BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G30410.1
Length=4827
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg313679 jgi|Araly1|313679|fgenesh1_pm.C_scaffold_1002459 6985 0.0
Ahg922097 jgi|Araly1|922097|scaffold_103378.1 5867 0.0
> Ahg313679 jgi|Araly1|313679|fgenesh1_pm.C_scaffold_1002459
Length=4488
Score = 6985 bits (3782), Expect = 0.0
Identities = 4116/4279 (96%), Gaps = 16/4279 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 371 TGTGCTTCTGGGGTTATTGGCTTGTTACTGTGTTGTTGAGCCTGTACTGAGATTGGTCAT 430
|||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 223 TGTG-TGCTAGGGATATTGGCTTGTTACTGTGTTGTTGAGCCTGTTCTGAGATTGGTCAT 281
Query 431 GGGGATTTCACTCTTTGACATGGATGAAGAA-ACTGATTTTCCTCCTTTTGAGGTTGCAT 489
||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||
Sbjct 282 GGGGATTTCACTCTTTGACTTGGATGAA-AACACTGAACTTCCTCCCTTTGAGGTTTCAT 340
Query 490 CTTTGATGGTTGAGGCATTCGCTTGGTTCTCCATGCTTGTTTTGATCGGACTCGAAACCA 549
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 341 CTTTAATGGTTGAGGCATTCGCTTGGTTCTCCATGCTTGTTTTGATCGGACTCGAAGCCA 400
Query 550 AACAATATGTCAAAGAGTTCCGGTGGTACGTGAGATTTGGTGTTTTATATGTTTTGGTTG 609
|||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 AACAATATGTCAAAGAGTTCAGATGGTATGTGAGATTTGGTGTTTTATATGTTTTGGTTG 460
Query 610 CTGATGCTGTGCTGCTGGATCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCC 669
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 CTGATGCTGTGCTGCTGGATCTTGTGTTGCCTTTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCC 520
Query 670 TATATCTCTTTATCAGTTCAAGATGTTCCCAGGCTCTTTTCGGAATTCTTCTTCTTATTT 729
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 521 TATATCTCTTTATCAGTTCAAGATGTTCCCAGGCTCTTTTTGGAATTCTTCTTCTTATTT 580
Query 730 ACATACCGGAACTGGATCCTTATCCAGGTTACCATATTGTAAACAATGAACCGTTAGACA 789
|||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 581 ACATTCCGGAACTGGACCCTTATCCGGGTTACCATATTGTAAACGATGAACCGTCAGACA 640
Query 790 ATGTTGAATATGATGCACTTCGAGGGGGAGAGCACATATGTCCCGAGCGACATGCCAGCA 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 ATGTTGAATATGATGCACTTCGAGGGGGAGAGCACATATGTCCCGAGCGACATGCCAGCA 700
Query 850 TATTTTCCAGAATATACTTTGGTTGGATCACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAAC 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 TATTTTCCAGAATATACTTTGGTTGGATCACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAAC 760
Query 910 CCATAACAGAGAAGGATGTTTGGCAATTAGACAAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATCA 969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 761 CCATAACAGAGAAGGATGTTTGGCAATTAGACAAATGGGACCAGACAGAAACTCTAATCA 820
Query 970 AAAGATTCCAAAGGTGCTGGACTGAAGAATCACGGAGACCTAAGCCATGGCTTCTCCGAG 1029
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 821 AAAGATTCCAAAGATGTTGGACTGAAGAATCACGGAGACCTAAGCCGTGGCTTCTCCGAG 880
Query 1030 CACTAAATAATAGCCTTGGTGGAAGATTCTGGTTGGCTGGTATTTTCAAGGTAACTCGTA 1089
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |
Sbjct 881 CACTAAATAATAGCCTTGGTCGAAGATTCTGGTTGGGTGGTATTTTC-----AA---G-A 931
Query 1090 TTGGAAATGATCTTTCTCAATTTGTTGGACCGGTTATACTGAGCCATTTATTACGGTCAA 1149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 932 TTGGAAATGATCTTTCTCAATTTGTTGGACCGGTTATACTGAGCCATCTATTGCGGTCAA 991
Query 1150 TGCAAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTGGCTATGTCTATGCTTTCATTATATTCGTTGGTG 1209
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 992 TGCAAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTGGCTATGTCTATGCTTTCATTATATTCGTTGGGG 1051
Query 1210 TGACACTTGGAGTGCTTTGTGAAGCCCAGTATTTTCAGAATGTTTGGCGGGTGGGATTTC 1269
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 TGACACTTGGAGTGCTTTGCGAAGCCCAGTACTTTCAGAATGTTTGGCGGGTGGGATTTC 1111
Query 1270 GGTTGAGATCAACTTTGGTTGCAGCTATATTCCACAAATCTTTAAGACTAACTCATGAAG 1329
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1112 GGTTGAGATCAACTTTGGTTTCAGCTATATTCCACAAATCGCTAAGACTAACTCATGAAG 1171
Query 1330 CTCGCAAGAATTTTGCATCT-GGAAAGGTCACAAACATGATAACTACAGATGCTAATGCA 1388
|||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 CTCGCAAGAATTTTGCATCTGGGAAA-GTAACAAACATGATAACTACAGATGCTAATGCA 1230
