BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G30420.1
Length=4488
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg922097 jgi|Araly1|922097|scaffold_103378.1 7275 0.0
Ahg313679 jgi|Araly1|313679|fgenesh1_pm.C_scaffold_1002459 6325 0.0
> Ahg922097 jgi|Araly1|922097|scaffold_103378.1
Length=4513
Score = 7275 bits (3939), Expect = 0.0
Identities = 4314/4494 (96%), Gaps = 29/4494 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTTTGAGGCATTGAATTGGTACTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 60
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGGGTTTTGAGGCCTTGAATTGGTACTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 80
Query 61 ACACCGGATGGTGCGTTTGGTGCCTACACGCCGTGTGCCATTGACTCACTAGTGATGATT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 81 ACACCGGATGGTGCGTTTGGTGCCTACACGCCTTGTGCGATTGACTCACTGGTGATGATT 140
Query 121 GTTTCTAACTCTGTACTTCTGGGTTTGTGTTTCTACCGGATATGGATCACCTTGTACAAT 180
|||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 141 GTTTCTAACTCTCTGCTTCTGAGTTTGTGTTTCTACCGGATATGGATCACCTTGGACAAT 200
Query 181 GCCAAAGCTCAGATTTATGTTTTGAGGAAGATGTACTATCACTGTGTGCTATGGATATTG 240
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 201 GCCAAAGCTCAGATTTATGTTTTGAGAAAGAAGTATTATAACTGTGTGCTGTGGATATTG 260
Query 241 GCTTGTTGCTGTGTTGTTGAGCCTGTACTGAGATTAGTT-ATGGGGATTTCGCTTTTTGA 299
|||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GCTTCTTACTGTGTTGTTGAGCCTTTACTGAGATT-GTTCATGGGGATTTCGCTTTTTGA 319
Query 300 -CATGGGTGATGAAACTGATCTTCCTCCCTTTGAGGTTGCATCCTTAATGGTTGAGGCAT 358
|| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 320 CCA-GGGTGAAGAGACTGATCTTCCTCCCTTTGAGGTTGCATCCTTAACGGTTGAGGCAT 378
Query 359 TTGCTTGGTTCGCCATGCTTGTTTTGATTGGACTTGAAACCAAACAATATGTCAAAGAGT 418
| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 TCGCTTGGCTCTCCATGCTTGTTTTGATTGGACTCGAAACCAAACAATATGTCAAAGAGT 438
Query 419 TCCGATGGTACGTGAGATTTGGTGTTGTATATGTTTTGGTTGCTGATGCGGTGCTGCTGG 478
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 439 TCCGATGGTACGTGAGATTTGGTGTTGTGTATGTTTTGGTTGCTGATGCTGTGCTGCTGG 498
Query 479 ACCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCCTATATCTCTGTATCAGTT 538
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 ATCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCCTATATCTCTGTATCAGTT 558
Query 539 CAAGATGTTGCCAGGCTCTTTTTGGAATCCTTCTACTTGTTTACATTCCTGAACTGGATC 598
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 559 CAAGATGTTGCCAGGCTCTTTTTGGAATCCTTCTTCTTGTTTACATTCCTGCACTGGATC 618
Query 599 TTTATCCAGATTACCATATTCTAAACAATGAATCGTTAGACAATGTTGAATATGATGCAC 658
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 619 CTTATCCAGGTTACCATATTCTAAACAATGAATCGTTAGACAGTGTTGAATATGATGCAC 678
Query 659 TGCCTGGGGGAGTGAACATATGTCCCGAGCGATATGCCAGCATATTTTCTGGAATATACT 718
| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 TTCGTGGGGGAGAGAACATATGTCCCGAGCGATATGCCAGCATATTTTCTGGAATATACT 738
Query 719 TTAGTTGGATGACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAGCCTATTACTGAGAGGGATG 778
|||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 739 TTAGTTGGATGACGCCGCTTATGCAGCTGGGCTATAGAAAGCCTATTACTGAGAAGGATG 798
Query 779 TTTGGCAATTAGACCAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATAAAAAGATTCCAAAGGTGCT 838
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 799 TTTGGCGATTAGACCAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATAAAAAGATTCCAAAGTTGCT 858
Query 839 GGACTGAAGAATCACGGAGGCCTAAGCCATGGCTACTCCGAGCACTAAATAATAGCCTTG 898
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 859 GGACTGAAGAATCACAGAGGCCTAAGCCATGGCTACTCCGAGCACTAAATAACAGCCTTG 918
Query 899 GTCGAAGGTTCTGGTTGGGTGGTATTTTCAAGGTTGGGCATGATCTATCTCAATTTGTTG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 919 GTCGAAGGTTCTGGTTGGGTGGTATTTTCAAGGTTGGACATGATCTATCTCAATTTGTTG 978
Query 959 GACCAGTTATACTGAGCCATATCCTGCAGTCAATGATAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTG 1018
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 GACCAGTTATACTGAGCCAAATCCTGCTGTCAATGCTAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTG 1038
Query 1019 GCTATGTCTATGCTTTCTTAATTTTCTTTGGGGTGACATTTGGAGTGCTTTGTCAATCTC 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 GCTATGTCTATGCTTTCTTAATTTTCTTTGGGGTGACATTTGGAGTGCTTTGTCAATCTC 1098
