BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G30400.1 Length=5168 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg473263 jgi|Araly1|473263|fgenesh2_kg.1__3217__AT1G30400.2 8202 0.0 Ahg482430 jgi|Araly1|482430|fgenesh2_kg.4__1490__AT2G34660.1 5195 0.0 > Ahg473263 jgi|Araly1|473263|fgenesh2_kg.1__3217__AT1G30400.2 Length=5079 Score = 8202 bits (4441), Expect = 0.0 Identities = 4735/4882 (97%), Gaps = 0/4882 (0%) Strand=Plus/Plus Query 98 GAGGAAGAAGATGGGGTTTGAGCCGTTGGATTGGTATTGCAAGCCGGTGCCGAATGGTGT 157 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 1 GAGGAAGAAGATGGGGTTTGAGCCGTTGGATTGGTACTGTAAGCCGGTGCCGAATGGTGT 60 Query 158 GTGGACTAAAACTGTGGATTATGCGTTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTATTGACTCTTT 217 |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GTGGACAAAAACAGTGGATTATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTATTGACTCTTT 120 Query 218 TGTGCTTGGTATCTCTCATCTGGTTCTGTTGATTCTGTGTCTTTATCGCTTGTGGCTCAT 277 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| Sbjct 121 TGTGCTTGGCATCTCTCATCTTGTTCTGTTGATTCTGTGCCTTTATCGATTATGGCTCAT 180 Query 278 CACGAAGGATCACAAAGTGGATAAGTTCTGCTTGAGGTCTAAATGGTTTAGCTATTTTCT 337 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || Sbjct 181 CACAAAGGATCACAAAGTGGATAAGTTCTGCTTGAGGTCTAAATGGTATAACTATTTCCT 240 Query 338 GGCTCTTTTGGCTGCTTATGCTACTGCGGAGCCTTTGTTTAGATTGGTCATGAGGATCTC 397 |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GGCTCTGTTGGCTGCTTATGGTACTGCTGAGCCTTTGTTTAGATTGGTCATGAGGATCTC 300 Query 398 TGTTTTGGATTTGGATGGAGCTGGGTTTCCTCCCTATGAGGCGTTTATGTTGGTCCTTGA 457 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 301 TGTTTTGGATTTGGATGGAGCTGGGTTTCCTCCGTATGAGGCGTTCATGTTGGTCCTTGA 360 Query 458 GGCTTTTGCTTGGGGTTCTGCTTTGGTCATGACTGTTGTGGAAACTAAAACGTATATCCA 517 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGCTTTTGCTTGGGGTTCTGCATTAGTCATGACTGTTGTGGAAACTAAAACGTATATCCA 420 Query 518 TGAACTCCGTTGGTATGTCAGATTCGCTGTCATTTATGCTCTTGTGGGAGACATGGTGTT 577 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 421 TGAACTCCGTTGGTATGTTAGATTCGCTGTCATTTATGCTCTTGTCGGAGACATGGTGTT 480 Query 578 GTTAAATCTTGTTCTCTCTGTTAAGGAGTACTATGGCAGTTTTAAACTGTATCTTTACAT 637 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GTTAAATCTTGTTCTCTCGGTGAAGGAGTACTATGGCAGTTTTAAACTGTATCTTTACAT 540 Query 638 AAGCGAGGTGGCAGTTCAGGTTGCATTTGGAACCCTCTTGTTTGTGTATTTCCCTAATTT 697 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AAGCGAGGTGGCAGTTCAGGTTGCATTTGGAACTCTCTTGTTTGTGTATTTCCCTAATTT 600 Query 698 GGACCCTTACCCTGGTTACACACCAGTTGGGACTGAAAATTCCGAGGATTACGAGTATGA 757 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 601 GGATCCTTACCCTGGTTACACACCAGTTGGGACTGAAACTTCGGAGGATTACGAGTATGA 660 Query 758 AGAGCTTCCTGGAGGAGAAAATATATGTCCTGAGAGGCATGCAAATTTATTTGACAGTAT 817 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AGAGCTTCCTGGAGGAGAAAATATATGTCCTGAGAGGCATGCAAATTTATTTGACAGTAT 720 Query 818 CTTCTTCTCATGGTTGAACCCATTGATGACTCTGGGATCAAAACGACCTCTCACCGAGAA 877 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 721 CTTCTTCTCATGGTTGAATCCATTGATGACTCTGGGATCGAAACGGCCTCTCACGGAGAA 780 Query 878 GGATGTATGGCATCTGGACACTTGGGATAAAACTGAAACTCTTATGAGGAGCTTCCAGAA 937 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 781 GGATGTATGGCATTTGGACACTTGGGATAAAACTGAAACTCTCATGAGGAGCTTCCAGAA 840 Query 938 GTCCTGGGATAAGGAACTAGAAAAGCCCAAACCGTGGCTTTTGAGAGCACTGAACAACAG 997 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 841 GTCCTGGGATAAGGAACTAGAAAAGCCCAAACCGTGGCTCTTGAGAGCACTGAACAACAG 900 Query 998 CCTTGGGGGAAGGTTTTGGTGGGGTGGCTTTTGGAAGATTGGGAATGACTGTTCACAGTT 1057 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 901 CCTTGGGGGAAGGTTTTGGTGGGGTGGCTTCTGGAAGATTGGGAATGACTGTTCACAATT 960 Query 1058 CGTGGGGCCTCTTCTACTGAATGAGCTCTTAAAGTCAATGCAACTTAATGAACCAGCGTG 1117 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 961 CGTGGGGCCTCTTCTACTGAATGAGCTCTTAAAGTCAATGCAACTAAATGAACCAGCGTG 1020 Query 1118 GATAGGTTACATCTATGCAATCTCAATCTTTGTTGGAGTGGTATTGGGGGTTTTATGTGA 1177 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 1021 GATAGGTTACATCTATGCAATCTCAATCTTTGTCGGAGTGGTATTGGGTGTTCTATGTGA 1080 Query 1178 AGCTCAGTATTTCCAAAATGTGATGCGTGTTGGTTACCGGCTTAGGTCTGCACTGATTGC 1237 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1081 AGCTCAGTATTTCCAAAATGTGATGCGTGTTGGTTACCGCCTTAGGTCTGCCCTGATTGC 1140 Query 1238 TGCTGTGTTCCGAAAATCTTTGAGGCTAACTAATGAGGGGCGGAAGAAGTTTCAAACAGG 1297 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 TGCTGTGTTCCGAAAATCGCTGAGGCTAACTAATGAGGGGCGGAAGAAGTTTCAAACAGG 1200 Query 1298 AAAAATAACAAACTTAATGACTACTGATGCTGAGTCGCTGCAGCAAATCTGCCAATCACT 