BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G36280.1

Length=1785
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg930346 jgi|Araly1|930346|scaffold_302803.1                       2577    0.0  
  Ahg493016 jgi|Araly1|493016|fgenesh2_kg.7__2449__AT4G18440.1        2182    0.0  
  Ahg320487 jgi|Araly1|320487|fgenesh1_pm.C_scaffold_4000544           300    3e-80


> Ahg930346 jgi|Araly1|930346|scaffold_302803.1
Length=1697

 Score = 2577 bits (1395),  Expect = 0.0
 Identities = 1553/1628 (95%), Gaps = 16/1628 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  141   CTTATACCCATAAGAAGTCTT-TTAAACCCATCAAAATCTCTGT--C-TCAT---CTTCC  193
             ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||   |||||
Sbjct  75    CTTATACCCACCAGAAGT-TTCTTAAACCCATCAAAATCTCTGTGCCATCATCAGCTTCC  133

Query  194   AAGAGTTTCATTCTCTGTTTCTTCTCC-TCATTCTCTCAAGCTAATGACTTCAACAAA-G  251
             ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct  134   AAGAGTTTCATTCTCTGTTTCTTCTCCGT-ATTCTCTCAAGCTAATGACTTCAAGAAAGG  192

Query  252   TTGATAGCAATGGCTAGTGCAAGTTCCAGAGACTTTGAGATGTCGAATTTAACAGCATTA  311
             || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193   TT-ATAGCAATGGCTGGTGCAAGTTCCAGAGACTTGGAGATGTCGAATTTAACAGCATTA  251

Query  312   TCGCCTTTGGATGGACGTTATTGGGGAAAAGTTAAGGACTTGGCTTCTTCTATGAGCGAG  371
             |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct  252   TCGCCTTTGGATGGACGTTACTGGGGGAAAGTTAAGGAATTGGCTTCTTCTATGAGTGAG  311

Query  372   TTTGGATTGATCTATTTCCGAGTACTTGTCGAGATCAAATGGCTTATTAAGCTTTCAAAT  431
             ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  312   TTTGGGTTGATCTATTTCCGTGTACTTGTCGAGATCAAATGGCTTCTTAAGCTTTCAAAT  371

Query  432   ATACCTCAAGTCACTGAAGTTCCAAGCTTTAGCAAAGAAGCTCATAAGTACTTGCAAGGT  491
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| 
Sbjct  372   ATTCCTCAAGTCACTGAAGTTCCAAGCTTTAGCAAAGAAGCTCAGATTTACTTGCAAGGC  431

Query  492   ATAATCGATGGATTTAGTATGGATGATGCATTGCAAGTTAAGAAGATTGAGAGAGTGACA  551
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||
Sbjct  432   ATAATCGATGGATTTAGCATGGATGATGCATTGGAAGTTAAGAAGATCGAGAAAGTAACA  491

Query  552   AATCACGATGTGAAAGCAGTGGAGTATTTTTTGAAACAAAAGTGTGAATCACATCCAGAG  611
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  492   AATCACGATGTGAAAGCAGTGGAGTATTTCTTGAAACAAAAATGTGAATCACATCCAGAG  551

Query  612   ATTGCTAAGGTTCTAGAGTTTTTCCATTTCGCTTGTACGTCTGAGGACATCAACAATCTT  671
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  552   ATTGCTAAGGTTCTTGAGTTTTTCCATTTCGCTTGCACGTCGGAGGACATCAACAATCTT  611

Query  672   TCCCATGCTTTGATGCTTCAAGAAGCACTTAGTTCGGTTATACTTCCTA-CCATGGATGA  730
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct  612   TCCCATGCTTTGATGCTTCAAGAAGCACTTAGTTCGGTTATACTTCC-AGCCATGGATGA  670

Query  731   GTTGATCAAGTCTATCTCTCTGATGGCTAAGAGCTTTGCATATGTACCTATGCTTTCACG  790
             | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct  671   GCTGATCAAGTCTCTCTCTCTGATGGCTAAGAGCTTTGCATATGTCCCCATGCTTTCACG  730

