BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G42470.1
Length=3899
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg913522 jgi|Araly1|913522|Al_scaffold_0001_3776 6082 0.0
> Ahg913522 jgi|Araly1|913522|Al_scaffold_0001_3776
Length=3786
Score = 6082 bits (3293), Expect = 0.0
Identities = 3610/3766 (96%), Gaps = 9/3766 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCAGATTCTGTTTGTTGGTTATGGAGTGGAAGCAAAACAATCAGCAGGATATTGTGCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGATTCTGTTTGTTGGTTATGGAGTGGAAGCAAAACAATCAGCCGGATATTGTGCT 60
Query 61 ATGTATGATATCTGTGGAGCAAGAAGTGATGGGAAAGTACTAAATTGCCCTTTCAACATT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATGTATGATATCTGTGGAGCAAGAAGTGATGGGAAAGTACTAAATTGCCCTTTCAACATT 120
Query 121 CCTTCTGTGAAGCCTGATGATTTGTTATCTTCAAAGATTCAAAGCTTATGTCCAACAATC 180
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTGCTGTGAAGCCTGATGATTTGTTATCTTCAAAGATTCAAAGCTTATGTCCAACAATC 180
Query 181 ACTGGCAATGTTTGTTGCACAGAGACTCAATTTGATACATTACGTTCGCAAGTTCAACAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 ACTGGCAATGTTTGTTGCACAGAGACTCAATTTGATACATTACGTTCACAAGTTCAACAG 240
Query 241 GCTATTCCTTTTATTGTTGGTTGTCCAGCATGTTTGAGGAACTTTCTGAATCTTTTTTGT 300
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 241 GCTATTCCTTTCATTGTAGGTTGTCCAGCATGTTTGAGGAATTTTCTGAATCTTTTCTGT 300
Query 301 GAACTTACTTGTTCTCCGGATCAGAGTTTGTTTATCAATGTAACTTCTACTACAAAGGTC 360
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GAACTTACTTGTTCTCCGGATCAGAGTTTATTCATCAATGTAACTTCTACTACAAAGGTC 360
Query 361 AAGAATAATTCTACTGTAGATGGAATTCAGTACTATATAACTGATGATTTTGGAGCTGGG 420
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 361 AAGAATAATTCGACTGTAGATGGGATTCAGTACTATATAACTGATGATTTTGGAGCGGGG 420
Query 421 ATGTATGAATCTTGCAAAAATGTAAAATTTGGTAGCTCGAATAGCCGAGCTTTAGACTTT 480
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATGTATGAATCTTGCAAAAATGTGAAATTCGGTAGCTCTAATAGCCGAGCTTTAGACTTT 480
Query 481 CTCGGAGCCGGTGCAAAGAACTTTAAGGAGTGGTTTACATTTATTGGTCAGAAAGCGGGT 540
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTCGGAGCCGGTGCAAAGGATTTTAAGGAGTGGTTTGCATTTATTGGTCAGAAAGCGGGT 540
Query 541 GTCAATTTGCCAGGCTCACCGTATGGGATCGCTTTTTTGCCAACACCGCCTGTGTCGTCT 600
|||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 541 GTCAATGTGCCAGGCTCACCGTATGGGATTGCGTTTTTGCCAACACCACCAGTGTCATCT 600
Query 601 GGAATGAGGCCTATGAATGTGTCTATTTATTCATGTGGTGATGAGTCTCTTGGCTGTTCT 660
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GGAATGAGGCCTATGAATGTGTCTACTTATTCATGCGGTGATGAGTCTCTTGGCTGTTCT 660
Query 661 TGTGGTGATTGTCCTTCTGCAGCTACTTGCTCTAGTAAAGCAGAAGTGCCTACTCAGAAA 720
