BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G42440.1 Length=2741 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg925613 jgi|Araly1|925613|scaffold_201174.1 3273 0.0 Ahg473739 jgi|Araly1|473739|fgenesh2_kg.1__3693__AT1G42440.1 1882 0.0 > Ahg925613 jgi|Araly1|925613|scaffold_201174.1 Length=2421 Score = 3273 bits (1772), Expect = 0.0 Identities = 2210/2420 (91%), Gaps = 35/2420 (1%) Strand=Plus/Plus Query 115 CCATGGGACGCTCTCGAGTTCAAGTTAACAAAGCTCACAAGACTCG-TTTCTCCTCTAAA 173 |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| Sbjct 19 CCATGGGAAACTCTAGAATTCAAGTTAACAAAGCTCACAAGACTAGATTT-ACCTCCAAA 77 Query 174 TCTTCTCGTAATCTCCATAGAACCAACCTTCAAGATAGTGGCCGGATTGGGAAATC-G-G 231 ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 78 TCTTCTCGTAATCTCCACAGAACTTCCCTCCAAGATAGTTGCCGGATTGGGAAATCAGAC 137 Query 232 A-TAGTAACTATGTTAAAGGAGCTAAAGCTGCTCGTGTTCAACGTGGTAAGATGCTTAGA 290 | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || Sbjct 138 AGTAATAACTATGTTAAAGGTGCTAAAGCTGCTCGTGTTCAGCGTGGCAAGATGCTTCGA 197 Query 291 GAGCAGAAGAGAGCAGCAGTTTTGAAGGAGAAGAGAGCATCAGGAGGAATT-AACAGTGC 349 |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 198 GAGCAGAAAAGGGCAACAGTTTTGAAGGAGAAGAGAGCATCAGGAGG-ATTAAACAGTGC 256 Query 350 TCCTCGTGTTATCGTTTTGTTTCCTCTCTCTGCTTCTGTGGAATTGAATTCACTTGGTGA 409 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 257 TCCTCGTGTTATCGTTTTGTTTCCTCTCTCTGCCTCTGTGGAATTGGATTCACTTAATGA 316 Query 410 AGATGTTTTGA-AGTTGTTATCTTCTGATGGTTCTGGAATTGCTTCTTCGACAGTTGCAT 468 |||| |||| | || | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 317 AGATCTTTT-AGAGCTATTATCTTCTGATGGTTCTGGGGTCACTTCTTCGACAGTTGCAT 375 Query 469 CTTCTGAGTATAAGC-TACGAGCAACTGTGTTAAAGGCGCCTCATGGGGATCTTCTGACA 527 ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct 376 CTTCTGAGTATAAGCTTA-AAGCAACCGTGTTAAAGGCACCTCATGGGGATCTTTTGACA 434 Query 528 TGTATGGAAATGGCCAAGGTTGCTGATTTGATGGCTTTTGTTGCATCTGCAAG-TGCTCC 586 || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 435 TGCATGGAAATGGCCAAGGTTGTTGATTTGATGGCTTTTGTTGCATCTGCAAGCT-CTCC 493 Query 587 GTGGGAAGAGAATAGCTCTAACT-TCATAGATTC-TTTCGGAAGTCAGTGTCTTTCTGTG 644 ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 494 ATGGGAAGAGAATAAATCTAACTAT-ATAGATTCATTT-GGAAATCAGTGTCTTTCTGTG 551 Query 645 TTTAGATCAATTGGTCTACCAAGCACTACTGTGTTGATCCGTGATTTGCCCAGTG-ATGT 703 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| || | Sbjct 552 TTTAGATCAATTGGTCTACCAAGCACCACTGTATTGATTCGTGATTTACCGAGTGAAT-T 610 Query 704 GAAAAAGAAAAATGAGATGAAAAAGATGTGTGCCTCTCAACTTGCTTCTGAATTTCCTGA 763 ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 611 AAAAAAGAAAAATGAGCTGAAGAAGATATGTGCCTCTCAACTTGCTTCTGAATTTCCTGA 670 Query 764 GGATTGTAAGTTTTATCCAGCAGATACCAGAGATGAGTTGCATAAGTTTATGTGGTTATT 823 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 671 GGATTGTAAGTTTTATCCAGCAGATACCAGAGATGAGTTGCATAAGTTTATGTGGTTATT 730 Query 824 CAAGGCGCAAAGGCTTACTGTGCCTCACTGGCGAAGTCAACGATCATACATTGTGGCTC- 882 ||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||| Sbjct 731 CAAAGCACAAAGGCTTACTGTACCTCATTGGCGGAGTCAAAGACCATATGTTGTGGCTCA 790 Query 883 GCAAGGCTGGGATGCTGGTGGATGATGAAAGCTCAGGAAAGTGCACTCTACTTCTCTCTG 942 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 791 G-AAGGTTGGGATGCTGGTGGATGATGAAAGCTCAGGAAAGTGCACTCTACTTCTCTCTG 849 Query 943 GTTACTTGCGTGCTCGCAAACTGTCTGTAAATCAACTGGTCCATGTTTCTGGCGTTGGGG 1002 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| | Sbjct 850 GTTACTTGCGTGCTCGCAAACTGTCTATAAATCAGCTGGTTCACGTTTCTGGCGTTGGTG 909 Query 1003 ATTTTCAATTCTCCAAAATTGAAGTGCTGAAGGATCCATTTCCTTTGAATGAAAGGAAAA 1062 ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 910 ATTTTCAGTTCTCAAAAATTGAGGTGCTAAACGAGCCATTTCCTTTGAATGAAAGGAAAA 969 Query 1063 ATCAGAATTCCATGGAATTAGATGATTCACATGATGAAGAGGTATTGAAGTCTCTGGTTC 1122 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 970 ATCAGAATTCCATGGAATTAGATGCTTTACATGATGAAGAGGTATTGAACTCTCTGGTTC 1029 Query 1123 CTGATCCCATGAAACAAGAGCCTTTAGTAATTGAAAACACTCCAGATCCTTTAGCAGGGG 1182 ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1030 CTGATCCTATAAAACAAGAGCCTTTAGTAGTTGAAAACACTCCAGATCCTTTAGCAGGGG 1089 Query 1183 AACAGACATGGCCAACAGAGGAAGAAATGGCTGAGGCTGACAAAAATCAGAAGCAGGGCA 1242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 1090 AACAGACATGGCCAACAGAGGAAGAAATGGCTGAGGCTGACAAAAATCAGAAACAGGGAA 1149 Query 1243 GGCTAAAGAAGAAGACTTTGCCGCGAGGGACTTCAGAATATCAGGCTGCTTGGATTGTGG 1302 | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1150 AGTTAAAGAAGAAGACTTTGCCAAGAGGGACTTCAGAATATCAGGCTGCTTGGATTGTGG 1209 Query 1303 ATGAAACAGATGAAGAGGATTCCGATAATGGTGATTCTGATGATAATGGTATGGTATTGG 1362 |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1210 ATGACACAGATGAAGAAGATTCTGATATTGGTGATTCTGATGATAACAGTATGGTATTGG 1269 Query 1363 ATAGAGGAGAGGATTCCAATCAAGAAGGAATGTATGACCAAGAATTTGAGGATGACGGAA 1422 |||||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1270 ATAGAGAAGAGGATGCCAATGAGGAAAGAAAGTATGACCAAGAATTTGAGGATGACGAAA 1329 Query 1423 AATCATTGAACCTGCGGGATATTGATACTGAAACTCAGAATGAATCCGAAATGGTGGACG 1482 ||||| ||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||| | Sbjct 1330 AATCACTGAACGTGCGGGATTTTGATAGTGGAACTCAGAATGACTCCGAGATGATGGATG 