Query  791   AACTCATGGGCAGCCAGCTTCACCTACAACATTGGGGAAGGAAATGGCGATTTTTGCTGT  850
             |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  731   AACTCACGGACAGCCAGCTTCACCTACAACTTTGGGGAAAGAAATGGCGATTTTTGCTGT  790

Query  851   GAGGTTAAGTGTAGAAAGGAGATATCTTTCAGAAACTAAGATTAAGGGGAAATTTGCGGG  910
             ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  791   GAGGTTAAGCGAAGAAAAGAGATATCTTTCAGAAACCAAGATTAAGGGGAAATTTGCGGG  850

Query  911   TGCTGTTGGAAACTACAACGCGCATATTTCCGCGTATTCTAATATTGACTGGCCTCATGT  970
             ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  851   TGCTGTTGGGAACTACAACGCCCATATTTCTGCATATTCTAATATCGACTGGCCTCATGT  910

Query  971   TGCAGAGGAGTTTGTTACTTCTCTTGGATTAACATTTAACCCATACGTGACTCAGATTGA  1030
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911   TGCAGAGGAGTTTGTTACATCTCTTGGATTAACATTTAACCCATACGTGACTCAGATTGA  970

Query  1031  ACCACATGACTATATGGCTAGACTTTTTAATACAATTAGCCAATTCAACAATGTCTTGAT  1090
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  971   ACCCCATGACTATATGGCTAGACTTTTTAATACAATTAGCCAATTCAACAATATCTTGAT  1030

Query  1091  TGATTTTGACAGAGATATATGGAGCTACATATCTCTAGGTTACTTTAAGCAGATAACTAA  1150
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1031  TGATTTTGACAGAGATATATGGAGCTACATATCTCTAGGGTACTTTAAGCAGATAACTAA  1090

Query  1151  AGCGGGTGAAATCGGATCATCGACAATGCCTCACAAAGTGAATCCTATTGACTTTGAGAA  1210
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1091  AGCGGGTGAAATCGGATCATCGACAATGCCTCACAAAGTGAATCCTATTGACTTTGAGAA  1150

Query  1211  CAGCGAAGGGAATCTAGGTAAAGCAAATGCAGAGCTTGCTTTTCTCAGCATGAAGCTTCC  1270
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1151  CAGTGAAGGGAATCTAGGTAAAGCAAATGCAGAGCTTGCTTTTCTCAGCATGAAGCTTCC  1210

Query  1271  CATTTCACGAATGCAGCGTGATTTAACAGATTCAACTGTCTTGAGAAACATGGGTGGAGC  1330
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1211  CATTTCACGAATGCAGCGTGATTTAACCGATTCAACTGTCTTGAGAAACATGGGTGGAGC  1270

Query  1331  TTTAGGACACTCTCTTCTGGCTTACAAGAGCGCGATACAGGGAATTGGGAAGCTTCAGGT  1390
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1271  TTTAGGACACTCTCTTCTGGCTTACAAGAGCGCGATACAGGGAATTGGGAAGCTTCAGGT  1330

Query  1391  TAATGAAGCTCGGTTAAAAGACGATTTGGATCATACTTGGGAAGTCCTCGCTGAACCGAT  1450
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1331  TAATGAAGCTCGGTTAAAAGAAGATTTGGATCATACTTGGGAAGTCCTCGCTGAACCGAT  1390

Query  1451  ACAAACTGTGATGAGGAGATATGGTGTTCCAGAGCCGTATGAGAAGCTGAAGGAGCTAAC  1510
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1391  ACAAACTGTGATGAGGAGATATGGTGTTCCAGAGCCGTATGAGAAGCTGAAGGAGCTAAC  1450

Query  1511  AAGAGGAAGAGCTGTGAATGAAGAAAGCATTAGAAAGTTTATTAAAAGTTTGGAATTGCC  1570
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct  1451  AAGAGGAAGAGCTGTGAATGAAGAAAGCATTAGAAAGTTTATTACAGGTTTGGAATTGCC  1510

