BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G33410.1
Length=4716
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg473514 jgi|Araly1|473514|fgenesh2_kg.1__3468__AT1G33410.1 4492 0.0
> Ahg473514 jgi|Araly1|473514|fgenesh2_kg.1__3468__AT1G33410.1
Length=4464
Score = 4492 bits (2432), Expect = 0.0
Identities = 2651/2757 (96%), Gaps = 14/2757 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1539 AGTCAGATGTTATTGGTTTAGTTAGAAATAATTCTGTATCACTGTTTTTTAGATTGGAGA 1598
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1409 AGTCAGATGTTATTGGTTTAGTTAGAAACAATTCTGTATCATTGTTTTTTAGATTGGAGA 1468
Query 1599 ACGCTGAGCACAGCCTTGGAGGTTCTTCCTCCGAACACAGCAACCTGACGAGCTTAGACT 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||
Sbjct 1469 ACGCTGAGCACAGCCTTGGAGGTTCTTCCTCCGAACACAGCAATCTGACAAGCTTAGGCT 1528
Query 1659 TGGGCGTGTCTCACAGCGACCATGAAATTCTGGCAGAGGTACTAAGATGTACTTCGAAGA 1718
|||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 TGGGTGTGTCTCACAATGAACATGAAATTCTGGCAGAGGTACTAAGATGTACTTCGAAGA 1588
Query 1719 TCAGTAAACAGTGGGGTGGTGCTCCTTATGCCATGTATTATGAATCAATTACCGGAAGGC 1778
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1589 TCAGTAAACAGTGGGGTGGTGCTCCTTATGCCATGTATTATGAATCAATTACTGGAAAGC 1648
Query 1779 CAATTATCTCATCGGATGAAATCGTTCCTCGCTTAGTTAACATCCTTGAGTCGGGATATT 1838
|| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1649 CAGTTATCTCATCTGATGAAATTGTTCCTCGCTTAGTTAACATCCTTGAGTCGGGATATT 1708
Query 1839 CTACGACCATAGGTCAACGTACTTGGTCAGATCTTGGTGCTGATAGAGCATGGGAAAAAG 1898
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 CTACAACCATAGGTCAGCGTACTTGGTCAGATCTTGGTGCTGATAGAGCATGGGAAAAAG 1768
Query 1899 AGCTAGAAGCTCATAAAAATCTTAGAACATTCTCCATTGACATGCTGCTGTCTCTCTCTG 1958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1769 AGCTAGAAGCTCATAAAAATCTTAGAACATTCTCCATTGACATGCTATTGTCTCTCTCTG 1828
Query 1959 CTCTATGTCAAAGGGCTGGATCTTGGGAAAAAGTCTTTACTATCATGGAGCACTATTTGC 2018
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 CTCTATGTCAAAGGGCTGGATCTTGGGAAAAAGTTTTTACTATCATGGAGCACTATTTGC 1888
Query 2019 AGTATTTGGTCCCTAAAAAATCTATGC-AGAAAAATGATGGTGAGGCATTATCTGATATC 2077
|||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1889 AGTATTTGGTCCCTAAGAAATCTATGCAAG-AAAATGATGGTGAGGCATTATCTGATATC 1947
Query 2078 TGTAGTTCTATCCTCGTCCAAGCCACTTCTCAGTTTGTAAAGGTGATGTTTGAGTCGGCA 2137
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1948 TGTAGTTCTATCCTCGTCCAAGCAACTTCTCAGTTTGTAAAGGTGATGTTTGAGTCAGCA 2007
Query 2138 TTTGACATCTTCCTACTCATCAGCTATCTGCTTAACATCGCTGGGCAGGTTAATATGTCA 2197
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 2008 TTTGACATCTTCCTACTGGTCAGCTATCTGCTTAACATTGCTGGACAGGTTAATATGTCA 2067
