BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G33390.1
Length=4066
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg473512 jgi|Araly1|473512|fgenesh2_kg.1__3466__AT1G33390.1 5853 0.0
Ahg948632 jgi|Araly1|948632|scaffold_800519.1 5773 0.0
Ahg936357 jgi|Araly1|936357|scaffold_500548.1 774 0.0
> Ahg473512 jgi|Araly1|473512|fgenesh2_kg.1__3466__AT1G33390.1
Length=3805
Score = 5853 bits (3169), Expect = 0.0
Identities = 3619/3829 (95%), Gaps = 60/3829 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 97 ATGGCAAGTGTGGTGGGAGATGATTGCAATTTAGATGTAATGCCTCCTAGGAAGAAGAAG 156
||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAGTCTGATGGGAGATGATTGCAATTTAGATATAATGCCTCCAAGGAAGAAGAAG 60
Query 157 AATAAAGGATCCAATAAGATGCAGGATAAGCTGAATTCAAATAATAACACGGGATCGAAG 216
||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||
Sbjct 61 AATAAGGGATCCAAT---A---AGGATAAGCTGAATTCAAATAACAACACGGTTTC-AAG 113
Query 217 -AAATCTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAATGTAA--ACACGGTAGCGTGCAAATCTCAG 273
| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||
Sbjct 114 TAGATCTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAA--TAAGGACACGGTAGTGAGCAAATCTCAG 171
Query 274 AAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCCTCTTTTCAAAAACT 333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 172 AAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCATCTTTGCAAAAACC 231
Query 334 GCCGAGTTGTTAGACAAGTACAAAATATCTGAGGATGTATCGTCGCTATTACAATCATCA 393
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 232 GCCGAGTTGTTAGACACGTACAAAATATCTGAGGATGTATCATCGCTATTACAATCGTCA 291
Query 394 AAAGTTATAGGAAGATCAGCTACTAAGCTGGAAAAAAGAAGGAGAGCAATGCAACTTTCT 453
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 AAAGTTATAGGAAGATCAGCCACTAAGCTGGAAAAACGAAGGAGAGCAATGCAACTTTCT 351
Query 454 AAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGATGAATCAGTCGAGCAAAATGACAATGATGAT 513
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 352 AAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGACGAATCAGTCGAGCGAAATGAC---GATGAT 408
Query 514 GATTCTTGTATGGATGAACCTACAACACCGGAACATGTTGAAATTGAAACT-CCAACTTT 572
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||
Sbjct 409 GATTCTTGTATGGACAAACCTACAACACCGGAACATGTTGAAATCGAAA-TCCCAACTTT 467
Query 573 TGTAACTGATTCTGAGCAGCAACTGG-T--T---C----A-T--G--CTGATCTAATGAT 617
||||||| |||||||||| ||||||| | | | | | | ||||||||||| |
Sbjct 468 TGTAACTTATTCTGAGCAACAACTGGTTCATGAGCATGAACTCGGTTCTGATCTAATGTT 527
Query 618 TTCTGCTGAAGAAAGTAGTAGCAAGCTTGAGGTAGACGACACTGTGGATATGATCCCACT 677
|||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 528 TTCTGCTGAAGAAACTAGTAGCAAGCTCGTGGTAGACGACAATGTGGATATGATCCTACA 587
Query 678 GACAACTTGTCGTGATGATGATGAAGACT--C----AATGGATGGG-CTCATTGAGAATG 730
||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||
Sbjct 588 GACAACTTGTCGTGATGATGAAGAAGACTCACAAAGAATGGATGGGAC-CATTGAGAATG 646
Query 731 AAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGCCCGCGTTTGTAGTTCATGTTTCAAGACCAG 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 647 AAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGCCCGCGTTTGTAGTTCATGTTTTGAGACCAG 706
Query 791 CCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTCCAATAGTAATGATGGAGCAGGAGATAATGG 850
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 707 CCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTCCGATAGTAATGATGGAGCAAGAGATAATGG 766
Query 851 AAGCTATTAATCGTCACCCTGCAGTTATTATTTCAGGACAAACTGGGTGTGGTAAAACCA 910
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 767 AAGCTATTAATCGTCACCCCACAGTTATTATTTCAGGACAAACCGGGTGTGGTAAAACCA 826
Query 911 CTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTGGTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAA 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 827 CTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTGGTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAA 886
Query 971 GTGGGATTATCGGGATTACCCAACCACGCCGTGTCGCCGTTCTTGCCACTGCCAAGAGAG 1030
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 887 GTGGGATTATAGGGATTACCCAACCACGCCGTGTCGCCGTCCTTGCCACTGCCAAGAGAG 946
Query 1031 TGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTAAAGAGGTTGGGTTTCAAGTTAGGTACGACA 1090
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 TGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTAAAGAAGTCGGGTTTCAAGTTAGGTACGACA 1006
Query 1091 AAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGTTTATGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 AAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGTTTATGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGA 1066
Query 1151 TACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACTCTGTGATTATTCTCGATGAAGCCCATGAAA 1210
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067 TACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACTCTGTGGTAATTCTCGATGAAGCCCATGAAA 1126
Query 1211 GAAGCTTGAACACAGACATTCTAATTGGGATGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGG 1270
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 GAAGTTTGAACACAGACATTCTAATTGGGATGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGG 1186
Query 1271 AATACTACGAGGAACAACAAAAGAGTCTTCAATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATGCC 1330
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1187 AATACTACGAGGAACAACAAACGAGTCTTCAATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATACC 1246
Query 1331 AAATCACGCCACTTAAACTTATATTGATGAGTGCGACTTTGCGAGTGGAAGATTTTGTAT 1390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1247 AAATCACGCCACTTAAACTTATATTGATGAGTGCGACTTTGCGGGTGGAAGATTTTGTAT 1306