Query 1389 CTTCAGCAAATATCACAACAGCTCCATGGCTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTG 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 CTTCAGCAAATATCACAACAGCTCCATGGCTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTG 1290
Query 1449 TCTATGATTCTGCTCTATCAGCAACTAGGAGTTGCTTCGCTTTTTGGTTCATTGATTCTG 1508
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1291 TCTATGATTCTTCTCTATCAACAACTAGGAGTTGCTTCGCTTTTCGGTTCATTGATTCTG 1350
Query 1509 TTTCTCCTAATTCCTCTCCAGACTCTGATTATAAGCAAAATGCGGAAACTGACTAAAGAA 1568
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 TTTCTACTAATTCCTCTCCAGACTCTGATTATAAGCAAAATGCGGAAACTGACTAAAGAA 1410
Query 1569 GGACTCCAGTGGACTGACAAAAGAGTCGGTATTACGAATGAGATTTTGTCATCCATGGAT 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1411 GGACTCCAGTGGACTGACAAAAGAGTCGGTATCACGAATGAGATATTGTCATCCATGGAT 1470
Query 1629 ACTGTGAAATGCTATGCATGGGAGAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAAC 1688
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 ACTGTAAAATGCTATGCACGGGAGAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAAT 1530
Query 1689 GAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAAAGCACAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTG 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 GAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAAAGCACAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTG 1590
Query 1749 AATAGCATCCCGGTAGTTGTGACTGTGGTTTCATTTGGGGTTTTCGTTCTGCTTGGAGGA 1808
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1591 AATAGCATCCCGGTAGTTGTGACTGTGGTTTCTTTTGGCGTTTTCGTTCTGCTCGGAGGA 1650
Query 1809 GATTTGACACCAGCAAGAGCATTCACATCTCTTTCTCTCTTCGCAGTTCTAAGATTTCCT 1868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1651 GATTTGACACCAGCAAGAGCATTCACATCTCTTTCTCTCTTCGCAGTACTTAGATTTCCT 1710
Query 1869 CTTAACATGCTACCAAATCTACTAAGCCAGGTTGTCAACGCAAATGTTTCACTACAACGC 1928
|| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 CTCAATATGCTACCAAATCTTCTAAGTCAGGTTGTCAATGCAAATGTTTCACTACAACGC 1770
Query 1929 ATTGAGGAACTACTTCTAAGTGAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTTCAACCA 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771 ATTGAGGAACTACTTCTAAGTGAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTTCAACCA 1830
Query 1989 GGAACTCCAGCCATTTCAATTAAGAATGGATACTTTTCATGGGATTCAAAGACTACCAAG 2048
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1831 GGAACTCCAGCCATATCAATTAAGAATGGATATTTTTCATGGGATTCAAAGACAACCAAG 1890
Query 2049 CCCACATTATCCGATATCAATTTGGAGATACCCGTGGGCACCTTGGTTGCCATTGTAGGT 2108
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 1891 CCCACATTATCCGATATCAATTTGGAGATACCGGTGGGCAGCTTAGTTGCCATTGTAGGT 1950
Query 2109 GGAACTGGAGAAGGTAAGACGTCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCT 2168
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 GGAACTGGAGAAGGTAAGACTTCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCT 2010
Query 2169 GAAACCACAAGCGTTGTTATTAGAGGCTCTGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTTCGTGGATC 2228
|||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 GAAACCTCGACCGTTGTTATTAGAGGCTCTGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTTCGTGGATC 2070
Query 2229 TTCAATGCCACTGTGCGTGAAAACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATAT 2288
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 TTTAATGCCACTGTGCGTGAAAACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATAT 2130
Query 2289 TGGAGGGCTATTGATGCGACTGCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAGGCCGTGAT 2348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2131 TGGAGGGCTATTGATGCGACTGCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAGGTCGTGAT 2190
Query 2349 CTTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGTGAATATTAGCGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTCTCA 2408
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2191 CTTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGTGAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTTTCA 2250
Query 2409 ATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTCAGATGTTTACATATTCGATGATCCTTTGAGTGCA 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2251 ATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTCAGATGTTTACATATTCGATGATCCTTTGAGTTCA 2310
