BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G47600.1
Length=1745
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg474259 jgi|Araly1|474259|fgenesh2_kg.1__4213__AT1G47600.1 2678 0.0
Ahg474221 jgi|Araly1|474221|fgenesh2_kg.1__4175__AT1G47600.1 2556 0.0
Ahg922901 jgi|Araly1|922901|scaffold_104182.1 2531 0.0
Ahg914284 jgi|Araly1|914284|Al_scaffold_0001_4538 1853 0.0
> Ahg474259 jgi|Araly1|474259|fgenesh2_kg.1__4213__AT1G47600.1
Length=1748
Score = 2678 bits (1450), Expect = 0.0
Identities = 1658/1754 (95%), Gaps = 32/1754 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCACCAAAAGAAGCACATCAATAAAGAAAATAC--A---AACCATGGCAATTCCAAAAG 55
|||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATCACCAAAATAAGCCCATCAATAAAGAAAATACAAACTCAACCATGGCAATTACAAAAG 60
Query 56 CTCACTACTCTTTAGCTGTTCTTGTCCTTCTCTTTGTCGTCGTTTCGAGTAGCCAAAAGG 115
|||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| |
Sbjct 61 CTCACTACTCCTTAGCAGTTCTTGTCGTTCTC-TT-T-GTCGTTTCGAGTAGCCAAAAAG 117
Query 116 TTTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGATAATACTCATGCATTCA 175
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 118 TCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGACAATACTCATGCATTCA 177
Query 176 ACCGTACGGGATTTCCCAGAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCTTATCAAATTG 235
|||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 178 ACCGAACTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCATATCAAATTG 237
Query 236 AAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCACGCATAGATATCCAGAAA 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 238 AAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTACTTCACTCATAGATATCCAGAAA 297
Query 296 AAGTACCGGATCGTAGTTCAGGAGATCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATG 355
|||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 AAGTTCCCGATCGCAGTTCAGGAGACCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATG 357
Query 356 ATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCTTACAGACTCTCGATAGCATGGTCAA 415
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 358 ATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCGACTCTCGATAGCATGGTCAA 417
Query 416 GGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACA 475
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 GGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGATTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACA 477
Query 476 ACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTTACTATATTTCATT 535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 478 ACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTGACTATATTTCATT 537
Query 536 GGGATGTTCCCCAAACTTTAGAAGACGAATATGGAGGTTTCTTAAGCACACGTATAGTGG 595
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 538 GGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCTTAAGCCCACGTATAGTGG 597
Query 596 AGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGGGTCAAATTTT 655
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 598 AGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTTGGAGACAGGGTCAAATTTT 657
Query 656 GGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGCTATGGAGATGGATCGTATC 715
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 658 GGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGTTATGGAGATGGATCGTATC 717
Query 716 CACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAG 775
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAATTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAG 777
Query 776 TTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATC 835
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 TTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCCAAAGCTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATC 837
Query 836 AGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAA 895
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 AGAAATTCCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAA 897
Query 896 ATGAATTTAGCGAACTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGACTTTTTTGTTGGAT 955
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 898 ACGAATTTAGCGAACTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGATTTTTTTGTTGGAT 957
Query 956 GGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAACGATAATGAGAGAGATGGTAGGAG 1015
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 958 GGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAAAGATTATGAGAGAGATGGTAGGAG 1017
Query 1016 ATAGATTGCCAGAATTCACTCCTGAGCAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTC 1075
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 ATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTC 1077
Query 1076 TAGGGTTGAACTATTATGTTACACAATATGCAACTGACGCACCTCCTCCGACACAACTTA 1135
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||
Sbjct 1078 TAGGGTTGAACTATTACGTTACACAATATGCAACCGACGCACCTGCTCCGGCAAAACCTA 1137
Query 1136 ATGCAATAACGGATGCACGAGTTACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTG 1195
||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 GTGCAATAACTGATCCACGAGTTACTCTTGGATTTTACCGCAATGGAGTTCCTATTGGTG 1197
Query 1196 TTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCA 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCA 1257
Query 1256 AAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATC 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATC 1317
Query 1316 TTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCA 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1318 TTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGAATTCAAAACCATTGCA 1377
Query 1376 GCCATCTCTCTTGTCTTAAATGCGCTATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTG 1435
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 GCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGCCATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTG 1437
Query 1436 CATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGA 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1438 CATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGA 1497
Query 1496 ATTGGGTCAATTTCACTAATCCTGCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCT 1555
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 ATTGGGTCAACTTCACTAATCCTTCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCT 1557