1389 Query 1483 ATGAAGACTTGACAGAAGAACAAATTAAGGATGAAATCAAGAAAATCAAAGAGGCATATG 1542 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct 1390 ATGAAGACTTGACAGATGAACAAATTAAGGATGAAATAAAGAAAATCAAAGAGGCACATG 1449 Query 1543 CTGATGACGAAGAATTTCCAGATGAAGTAGAGACTCCCATTGATGTTCCTGCAAGAAGAC 1602 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1450 CTGATGACGAGGAATTTCCAGATGAAGTAGAGACTCCCATTGATGTTCCTGCAAGAAGAC 1509 Query 1603 GTTTTGCAAAGTACAGGGGTCTTAAATCCTTCAGAACCTCCTCGTGGGATCCAAATGAGT 1662 |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1510 GTTTCGCAAAGTACAGGGGTCTTAAATCCTTCCGAACCTCCTCGTGGGATCCAAATGAGT 1569 Query 1663 CTTTACCTCAGGACTATGCTAGAATTTTTGCTTTTGATAATGTCGCAAGGACTCAAAAGC 1722 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| Sbjct 1570 CTCTACCTCAGGACTATGCTAGAATTTTTGCTTTTGATAACGTTGCCAGGACTCAAAAGC 1629 Query 1723 TTGTGCTCAAGCAAGCCCTGAAGATGGAAGAAGAAGACAGAGATGATTGTGTACCA-ATT 1781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | Sbjct 1630 TTGTGCTCAAGCAAGCCCTGAAGATGGAAGAAGAAGACAGAGATGATTGTGTAC-AGACT 1688 Query 1782 GGGTCATATGTACGGCTGCATATTAAAGAAGTGCCTCTTGGTGCTGCCTCTAAACTATCT 1841 ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 GGGTCATATGTCCGACTGCATATTAAGGAAGTGCCTCTTGGTGCTGCCTCTAAACTATCC 1748 Query 1842 TCTCTTGTGAACACAACGAAACCAATTATAGGATTTGGGCTTCTGCAGCATGAA-TCCAA 1900 || ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||| | || || ||| |||| Sbjct 1749 TCCCTTGTGAACACAA--AACCCA-TTATAGGATTTCGCCTTATACAACACGAAATCCA- 1804 Query 1901 GATGTCGGTTCTGCATTTTAGCGTAAAGAAGTATGATGGTTACGAAGCTCCTATTAAAAC 1960 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1805 GATGTCAGTTCTGCATTTTAGTGTAAAGAAGTATGATGGTTACGAAGCTCCTATTAAAAC 1864 Query 1961 AAAAGAAGAGCTAATGTTCCATGTTGGTTTCCGTCAATTCATTGCAAGGCCGGTATTTGC 2020 |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 1865 GAAAGAAGAACTTATGTTCCATGTTGGTTTCCGTCAAGTCATTGCAAGGCCGGTATTTTC 1924 Query 2021 GACCGACAATTTCAGCTCAGACAAGCACAAGATGGAGAGATTCCTGCATCCAGGGTGTTT 2080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct 1925 AACCGACAATTTCAGCTCAGACAAGCACAAGATGGAGAGATTCTTGCATTCAGGGAGTTT 1984 Query 2081 CTCGTTGGCTTCAATATACGGCCCCATATCTTTCCCACCCCTTCCTTTGGTAGTTCTGAA 2140 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct 1985 CTCGTTGGCTTCAATATATGGCCCAATATCTTTCCCACCCCTTCCTTTGGTAGCTCTAAA 2044 Query 2141 GATTTCTGAAGGGTCGGATCCTCCTGCCATTGCTGCCCTTGGTTCCTTGAAAAGCGTAGA 2200 ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct 2045 GATATCTGAAGGGTCAGATCCT---GCCGTTGCTGCCCTTGGTTCCTTGAAAAGCATTGA 2101 Query 2201 ACCCAACAAAATAATCTTAAAGAAGATAATATTAACTGGGTACCCTCAGAGAGTATCGAA 