Query 2198 CAGCAAGACATATGCAAGCTACGGCTTGAGTTGCTTCCAATGATCCAAGATATTGTCTCA 2257
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2068 CAGCAAGACATGTGCAAGCTACGGCTTGAGTTGCTTCCGATGATCCAAGATATTGTCTCA 2127
Query 2258 GAGTGGCTCATCATCCTTTTCTTTGTTACCACTCCAGCTGAGTCAACTTCTATGGAAGAT 2317
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128 GAGTGGCTCATTATCCTTTTCTTTGTTACCACTCCAGCTGAGTCAACTTCTATGGAAGAT 2187
Query 2318 TTCAGCTTGAAACTTTCATCTCTACAGATTGATAGCAGCATTGACAAAAGATCATGGAAC 2377
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2188 TTCAGCTCGAAACTTTCATCTCTACAGATTGATAGCAGCATTGACAAAAGATCATGGAAC 2247
Query 2378 GCAATGCTAGGGAAATGTGGTTTCTCACTGGCGTTTATTCTTCTCTTTAGTGACCGAAGT 2437
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2248 GCAATGCTTGGGAAATGTGGTTTCTCATTGGCGTTTATTCTTCTCTTTAGTGACCGAAGT 2307
Query 2438 TGCATTGTGGATGGCCGCTTTAACTTGAGATATCTTCCGAGTTCACAAATCATTACAAGT 2497
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2308 TGCATTGTGGACGGCCGCTTTAACTTGAGATATCTTCCGAGTTCACAAATCATTACAAGT 2367
Query 2498 TTGGTGCAAAACTTTATCAGCTGGATTCGGTATAGTAAAACAGGAGATGACTCTTCTTCA 2557
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2368 TTGGTGCAAAACTTTATCAGCTGGATTCGTTATAGTAAAACAGGAGAGGAGTCTTCTTCA 2427
Query 2558 CTGCTAAGACGCTCCACGGAACTTAGTCTTAGGTTGATTCGGAATGGACAATCTGATGCT 2617
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 CTGCTAAGACGCTCCACTGAGCTTAGTCTTAGGTTGATTAGGAATGGACAATCTGATGCT 2487
Query 2618 GTTGAGCGAATCCTTGTGGTTGTGGAGGCAAGTTTACGTGGGGAGAAAACATTTGGATGT 2677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2488 GTTGAGCGAATCCTTGTGGTTGTGGAGGCAAGTTTACGTGGGGAGAAAACATTTGGATGT 2547
Query 2678 TCTCAAGATACTAGTGGAGATTGGTGTCTTCTTCAACATCTCCGTGGTTGTTGCCTTCTT 2737
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2548 TCTCAAGATACTAGTGGGGATTGGTGTCTTCTTCAACATCTCCGTGGTTGTTGCCTTCTT 2607
Query 2738 GATCAAGTACAACGTGGTGCAAGTGGCATATTAAGAGAGAGAAAGATTATTGATGCCATC 2797
||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2608 GATCAAGTACAACGTGGGGCATGCGGCATATTAAGAGAGAGGAAGATTATTGATGCCATC 2667
Query 2798 CGCTGCTTCTTCAGAGCTTCATCAGGTGAAGGATCTTGGAAGGCTTTGCACAGCTTGTCT 2857
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2668 CGCTGTTTCTTCAGAGCTTCATCAGGTGAAGGATCTTGGAAGGCTTTACACAGCCTGTCT 2727
Query 2858 AAAGAAGCAGGATTTTCACCTGCCACAACGGGTCCAAGTATTTTAGATGGTTCTACGTCT 2917
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2728 AAAGAAGCAGGATTTTCACCTGCGACAACGGGTCCCAGTATTTCAGATGGTTCTATGTCT 2787
Query 2918 TCTGCAG-CATGGAAACTTCATTACTAT-GAGTGGGCTATGCAAATTTTTGAACGGTACA 2975
| ||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2788 TGTGC-GACATGGAAACTTCAGTACT-TCGAGTGGGCTATGCAAATTTTTGAACGGTACA 2845