Query 1391 CGGGGAAAAGGTTATTCCCTAATATACCTCCTCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATC 1450
| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 CAGGGAAAAGGTTATTCCCTAAGATACCTCCGCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATC 1366
Query 1451 CAGTAACTATACATTTCTCCAAG-AAGACTGAGATTGTTGATTATATAGGTGAAGCTTAT 1509
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1367 CAGTAACTATACATTTCTCC-AGAAAGACTGAGATTGTTGATTATATCGGTCAAGCTTAT 1425
Query 1510 AAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGTTACCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACT 1569
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 AAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGCTACCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACT 1485
Query 1570 GGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAGAAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTT 1629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1486 GGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAGAAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTT 1545
Query 1630 GTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTGAAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGT 1689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 GTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTGAAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGT 1605
Query 1690 GGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCATTTGATGATGACTCCAACAATCAAAATTCC 1749
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
Sbjct 1606 GGTGTTGATATGAAGGAGATTGCTGAAGCATTTGATGATGGCTCCGACAATCAAAATTAC 1665
Query 1750 AGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCTGATATTGGTGATGGTAACTATGATGATGAT 1809
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666 AGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCTGAAATTGGTGATGGTAACTATGATGATGAT 1725
Query 1810 TTTGAAGAGGAAGACATGTATGAGTCTGATGAAGACAGGGACTGGGAAACTGTTGATGAC 1869
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1726 TTTGAAGAAGAAGACATGTATGAGTCTGATGAAGACAGGGACTGGGAAACTGTTGATGAC 1785
Query 1870 GGCTTTGCAAGTTCATTTGTAGAGGAAGGGAAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAAT 1929
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786 GGCTTTGCAAGTTCATTGGTAGAGGAAGGGAAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAAT 1845
Query 1930 GCTTTGGCAGACAAAAATGGATCCGTATCTGCTGAGCCGGCAAAGTCCATTGCAGCAGAG 1989
| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1846 GGTTTGGCAAACGAAAATGGATCCGTATCTGCTGAGCCGACAAAGACCATTGCAGCAGAG 1905
Query 1990 AATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACA-AGTTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCC 2048
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906 AATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACACA-TTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCC 1964
Query 2049 ACTTTATGCTATGCTATCTCCAGCTGCACAGCTTCGAGTGTTTGAGGAAGTTGAGAAAGA 2108
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1965 ACTTTATGCGATGCTATCTCCAGCTGCACAGCTCCGAGTGTTTGAGGAATTTGAGAAAGA 2024
Query 2109 AGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGTAGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCTGGTAT 2168
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2025 AGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGTAGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCCGGTAT 2084
Query 2169 AAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAAAGTAAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTAT 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2085 AAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAAAGTGAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTAT 2144
Query 2229 GGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGCCAAGCTTCGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGC 2288
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 GGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGTCAAGCTTAGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGC 2204
Query 2289 TGGACGAACTGGACCTGGTCACTGTTATCGTCTCTATTCATCTGCAGTTTTTAGCAATAT 2348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2205 TGGACGAACTGGACCTGGTCACTGTTATCGTCTCTATTCATCTGCGGTTTTTAGCAATAT 2264
Query 2349 ATTTGAGGAATCTTCGCTTCCTGAAATCATGAAAGTTCCTGTTGATGGAGTCATTCTTCT 2408
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2265 ATTTGAGGAATCTTCGCCTCCTGAAATCACGAAAGTTCCTGTTGATGGAGTTGTTCTTCT 2324
Query 2409 CATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGAGAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGAGCC 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2325 CATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGAGAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGATCC 2384
Query 2469 ATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACGATGCCTAAAAGCTTTAGAGGCTCTAGACAGCAACGG 2528
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2385 ATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACGATGCTTAAAAGCTTTAGAGGCTCTCGACAGCAACGG 2444
Query 2529 AGGGTTAACACCATTAGGAAAGGCTATGTCTCACTATCCTATGAGTCCACGTCACTCAAG 2588
| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 AAGGTTAACACCATTAGGAAAAGCTATGTCTTACTATCCCATGAGTCCACGTCACTCAAG 2504
Query 2589 AATGCTTCTAACAGTCATCCAAATGCTAAAAGAGACCCGGAATTACTCACGCGCGAATCT 2648
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 AATGCTTCTCACAGTCATCCAAATGCTAAAAGAGACCCGGAATTACTCACGCGCGAATCT 2564
Query 2649 CATCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGCCGCGTTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAAT 2708