Query 1079 AGTACTTTCAACATGTTGGGCGAGTGGGATTTCGGTTGAGGTCAACTTTGGTTGCAGCTA 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 AGTACTTTCAACATGTTGGGCGAGTGGGATTTCGGTTGAGGTCAACTTTGGTTGCAGCTA 1158
Query 1139 TATTCCACAAATCTTTAAGACTAACCAATAAAGCTCGCAAAAATTTTGCATCTGGGAAAG 1198
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1159 TATTCCACAAATCTTTAAGACTAACCAATGAAGCTCGCAAGAATTTTGCATCTGGGAAAG 1218
Query 1199 TCACAAACATGATAACTACTGATGCTAATGCACTTCAGCTAATAGCAGAACAGCTCCATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219 TCACAAACATGATAACTACTGATGCTAATGCACTTCAGCTAATAGCAGAACAGCTCCATG 1278
Query 1259 GTTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTGTCTATGGTTCTTCTCTATCAACAACTAG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 GTTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTGTCTATGGTTCTTCTCTATCAACAACTAG 1338
Query 1319 GAGTTGCTTCAATTTTCGGTTCACTGATTTTATTTCTCCTTATTCCTTTCCAGACTCTGA 1378
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1339 GAGTTGCTTCAATTTTCGGTTCACTGATTCTATTTCTCCTAATTCCTCTCCAGACTCTGA 1398
Query 1379 TTGTAAGAAAAATGCGGAAACTTACTAAAGAAGGACTCCAGTGGACTGACAAAAGAGTCG 1438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1399 TTGTAAGAAAAATGCGGAAACTTACTAAAGAAGGACTCCAGTGGACGGACAAAAGAGTCG 1458
Query 1439 GTATCATATATGAGATTTTGGCATCCATGGATATTGTAAAATGCTATGCATGGGAGAAGA 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459 GTATCATATATGAGATTTTGGCATCCATGGATATTGTAAAATGCTATGCATGGGAGAAGA 1518
Query 1499 GCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAACGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAAAGCGC 1558
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1519 GCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAACGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAGAGCGC 1578
Query 1559 AGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTGAACAGCACCCCAGTTGTTGTGACCTTGG 1618
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1579 AGTTACTATCAGCTTTCAATAGTTTTATACTGAACAGCACCCCAGTTGTTGTGACCTTGG 1638
Query 1619 TTTCATTTGGGGTTTATGTTCTGCTTGGAGGAGATTTGACACCAGCAAGGGCATTCACAT 1678
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639 TTTCATTTGGGGTTTTTGTTCTGCTTGGAGGAGATTTGACACCAGCAAGGGCATTCACAT 1698
Query 1679 CTCTTTCTCTATTTGCAGTTCTAAGATCTCCTCTCAGCACGCTACCAAATCTTATAAGTC 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 CTCTTTCTCTATTTGCAGTTCTAAGATCTCCTCTCAGCACGCTACCAAATCTTATAAGTC 1758
Query 1739 AGGCTGTCAACGCAAATGTTTCACTGCAACGCATTGAGGAACTACTTTTAAGTGAAGAGA 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1759 AGGCTGTCAACGCAAATGTTTCACTGCAACGCATTGAGGAACTACTTTTAAGTGAAGAGA 1818
Query 1799 GAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTCCAACCAGGAGCTCCAGCCATTTCCATTAAGAATG 1858
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1819 GAGTTCTAGCACAAAACCTACCTCTCCAACCAGGAGCTCCAGCCATTTCCATCAAGAATG 1878
Query 1859 GATATTTTTCATGGGATTCAAAGACATCCAAACCCACATTATC--GGATATCAATTTGGA 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1879 GATATTTTTCATGGGATTCAAAGACATCCAAACCCACATTATCTAGGAT--CAATTTGGA 1936
Query 1917 GATACCGGTGGGCAGCTTGGTTGCCATTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACGTCACT 1976
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1937 GATACCGGTAGGCAGCTTGGTTGCCATTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACGTCACT 1996
Query 1977 TATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCTGAAACCTCAAGCGTTGATATCAGAGG 2036
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1997 TGTTTCGGCAATGCTGGGAGAGTTATCTCATGCTGAAACCTCAAGCGTTGTTATTAGAGG 2056
Query 2037 ATCTGTAGCTTATGTACCTCAAGTTTCATGGATCTTTAATGCCACTCTGCGTGAAAACAT 2096
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057 ATCCGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTTCATGGATCTTCAATGCCACTCTGCGTGAAAACAT 2116
Query 2097 TTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATATTGGAGGGCTATTGATGTGACTGCCTT 2156
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2117 CTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATATTGGAGGGTTATTGATGTGACTGCCTT 2176
Query 2157 ACAACACGATCTTGATTTGTTTCCAGGCCGTGATCGTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGT 2216
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2177 ACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAGGCCGTGATCTTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGT 2236
