BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G48430.1

Length=2137
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg336963 jgi|Araly1|336963|fgenesh1_pg.C_scaffold_1003528          2854    0.0  
  Ahg929642 jgi|Araly1|929642|scaffold_302099.1                       1820    0.0  


> Ahg336963 jgi|Araly1|336963|fgenesh1_pg.C_scaffold_1003528
Length=1782

 Score = 2854 bits (1545),  Expect = 0.0
 Identities = 1706/1785 (96%), Gaps = 6/1785 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  118   ATGGTTCCTCCGGCTAAAAAATTCATCAACAACCCCAACGATGTTGTAACCGAGTTCATC  177
             |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1     ATGGTTCCACCAGCTAAAAAATTCATCAACAACCCCAACGATGTTGTAACCGAGTTCATT  60

Query  178   GAAGGTCTCGTCGAAACTTATCCTGGACTTCAGTATTTGGATGGTCTTCCCGAGATCAAA  237
             || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  61    GAGGGTCTCGTTGAAACTTATCCTGGACTTCAGTATTTGGATGGTCTTCCTGAGATCAAA  120

Query  238   GTTGTACTAAGAGCTGATGTCTCAGCTGCAAATTATGACAAGGTTGCCGTTATATCAGGA  297
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GTTGTACTAAGAGCTGATATCTCAGCTGCAAATTATGACAAGGTTGCCGTTATATCAGGA  180

Query  298   GGAGGAAGTGGGCATGAACCAGCACAAGCTGGGTATGTTGGAGAAGGAATGCTCACAGCT  357
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   GGAGGAAGTGGGCATGAACCAGCACAAGCTGGCTATGTTGGAGAAGGAATGCTCACAGCT  240

Query  358   GCTATTTGTGGAGATGTTTTTGCTTCGCCAACTGTTGATTCCATCCTAGCTAGGATTCGT  417
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| 
Sbjct  241   GCTATTTGTGGAGATGTTTTTGCTTCGCCACCTGTTGATTCCATCCTAGCTGGGATTCGA  300

Query  418   GCTGTAACTGGTCCAAAAGGATGCCTCTTGGTTGTCACGAACTATACTGGTGACCGCTTG  477
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct  301   GCTGTAACTGGTCCAAAAGGATGCCTCTTGGTTGTCACGAATTACACTGGTGACCGCTTG  360

Query  478   AACTTTGGCCTGGCAGCTGAGCAAGCAAAAACTGAGGGTTTCGATATAGAGACTGTAATT  537
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct  361   AACTTTGGCCTGGCAGCTGAGCAAGCAAAAATTGAGGGTTTCGAAATAGAGACTGTGATT  420

Query  538   GTTGGAGATGATTGTGCTCTACCCCCGCCGCGTGGCGTAGCTGGGCGCAGAGGTTTAGCG  597
             |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct  421   GTTGGAGACGATTGTGCTCTACCCCCGCCTCTTGGCATAGCTGGACGCAGAGGTTTAGCG  480

Query  598   GGAACAGTTCTTGTCCATAAGGTTGCTGGAGCAGCAGCTGCTGCTGGACTTTCTCTAGCA  657
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct  481   GGAACAATTCTTGTCCATAAGGTTGCTGGAGCAGCATCTGCTGCTGGTCTTTCTCTAGCA  540

Query  658   GAAGTTGCAGCAGAAGCAAAACATGCATCTGAAATGGTTGGAACCATGGGTGTTGCACTA  717
             ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  541   GAAGTTGCAGCGGAAGTAAAACATGCATCTGAAATGGTTGGGACCATGGGTGTTGCACTA  600

Query  718   TCTGTCTGTGCGCTTCCAGGACAGGTTACATCAGATCGTTTGGGTCCAGAGAAAATGGAA  777
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   TCTGTTTGTGCGCTTCCAGGACAGGTTACATCAGATCGTTTGGGTCCAGAGAAAATGGAA  660