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 CGTCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGCCGCGTTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAAT 2624
Query 2709 GGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAACGAGTCCAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAACAAGA 2768
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2625 GGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAACGAGTCCAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAGCAAGA 2684
Query 2769 AGATAAACAACGGAAAAAGGATCGGAAAGAGAAGATTAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTC 2828
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2685 AGATAAACAACGGAGAAAGGATCGGAAAGAGAAGATCAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTC 2744
Query 2829 CAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACTGTAGCTTACGCATTGCATTCCTTTGAGGTCTCGGA 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2745 CAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACTGTAGCTTATGCATTGCATTCTTTTGAGGTCTCAGA 2804
Query 2889 GAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAATGGGTTGCATTTGAAGACCATGGACGAGATGTC 2948
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2805 GAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAACGGTTTGCATTTAAAGACCATGGACGAGATGTC 2864
Query 2949 TAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGCGACTTGTTTTCAACTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGA 3008
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 TAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGAGACTTGTTTTCAGCTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGA 2924
Query 3009 AGACAGCTTT-TCATGGACTCATGGGACTATACAAGACGTAGAGAAGTCATGGAGAATCA 3067
||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2925 CGACGG-TTTCTCATGGACTCATGGGACTATACAAGACGTAGAGAAGTCATGGAGAATCA 2983
Query 3068 CCACATCGACTTCCTCAAAA-ACCCCTCTTCTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAA 3126
|||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 CCACATCGTCTTCCTCAAAATATCC-TCTTCTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAA 3042
Query 3127 GCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTAGCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAA 3186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3043 GCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTAGCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAA 3102
Query 3187 GCATGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTGCACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACTCAGCT 3246
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3103 GCTTGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTGCACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACACAGCT 3162
Query 3247 CCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTACTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCG 3306
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3163 CCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTACTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCA 3222
Query 3307 ACTCGGGTGAGGCCAGAATGGCTGGTGAAGCACGC-AAAGTCTCTCTGCGTGTTCTC-TG 3364
||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3223 ACTCGAGTAAAGCCGGAATGGCTGGTGAAGCACGCTAAA-TCTCTCTGCGTGTTCTCCT- 3280
Query 3365 CACCGCTCAAGGACCCGAAACCATATTACTCAAGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGG 3424
|||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3281 CACCACTCAAGGACCCGAAACCTTATTACTCGAGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGG 3340
Query 3425 TCGTTCCGAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAACTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAG 3484
|| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3341 TCATTCCAAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAGCTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACCG 3400
Query 3485 AGGATAGAGACCGAGCAGCGGCTTTCGGATGCGCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTAACTT 3544
| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3401 ATGATAGAGACCGAGCAGCAGCTTTCGGATGTGCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTACCTT 3460
Query 3545 GTTTGAAAAGC-TTCAGGGCTTTGTTGGCTGGGAAACCTGAAACGTTGTTGGAAAGAGAA 3603
||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3461 GTTTGAAAAGCGTT-AGGACGTTGTTGGCTGGGAAACCTGAAACATTGTTGGAAAGAGAA 3519
Query 3604 GCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGAGTTTGGTGATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGAT 3663
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3520 GCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGGGTTTGGTGATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGAT 3579
Query 3664 ACTTTGGAGAGTTTGAGAAAGAATTGGGAACAGAATCCGAATGTGCTTTATTCAGAGATT 3723
| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |
Sbjct 3580 AGTTTAGAGAGTTTGAGAAAGAGTTGGGAGCAGAATCCGAATGTGCTTTACTCTGAGACT 3639
Query 3724 GAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCGTGTCAAAGACCTTTGGCAGACAATGCTA 3783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3640 GAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCGTGTCAAAGAGCTTTGGCAAACAATGCTA 3699
Query 3784 AAGGAAGCTCACGTTCGAAGAAGTTAGAGGAG-A--TAAGTGTGTTTAAACTTTTTTATT 3840
||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| | ||||||| || ||| || ||| ||
Sbjct 3700 AAGGAGGCTAACGTTCAAAGAAGTCAGAGGAGGAGATAAGTGTCTTCAAAATTATTT-TT 3758
Query 3841 CTATTTTGAAAGGAAATTTTGTTAGAAACTTAAAAGTGTATCAGAGAAA 3889
||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3759 A-ATTACGAA-GGAAATTTTGTTAGAAACTTAAATGTGTAACAGAGAAA 3805
> Ahg948632 jgi|Araly1|948632|scaffold_800519.1
Length=3796
Score = 5773 bits (3126), Expect = 0.0