Query 2976 ATATAAGTGAAGGAGCTTGTCAGTTTGCCTATGCAGCCCTTGAGCAAGTAGATGATGCCT 3035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2846 ATATAAGTGAAGGAGCTTGTCAGTTTGCCTATGCAGCCCTTGAGCAAGTAGATGAGGCCT 2905
Query 3036 ATAATTTCATAGAGATGACTGAGGAATTCGATCCAACTAAAGCAGCCACCTACACTAGAG 3095
|| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2906 ATGATTTCATAGAGAGGACTGAGGAATTCGATCTAACTAAAGCAGCCACCGACACTAGAG 2965
Query 3096 GACGACTGTGGGCAAATGTTTTCAAGTTCACCTTAGATCTCAATCTCTTGAATGATGCCT 3155
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |
Sbjct 2966 GACGACTGTGGGCAAATGTTTTCAAGTTCACCTTAGATCTGAATCTCTTGAACGACGCTT 3025
Query 3156 ACTGTGCTATAATTTCAAACCCTGATGAGGAGATTAAGCGCATCTGTTTGAGGCGCTTCA 3215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3026 ACTGTGCTATAATTTCAAACCCTGATGAGGAGATTAAGCGCATCTGTTTGAGGCGCTTCA 3085
Query 3216 TAATAGTTCTATTTGAATGTGGCAAAACGAAGATCCTCAGTGATGGACATCTACCTTTCA 3275
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3086 TAATTGTTCTATTTGAATGTGGCAAAACAAAGATCCTCAGTGATGGACATCTACCTTTCA 3145
Query 3276 TCGGCT-TAACAGAGAAGATCACCCAAGAGCTTTTTTGGAAGGCCGGACGTTCTGATATA 3334
|||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3146 TCGG-TCTAACAGAGAAGATCACCCAAGAGCTTTTCTGGAAGGCCGGACGTTCTGAAATA 3204
Query 3335 ATGATGAAGCCAAATCCATACAAGCTGCTTTATGCTTATGAGATGAGACGACACAATTGG 3394
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3205 ATGATGAAGCCAAATCCATACAAGTTGCTTTATGCGTATGAGATGAGACGACACAATTGG 3264
Query 3395 CGAATGGCGGCAAGTTACATGTATCAGTTTTCTGCCCGTTTGAGAAGCGAGGGAGCATGC 3454
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3265 CGAATGGCGGCAAGTTACATGTATCAGTTTTCTGCCCGTTTGAGAAGCGAGGCTGCATGC 3324
Query 3455 AAGGATTACAAACACATGTCCCTAGTTTTGCAAGAGAGGCTTAATGGACTTTCTGCTGCT 3514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3325 AAGGATTACAAACACATGTCCCTAGTTTTGCAAGAGAGGCTTAATGGACTTTCTGCTGCT 3384
Query 3515 ATGAATGCATTAGCCCTTGTTCATCCTGGGTATGCTTGGATTGATCCAGTACCAGAAGAA 3574
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3385 ATTAATGCATTAGCCCTTGTTCATCCTGGGTATGCTTGGATTGATCCAGTACCAGAAGAA 3444
Query 3575 ACCACACGTTATCCGGTTAAAAAGGCTAGAAGAGCAGAAGAAGAACAATTAAGGAGTAAT 3634
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3445 TCCACACGTTATCCAGTTAAAAAGGCTAGAAGAGCAGAAGAAGAACAATTAAGGAGTAAT 3504
Query 3635 GACCAGCCCAAAGGGGAGAAGAGTTGCATTGATATCGAGAAACTCCAAAACGAGTTTGTT 3694
| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3505 G---A---CAAAGGGGAGCAGAGTTGCATTGATATCGAGAAACTTCAAAACGAGTTTGTT 3558
Query 3695 TTTACTACTGCTGAATATATGCTTTCTCTGAAAAATTTCGGGTGGACATATTCAGGACTC 3754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3559 TTTACTACTGCTGAATATATGCTTTCTCTGAAAAATTTCGGGTGGACATATTCAGGACTC 3618
