTTAAAGTCAATGCAACTAAATGAACCAGCGTG 1020
Query 1118 GATAGGTTACATCTATGCAATCTCAATCTTTGTTGGAGTGGTATTGGGGGTTTTATGTGA 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 1021 GATAGGTTACATCTATGCAATCTCAATCTTTGTCGGAGTGGTATTGGGTGTTCTATGTGA 1080
Query 1178 AGCTCAGTATTTCCAAAATGTGATGCGTGTTGGTTACCGGCTTAGGTCTGCACTGATTGC 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1081 AGCTCAGTATTTCCAAAATGTGATGCGTGTTGGTTACCGCCTTAGGTCTGCCCTGATTGC 1140
Query 1238 TGCTGTGTTCCGAAAATCTTTGAGGCTAACTAATGAGGGGCGGAAGAAGTTTCAAACAGG 1297
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 TGCTGTGTTCCGAAAATCGCTGAGGCTAACTAATGAGGGGCGGAAGAAGTTTCAAACAGG 1200
Query 1298 AAAAATAACAAACTTAATGACTACTGATGCTGAGTCGCTGCAGCAAATCTGCCAATCACT 1357
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 AAAAATAACAAACTTAATGACGACTGATGCTGAGTCGCTGCAGCAAATCTGCCAATCACT 1260
Query 1358 TCATACCATGTGGTCGGCGCCATTTCGTATAATTGTAGCACTGGTTCTCCTCTATCAACA 1417
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1261 TCATACCATGTGGTCGGCTCCATTTCGTATAATAGTAGCGCTGGTTCTCCTCTACCAACA 1320
Query 1418 ATTGGGTGTTGCCTCGATCATTGGTGCATTGTTTCTTGTCCTTATGTTCCCCATACAGAC 1477
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1321 ATTGGGTGTTGCCTCGATCATCGGTGCATTGTTTCTTGTCCTTATGTTCCCTATACAGAC 1380
Query 1478 TGTTATTATAAGCAAAACGCAGAAGTTAACAAAAGAAGGGTTGCAGCGTACTGACAAGAG 1537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TGTTATTATAAGCAAAACGCAGAAGTTAACAAAAGAAGGGTTGCAGCGTACTGACAAGAG 1440
Query 1538 AATTGGCCTAATGAATGAGGTTTTAGCGGCAATGGATACAGTGAAGTGTTACGCTTGGGA 1597
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1441 AATTGGCCTAATGAACGAGGTTTTAGCCGCAATGGATACAGTGAAGTGCTATGCTTGGGA 1500
Query 1598 AAACAGTTTTCAGTCCAAGGTTCAAACTGTACGTGATGATGAATTATCTTGGTTCCGGAA 1657
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 AAACAGTTTTCAGGCCAAGGTTCAAACTGTACGTGATGATGAATTATCTTGGTTCCGGAA 1560
Query 1658 AGCACAACTCCTGTCAGCGTTCAATATGTTCATACTAAACAGCATTCCTGTCCTCGTGAC 1717
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 AGCACAGCTCCTGTCAGCGTTCAATATGTTCATTCTAAACAGCATTCCTGTCCTCGTGAC 1620
Query 1718 TGTTGTTTCATTTGGTGTGTTCTCATTGCTTGGAGGAGATCTGACACCTGCAAGAGCGTT 1777
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TGTTGTTTCATTTGGTGTGTTCTCATTTCTTGGAGGAGATCTGACACCTGCAAGAGCGTT 1680
Query 1778 TACGTCACTCTCTCTATTTTCTGTGCTTCGCTTCCCTTTATTCATGCTTCCAAACATTAT 1837
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TACGTCACTTTCTCTATTTTCTGTGCTTCGCTTCCCTTTATTCATGCTTCCAAACATTAT 1740
Query 1838 AACTCAGATGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAACCGTTTGGAGGAGGTACTGTCAACCGA 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||
Sbjct 1741 AACTCAGATGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAACCGTTTGGAGGAAGTGCTGTCGACGGA 1800
Query 1898 AGAGAGAGTTCTCTTACCGAATCCTCCCATTGAACCTGGACAGCCAGCTATCTCAATAAG 1957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 AGAGAGAGTTCTCTTACCGAATCCTCCCATTGAACCTGGACAGCCAGCTATCTCAATAAG 1860
Query 1958 AAATGGATACTTCTCCTGGGATTCAAAGGCGGATAGGCCAACATTGTCAAACATCAACCT 2017
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1861 AAATGGATACTTCTCATGGGATTCAAAGGCGGATAGGCCAACCTTGTCAAACATCAACCT 1920
Query 2018 GGACATACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCGGTAGTTGGCAGCACAGGAGAAGGAAAAACCTC 2077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GGACATACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCGGTAGTTGGCAGTACAGGAGAAGGAAAAACCTC 1980
Query 2078 CCTGATATCTGCTATGCTTGGGGAACTTCCTGCAAGATCTGATGCGACTGTTACTCTTAG 2137
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1981 CCTGATATCTGCTATGCTTGGGGAACTTCCTGCAAGATCTGATGCGACAGTTACTCTTAG 2040
Query 2138 AGGATCAGTCGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAACGCAACAGTACGTGACAA 2197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 AGGATCAGTCGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAACGCAACAGTACGTGACAA 2100
Query 2198 TATATTGTTTGGGGCTCCTTTTGACCAAGAAAAATATGAAAGGGTGATTGATGTGACAGC 2257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 TATATTGTTTGGGGCTCCTTTTGACCAAGAAAAATATGAAAGGGTGATTGATGTGACAGC 2160