Identities = 3586/3798 (94%), Gaps = 71/3798 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 85 ATTGGTACGATTATGGCAAGTGTGGTGGGAGATGATTGCAATTTAGATGTAATGCCTCCT 144
||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 9 ATTTGTACAATTATGGCGAGTCTGATGGGAGATGATTGCAATTTAGATATAATGCCGCCT 68
Query 145 AGGAAGAAGAAGAATAAAGGATCCAATAAGATGCAGGATAAGCTGAATTCAAATAATAAC 204
| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 69 A-G--GAAGAAGAATAAGGGATCCAAT---A---AGGATAAGCTGAATTCAAATAAGAAG 119
Query 205 ACGGGATCGAAG-AAATCTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAATGTAA--ACACGGTAGCG 261
|||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |
Sbjct 120 ACGGTTTC-AAGCAGATGTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAA--TAAGGACACCGTAGTG 176
Query 262 TGCAAATCTCAGAAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCCTC 321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 177 AGCAAATCTCAGAAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCATC 236
Query 322 TTTTCAAAAACTGCCGAGTTGTTAGACAAGTACAAAATATCTGAGGATGTATCGTCGCTA 381
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 237 TTTGCAAAAACTGCCGAGTTGTTAGACAAGTACAAAATTTCTGAGGATGTATCATCGCTA 296
Query 382 TTACAATCATCAAAAGTTATAGGAAGATCAGCTACTAAGCTGGAAAAAAGAAGGAGAGCA 441
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 297 TTACAATCTTCAAAAGTTATAGGAAGATCAGCAACTAAGCTGGAAAAACGAAGGAGAGCA 356
Query 442 ATGCAACTTTCTAAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGATGAATCAGTCGAGCAAAAT 501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 ATGCAACTTTCTAAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGATGAATCAGTCGAGCAAAAT 416
Query 502 GAC-A--ATGA----TG-AT----G-A--T-----TCTTG-TATGGATGAACCTACAACA 540
||| | |||| || || | | | | | |||||| ||||||||||||
Sbjct 417 GACGATGATGATTCTTGTATGGACGAACCTACAGCACCAGATATGGACGAACCTACAACA 476
Query 541 CCGGAACATGTTGAAATTGAAACT-CCAACTTTTGTAACTGATTCTGAGCAGCA-A--C- 595
||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| || | |
Sbjct 477 CCGGAACATGTTGAAATCGAAA-TCCCAACTTTTGCAACTGATTCTGAGCAACAGATTCA 535
Query 596 TG-----G--TTC-ATGCTGATCTAATGATTTCTGCTGAAGAAAGTAGTAGCAAGCTTGA 647
|| | || | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 536 TGCCCATGAACTCGGTTCTGATCTAGTGATTTCTGCTGAAGAAACTAGTAGCAAGCTTGT 595
Query 648 GGTAGACGACACTGTGGATATGATCCCACTGACAACTTGTCGTGATGATGATGAAGACT- 706
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 596 GGTAGACGACACTGTGGATATGATCCTACAGACAACTTGTCGTGATGATGAAGAAGGCTC 655
Query 707 -C----AATGGATGGG-CTCATTGAGAATGAAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGC 760
| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 ACAAAGAATGGATGGGAC-CATTGAGAATGAAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGC 714
Query 761 CCGCGTTTGTAGTTCATGTTTCAAGACCAGCCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTC 820
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 CTGCGTTTGTAGTTCATGTTTCAAGACCAGCCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTC 774
Query 821 CAATAGTAATGATGGAGCAGGAGATAATGGAAGCTATTAATCGTCACCCTGCAGTTATTA 880
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 775 CGATAGTAATGATGGAGCAGGAGATAATGGAAGCTATTAATCGTCACCCTGCGGTTATTA 834
Query 881 TTTCAGGACAAACTGGGTGTGGTAAAACCACTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTG 940
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 TTTCAGGACAAACCGGGTGTGGTAAAACCACTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTG 894
Query 941 GTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAAGTGGGATTATCGGGATTACCCAACCACGCC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 GTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAAGTGGGATTATCGGGATTACCCAACCACGCC 954
Query 1001 GTGTCGCCGTTCTTGCCACTGCCAAGAGAGTGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTA 1060
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GTGTCGCCGTCCTTGCCACTGCCAAGAGAGTGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTA 1014
Query 1061 AAGAGGTTGGGTTTCAAGTTAGGTACGACAAAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGT 1120
|||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 AAGAAGTCGGGTTTCAAGTTAGGTATGACAAAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGT 1074
Query 1121 TTATGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGATACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACT 1180
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TTTTGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGATACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACT 1134
Query 1181 CTGTGATTATTCTCGATGAAGCCCATGAAAGAAGCTTGAACACAGACATTCTAATTGGGA 1240
|||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CTGTAATAATTCTCGATGAAGCCCATGAAAGAAGTTTGAACACAGACATTCTAATTGGGA 1194
Query 1241 TGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGGAATACTACGAGGAACAACAAAAGAGTCTTC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 TGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGGAATACTACGAGGAACAACAAAAGAGTCTTC 1254
Query 1301 AATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATGCCAAATCACGCCACTTAAACTTATATTGATGA 1360
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1255 AATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATACCAAATCACGCCACTTAAGCTTATATTGATGA 1314
Query 1361 GTGCGACTTTGCGAGTGGAAGATTTTGTATCGGGGAAAAGGTTATTCCCTAATATACCTC 1420
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1315 GTGCGACTTTGCGAGTGAAAGATTTTGTATCAGGGAAAAGGTTATTCCCTAAGATACCTC 1374
Query 1421 CTCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATCCAGTAACTATACATTTCTCCAAG-AAGACT 1479
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||
Sbjct 1375 CGCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATCCAGTAACTATTCATTTCTCC-AGAAAGACT 1433