Query  778   CTTGGGCTTGGAGTTCATGGGGAGCCTGGTGCTGCTGTAGTCGACATTCAACCTGTGGAA  837
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  661   CTTGGGCTTGGAGTTCATGGGGAGCCTGGTGCTGCTGTGGTCGACATTCAACCTGTGGAA  720

Query  838   GTTGTAGTGTCCCATGTTCTTCAACAGATACTGAGTCCAGAGACAAATTATGTTCCAATT  897
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  721   GTTGTAGTGTCCCATGTTCTTCAACAGATACTGAGTCCAGAGACCAATTATGTTCCAATT  780

Query  898   ACACGTGGTAACAGTGTGGTTCTGATGATTAATGGCTTAGGTGGTACACCTCTAATGGAA  957
             |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   ACACGTGGTAGCAGCGTGATTCTGATGGTTAATGGCTTAGGTGGTACACCTCTAATGGAA  840

Query  958   CTTATGATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCAAAATTACAGTTGGAATATGGGCTTGCCGTT  1017
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   CTTATGATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCAAAACTACAGTTGGAATATGGGCTTGCCGTT  900

Query  1018  GATAGGGTGTATACTGGATCATTTATGACGTCTCTTGATATGGCAGGGTTCTCGATATCG  1077
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   GATAGGGTGTATACTGGATCATTTATGACGTCTCTTGATATGGCAGGGTTCTCGATATCG  960

Query  1078  ATCATGAAGGCCGACCAGTCAATTTTAGAGCGTTTGGATGCTCCGACCAATGCTCCTAGT  1137
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  961   ATCATGAAGGCTGACCAGTCAATTTTAGAGCGTTTGGATGCTCCGACCAAGGCTCCTAGT  1020

Query  1138  TGGCCAGTTGGCACAGATGGAAGCCGCCCACCAGCAAAGATCCCCGTTCCACTTCCCTTC  1197
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1021  TGGCCAGTTGGCACAGATGGAAGCCGCCCACCAGCAAAGATCCCCGTTCCACTGCCCTTC  1080

Query  1198  CGATCAACCAAAAACGAAGAGTCTCGATACCGACCTCAGGAGCTTAGTCAACAGGGGC-G  1256
             |||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||| || |||  |
Sbjct  1081  CGATCAACAAAAAACAAAGAGTTTCTATGCCGACCTCAAGAGCTTAGTCATCAAGGGAAG  1140

Query  1257  AATTCTTGAGGCAGCTATTGAAGCAGCAGCAACTGTAGTCATCAATCTGAAGGATAGTTT  1316
             | | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct  1141  A-TCCTTGAGGCTGCTATTGAAGCAGCAGTAACTGTAGTCATAAATCTAAAGGATAGTTT  1199

Query  1317  GAACGAATGGGATGGAAAAGTAGGTGATGGGGATTGTGGATCAACAATGTGCAGAGGTGC  1376
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct  1200  GAATGAATGGGATGGAAAAGTAGGTGATGGGGACTGTGGATCAACAATGTGTAGAGGCGC  1259

Query  1377  AACAGCTATTCTGGAGGACATGAAGAAGTATTATCCGCTCAACGATGCTGCGGAAACAGT  1436
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct  1260  AACAGCTATTCTAGAGGACATGAAGAAGTATTATCCACTCAACGATGCCGCTGAAACAGT  1319

Query  1437  GAGTGAGATTGGTTCATCGATTAGAAGAGTCATGGGGGGAACAAGTGGAATAATTTACAA  1496
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1320  GAGTGAGATTGGTTCATCTATTAGAAGAGTCATGGGGGGGACAAGTGGAATAATTTACAA  1379

Query  1497  TCTCCTCTGTAAGGCAGCATATGCGGAGTTAAAAGCTAACAGT-CAATCAGAAACCACTT  1555
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| 
Sbjct  1380  TCTCCTCTGTAAGGCAGCATATGCGGAGTTAAAAGCTAAC-GTTCAGTCAGAAACCACT-  1437