Query 2258 ACTCCAGCATGACCTTGAGTTACTGCCTGGAGGTGACCTCACGGAGATCGGAGAAAGGGG 2317
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2161 ACTGCAGCATGACCTTGAGTTACTGCCTGGTGGTGACCTCACGGAGATTGGAGAAAGGGG 2220
Query 2318 TGTTAACATCAGTGGGGGACAAAAGCAGAGGGTTTCTATGGCTAGGGCCGTTTACTCAAA 2377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TGTTAACATCAGTGGGGGACAAAAGCAGAGGGTTTCTATGGCTAGGGCCGTTTACTCAAA 2280
Query 2378 TTCAGACGTGTGCATCTTAGATGACCCATTGAGTGCCCTTGATGCGCATGTTGGTCAGCA 2437
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 TTCAGATGTGTGCATCTTCGATGACCCATTGAGTGCCCTTGATGCGCATGTTGGTCAGCA 2340
Query 2438 GGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGGGAACTAGGGCAGACAACGAGAGTACTTGTTACAAA 2497
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2341 GGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGAGAACTAGGGCAGACAACAAGAGTACTTGTTACAAA 2400
Query 2498 TCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGATAAAATCCTACTTGTCCATGAGGGAACAGTAAA 2557
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 CCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGATAAAATCCTACTTGTCCATGAGGGAACAGTAAA 2460
Query 2558 AGAGGAAGGAACATATGAAGAATTATGCCATAGTGGCCCGTTGTTCCAGAGGTTAATGGA 2617
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 AGAAGAAGGAACATATGAAGAATTATGCCATAGTGGCCCATTGTTCCAGAGGTTAATGGA 2520
Query 2618 AAATGCAGGGAAGGTTGAAGATTATTCAGAAGAAAATGGAGAAGCTGAAGTAGATCAAAC 2677
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 AAATGCAGGGAAGGTTGAAGAATATTCAGAAGAAATTGGAGAAGCTGAAGTAGATCAAAC 2580
Query 2678 ATCTGTAAAACCAGTTGAAAATGGGAACGCTAATAATCTGCAGAAGGATGGAATCGAGAC 2737
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2581 ATCTGTAAAACCAGTTGAAAATGGGAACACTAATAATCTGCAGAAGGATGAAATCGAGAC 2640
Query 2738 AAAGAATTCCAAAGAAGGAAACTCTGTTCTTGTCAAGCGAGAAGAACGTGAAACTGGAGT 2797
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 AAAGAAATCCAAAGAAGGAAACTCTGTGCTTGTCAAGCGAGAAGAACGTGAAACTGGAGT 2700
Query 2798 TGTGAGTTGGAAAGTCCTGGAGAGGTACCAGAATGCACTTGGAGGTGCATGGGTAGTGAT 2857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 TGTGAGTTGGAAAGTCCTGGAGAGGTACCAGAATGCACTTGGAGGTGCATGGGTAGTGAT 2760
Query 2858 GATGCTCGTTATATGCTACGTCTTGACTCAAGTATTTCGGGTTTCAAGCAGCACTTGGTT 2917
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 GATGCTCCTTATATGCTACGTCTTGACTCAAGTATTTCGGGTTTCAAGCAGCACTTGGTT 2820
Query 2918 GAGTGAGTGGACTGATTCAGGAACCCCAAAGACTCATGGACCCCTATTCTATAATATTGT 2977
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 GAGTGAGTGGACTGATGCAGGAACCCCTAAGACTCATGGACCCCTATTCTATAATATTGT 2880
Query 2978 CTATGCGCTTCTTTCGTTTGGACAGGTCTCTGTGACATTGATCAATTCATATTGGTTGAT 3037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 CTATGCGCTTCTTTCGTTTGGACAGGTCTCTGTGACATTGATCAATTCATATTGGTTGAT 2940
Query 3038 TATGTCCAGTCTATATGCAGCTAAAAAGATGCATGATGCTATGCTTGGTTCCATACTAAG 3097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2941 TATGTCCAGTCTATATGCAGCTAAAAAGATGCATGATGCTATGCTTGGTTCCATACTAAG 3000
Query 3098 GGCTCCAATGGTGTTCTTTCAAACCAATCCATTAGGACGGATAATCAATCGATTTGCAAA 3157
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3001 GGCTCCAATGGTCTTCTTTCAAACCAATCCATTAGGACGGATAATCAATCGATTTGCTAA 3060
Query 3158 AGATATGGGAGATATTGATCGAACTGTGGCAGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTTCAAT 3217
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 AGATATGGGCGATATTGATCGAACTGTGGCAGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTTCAAT 3120
Query 3218 CGCACAGCTTCTTTCAACTGTTATCTTGATTGGCATTGTCAGCACTCTGTCCCTGTGGGC 3277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3121 CGCACAGCTTCTTTCAACTGTTATCTTGATTGGCATTGTCAGCACTCTGTCCCTGTGGGC 3180
Query 3278 CATCATGCCCCTGTTGGTCGTGTTCTATGGAGCTTATCTGTATTACCAGAACACATCTCG 3337
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 CATCATGCCCTTGTTGGTCGTGTTCTATGGAGCTTATCTGTATTACCAGAACACATCTCG 3240
Query 3338 GGAAATTAAACGTATGGATTCCACTACAAGATCGCCAGTTTATGCTCAATTTGGTGAGGC 3397
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3241 TGAAATTAAACGTATGGATTCCACTACAAGATCACCCGTTTATGCTCAATTTGGAGAGGC 3300
Query 3398 ATTGAATGGACTATCTAGTATCCGTGCTTATAAAGCATATGACAGGATGGCTGAAATTAA 3457