Query 2469 TTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAGGATGAGCTAAGGGGG 2528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311 TTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAGGATGAGCTAAGGGGG 2370
Query 2529 AAAACAAGGGTTCTTGTAACAAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAAAATAATT 2588
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2371 AAAACAAGAGTTCTTGTCACAAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATAATT 2430
Query 2589 TTAGTCTCCGAAGGAATGATTAAAGAGGAGGGAACCTTTGTAGAGCTGTCAAAAAGTGGG 2648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2431 TTAGTCTCCGAAGGAATGATTAAAGAGGAGGGAACCTTTACAGAGCTGTCAAAAAGTGGG 2490
Query 2649 ATTTTGTTCAAGAAACTAATGGAGAATGCTGGAAAAATGGATGCAACCCAAGAGGTCAAT 2708
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2491 AGTTTGTTCAAGAAACTAATGGAGAATGCTGGAAAAATGGACGCAACCCAAGAGGTCAAT 2550
Query 2709 ACAAATGATGAGAACATTTTGAAGCTGGGTCCTACTGTCACGGTTGATGTGAGTGAAAGA 2768
|||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2551 ACAAATGACGAGGACATTTTGAAACTGGGTCCTACTGTCACGATTGATGTGAGTGAAAGA 2610
Query 2769 AATCTTGGCAGTACCAAGCAAGGGAAACGGAGAAGATCAGTGCTCATAAAGCAAGAAGAA 2828
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2611 AATCTTGGCAGTACCAAGCAAGGGAAACGGAGAAGATCTGTGCTTGTAAAGCAAGAAGAA 2670
Query 2829 CGGGAAACTGGCATCATTAGTTGGAATGTTCTGATGAGGTATAAAGAAGCAGTAGGCGGC 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 CGGGAAACTGGCATCATTAGTTGGAATGTTCTGATGAGGTATAAAGAAGCAGTAGGCGGC 2730
Query 2889 TTATGGGTAGTTATGATTCTACTGGCATGCTATTTAGCAACTGAAGTTCTCCGAGTTTCA 2948
||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2731 TTATGGGTAGTTATGATTCTATTAGCATGCTATTTAACAACTGAAGTTCTACGAGTTTCA 2790
Query 2949 AGTAGCACATGGTTAAGTATTTGGACTGATCAAAGTACGTCAAAGAATTATAGTCCCGGT 3008
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2791 AGTAGCACATGGTTAAGTATTTGGACTGATCAAAGCACGTCAAAGAGTTATAGCCCCGGT 2850
Query 3009 TTCTACATTGTTGTATATGCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTCACCAAC 3068
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2851 TTTTACATTGTTGTATATGCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTCACCAAC 2910
Query 3069 TCTTTTTGGCTGATCACATCAAGTTTGCATGCCGCCAGAAGACTCCATGATGCGATGCTG 3128
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||
Sbjct 2911 TCCTTTTGGCTGATCACATCAAGTTTACATGCCGCCAAAAGACTCCATGACGGGATGCTG 2970
Query 3129 AGTTCTATTCTTCGAGCTCCTATGCTCTTCTTCCACACAAACCCAACTGGACGTGTAATA 3188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2971 AGTTCTATTCTTCGAGCTCCTATGCTCTTCTTCCACACAAACCCAACTGGACGTGTAATA 3030
Query 3189 AACAGATTTTCTAAGGATATTGGTGATATAGATAGAAACGTTGCCAACCTAATGAATATG 3248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3031 AACAGATTTTCTAAGGATATTGGTGATATAGATAGAAACGTTGCCAACCTAATGAATATG 3090
Query 3249 TTCATGAACCAGCTATGGCAACTCCTCTCAACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACA 3308
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3091 TTCATGAACCAGCTATGGCAACTCCTCTCGACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACA 3150
Query 3309 ATTTCGTTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAGCATATCTCTACTAT 3368
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3151 ATTTCATTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATTCAGCATATCTCTACTAT 3210
Query 3369 CAGAGCACATCTCGTGAAGTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCGCCTATTTATGCT 3428
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3211 CAGAGCACATCCCGTGAAGTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCACCTATTTATGCT 3270
Query 3429 CAGTTTGGAGAAGCTTTAAATGGTTTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGG 3488
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3271 CAGTTTGGAGAAGCTTTGAATGGTTTGTCAAGTATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGG 3330
Query 3489 ATGGCCAAGATTAATGGAAAATCCATGGACAATAACATAAGGTTCACTCTTGCAAATACT 3548
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 ATGGCCAAGATTAATGGAAAATCCATGGACAACAACATAAGGTTCACTCTTGCAAATACT 3390
Query 3549 AGTTCCAATCGTTGGCTCACTATAAGATTGGAGACTCTTGGGGGTGTCATGATTTGGTTA 3608
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3391 AGCTCAAATCGTTGGCTCACTATAAGATTGGAGACTCTTGGGGGTGTGATGATTTGGTTA 3450
Query 3609 ACTGCAACGTTTGCGGTTCTGCAAAATGGTAATACAAATAACCAAGCTGGTTTTGCATCT 3668