Query  1556  CCAAA-CACTGGTCTGAAGCACTCAAGTCATCAATCTCTGCTGTCAGTAAATATGGTGGA  1614
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1438  CCAAAACACTGGTCTGAAGCACTCAAGTCATCAATCTCTGCTGTCAGTAAATATGGTGGA  1497

Query  1615  GCAACTGCCGGTTATAGAACGATGTTAGATGCGCTCATCCCCGCTTCAAAAGTCCTTGAG  1674
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1498  GCAACTTCCGGTTATAGAACGATGTTAGATGCGCTCATCCCAGCTTCAAAAGTCCTTGAG  1557

Query  1675  GAGAAGCTGAGTGTTGGGGAGGACCCTATTGCTGCTTTTGTTCTGTCTGCTGAAGCTGCG  1734
             |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1558  GAGAAGTTGAGTGCTGGGGAGGACCCTATTGCTGCTTTTGTTCTGTCTGCTGAAGCTGCA  1617

Query  1735  ACCGCAGGAGCTGAATCTACCATTCATATGAAAGCACAGGCCGGGAGATCAAGCTATGTA  1794
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1618  ACCGCAGGAGCTGAATCTACCATTCATATGAAAGCACAGGCCGGGAGATCAAGCTATGTA  1677

Query  1795  TCAGCTGAGATTTTTGCATCAATTCCTGATCCAGGAGCAATGGCTGCAGCGGCATGGTAC  1854
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1678  TCAGCTGAGATTCTTGCATCAATTCCTGATCCAGGTGCAATGGCTGCAGCGGCATGGTAC  1737

Query  1855  AGCGCCGCTGCAAGAGCCGTGAAAGAGCAGAGGCAGAGGTTTTGA  1899
             ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||
Sbjct  1738  AGCGCCGCTGCAAGAGCCGTGAAGGAGCAGAGCCAGGGGTTTTGA  1782


> Ahg929642 jgi|Araly1|929642|scaffold_302099.1
Length=1828

 Score = 1820 bits (985),  Expect = 0.0
 Identities = 1525/1786 (85%), Gaps = 35/1786 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  118   ATGGTTCCTC-CGGCTAAAAAATTCATCAACAACCCCAACGATGTTGTAACCGAGTTCAT  176
             ||||||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  21    ATGGTT-TTCGCGGCCAAGAAATTCATCAACAACCCCAACGATGTTGTAACTGAGTTCAT  79

Query  177   CGAAGGTCTCGTCGAAACTTATCCTGGACTTCAGTATTTGGATGGTC-TTCCCGAGATCA  235
              || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| | |
Sbjct  80    AGAGGGTCTGGTCGAAACTTATCCTGGACTCCAGTATTTGGATGG-CTTTCCTGAGGTTA  138

Query  236   AAGTTGTACTAAGAGCTGATGTCTCAGCTGCAAATTATGACAAGGTTGCCGTTATATCAG  295
             |||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  139   AAGTGGTGCTACGAGCTGATGTTTCAGCTGCAAAATATGACAAGGTTGCCGTTATCTCAG  198

Query  296   GAGGAGGAAGTGGGCATGAACCAGCACAAGCTGGGTATGTTGGAGAAGGAATGCTCACAG  355
             | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||
Sbjct  199   GTGGAGGCAGTGGGCATGAGCCTGCACATGCTGGATACGTTGGAGAAGGAATGCTAACAG  258

Query  356   CTGCTATTTGTGGAGATGTTTTTGCTTCGCCAACTGTTGATTCCATCCTAGCTAGG-ATT  414
             ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| ||| || || 
Sbjct  259   CTGCTATCTGTGGAGATGTCTTTGCCTCCCCACCAGTTGATTCTATCCTTGCT-GGAATC  317

Query  415   CGTGCTGTAACTGGTCCAAAAGGATGCCTCTTGGTTGTCACGAACTATACTGGTGACCGC  474
             || ||||||||||||    | ||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||| |||
Sbjct  318   CGAGCTGTAACTGGTAGTGAGGGATGTCTATTGATTGTCAAGAATTATACTGGTGATCGC  377