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301 ATTGAATGGGCTATCTAGTATCCGTGCTTATAAAGCATATGACAGGATGGCTGAAATTAA 3360
Query 3458 TGGAAGGTCAATGGACAATAACATCAGATTCACACTTGTAAACATGGCTGCAAATCGGTG 3517
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 CGGAAGGTCAATGGATAATAACATCAGATTCACACTTGTAAACATGGCTGCAAATCGGTG 3420
Query 3518 GCTGGGAATCCGTTTGGAAGTTTTGGGAGGTCTCATGGTTTGGTTGACTGCGTCATTAGC 3577
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3421 GCTGGGAATTCGTTTGGAAGTTTTGGGAGGTCTCATGGTTTGGTTGACTGCGTCATTAGC 3480
Query 3578 CGTCATGCAGAACGGAAAGGCAGCGAACCAACAAGCATATGCATCTACGATGGGTTTGCT 3637
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 CGTCATGCAGAACGGAAAGGCAGAGAACCAACAAGCATATGCATCTACGATGGGTTTGCT 3540
Query 3638 TCTCAGTTATGCGTTAAGCATTACCAGCTCTTTAACAGCTGTACTGAGACTCGCGAGTCT 3697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 TCTCAGTTATGCGTTAAGCATTACCAGCTCTTTAACAGCTGTACTGAGACTCGCGAGTCT 3600
Query 3698 AGCTGAGAATAGTTTAAACTCGGTTGAGCGTGTTGGAAATTATATCGAGATACCATCAGA 3757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3601 AGCTGAGAATAGTTTAAACTCGGTTGAGCGTGTTGGAAATTATATCGAGATACCATCAGA 3660
Query 3758 GGCTCCATTGGTCATTGAAAACAACCGTCCACCTCCCGGATGGCCATCATCTGGATCCAT 3817
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3661 GGCTCCATTGATCATTGAAAACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCAT 3720
Query 3818 AAAATTTGAGGATGTTGTTCTTCGTTACCGCCCTGAGTTACCTCCTGTTCTTCATGGAGT 3877
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3721 AAAATTTGAGGATGTTGTTCTTCGTTACCGCCCTGAATTACCTCCTGTTCTCCATGGAGT 3780
Query 3878 TTCGTTCTTGATTTCTCCAATGGATAAGGTGGGAATTGTTGGGAGGACAGGCGCTGGGAA 3937
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 3781 TTCGTTCTTGATTTCTCCAATGGATAAGGTGGGAATTGTTGGAAGAACAGGCGCTGGGAA 3840
Query 3938 ATCAAGCCTCTTAAATGCCTTATTCAGGATTGTGGAGCTGGAAAAAGGAAGGATTTTAAT 3997
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 3841 ATCAAGCCTCTTAAATGCCTTATTCCGGATTGTGGAGCTCGAAAAAGGAAGGATCTTGAT 3900
Query 3998 TGATGAATGCGACATTGGAAGATTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATTAT 4057
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3901 CGATGAATGCGACATTGGCAGATTTGGACTGATGGACCTACGTACAGTGCTCGGAATTAT 3960
Query 4058 ACCGCAAGCGCCAGTTCTTTTCTCAGGTACCGTGAGATTCAATCTTGACCCATTTAGTGA 4117
||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3961 ACCACAGGCGCCAGTTCTTTTCTCAGGTACTGTGAGATTCAATCTCGACCCATTTAGTGA 4020
Query 4118 ACACAACGACGCCGATCTCTGGGAATCTCTTGAGAGGGCACACTTGAAAGATACTATCCG 4177
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4021 ACACAACGATGCCGATCTTTGGGAATCTCTTGAGAGGGCACACTTGAAAGATACTATACG 4080
Query 4178 CAGAAATCCTCTTGGTCTTGATGCTGAGGTAACTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTTGG 4237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4081 CAGAAATCCTCTTGGTCTTGATGCTGAGGTAACTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTTGG 4140
Query 4238 ACAGAGACAGTTGTTGAGTCTTGCACGTGCATTGTTACGAAGATCTAAGATACTTGTTCT 4297
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4141 ACAGAGACAGTTGTTGAGTCTTGCACGTGCATTGTTGCGAAGATCTAAGATACTTGTTCT 4200
Query 4298 TGATGAAGCAACTGCTGCAGTTGACGTAAGAACTGATGTTCTCATCCAAAAGACCATCCG 4357
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4201 TGATGAAGCAACTGCTGCTGTTGACGTTAGAACTGATGTTCTCATCCAAAAGACCATCCG 4260
Query 4358 AGAAGAATTCAAGTCATGCACAATGCTAATCATCGCTCATCGTCTCAATACTATCATCGA 4417
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4261 AGAAGAATTCAAGTCCTGCACGATGCTAATCATCGCTCATCGTCTCAATACTATCATTGA 4320
Query 4418 CTGTGACAAAGTTCTTGTCCTTGATTCTGGAAAAGTTCAGGAATTCAGTTCACCGGAGAA 4477
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4321 CTGTGACAAAGTTCTCGTCCTTGATTCTGGAAAAGTTCAGGAATTCAGTTCACCGGAGAA 4380
Query 4478 TCTTCTTTCAAATGGAGAAAGTTCTTTCTCGAAGATGGTTCAAAGTACAGGAACTGCAAA 4537
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4381 TCTTCTTTCAAACGGAGAAAGTTCTTTCTCAAAGATGGTTCAAAGTACAGGAACTGCAAA 4440
Query 4538 CGCGGAGTACTTACGTAGTATAACACTAGAGAACAAACGTACCAGAGAAGCTAACGGTGA 4597
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4441 CGCGGAGTACTTACGTAGTATAACACTTGAGAACACACGTACCAGAGATGCTAACGGTGA 4500