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 661 TGTGGTGATTGTCCTTCTGCAGCTACTTGCTCCAGTAAAGCAGAAGTTCCTACTCAGAAA 720
Query 721 AAACATTCTTGCTCTATCAAGATTGGATCACTTGAGGTGAAATGTGTTGATTTCATATTA 780
|| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 721 AAGCACTCTTGTTCTATCAAAATTGGATCACTTGAGGCGAAATGTGTTGATTTCATACTA 780
Query 781 GCCATTTTGTATATTGTATTGGTTTCATTGTTTCTTGGAGGAGGTTTACTTCACCCAGTA 840
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 781 GCCATTGTGTATATTGTATTGGTTTCACTGTTTCTCGGAGGCGGTTTACTTCACCGAGTA 840
Query 841 AGGGGTAAGAAAAAGACCTCACAGATGGGAACATTGTCAGAAGCTAGTGGAGAACGAAA- 899
||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| | |||
Sbjct 841 AGGGGTAAGAAAAAGACCTCACAGATGAGACCATCGTCAGAAGCTGGTGGAGAGC-AAAG 899
Query 900 TTCTGTTAATCAGCAAAAACCAGACACTATTCAAT-CGCAGATGTTACAAAATACTCCAC 958
||||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TTCTGCTAATTTGCAAAAACCAGACACTA-TCCATGCACAGATGTTACAAAATACTCCAC 958
Query 959 AGAGAAACTGGGGTCAGCTATCGACAGTACAAGGACACTTGGCCAACTTTTACGGGAAGT 1018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 959 AGAGAAACTGGGGTCAGCTATCGACAGTACAAGGACACTTGGCCAATTTTTACAGGAAGT 1018
Query 1019 ATGGGATTTGGGTAGCAAGACACCCCACTCTTGTTTTGTGTTTGTCAGTCTCTGTAGTTC 1078
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 ATGGGATTTGGGTAGCAAGACACCCAACTCTTGTTTTGTGTTTGTCAGTCTCTGTAGTTC 1078
Query 1079 TTCTCCTTTGTGTGGGTCTGATCCGGTTCAAAGTTGAGACACGGCCTGATAAGCTGTGGG 1138
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1079 TTCTCCTTTGTGTGGGTCTGATCCGATTCAAAGTGGAGACACGGCCTGATAAGCTATGGG 1138
Query 1139 TAGGATCAGGTAGCAGAGCTGCTGAAGAGAAACAATTCTTTGACACTCATCTTGCTCCTT 1198
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1139 TAGGATCAGGGAGCAGAGCTGCTGAAGAGAAACAATTCTTTGACACCCATCTTGCTCCTT 1198
Query 1199 TCTACAGAATTGAACAGCTAATAATAGCAACAGTTCAAACATCTTCTCACGAAAAGGCGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 TCTACAGAATTGAACAGCTAATAATAGCAACAGTTCAAAAATCTTCTCACGAAAAGGCGC 1258
Query 1259 CAGAGATTTTGACAGATGACAATATTAAGTTACTTTTTGACATACAAAAGAAGGTCGATG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGAGATTTTGACAGATGACAATATTAAGTTACTTTTTGACATACAAAAGAAGGTCGATG 1318
Query 1319 GACTTCGGGCAAATCACTCAGGTTCAATGGTTTCTCTGACAGATATCTGCATGAAACCCC 1378
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1319 GACTTCGGGCAAATCACTCAGGTTCAATGGTTTCTCTGACAGATATTTGCATGAAACCCC 1378
Query 1379 TGGGAGAGGATTGTGCCACACAGAGTGTTCTGCAGCAGTATTTCAAAATGAAACCAGAAA 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1379 TGGGAGAGGATTGTGCCACACAGAGTGTTCTGCAG---TATTTCAAGATGAAACCAGAAA 1435
Query 1439 ATTATGACGACTATGGAGGCGTTGATCATGTTAAATATTGTTTTGAGCATTTCACCTCGA 1498