1357 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 AAAAATAACAAACTTAATGACGACTGATGCTGAGTCGCTGCAGCAAATCTGCCAATCACT 1260 Query 1358 TCATACCATGTGGTCGGCGCCATTTCGTATAATTGTAGCACTGGTTCTCCTCTATCAACA 1417 |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 1261 TCATACCATGTGGTCGGCTCCATTTCGTATAATAGTAGCGCTGGTTCTCCTCTACCAACA 1320 Query 1418 ATTGGGTGTTGCCTCGATCATTGGTGCATTGTTTCTTGTCCTTATGTTCCCCATACAGAC 1477 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1321 ATTGGGTGTTGCCTCGATCATCGGTGCATTGTTTCTTGTCCTTATGTTCCCTATACAGAC 1380 Query 1478 TGTTATTATAAGCAAAACGCAGAAGTTAACAAAAGAAGGGTTGCAGCGTACTGACAAGAG 1537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 TGTTATTATAAGCAAAACGCAGAAGTTAACAAAAGAAGGGTTGCAGCGTACTGACAAGAG 1440 Query 1538 AATTGGCCTAATGAATGAGGTTTTAGCGGCAATGGATACAGTGAAGTGTTACGCTTGGGA 1597 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 1441 AATTGGCCTAATGAACGAGGTTTTAGCCGCAATGGATACAGTGAAGTGCTATGCTTGGGA 1500 Query 1598 AAACAGTTTTCAGTCCAAGGTTCAAACTGTACGTGATGATGAATTATCTTGGTTCCGGAA 1657 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 AAACAGTTTTCAGGCCAAGGTTCAAACTGTACGTGATGATGAATTATCTTGGTTCCGGAA 1560 Query 1658 AGCACAACTCCTGTCAGCGTTCAATATGTTCATACTAAACAGCATTCCTGTCCTCGTGAC 1717 |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 AGCACAGCTCCTGTCAGCGTTCAATATGTTCATTCTAAACAGCATTCCTGTCCTCGTGAC 1620 Query 1718 TGTTGTTTCATTTGGTGTGTTCTCATTGCTTGGAGGAGATCTGACACCTGCAAGAGCGTT 1777 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 TGTTGTTTCATTTGGTGTGTTCTCATTTCTTGGAGGAGATCTGACACCTGCAAGAGCGTT 1680 Query 1778 TACGTCACTCTCTCTATTTTCTGTGCTTCGCTTCCCTTTATTCATGCTTCCAAACATTAT 1837 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 TACGTCACTTTCTCTATTTTCTGTGCTTCGCTTCCCTTTATTCATGCTTCCAAACATTAT 1740 Query 1838 AACTCAGATGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAACCGTTTGGAGGAGGTACTGTCAACCGA 1897 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || Sbjct 1741 AACTCAGATGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAACCGTTTGGAGGAAGTGCTGTCGACGGA 1800 Query 1898 AGAGAGAGTTCTCTTACCGAATCCTCCCATTGAACCTGGACAGCCAGCTATCTCAATAAG 1957 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 AGAGAGAGTTCTCTTACCGAATCCTCCCATTGAACCTGGACAGCCAGCTATCTCAATAAG 1860 Query 1958 AAATGGATACTTCTCCTGGGATTCAAAGGCGGATAGGCCAACATTGTCAAACATCAACCT 2017 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1861 AAATGGATACTTCTCATGGGATTCAAAGGCGGATAGGCCAACCTTGTCAAACATCAACCT 1920 Query 2018 GGACATACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCGGTAGTTGGCAGCACAGGAGAAGGAAAAACCTC 2077 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1921 GGACATACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCGGTAGTTGGCAGTACAGGAGAAGGAAAAACCTC 1980 Query 2078 CCTGATATCTGCTATGCTTGGGGAACTTCCTGCAAGATCTGATGCGACTGTTACTCTTAG 2137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1981 CCTGATATCTGCTATGCTTGGGGAACTTCCTGCAAGATCTGATGCGACAGTTACTCTTAG 2040 Query 2138 AGGATCAGTCGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAACGCAACAGTACGTGACAA 2197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 AGGATCAGTCGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAACGCAACAGTACGTGACAA 2100 Query 2198 TATATTGTTTGGGGCTCCTTTTGACCAAGAAAAATATGAAAGGGTGATTGATGTGACAGC 2257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 TATATTGTTTGGGGCTCCTTTTGACCAAGAAAAATATGAAAGGGTGATTGATGTGACAGC 2160 Query 2258 ACTCCAGCATGACCTTGAGTTACTGCCTGGAGGTGACCTCACGGAGATCGGAGAAAGGGG 2317 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2161 ACTGCAGCATGACCTTGAGTTACTGCCTGGTGGTGACCTCACGGAGATTGGAGAAAGGGG 2220 Query 2318 TGTTAACATCAGTGGGGGACAAAAGCAGAGGGTTTCTATGGCTAGGGCCGTTTACTCAAA 2377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2221 TGTTAACATCAGTGGGGGACAAAAGCAGAGGGTTTCTATGGCTAGGGCCGTTTACTCAAA 2280 Query 2378 TTCAGACGTGTGCATCTTAGATGACCCATTGAGTGCCCTTGATGCGCATGTTGGTCAGCA 2437 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2281 TTCAGATGTGTGCATCTTCGATGACCCATTGAGTGCCCTTGATGCGCATGTTGGTCAGCA 2340 Query 2438 GGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGGGAACTAGGGCAGACAACGAGAGTACTTGTTACAAA 2497 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2341 GGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGAGAACTAGGGCAGACAACAAGAGTACTTGTTACAAA 2400 Query 2498 TCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGATAAAATCCTACTTGTCCATGAGGGAACAGTAAA 2557 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2401 CCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGATAAAATCCTACTTGTCCATGAGGGAACAGTAAA 2460 Query 2558 AGAGGAAGGAACATATGAAGAATTATGCCATAGTGGCCCGTTGTTCCAGAGGTTAATGGA 