Query 2217 GAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTTTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTC 2276
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 GAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAAAGAGTTTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTC 2296
Query 2277 AGATATTTACATATTTGATGATCCTTTCAGTGCTTTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGT 2336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2297 AGATATTTACATATTTGATGATCCTTTCAGTGCTTTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGT 2356
Query 2337 CTTTGATAGCTGCGTGAA-GCATGAGCTGAAGGGGAAAACCAGGGTTCTTGTAACAAATC 2395
||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2357 CTTTGATAGCTGCATGAAAG-ATGAGCTGAAGGGGAAAACAAGGGTTCTTGTCACAAATC 2415
Query 2396 AGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATAATTTTAGTCTCCGAAGGAATGATCAAAG 2455
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2416 AGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATCATTTTAGTCTCCGAAGGAATGATTAAAG 2475
Query 2456 AGGAGGGAAACTTCGCAGAGCTGTCAAAAAGTGGGACTTTGTTCAAAAAACTAATGGAGA 2515
||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2476 AGGAGGGAACCTTTGCAGAGCTATCAAAAAGTGGGAGTTTGTTCCAGAAACTAATGGAGA 2535
Query 2516 ATGCTGGAAAAATGGATGCAACCCAAGAAGTCAATACAAATGACGAGAACAT-TTCGAAG 2574
|||| || ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||| | || ||||
Sbjct 2536 ATGCAGGTAAAATGGATTCAACCCAAGAGGTGAATAAAAATGAAGAGAAAAGCTT-GAAG 2594
Query 2575 CTGGGTCCTACTGTCACGATTGATGTGAGTGAAAGAAGTCTTGGCAGTATCCAGCAAGGG 2634
| || ||||||||||||||||||| | || | || | | || | |||||||
Sbjct 2595 CCGGATCCTACTGTCACGATTGATCT-AG--ACAGTA--C----CA----C--GCAAGGG 2639
Query 2635 AAATGGGGAAGATCCATGCTTGTAAAGCAAGAAGAGCGGGAAACTGGCATCATTAGCTGG 2694
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2640 AAACGGGGAAGATCCGTGCTTGTAAAGCAAGAAGAGCGGGAAACTGGCATCATTAGTTGG 2699
Query 2695 GATGTTGTGATGAGGTATAATAAAGCAGTAGGCGGCTTATGGGTAGTTATGATTCTCTTA 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2700 GATGTTGTGATGAGGTATAATAAAGCAGTAGGCGGCTTATGGGTAGTCATGATTCTCTTA 2759
Query 2755 GTATGCTATTTAACAACTGAAGTTCTCCGAGTTTTAAGTAGCACATGGTTAAGTATTTGG 2814
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2760 GTATGCTATTTAACAACTGAAATTCTCCGAGTTTTAAGTAGCACATGGCTAAGTATTTGG 2819
Query 2815 ACTGATCAAAGCACGCCAAAGAGTTATAGTCCCGGTTTCTACATTGTCGTATATGCTCTT 2874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2820 ACTGATCAAAGCACGCCAAAGAGTTATAGTCCCGGTTTCTACATTGTCCTATATGCTCTT 2879
Query 2875 CTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTTACCAACTCTTTTTGGTTGATCTCGTCAAGT 2934
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2880 CTCGGATTTGGTCAGGTGGTTGTCACGTTTACCAACTCTTTTTGGTTGATCTCGTTAAGT 2939
Query 2935 TTACATGCCGCTAAAAGACTCCATGACGCAATGCTGAATTCTATCCTACGTGCTCCTATG 2994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 TTACATGCCGCTAAAAGACTCCATGACGCAATGCTGAATTCTATCCTACGTGCTCCTATG 2999
Query 2995 CTCTTCTTCGAAACAAACCCAACCGGACGTGTAATAAACAGGTTTTCTAAGGATATTGGT 3054
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 CTCTTCTTCGAAACAAACCCAACTGGACGTGTAATAAACAGGTTTTCTAAGGATATTGGT 3059
Query 3055 GATATAGATAGAAACGTGGCCAACCTAATGAACATGTTCATGAACCAGCTATGGCAACTC 3114
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 GATATAGACAGAAACGTGGCCAACCTAATGAATATGTTCATGAACCAGCTATGGCAACTC 3119
Query 3115 CTCTCGACATTTGCACTTATAGGTATTGTCAGTACAATTTCATTGTGGGCAATAATGCCA 3174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 CTCTCGACATTTGCACTTATAGGTATTGTCAGTACAATTTCATTGTGGGCAATAATGCCA 3179
Query 3175 CTCCTAATACTGTTTTATGCAACATATATCTACTATCAGAGCACATCCCGTGAAGTTAGA 3234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 CTCCTAATACTGTTTTATGCAACATATATCTACTATCAGAGCACATCCCGTGAAGTTAGA 3239
Query 3235 CGTTTGGATTCCGTTACTAGATCACCTATCTATGCTCTATTTGGAGAAGCTTTGAATGGT 3294
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 3240 CGTTTGGATTCCGTTACAAGATCACCTATATATGCTCAATTTGGAGAAGCATTGAATGGT 3299
Query 3295 TTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGGATGGCAAAGATAAATGGAAAATCC 3354
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3300 TTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAGCTTATGACCGGATGGCAAAGATTAATGGAAAATCC 3359
Query 3355 ATGGACAACAACATAAGGTTTACTCTCGCTAGTACTAGCTCAAATCGTTGGCTCACTATA 3414