Query  1571  TGAAGAAGCAAAAGACCAACTTTTGAAGCTAACTCCACACACATATGTTGGCGCTGCTGC  1630
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1511  TGAAGAAGCAAAAGACCAACTTTTGAAGCTAACTCCACACACATATGTTGGCGCTGCTGC  1570

Query  1631  TGCATTGGCACTAGCCGTGGATGATGCTGTGCACTTGGGACATTAATAATATGATCATAT  1690
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1571  TGCATTGGCACTAGCCGTGGATGAAGCTGTGCACTTGGGACATTAATAATATGATCAAAT  1630

Query  1691  TGGTGTAGATGATTCTGCTTGTTGTATTATGATTTTCTTTTCCCAAATCCA-ATGGGAAA  1749
              ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||
Sbjct  1631  CGGTGTAGATGATGGTGCTTGTTGTATTATGATTTTCTTTGCCCAAATC-ATATGGGAAA  1689

Query  1750  ACAAGAAT  1757
             ||||||||
Sbjct  1690  ACAAGAAT  1697


> Ahg493016 jgi|Araly1|493016|fgenesh2_kg.7__2449__AT4G18440.1
Length=1833

 Score = 2182 bits (1181),  Expect = 0.0
 Identities = 1546/1714 (90%), Gaps = 57/1714 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  91    AAATGGAGCTCAATTTATCTTCGATGG------CC-A--CCAAAATCCCTTGTTCCGGCC  141
             |||||||||||||||||||||||||||      || |  |||||||||||| || |||  
Sbjct  73    AAATGGAGCTCAATTTATCTTCGATGGCTTTAACCAACCCCAAAATCCCTTCTTTCGGTT  132

Query  142   TTATACCCATAAGAAGTCTT-TTAAACCCATCAAAATC--T-C---T-G----TC-TCAT  188
             ||| |||||   ||| | ||  ||||||||||||||||  | |   | |    || ||||
Sbjct  133   TTACACCCACCGGAA-TATTCCTAAACCCATCAAAATCAGTGCGTTTGGCTTCTCATCAT  191

Query  189   ---CTTCCAAGAGTTTCATTCTCTGTTTCTTCTCCTCATTCTCTC-AAGCTAATGACTTC  244
                ||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||| | |||||| |||||||
Sbjct  192   CGGCTTCCGAGAGTTTCATGCTCTGTTTCTACTACTGATTCTC-CGAAGCTAGTGACTTC  250

Query  245   AACAAAGTTGATAGCAATGGCT--AGTGCAAGTTCCAGAGACTTTGAGATGTCGAATTTA  302
             || |||| || | |||||||||  ||||  || || |||||||| |||||||||||||||
Sbjct  251   AAGAAAGGTGGTGGCAATGGCTGGAGTG--AGCTCTAGAGACTTGGAGATGTCGAATTTA  308

Query  303   ACAGCATTATCGCCTTTGGATGGACGTTATTGGGGAAAAGTTAAGGACTTGGCTTCTTCT  362
             || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309   ACGGCATTGTCGCCTTTGGATGGACGTTATTGGGGAAAAGTTAAGGACTTGGCTTCTTCT  368

Query  363   ATGAGCGAGTTTGGATTGATCTATTTCCGAGTACTTGTCGAGATCAAATGGCTTATTAAG  422
              |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||
Sbjct  369   CTGAGCGAGTTTGGATTGATCTATTTCCGAGTATTTGTCGAGATCAAATGGCTTCTGAAG  428

Query  423   CTTTCAAATATACCTCAAGTCACTGAAGTTCCAAGCTTTAGCAAAGAAGCTCATAAG-TA  481
             ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||
Sbjct  429   CTTTCGAATATTCCTGAAGTCACTGAAGTTCCAAGCTTTAGCAAAGAAGCTCA-GAGTTA  487

Query  482   CTTGCAAGGTATAATCGATGGATTTAGTATGGATGATGCATTGCAAGTTAAGAAGATTGA  541
             ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct  488   CTTGCAAGGGATAATCGATGGATTTAGCATAGATGATGCATTGGAAGTTAAGAATATTGA  547