2617 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2461 AGAAGAAGGAACATATGAAGAATTATGCCATAGTGGCCCATTGTTCCAGAGGTTAATGGA 2520 Query 2618 AAATGCAGGGAAGGTTGAAGATTATTCAGAAGAAAATGGAGAAGCTGAAGTAGATCAAAC 2677 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2521 AAATGCAGGGAAGGTTGAAGAATATTCAGAAGAAATTGGAGAAGCTGAAGTAGATCAAAC 2580 Query 2678 ATCTGTAAAACCAGTTGAAAATGGGAACGCTAATAATCTGCAGAAGGATGGAATCGAGAC 2737 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2581 ATCTGTAAAACCAGTTGAAAATGGGAACACTAATAATCTGCAGAAGGATGAAATCGAGAC 2640 Query 2738 AAAGAATTCCAAAGAAGGAAACTCTGTTCTTGTCAAGCGAGAAGAACGTGAAACTGGAGT 2797 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2641 AAAGAAATCCAAAGAAGGAAACTCTGTGCTTGTCAAGCGAGAAGAACGTGAAACTGGAGT 2700 Query 2798 TGTGAGTTGGAAAGTCCTGGAGAGGTACCAGAATGCACTTGGAGGTGCATGGGTAGTGAT 2857 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2701 TGTGAGTTGGAAAGTCCTGGAGAGGTACCAGAATGCACTTGGAGGTGCATGGGTAGTGAT 2760 Query 2858 GATGCTCGTTATATGCTACGTCTTGACTCAAGTATTTCGGGTTTCAAGCAGCACTTGGTT 2917 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2761 GATGCTCCTTATATGCTACGTCTTGACTCAAGTATTTCGGGTTTCAAGCAGCACTTGGTT 2820 Query 2918 GAGTGAGTGGACTGATTCAGGAACCCCAAAGACTCATGGACCCCTATTCTATAATATTGT 2977 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2821 GAGTGAGTGGACTGATGCAGGAACCCCTAAGACTCATGGACCCCTATTCTATAATATTGT 2880 Query 2978 CTATGCGCTTCTTTCGTTTGGACAGGTCTCTGTGACATTGATCAATTCATATTGGTTGAT 3037 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2881 CTATGCGCTTCTTTCGTTTGGACAGGTCTCTGTGACATTGATCAATTCATATTGGTTGAT 2940 Query 3038 TATGTCCAGTCTATATGCAGCTAAAAAGATGCATGATGCTATGCTTGGTTCCATACTAAG 3097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2941 TATGTCCAGTCTATATGCAGCTAAAAAGATGCATGATGCTATGCTTGGTTCCATACTAAG 3000 Query 3098 GGCTCCAATGGTGTTCTTTCAAACCAATCCATTAGGACGGATAATCAATCGATTTGCAAA 3157 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3001 GGCTCCAATGGTCTTCTTTCAAACCAATCCATTAGGACGGATAATCAATCGATTTGCTAA 3060 Query 3158 AGATATGGGAGATATTGATCGAACTGTGGCAGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTTCAAT 3217 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3061 AGATATGGGCGATATTGATCGAACTGTGGCAGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTTCAAT 3120 Query 3218 CGCACAGCTTCTTTCAACTGTTATCTTGATTGGCATTGTCAGCACTCTGTCCCTGTGGGC 3277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3121 CGCACAGCTTCTTTCAACTGTTATCTTGATTGGCATTGTCAGCACTCTGTCCCTGTGGGC 3180 Query 3278 CATCATGCCCCTGTTGGTCGTGTTCTATGGAGCTTATCTGTATTACCAGAACACATCTCG 3337 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3181 CATCATGCCCTTGTTGGTCGTGTTCTATGGAGCTTATCTGTATTACCAGAACACATCTCG 3240 Query 3338 GGAAATTAAACGTATGGATTCCACTACAAGATCGCCAGTTTATGCTCAATTTGGTGAGGC 3397 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3241 TGAAATTAAACGTATGGATTCCACTACAAGATCACCCGTTTATGCTCAATTTGGAGAGGC 3300 Query 3398 ATTGAATGGACTATCTAGTATCCGTGCTTATAAAGCATATGACAGGATGGCTGAAATTAA 3457 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3301 ATTGAATGGGCTATCTAGTATCCGTGCTTATAAAGCATATGACAGGATGGCTGAAATTAA 3360 Query 3458 TGGAAGGTCAATGGACAATAACATCAGATTCACACTTGTAAACATGGCTGCAAATCGGTG 3517 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3361 CGGAAGGTCAATGGATAATAACATCAGATTCACACTTGTAAACATGGCTGCAAATCGGTG 3420 Query 3518 GCTGGGAATCCGTTTGGAAGTTTTGGGAGGTCTCATGGTTTGGTTGACTGCGTCATTAGC 3577 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3421 GCTGGGAATTCGTTTGGAAGTTTTGGGAGGTCTCATGGTTTGGTTGACTGCGTCATTAGC 3480 Query 3578 CGTCATGCAGAACGGAAAGGCAGCGAACCAACAAGCATATGCATCTACGATGGGTTTGCT 3637 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3481 CGTCATGCAGAACGGAAAGGCAGAGAACCAACAAGCATATGCATCTACGATGGGTTTGCT 3540 Query 3638 TCTCAGTTATGCGTTAAGCATTACCAGCTCTTTAACAGCTGTACTGAGACTCGCGAGTCT 3697 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3541 TCTCAGTTATGCGTTAAGCATTACCAGCTCTTTAACAGCTGTACTGAGACTCGCGAGTCT 3600 Query 3698 AGCTGAGAATAGTTTAAACTCGGTTGAGCGTGTTGGAAATTATATCGAGATACCATCAGA 3757 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3601 AGCTGAGAATAGTTTAAACTCGGTTGAGCGTGTTGGAAATTATATCGAGATACCATCAGA 3660 Query 3758 GGCTCCATTGGTCATTGAAAACAACCGTCCACCTCCCGGATGGCCATCATCTGGATCCAT 3817 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3661 GGCTCCATTGATCATTGAAAACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCAT 3720 Query 3818 AAAATTTGAGGATGTTGTTCTTCGTTACCGCCCTGAGTTACCTCCTGTTCTTCATGGAGT 3877 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 3721 AAAATTTGAGGATGTTGTTCTTCGTTACCGCCCTGAATTACCTCCTGTTCTCCATGGAGT 3780 Query 3878 TTCGTTCTTGATTTCTCCAATGGATAAGGTGGGAATTGTTGGGAGGACAGGCGCTGGGAA 3937 