||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1436 ATTATGATGACTTTGGAGGCGTCGATCATGTTAAATATTGCTTTGAGCATTTCACCTCGA 1495
Query 1499 CAGAATCATGTTTGAGTGCATTTAAGGGTCCACTTGATCCAACTACTGCACTGGGAGGTT 1558
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 CAGATTCATGTTTGAGTGCATTTAAGGGTCCACTTGATCCAACTACTGCACTGGGAGGTT 1555
Query 1559 TCTCAGGGAACAGTTTTAGTGAGGCTTCTGCTTTTCTTGTGACTTATCCTGTGGACAATT 1618
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 TCTCAGGGAACAGTTTTAGTGAGGCTTCTGCTTTTCTTGTGACTTATCCTGTGGACAATG 1615
Query 1619 TTGTTGACAATAAAGGTAACAAAACTGAGAAAGCAGTAGCATGGGAGAAAGCCTTTATCC 1678
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 CTGTTGACAATAAAGGTAACAAAACTGAGAAAGCAGTAGCATGGGAGAAAGCCTTTATCC 1675
Query 1679 AACTGGCCAAGGATGAGTTGTTGCCAATGGTTCAAGCAAAAAATTTAACTCTTTCTTTCT 1738
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 AACTGGCCAAGGATGAGTTGTTGCCAATGGTTAAAGCAAAAAATTTAACTCTTTCTTTCT 1735
Query 1739 CGTCGGAAAGTTCTATTGAAGAAGAACTGAAAAGAGAAAGCACAGCAGATGTCATAACTA 1798
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 CTTCGGAAAGTTCTATTGAAGAAGAATTGAAAAGAGAAAGCACAGCAGATGTCATAACTA 1795
Query 1799 TAGCCATAAGTTATCTTGTCATGTTTGCCTATATATCACTCACACTTGGAGATTCACCTC 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 TAGCCATAAGTTATCTTGTCATGTTTGCCTATATATCACTCACACTTGGAGATTCACCTC 1855
Query 1859 GCTTAAAGTCCTTTTACATTACATCCAAGGTTCTGCTTGGTCTATCTGGTGTTCTACTTG 1918
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 GCTTAAATTCCTTTTACATAACATCCAAGGTTCTGCTTGGTCTATCTGGTGTTCTACTTG 1915
Query 1919 TCATGCTTTCTGTCCTTGGCTCTGTAGGATTTTTCAGTGCCGTTGGGATGAAATCGACTC 1978
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 TCATGCTTTCCGTCCTCGGCTCTGTAGGATTTTTCAGTGCCGTTGGGATGAAATCGACTC 1975
Query 1979 TAATCATAATGGAAGTTATACCTTTTCTTGTTTTGGCTGTCGGTGTTGATAATATGTGCA 2038
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 TTATAATAATGGAAGTTATACCTTTTCTTGTTTTGGCTGTCGGTGTTGATAATATGTGCA 2035
Query 2039 TCCTGGTTCATGCTGTCAAGAGGCAAGAGCAAGAGCTGCCTTTGGAAAGAAGAATTAGCA 2098
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 2036 TACTGGTTCATGCTGTGAAGAGGCAAGAGCAAGAGCTGCCTTTGGAAAGACGAATAAGCA 2095
Query 2099 ATGCCCTTATGGAAGTTGGACCATCGATTACTCTAGCAAGTTTAGCCGAGATTTTAGCTT 2158
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 ATGCCCTTATGGAAGTTGGACCATCGATTACTCTTGCAAGTTTAGCCGAGATTTTAGCTT 2155
Query 2159 TCGCTGTTGGTGCTTTCATTAAAATGCCAGCTGTTCGAGTATTCTCCATGTTTGCTGCAT 2218
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2156 TTGCTGTTGGTGCTTTTATTAAAATGCCAGCTGTTCGAGTGTTCTCCATGTTTGCTGCAT 2215
Query 2219 TGGCTGTCCTTTTGGACTTTCTTCTCCAGATTACCGCGTTTGTAGCTTTGATAGTTTTTG 2278
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TGGCTGTCCTTTTGGACTTTCTTCTCCAGATTACTGCGTTTGTAGCTTTGATAGTTTTTG 2275