|||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||
Sbjct 3451 ACTGCAACTTTTGCGGTTCTGCAAAATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGCTTTTGCATCA 3510
Query 3669 ACGATGGGTCTCCTTCTTAGTTACACTCTGAATATCACTAGTCTGTTAAGTGGTGTTCTA 3728
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3511 ACGATGGGTCTCCTTCTTAGTTACACTCTGAATATCACTAGTCTATTAAGTGGTGTTCTA 3570
Query 3729 AGGCAAGCTAGCAGAGCGGAGAACAGCTTGAATTCTGTTGAGCGTGTTGGTAACTATATT 3788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3571 AGGCAAGCTAGCAGAGCGGAGAACAGCTTGAATTCTGTTGAGCGTGTTGGTAACTACATT 3630
Query 3789 GATCTTCCTTCTGAGGCTACAGATATAATTGAGAACAATCGTCCTGTATG-TGGCTGGCC 3847
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||
Sbjct 3631 GATCTTCCTTCTGAGGCTACAGATATAATTGAGAACAATCGTCCAGTA-GCTGGCTGGCC 3689
Query 3848 TTCAGGAGGATCAATTAAGTTTGAAGACGTCCACCTGCGTTATCGACCCGGGCTTCCTCC 3907
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3690 TTCAAGAGGATCAATTAAGTTCGAAGACGTCCACCTGCGTTATCGACCCGGGCTTCCTCC 3749
Query 3908 AGTGTTGCATGGACTGACCTTTTTTGTTTCTCCCAGTGAGAAAGTAGGAGTTGTGGGAAG 3967
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3750 AGTATTGCATGGGCTGACCTTTTTTGTTTCTCCCAGTGAGAAAGTAGGAGTTGTGGGAAG 3809
Query 3968 AACTGGGGCAGGAAAATCTTCAATGCTGAATGCATTATTTCGGATCGTGGAAGTGGAAAA 4027
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3810 AACTGGGGCAGGAAAATCTTCCATGCTGAATGCATTATTTCGGATCGTGGAAGTGGAAAA 3869
Query 4028 GGGAAGAATTATGATTGATGATTGTGATGTGGCTAAGTTCGGACTGACAGATGTACGCAG 4087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3870 GGGAAGAATTATGATTGATGATTGTGATGTGGCTAAGTTCGGACTAACAGATTTACGCAG 3929
Query 4088 GGTTCTAAGTATCATACCACAATCTCCAGTTCTTTTCTCAGGGACGGTGAGATTCAACAT 4147
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3930 GGTTCTAAGTATCATACCACAATCTCCTGTTCTTTTCTCAGGGACGGTGAGATTCAATAT 3989
Query 4148 TGATCCATTTAGTGAGCACAATGATGCTGGCCTCTGGGAGGCTCTTCACAGAGCGCATAT 4207
|||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||
Sbjct 3990 CGATCCATTTAGTGAACATAATGATGCTGACCTCTGGGAAGCTCTACAAAGGGCGCATAT 4049
Query 4208 AAAAGATGTCATCAGCAGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTGTGAGGGAGGTGA 4267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4050 AAAAGATGTCATCAGCAGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTCTGAGGGAGGTGA 4109
Query 4268 GAATTTCAGCGTGGGGCAAAGGCAACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATTGCTAAGAAGATC 4327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4110 GAATTTCAGCGTGGGGCAAAGGCAACTGCTGAGTCTTGCGCGTGCGTTGCTAAGAAGATC 4169
Query 4328 TAAGATCCTTGTTCTCGATGAAGCAACGGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGAT 4387
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4170 TAAGATCCTTGTTCTCGATGAAGCAACAGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGAT 4229
Query 4388 ACAGAGGACCATTCGCGAGGAATTCAAGTCTTGCACAATGCTTGTTATTGCTCACAGGTT 4447
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4230 ACAGAGGACCATTCGGGAGGAATTCAAGTCTTGCACAATGCTTGTTATTGCTCACAGGTT 4289
Query 4448 GAATACCATCATCGACTGTGACAAGATTCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTA 4507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4290 GAATACCATCATCGACTGTGACAAGATTCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTA 4349
Query 4508 TGATAGTCCACAAGAATTGCTATCAAGAGATACAAGCGCCTTCTTTAGGATGGTTCATAG 4567
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4350 TGATAGTCCTCAAGAATTGCTATCAAGAGACACAAGCGCCTTCTTTAGTATGGTTCATAG 4409
Query 4568 CACCGGACCAGCAAATGCTCAGTACCTTTCCAATTTGGTCTTTGAAAGGAGAGAGAATGG 4627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4410 CACCGGACCAGCAAATGCTCAGTACCTTTCCAATTTGGTCTTTGAAAGGCGAGAGAATGG 4469
Query 4628 AATGAGTGTGGGTGGATAA 4646
|||||| |||||||||||
Sbjct 4470 TATGAGTTTGGGTGGATAA 4488
Score = 215 bits (116), Expect = 3e-54
Identities = 134/143 (94%), Gaps = 0/143 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 240 ATGGGTTTTGAAGCCTTGAATTGGTACTGCAAGCCAGTTGCAGACGGATTTTGGGAAAAG 299
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTTTTGAAGCTTTGAATTGGTATTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 60
Query 300 GCAGTGGATGGTGCGTTTGGAGCCTACACGCCTTGTGCCATTGACTCACTAGTGATGCTT 359