Query 4598 TGATTCACAACCTTTAGAAGGTCAAAGGAAATGGCAAGCTTCTTCTCGTTGGGCTGCAGC 4657
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4501 TGATTCACAACCTTTAGAAGGTCAGAGGAAATGGCAAGCTTCTTCTCGTTGGGCTGCAGC 4560
Query 4658 TGCTCAATTTGCATTGGCTGTGAGCCTCACTTCATCTCACAACGACCTCCAAAGCCTTGA 4717
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4561 TGCTCAGTTTGCTTTGGCTGTGAGCCTCACTTCATCTCACAACGACCTTCAAAGCCTTGA 4620
Query 4718 AATCGAAGATGATAACAGTATTTTGAAGAAAACAAAGGACGCCGTCGTCACTCTACGCAG 4777
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4621 AATCGAAGATGATAACAGCATTTTGAAGAAAACGAAGGACGCCGTCGTCACTCTACGCAG 4680
Query 4778 TGTCCTTGAAGGGAAACATGATAAAGAGATTGAAGACTCTCTAAACCAAAGTGACATCTC 4837
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4681 TGTTCTTGAAGGGAAACACGATAAAGAGATTGAAGATTCTCTTAACCAAAGTGACATCTC 4740
Query 4838 TAGAGAGCGTTGGTGGCCATCTCTTTACAAAATGGTCGAAGGGCTTGCCGTGATGAGCAG 4897
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4741 TAGAGAGCGTTGGTGGCCATCTCTTTACAAAATGGTCGAAGGGCTTGCGGTGATGAGCAG 4800
Query 4898 ATTGGCGAGGAACAGAATGCAACACCCGGATTACAATTTAGAAGGGAAATCGTTTGACTG 4957
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4801 ATTGGCGAGGAACCGAATGCAACACCCGGATTACAACTTAGAAGGGAAATCGTTTGACTG 4860
Query 4958 GGACAATGTCGAGATGTAAACG 4979
||||||||||||||||||||||
Sbjct 4861 GGACAATGTCGAGATGTAAACG 4882
Score = 145 bits (78), Expect = 4e-33
Identities = 124/145 (86%), Gaps = 7/145 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 5022 GGAACTTTTATTTGTATTGCTTGGGATACACGTAACAAAATGCCCATTAATCGTGGTGT- 5080
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 4882 GGAACTTTTATTT-TATTGATTGGGATACACGTAACAAAATGCCCATTTTTTGTGGTGTT 4940
Query 5081 AACTATATAGGCTATGCTTCTTTTGGGAAAAAGAGAGTTTGATTAC-AGAGGATGTGATG 5139
|| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| || | | |||||| ||||
Sbjct 4941 AATTATATAGGCTGTACTTCTTTTGGGAAA--GAGTGTTTGGTTCCCAAAGGATGGGATG 4998
Query 5140 ATA-ACACAATTGGAATTCAAATTT 5163
||| ||| |||| ||||| ||||||
Sbjct 4999 ATACACAGAATTCGAATT-AAATTT 5022
> Ahg482430 jgi|Araly1|482430|fgenesh2_kg.4__1490__AT2G34660.1
Length=5382
Score = 5195 bits (2813), Expect = 0.0
Identities = 4240/4927 (86%), Gaps = 105/4927 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 105 AAGATGGGGTTTGAGCCGTTGGATTGGTATTGCAAGCCGGTGCCGAATGGTGTGTGGACT 164
|||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 346 AAGATGGGATTTGAGTTTTTTGAATGGTATTGTAAGCCGGTGCCTAATGGTGTTTGGAC- 404
Query 165 AAAAC-TGTGGATTATGCGTTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTATTGACTCTTTTGTGCT 223
||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 405 AAAACAAGTGGCTAATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTACTGACTCTTTTGTGCT 464
Query 224 TGGTATCTCTCATCTGGTTCTGTTGATTCTGTGTCTTTATCGCT-TGTGGCTCATCACGA 282
||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| | | ||||||| || ||
Sbjct 465 CGGTATCTCTCAACTGGTTCTGTTGGTTTTGTGTCTGTATCG-TATATGGCTCACCATGA 523
Query 283 AGGATCACAAAGTGGATAAGTTCTGCTTGAGGTCTAAATGGTTTAGCTATTTTCTGGCTC 342
| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||
Sbjct 524 AAGATCACAAGGTGGAGAGGTTCTGCTTGAGGTCAAAATTGTATAACTATTTCCTGGCT- 582
Query 343 TT-TTGGCTGCTTATGCTACTGCGGAGCCTTTGTTTAGATTGGTCATGAGGATCTCTGTT 401
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| || |||
Sbjct 583 TTGTTGGCTGCTTATGCTACTGCTGAGCCTTTGTTCAGATTGATTATGGGGATTTCAGTT 642
Query 402 TTGGATTTGGATGGAGCTGGGTTTCCTCCCTATGAGGCGTTTATG-TT-GGTCCTTGAGG 459
||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| || | || ||| | | |
Sbjct 643 TTGGATTTGGATGGACCTGGACTTCCTCCTTTTGAGGC-ATTCGGATTGGGT-GTCAAAG 700
Query 460 CTTTTGCTTGGGGTTCTGCTTTGGTCATGACTGTTGTGGAAACTAAAACGTATATCCATG 519
||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||| || |||| ||
Sbjct 701 CTTTTGCTTGGGGCTCTGCAATGGTCATGATTTTTATGGAAACTAAAATTTACATCCGTG 760
Query 520 AACTCCGTTGGTATGTCAGATTCGCTGTCATTTATGCTCTTGTGGGAGACATGGTGTTGT 579
|||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 761 AACTCCGTTGGTATGTTAGGTTTGCTGTCATATATGCTCTTGTGGGGGATATGGTCTTGC 820
Query 580 TAAATCTTGTTCTCTCTGTTAAGGAGTACTATGGCAGTTTTAAACTGTATCTTTACATAA 639