Query 2279 ACTTCCGACGGACGGAGGATAAGCGAGTTGATTGCTTCCCGTGTATTAAGACATCAAAAT 2338
|||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2276 ACTTCCAACGGACAGAGGATAAGCGGGTTGATTGCTTCCCATGTATTAAGACATCGAAAT 2335
Query 2339 CATCTATTAGTGCTGAAAAAGGGGTTGGTCAAAGAAAAGCTGGCCTTTTGACTCGATATA 2398
|||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 CATCTAATAGCGCTGACAAAGGGGTTGGTCAGAGAAAAGCTGGCCTTTTGACTCGATATA 2395
Query 2399 TGAAGGAAGTCCATGCACCTGTTCTTAGCCATTGGATAGTCAAAATAGTGGTCATTGCCT 2458
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2396 TGAAGGAAGTCCATGCACCCGTTCTTAGCCATTGGGCAGTCAAAATATTGGTTATTGCCT 2455
Query 2459 TCTTCTTTGGCTTAGCAATGGCTGGAATTGCATTGTCGACTCGTATTGAGCCTGGTTTGG 2518
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2456 TCTTCTTTGGCTTAGCTATGGCTGGAATTGCAATGTCCACTCGGATTGAGCCTGGCTTGG 2515
Query 2519 AGCAACAGATTGTTCTTCCTCAAGACTCATATCTTCAGGGTTACTTCAACAATATTTCTA 2578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2516 AGCAACAGATTGTTCTTCCTCAAGACTCATATCTTCAGGGTTACTTCAACAATATTTCAA 2575
Query 2579 CATATCTTCGAATCGGTCCACCTTTATACTTTGTTCTGAAGAATTATAACTACAGCTCAG 2638
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 CATATCTTCGTATTGGTCCACCTTTATACTTTGTTCTGAAGAATTATAACTACAGCTCAG 2635
Query 2639 AATCAAGACATACAAATCAACTTTGTTCCATTAACAAGTGTAATCCTAACTCTCTTTTAA 2698
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2636 AATCAAGACAGACTAATCAACTTTGTTCCATTAACAAGTGTGATTCTAACTCTCTTTTAA 2695
Query 2699 ATGAGATTGCAAGGGCTTCTTTGACTCCGGAACTAAGCTACATAGCTAAGCCAGCTGCTT 2758
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696 ATGAGATTGCAAGGGCTTCTTTGACTCCAGAACTAAGCTACATAGCTAAGCCAGCTGCTT 2755
Query 2759 CGTGGCTCGATGACTTTCTTGTGTGGTTATCTCCCGAGGCGTTTGGATGTTGCAGAAAGT 2818
| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2756 CATGGCTTGATGACTTTCTCGTGTGGTTATCTCCCGAGGCGTTTGGCTGTTGCCGAAAGT 2815
Query 2819 TTACAAATGGTACCTTTTGCCCCCCTGATGACCAGCCTCCTTGTTGCCCTCCTGGTCAAA 2878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 2816 TTACAAATGGTACCTTTTGCCCCCCTGATGACCAGCCTCCTTGTTGCTCTCCTGATCAAG 2875
Query 2879 -CGAGCTGTGGCCTAAGTGAAGTATGCAAAGATTGTACCACGTGCTTCCGGCATGCAGAT 2937
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2876 GC-AGCTGTGGCCTAAGTGAAGTATGCAAAGATTGTACCACGTGCTTCCGTCATGCAGAT 2934
Query 2938 TTAAGTAGTGACCGCCCTTCCACAACACAATTCAAAGAGAAACTTCCTTGGTTCCTCAAC 2997
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 TTAAGTAGTGACCGCCCATCCACAACCCAATTCAAAGAGAAACTTCCTTGGTTCCTCAAC 2994
Query 2998 GCGCTCCCTTCTGCTGATTGTGCTAAAGGTGGACATGGTGCTTATTCTAGTAGTGTTGAT 3057
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 GCGCTTCCTTCCGCTGATTGTGCTAAAGGTGGACATGGTGCTTATTCTAGTAGTGTTGAT 3054