Query 1556 CTAAGTTCCTCGCAAAATAAGTTGAAGCC--C--TAGATTTATAAATCCAAACCTCGAAT 1611
||| |||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 1558 CTAGGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAAGCCGGCCCTTGAT--ATAAATCCAAACCTCAAAT 1615
Query 1612 GTAATAACAATTGTACTGTATGTATT-TTA----A-GAC--C-T-----T-ATGTGTTTT 1656
|||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | | ||||||| |
Sbjct 1616 GTAATAACAATTGTACTGTATGTATTATTATTTTAAGACTGCCTAAACCTTATGTGTTGT 1675
Query 1657 GTATATGATGTTAATAATGTTGTAATAATCGGATCCTAATTTCGTG-CACAGTTCATAAA 1715
|| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||||
Sbjct 1676 GTGTATGTTGTTAATAATGTTGTGATAATCGGATCTTAATT-CGGGGC-CAGTTCATAAA 1733
Query 1716 TAAATAAAAATGTA 1729
||||||||||||||
Sbjct 1734 TAAATAAAAATGTA 1747
> Ahg474221 jgi|Araly1|474221|fgenesh2_kg.1__4175__AT1G47600.1
Length=1707
Score = 2556 bits (1384), Expect = 0.0
Identities = 1593/1691 (94%), Gaps = 26/1691 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 17 CATCAATAAAGAAAATAC--A---AACCATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGC 71
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 CATCAATAAAGAAAATACAAACTCAACCATGGCAATTACAAAAGCTCACTACTCTTTAGC 62
Query 72 TGTTCTTGTCCTTCTCTTTGTCGTCGTTTCGAGTAGCCAAAAGGTTTGCAATCCAGAATG 131
||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 63 AGTTCTTGTCGTTCTC-TT-T-GTCGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATG 119
Query 132 CAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGATAATACTCATGCATTCAACCGTACGGGATTTCC 191
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 120 CAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGACAATACTCATGCATTCAACCGAACTGGATTTCC 179
Query 192 CAGAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAG 251
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCATATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAG 239
Query 252 AGCACTTAATGGATGGGACTATTTCACGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAG 311
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 240 AGCACTTAATGGATGGGACTACTTCACTCATAGATATCCAGAAAAAGTTCCGGATCGCAG 299
Query 312 TTCAGGAGATCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAA 371
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TTCAGGAGACCTTGCGTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAA 359
Query 372 AAGAATGAATGTTCAAGCTTACAGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGG 431
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AAGAATGAATGTTCAAGCATACCGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGG 419
Query 432 AAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGA 491
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 AAGACTGATTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGA 479
Query 492 GTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAAAC 551
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 480 GTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTGACTATTTTTCATTGGGATGTTCCCCAGAC 539
Query 552 TTTAGAAGACGAATATGGAGGTTTCTTAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTA 611
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCTTAAGCTCACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTA 599
Query 612 CGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCA 671
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTTGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCA 659
Query 672 GCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGCTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCAC 731
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGTTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCAC 719
Query 732 CGGCTGTGAACTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACT 791
|||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CGGCTGTGAATTTGGAGGAGATTCCGGAGTGGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACT 779
Query 792 TCTAGCTCATGCAAAAACTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGG 851
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TCTAGCTCATGCCAAAGCTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGG 839
Query 852 TAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAAATGAATTTAGCGAA-C 910
|||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || | || |
Sbjct 840 TAAGATTGGAACAACTTTGATTGGGAGATGGTTCGCCCCACTAAACGAATCTAAC-AATC 898
Query 911 TCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGACTTTTTT-GTTGGATGGTTCTTGGATCCA 969
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGA-TTTTTTCGTTGGATGGTTCTTGGATCCA 957
Query 970 TTGGTGTACGGAAAATATCCAACGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAA 1029
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 TTGGTGTATGGAAAATATCCAAAGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAA 1017
Query 1030 TTCAC-TCCTGAGCAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTA 1088
||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1018 TTCACAT-CGGAGGAATCAGCTTTAGTAAAAGGATCACTTGATTTTTTAGGGTTGAACTA 1076
Query 1089 TTATGTTACACAATATGCAACTGACGCACCTCCTCCGACACAACTTAATGCAATAACGGA 1148
||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1077 TTACGTTACACAATATGCAACCGACGCACCTGCTCCAACACAACCTAGTGCAATAACGGA 1136
Query 1149 TGCACGAGTTACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAG 1208
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 TCCACGAGTTACTCTTGGATTTTACCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAG 1196
Query 1209 CTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAA 1268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 CTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAA 1256
Query 1269 AAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAAC 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 AAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAAC 1316
Query 1329 GCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTG 1388
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGAATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTG 1376
Query 1389 TCTTAAATGCGCTATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGAT 1448
||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1377 TCTCAAATGCGTTATGATGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCACTGAT 1436
Query 1449 GGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAATTT 1508