|||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||| ||
Sbjct 821 TAAATCTTGTTCTCTCAGTTAAGGAGTTCTATAGCAGTTATGTTCTGTATCTCTACACAA 880
Query 640 GCGAGGTGGCAGTTCAGGTTGC-ATTTGGAACCCTCTTGTTTGTGTAT-TTCCCTAATTT 697
|||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |
Sbjct 881 GCGAGGTGGCAGCTCAGGTT-CTGTTTGGAATTCTCTTGTTTATGCATCTTCCC-AATCT 938
Query 698 GGACCCTTACCCTGGTTACACACCAGTTG-GGACTGAAAAT-TCCGAGGATTACGAGTAT 755
||| ||||||||||| |||| |||| || | | ||||| | | || ||||| ||||||
Sbjct 939 GGATCCTTACCCTGGCTACATGCCAG-TGCGAAGTGAAACTAT-GGATGATTATGAGTAT 996
Query 756 GAAGAGCTTCCTGGA-GGAGAA-AATATATGTCCTGAGAGGCATGCAAATTTATTTGACA 813
|||||| || || || ||| || || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 997 GAAGAGATTTCT-GATGGACAACAA-ATATGCCCTGAGAAGCATGCAAATATATTTGACA 1054
Query 814 GTATCTTCTTCTCATGGTTGAACCCATTGATGACTCTGGGATC-AAAACGACCTCTCACC 872
||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||
Sbjct 1055 AAATCTTCTTCTCATGGATGAACCCCTTGATGACTTTGGGATCTAAAA-GGCCTCTAACA 1113
Query 873 GAGAAGGATGTATGGCATCTGGACACTTGGGATAAAACTGAAACTCT-TATGAGGAGCTT 931
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | | | ||| ||
Sbjct 1114 GAGAAGGATGTGTGGTATCTGGACACTTGGGATCAGACTGAAACTCTGT-TCACGAGTTT 1172
Query 932 CCAG-AAGTCCTGGGATAAGGAACTAGAAAAGCC-CAAACCGTGGCTTTTGAGAGCACTG 989
||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1173 TCAGCAA-TCCTGGGATAAGGAACTACAAAAGCCGC-AACCGTGGCTGTTGAGAGCATTG 1230
Query 990 AACAACAGCCTTGGG-GGAAGGTTTTGGTGGGGTGGCTTTTGGAAGATTGGGAATGACTG 1048
||||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1231 AACAATAG-CTTGGGAGGAAGGTTTTGGTGGGGAGGATTTTGGAAGATCGGGAATGATTG 1289
Query 1049 TTCACAGTTCGTGGGGCCTCTTCTACTGAATGAGCTCTTAAAGTCAATGCAACTTA-ATG 1107
||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |||
Sbjct 1290 CTCACAATTTGTGGGGCCTCTTTTACTGAATCAACTCTTAAAGTCAATGCAA-GAAGATG 1348
Query 1108 AACCAGCGTGGATAGGTTACATCTATGCAATCTCAATCTTTGTTGGAGTGGTATTGGGGG 1167
| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 AGCCAGCTTGGATGGGTTACATCTATGCGTTCTCTATCTTTGTTGGAGTGGTATTGGGGG 1408
Query 1168 TTTTATGTGAAGCTCAGTATTTCCAAAATGTGATGCGTGTTGGTTACCGGCTTAGGTCTG 1227
| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||
Sbjct 1409 TGCTATGTGAAGCTCAATATTTCCAGAATGTCATGCGTGTTGGTTACCGACTGAGATCTG 1468
Query 1228 CACTGATTGCTGCTGTGTTCCGAAAATCTTTGAGGCTAACTAATGAGGGGCGGAAG-AAG 1286
| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || | | || |||
Sbjct 1469 CCCTGATTGCTGCTGTGTTCCGCAAATCGTTGAGGTTAACTAATGAAGGTC-GTAGAAAG 1527
Query 1287 TTTCAAACAGGAAAAATAACAAACTTAATGACTACTGATGCTGAGTCGCTGCAGCAAATC 1346
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||
Sbjct 1528 TTTCAAACTGGAAAGATAACTAACTTAATGACGACTGATGCCGAATCTCTTCAGCAAATT 1587
Query 1347 TGCCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCGCCATTTCGTATAATTGTAGCACTGGTTCTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1588 TGCCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCTCCATTTCGTATAATTATAGCACTGGTTCTC 1647
Query 1407 CTCTATCAACAATTGGGTGTTGCCTCGATCATTGGTGCATTGTTTCTT-GTCCTTATGTT 1465
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||
Sbjct 1648 CTCTATCAGCAATTGGGTGTTGCCTCGCTCATTGGTGCATTG-TTGTTGGTCCTTATGTT 1706
Query 1466 CCCCATACAGACTGTTATTATAAGCAAAACGCAGAAGTTAACAAAAGAAGGGTTGCAGCG 1525
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1707 CCCTTTACAGACTGTTATTATAAGCAAAATGCAGAAGCTGACAAAGGAAGGTTTGCAGCG 1766
Query 1526 TACTGACAAGAGAATTGGCCTAATGAATGAGGTTTTAGCGGCAATGGATACAGTGAAGTG 1585
|||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1767 TACTGACAAGGGAATTGGCCTTATGCATGAGGTTTTAGCTGCAATGGATACAGTAAAGTG 1826
Query 1586 TTACGCTTGGGAAAACAGTTTTCAGTCCAAGGTTCAAACTGTACGTGATGATGAATTATC 1645
||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827 TTATGCTTGGGAAAACAGTTTCCAGTCCAAGGTCCAAACTGTACGTGATGATGAATTATC 1886
Query 1646 TTGGTTCCGGAAAGCACAACTCCTGTCAGCGTTCAATATGTTCATACTAAACAGCATTCC 1705
||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1887 TTGGTTCCGGAAATCACAGCTCCTGGGAGCGTTGAATATGTTCATACTGAATAGCATTCC 1946
Query 1706 TGTCCTCGTGACTGTTGTTTCATTTGGTGTGTTCTCATTGCTTGGAGGAGATCTGACACC 1765