Query 3058 TTGCAAGGCTATGCAAATGGTATCATTCAAGCTTCATCGTTCCGTACTTATCACACACCC 3117
|| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3055 TTACAAGGCTATGAAAATGGTATAATTCAAGCTTCATCGTTCCGCACTTATCACACACCC 3114
Query 3118 CTTAACAAGCAGGTTGACTTTGTTAATTCAATGAGAGCTGCTCAAGAATTTAGTGCAAAA 3177
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 CTTAACAAGCAGGCTGACTTTGTTAATTCAATGAGAGCTGCTCAAGAATTTAGTGCAAAA 3174
Query 3178 GTTTCCCGTTCCTTAAAGATGGAGATATATCCTTATTCAGTGTTTTATATGTTCTTTGAG 3237
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 GTTTCCCGTTCCTTAAAGATGGAGATATATCCATATTCAGTGTTTTATATGTTCTTTGAG 3234
Query 3238 CAATATCTTGACATATGGAAAACTGCATTAATCAACCTCTCCATAGCCATCGCTGCCGTG 3297
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3235 CAATATCTTGACATATGGAAAACTGCACTAATCAACCTCTCCATAGCCATTGCTGCCGTG 3294
Query 3298 TTTGTCGTGTGTTTAATCATCACATGCAGCTTTTGGAGCTCGGCAATTATTTTGCTGGTG 3357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3295 TTTGTCGTGTGTTTAATCATCACATGCAGCTTTTGGAGCTCCGCAATTATTTTGCTGGTG 3354
Query 3358 ATCGCGATGATCATTATTGATCTCCTGGGAGTTATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAAC 3417
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3355 ATCGCAATGATCATTATTGATCTCTTGGGAGTTATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAAC 3414
Query 3418 GCACTATCGGTTGTAAATCTAATCATGTCCGTGGGCATAGCGGTTGAGTTTTGCGTACAC 3477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 3415 GCACTATCGGTTGTAAATCTAATCATGTCCGTGGGCATAGCGGTTGAGTTTTGTGTGCAC 3474
Query 3478 ATAACACACGCTTTCTCGCACTGGGGACAGAAACCATCGGATGAAAGAGGCGTTGGGTGG 3537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 ATAACACACGCTTTCTCGCACTGGGGACAGAAACCATCGGATGAAAGAGGCGTTGGGTGG 3534
Query 3538 GATGGGAGCTTCAGTTTTCAGTGGAATTACATTGACGAAACTAGTTGGGGTGATTGTGCT 3597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3535 GATGGGAGCTTCAGTTTTCAGTGGAATTACATTGACGAAGCTAGTTGGGGTAATTGTGCT 3594
Query 3598 CGGTTTCTCAAGATCAGAAGTCTTTGTGGTGTACTACTTCAAGATGTATTTGGCACTAGT 3657
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3595 CAGTTTCTCAAGATCAGAAGTCTTTGTGGTCTACTACTTCAAGATGTATCTGGCACTAGT 3654
Query 3658 CCTTCTCGGTTTCTTACACGGCCTTGTATTTTTACCGGTGTTCTTGAGCATGTTTGGTCC 3717
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 CCTCCTCGGTTTCTTGCACGGCCTTGTATTTTTACCGGTGTTCTTGAGCATGTTTGGTCC 3714
Query 3718 AGCTCCAAGACATGTAGAAGGGGAAAGGCAAGATCATCGACCTTCG 3763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 TTCTCCAAGACATGTAGAAGGGGAAAGGCAAGATCATCGACCTTCG 3760
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 147358922656
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5