Query 1480 GAGATTGTTGATTATATAGGTGAAGCTTATAAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGTTA 1539
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 GAGATTGTTGATTATATCGGTCAAGCTTATAAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGTTA 1493
Query 1540 CCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACTGGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAG 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 CCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACTGGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAG 1553
Query 1600 AAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTTGTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTG 1659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTTGTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTG 1613
Query 1660 AAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGTGGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCA 1719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 AAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGTGGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCA 1673
Query 1720 TTTGATGATGACTCCAACAATCAAAATTCCAGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCT 1779
|||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TTTGATGATGGCTCCGACAATCAAAATTACAGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCT 1733
Query 1780 GATATTGGTGATGGTAACTATGATGATGATTTTGAAGAGGAAGACATGTATGAGTCTGAT 1839
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1734 GAAATTGGTGATGGTAACTATGATGATGATTTTGAAGAAGAAGACATGTACGAGTCTGAT 1793
Query 1840 GAAGACAGGGACTGGGAAACTGTTGATGACGGCTTTGCAAGTTCATTTGTAGAGGAAGGG 1899
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 GAAGACAGGGACTGGGAAACCGTTGATGACGGCTTCACAAGTTCATTTGTAGAGGAAGGG 1853
Query 1900 AAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAATGCTTTGGCAGACAAAAATGGATCCGTATCT 1959
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 AAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAATGGTTTGGCAGACAAAAATGGATCCGTATCT 1913
Query 1960 GCTGAGCCGGCAAAGTCCATTGCAGCAGAGAATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACA-A 2018
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1914 GCTGAGCCAACAAAGACCATTGCAGCAGAGAATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACACA 1973
Query 2019 GTTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCCACTTTATGCTATGCTATCTCCAGCTGCACA 2078
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 -TTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCCACTTTATGCGATGCTATCTCCAGCTGCACA 2032
Query 2079 GCTTCGAGTGTTTGAGGAAGTTGAGAAAGAAGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGT 2138
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 GCTCCGAGTGTTTGAGGAATTTGAGAAAGAAGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGT 2092
Query 2139 AGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCTGGTATAAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAA 2198
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 AGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCCGGTATAAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAA 2152
Query 2199 AGTAAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTATGGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGCCA 2258
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 AGTGAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTATGGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGCCA 2212
Query 2259 AGCTTCGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGCTGGACGAACTGGACCTGGTCACTGTTATCG 2318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 AGCTTCGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGCTGGACGAACCGGACCTGGTCACTGTTATCG 2272
Query 2319 TCTCTATTCATCTGCAGTTTTTAGCAATATATTTGAGGAATCTTCGCTTCCTGAAATCAT 2378
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2273 TCTCTATTCATCTGCGGTTTTTAGCAATATATTTGAGGAATCTTCGCCTCCTGAAATCAC 2332
Query 2379 GAAAGTTCCTGTTGATGGAGTCATTCTTCTCATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGA 2438
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 AAAAGTTCCTGTTGATGGAGTTGTTCTTATCATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGA 2392
Query 2439 GAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGAGCCATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACGATGCCT 2498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 2393 GAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGAGCCATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACAATGCTT 2452
Query 2499 AAAAGCTTTAGAGGCTCTAGACAGCAACGGAGGGTTAACACCATTAGGAAAGGCTATGTC 2558
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 AAAAGCTTTAGAGGCTCTTGACAGCAACGGACGGTTAACACCATTAGGAAAGGCTATGTC 2512
Query 2559 TCACTATCCTATGAGTCCACGTCACTCAAGAATGCTTCTAACAGTCATCCAAATGCTAAA 2618
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 TCACTATCCCATGAGTCCACGTCACTCAAGAATGCTTCTCACAGTCATCCAAATGCTAAA 2572
Query 2619 AGAGACCCGGAATTACTCACGCGCGAATCTCATCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGC 2678
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 AGAGACCCGGAATTACTCACGCGTGAATCTCGTCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGC 2632
Query 2679 CGCGTTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAATGGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAACGAGTC 2738
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2633 CGCATTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAATGGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAATGAATC 2692
Query 2739 CAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAACAAGAAGATAAACAACGGAAAAAGGATCGGAAAGA 2798
