BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G47600.1 Length=1745 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg474259 jgi|Araly1|474259|fgenesh2_kg.1__4213__AT1G47600.1 2678 0.0 Ahg474221 jgi|Araly1|474221|fgenesh2_kg.1__4175__AT1G47600.1 2556 0.0 Ahg922901 jgi|Araly1|922901|scaffold_104182.1 2531 0.0 Ahg914284 jgi|Araly1|914284|Al_scaffold_0001_4538 1853 0.0 > Ahg474259 jgi|Araly1|474259|fgenesh2_kg.1__4213__AT1G47600.1 Length=1748 Score = 2678 bits (1450), Expect = 0.0 Identities = 1658/1754 (95%), Gaps = 32/1754 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATCACCAAAAGAAGCACATCAATAAAGAAAATAC--A---AACCATGGCAATTCCAAAAG 55 |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| Sbjct 1 ATCACCAAAATAAGCCCATCAATAAAGAAAATACAAACTCAACCATGGCAATTACAAAAG 60 Query 56 CTCACTACTCTTTAGCTGTTCTTGTCCTTCTCTTTGTCGTCGTTTCGAGTAGCCAAAAGG 115 |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| | Sbjct 61 CTCACTACTCCTTAGCAGTTCTTGTCGTTCTC-TT-T-GTCGTTTCGAGTAGCCAAAAAG 117 Query 116 TTTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGATAATACTCATGCATTCA 175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 118 TCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGACAATACTCATGCATTCA 177 Query 176 ACCGTACGGGATTTCCCAGAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCTTATCAAATTG 235 |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 178 ACCGAACTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCATATCAAATTG 237 Query 236 AAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCACGCATAGATATCCAGAAA 295 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 238 AAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTACTTCACTCATAGATATCCAGAAA 297 Query 296 AAGTACCGGATCGTAGTTCAGGAGATCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATG 355 |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 AAGTTCCCGATCGCAGTTCAGGAGACCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATG 357 Query 356 ATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCTTACAGACTCTCGATAGCATGGTCAA 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 358 ATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCGACTCTCGATAGCATGGTCAA 417 Query 416 GGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACA 475 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 GGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGATTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACA 477 Query 476 ACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTTACTATATTTCATT 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 478 ACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTGACTATATTTCATT 537 Query 536 GGGATGTTCCCCAAACTTTAGAAGACGAATATGGAGGTTTCTTAAGCACACGTATAGTGG 595 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct 538 GGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCTTAAGCCCACGTATAGTGG 597 Query 596 AGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGGGTCAAATTTT 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 598 AGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTTGGAGACAGGGTCAAATTTT 657 Query 656 GGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGCTATGGAGATGGATCGTATC 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 658 GGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGTTATGGAGATGGATCGTATC 717 Query 716 CACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAG 775 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 CACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAATTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAG 777 Query 776 TTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATC 835 |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 TTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCCAAAGCTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATC 837 Query 836 AGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAA 895 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 AGAAATTCCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAA 897 Query 896 ATGAATTTAGCGAACTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGACTTTTTTGTTGGAT 955 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 898 ACGAATTTAGCGAACTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGATTTTTTTGTTGGAT 957 Query 956 GGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAACGATAATGAGAGAGATGGTAGGAG 1015 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct 958 GGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAAAGATTATGAGAGAGATGGTAGGAG 1017 Query 1016 ATAGATTGCCAGAATTCACTCCTGAGCAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTC 1075 ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 ATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTC 1077 Query 1076 TAGGGTTGAACTATTATGTTACACAATATGCAACTGACGCACCTCCTCCGACACAACTTA 1135 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| || Sbjct 1078 TAGGGTTGAACTATTACGTTACACAATATGCAACCGACGCACCTGCTCCGGCAAAACCTA 1137 Query 1136 ATGCAATAACGGATGCACGAGTTACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTG 1195 ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 GTGCAATAACTGATCCACGAGTTACTCTTGGATTTTACCGCAATGGAGTTCCTATTGGTG 1197 Query 1196 TTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCA 1255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 TTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCA 1257 Query 1256 AAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATC 1315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 AAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATC 1317 Query 1316 TTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCA 1375 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1318 TTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGAATTCAAAACCATTGCA 1377 Query 1376 GCCATCTCTCTTGTCTTAAATGCGCTATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTG 1435 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1378 GCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGCCATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTG 1437 Query 1436 CATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGA 1495 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1438 CATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGA 1497 Query 1496 ATTGGGTCAATTTCACTAATCCTGCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCT 1555 |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1498 ATTGGGTCAACTTCACTAATCCTTCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCT 1557 Query 1556 CTAAGTTCCTCGCAAAATAAGTTGAAGCC--C--TAGATTTATAAATCCAAACCTCGAAT 1611 ||| |||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| Sbjct 1558 CTAGGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAAGCCGGCCCTTGAT--ATAAATCCAAACCTCAAAT 1615 Query 1612 GTAATAACAATTGTACTGTATGTATT-TTA----A-GAC--C-T-----T-ATGTGTTTT 1656 |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | | ||||||| | Sbjct 1616 GTAATAACAATTGTACTGTATGTATTATTATTTTAAGACTGCCTAAACCTTATGTGTTGT 1675 Query 1657 GTATATGATGTTAATAATGTTGTAATAATCGGATCCTAATTTCGTG-CACAGTTCATAAA 1715 || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | | ||||||||||| Sbjct 1676 GTGTATGTTGTTAATAATGTTGTGATAATCGGATCTTAATT-CGGGGC-CAGTTCATAAA 1733 Query 1716 TAAATAAAAATGTA 1729 |||||||||||||| Sbjct 1734 TAAATAAAAATGTA 1747 > Ahg474221 jgi|Araly1|474221|fgenesh2_kg.1__4175__AT1G47600.1 Length=1707 Score = 2556 bits (1384), Expect = 0.0 Identities = 1593/1691 (94%), Gaps = 26/1691 (2%) Strand=Plus/Plus Query 17 CATCAATAAAGAAAATAC--A---AACCATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGC 71 |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3 CATCAATAAAGAAAATACAAACTCAACCATGGCAATTACAAAAGCTCACTACTCTTTAGC 62 Query 72 TGTTCTTGTCCTTCTCTTTGTCGTCGTTTCGAGTAGCCAAAAGGTTTGCAATCCAGAATG 131 ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 63 AGTTCTTGTCGTTCTC-TT-T-GTCGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATG 119 Query 132 CAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGATAATACTCATGCATTCAACCGTACGGGATTTCC 191 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 120 CAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGACAATACTCATGCATTCAACCGAACTGGATTTCC 179 Query 192 CAGAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAG 251 || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 CAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCATATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAG 239 Query 252 AGCACTTAATGGATGGGACTATTTCACGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAG 311 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 240 AGCACTTAATGGATGGGACTACTTCACTCATAGATATCCAGAAAAAGTTCCGGATCGCAG 299 Query 312 TTCAGGAGATCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAA 371 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 TTCAGGAGACCTTGCGTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAA 359 Query 372 AAGAATGAATGTTCAAGCTTACAGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGG 431 |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 AAGAATGAATGTTCAAGCATACCGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGG 419 Query 432 AAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGA 491 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 AAGACTGATTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGA 479 Query 492 GTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAAAC 551 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 480 GTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATATGTGACTATTTTTCATTGGGATGTTCCCCAGAC 539 Query 552 TTTAGAAGACGAATATGGAGGTTTCTTAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTA 611 ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 TTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCTTAAGCTCACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTA 599 Query 612 CGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCA 671 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 CGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTTGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCA 659 Query 672 GCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGCTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCAC 731 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 GCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGTTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCAC 719 Query 732 CGGCTGTGAACTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACT 791 |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 