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 ATGGACAACAACATAAGGTTCACTCTCGCTAATACTAGCTCAAATCGTTGGCTCACTATA 3419
Query 3415 AGATCTGAGAGTCTTGGGGGTGTCATGATTTGGTTAACTGCAACTTTTGCGGTTCTGCGA 3474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3420 AGATCTGAGAGTCTTGGGGGTGTCATGATTTGGTTAACTGCAACCTTTGCGGTTCTGCGT 3479
Query 3475 TATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGTTTTTGCATCTACGATGGGTCTCCTTCTTAGTTAC 3534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 TATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGTTTTTGCATCTACAATGGGTCTCCTTCTTAGTTAC 3539
Query 3535 ACTCTGAATATCACTACTCTGTTAAGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAAAGCAGAGAAC 3594
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 ACTCTGAGTATCACTACTTTGTTAAGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAAAGCAGAGAAC 3599
Query 3595 AGCTTAAACTCTGTTGAGCGTGTTGGCAACTATATTGATCTTCCTTCTGAGGCTACAGCT 3654
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 3600 AGCTTAAATTCTGTTGAGCGTGTTGGCAACTACGTTGATCTTCCTTCTGAGGCGACATAT 3659
Query 3655 ATAATCGAGAACAATCGTCCAGTATCTGGCTGGCCTTCAAGAGGATCAATTCAA-TTTGA 3713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||
Sbjct 3660 ATAATCGAGAACAATCGTCCAGTATCTGGCTGGCCTTCAAGAGGCTCAATT-AAGTTTGA 3718
Query 3714 AGACGTTCACCTGCGTTATAGACCCGGGCTTCCTCCAGTATTGCATGGACTGTCCTTTTT 3773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 AGACGTTCACCTGCGTTATAGACCCGGGCTTCCTCCAGTATTGCATGGACTGTCCTTTTT 3778
Query 3774 TGTTTATCCGAGTGAGAAAGTAGGAGTGGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAGTCTTCCAT 3833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3779 TGTTTATCCGAGTGAGAAAGTAGGAGTGGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAGTCTTCCAT 3838
Query 3834 GCTGAATGCATTATACCGGATTGTGGAATTGGAAAAAGGAAGAATCCTGATTGATGATTA 3893
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3839 GCTGAATGCATTATACCGGATTGTGGAATTGGAAAAGGGAAGAATCATGATTGATGATTA 3898
Query 3894 TGATGTGGCTAAGTTTGGACTGACAGATTTGCGTAGGGTCCTAAGTATCATACCCCAGTC 3953
||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3899 TGATGTGGCTAAGTTTGGACTGACAGATTTGCGCAGTGCCCTAAGTATCATACCCCAGTC 3958
Query 3954 ACCAGTTCTTTTTTCAGGGACGGTGAGATTCAATATCGATCCATTTAGTGAACACAATGA 4013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 ACCAGTTCTTTTTTCAGGGACGGTGAGATTCAATATCGATCCATTTAGTGAACACAATGA 4018
Query 4014 TGCTGACCTCTGGGAGGCTCTAGAAAGGGCGCATATAAAAGATGTCATCGATAGGAATCC 4073
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 4019 TGCTGACCTCTGGGAGGCTCTACAAAGGGTGCATATAAAAGATGTCATCGACAGGAGTCC 4078
Query 4074 TTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTCTGAGGGAGGTGAGAACTTCAGTGTGGGGCAAAGACA 4133
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4079 TTTTGGCCTAGATGCGGAGGTCTCTGAAGGAGGTGAGAACTTCAGTGTGGGGCAAAGGCA 4138
Query 4134 ACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATTGCTAAGAAGATCTAAGATCCTTTTTCTTGATGAAGC 4193
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 4139 ACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATTGCTAAGAAGATCTAAGATCCTTGTTCTCGATGAAGC 4198
Query 4194 AACTGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGATACAGAGGACCATACGTGAGGAATT 4253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4199 AACTGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGATACAGAGGACCATCCGTGAGGAATT 4258
Query 4254 CAAGTCTTGTACAATGCTTATTATCGCTCACAGATTGAATACCATCATCGACTGCGACAA 4313
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 CAAGTCTTGTACAATGCTTGTTATCGCTCACAGATTGAATACCATCATCGACTGCGACAA 4318
Query 4314 GATCCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTATGATAGTCCACAAGAATTGCTATC 4373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4319 GATCCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTATGATAGTCCACAAGAATTGCTATC 4378
Query 4374 AAGAGATACAAGTGCTTTCTTTAAGATGGTTCATAGCACTGGACCAGAAAATGGTCAGTA 4433
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4379 AAGAGATACAAGTGCCTTCTTTAGGATGGTTCATAGCACTGGACCAGAAAATGCTCAGTA 4438
Query 4434 CCTTTCCAACTTGGTCTTTGAAAGGAGAGGGAATGGAATGAGTCAAGGTGGATA 4487
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4439 CCTTACCAACTTGGTATTTGAAAGGAGAGGGAATGGAATGAGTCTGGGTGGATA 4492
> Ahg313679 jgi|Araly1|313679|fgenesh1_pm.C_scaffold_1002459
Length=4488
Score = 6325 bits (3425), Expect = 0.0