Query 3755 GAAAAGCCACCATCAGATTTGGTTGACCTTCTTGTCCAGGCAAACTTGTATGACATGGCA 3814
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3619 GAAAAGCCACCATCGGATTTGGTTGACCTTCTTGTCCAGGCAAACTTGTATGACATGGCA 3678
Query 3815 TTCACTGTTGTTTTGAAATTTTGGAGGGGCTCCGCTTTGAAAAGGGAGCTGGAAAAGATA 3874
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3679 TTCACTGTTGTTTTAAAATTTTGGAGTGGCTCCGCTTTGAAAAGGGAGCTGGAGAAGATA 3738
Query 3875 TTTGAGAATATGGCAATTAAATGTTGCCCTGCTAAAGGAACTCTGTGGTCATCGCCTAAT 3934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||
Sbjct 3739 TTTGAGAATATGGCAATTAAATGTTGCCCTGCTAAAGGAGCGCTGTGGACATCGCCTAAT 3798
Query 3935 CTTATGTTAACATCTAACGATGAAGAAGTTACTCATTCGCCTGATAGAAGCCCTGCTGAT 3994
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3799 CTTATGTTAATATCTAACGATGAAGAAGTTACTCATTCGCCTGATAGAAGCCCTGCTGTT 3858
Query 3995 CAGGGCTCTAAGTTGGCTGGTGATTGGGAAATTCTTGAGGTTTATCTGAAGAGGTACATA 4054
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3859 CAGGGCTCTAAGTTGGCTGGTGACTGGGAAATTCTTGAGGTTTATCTGAAGAGGTACATA 3918
Query 4055 GACATACACGCTAGACTACCGGTTTCTGTTGCTTCAACCCTTCTTCAAGCAGATTCTTGT 4114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3919 GACATACACGCTAGACTACCGGTTTCTGTTGCTTCAACCCTTCTTCAAGCAGATTCTTGT 3978
Query 4115 ATCGAATTGCCTCTCTGGCTGATTCAAATGTTCAAGGATGGTCAGAAGGAAAAAGCTTTG 4174
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3979 ATCGAATTGCCTCTCTGGCTGGTTCAAATGTTCAAGGACGGTCAGAAGGAAAAAGCTTTG 4038
Query 4175 GGAATGGCTGGGCAAGAAGCAAGTCCTGCTTCCTTGTTTCAGTTATATGTTGATTATGGG 4234
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4039 GGAATGGCTGGGAAAGAAGCAAGTCCTGCTTCCTTGTTTCAGTTATATGTTGATTATGGG 4098
Query 4235 CGTCTTACAGAGGCAACTAATTTGCTACTTGAGTACATGGAATCATTTGCTTCATCG 4291
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 4099 CGTCTTACAGAGGCCACTAATTTGCTACTGGAGTACATGGAAGCATTTGCATCATCG 4155
Score = 2172 bits (1176), Expect = 0.0
Identities = 1332/1410 (94%), Gaps = 0/1410 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 23 ATGGAGGAGAATCGTCGGAATCCGTCGGCCGGTATGGAAGTTCCAGTTGCCGGCGGCGGA 82
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGAGAATCGTCGGAATTCGTTTGCCGGTATGGAAGTTCCAATTGCCGGCGGCGGA 60
Query 83 AATGTCGTCAAATGGATTGAGATATCTGTTCCTTCACCTTCTGTTTCATCTTCTAGTATC 142
|||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 AATGTCGTTAAATGGATCGAGATATCTGTGCCTTCACCATCTGTTTCTTCTTCTAGTATC 120
Query 143 GGTGCTAATTCAAGTGAGGACAATGAGTGTGTTCAGCTTCCTTTGTCTGAAGACTACGCT 202
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||
Sbjct 121 GGTGCTAGTTCAAGTGAGGACAATGAATGTGTTCAGCTTCCTTCGTATGAAGATTACGCT 180
Query 203 TCTAGCTCTGTAATTGGGGAACCTTCGATCTCTTTCGTTTGGAGAATCAACAAGACGAGT 262