Query  542   GAGAGTGACAAATCACGATGTGAAAGCAGTGGAGTATTTTTTGAAACAAAAGTGTGAATC  601
             |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  548   GAGAATAACAAATCACGATGTGAAAGCAGTGGAGTATTTCTTGAAACAAAAGTGTGAATC  607

Query  602   ACATCCAGAGATTGCTAAGGTTCTAGAGTTTTTCCATTTCGCTTGTACGTCTGAGGACAT  661
             ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct  608   ACAACCAGAGATTGCTAAGGTTCTTGAGTTTTTCCATTTTGCTTGCACGTCTGAGGACAT  667

Query  662   CAACAATCTTTCCCATGCTTTGATGCTTCAAGAAGCACTTAGTTCGGTTATACTTCCTA-  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 
Sbjct  668   CAACAATCTTTCCCATGCTTTGATGCTTCAAGAAGCACTTAGTTCGGTTATACTTCC-AT  726

Query  721   CCATGGATGAGTTGATCAAGTCTATCTCTCTGATGGCTAAGAGCTTTGCATATGTACCTA  780
             ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |
Sbjct  727   CCATGGATGAGCTGATCAAGTCAATTTCTCTGATGGCTAAGAACTTTGCATATGTCCCCA  786

Query  781   TGCTTTCACGAACTCATGGGCAGCCAGCTTCACCTACAACATTGGGGAAGGAAATGGCGA  840
             ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || || || ||||||||||
Sbjct  787   TGCTTTCACGAACTCATGGGCAGCCAGCTACGCCAACAACTTTAGGAAAAGAAATGGCGA  846

Query  841   TTTTTGCTGTGAGGTTAAGTGTAGAAAGGAGATATCTTTCAGAAACTAAGATTAAGGGGA  900
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847   TTTTTGCTGTGAGGTTAAGTGAAGAAAGGAGATATCTTTCAGAAACTAAGATTAAGGGGA  906

Query  901   AATTTGCGGGTGCTGTTGGAAACTACAACGCGCATATTTCCGCGTATTCTAATATTGACT  960
             ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct  907   AATTTGCGGGTGCTGTTGGGAACTACAACGCCCATATTTCCGCATATTCGAATATTGACT  966

Query  961   GGCCTCATGTTGCAGAGGAGTTTGTTACTTCTCTTGGATTAACATTTAACCCATACGTGA  1020
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  967   GGCCTCATGTTGCAGAGGATTTTGTTACTTCTCTTGGATTAACATTCAACCCATACGTGA  1026

Query  1021  CTCAGATTGAACCACATGACTATATGGCTAGACTTTTTAATACA-ATTAGCCAATTCAAC  1079
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct  1027  CTCAGATTGAACCTCATGACTATATGGCTAGACTTTTTAATA-ATATTAGCCAATTCAAC  1085

Query  1080  AATGTCTTGATTGATTTTGACAGAGATATATGGAGCTACATATCTC-TAGGTTACTTTAA  1138
             ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||
Sbjct  1086  AATATTTTAATTGATTTTGACAGAGATATATGGAGCTACATATC-CATGGGGTACTTTAA  1144

Query  1139  GCA-G--A-T--AACTAAAGCGGGTGAAATCGGATCATCGACAATGCCTCACAAAGTGAA  1192
             ||| |  | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1145  GCAGGCAAGTACAACTAAAGCGGGTGAAATTGGATCATCGACAATGCCTCACAAAGTGAA  1204

Query  1193  TCCTATTGACTTTGAGAACAGCGAAGGGAATCTAGGTAAAGCAAATGCAGAGCTTGCTTT  1252
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||
Sbjct  1205  TCCTATTGACTTTGAGAACAGCGAAGGGAACCTAGGGAAAGCTAACGCAGAGCTTACTTT  1264

Query  1253  TCTCAGCATGAAGCTTCCCATTTCACGAATGCAGCGTGATTTAACAGATTCAACTGTCTT  1312
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1265  TCTCAGCATGAAGCTTCCCATTTCACGGATGCAGCGTGATTTAACCGATTCAACTGTCTT  1324