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 TCAGTGGATGGTGCGTTTGGAGCCTATACGCCGTGTGCCATTGACTCACTTGTGATGCTT 120
Query 360 GTTTCTCACTTTGTGCTTCTGGG 382
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTTCTCACTTTGTGCTTCTGGG 143
> Ahg922097 jgi|Araly1|922097|scaffold_103378.1
Length=4513
Score = 5867 bits (3177), Expect = 0.0
Identities = 3941/4309 (91%), Gaps = 55/4309 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 371 TGTGCTTCTGGGGTTATTGGCTTGTTACTGTGTTGTTGAGCCTGTACTGAGATTGGTCAT 430
|||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 243 TGTG-TGCTGTGGATATTGGCTTCTTACTGTGTTGTTGAGCCTTTACTGAGATTGTTCAT 301
Query 431 GGGGATTTCACTCTTTGA-CATGGATGAAGAAACTGATTTTCCTCCTTTTGAGGTTGCAT 489
||||||||| || ||||| || || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 302 GGGGATTTCGCTTTTTGACCA-GGGTGAAGAGACTGATCTTCCTCCCTTTGAGGTTGCAT 360
Query 490 CTTTGATGGTTGAGGCATTCGCTTGGTTCTCCATGCTTGTTTTGATCGGACTCGAAACCA 549
| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 361 CCTTAACGGTTGAGGCATTCGCTTGGCTCTCCATGCTTGTTTTGATTGGACTCGAAACCA 420
Query 550 AACAATATGTCAAAGAGTTCCGGTGGTACGTGAGATTTGGTGTTTTATATGTTTTGGTTG 609
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 421 AACAATATGTCAAAGAGTTCCGATGGTACGTGAGATTTGGTGTTGTGTATGTTTTGGTTG 480
Query 610 CTGATGCTGTGCTGCTGGATCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCC 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTGATGCTGTGCTGCTGGATCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCC 540
Query 670 TATATCTCTTTATCAGTTCAAGATGTTCCCAGGCTCTTTTCGGAATTCTTCTTCTTATTT 729
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||
Sbjct 541 TATATCTCTGTATCAGTTCAAGATGTTGCCAGGCTCTTTTTGGAATCCTTCTTCTTGTTT 600
Query 730 ACATACCGGAACTGGATCCTTATCCAGGTTACCATATTGTAAACAATGAACCGTTAGACA 789
|||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 601 ACATTCCTGCACTGGATCCTTATCCAGGTTACCATATTCTAAACAATGAATCGTTAGACA 660
Query 790 ATGTTGAATATGATGCACTTCGAGGGGGAGAGCACATATGTCCCGAGCGACATGCCAGCA 849
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 661 GTGTTGAATATGATGCACTTCGTGGGGGAGAGAACATATGTCCCGAGCGATATGCCAGCA 720
Query 850 TATTTTCCAGAATATACTTTGGTTGGATCACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAAC 909
||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |
Sbjct 721 TATTTTCTGGAATATACTTTAGTTGGATGACGCCGCTTATGCAGCTGGGCTATAGAAAGC 780
Query 910 CCATAACAGAGAAGGATGTTTGGCAATTAGACAAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATCA 969
| || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 781 CTATTACTGAGAAGGATGTTTGGCGATTAGACCAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATAA 840
Query 970 AAAGATTCCAAAGGTGCTGGACTGAAGAATCACGGAGACCTAAGCCATGGCTTCTCCGAG 1029
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 841 AAAGATTCCAAAGTTGCTGGACTGAAGAATCACAGAGGCCTAAGCCATGGCTACTCCGAG 900
Query 1030 CACTAAATAATAGCCTTGGTGGAAGATTCTGGTTGGCTGGTATTTTCAAGGTAACTCGTA 1089
|||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | |
Sbjct 901 CACTAAATAACAGCCTTGGTCGAAGGTTCTGGTTGGGTGGTATTTTCAA-G------G-- 951
Query 1090 TTGGAAATGATCTTTCTCAATTTGTTGGACCGGTTATACTGAGCCATTTATTACGGTCAA 1149
||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||
Sbjct 952 TTGGACATGATCTATCTCAATTTGTTGGACCAGTTATACTGAGCCAAATCCTGCTGTCAA 1011
Query 1150 TGCAAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTGGCTATGTCTATGCTTTCATT-ATATTCGTTGGT 1208
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||
Sbjct 1012 TGCTAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTGGCTATGTCTATGCTTTC-TTAATTTTCTTTGGG 1070
Query 1209 GTGACACTTGGAGTGCTTTGTGAAGCCCAGTATTTTCAGA-ATGTTTGGCGGGTGGGATT 1267
|||||| |||||||||||||| || | ||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||
Sbjct 1071 GTGACATTTGGAGTGCTTTGTCAATCTCAGTACTTTCA-ACATGTTGGGCGAGTGGGATT 1129
Query 1268 TCGGTTGAGATCAACTTTGGTTGCAGCTATATTCCACAAATCTTTAAGACTAACTC-ATG 1326
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 1130 TCGGTTGAGGTCAACTTTGGTTGCAGCTATATTCCACAAATCTTTAAGACTAAC-CAATG 1188
Query 1327 AAGCTCGCAAGAATTTTGCATCT-GGAAAGGTCACAAACATGATAACTACAGATGCTAAT 1385
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1189 AAGCTCGCAAGAATTTTGCATCTGGGAAA-GTCACAAACATGATAACTACTGATGCTAAT 1247
Query 1386 GCACTTCAGCAAATATCACAACAGCTCCATGGCTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATT 1445