Identities = 4150/4504 (92%), Gaps = 34/4504 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTTTGAGGCATTGAATTGGTACTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 60
||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTTTTGAAGCTTTGAATTGGTATTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 60
Query 61 ACACCGGATGGTGCGTTTGGTGCCTACACGCCGTGTGCCATTGACTCACTAGTGATGATT 120
|| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 61 TCAGTGGATGGTGCGTTTGGAGCCTATACGCCGTGTGCCATTGACTCACTTGTGATGCTT 120
Query 121 GTTTCTAACTCTGTACTTCTGGGTTTGTGTTTCTACCGGATATGGATCACCTTGTACAAT 180
|||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 121 GTTTCTCACTTTGTGCTTCTGGGTTTGTGTTTCTACCGGATATGGATCATCTTCCACAAT 180
Query 181 GCCAAAGCTCAGATTTATGTTTTGAGGAAGATGTACTATCACTGTGTGCTATGGATATTG 240
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 181 ACCAAAGCTCAGATTTATGTTTTGAGGAAGAAGTATTATAACTGTGTGCTAGGGATATTG 240
Query 241 GCTTGTTGCTGTGTTGTTGAGCCTGTACTGAGATTAGTTATGGGGATTTCGCTTTTTGAC 300
||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||
Sbjct 241 GCTTGTTACTGTGTTGTTGAGCCTGTTCTGAGATTGGTCATGGGGATTTCACTCTTTGAC 300
Query 301 ATGGGTGATGAA-ACTGATCTTCCTCCCTTTGAGGTTGCATCCTTAATGGTTGAGGCATT 359
||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 301 TTGGATGA-AAACACTGAACTTCCTCCCTTTGAGGTTTCATCTTTAATGGTTGAGGCATT 359
Query 360 TGCTTGGTTCGCCATGCTTGTTTTGATTGGACTTGAAACCAAACAATATGTCAAAGAGTT 419
||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CGCTTGGTTCTCCATGCTTGTTTTGATCGGACTCGAAGCCAAACAATATGTCAAAGAGTT 419
Query 420 CCGATGGTACGTGAGATTTGGTGTTGTATATGTTTTGGTTGCTGATGCGGTGCTGCTGGA 479
| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 420 CAGATGGTATGTGAGATTTGGTGTTTTATATGTTTTGGTTGCTGATGCTGTGCTGCTGGA 479
Query 480 CCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCCTATATCTCTGTATCAGTTC 539
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 480 TCTTGTGTTGCCTTTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCCTATATCTCTTTATCAGTTC 539
Query 540 AAGATGTTGCCAGGCTCTTTTTGGAATCCTTCTACTTGTTTACATTCCTGAACTGGATCT 599
|||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |
Sbjct 540 AAGATGTTCCCAGGCTCTTTTTGGAATTCTTCTTCTTATTTACATTCCGGAACTGGACCC 599
Query 600 TTATCCAGATTACCATATTCTAAACAATGAATCGTTAGACAATGTTGAATATGATGCACT 659
|||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TTATCCGGGTTACCATATTGTAAACGATGAACCGTCAGACAATGTTGAATATGATGCACT 659
Query 660 GCCTGGGGGAGTGAACATATGTCCCGAGCGATATGCCAGCATATTTTCTGGAATATACTT 719
| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 660 TCGAGGGGGAGAGCACATATGTCCCGAGCGACATGCCAGCATATTTTCCAGAATATACTT 719
Query 720 TAGTTGGATGACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAGCCTATTACTGAGAGGGATGT 779
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||
Sbjct 720 TGGTTGGATCACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAACCCATAACAGAGAAGGATGT 779
Query 780 TTGGCAATTAGACCAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATAAAAAGATTCCAAAGGTGCTG 839
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||
Sbjct 780 TTGGCAATTAGACAAATGGGACCAGACAGAAACTCTAATCAAAAGATTCCAAAGATGTTG 839
Query 840 GACTGAAGAATCACGGAGGCCTAAGCCATGGCTACTCCGAGCACTAAATAATAGCCTTGG 899
|||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GACTGAAGAATCACGGAGACCTAAGCCGTGGCTTCTCCGAGCACTAAATAATAGCCTTGG 899
Query 900 TCGAAGGTTCTGGTTGGGTGGTATTTTCAAGGTTGGGCATGATCTATCTCAATTTGTTGG 959
|||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 900 TCGAAGATTCTGGTTGGGTGGTATTTTCAAGATTGGAAATGATCTTTCTCAATTTGTTGG 959
Query 960 ACCAGTTATACTGAGCCATATCCTGCAGTCAATG-ATAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTG 1018
||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACCGGTTATACTGAGCCATCTATTGCGGTCAATGCA-AGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTG 1018
Query 1019 GCTATGTCTATGCTTTC-TTAATTTTCTTTGGGGTGACATTTGGAGTGCTTTGTC-AATC 1076
||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||| | || |
Sbjct 1019 GCTATGTCTATGCTTTCATT-ATATTCGTTGGGGTGACACTTGGAGTGCTTTG-CGAAGC 1076
Query 1077 TCAGTACTTTCA-ACATGTTGGGCGAGTGGGATTTCGGTTGAGGTCAACTTTGGTTGCAG 1135
||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1077 CCAGTACTTTCAGA-ATGTTTGGCGGGTGGGATTTCGGTTGAGATCAACTTTGGTTTCAG 1135
Query 1136 CTATATTCCACAAATCTTTAAGACTAAC-CAATAAAGCTCGCAAAAATTTTGCATCTGGG 1194