2260 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 2102 ACCCAACAAAATAATTTTAAAGAAGATAATATTAACTGGGTATCCTCAGAGAGTATCAAA 2161 Query 2261 AATGAAAGCTTCAGTCAGATATATGTTCCACAACCCCGAAGACGTGAAATGGTTCAAGCC 2320 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2162 AATGAAAGCATCAGTCAGATATATGTTCCACAACCCAGAAGACGTGAAATGGTTCAAGCC 2221 Query 2321 TGTTGAAGTATGGTCAAAATGCGGGCGTCGTGGTCGCGTGAAGGAACCAGTAGGCACACA 2380 ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 2222 TGTAGAAGTGTGGTCAAAATGTGGTCGTCGTGGTCGCGTGAAGGAGCCAGTGGGCACACA 2281 Query 2381 TGGGGCAATGAAATGCATATTCAATGGAGTGGTTCAACAACATGACGTAGTGTGCATGAA 2440 |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||| Sbjct 2282 TGGGGCGATGAAATGTATATTCAATGGAGTGGTGCAGCAACATGACATTGTCTGCATGAA 2341 Query 2441 CTTGTACAAGCGCGCTTATCCC-AAGTGGCCTGAACGTCTGTACCCACAGCTTCTCTGAT 2499 ||||||||| || || || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2342 CTTGTACAAACGTGCGTA-CCCTAAGTGGCCTGAGCGTCTGTACCCGCAGCTTCTCTGAT 2400 Query 2500 TCGAATTTTTTA-AATGAAG 2518 || ||||| | | ||||||| Sbjct 2401 TCCAATTTGT-AGAATGAAG 2419 > Ahg473739 jgi|Araly1|473739|fgenesh2_kg.1__3693__AT1G42440.1 Length=2585 Score = 1882 bits (1019), Expect = 0.0 Identities = 1130/1184 (95%), Gaps = 6/1184 (1%) Strand=Plus/Plus Query 544 AGGTTGCTGATTTGATGGCTTTTGTTGCATCTGCAAGTGCTCCGTGGGAAGAGAATAGCT 603 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 522 AGGTTGCTGATTTGATGGCTTTTGTTGCATCTGCAAGCGCTCCGTGGGAAGAGAATAGCT 581 Query 604 CTAACTTCATAGATTC-TTTCGGAAGTCAGTGTCTTTCTGTGTTTAGATCAATTGGTCTA 662 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 582 CTAACTTCATAGATTCATTT-GGAAGTCAGTGTCTTTCTGTGTTTAGATCAATTGGTTTA 640 Query 663 CCAAGCACTACTGTGTTGATCCGTGATTTGCCCAGTGATGTGAAAAAGAAAAATGAGATG 722 |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 641 CCAAGCACCACTGTGTTGATCCGTGATTTACCTAGTGATGTGAAAAAGAAAAATGAGATG 700 Query 723 AAAAAGATGTGTGCCTCTCAACTTGCTTCTGAATTTCCTGAGGATTGTAAGTTTTATCCA 782 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 701 AAAAAGATGTGTGCCTCTCAACTTGCTTCTGAATTTCCCGAGGATTGTAAGTTTTATCCA 760 Query 783 GCAGATACCAGAGATGAGTTGCATAAGTTTATGTGGTTATTCAAGGCGCAAAGGCTTACT 842 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 761 GCAGATACCAGAGATGAGTTGCATAAGTTTATGTGGTTATTCAAGGCACAAAGGCTTACC 820 Query 843 GTGCCTCACTGGCGAAGTCAACGATCATACATTGTGGCTC-GCAAGGCTGGGATGCTGGT 901 || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||||| Sbjct 821 GTACCTCACTGGCGAAGTCAACGACCATATGTTGTGGCTCAG-AAGGTTGGGATGCTGGT 879 Query 902 GGATGATGAAAGCTCAGGAAAGTGCACTCTACTTCTCTCTGGTTACTTGCGTGCTCGCAA 961 