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2693 CAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAGCAAGAAGATAAACAACGGAGAAAGGATCGGAAAGA 2752
Query 2799 GAAGATTAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTCCAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACTGTAGC 2858
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2753 GAAAATCAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTCCAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACCGTAGC 2812
Query 2859 TTACGCATTGCATTCCTTTGAGGTCTCGGAGAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAATGG 2918
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2813 TTATGCATTGCATTCCTTTGAGGTCTCAGAGAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAACGG 2872
Query 2919 GTTGCATTTGAAGACCATGGACGAGATGTCTAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGCGACTTGT 2978
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2873 TTTGCATTTAAAGACCATGGACGAGATGTCTAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGAGACTTGT 2932
Query 2979 TTTCAACTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGAAGACAGCTTT-TCATGGACTCATGGGACTA 3037
||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2933 TTTCAGCTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGACGACGG-TTTCTCATGGACTCATGGGACTA 2991
Query 3038 TACAAGACGTAGAGAAGTCATGGAGAATCACCACATCGACTTCCTCAAAA-ACCCCTCTT 3096
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||
Sbjct 2992 TACAAGACATAGAGAAGTCATGGAGAATCACCACATTGTCTTCCTCAAAATATCC-TCTT 3050
Query 3097 CTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAAGCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTA 3156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 CTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAAGCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTA 3110
Query 3157 GCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAAGCATGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTG 3216
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3111 GCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAAGCTTGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTG 3170
Query 3217 CACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACTCAGCTCCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTA 3276
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3171 CACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACACAGCTCCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTA 3230
Query 3277 CTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCGACTCGGGTGAGGCCAGAATGGCTGGTGAAG 3336
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 3231 CTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCGACTCGAGTGAAGCCGGAATGGCTGGTGAAG 3290
Query 3337 CACGCAAAGTCTCTCTGCGTGTTCTCTGCACCGCTCAAGGACCCGAAACCATATTACTCA 3396
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 CACGCAAAGTCTCTCTGCGTGTTCTCTGCACCACTCAAGGACCCGAAACCATATTACTCG 3350
Query 3397 AGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGGTCGTTCCGAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAA 3456
|||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3351 AGTGAGGAGGATAGAGCTTTGTGTTGGGTCGTCCCGAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAG 3410
Query 3457 CTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATAGAGACCGAGCAGCGGCTTTCGGATGC 3516
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 CTGCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATAGAGACCGAGCAGCGGCTTTCGGATGT 3470
Query 3517 GCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTAACTTGTTTGAAAAGC-TTCAGGGCTTTGTTGGCTGG 3575
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||
Sbjct 3471 GCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTACCTTGTTTGAAAAGCGTT-AGGACGTTGTTGGCTGG 3529
Query 3576 GAAACCTGAAACGTTGTTGGAAAGAGAAGCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGAGTTTGGT 3635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3530 GAAACCTGAAACGTTGTTGGAAAGAGAAGCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGAGTTTGGT 3589
Query 3636 GATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGATACTTTGGAGAGTTTGAGAAAGAATTGGGAACA 3695
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3590 GATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGATAGTTTAGAGAGTTTGAGAAAGAGTTGGGAACA 3649
Query 3696 GAATCCGAATGTGCTTTATTCAGAGATTGAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCG 3755
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 GAATCCGAAGGTGCTTTATTCAGAGATTGAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCG 3709
Query 3756 TGTCAAAGACCTTTGGCAGACAATGCTAAAGGAAGCTCACGTTCGAAGAAGTTAGAGGAG 3815
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 3710 TGTCAAAGACCTTTGGCAGACAATGCTAAAGGAGGCTCACGTTCAAAGAAGTCAGAGGAG 3769
Query 3816 A---TAAGTGTGTTTAAA 3830
| ||||||| ||||||
Sbjct 3770 AAGATAAGTGTCTTTAAA 3787
> Ahg936357 jgi|Araly1|936357|scaffold_500548.1
Length=3032
Score = 774 bits (419), Expect = 0.0
Identities = 491/526 (93%), Gaps = 4/526 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2028 AGGAAAATTACGTGTTCTTCCACTTTATGCTATGCTATCTCCAGCTGCACAGCTTCGAGT 2087
|||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 998 AGGAAAATTACGTG--CTCCCACTTTATGCGATGCTATCTCCAGCTGCACAGCTCCGAGT 1055
Query 2088 GTTTGAGGAAGTTGAGAAAGAAGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGTAGCGGAAAC 2147
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1056 GTTCGAGGATGTTGAGAAAGAAGAAAGACTTGTGGTCGTGGCAACAAATGTAGCGGAAAC 1115
Query 2148 TTCTCTGACTATTCCTGGTATAAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAAAGTAAAGAA 2207