|||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1136 CTATATTCCACAAATCGCTAAGACTAACTC-ATGAAGCTCGCAAGAATTTTGCATCTGGG 1194
Query 1195 AAAGTCACAAACATGATAACTACTGATGCTAATGCACTTCAGCTAATAGCAGAACAGCTC 1254
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||
Sbjct 1195 AAAGTAACAAACATGATAACTACAGATGCTAATGCACTTCAGCAAATATCACAACAGCTC 1254
Query 1255 CATGGTTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTGTCTATGGTTCTTCTCTATCAACAA 1314
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1255 CATGGCTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTGTCTATGATTCTTCTCTATCAACAA 1314
Query 1315 CTAGGAGTTGCTTCAATTTTCGGTTCACTGATTTTATTTCTCCTTATTCCTTTCCAGACT 1374
|||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| ||||||||
Sbjct 1315 CTAGGAGTTGCTTCGCTTTTCGGTTCATTGATTCTGTTTCTACTAATTCCTCTCCAGACT 1374
Query 1375 CTGATTGTAAGAAAAATGCGGAAACTTACTAAAGAAGGACTCCAGTGGACTGACAAAAGA 1434
|||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 CTGATTATAAGCAAAATGCGGAAACTGACTAAAGAAGGACTCCAGTGGACTGACAAAAGA 1434
Query 1435 GTCGGTATCA-TATATGAGATTTTGGCATCCATGGATATTGTAAAATGCTATGCATGGGA 1493
|||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1435 GTCGGTATCACGA-ATGAGATATTGTCATCCATGGATACTGTAAAATGCTATGCACGGGA 1493
Query 1494 GAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAACGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAA 1553
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 GAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAATGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAA 1553
Query 1554 AGCGCAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTGAACAGCACCCCAGTTGTTGTGAC 1613
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||
Sbjct 1554 AGCACAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTGAATAGCATCCCGGTAGTTGTGA- 1612
Query 1614 CT-TGGTTTCATTTGGGGTTTAT-GTTCTGCTTGGAGGAGATTTGACACCAGCAAGGGCA 1671
|| ||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1613 CTGTGGTTTCTTTTGGCGTTT-TCGTTCTGCTCGGAGGAGATTTGACACCAGCAAGAGCA 1671
Query 1672 TTCACATCTCTTTCTCTATTTGCAGTTCTAAGATCTCCTCTCAGCACGCTACCAAATCTT 1731
||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||
Sbjct 1672 TTCACATCTCTTTCTCTCTTCGCAGTACTTAGATTTCCTCTCAATATGCTACCAAATCTT 1731
Query 1732 ATAAGTCAGGCTGTCAACGCAAATGTTTCACTGCAACGCATTGAGGAACTACTTTTAAGT 1791
||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1732 CTAAGTCAGGTTGTCAATGCAAATGTTTCACTACAACGCATTGAGGAACTACTTCTAAGT 1791
Query 1792 GAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTCCAACCAGGAGCTCCAGCCATTTCCATT 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||
Sbjct 1792 GAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTTCAACCAGGAACTCCAGCCATATCAATT 1851
Query 1852 AAGAATGGATATTTTTCATGGGATTCAAAGACATCCAAACCCACATTATCGGATATCAAT 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1852 AAGAATGGATATTTTTCATGGGATTCAAAGACAACCAAGCCCACATTATCCGATATCAAT 1911
Query 1912 TTGGAGATACCGGTGGGCAGCTTGGTTGCCATTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACG 1971
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 TTGGAGATACCGGTGGGCAGCTTAGTTGCCATTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACT 1971
Query 1972 TCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCTGAAACCTCAAGCGTTGATATC 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 1972 TCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCTGAAACCTCGACCGTTGTTATT 2031
Query 2032 AGAGGATCTGTAGCTTATGTACCTCAAGTTTCATGGATCTTTAATGCCACTCTGCGTGAA 2091
||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2032 AGAGGCTCTGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTTCGTGGATCTTTAATGCCACTGTGCGTGAA 2091
Query 2092 AACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATATTGGAGGGCTATTGATGTGACT 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2092 AACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATATTGGAGGGCTATTGATGCGACT 2151
Query 2152 GCCTTACAACACGATCTTGATTTGTTTCCAGGCCGTGATCGTACTGAGATTGGAGAACGT 2211
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2152 GCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAGGTCGTGATCTTACTGAGATTGGAGAACGT 2211
Query 2212 GGGGTGAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTTTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCA 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 GGGGTGAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTTTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCA 2271