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1437 GGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTT 1496
Query 1509 CACTAATCCTGCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGC 1568
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1497 CACTAATCCTGCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCCTCGC 1556
Query 1569 AAAATAAGTTGAAGCC--C--TAGATTTATAAATCCAAACCTCGAATGTAATAACAATTG 1624
||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1557 AAAATAAGTGGAAGCCGGCCCTTGAT--ATAAATCCAAACCTCGAACGTAATAACAATGG 1614
Query 1625 TACTGTATGTATT-TTAAGACCTTATGTGT-T-TTGTATATGATGTTAATAATGTTGTAA 1681
||||||||||||| ||| ||| | || | |||||| | ||||||||||||||| |
Sbjct 1615 TACTGTATGTATTATTATTTT-TTAAGAGTGTATTGTATGT--TGTTAATAATGTTGTGA 1671
Query 1682 TAATCGGATCC 1692
|||||||||||
Sbjct 1672 TAATCGGATCC 1682
> Ahg922901 jgi|Araly1|922901|scaffold_104182.1
Length=1574
Score = 2531 bits (1370), Expect = 0.0
Identities = 1500/1563 (96%), Gaps = 8/1563 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 24 AAAGAAAATAC-AA---A-CCATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGCTGTTCTT 78
||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 AAAGAAAATACAAACTCAGCCATGGCAATTACAAAAGCTCACTACTCTTTAGCAGTTCTT 60
Query 79 GTCCTTCTCTTTGTCGTCGTTTCGAGTAGCCAAAAGGTTTGCAATCCAGAATGCAAGGCC 138
||| ||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTCGTTCTC-TT-T-GTCGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCC 117
Query 139 AAAGAACCCTTCCACTGCGATAATACTCATGCATTCAACCGTACGGGATTTCCCAGAAAT 198
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||
Sbjct 118 AAAGAACCCTTCCACTGCGACAATACTCATGCATTCAACCGAACTGGATTTCCCAAAAAT 177
Query 199 TTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTT 258
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 TTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCATATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTT 237
Query 259 AATGGATGGGACTATTTCACGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGGA 318
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 238 AATGGATGGGACTACTTCACTCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGCAGTTCAGGA 297
Query 319 GATCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATG 378
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 GACCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATG 357
Query 379 AATGTTCAAGCTTACAGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTG 438
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 AATGTTCAAGCATACCGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTG 417
Query 439 ACTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAA 498
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 ATTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAA 477
Query 499 GCAAATGGCATAGAACCATATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAAACTTTAGAA 558
|||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 478 GCAAATAGCATAGAACCATATGTGACTATTTTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAA 537
Query 559 GACGAATATGGAGGTTTCTTAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAG 618
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 538 GACGAATATGGAGGCTTCTTAAGCCCACGTATAGTGGAGGATTACACAAACTACGCTGAG 597
Query 619 CTTCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTC 678
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 CTTCTATTCCAAAGGTTCGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTC 657
Query 679 TCTCTTGCAACCAAAGGCTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGT 738
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TCTCTTGCAACCAAAGGTTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGT 717
Query 739 GAACTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCT 798
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 718 GAATTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATTACCAACTTCTAGCT 777
Query 799 CATGCAAAAACTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATA 858
||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 778 CATGCGAAAGCTGTATCTCTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTCCAAGGTGGTAAGATA 837
Query 859 GGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAAATGAATTTAGCGAACTCGACAAG 918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 838 GGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAAACGAATTTAGCGAACTCGACAAA 897
Query 919 GCTGCTGCAAAACGAGCATTCGACTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTAC 978
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GCTGCTGCAAAACGAGCATTTGATTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTAC 957
Query 979 GGAAAATATCCAACGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACTCCT 1038
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 958 GGAAAATATCCAAAGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCT 1017
Query 1039 GAGCAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTATGTTACA 1098
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1018 GAGGAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTACA 1077
Query 1099 CAATATGCAACTGACGCACCTCCTCCGACACAACTTAATGCAATAACGGATGCACGAGTT 1158
||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1078 CAATATGCAACCGACGCACCTGCTCCGACACAACCTAGTGCAATAACCGATCCACGAGTT 1137
Query 1159 ACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTAC 1218
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ACTCTTGGATTTTACCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTAC 1197
Query 1219 TATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTT 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTT 1257
Query 1279 ACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACT 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACT 1317
Query 1339 GCTCTTGCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTTAAATGC 1398
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1318 GCTCTTGCCGATAATGGACGAATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGC 1377
Query 1399 GCTATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTAC 1458
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 GCCATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTAC 1437
Query 1459 GAATTCGGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAATTTCACTAATCCT 1518
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1438 GAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCT 1497