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1116 TTCTCTGACTATTTCAGGTATAAAGTATGTGGTTGATTCAGGTCGGGTTAGAGTGAAGAA 1175
Query 2208 TTATGATTCTAAGACTGGTATGGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGCCAAGCTTCGGC 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1176 TTATGATTCTAAGACTGGTATGGAAAGTTATGAGGTAGAATGGATTAGTCAAGCTTCGGC 1235
Query 2268 TAGTCAACGAGCTGGAAGAGCTGGACGAACTGGACCTGGTCACTGTTATCGTCTCTATTC 2327
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TAGTCAACGTGCTGGAAGAGCTGGACGAACTGGACCCGGTCACTGTTATCGTCTCTATTC 1295
Query 2328 ATCTGC-AGTTTTTAGCAATATATTTGAGGAATCTTCGCTTCCTGAAATCATGAAAGTTC 2386
|||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1296 ATCTGCGA-TTTTTAGCAATATATTTGAGGAGTCTTCACCTCCTGAAATCACGAAAGTTC 1354
Query 2387 CTGTTGATGGAGTCATTCTTCTCATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGAGAATTTCC 2446
||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1355 CTGTTGATGGAATCGTTCTTCTCATGAAGTCTATGAACATTTCAAAGGTTGAGAATTTCC 1414
Query 2447 CGTTTCCAACTCCGCCTGAGCCATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACGATGCCTAAAAGCTT 2506
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1415 CATTTCCAACTCCGCCTGAGCCATCAGCTATTAGAGAAGCAGAAAGATGCTTAAAAGCTT 1474
Query 2507 TAGAGGCTCTAGACAGCAACGGAGGGTTAACACCATTAGGAAAGGC 2552
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1475 TAGAGGCTCTTGACAGCAACGGACGGTTAACACCATTCGGAAAGGC 1520
Score = 745 bits (403), Expect = 0.0
Identities = 528/589 (90%), Gaps = 6/589 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2630 ATTACTCACGCGCGAATCTCATCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGCCGCGTTGAGCT 2689
||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 ATTACTCCCGGGCGAATCTTGTCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGCCGCGTTGAGCT 1585
Query 2690 TACCAAACCCTTTGATAATGGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAACGAGTCCAAAGATGCTG 2749
||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1586 TACCAAACCCTTTGACAATGCAGTTCGAAGGAGAGAAGAAAACCGAGTTTGAAGATGCTG 1645
Query 2750 ACAAAACCGTCAAACAAGAAGATAAACAACGGAAAAAGGATCGGAAAGAGAAGATTAAAG 2809
||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1646 GCAAAATCGTCAAGCAAGAAGATAAACAATGGAGAAAGGAGCGGAAAGAGAAGATCAAAG 1705
Query 2810 CTGCTCGGGACAGATTTTCCAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACTGTAGCTTACGCATTGC 2869
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1706 CTGCTCAGGACAGATTTTCCAACCAAAGCAGCGATGGTTTGACTGTTGCTTACGCATTGC 1765
Query 2870 ATTCCTTTGAGGTCTCGGAGAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAATGGGTTGCATTTGA 2929
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||
Sbjct 1766 ATTCCTTTGAGGTCTGGGAGAATGGCGCGGGCTTCTGCTAGTCGAACGGAATGCATTTGA 1825
Query 2930 AGACCATGGACGAGATGTCTAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGCGACTTGTTTTCAACTGTT 2989
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1826 AGACCATGGACGAAATGTCTAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGCGAATTGTTTTCAGCTGTT 1885
Query 2990 GTAAGCCCTCCGAAACCGAAGACAGCTTT-TCATGGACTCATGGGACTATACAAGACGTA 3048
||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 GTAAGCCTTCTGAAACCGAAGATGG-TTTCTCATGGACTCATGGGACTATACAAGACGTA 1944
Query 3049 GAGAAGTCATGGAGAATCACCACATCGACTTCCTCAA-AAACCC-CTCTTCTACAGAACG 3106
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || || ||||||| |
Sbjct 1945 GAGAAGTCATGGAGAATCACCGGATCGTCTTCCTCAAGAAACCCGCT-TT-TACAGAATG 2002
Query 3107 AAGAAGAACTGTTAGGAGAAGCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTAGCCAGAAAGA 3166
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 2003 AAGAAGAGCTGTTAGGAGAAGCCATATGTACGGGATGGGCTGACCGAGTAGCTAGAAAGA 2062
Query 3167 CCAGAGCGACAGAATACCAAGCATGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTT 3215
| | |||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||
Sbjct 2063 CTAAAGCGACGGAATACCAAGCCTGCACGTTTCAAGAACCAGTTTTCTT 2111
Score = 688 bits (372), Expect = 0.0
Identities = 451/489 (92%), Gaps = 6/489 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3268 GAGCTCCTACTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCGACTCGGGTGAGGCCAGAATGG 3327
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||
Sbjct 2542 GAGCTCCTACTCACCAACAGACCGTACATGCACGGAGCGACACGGGTGAAGCCGGAATGG 2601
Query 3328 CTGGTGAAGCACGCAAAGTCTCTCTGCGTGTTCTCTGCACCGCTCAAGGACCCGAAACCA 3387
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2602 CTGGTGAAGCACTCAAAGTCTCTCTGCGTTTTCTCCGCACCACTCAAGGACCCAAAACCA 2661
Query 3388 TATTACTCAAGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGGTCGTTCCGAGTTTCGGTCCTCAT 3447
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2662 TATTACTCGAGTGAGGGGGATAGAGTTTTGTGCTGGATCGTTCCGAGTTTTGGTCCTTAT 2721
Query 3448 AATTGGGAACTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATAGAGACCGAGCAGCGGCT 3507
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2722 AATTGGGAGCTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATAGAGACCGAGCAGCGGTT 2781
Query 3508 TTCGGATGCGCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTAACTTGTTTGAAAAGCTTCAGGGCT-TT 3566
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| | ||
Sbjct 2782 TTCGGATGCGCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTGCCTTGTTTAAAAAGCGTGAGGG-TGTT 2840
Query 3567 GTTGGCTGGGAAACCTGAAACGTTGTTGGAAAGAGAAGCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGG 3626
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2841 AATGGCTGGGAAACCTGAAATGTTGTTGGAAAGAGAAGCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGG 2900
Query 3627 GAGTTTGGTGATG-GTTTTGACAGAGAAGAAGATTGATACTTTGGAGAGTTTGAGAAAGA 3685
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2901 GAGTTTGGTGA-GAGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGATAGTTTGGAGACTTTGAGAAAGA 2959