Query 2272 AATTCAGATATTTACATATTTGATGATCCTTTCAGTGCTTTAGATGCTCATGTTGCTCAC 2331
||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 AATTCAGATGTTTACATATTCGATGATCCTTTGAGTTCATTAGATGCTCATGTTGCTCAC 2331
Query 2332 CAGGTCTTTGATAGCTGCGTGAAGCATGAGCTGAAGGGG-AAAACCAGGGTTCTTGTAAC 2390
|||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||
Sbjct 2332 CAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAGGATGAGCT-AAGGGGGAAAACAAGAGTTCTTGTCAC 2390
Query 2391 AAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATAATTTTAGTCTCCGAAGGAATGAT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 AAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATAATTTTAGTCTCCGAAGGAATGAT 2450
Query 2451 CAAAGAGGAGGGAAACTTCGCAGAGCTGTCAAAAAGTGGGACTTTGTTCAAAAAACTAAT 2510
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 2451 TAAAGAGGAGGGAACCTTTACAGAGCTGTCAAAAAGTGGGAGTTTGTTCAAGAAACTAAT 2510
Query 2511 GGAGAATGCTGGAAAAATGGATGCAACCCAAGAAGTCAATACAAATGACGAGAACATTTC 2570
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2511 GGAGAATGCTGGAAAAATGGACGCAACCCAAGAGGTCAATACAAATGACGAGGACATTTT 2570
Query 2571 GAAGCTGGGTCCTACTGTCACGATTGATGTGAGTGAAAGAAGTCTTGGCAGTATCCA-GC 2629
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||
Sbjct 2571 GAAACTGGGTCCTACTGTCACGATTGATGTGAGTGAAAGAAATCTTGGCAGTA-CCAAGC 2629
Query 2630 AAGGGAAATGGGGAAGATCCATGCTTGTAAAGCAAGAAGAGCGGGAAACTGGCATCATTA 2689
|||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2630 AAGGGAAACGGAGAAGATCTGTGCTTGTAAAGCAAGAAGAACGGGAAACTGGCATCATTA 2689
Query 2690 GCTGGGATGTTGTGATGAGGTATAATA-AAGCAGTAGGCGGCTTATGGGTAGTTATGATT 2748
| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 GTTGGAATGTTCTGATGAGGTATAA-AGAAGCAGTAGGCGGCTTATGGGTAGTTATGATT 2748
Query 2749 CTCTTAGTATGCTATTTAACAACTGAAGTTCTCCGAGTTTTAAGTAGCACATGGTTAAGT 2808
|| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2749 CTATTAGCATGCTATTTAACAACTGAAGTTCTACGAGTTTCAAGTAGCACATGGTTAAGT 2808
Query 2809 ATTTGGACTGATCAAAGCACGCCAAAGAGTTATAGTCCCGGTTTCTACATTGTCGTATAT 2868
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2809 ATTTGGACTGATCAAAGCACGTCAAAGAGTTATAGCCCCGGTTTTTACATTGTTGTATAT 2868
Query 2869 GCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTTACCAACTCTTTTTGGTTGATCTCG 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |
Sbjct 2869 GCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTCACCAACTCCTTTTGGCTGATCACA 2928
Query 2929 TCAAGTTTACATGCCGCTAAAAGACTCCATGACGCAATGCTGAATTCTATCCTACGTGCT 2988
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||
Sbjct 2929 TCAAGTTTACATGCCGCCAAAAGACTCCATGACGGGATGCTGAGTTCTATTCTTCGAGCT 2988
Query 2989 CCTATGCTCTTCTTCGAAACAAACCCAACCGGACGTGTAATAAACAGGTTTTCTAAGGAT 3048
||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2989 CCTATGCTCTTCTTCCACACAAACCCAACTGGACGTGTAATAAACAGATTTTCTAAGGAT 3048
Query 3049 ATTGGTGATATAGATAGAAACGTGGCCAACCTAATGAACATGTTCATGAACCAGCTATGG 3108
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3049 ATTGGTGATATAGATAGAAACGTTGCCAACCTAATGAATATGTTCATGAACCAGCTATGG 3108
Query 3109 CAACTCCTCTCGACATTTGCACTTATAGGTATTGTCAGTACAATTTCATTGTGGGCAATA 3168
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CAACTCCTCTCGACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACAATTTCATTGTGGGCAATA 3168
Query 3169 ATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAACATATATCTACTATCAGAGCACATCCCGTGAA 3228
|||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 ATGCCACTCCTAATACTGTTTTATTCAGCATATCTCTACTATCAGAGCACATCCCGTGAA 3228
Query 3229 GTTAGACGTTTGGATTCCGTTACTAGATCACCTATCTATGCTCTA-TTTGGAGAAGCTTT 3287
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3229 GTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCACCTATTTATGCTC-AGTTTGGAGAAGCTTT 3287
Query 3288 GAATGGTTTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGGATGGCAAAGATAAATGG 3347
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3288 GAATGGTTTGTCAAGTATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGGATGGCCAAGATTAATGG 3347
Query 3348 AAAATCCATGGACAACAACATAAGGTTTACTCTCGCTAGTACTAGCTCAAATCGTTGGCT 3407
||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3348 AAAATCCATGGACAACAACATAAGGTTCACTCTTGCAAATACTAGCTCAAATCGTTGGCT 3407