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTAGCTCTGTAATTGGAGAACCTCCGATCTCTTTCGTTTGGACAATCAACAAGACGAGT 240
Query 263 CCAAATGCTCTCGAGCTTCTTCAGCTCTCAGCTAAGTCTGGATTTCCAATAACAGGACTG 322
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||
Sbjct 241 CCTAATGCTCTCGAGCTTCTTCAGCTCTCTGCTAAATCGGGATTCCCAATAACTGGGCTG 300
Query 323 CGTTTCGTCTTTGCTCAGACTCTTTCTCCTTTTGCTTTTGTATACGCCGATGAGGGTGGT 382
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 301 CGTTTCCTTTTTGCTCAGACTCTTTCTCCTTTTGCTTTTGTATACGCCGATAAGGGTAGT 360
Query 383 GATAGTGGTCGTCTTGTCTACTTTCTTTACTCTCTCACGCCGTCTGGTGTTGTCTACGTT 442
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GATAGTGGTCGTCTTGTCTACTTTCTTTACGCTCTCACGCCGTCTGGTGTTGTCTACGTT 420
Query 443 CTTAAACTCTCGAATACGTTAGCATATAAGTCTGGTTCAGTCTTCCCGCTTGATCATTTG 502
|| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||
Sbjct 421 CTGAAACTATTGAATACGTCAGCCTATAAGTCTGGCTCAGTTTTCCCGGTTGATCATCTG 480
Query 503 ATTCACTTGGATGTTCGACCTTACTTGAACGAGAGTCGTGTTACTAGTGTTGCTGCATCG 562
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 481 ATTCACTTGGATGTTCGACCTTACTTGAACGAGACTCGTGCTACTAGTGTTGCTGCATTG 540
Query 563 CCTGGTTTCATTTTTCTCGGGAGGTCCGATGGTTGTGTCTCTTGCTTCCAACCTATTGTG 622
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 541 CCTGGTTTCATTTTTCTCGGGAGGTCTGATGGTTGTGTCTCTTGCTTCCAACCTGTTGTG 600
Query 623 TATTTTCAGAAATCTTCAGGTTTCCACCAGGAGCTGCGTGATGATACAGGATTTGGTCGT 682
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 601 TATTTTCAGAAATCATCAGGATTCCACCAGGAGCTGCGTGATGATACTGGGTTTGGTCGT 660
Query 683 CTGGGGACAGTTGTTGCAGCCGTGCAAGATTTATTTATATCAGAAGTTCATGGAAGAAAT 742
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTGGGGACAGTGGTTGCAGCCGTACAAGATTTATTTATATCAGAAGTTCATGGAAGAAAT 720
Query 743 TATCTATGTGTGCTTCATGCTGACGGGGCATTACGTGTCTGGGATATTTTGACTTATAGC 802
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TATATATGTGTGCTTCATGCTGATGGGGCATTACGTGTTTGGGATATTTTGACTTATAGC 780
Query 803 AGGGTTTTATGTCAGAGTATAGCTGCTAAGAACCTTGAGGGGGTTATGTGTGTGAGGTTA 862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGGGTTTTATGTCAGAGTATAGCTGCTAAGAACCTTGAGGGGGTTATGTGTGTGAGGTTA 840
Query 863 TGGTTGGGCAAAGCTGATTACGATTCTGGCATCATTCCATTAGCTGTCTTGTATAGAAAG 922
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 841 TGGTTGGGCAAAGCTGATTACGATTCTGGAATCATTCCATTAGCCGTCTTGTATAGAAAG 900
Query 923 AGTATGAATGACAGCATGGACGTGATCACTGTATATGGCCTGCACTTTAGTTCTGCGGAG 982
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 901 AGTATGGATGATAGCATGGACGTGATCACTGTATATGGTCTGCACTTTAGTTCTGGGGAG 960
Query 983 GGGATAGCTTTGTCTCTAGATTCTGGATTACAGAATATACCACTGGAAGAGGGGGAATTG 1042
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GGGATAGCTTTGTCTCTAGATTCTGGATTACAGAATATTCCACTGGAAGAGGGGGAATTG 1020