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 3781 TTCGTTCTTGATTTCTCCAATGGATAAGGTGGGAATTGTTGGAAGAACAGGCGCTGGGAA 3840 Query 3938 ATCAAGCCTCTTAAATGCCTTATTCAGGATTGTGGAGCTGGAAAAAGGAAGGATTTTAAT 3997 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || Sbjct 3841 ATCAAGCCTCTTAAATGCCTTATTCCGGATTGTGGAGCTCGAAAAAGGAAGGATCTTGAT 3900 Query 3998 TGATGAATGCGACATTGGAAGATTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATTAT 4057 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3901 CGATGAATGCGACATTGGCAGATTTGGACTGATGGACCTACGTACAGTGCTCGGAATTAT 3960 Query 4058 ACCGCAAGCGCCAGTTCTTTTCTCAGGTACCGTGAGATTCAATCTTGACCCATTTAGTGA 4117 ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3961 ACCACAGGCGCCAGTTCTTTTCTCAGGTACTGTGAGATTCAATCTCGACCCATTTAGTGA 4020 Query 4118 ACACAACGACGCCGATCTCTGGGAATCTCTTGAGAGGGCACACTTGAAAGATACTATCCG 4177 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4021 ACACAACGATGCCGATCTTTGGGAATCTCTTGAGAGGGCACACTTGAAAGATACTATACG 4080 Query 4178 CAGAAATCCTCTTGGTCTTGATGCTGAGGTAACTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTTGG 4237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4081 CAGAAATCCTCTTGGTCTTGATGCTGAGGTAACTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTTGG 4140 Query 4238 ACAGAGACAGTTGTTGAGTCTTGCACGTGCATTGTTACGAAGATCTAAGATACTTGTTCT 4297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4141 ACAGAGACAGTTGTTGAGTCTTGCACGTGCATTGTTGCGAAGATCTAAGATACTTGTTCT 4200 Query 4298 TGATGAAGCAACTGCTGCAGTTGACGTAAGAACTGATGTTCTCATCCAAAAGACCATCCG 4357 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4201 TGATGAAGCAACTGCTGCTGTTGACGTTAGAACTGATGTTCTCATCCAAAAGACCATCCG 4260 Query 4358 AGAAGAATTCAAGTCATGCACAATGCTAATCATCGCTCATCGTCTCAATACTATCATCGA 4417 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4261 AGAAGAATTCAAGTCCTGCACGATGCTAATCATCGCTCATCGTCTCAATACTATCATTGA 4320 Query 4418 CTGTGACAAAGTTCTTGTCCTTGATTCTGGAAAAGTTCAGGAATTCAGTTCACCGGAGAA 4477 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4321 CTGTGACAAAGTTCTCGTCCTTGATTCTGGAAAAGTTCAGGAATTCAGTTCACCGGAGAA 4380 Query 4478 TCTTCTTTCAAATGGAGAAAGTTCTTTCTCGAAGATGGTTCAAAGTACAGGAACTGCAAA 4537 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4381 TCTTCTTTCAAACGGAGAAAGTTCTTTCTCAAAGATGGTTCAAAGTACAGGAACTGCAAA 4440 Query 4538 CGCGGAGTACTTACGTAGTATAACACTAGAGAACAAACGTACCAGAGAAGCTAACGGTGA 4597 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4441 CGCGGAGTACTTACGTAGTATAACACTTGAGAACACACGTACCAGAGATGCTAACGGTGA 4500 Query 4598 TGATTCACAACCTTTAGAAGGTCAAAGGAAATGGCAAGCTTCTTCTCGTTGGGCTGCAGC 4657 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4501 TGATTCACAACCTTTAGAAGGTCAGAGGAAATGGCAAGCTTCTTCTCGTTGGGCTGCAGC 4560 Query 4658 TGCTCAATTTGCATTGGCTGTGAGCCTCACTTCATCTCACAACGACCTCCAAAGCCTTGA 4717 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4561 TGCTCAGTTTGCTTTGGCTGTGAGCCTCACTTCATCTCACAACGACCTTCAAAGCCTTGA 4620 Query 4718 AATCGAAGATGATAACAGTATTTTGAAGAAAACAAAGGACGCCGTCGTCACTCTACGCAG 4777 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4621 AATCGAAGATGATAACAGCATTTTGAAGAAAACGAAGGACGCCGTCGTCACTCTACGCAG 4680 Query 4778 TGTCCTTGAAGGGAAACATGATAAAGAGATTGAAGACTCTCTAAACCAAAGTGACATCTC 4837 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4681 TGTTCTTGAAGGGAAACACGATAAAGAGATTGAAGATTCTCTTAACCAAAGTGACATCTC 4740 Query 4838 TAGAGAGCGTTGGTGGCCATCTCTTTACAAAATGGTCGAAGGGCTTGCCGTGATGAGCAG 4897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4741 TAGAGAGCGTTGGTGGCCATCTCTTTACAAAATGGTCGAAGGGCTTGCGGTGATGAGCAG 4800 Query 4898 ATTGGCGAGGAACAGAATGCAACACCCGGATTACAATTTAGAAGGGAAATCGTTTGACTG 4957 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4801 ATTGGCGAGGAACCGAATGCAACACCCGGATTACAACTTAGAAGGGAAATCGTTTGACTG 4860 Query 4958 GGACAATGTCGAGATGTAAACG 4979 |||||||||||||||||||||| Sbjct 4861 GGACAATGTCGAGATGTAAACG 4882 Score = 145 bits (78), Expect = 4e-33 Identities = 124/145 (86%), Gaps = 7/145 (5%) Strand=Plus/Plus Query 5022 GGAACTTTTATTTGTATTGCTTGGGATACACGTAACAAAATGCCCATTAATCGTGGTGT- 5080 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 4882 GGAACTTTTATTT-TATTGATTGGGATACACGTAACAAAATGCCCATTTTTTGTGGTGTT 4940 Query 5081 AACTATATAGGCTATGCTTCTTTTGGGAAAAAGAGAGTTTGATTAC-AGAGGATGTGATG 5139 || |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| || | | |||||| |||| Sbjct 4941 AATTATATAGGCTGTACTTCTTTTGGGAAA--GAGTGTTTGGTTCCCAAAGGATGGGATG 4998 Query 5140 ATA-ACACAATTGGAATTCAAATTT 5163 ||| ||| |||| ||||| |||||| Sbjct 4999 ATACACAGAATTCGAATT-AAATTT 5022 > Ahg482430 jgi|Araly1|482430|fgenesh2_kg.4__1490__AT2G34660.1 Length=5382 Score = 5195 bits (2813), Expect = 0.0 Identities = 4240/4927 (86%), Gaps = 105/4927 (2%) Strand=Plus/Plus Query 105 AAGATGGGGTTTGAGCCGTTGGATTGGTATTGCAAGCCGGTGCCGAATGGTGTGTGGACT 164 |||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 346 AAGATGGGATTTGAGTTTTTTGAATGGTATTGTAAGCCGGTGCCTAATGGTGTTTGGAC- 404 Query 165 AAAAC-TGTGGATTATGCGTTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTATTGACTCTTTTGTGCT 223 ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 405 AAAACAAGTGGCTAATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTACTGACTCTTTTGTGCT 464 Query 224 TGGTATCTCTCATCTGGTTCTGTTGATTCTGTGTCTTTATCGCT-TGTGGCTCATCACGA 282 ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| | | ||||||| || || Sbjct 465 CGGTATCTCTCAACTGGTTCTGTTGGTTTTGTGTCTGTATCG-TATATGGCTCACCATGA 523 Query 283 AGGATCACAAAGTGGATAAGTTCTGCTTGAGGTCTAAATGGTTTAGCTATTTTCTGGCTC 342 | |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| || || |||||| |||||| Sbjct 524 AAGATCACAAGGTGGAGAGGTTCTGCTTGAGGTCAAAATTGTATAACTATTTCCTGGCT- 582 Query 343 TT-TTGGCTGCTTATGCTACTGCGGAGCCTTTGTTTAGATTGGTCATGAGGATCTCTGTT 401 || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| || ||| Sbjct 583 TTGTTGGCTGCTTATGCTACTGCTGAGCCTTTGTTCAGATTGATTATGGGGATTTCAGTT 642 Query 402 TTGGATTTGGATGGAGCTGGGTTTCCTCCCTATGAGGCGTTTATG-TT-GGTCCTTGAGG 459 ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| || | || ||| | | | Sbjct 643 TTGGATTTGGATGGACCTGGACTTCCTCCTTTTGAGGC-ATTCGGATTGGGT-GTCAAAG 700 Query 460 CTTTTGCTTGGGGTTCTGCTTTGGTCATGACTGTTGTGGAAACTAAAACGTATATCCATG 519 ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||| || |||| || Sbjct 701 CTTTTGCTTGGGGCTCTGCAATGGTCATGATTTTTATGGAAACTAAAATTTACATCCGTG 760 Query 520 AACTCCGTTGGTATGTCAGATTCGCTGTCATTTATGCTCTTGTGGGAGACATGGTGTTGT 579 |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct 761 AACTCCGTTGGTATGTTAGGTTTGCTGTCATATATGCTCTTGTGGGGGATATGGTCTTGC 820 Query 580 TAAATCTTGTTCTCTCTGTTAAGGAGTACTATGGCAGTTTTAAACTGTATCTTTACATAA 639 |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||| || Sbjct 821 TAAATCTTGTTCTCTCAGTTAAGGAGTTCTATAGCAGTTATGTTCTGTATCTCTACACAA 880 Query 640 GCGAGGTGGCAGTTCAGGTTGC-ATTTGGAACCCTCTTGTTTGTGTAT-TTCCCTAATTT 697 |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | Sbjct 881 GCGAGGTGGCAGCTCAGGTT-CTGTTTGGAATTCTCTTGTTTATGCATCTTCCC-AATCT 938 Query 698 GGACCCTTACCCTGGTTACACACCAGTTG-GGACTGAAAAT-TCCGAGGATTACGAGTAT 755 ||| ||||||||||| |||| |||| || | | ||||| | | || ||||| |||||| Sbjct 939 GGATCCTTACCCTGGCTACATGCCAG-TGCGAAGTGAAACTAT-GGATGATTATGAGTAT 996 Query 756 GAAGAGCTTCCTGGA-GGAGAA-AATATATGTCCTGAGAGGCATGCAAATTTATTTGACA 813 |||||| || || || ||| || || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct 997 GAAGAGATTTCT-GATGGACAACAA-ATATGCCCTGAGAAGCATGCAAATATATTTGACA 1054 Query 814 GTATCTTCTTCTCATGGTTGAACCCATTGATGACTCTGGGATC-AAAACGACCTCTCACC 872 ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || Sbjct 1055 AAATCTTCTTCTCATGGATGAACCCCTTGATGACTTTGGGATCTAAAA-GGCCTCTAACA 1113 Query 873 GAGAAGGATGTATGGCATCTGGACACTTGGGATAAAACTGAAACTCT-TATGAGGAGCTT 931 ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | | | ||| || Sbjct 1114 GAGAAGGATGTGTGGTATCTGGACACTTGGGATCAGACTGAAACTCTGT-TCACGAGTTT 1172 Query 932 CCAG-AAGTCCTGGGATAAGGAACTAGAAAAGCC-CAAACCGTGGCTTTTGAGAGCACTG 989 ||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| || Sbjct 1173 TCAGCAA-TCCTGGGATAAGGAACTACAAAAGCCGC-AACCGTGGCTGTTGAGAGCATTG 1230 Query 990 AACAACAGCCTTGGG-GGAAGGTTTTGGTGGGGTGGCTTTTGGAAGATTGGGAATGACTG 1048 ||||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || Sbjct 1231 AACAATAG-CTTGGGAGGAAGGTTTTGGTGGGGAGGATTTTGGAAGATCGGGAATGATTG 1289 Query 1049 TTCACAGTTCGTGGGGCCTCTTCTACTGAATGAGCTCTTAAAGTCAATGCAACTTA-ATG 1107 ||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||| Sbjct 1290 CTCACAATTTGTGGGGCCTCTTTTACTGAATCAACTCTTAAAGTCAATGCAA-GAAGATG 1348 Query 1108 AACCAGCGTGGATAGGTTACATCTATGCAATCTCAATCTTTGTTGGAGTGGTATTGGGGG 1167 | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1349 AGCCAGCTTGGATGGGTTACATCTATGCGTTCTCTATCTTTGTTGGAGTGGTATTGGGGG 1408 Query 1168 TTTTATGTGAAGCTCAGTATTTCCAAAATGTGATGCGTGTTGGTTACCGGCTTAGGTCTG 1227 | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||| Sbjct 1409 TGCTATGTGAAGCTCAATATTTCCAGAATGTCATGCGTGTTGGTTACCGACTGAGATCTG 1468 Query 1228 CACTGATTGCTGCTGTGTTCCGAAAATCTTTGAGGCTAACTAATGAGGGGCGGAAG-AAG 1286 | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || | | || ||| Sbjct 1469 CCCTGATTGCTGCTGTGTTCCGCAAATCGTTGAGGTTAACTAATGAAGGTC-GTAGAAAG 1527 Query 1287 TTTCAAACAGGAAAAATAACAAACTTAATGACTACTGATGCTGAGTCGCTGCAGCAAATC 1346 |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||| Sbjct 1528 