|||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 GCACTTCAGCTAATAGCAGAACAGCTCCATGGTTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATT 1307
Query 1446 GTGTCTATGATTCTGCTCTATCAGCAACTAGGAGTTGCTTCGCTTTTTGGTTCATTGATT 1505
||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||
Sbjct 1308 GTGTCTATGGTTCTTCTCTATCAACAACTAGGAGTTGCTTCAATTTTCGGTTCACTGATT 1367
Query 1506 CTGTTTCTCCTAATTCCTCTCCAGACTCTGATTATAAGCAAAATGCGGAAACTGACTAAA 1565
|| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1368 CTATTTCTCCTAATTCCTCTCCAGACTCTGATTGTAAGAAAAATGCGGAAACTTACTAAA 1427
Query 1566 GAAGGACTCCAGTGGACTGACAAAAGAGTCGGTATTACGA-ATGAGATTTTGTCATCCAT 1624
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||
Sbjct 1428 GAAGGACTCCAGTGGACGGACAAAAGAGTCGGTATCA-TATATGAGATTTTGGCATCCAT 1486
Query 1625 GGATACTGTGAAATGCTATGCATGGGAGAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAG 1684
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 GGATATTGTAAAATGCTATGCATGGGAGAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAG 1546
Query 1685 AAACGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAAAGCACAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTAT 1744
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1547 AAACGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAGAGCGCAGTTACTATCAGCTTTCAATAGTTTTAT 1606
Query 1745 ACTGAATAGCATCCCGGTAGTTGTGA-CTGTGGTTTCATTTGGGGTTTTCGTTCTGCTTG 1803
|||||| |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1607 ACTGAACAGCACCCCAGTTGTTGTGACCT-TGGTTTCATTTGGGGTTTTTGTTCTGCTTG 1665
Query 1804 GAGGAGATTTGACACCAGCAAGAGCATTCACATCTCTTTCTCTCTTCGCAGTTCTAAGAT 1863
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1666 GAGGAGATTTGACACCAGCAAGGGCATTCACATCTCTTTCTCTATTTGCAGTTCTAAGAT 1725
Query 1864 TTCCTCTTAACATGCTACCAAATC-TACTAAGCCAGGTTGTCAACGCAAATGTTTCACTA 1922
|||||| | || ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1726 CTCCTCTCAGCACGCTACCAAATCTTA-TAAGTCAGGCTGTCAACGCAAATGTTTCACTG 1784
Query 1923 CAACGCATTGAGGAACTACTTCTAAGTGAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTT 1982
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1785 CAACGCATTGAGGAACTACTTTTAAGTGAAGAGAGAGTTCTAGCACAAAACCTACCTCTC 1844
Query 1983 CAACCAGGAACTCCAGCCATTTCAATTAAGAATGGATACTTTTCATGGGATTCAAAGACT 2042
||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 CAACCAGGAGCTCCAGCCATTTCCATCAAGAATGGATATTTTTCATGGGATTCAAAGAC- 1903
Query 2043 A-CCAAGCCCACATTATCCGA-TATCAATTTGGAGATACCCGTGGGCACCTTGGTTGCCA 2100
| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||
Sbjct 1904 ATCCAAACCCACATTAT-CTAGGATCAATTTGGAGATACCGGTAGGCAGCTTGGTTGCCA 1962
Query 2101 TTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACGTCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTAT 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1963 TTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACGTCACTTGTTTCGGCAATGCTGGGAGAGTTAT 2022
Query 2161 CTCATGCTGAAACCACAAGCGTTGTTATTAGAGGCTCTGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTT 2220
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 CTCATGCTGAAACCTCAAGCGTTGTTATTAGAGGATCCGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTT 2082
Query 2221 CGTGGATCTTCAATGCCACTGTGCGTGAAAACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTG 2280
| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083 CATGGATCTTCAATGCCACTCTGCGTGAAAACATCTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTG 2142
Query 2281 AAAGATATTGGAGGGCTATTGATGCGACTGCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAG 2340
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 AAAGATATTGGAGGGTTATTGATGTGACTGCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAG 2202
Query 2341 GCCGTGATCTTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGTGAATATTAGCGGAGGGCAGAAGCAGA 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2203 GCCGTGATCTTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGTGAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAAA 2262
Query 2401 GAGTCTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTCAGATGTTTACATATTCGATGATCCTT 2460
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 2263 GAGTTTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTCAGATATTTACATATTTGATGATCCTT 2322