Query 1043 CGGGATGTCAGATTTACATCCGACAAGATCTGGACTCTAAAGGCCAATGAATTAACATCT 1102
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1021 CGGGATGTCAGATTTACGTCCGACAAGATCTGGACTCTAAAGGCCGATGAATTGACATCT 1080
Query 1103 TACATGTTGTGCCAGAAATCTAGCACCATGGAAGCGCAGTCTTACACGTTGCAGGAAGAC 1162
||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1081 CACATGTTGTTCCAGAAATCTAGCACTATGGAAGCACAGTCTTACACTTTGCAGGAAGAC 1140
Query 1163 TACATTTCTGAACAGCTATTTCTGAGTTCTAGGAGCTCTTCACATGATCTTCTTTTGACT 1222
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1141 TACATTTCTGAACAGCTATTTCTAAGTTCTAGGAGCTCTTCACAGGATCTTCTTTTGACA 1200
Query 1223 ACTCATTCACTGTTTTCATCCGCAAAGGATCAAATTATGGGATTCATTTCGTCAATCTTC 1282
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1201 ACTCATTCACTGTTTTCATCCGTAAAGGATCAAATTATGGGATTCATTTCGTCGATCTTC 1260
Query 1283 TTACGCAGGCTTCTTTGTCCTGGAATTTTTCACAATGTTGCCTTACGTCTAACTTTACTG 1342
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1261 TTACGCAGGCTTCTTTGTCCTGGAATTTTTCATAATGTTGCCTTGCGTCTAACTTTACTA 1320
Query 1343 GACCACAACAAAAACTGGACTGATTCCGAGTTTCAATCTTTAAGTCTTGATGAGCTTACA 1402
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GACCACAACAAACACTGGACTGATTCTGAGTTTCAGTCTTTAAGTCTTGATGAGCTTACA 1380
Query 1403 AGCGAGATTCTTTTACTGGTTGAGCATGAG 1432
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 AGCGAGATTCTTTTACTGGTTGAGCATGAG 1410
Score = 425 bits (230), Expect = 1e-117
Identities = 266/283 (94%), Gaps = 3/283 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4319 AAACCAGCAGAGGTATTGAAGAGGAAAAAGGTATCCGGAGTTTGGTTTCCGTACACAACA 4378
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4156 AAACCAGCAGAGGTATTGAAGAGGAAAAAGGTATCAGGAGTTTGGTTTCCATACACAACA 4215
Query 4379 GTAGAAAGACTATGGTGGGAGCTAGAGAAAACAATGAACTCAGGACGAATGGTGGAGCAA 4438
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4216 GTAGAAAGACTATGGTGGGAGCTAGAGAAAACGATGAACTCAGGACGGATGGTGGAGCAA 4275
Query 4439 TGCCATAAGCTGAAGGAACAACTTCATCATGCATTACTCAATCACTTAAAACTGCTTAAG 4498
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4276 TGTCATAAGCTGAAGGAACAACTCCATCATGCATTACTCAATCACTTAAAACTGCTAAAG 4335
Query 4499 GTGGACTCAAATGATGCTGTATCCTCTGCAACCGGTTAAAGAAAGTCTTGATTGTTCCGT 4558
|||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 4336 GTGGACTCAAATGATGCTGTGTCGTCTGCTACAGGTTAAAGAAAGTCTTGTTTGATCCGT 4395
Query 4559 GTGAATATTATTATATCTGTATCAAAA-TCGTATCAGGCTTTT 4600
||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 4396 GTGAATATTAT-A-ATCTGTATGAAAAATCGTATCAGGCTTTT 4436
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 178451959797
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5