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 880 GGATGATGAAAGCTCAGGAAAGTGCACTCTACTTCTCTCTGGTTACTTGCGTGCTCGCAA 939 Query 962 ACTGTCTGTAAATCAACTGGTCCATGTTTCTGGCGTTGGGGATTTTCAATTCTCCAAAAT 1021 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 940 ACTGTCTGTAAATCAGCTGGTCCACGTTTCTGGCGTTGGTGATTTTCAATTCTCCAAAAT 999 Query 1022 TGAAGTGCTGAAGGATCCATTTCCTTTGAATGAAAGGAAAAATCAGAATTCCATGGAATT 1081 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1000 TGAAGTGCTGAAGGATCCATTTCCTTTGAATGAAAGGAAAAATCAGAATTCCATGGAATT 1059 Query 1082 AGATGATTCACATGATGAAGAGGTATTGAAGTCTCTGGTTCCTGATCCCATGAAACAAGA 1141 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1060 AGATGCTTCACATGATGAAGAGGTGTTGAAGTCTCTGGTTCCTGATCCCATGAAACAAGA 1119 Query 1142 GCCTTTAGTAATTGAAAACACTCCAGATCCTTTAGCAGGGGAACAGACATGGCCAACAGA 1201 |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1120 GCCTTTAGTAGTTGAAAACATTCCAGATCCTTTAGCAGGGGAACAGACATGGCCAACAGA 1179 Query 1202 GGAAGAAATGGCTGAGGCTGACAAAAATCAGAAGCAGGGCAG-GCTAAAGAAGAAGACTT 1260 |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | | ||||||||||||||| Sbjct 1180 GGAAGAAATGGCTGAGGCTGACAAAATTCAGAAACATGGAAATG-TAAAGAAGAAGACTT 1238 Query 1261 TGCCGCGAGGGACTTCAGAATATCAGGCTGCTTGGATTGTGGATGAAACAGATGAAGAGG 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1239 TGCCGCGAGGGACTTCAGAATATCAGGCTGCTTGGATTGTGGATGACACAGATGAAGAGG 1298 Query 1321 ATTCCGATAATGGTGATTCTGATGATAATGGTATGGTATTGGATAGAGGAGAGGATTCCA 1380 ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||| Sbjct 1299 ATTCCGATAATGGTGATTCCGATGATAACGGCATGGTGTTGGATAGAGGAGACGAATCCA 1358 Query 1381 ATCAAGAAGGAATGTATGACCAAGAATTTGAGGATGACGGAAAATCATTGAACCTGCGGG 1440 ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | Sbjct 1359 ATCAAAAAGGAAGGTATGACCAAGAATTTGAGGATGATGAAAAATCACTGAACCTGCGTG 1418 Query 1441 ATATTGATACTGAAACTCAGAATGAATCCGAAATGGTGGACGATGAAGACTTGACAGAAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct 1419 ATATTGATACTGAAACTCAGAATGAATCGGAAATGATGGACGATGAAGACTTGACAGAGG 1478 Query 1501 AACAAATTAAGGATGAAATCAAGAAAATCAAAGAGGCATATGCTGATGACGAAGAATTTC 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| Sbjct 1479 AACAAATTAAGGATGAAATCAAGAAAATCAAAGAGGCATATGCTGAGGATGAGGAATTTC 1538 Query 1561 CAGATGAAGTAGAGACTCCCATTGATGTTCCTGCAAGAAGACGTTTTGCAAAGTACAGGG 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1539 CAGATGAAGTAGAGACTCCCATTGATGTTCCTGCAAGAAGACGTTTTGCAAAGTACAGGG 1598 Query 1621 GTCTTAAATCCTTCAGAACCTCCTCGTGGGATCCAAATGAGTCTTTACCTCAGGACTATG 1680 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1599 GTCTGAAATCCTTTAGAACCTCCTCGTGGGATCCAAATGAGTCTTTACCTCAGGACTATG 