CGGCTGTGAATTTGGAGGAGATTCCGGAGTGGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACT 779 Query 792 TCTAGCTCATGCAAAAACTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGG 851 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TCTAGCTCATGCCAAAGCTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGG 839 Query 852 TAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAAATGAATTTAGCGAA-C 910 |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || | || | Sbjct 840 TAAGATTGGAACAACTTTGATTGGGAGATGGTTCGCCCCACTAAACGAATCTAAC-AATC 898 Query 911 TCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGACTTTTTT-GTTGGATGGTTCTTGGATCCA 969 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 899 TCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCATTCGA-TTTTTTCGTTGGATGGTTCTTGGATCCA 957 Query 970 TTGGTGTACGGAAAATATCCAACGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAA 1029 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 TTGGTGTATGGAAAATATCCAAAGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAA 1017 Query 1030 TTCAC-TCCTGAGCAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTA 1088 ||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1018 TTCACAT-CGGAGGAATCAGCTTTAGTAAAAGGATCACTTGATTTTTTAGGGTTGAACTA 1076 Query 1089 TTATGTTACACAATATGCAACTGACGCACCTCCTCCGACACAACTTAATGCAATAACGGA 1148 ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| Sbjct 1077 TTACGTTACACAATATGCAACCGACGCACCTGCTCCAACACAACCTAGTGCAATAACGGA 1136 Query 1149 TGCACGAGTTACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAG 1208 | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 TCCACGAGTTACTCTTGGATTTTACCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAG 1196 Query 1209 CTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAA 1268 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 CTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAA 1256 Query 1269 AAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAAC 1328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 AAATCCACTTACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAAC 1316 Query 1329 GCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTG 1388 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 GCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATGGACGAATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTG 1376 Query 1389 TCTTAAATGCGCTATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGAT 1448 ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1377 TCTCAAATGCGTTATGATGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCACTGAT 1436 Query 1449 GGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAATTT 1508 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1437 GGACAATTACGAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTT 1496 Query 1509 CACTAATCCTGCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGC 1568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1497 CACTAATCCTGCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCCTCGC 1556 Query 1569 AAAATAAGTTGAAGCC--C--TAGATTTATAAATCCAAACCTCGAATGTAATAACAATTG 1624 ||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 1557 AAAATAAGTGGAAGCCGGCCCTTGAT--ATAAATCCAAACCTCGAACGTAATAACAATGG 1614 Query 1625 TACTGTATGTATT-TTAAGACCTTATGTGT-T-TTGTATATGATGTTAATAATGTTGTAA 1681 ||||||||||||| ||| ||| | || | |||||| | ||||||||||||||| | Sbjct 1615 TACTGTATGTATTATTATTTT-TTAAGAGTGTATTGTATGT--TGTTAATAATGTTGTGA 1671 Query 1682 TAATCGGATCC 1692 ||||||||||| Sbjct 1672 TAATCGGATCC 1682 > Ahg922901 jgi|Araly1|922901|scaffold_104182.1 Length=1574 Score = 2531 bits (1370), Expect = 0.0 Identities = 1500/1563 (96%), Gaps = 8/1563 (1%) Strand=Plus/Plus Query 24 AAAGAAAATAC-AA---A-CCATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGCTGTTCTT 78 ||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1 AAAGAAAATACAAACTCAGCCATGGCAATTACAAAAGCTCACTACTCTTTAGCAGTTCTT 60 Query 79 GTCCTTCTCTTTGTCGTCGTTTCGAGTAGCCAAAAGGTTTGCAATCCAGAATGCAAGGCC 138 ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GTCGTTCTC-TT-T-GTCGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCC 117 Query 139 AAAGAACCCTTCCACTGCGATAATACTCATGCATTCAACCGTACGGGATTTCCCAGAAAT 198 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| Sbjct 118 AAAGAACCCTTCCACTGCGACAATACTCATGCATTCAACCGAACTGGATTTCCCAAAAAT 177 Query 199 TTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTT 258 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 178 TTCACTTTTGGTGCAGCTACTTCGGCATATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTT 237 Query 259 AATGGATGGGACTATTTCACGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGGA 318 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 238 AATGGATGGGACTACTTCACTCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGCAGTTCAGGA 297 Query 319 GATCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATG 378 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 GACCTTGCTTGTGATTCGTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATG 357 Query 379 AATGTTCAAGCTTACAGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTG 438 ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 358 AATGTTCAAGCATACCGACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTG 417 Query 439 ACTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAA 498 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 ATTGGGGGAGTGGACGAGAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAA 477 Query 499 GCAAATGGCATAGAACCATATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAAACTTTAGAA 558 |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 478 GCAAATAGCATAGAACCATATGTGACTATTTTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAA 537 Query 559 GACGAATATGGAGGTTTCTTAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAG 618 |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 538 GACGAATATGGAGGCTTCTTAAGCCCACGTATAGTGGAGGATTACACAAACTACGCTGAG 597 Query 619 CTTCTATTCCAAAGATTCGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTC 678 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 CTTCTATTCCAAAGGTTCGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTC 657 Query 679 TCTCTTGCAACCAAAGGCTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGT 738 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 TCTCTTGCAACCAAAGGTTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGT 717 Query 739 GAACTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCT 798 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 718 GAATTTGGAGGAGATTCTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATTACCAACTTCTAGCT 777 Query 799 CATGCAAAAACTGTATCTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATA 858 ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 778 CATGCGAAAGCTGTATCTCTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTCCAAGGTGGTAAGATA 837 Query 859 GGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAAATGAATTTAGCGAACTCGACAAG 918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 838 GGAACAACCTTGATCGGGAGATGGTTCGCCCCGCTAAACGAATTTAGCGAACTCGACAAA 897 Query 919 GCTGCTGCAAAACGAGCATTCGACTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTAC 978 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GCTGCTGCAAAACGAGCATTTGATTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTAC 957 Query 979 GGAAAATATCCAACGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACTCCT 1038 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 958 GGAAAATATCCAAAGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCT 1017 Query 1039 GAGCAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTATGTTACA 1098 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1018 GAGGAATCAGCTTTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTACA 1077 Query 1099 CAATATGCAACTGACGCACCTCCTCCGACACAACTTAATGCAATAACGGATGCACGAGTT 1158 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| Sbjct 1078 CAATATGCAACCGACGCACCTGCTCCGACACAACCTAGTGCAATAACCGATCCACGAGTT 1137 Query 1159 ACTCTTGGATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTAC 1218 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 ACTCTTGGATTTTACCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTAC 1197 Query 1219 TATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTT 1278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 TATCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTT 1257 Query 1279 ACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACT 1338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 ACCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACT 1317 Query 1339 GCTCTTGCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTTAAATGC 1398 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1318 GCTCTTGCCGATAATGGACGAATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGC 1377 Query 1399 GCTATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTAC 1458 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1378 GCCATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTAC 1437 Query 1459 GAATTCGGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAATTTCACTAATCCT 1518 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1438 GAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCT 1497 Query 1519 GCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAAGTT 1578 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1498 TCTGATCGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCCTCGCAAAATAAGTG 1557 Query 1579 GAA 1581 ||| Sbjct 1558 GAA 1560 > Ahg914284 jgi|Araly1|914284|Al_scaffold_0001_4538 Length=1515 Score = 1853 bits (1003), Expect = 0.0 Identities = 1377/1551 (89%), Gaps = 51/1551 (3%) Strand=Plus/Plus Query 40 ATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGCTGTTC-TTGTCCTTCTCTTTGTCGTCGT 98 ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| | | | Sbjct 1 ATGGCAATTCCAAAACCTCACTACTCTTTAGC-CATCATTGTTGTTCTCTTTG-CAT--T 56 Query 99 TTCGAGTAGCCAAAAGGTTTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCGA 158 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 57 TTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCGAAGAACCCTTCAACTGCGA 116 Query 159 TAATACTCATGCATTCAACCGTACGGGATTTCCCAGAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTAC 218 || |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 117 CAAAACTCTTGCATTCAACCGAAATGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCCAC 176 Query 219 TTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCAC 278 |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 