Query 2461 TGAGTGCATTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAGGATGAGC 2520
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2323 TCAGTGCTTTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAAGATGAGC 2382
Query 2521 T-AAGGGGGAAAACAAGGGTTCTTGTAACAAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGAT 2579
| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2383 TGAA-GGGGAAAACAAGGGTTCTTGTCACAAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGAT 2441
Query 2580 AAAATAATTTTAGTCTCCGAAGGAATGATTAAAGAGGAGGGAACCTTTGTAGAGCTGTCA 2639
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2442 AGAATCATTTTAGTCTCCGAAGGAATGATTAAAGAGGAGGGAACCTTTGCAGAGCTATCA 2501
Query 2640 AAAAGTGGGATTTTGTTCAAGAAACTAATGGAGAATGCTGGAAAAATGGATGCAACCCAA 2699
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||
Sbjct 2502 AAAAGTGGGAGTTTGTTCCAGAAACTAATGGAGAATGCAGGTAAAATGGATTCAACCCAA 2561
Query 2700 GAGGTCAATACAAATGATGAGAACATTTTGAAGCTGGGTCCTACTGTCACGGTTGATGTG 2759
||||| |||| |||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||| || |
Sbjct 2562 GAGGTGAATAAAAATGAAGAGAAAAGCTTGAAGCCGGATCCTACTGTCAC----GA--T- 2614
Query 2760 AGTGAAAGAAATCTTGGCAGTACCAAGCAAGGGAAACGGAGAAGATCAGTGCTCATAAAG 2819
| | |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||
Sbjct 2615 --T----G--ATCTAGACAGTACCACGCAAGGGAAACGGGGAAGATCCGTGCTTGTAAAG 2666
Query 2820 CAAGAAGAACGGGAAACTGGCATCATTAGTTGGAATGTTCTGATGAGGTATAA-AGAAGC 2878
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||
Sbjct 2667 CAAGAAGAGCGGGAAACTGGCATCATTAGTTGGGATGTTGTGATGAGGTATAATA-AAGC 2725
Query 2879 AGTAGGCGGCTTATGGGTAGTTATGATTCTAC-TGGCATGCTATTTAGCAACTGAAGTTC 2937
||||||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2726 AGTAGGCGGCTTATGGGTAGTCATGATTCT-CTTAGTATGCTATTTAACAACTGAAATTC 2784
Query 2938 TCCGAGTTTCAAGTAGCACATGGTTAAGTATTTGGACTGATCAAAGTACGTCAAAGAATT 2997
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||
Sbjct 2785 TCCGAGTTTTAAGTAGCACATGGCTAAGTATTTGGACTGATCAAAGCACGCCAAAGAGTT 2844
Query 2998 ATAGTCCCGGTTTCTACATTGTTGTATATGCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCA 3057
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2845 ATAGTCCCGGTTTCTACATTGTCCTATATGCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGTTGTCA 2904
Query 3058 CGTTCACCAACTCTTTTTGGCTGATCACATCAAGTTTGCATGCCGCCAGAAGACTCCATG 3117
|||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||| | |||||||||||
Sbjct 2905 CGTTTACCAACTCTTTTTGGTTGATCTCGTTAAGTTTACATGCCGCTAAAAGACTCCATG 2964
Query 3118 ATGCGATGCTGAGTTCTATTCTTCGAGCTCCTATGCTCTTCTTCCACACAAACCCAACTG 3177
| || ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2965 ACGCAATGCTGAATTCTATCCTACGTGCTCCTATGCTCTTCTTCGAAACAAACCCAACTG 3024
Query 3178 GACGTGTAATAAACAGATTTTCTAAGGATATTGGTGATATAGATAGAAACGTTGCCAACC 3237
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3025 GACGTGTAATAAACAGGTTTTCTAAGGATATTGGTGATATAGACAGAAACGTGGCCAACC 3084
Query 3238 TAATGAATATGTTCATGAACCAGCTATGGCAACTCCTCTCAACATTTGCTCTTATAGGTA 3297
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 3085 TAATGAATATGTTCATGAACCAGCTATGGCAACTCCTCTCGACATTTGCACTTATAGGTA 3144
Query 3298 CTGTCAGTACAATTTCGTTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAGCAT 3357
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3145 TTGTCAGTACAATTTCATTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAACAT 3204
Query 3358 ATCTCTACTATCAGAGCACATCTCGTGAAGTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCGC 3417
|| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3205 ATATCTACTATCAGAGCACATCCCGTGAAGTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCAC 3264
Query 3418 CTATTTATGCTCAGTTTGGAGAAGCTTTAAATGGTTTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAG 3477
|||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3265 CTATATATGCTCAATTTGGAGAAGCATTGAATGGTTTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAG 3324
Query 3478 CCTATGACCGGATGGCCAAGATTAATGGAAAATCCATGGACAATAACATAAGGTTCACTC 3537
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3325 CTTATGACCGGATGGCAAAGATTAATGGAAAATCCATGGACAACAACATAAGGTTCACTC 3384
Query 3538 TTGCAAATACTAGTTCCAATCGTTGGCTCACTATAAGAT-TGGAGACTCTTGGGGGTGTC 3596
| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||
Sbjct 3385 TCGCTAATACTAGCTCAAATCGTTGGCTCACTATAAGATCT-GAGAGTCTTGGGGGTGTC 3443
Query 3597 ATGATTTGGTTAACTGCAACGTTTGCGGTTCTGCAAAATGGTAATACAAATAACCAAGCT 3656
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || | |||||||||
Sbjct 3444 ATGATTTGGTTAACTGCAACCTTTGCGGTTCTGCGTTATGGGAATGCAGAGAACCAAGCT 3503
Query 3657 GGTTTTGCATCTACGATGGGTCTCCTTCTTAGTTACACTCTGAATATCACTAGTCTGTTA 3716
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||
Sbjct 3504 GTTTTTGCATCTACAATGGGTCTCCTTCTTAGTTACACTCTGAGTATCACTACTTTGTTA 3563
Query 3717 AGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAGAGCGGAGAACAGCTTGAATTCTGTTGAGCGTGTT 3776
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3564 AGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAAAGCAGAGAACAGCTTAAATTCTGTTGAGCGTGTT 3623
Query 3777 GGTAACTATATTGATCTTCCTTCTGAGGCTACAGATATAATTGAGAACAATCGTCCTGTA 3836
|| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 3624 GGCAACTACGTTGATCTTCCTTCTGAGGCGACATATATAATCGAGAACAATCGTCCAGTA 3683
Query 3837 TGTGGCTGGCCTTCAGGAGGATCAATTAAGTTTGAAGACGTCCACCTGCGTTATCGACCC 3896
| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 3684 TCTGGCTGGCCTTCAAGAGGCTCAATTAAGTTTGAAGACGTTCACCTGCGTTATAGACCC 3743
Query 3897 GGGCTTCCTCCAGTGTTGCATGGACTGACCTTTTTTGTTTCTCCCAGTGAGAAAGTAGGA 3956
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 3744 GGGCTTCCTCCAGTATTGCATGGACTGTCCTTTTTTGTTTATCCGAGTGAGAAAGTAGGA 3803
Query 3957 GTTGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAATCTTCAATGCTGAATGCATTATTTCGGATCGTG 4016
|| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 3804 GTGGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAGTCTTCCATGCTGAATGCATTATACCGGATTGTG 3863
Query 4017 GAAGTGGAAAAGGGAAGAATTATGATTGATGATTGTGATGTGGCTAAGTTCGGACTGACA 4076
||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3864 GAATTGGAAAAGGGAAGAATCATGATTGATGATTATGATGTGGCTAAGTTTGGACTGACA 3923
Query 4077 GATGTACGCAGGGTTCTAAGTATCATACCACAATCTCCAGTTCTTTTCTCAGGGACGGTG 4136
||| | ||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3924 GATTTGCGCAGTGCCCTAAGTATCATACCCCAGTCACCAGTTCTTTTTTCAGGGACGGTG 3983
Query 4137 AGATTCAACATTGATCCATTTAGTGAGCACAATGATGCTGGCCTCTGGGAGGCTCTTCAC 4196
|||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 3984 AGATTCAATATCGATCCATTTAGTGAACACAATGATGCTGACCTCTGGGAGGCTCTACAA 4043
Query 4197 AGAGCGCATATAAAAGATGTCATCAG-CAGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTG 4255
|| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4044 AGGGTGCATATAAAAGATGTCATC-GACAGGAGTCCTTTTGGCCTAGATGCGGAGGTCTC 4102
Query 4256 TGAGGGAGGTGAGAATTTCAGCGTGGGGCAAAGGCAACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATT 4315
||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4103 TGAAGGAGGTGAGAACTTCAGTGTGGGGCAAAGGCAACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATT 4162
Query 4316 GCTAAGAAGATCTAAGATCCTTGTTCTCGATGAAGCAACGGCATCTGTTGATGTCAGAAC 4375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4163 GCTAAGAAGATCTAAGATCCTTGTTCTCGATGAAGCAACTGCATCTGTTGATGTCAGAAC 4222
Query 4376 AGATTCTCTGATACAGAGGACCATTCGCGAGGAATTCAAGTCTTGCACAATGCTTGTTAT 4435
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4223 AGATTCTCTGATACAGAGGACCATCCGTGAGGAATTCAAGTCTTGTACAATGCTTGTTAT 4282
Query 4436 TGCTCACAGGTTGAATACCATCATCGACTGTGACAAGATTCTTGTGCTTAGTTCTGGTCA 4495
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4283 CGCTCACAGATTGAATACCATCATCGACTGCGACAAGATCCTTGTGCTTAGTTCTGGTCA 4342
Query 4496 GGTTTTGGAGTATGATAGTCCACAAGAATTGCTATCAAGAGATACAAGCGCCTTCTTTAG 4555
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4343 GGTTTTGGAGTATGATAGTCCACAAGAATTGCTATCAAGAGATACAAGTGCCTTCTTTAG 4402
Query 4556 GATGGTTCATAGCACCGGACCAGCAAATGCTCAGTACCTTTCCAATTTGGTCTTTGAAAG 4615
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 4403 GATGGTTCATAGCACTGGACCAGAAAATGCTCAGTACCTTACCAACTTGGTATTTGAAAG 4462
Query 4616 GAGAGAGAATGGAATGAGTGTGGGTGGATAAAAATGGTCACTAGCCTTC 4664
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||
Sbjct 4463 GAGAGGGAATGGAATGAGTCTGGGTGGATAAAAATAGACACCAGCCTTC 4511
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182676350400
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5