1658 Query 1681 CTAGAATTTTTGCTTTTGATAATGTCGCAAGGACTCAAAAGCTT 1724 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1659 CCAGAATTTTTGCTTTTGATAATGTCGCCAGGACTCAAAAGCTT 1702 Score = 1334 bits (722), Expect = 0.0 Identities = 841/896 (94%), Gaps = 17/896 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1765 ATGATTGTGTACCAA-TTGGGTCATATGTACGGCTGCATATTAAAGAAGTGCCTCTTGGT 1823 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1703 ATGATTGTGTACCAACTTGGGTCATATGTACGGCTGCATATTAAAGAAGTGCCTCTTGGT 1762 Query 1824 GCTGCCTCTAAACTATCTTCTCTTGTGAACACAACGAAACCAATTATAGGATTTGGGCTT 1883 ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1763 GCTGCCTCTAAACTATCCTCCCTTGTGAACACAACGAAACCCATTATAGGATTTGGGCTT 1822 Query 1884 CTGCAGCATGAATCCAAGATGTCGGTTCTGCATTTTAGCGTAAAGAAGTATGATGGTTAC 1943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1823 CTGCAGCATGAATCCAAGATGTCGGTTCTGCATTTTAGCGTAAAGAAGTATGATGGTTAC 1882 Query 1944 GAAGCTCCTATTAAAACAAAAGAAGAGCTAATGTTCCATGTTGGTTTCCGTCAATTCATT 2003 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1883 GAAGCTCCTATTAAAACAAAAGAAGAGCTTATGTTCCATGTTGGTTTCCGCCAATTCATT 1942 Query 2004 GCAAGGCCGGTATTTGCGACCGACAATTTCAGCTCAGACAAGCACAAGATGGAGAGATTC 2063 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1943 GCAAGGCCGGTATTTTCAACCGACAATTTCAGCTCAGACAAGCACAAGATGGAGAGATTC 2002 Query 2064 CTGCATCCAGGGTGTTTCTCGTTGGCTTCAATATACGGCCCCATATCTTTCCCACCCCTT 2123 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| Sbjct 2003 CTGCATCCAGGGCGTTTCTCGTTGGCTTCAATATACGGTCCAATATCTTTCCCACCACTT 2062 Query 2124 CCTTTGGTAGTTCTGAAGATTTCTGAAGGGTCGGATCCTCCTGCCATTGCTGCCCTTGGT 2183 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| Sbjct 2063 CCTTTGGTTGTTCTGAAGATTTCTGAAGGGTCGGATGCTCCTGCCGTGGCTGCCCTTGGT 2122 Query 2184 TCCTTGAAAAGCGTAGA-ACCCAACAAAATAATCTTAAAGAAGATAATATTAACTGGGTA 2242 ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2123 TCCTTGAAAAGCGTAGACACC-AACAAAATAATTTTAAAGAAGATAATATTAACTGGGTA 2181 Query 2243 CCCTCAGAGAGTATCGAAA-ATGAAAGCTTCAGTCAGATATATGTTCCACAACCCCGAAG 2301 ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2182 TCCTCAGAGAGTGTC-AAAGATGAAAGCATCAGTCAGATATATGTTCCACAACCCAGAAG 2240 Query 2302 ACGTGAAATGGTTCAAGCCTGTTGAAGTATGGTCAAAATGCGGGCGTCGTGGTCGCGTGA 2361 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2241 ATGTGAAATGGTTCAAGCCTGTTGAAGTGTGGTCAAAATGCGGGCGTCGTGGTCGTGTGA 2300 Query 2362 AGGAACCAGTAGGCACACATGGGGCAATGAAATGCATATTCAATGGAGTGGTTCAACAAC 2421 |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2301 AGGAGCCAGTGGGCACACATGGGGCAATGAAATGCATATTCAATGGAGTGGTTCAGCAAC 2360 