TTTCAAACTGGAAAGATAACTAACTTAATGACGACTGATGCCGAATCTCTTCAGCAAATT 1587 Query 1347 TGCCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCGCCATTTCGTATAATTGTAGCACTGGTTCTC 1406 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1588 TGCCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCTCCATTTCGTATAATTATAGCACTGGTTCTC 1647 Query 1407 CTCTATCAACAATTGGGTGTTGCCTCGATCATTGGTGCATTGTTTCTT-GTCCTTATGTT 1465 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| Sbjct 1648 CTCTATCAGCAATTGGGTGTTGCCTCGCTCATTGGTGCATTG-TTGTTGGTCCTTATGTT 1706 Query 1466 CCCCATACAGACTGTTATTATAAGCAAAACGCAGAAGTTAACAAAAGAAGGGTTGCAGCG 1525 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| Sbjct 1707 CCCTTTACAGACTGTTATTATAAGCAAAATGCAGAAGCTGACAAAGGAAGGTTTGCAGCG 1766 Query 1526 TACTGACAAGAGAATTGGCCTAATGAATGAGGTTTTAGCGGCAATGGATACAGTGAAGTG 1585 |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 1767 TACTGACAAGGGAATTGGCCTTATGCATGAGGTTTTAGCTGCAATGGATACAGTAAAGTG 1826 Query 1586 TTACGCTTGGGAAAACAGTTTTCAGTCCAAGGTTCAAACTGTACGTGATGATGAATTATC 1645 ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1827 TTATGCTTGGGAAAACAGTTTCCAGTCCAAGGTCCAAACTGTACGTGATGATGAATTATC 1886 Query 1646 TTGGTTCCGGAAAGCACAACTCCTGTCAGCGTTCAATATGTTCATACTAAACAGCATTCC 1705 ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| Sbjct 1887 TTGGTTCCGGAAATCACAGCTCCTGGGAGCGTTGAATATGTTCATACTGAATAGCATTCC 1946 Query 1706 TGTCCTCGTGACTGTTGTTTCATTTGGTGTGTTCTCATTGCTTGGAGGAGATCTGACACC 1765 ||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || Sbjct 1947 TGTTCTTGTGACTATTGTTTCATTTGGTGTGTTCACATTACTTGGAGGAGACCTGACCCC 2006 Query 1766 TGCAAGAGCGTTTACGTCACTCTCTCTATTTTCTGTGCTTCGCTTCCCTTTATTCATGCT 1825 |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| Sbjct 2007 TGCAAGAGCGTTTACGTCGCTCTCTCTCTTTGCTGTGCTTCGTTTCCCTCTCTTCATGCT 2066 Query 1826 TCCAAACATTATAACTCAGATGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAACCGTTTGGAGGAGGT 1885 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2067 TCCAAACATTATAACTCAGGTGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAAACGTTTGGAGGAGGT 2126 Query 1886 ACT-GTCAACCGAAGAGAGAGTTCTCTTACCGAATCCTCCCATTGAACCTGGACAGCCAG 1944 || | | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 2127 -CTTGGCGACAGAAGAGAGAATTCTCTTACCAAATCCTCCCATTGAACCTGGAGAACCAG 2185 Query 1945 CTATCTCAATAAGAAATGGATACTTCTCCTGGGATTCAAAGGCGGATAGGCCAACATTGT 2004 | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| Sbjct 2186 CCATCTCAATAAGAAATGGATATTTCTCTTGGGATTCTAAGGGGGATAGGCCGACATTGT 2245 Query 2005 CAAACATCAACCTGGACATACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCGGTAGTTGGCAGCACAGGAG 2064 |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | Sbjct 2246 CAAATATCAACTTGGATGTACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCTGTGGTTGGTAGTACAGGCG 2305 Query 2065 AAGGAAAAACCTCCCTGATATCTGCTATGCTTGGGGAACTTCCTGCAAGATCTGATGCGA 2124 ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| | Sbjct 2306 AAGGAAAAACCTCTCTAATATCTGCTATCCTTGGTGAACTTCCTGCAACATCTGATGCAA 2365 Query 2125 CTG-TTACTCTTAGAGGATCAGTCGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAACGCA 2183 || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2366 -TGGTTACTCTCAGAGGATCAGTTGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAATGCA 2424 Query 2184 ACAGTACGTGACAATATATTGTTTGGGGCTCCTTTTGACCAAGAAAAATATGAAAGGGTG 2243 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| Sbjct 2425 ACAGTACGCGACAATATATTGTTTGGTTCTCCTTTCGACCGTGAAAAGTATGAAAGGGTC 2484 Query 2244 ATTGATGTGACAGCACTCCAGCATGACCTTGAGTTACTGCCTGGAGGTGACCTCACGGAG 2303 ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||| Sbjct 2485 ATTGATGTGACTTCACTCAAGCATGACCTAGAGCTACTACCTGGTGGTGATCTCACGGAG 2544 Query 2304 ATCGGAGAAAGGGGTGTTAACATCAGTGGGGGACAAAAGCAGAGGGTTTCTATGGCTAGG 2363 || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2545 ATTGGAGAAAGAGGTGTTAATATCAGTGGAGGACAGAAGCAGAGGGTTTCCATGGCTAGG 2604 Query 2364 GCCGTTTACTCAAATTCAGACGTGTGCATCTTAGATGACCCATTGAGTGCCCTTGATGCG 2423 |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| Sbjct 2605 GCCGTTTACTCAGATTCAGATGTGTACATCTTTGATGACCCGTTAAGTGCCCTTGATGCT 2664 Query 2424 CATGTTGGTCAGCAGGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGGGAACTAGGGCAGACAACGAGA 2483 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| || Sbjct 2665 CATGTTGGTCAACAGGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGAGAATTAGCGCAGAAAACAAGG 2724 Query 2484 GTACTTGTTACAAATCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGATAAAATCCTACTTGTCCAT 2543 || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 2725 GTCCTTGTTACAAACCAGCTCCACTTCCTATCGCAAGTGGATAGAATTGTACTTGTCCAT 