||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1947 TGTTCTTGTGACTATTGTTTCATTTGGTGTGTTCACATTACTTGGAGGAGACCTGACCCC 2006
Query 1766 TGCAAGAGCGTTTACGTCACTCTCTCTATTTTCTGTGCTTCGCTTCCCTTTATTCATGCT 1825
|||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 2007 TGCAAGAGCGTTTACGTCGCTCTCTCTCTTTGCTGTGCTTCGTTTCCCTCTCTTCATGCT 2066
Query 1826 TCCAAACATTATAACTCAGATGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAACCGTTTGGAGGAGGT 1885
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2067 TCCAAACATTATAACTCAGGTGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAAACGTTTGGAGGAGGT 2126
Query 1886 ACT-GTCAACCGAAGAGAGAGTTCTCTTACCGAATCCTCCCATTGAACCTGGACAGCCAG 1944
|| | | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 2127 -CTTGGCGACAGAAGAGAGAATTCTCTTACCAAATCCTCCCATTGAACCTGGAGAACCAG 2185
Query 1945 CTATCTCAATAAGAAATGGATACTTCTCCTGGGATTCAAAGGCGGATAGGCCAACATTGT 2004
| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||
Sbjct 2186 CCATCTCAATAAGAAATGGATATTTCTCTTGGGATTCTAAGGGGGATAGGCCGACATTGT 2245
Query 2005 CAAACATCAACCTGGACATACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCGGTAGTTGGCAGCACAGGAG 2064
|||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |
Sbjct 2246 CAAATATCAACTTGGATGTACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCTGTGGTTGGTAGTACAGGCG 2305
Query 2065 AAGGAAAAACCTCCCTGATATCTGCTATGCTTGGGGAACTTCCTGCAAGATCTGATGCGA 2124
||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 2306 AAGGAAAAACCTCTCTAATATCTGCTATCCTTGGTGAACTTCCTGCAACATCTGATGCAA 2365
Query 2125 CTG-TTACTCTTAGAGGATCAGTCGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAACGCA 2183
|| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2366 -TGGTTACTCTCAGAGGATCAGTTGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAATGCA 2424
Query 2184 ACAGTACGTGACAATATATTGTTTGGGGCTCCTTTTGACCAAGAAAAATATGAAAGGGTG 2243
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||
Sbjct 2425 ACAGTACGCGACAATATATTGTTTGGTTCTCCTTTCGACCGTGAAAAGTATGAAAGGGTC 2484
Query 2244 ATTGATGTGACAGCACTCCAGCATGACCTTGAGTTACTGCCTGGAGGTGACCTCACGGAG 2303
||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2485 ATTGATGTGACTTCACTCAAGCATGACCTAGAGCTACTACCTGGTGGTGATCTCACGGAG 2544
Query 2304 ATCGGAGAAAGGGGTGTTAACATCAGTGGGGGACAAAAGCAGAGGGTTTCTATGGCTAGG 2363
|| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2545 ATTGGAGAAAGAGGTGTTAATATCAGTGGAGGACAGAAGCAGAGGGTTTCCATGGCTAGG 2604
Query 2364 GCCGTTTACTCAAATTCAGACGTGTGCATCTTAGATGACCCATTGAGTGCCCTTGATGCG 2423
|||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2605 GCCGTTTACTCAGATTCAGATGTGTACATCTTTGATGACCCGTTAAGTGCCCTTGATGCT 2664
Query 2424 CATGTTGGTCAGCAGGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGGGAACTAGGGCAGACAACGAGA 2483
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||
Sbjct 2665 CATGTTGGTCAACAGGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGAGAATTAGCGCAGAAAACAAGG 2724
Query 2484 GTACTTGTTACAAATCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGATAAAATCCTACTTGTCCAT 2543
|| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2725 GTCCTTGTTACAAACCAGCTCCACTTCCTATCGCAAGTGGATAGAATTGTACTTGTCCAT 2784
Query 2544 GAGGGAACAGTAAAAGAGGAAGGAACATATGAAGAATTATGCCA-TAGTGGCCCGTTGTT 2602
|| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||
Sbjct 2785 GAAGGCACAGTGAAAGAGGAAGGAACATATGAAGAGCTAT-CCAATAATGGCCCTTTGTT 2843
Query 2603 CCAGAGGTTAATGGAAAATGCAGGGAAGGTTGAAGATTATTCAGAAGAAAATGGAGAAGC 2662
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2844 CCAGAGGTTAATGGAAAATGCGGGGAAGGTGGAAGAATATTCAGAAGAAAATGGAGAAGC 2903
Query 2663 TGAAGTAGATCAAACATCTG-TAAAACCAGTTGAAAATGGGAACGCTAATAATCTGCAGA 2721
||| | ||||||| || || || ||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||
Sbjct 2904 TGAGGCAGATCAAGCAG-TGGTACAACCAGTTGCGAATGGGAACACAAATGGTCTTCAGA 2962
Query 2722 AGGATGGAA-T--CGAGA------C-AA--A-G-AATTCCAAA-GAAGGAAACTCTGTTC 2766
|||||||| | ||| | | || | | || | ||| | |||||| ||||| |
Sbjct 2963 TGGATGGAAGTGACGATAAAAAATCCAAGGAAGGAAATAAAAAAGGAGGAAAGTCTGTCC 3022
Query 2767 TTGTCAAGCGAGAAGAACGTGAAACTGGAGTTGTGAGTTGGAAAGTCCTGGAGAGGTACC 2826