Query  1313  GAGAAACATGGGTGGAGCTTTAGGACACTCTCTTCTGGCTTACAAGAGCGCGATACAGGG  1372
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1325  GAGAAACATGGGTGGAGCTTTAGGACACTCTCTTCTGGCTTACAAGAGCGCGATACAGGG  1384

Query  1373  AATTGGGAAGCTTCAGGTTAATGAAGCTCGGTTAAAAGACGATTTGGATCATACTTGGGA  1432
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||
Sbjct  1385  AATCGGGAAGCTTCAGGTTAATGAAGCTCGTTTAAAAGAAGATTTGGATGATAATTGGGA  1444

Query  1433  AGTCCTCGCTGAACCGATACAAACTGTGATGAGGAGATATGGTGTTCCAGAGCCGTATGA  1492
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||
Sbjct  1445  AGTCCTTGCTGAACCGATACAAACTGTGATGAGGAGATACGGTGTCCCTGAGGCGTATGA  1504

Query  1493  GAAGCTGAAGGAGCTAACAAGAGGAAGAGCTGTGAATGAAGAAAGCATTAGAAAGTTTAT  1552
              ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct  1505  AAAGCTGAAGGAGCTAACAAGAGGAAAAGCTGTGAATGAAGAAAGCATAAGAACGTTTAT  1564

Query  1553  TAAAAGTTTGGAATTGCCTGAAGAAGCAAAAGACCAACTTTTG-AAGCTAACTCCACACA  1611
              ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct  1565  CAAAGGTTTGGAATTGCCTGCAGAAGCAAAAGACCAACTTTTGGAA-CTAACTCCACACA  1623

Query  1612  CATATGTTGGCGCTGCTGCTGCATTGGCACTAGCCGTGGATGATGCTGTGCACTTGGGAC  1671
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1624  CATATGTTGGTGCTGCTGCTGCATTGGCACTAGCCGTGGATGAAGCTGTGCACTTGGGAC  1683

Query  1672  ATTAATAATATGATCATATTGGTGTAGATGATTCTGCTTGTTGTATTATGATTTTCTTTT  1731
             ||| || ||  ||||| | ||||| | | |||| | ||  |||||||||| |  ||||||
Sbjct  1684  ATTGATGAT--GATCAAAGTGGTG-ATA-GATTGTCCTC-TTGTATTATGGTACTCTTTT  1738

Query  1732  CCCAAATCCAATGGGAAAACAAGAATCAGTTTAT  1765
             || ||||| ||||| |||||| || ||| |||||
Sbjct  1739  CC-AAATC-AATGG-AAAACA-GAGTCAATTTAT  1768


> Ahg320487 jgi|Araly1|320487|fgenesh1_pm.C_scaffold_4000544
Length=333

 Score =  300 bits (162),  Expect = 3e-80
 Identities = 212/235 (90%), Gaps = 8/235 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  261  ATGGCTAGTGCAAGTTCCAGAGACTTTGAGATGTCGAATTTAACAGCATTATCGCCTTTG  320
            |||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ATGGTTTGTGCAAGTTCCAGAGAGTTGGAGATGTCAAATTTAACAGCATTATCGCCTTTG  60

Query  321  GATGGACGTTATTGG-GGAAAAGTTAAGGACTTGGCTTCTTCTATGAGCGAGTTT-GGAT  378
            |||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  61   GATGGACGTTTTTGGAGGAAAT-TTAAGGAATTGGCTTCTTCTATGAGCGAGTTTAGG-T  118

Query  379  TGATCTATTTCCGAGTACTTG-TCGAGATCAAATGGCTTATTAAGCTTTCAAATATAC-C  436
            ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| || |
Sbjct  119  TGATCTATTTCCGAGCACTTGGT-GAGATCAAATGGCTTCCTAAGCTTTCAAATACACTC  177

Query  437  TCAA-GTCACTGAAGTTCCAAGCTTTAGCAAAGAAGCTCATAAGTACTTGCAAGG  490
            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||
Sbjct  178  TCAAAGTCACTGAAGTTCCAAGCTTTAGCAAAGAAGCTCAGATTTACTTGCAAGG  232



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 67000740955


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5