177 TTCGGCATACCAGATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCAC 236 Query 279 GCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGGAGATCTTGCTTGTGATTCGTA 338 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 237 TCATAGATATCCAGAAAAAGTACCAGATCGCAGTACGGGAGACCTTGCTTGTAATTCGTA 296 Query 339 TGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCTTACAGACT 398 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | Sbjct 297 TGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCGATT 356 Query 399 CTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAGAA 458 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || ||||| Sbjct 357 CTCAATAGCATGGTCGAGGGTCTTACCAAAGGGAAGATTAATTGGGGGAGTCGATGAGAA 416 Query 459 TGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATA 518 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 417 TGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCATT 476 Query 519 TGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAAACTTTAGAAGACGAATATGGAGGTTTCTT 578 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 477 TGTGACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCTT 536 Query 579 AAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGG 638 |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 AAGCCCACGTATAGTGGAGGACTTCAAAAATTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCGG 596 Query 639 AGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAACCAAAGGCTA 698 |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct 597 AGACAGAGTTAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCGTTCTCTCTCGCAACCAAAGGTTA 656 Query 699 TGGAGATGGATC-GTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGATTCTG 757 |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| Sbjct 657 TGGAGATGGA-CAGTATCCACCAGGACGGTGCACTGACTGTGAATTTGGAGGAGATTCTG 715 Query 758 GAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTATCTT 817 || ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| || || |||||||||||| Sbjct 716 GAACTGAACCTTATATAGTTGGACATCACGAACTTCTAGCACACGCGGAAACTGTATCTT 775 Query 818 TATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGGA 877 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | Sbjct 776 TATACCGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGGACGACATTGATCGGTA 835 Query 878 GATGGTTCGCCCCGCTAAATGAATTTAGCGAA-CTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCA 936 |||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 836 GATGGTTCATCCCACTAAATGAAACTAGC-AATCTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCA 894 Query 937 TTCGACTTTTTT-GTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAACGAT 995 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| Sbjct 895 TTCGA-TTTTTCAGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTATACGGACAATATCCAAAGAT 953 Query 996 AATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACTCCTGAGCAATCAGCTTTAGT 1055 ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||| | Sbjct 954 AATGAGAGAGATGTTAGGAGATAGACTACCAAAATTCACGCCTGAGGAATCAGCTTTACT 1013 Query 1056 TAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTATGTTACACA-ATATGCAAC-TGAC 1113 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| | || Sbjct 1014 TAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTACTACGTTACA-AGATATGCAACCT-AC 1071 Query 1114 GCACCTCCTCC---G---ACACAACTTAATG-CAATAACGGATGCACGAGTTACTCTTGG 1166 |||||||||| | ||||||| || || | |||| ||| || |||||||| |||| Sbjct 1072 ACACCTCCTCCAATGCCGACACAACCTAGTGTCC-TAACTGATTCAGGAGTTACTATTGG 1130 Query 1167 ATTTTATCGCAATGGAGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCC 1226 |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| || | | ||| Sbjct 1131 ATTTGAGCGCAATGGAGTTCCTATTGGTATTAAGGCT---AG--------A-T-TCC--- 1174 Query 1227 AGGATTCCGTCAGATTCTAAA-CTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACA 1285 | | | |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 1175 -G--T-C----AGATTCTAAATC-ACATCAAAAACAACTACAAGAATCCACTAACCTACA 1225 Query 1286 TCACCGAAAACGGAGTTGCTGAT-CTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTT 1344 ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| Sbjct 1226 TCACCGAAAACGGAGTTGCTGATGCT-GATTTTGGAAACGTTACGATTGCAAATGCTCTT 1284 Query 1345 GCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTTAAATGCGCTATG 1404 |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| Sbjct 1285 GCCGATAATGGACGAATTCAATTTCAATGCAGCCATCTTTCTTGTCTCAAATGCGCCATG 1344 Query 1405 AAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTC 1464 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1345 CAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTC 1404 Query 1465 GGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAATTTCACTAATCCTGCTGAT 1524 |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1405 GGAAATGGTTACACTCTCCGGTTCGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTGCTGAT 1464 Query 1525 CGAAAAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAA 1575 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| Sbjct 1465 CGAAGAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCATTGCAAAATAA 1515 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 65477131155 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5