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 3023 TCATCAAGCAAGAAGAACGTGAAACTGGAGTTGTGAGTTGGAGAGTCCTGAAGAGGTACC 3082
Query 2827 AGAATGCACTTGGAGGTGCATGGGTAGTGATGATGCTCGTTATATGCTACGTCTTGACTC 2886
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||
Sbjct 3083 AGGATGCACTTGGAGGGGCATGGGTAGTGATGATGCTCCTTTTATGCTACGTCTTAACAG 3142
Query 2887 AAGTATTTCGGGTTTCAAGCAGCACT-TGGTTGAGTGAGTGGACTGATTCAGGAACCCCA 2945
|||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 3143 AAGTATTTCGGGTTACTAGCAGCA-TGTGGTTGAGTGAGTGGACTGATGCAGGAACTCCA 3201
Query 2946 AAGACTCATGGACCCCTATTCTATAATATTGTCTATGCGCTTCTTTCGTTTGGACAGGTC 3005
|||| |||||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3202 AAGAGTCATGGACCCCTTTTCTACAATCTCATATATGCACTTCTCTCGTTTGGACAGGTT 3261
Query 3006 TCTG-TGACATTGATCAATTCATATTGGTTGATTATGTCCAGTCTATATGCAGCTAAAAA 3064
| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3262 T-TGGTGACATTGACCAATTCATATTGGTTGATTATGTCCAGTCTTTATGCAGCTAAGAA 3320
Query 3065 GATGCATGATGCTATGCTTGGTTCCATACTAAGGGCTCCAATGGTG-TTCTTTCAAACCA 3123
| | || || ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| || ||||
Sbjct 3321 GTTACACGACAATATGCTTCACTCCATACTAAGGGCCCCGATG-TCCTTCTTCCATACCA 3379
Query 3124 ATCCATTAGGACGGATAATCAATCGATTTGCAAAAGATATGGGAGATATTGATCGAACTG 3183
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 3380 ATCCGCTAGGACGGATAATCAATCGATTCGCAAAAGATCTGGGTGATATTGATCGAACTG 3439
Query 3184 TGGCAGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTTCAA-TCGCACAGCTTCTTTCAACTGTTATC 3242
|||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 3440 TGGCTGTCTTTGTGAACATGTTTATGGGT-CAAGTCTCACAGCTCCTTTCAACTGTTGTC 3498
Query 3243 TTGATTGGCATTGTCAGCACTCTGTCCCTGTGGGCCATCATGCCCCTGTTGGTCGTGTTC 3302
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3499 TTGATTGGCATTGTAAGCACTTTGTCCTTGTGGGCCATCATGCCCCTCCTGGTCTTGTTT 3558
Query 3303 TATGGAGCTTATCTGTATTACCAGAACACATCTCGGGAAATTAAACGTATGGATTCCACT 3362
|||||||| ||||| ||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||| | |
Sbjct 3559 TATGGAGCGTATCTTTATTACCAGAACACAGCACGTGAGGTTAAGCGTATGGATTCAATT 3618
Query 3363 ACAAGATCGCCAGTTTATGCTCAATTTGGTGAGGCATTGAATGGACT-ATCTAGTATCCG 3421
|||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||
Sbjct 3619 TCAAGATCGCCTGTTTATGCACAGTTTGGAGAGGCATTGAATGG-CTTATCAACTATCCG 3677
Query 3422 TGCTTATAAAGCATATGA-CAGGATGGCTGAAATTAATGGAAGGTCAATGGACAATAACA 3480
|||||| ||||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3678 TGCTTACAAAGCATATGATC-GGATGGCTGATATCAACGGAAGATCAATGGATAATAACA 3736
Query 3481 TCAGATTCACACTTGTAAACATGGCTGCAAATCGGTGGCTGGGAATCCGTTTGGAAGTTT 3540
|||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |
Sbjct 3737 TCAGATTCACTCTTGTCAACATGGGTGCCAATCGGTGGCTCGGAATTCGTTTAGAAACTC 3796
Query 3541 TGGGAGGTCTCATGGTTTGGTTGACTGCGTCATTAGCCGTCATGCAGAACGGAA-AGGCA 3599
|||| ||||| ||| ||||| |||| || || || || ||||||||||| |||| || |
Sbjct 3797 TGGGTGGTCTTATGATTTGGCTGACAGCATCCTTTGCTGTCATGCAGAATGGAAGAG-CG 3855
Query 3600 GCGAACCAACAAGCATATGCATCTACGATGGGTTTGCTTCTCAGTTATGCGTTAAGCATT 3659
| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||
Sbjct 3856 GAGAACCAACAGGCATTTGCATCTACAATGGGGTTGCTTCTTAGTTATGCCTTAAATATT 3915
Query 3660 ACCAGCTCT-TTAACAGCTGTACTGAGACTCGCGAGTCTAGCTGAGAATAGTTTAAACTC 3718
||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |
Sbjct 3916 ACCAGCT-TGTTAACAGGTGTTCTGAGACTTGCGAGTTTGGCTGAGAATAGTCTAAACGC 3974
Query 3719 GGTTGAGCGTGTTGGAAATTATATCGAGATACCATCAGAGGCTCCA-TTGGTCATTGAAA 3777
||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| || |
Sbjct 3975 GGTTGAGCGTGTTGGCAATTATATAGAGATACCGCCAGAGGCTCCGCTTG-TCATCGAGA 4033
Query 3778 ACAACCGTCCACCTCCCGGATGGCCATCATCTGGATCCATAAAATTTGAGGATGTTGTTC 3837
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4034 ACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCATAAAATTTGAGGATGTTGTTC 4093
Query 3838 TTCGTTACCGCCCTGAGTTACCTCCTGTTCTTCATGGAGTTTCGTTCTTGATTTC-TCCA 3896
| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||
Sbjct 4094 TCCGTTACCGCCCTCAGTTACCCCCTGTGCTTCATGGGGTTTCTTTCTTCATT-CATCCA 4152
Query 3897 ATGGATAAGGTGGGAATTGTTGGGAGGACAGGCGCTGGGAAATCAAGCCTCTTAAATGCC 3956
| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||
Sbjct 4153 ACAGATAAGGTGGGGATTGTTGGAAGGACTGGTGCTGGGAAGTCAAGCCTGTTGAATGCA 4212
Query 3957 TTATTCAGGATTGTGGAGCTGGAAAAAGGAAGGATTTTAATTGATGAATGCGACATTGGA 4016
||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||
Sbjct 4213 TTATTTAGAATTGTGGAGGTGGAAAAAGGAAGGATCTTAATCGATGAGTGTGACGTTGGA 4272
Query 4017 A-GATTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATTATACCGCAAG-CGCCAGTTC 4074
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | | |||||||
Sbjct 4273 AAG-TTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATCATTCCACA-GTCACCAGTTC 4330
Query 4075 TTTTCTCAGGTACCGTGAGATTCAATCTTGACCCATTTAGTGAACACAACGACGCCGATC 4134
|||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||
Sbjct 4331 TTTTCTCAGGAACTGTGAGGTTCAATCTTGATCCATTTGGTGAACACAATGATGCTGATC 4390
Query 4135 TCTGGGAATCTCTTGAGAGGGCACACTTGAAAGATACTATCCGCAGAAATCCTCTTGGTC 4194
| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4391 TTTGGGAATCTCTAGAGAGGGCACACTTGAAGGATACCATCCGCAGAAATCCTCTTGGTC 4450
Query 4195 TTGATGCTGAGGTAACTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTTGGACAGAGACAGTTGTTGA 4254
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||
Sbjct 4451 TTGATGCTGAGGTCTCAGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTGGGGCAGAGGCAATTGTTGA 4510
Query 4255 GTCTTGCACGTGCATTGTTACGAAGATCTAAGATACTTGTTCTTGATGAAGCAACTGCTG 4314
||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 4511 GTCTTTCACGTGCGTTGTTACGGAGATCTAAGATACTCGTCCTTGATGAAGCAACTGCTG 4570
Query 4315 CAGTTGACGTAAGAACTGATGTTCTCATCCAAAAGACCATCCGAGAAGAATTCAAGTCAT 4374
| ||||| || ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4571 CTGTTGATGTTAGAACCGATGCCCTCATTCAGAAGACTATCCGAGAAGAATTCAAGTCAT 4630
Query 4375 GCACAATGCTAATCATCGCTCATCGTCTCAATACTATCATCGACTGTGACAAAGTTCTTG 4434
|||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |
Sbjct 4631 GCACGATGCTTATCATCGCTCACCGTCTCAATACCATCATTGACTGTGACAAAATTCTCG 4690
Query 4435 TCCTTGATTCTGGAAAAGTTCAGGAATTCAGTTCACCGGAGAATCTTCTTTCAAATGGAG 4494
| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||
Sbjct 4691 TGCTTGATTCTGGAAGAGTTCAAGAATTCAGTTCACCGGAGAACCTTCTTTCAAACGAAG 4750
Query 4495 AAAGTTCTTTCTCGAAGATGGTTCAAAGTACAGGAACTGCAAACGCGGAGTACTTACGTA 4554
||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||
Sbjct 4751 GAAGCTCTTTCTCCAAGATGGTTCAAAGCACTGGAGCTGCAAATGCTGAGTACTTGCGTA 4810
Query 4555 GTATAACACTAGAGAACAAACGTACCAGAGAAGCTAACGGTGATGATTCACAACCTTTAG 4614
|| || ||| || ||||| ||| ||||||| | | | | | | ||| | || |
Sbjct 4811 GTTTAGTACTCGACAACAAGCGTGCCAGAGATG--A-C--TCAC-A---ACA-C-TT-AC 4858
Query 4615 AAGGTCAAAGGAAATGGCAAGCTTCTTCTCGTTGGGCTGCAGCTGCTCAATTTGCAT-TG 4673
|||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||
Sbjct 4859 AAGGCCAGAGGAAATGGCTGGCTTCTTCTCGCTGGGCTGCAGCCGCTCAGTTTGC-TCTG 4917
Query 4674 GCTGTGAGCCTCACTTCATCTCACAACGACCTCCAAAGCCTTGAAATCGAAGATGATAAC 4733
|||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 4918 GCTGTGAGTCTTACTTCGTCGCACAACGATCTTCAAAGCCTTGAAATTGAAGATGATAGC 4977
Query 4734 AGTATTTTGAAGAAAACAAAGGACGCCGTCGTCACTCTACGCAGTGTCCTTGAAGGGAAA 4793
|| |||||||||| |||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||||
Sbjct 4978 AGCATTTTGAAGAGAACAAACGATGCGGTTGTGACTCTGCGCAGTGTTCTCGAGGGGAAA 5037
Query 4794 CATGATAAAGAGATTGAAGACTCTCTA-AACCAAAGTGACATCTCTAGAGAGCGTTGGTG 4852
|| || |||||||||| ||| || || || || || | ||||||| |||| | ||||
Sbjct 5038 CACGACAAAGAGATTGCAGAGTCGCTTGAAG-AACGTAATATCTCTAAAGAGGGCTGGTT 5096
Query 4853 GCCATCTCTTTACAAAATGGTCGAAGGGCTTGCCGTGATGAGCAGATTGGCGAGGAA-CA 4911
| |||| || || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 5097 GTCATCACTCTATAGAATGGTAGAAGGGCTTGCGGTGATGAGCAGATTAGCAAGGAATC- 5155
Query 4912 GAATGCAACACCCGGATTACAATTTAGAAGGGAAAT-CGTTTGACTGGGACAATGTCGAG 4970
|||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 5156 GAATGCAACAACCGGATTACAATTTCGAAGG-AAATACATTTGACTGGGACAATGTCGAG 5214
Query 4971 ATGTAAA 4977
|||||||
Sbjct 5215 ATGTAAA 5221
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 195653982793
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5