2784 Query 2544 GAGGGAACAGTAAAAGAGGAAGGAACATATGAAGAATTATGCCA-TAGTGGCCCGTTGTT 2602 || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| Sbjct 2785 GAAGGCACAGTGAAAGAGGAAGGAACATATGAAGAGCTAT-CCAATAATGGCCCTTTGTT 2843 Query 2603 CCAGAGGTTAATGGAAAATGCAGGGAAGGTTGAAGATTATTCAGAAGAAAATGGAGAAGC 2662 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2844 CCAGAGGTTAATGGAAAATGCGGGGAAGGTGGAAGAATATTCAGAAGAAAATGGAGAAGC 2903 Query 2663 TGAAGTAGATCAAACATCTG-TAAAACCAGTTGAAAATGGGAACGCTAATAATCTGCAGA 2721 ||| | ||||||| || || || ||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||| Sbjct 2904 TGAGGCAGATCAAGCAG-TGGTACAACCAGTTGCGAATGGGAACACAAATGGTCTTCAGA 2962 Query 2722 AGGATGGAA-T--CGAGA------C-AA--A-G-AATTCCAAA-GAAGGAAACTCTGTTC 2766 |||||||| | ||| | | || | | || | ||| | |||||| ||||| | Sbjct 2963 TGGATGGAAGTGACGATAAAAAATCCAAGGAAGGAAATAAAAAAGGAGGAAAGTCTGTCC 3022 Query 2767 TTGTCAAGCGAGAAGAACGTGAAACTGGAGTTGTGAGTTGGAAAGTCCTGGAGAGGTACC 2826 | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct 3023 TCATCAAGCAAGAAGAACGTGAAACTGGAGTTGTGAGTTGGAGAGTCCTGAAGAGGTACC 3082 Query 2827 AGAATGCACTTGGAGGTGCATGGGTAGTGATGATGCTCGTTATATGCTACGTCTTGACTC 2886 || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || Sbjct 3083 AGGATGCACTTGGAGGGGCATGGGTAGTGATGATGCTCCTTTTATGCTACGTCTTAACAG 3142 Query 2887 AAGTATTTCGGGTTTCAAGCAGCACT-TGGTTGAGTGAGTGGACTGATTCAGGAACCCCA 2945 |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 3143 AAGTATTTCGGGTTACTAGCAGCA-TGTGGTTGAGTGAGTGGACTGATGCAGGAACTCCA 3201 Query 2946 AAGACTCATGGACCCCTATTCTATAATATTGTCTATGCGCTTCTTTCGTTTGGACAGGTC 3005 |||| |||||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 3202 AAGAGTCATGGACCCCTTTTCTACAATCTCATATATGCACTTCTCTCGTTTGGACAGGTT 3261 Query 3006 TCTG-TGACATTGATCAATTCATATTGGTTGATTATGTCCAGTCTATATGCAGCTAAAAA 3064 | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 3262 T-TGGTGACATTGACCAATTCATATTGGTTGATTATGTCCAGTCTTTATGCAGCTAAGAA 3320 Query 3065 GATGCATGATGCTATGCTTGGTTCCATACTAAGGGCTCCAATGGTG-TTCTTTCAAACCA 3123 | | || || ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| || |||| Sbjct 3321 GTTACACGACAATATGCTTCACTCCATACTAAGGGCCCCGATG-TCCTTCTTCCATACCA 3379 Query 3124 ATCCATTAGGACGGATAATCAATCGATTTGCAAAAGATATGGGAGATATTGATCGAACTG 3183 |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 3380 ATCCGCTAGGACGGATAATCAATCGATTCGCAAAAGATCTGGGTGATATTGATCGAACTG 3439 Query 3184 TGGCAGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTTCAA-TCGCACAGCTTCTTTCAACTGTTATC 3242 |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| || Sbjct 3440 TGGCTGTCTTTGTGAACATGTTTATGGGT-CAAGTCTCACAGCTCCTTTCAACTGTTGTC 3498 Query 3243 TTGATTGGCATTGTCAGCACTCTGTCCCTGTGGGCCATCATGCCCCTGTTGGTCGTGTTC 3302 |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 3499 TTGATTGGCATTGTAAGCACTTTGTCCTTGTGGGCCATCATGCCCCTCCTGGTCTTGTTT 3558 Query 3303 TATGGAGCTTATCTGTATTACCAGAACACATCTCGGGAAATTAAACGTATGGATTCCACT 3362 |||||||| ||||| ||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||| | | Sbjct 3559 TATGGAGCGTATCTTTATTACCAGAACACAGCACGTGAGGTTAAGCGTATGGATTCAATT 3618 Query 3363 ACAAGATCGCCAGTTTATGCTCAATTTGGTGAGGCATTGAATGGACT-ATCTAGTATCCG 3421 |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| Sbjct 3619 TCAAGATCGCCTGTTTATGCACAGTTTGGAGAGGCATTGAATGG-CTTATCAACTATCCG 3677 Query 3422 TGCTTATAAAGCATATGA-CAGGATGGCTGAAATTAATGGAAGGTCAATGGACAATAACA 3480 |||||| ||||||||||| | |||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||| Sbjct 3678 TGCTTACAAAGCATATGATC-GGATGGCTGATATCAACGGAAGATCAATGGATAATAACA 3736 Query 3481 TCAGATTCACACTTGTAAACATGGCTGCAAATCGGTGGCTGGGAATCCGTTTGGAAGTTT 3540 |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | Sbjct 3737 TCAGATTCACTCTTGTCAACATGGGTGCCAATCGGTGGCTCGGAATTCGTTTAGAAACTC 3796 Query 3541 TGGGAGGTCTCATGGTTTGGTTGACTGCGTCATTAGCCGTCATGCAGAACGGAA-AGGCA 3599 |||| ||||| ||| ||||| |||| || || || || ||||||||||| |||| || | Sbjct 3797 TGGGTGGTCTTATGATTTGGCTGACAGCATCCTTTGCTGTCATGCAGAATGGAAGAG-CG 3855 Query 3600 GCGAACCAACAAGCATATGCATCTACGATGGGTTTGCTTCTCAGTTATGCGTTAAGCATT 3659 | ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| Sbjct 3856 GAGAACCAACAGGCATTTGCATCTACAATGGGGTTGCTTCTTAGTTATGCCTTAAATATT 3915 Query 3660 ACCAGCTCT-TTAACAGCTGTACTGAGACTCGCGAGTCTAGCTGAGAATAGTTTAAACTC 3718 ||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| | Sbjct 3916 ACCAGCT-TGTTAACAGGTGTTCTGAGACTTGCGAGTTTGGCTGAGAATAGTCTAAACGC 3974 Query 3719 GGTTGAGCGTGTTGGAAATTATATCGAGATACCATCAGAGGCTCCA-TTGGTCATTGAAA 3777 ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| || | Sbjct 3975 GGTTGAGCGTGTTGGCAATTATATAGAGATACCGCCAGAGGCTCCGCTTG-TCATCGAGA 