Query 3408 CACTATAAGATCTG-AGAGTCTTGGGGGTGTCATGATTTGGTTAACTGCAACTTTTGCGG 3466
||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 CACTATAAGAT-TGGAGACTCTTGGGGGTGTGATGATTTGGTTAACTGCAACTTTTGCGG 3466
Query 3467 TTCTGCGATATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGTTTTTGCATCTACGATGGGTCTCCTTC 3526
|||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3467 TTCTGCAAAATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGCTTTTGCATCAACGATGGGTCTCCTTC 3526
Query 3527 TTAGTTACACTCTGAATATCACTACTCTGTTAAGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAAAG 3586
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3527 TTAGTTACACTCTGAATATCACTAGTCTATTAAGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAGAG 3586
Query 3587 CAGAGAACAGCTTAAACTCTGTTGAGCGTGTTGGCAACTATATTGATCTTCCTTCTGAGG 3646
| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3587 CGGAGAACAGCTTGAATTCTGTTGAGCGTGTTGGTAACTACATTGATCTTCCTTCTGAGG 3646
Query 3647 CTACAGCTATAATCGAGAACAATCGTCCAGTATCTGGCTGGCCTTCAAGAGGATCAATTC 3706
|||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 CTACAGATATAATTGAGAACAATCGTCCAGTAGCTGGCTGGCCTTCAAGAGGATCAATT- 3705
Query 3707 AATTT-GAAGACGTTCACCTGCGTTATAGACCCGGGCTTCCTCCAGTATTGCATGGACTG 3765
|| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3706 AAGTTCGAAGACGTCCACCTGCGTTATCGACCCGGGCTTCCTCCAGTATTGCATGGGCTG 3765
Query 3766 TCCTTTTTTGTTTATCCGAGTGAGAAAGTAGGAGTGGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAG 3825
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3766 ACCTTTTTTGTTTCTCCCAGTGAGAAAGTAGGAGTTGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAA 3825
Query 3826 TCTTCCATGCTGAATGCATTATACCGGATTGTGGAATTGGAAAAAGGAAGAATCCTGATT 3885
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3826 TCTTCCATGCTGAATGCATTATTTCGGATCGTGGAAGTGGAAAAGGGAAGAATTATGATT 3885
Query 3886 GATGATTATGATGTGGCTAAGTTTGGACTGACAGATTTGCGTAGGGTCCTAAGTATCATA 3945
||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct 3886 GATGATTGTGATGTGGCTAAGTTCGGACTAACAGATTTACGCAGGGTTCTAAGTATCATA 3945
Query 3946 CCCCAGTCACCAGTTCTTTTTTCAGGGACGGTGAGATTCAATATCGATCCATTTAGTGAA 4005
|| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3946 CCACAATCTCCTGTTCTTTTCTCAGGGACGGTGAGATTCAATATCGATCCATTTAGTGAA 4005
Query 4006 CACAATGATGCTGACCTCTGGGAGGCTCTAGAAAGGGCGCATATAAAAGATGTCATC-GA 4064
|| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4006 CATAATGATGCTGACCTCTGGGAAGCTCTACAAAGGGCGCATATAAAAGATGTCATCAGC 4065
Query 4065 TAGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTCTGAGGGAGGTGAGAACTTCAGTGTGGG 4124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4066 -AGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTCTGAGGGAGGTGAGAATTTCAGCGTGGG 4124
Query 4125 GCAAAGACAACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATTGCTAAGAAGATCTAAGATCCTTTTTCT 4184
|||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4125 GCAAAGGCAACTGCTGAGTCTTGCGCGTGCGTTGCTAAGAAGATCTAAGATCCTTGTTCT 4184
Query 4185 TGATGAAGCAACTGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGATACAGAGGACCATACG 4244
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4185 CGATGAAGCAACAGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGATACAGAGGACCATTCG 4244
Query 4245 TGAGGAATTCAAGTCTTGTACAATGCTTATTATCGCTCACAGATTGAATACCATCATCGA 4304
||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4245 GGAGGAATTCAAGTCTTGCACAATGCTTGTTATTGCTCACAGGTTGAATACCATCATCGA 4304
Query 4305 CTGCGACAAGATCCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTATGATAGTCCACAAGA 4364
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4305 CTGTGACAAGATTCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTATGATAGTCCTCAAGA 4364
Query 4365 ATTGCTATCAAGAGATACAAGTGCTTTCTTTAAG-ATGGTTCATAGCACTGGACCAGAAA 4423
||||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 4365 ATTGCTATCAAGAGACACAAGCGCCTTCTTTA-GTATGGTTCATAGCACCGGACCAGCAA 4423
Query 4424 ATGGTCAGTACCTTTCCAACTTGGTCTTTGAAAGGAGAGGGAATGGAATGAGTCAAGGTG 4483
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||
Sbjct 4424 ATGCTCAGTACCTTTCCAATTTGGTCTTTGAAAGGCGAGAGAATGGTATGAGTTTGGGTG 4483
Query 4484 GATA 4487
||||
Sbjct 4484 GATA 4487
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 169774833153
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5