Query 3686 ATTGGGAACAGAATCCGAATGTGCTTTATTCAGAGATTGAAGTTTGGTTTCAGAA-AAAG 3744
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| | || ||||
Sbjct 2960 GCTGGGAACAGAATCCGAATGTGCTTTATGCGGAGATTGAAGCTTGGTTTTA-AAGAAAG 3018
Query 3745 TTTCGTCAT 3753
|||||||||
Sbjct 3019 TTTCGTCAT 3027
Score = 518 bits (280), Expect = 2e-145
Identities = 361/400 (90%), Gaps = 5/400 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1569 TGGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAGAAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGT 1628
||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 TGGTCAAAGAGAAGTTGACTATTTATGCGACAAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGT 656
Query 1629 TGTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTGAAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGG 1688
| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 AGGTCAAGCTGCTTTAAGAGATGCTTCCGTCAAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGT 716
Query 1689 TGGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCATTTGATGATGACTCCAACAATCAAAATTC 1748
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 717 TGGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCATTTGATGATGACTACAACAGTCAAAATTA 776
Query 1749 CAGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCTGATATTGGTGATGGTAACTATGATGATGA 1808
|||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 CAGGTTTAACTCGCATGGAGATGATCCTTTTGAAATTGGTGATGGTAACTATGATGAT-- 834
Query 1809 TTTTGAAGAGGAAGACATGTATGAGTCTGATGAAGACAGGGACTGGGAAACTGTTGATGA 1868
||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 835 TTT-GAAGAAGAAGACATCTATGAGTCTGATGATGACAGCGACTGGGAAATTGTTGATGA 893
Query 1869 CGGCTTTGCAAGTTCATTTGTAGAGGAAGGGAAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAA 1928
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||
Sbjct 894 CGGCTTTGGAAGTTCATTGGTAGAGGAAGGGAAGCATGATGCTCTTCGAGAAACGTTTAA 953
Query 1929 TGCTTTGGCAGACAAA-AATGGATCCGTATCTGCTGAGCC 1967
|||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||
Sbjct 954 TGCTTTGGAAGA-AAATAATGGACCCAAATCTGCTGAGCC 992
Score = 499 bits (270), Expect = 6e-140
Identities = 325/350 (93%), Gaps = 10/350 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1153 CAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACTCTGTGATTATTCTCGATGAAGCCCATGAAAGA 1212
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 259 CAGAAGGATTTCTTATTGAGGCGTTACTCTGTGATTATTCTCGATGAAGTCCATGAAAGA 318
Query 1213 AGCTTGAACACAGACATTCTAATTGGGATGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGGAA 1272
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 319 AGCTTGAACACAGACATTCTCATTGGGATGCTCACTCGAGTCATTAAAATCCGACAGGAA 378
Query 1273 TACTACGAGGAACAACAAAAGAGTCTTCAATCTGGAGGCA-CAGTA-ACCTCAGAATGCC 1330
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | | | |||
Sbjct 379 TACTACGAGGAACAACATAAGAGTCTTCAATCTGGAGG-ATTAGTAGA-C-C--AAT--- 430
Query 1331 AAATCACGCCACTTAAACTTATATTGATGAGTGCGACTTTGCGAGTGGAAGATTTTGTAT 1390
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 431 TTATCACACCACTTAAACTTATATTGATGAGTGCGACTTTGCGGGTGGAAGATTTTGTAT 490
Query 1391 CGGGGAAAAGGTTATTCCCTAATATACCTCCTCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATC 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 CGGGGAAAAGGTTATTCCCTAATATACCTCCTCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATC 550
Query 1451 CAGTAACTATACATTTCTCCAAGAAGACTGAGATTGTTGATTATATAGGT 1500
|||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 551 CAGTTACTATACATTTCTCCAAGAGGACTGAGGTTGTTGATTATATTGGT 600
Score = 361 bits (195), Expect = 3e-98
Identities = 245/269 (91%), Gaps = 3/269 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3267 CGAGCTCCTACTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCGACTCGGGTGAGGCCAG-AAT 3325
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||
Sbjct 2112 CGAGCTCCTACTCACCAACAAACCGTACATGCACAGAGCGACACGGGTGAAGCC-GAAAT 2170
Query 3326 GGCTGGTGAAGCACGCAAAGTCTCTCTGCGTGTTCTCTGCACCGCTCAAGGACCCGAAAC 3385
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 2171 GGCTGGTGAAGCACTCAAAGTCTCTCTGCGTGTTCTCCACACCACTCAAGGACCCGAAAC 2230
Query 3386 CATATTACTCAAGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGGTCGTTCCGAGTTTCGGTCCTC 3445
|||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 2231 CATATTACTCGAGTGAGGGGGATAGAGTTATGTGCTGGGCCGTTCCGAGTTTTGGTCCTC 2290
Query 3446 ATAATTGGGAACTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATAGAGACCGAGCAGCGG 3505
||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2291 GTAACTGGGGGCTTCCAGCTCACAGTGTGGCAATAACAGAGGATATACACCGAGCAGCGG 2350
Query 3506 CTTTCGGATGCGCTTTGCTTCAAGGAGAG 3534
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2351 -TTTCGGATGCGCTTTGCTTCAAGGAGAG 2378
Score = 243 bits (131), Expect = 1e-62
Identities = 163/179 (91%), Gaps = 0/179 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 921 TCAGTTCCTTTATGAAGCTGGTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAAGTGGGATTAT 980
|||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 69 TCAGTTTCTTTATGAAGCTGGTTTAGGTTTAAAGCAATTCACTTCTCGAAGTGGGATTAC 128
Query 981 CGGGATTACCCAACCACGCCGTGTCGCCGTTCTTGCCACTGCCAAGAGAGTGGCATTTGA 1040
| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 CAGGATTACTCAACCACGCCGTGTTGCTGTCCTTGCCACTGCCAAGAGAGTGGCATTTGA 188
Query 1041 GCTTGGTGTTCGTCTTGGTAAAGAGGTTGGGTTTCAAGTTAGGTACGACAAAAAGATTG 1099
|||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 189 GCTTGGACTTCGTCTCGGTAAAGAAGTCGGGTTTCAAGTTAGATACGACAAAAAGATTG 247
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 153714537347
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5