4033 Query 3778 ACAACCGTCCACCTCCCGGATGGCCATCATCTGGATCCATAAAATTTGAGGATGTTGTTC 3837 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4034 ACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCATAAAATTTGAGGATGTTGTTC 4093 Query 3838 TTCGTTACCGCCCTGAGTTACCTCCTGTTCTTCATGGAGTTTCGTTCTTGATTTC-TCCA 3896 | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||| Sbjct 4094 TCCGTTACCGCCCTCAGTTACCCCCTGTGCTTCATGGGGTTTCTTTCTTCATT-CATCCA 4152 Query 3897 ATGGATAAGGTGGGAATTGTTGGGAGGACAGGCGCTGGGAAATCAAGCCTCTTAAATGCC 3956 | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| Sbjct 4153 ACAGATAAGGTGGGGATTGTTGGAAGGACTGGTGCTGGGAAGTCAAGCCTGTTGAATGCA 4212 Query 3957 TTATTCAGGATTGTGGAGCTGGAAAAAGGAAGGATTTTAATTGATGAATGCGACATTGGA 4016 ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| Sbjct 4213 TTATTTAGAATTGTGGAGGTGGAAAAAGGAAGGATCTTAATCGATGAGTGTGACGTTGGA 4272 Query 4017 A-GATTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATTATACCGCAAG-CGCCAGTTC 4074 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | | ||||||| Sbjct 4273 AAG-TTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATCATTCCACA-GTCACCAGTTC 4330 Query 4075 TTTTCTCAGGTACCGTGAGATTCAATCTTGACCCATTTAGTGAACACAACGACGCCGATC 4134 |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || || |||| Sbjct 4331 TTTTCTCAGGAACTGTGAGGTTCAATCTTGATCCATTTGGTGAACACAATGATGCTGATC 4390 Query 4135 TCTGGGAATCTCTTGAGAGGGCACACTTGAAAGATACTATCCGCAGAAATCCTCTTGGTC 4194 | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4391 TTTGGGAATCTCTAGAGAGGGCACACTTGAAGGATACCATCCGCAGAAATCCTCTTGGTC 4450 Query 4195 TTGATGCTGAGGTAACTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTTGGACAGAGACAGTTGTTGA 4254 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| Sbjct 4451 TTGATGCTGAGGTCTCAGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTGGGGCAGAGGCAATTGTTGA 4510 Query 4255 GTCTTGCACGTGCATTGTTACGAAGATCTAAGATACTTGTTCTTGATGAAGCAACTGCTG 4314 ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 4511 GTCTTTCACGTGCGTTGTTACGGAGATCTAAGATACTCGTCCTTGATGAAGCAACTGCTG 4570 Query 4315 CAGTTGACGTAAGAACTGATGTTCTCATCCAAAAGACCATCCGAGAAGAATTCAAGTCAT 4374 | ||||| || ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4571 CTGTTGATGTTAGAACCGATGCCCTCATTCAGAAGACTATCCGAGAAGAATTCAAGTCAT 4630 Query 4375 GCACAATGCTAATCATCGCTCATCGTCTCAATACTATCATCGACTGTGACAAAGTTCTTG 4434 |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | Sbjct 4631 GCACGATGCTTATCATCGCTCACCGTCTCAATACCATCATTGACTGTGACAAAATTCTCG 4690 Query 4435 TCCTTGATTCTGGAAAAGTTCAGGAATTCAGTTCACCGGAGAATCTTCTTTCAAATGGAG 4494 | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || Sbjct 4691 TGCTTGATTCTGGAAGAGTTCAAGAATTCAGTTCACCGGAGAACCTTCTTTCAAACGAAG 4750 Query 4495 AAAGTTCTTTCTCGAAGATGGTTCAAAGTACAGGAACTGCAAACGCGGAGTACTTACGTA 4554 ||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| |||| Sbjct 4751 GAAGCTCTTTCTCCAAGATGGTTCAAAGCACTGGAGCTGCAAATGCTGAGTACTTGCGTA 4810 Query 4555 GTATAACACTAGAGAACAAACGTACCAGAGAAGCTAACGGTGATGATTCACAACCTTTAG 4614 || || ||| || ||||| ||| ||||||| | | | | | | ||| | || | Sbjct 4811 GTTTAGTACTCGACAACAAGCGTGCCAGAGATG--A-C--TCAC-A---ACA-C-TT-AC 4858 Query 4615 AAGGTCAAAGGAAATGGCAAGCTTCTTCTCGTTGGGCTGCAGCTGCTCAATTTGCAT-TG 4673 |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || Sbjct 4859 AAGGCCAGAGGAAATGGCTGGCTTCTTCTCGCTGGGCTGCAGCCGCTCAGTTTGC-TCTG 4917 Query 4674 GCTGTGAGCCTCACTTCATCTCACAACGACCTCCAAAGCCTTGAAATCGAAGATGATAAC 4733 |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 4918 GCTGTGAGTCTTACTTCGTCGCACAACGATCTTCAAAGCCTTGAAATTGAAGATGATAGC 4977 Query 4734 AGTATTTTGAAGAAAACAAAGGACGCCGTCGTCACTCTACGCAGTGTCCTTGAAGGGAAA 4793 || |||||||||| |||||| || || || || ||||| |||||||| || || |||||| Sbjct 4978 AGCATTTTGAAGAGAACAAACGATGCGGTTGTGACTCTGCGCAGTGTTCTCGAGGGGAAA 5037 Query 4794 CATGATAAAGAGATTGAAGACTCTCTA-AACCAAAGTGACATCTCTAGAGAGCGTTGGTG 4852 || || |||||||||| ||| || || || || || | ||||||| |||| | |||| Sbjct 5038 CACGACAAAGAGATTGCAGAGTCGCTTGAAG-AACGTAATATCTCTAAAGAGGGCTGGTT 5096 Query 4853 GCCATCTCTTTACAAAATGGTCGAAGGGCTTGCCGTGATGAGCAGATTGGCGAGGAA-CA 4911 | |||| || || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | Sbjct 5097 GTCATCACTCTATAGAATGGTAGAAGGGCTTGCGGTGATGAGCAGATTAGCAAGGAATC- 5155 Query 4912 GAATGCAACACCCGGATTACAATTTAGAAGGGAAAT-CGTTTGACTGGGACAATGTCGAG 4970 |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 5156 GAATGCAACAACCGGATTACAATTTCGAAGG-AAATACATTTGACTGGGACAATGTCGAG 5214 Query 4971 ATGTAAA 4977 ||||||| Sbjct 5215 ATGTAAA 5221 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 195653982793 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5