Query 1519 GCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAAGTT 1578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCCTCGCAAAATAAGTG 1557
Query 1579 GAA 1581
|||
Sbjct 1558 GAA 1560
> Ahg914284 jgi|Araly1|914284|Al_scaffold_0001_4538
Length=1515
Score = 1853 bits (1003), Expect = 0.0
Identities = 1377/1551 (89%), Gaps = 51/1551 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 40 ATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGCTGTTC-TTGTCCTTCTCTTTGTCGTCGT 98
||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| | | |
Sbjct 1 ATGGCAATTCCAAAACCTCACTACTCTTTAGC-CATCATTGTTGTTCTCTTTG-CAT--T 56
Query 99 TTCGAGTAGCCAAAAGGTTTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGA 158
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 57 TTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCGAAGAACCCTTCAACTGCGA 116
Query 159 TAATACTCATGCATTCAACCGTACGGGATTTCCCAGAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTAC 218
|| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 117 CAAAACTCTTGCATTCAACCGAAATGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCCAC 176
Query 219 TTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCAC 278
|||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 TTCGGCATACCAGATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCAC 236
Query 279 GCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGGAGATCTTGCTTGTGATTCGTA 338
||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 237 TCATAGATATCCAGAAAAAGTACCAGATCGCAGTACGGGAGACCTTGCTTGTAATTCGTA 296
Query 339 TGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCTTACAGACT 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
Sbjct 297 TGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCGATT 356
Query 399 CTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAGAA 458
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||
Sbjct 357 CTCAATAGCATGGTCGAGGGTCTTACCAAAGGGAAGATTAATTGGGGGAGTCGATGAGAA 416
Query 459 TGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 TGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATT 476
Query 519 TGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAAACTTTAGAAGACGAATATGGAGGTTTCTT 578
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 477 TGTGACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCTT 536
Query 579 AAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGG 638
|||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 AAGCCCACGTATAGTGGAGGACTTCAAAAATTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGG 596
Query 639 AGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGCTA 698
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 597 AGACAGAGTTAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCGTTCTCTCTCGCAACCAAAGGTTA 656
Query 699 TGGAGATGGATC-GTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGATTCTG 757
|||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 657 TGGAGATGGA-CAGTATCCACCAGGACGGTGCACTGACTGTGAATTTGGAGGAGATTCTG 715
Query 758 GAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTATCTT 817
|| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 716 GAACTGAACCTTATATAGTTGGACATCACGAACTTCTAGCACACGCGGAAACTGTATCTT 775
Query 818 TATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGA 877
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |
Sbjct 776 TATACCGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGGACGACATTGATCGGTA 835
Query 878 GATGGTTCGCCCCGCTAAATGAATTTAGCGAA-CTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCA 936
|||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 GATGGTTCATCCCACTAAATGAAACTAGC-AATCTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCA 894
Query 937 TTCGACTTTTTT-GTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAACGAT 995
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||
Sbjct 895 TTCGA-TTTTTCAGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTATACGGACAATATCCAAAGAT 953
Query 996 AATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACTCCTGAGCAATCAGCTTTAGT 1055
||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |
Sbjct 954 AATGAGAGAGATGTTAGGAGATAGACTACCAAAATTCACGCCTGAGGAATCAGCTTTACT 1013
Query 1056 TAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTATGTTACACA-ATATGCAAC-TGAC 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||
Sbjct 1014 TAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTACTACGTTACA-AGATATGCAACCT-AC 1071
Query 1114 GCACCTCCTCC---G---ACACAACTTAATG-CAATAACGGATGCACGAGTTACTCTTGG 1166
|||||||||| | ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| ||||
Sbjct 1072 ACACCTCCTCCAATGCCGACACAACCTAGTGTCC-TAACTGATTCAGGAGTTACTATTGG 1130
Query 1167 ATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCC 1226
|||| | ||||||||||||||||||||| || |||| || | | |||
Sbjct 1131 ATTTGAGCGCAATGGAGTTCCTATTGGTATTAAGGCT---AG--------A-T-TCC--- 1174
Query 1227 AGGATTCCGTCAGATTCTAAA-CTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACA 1285
| | | |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1175 -G--T-C----AGATTCTAAATC-ACATCAAAAACAACTACAAGAATCCACTAACCTACA 1225
Query 1286 TCACCGAAAACGGAGTTGCTGAT-CTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTT 1344
||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| |||||| |||||||
Sbjct 1226 TCACCGAAAACGGAGTTGCTGATGCT-GATTTTGGAAACGTTACGATTGCAAATGCTCTT 1284
Query 1345 GCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTTAAATGCGCTATG 1404
|||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 1285 GCCGATAATGGACGAATTCAATTTCAATGCAGCCATCTTTCTTGTCTCAAATGCGCCATG 1344
Query 1405 AAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTC 1464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 CAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTC 1404
Query 1465 GGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAATTTCACTAATCCTGCTGAT 1524
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1405 GGAAATGGTTACACTCTCCGGTTCGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTGCTGAT 1464
Query 1525 CGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAA 1575
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||
Sbjct 1465 CGAAGAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCATTGCAAAATAA 1515
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 65477131155
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5