Query 2422 ATGACGTAGTGTGCATGAACTTGTACAAGCGCGCTTATCCCAAGTGGCCTGAACGTCTGT 2481 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2361 ATGACATAGTGTGCATGAACTTGTACAAGCGCGCTTATCCCAAGTGGCCTGAACGTCTGT 2420 Query 2482 ACCCACAGCTTCTCTGATTCGAATTTTTTAAATGAAGATGATGATGTTCAAGTTTCTCTG 2541 |||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2421 ACCCGCAGCTTCTCTGATTCAAATATATAAAATGAAGATGATGATGTTCAAGTTTCTCTG 2480 Query 2542 AATTGACGACATTCTTCTTTGGTAATTTATGGTGGTGGTTTAGTGGAAGTCCTCCAGTTT 2601 | || | || || | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2481 A-TT--CTAC-TT-T-C---G-TAATTTATGGTGGTGGTTTAGTTGAAGTCCTCCAGTTT 2530 Query 2602 TGTCCTGTATGTGATAAAAATATGCAAATTTTCTTCTTT-ATTGCTCACTATACAT 2656 ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||| |||||| Sbjct 2531 TGTCCTGTATGTGATAAAAATATACAAGTTTT-TTCCTTCATTGCTCACAATACAT 2585 Score = 623 bits (337), Expect = 2e-177 Identities = 405/438 (92%), Gaps = 4/438 (1%) Strand=Plus/Plus Query 111 GAAGCCATGGGACGCTCTCGAGTTCAAGTTAACAAAGCTCACAAGACTCGTTTCTCCTCT 170 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 32 GAAGCCATGGGACGCTCTCGAGTTCAAGTTAACAAAGCTCACAAGACACGTTTCTCCTCT 91 Query 171 AAATCTTCTCGTAATCTCCATAGAACCAACCTTCAAGATAGTGGCCGGATTGGGAAATCG 230 ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 92 AAATCTTCTCGCAATCTCCACAGGACTTCCCTCCAAGATAGCAACCGGATTGGGAAATCG 151 Query 231 GATAGTAACTATGTTAAAGGAGCTAAAGCTGCTCGTGTTCAACGTGGTAAGATGCTTAGA 290 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || Sbjct 152 GATAACAACTATGTTAAAGGTGCTAAAGCTGCTCGTGTTCAGCGTGGAAAGATGATTCGA 211 Query 291 GAGCAGAAGAGAGCAGCAGTTTTGAAGGAGAAGAGAGCATCAGGAGGAATTA-ACAGTGC 349 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct 212 GAGCAGAAAAGAGCAGCAGTTTTGAAGGAGAAGAGAGCATCAGGAGG-ATTACACAGTGC 270 Query 350 TCCTCGTGTTATCGTTTTGTTTCCTCTCTCTGCTTCTGTGGAATTGAATTCACTTGGTGA 409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 271 TCCTCGTGTTATCGTTTTGTTTCCTCTCTCTGCTTCTGTGGAATTGAATTCACTTGGTGA 330 Query 410 AGATGTTTTGAAGTTGTTATCTTCTGATGGTTCTGGAA-TTGCTTCTTCGACAGTTGCAT 468 ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| Sbjct 331 AGATGTTTTAAAGCTATTGTCTTCTGATGGTTCTGGAAATTG-TTCTTCAACAGTTGCAT 389 Query 469 CTTCTGAGTATAAGCTACGAGCAACTGTGTTAAAGGCGCCTCATGGGGATCTTCTGACAT 528 ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct 390 CTTCTGAGTATAAGCTAAGAGCAACTGTCTTAAAGGCCCCTCACGGAGATCTTCTGACAT 449 Query 529 GTATGGAAATGGCCAAGG 546 |||||||||||||||||| Sbjct 450 GTATGGAAATGGCCAAGG 467 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 103415015175 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5