Query  475   TTGAACTTTGGCCTGGCAGCTGAGCAAGCAAAAACTGAGGGTTTCGATA-TAGAGACTGT  533
             |||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||| |||| | | | | ||||||||
Sbjct  378   TTGAACTTTGGTTTGGCTGCTGAACAAGCAAAATCTGAAGGTTAC-AAAGTTGAGACTGT  436

Query  534   AATTGTTGGAGATGATTGTGCTCTACCCCCGCCGCGTGGCGTAGCTGGGCGCAGAGGTTT  593
             |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||| |||||||| ||
Sbjct  437   AATTGTTGGAGAGGATTGCGCTTTACCCCCGCCACGTGGTATCGCTGGACGCAGAGGGTT  496

Query  594   AGCGGGAACAGTTCTTGTCCATAAGGTTGCTGGAGCAGCAGCTGCTGCTGGACTTTCTCT  653
             ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct  497   AGCAGGAACAGTTCTCGTCCATAAGGTTGCAGGTGCAGCAGCAGCTGCTGGTCTTTCTCT  556

Query  654   AGCAGAAGTTGCAGCAGAAGCAAAACATGCATCTGAAATGGTTGGAACCATGGGTGTTGC  713
             || | ||||||| || || ||||||  ||| || || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct  557   AGAAAAAGTTGCGGCTGAGGCAAAATGTGCGTCAGAGATGGTTGGTACCATGGGTGTTGC  616

Query  714   ACTATCTGTCTGTGCGCTTCCAGGACAGGTTACATCAGATCGTTTGGGTC-CAGAGAAAA  772
             | |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||| |
Sbjct  617   ATTATCCGTCTGTACACTTCCTGGACAGGTTACATCAGATCGTCTAGG-CGCAGAGAAGA  675

Query  773   TGGAACTTGGGCTTGGAGTTCATGGGGAGCCTGGTGCTGCTGTAGTCGACATTCAACCTG  832
             ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||||
Sbjct  676   TGGAACTCGGGCTTGGAATTCATGGAGAACCTGGTGCTGCTGTGGTTGACGTTCAACCTG  735

Query  833   TGGAAGTT-GTAGTGTCCCATGTTCTTCAACAGATACTGAGTCCAGAGACAAATTATGTT  891
             ||| | || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct  736   TGG-ATTTGGTGGTTTCCCATGTTCTTCAGCAGATACTTAGTCCTGAGACCAATTATGTT  794

Query  892   CCAATTACACGTGGTAACAGTGTGGTTCTGATGATTAATGGCTTAGGTGGTACACCTCTA  951
             |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || || || || ||| ||
Sbjct  795   CCAATTACACGTGGTAACAGAGTGGTTCTCATGGTTAATGGTTTGGGAGGCACCCCTTTA  854

Query  952   ATGGAACTTATGATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCAAAATTACAGTTGGAATATGGGCTT  1011
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||
Sbjct  855   ATGGAACTTATGATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCTAAACTGCAGTTGGAATTTGGACTT  914

Query  1012  GCCGTTGATAGGGTGTATACTGGATCATTTATGACGTCTCTTGATATGGCAGGGTTCTCG  1071
             |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  915   GCCGTTGATAGGGTGTATACAGGCTTTTTTATGACTTCTCTTGATATGGCAGGATTCTCG  974

Query  1072  ATATCGATCATGAAGGCCGACCAGTCAATTTTAGAGCGTTTGGATGCTCCGACCAATGCT  1131
             || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||
Sbjct  975   ATTTCAATCATGAAGGCTGACCAGTCGATTTTAGACCGATTGGATGCTCCAACCAAGGCT  1034

Query  1132  CCTAGTTGGCCAGTTGGCACAGATGG-AAGCCGCCCACCAGCAAAGATCCCCGTTCCACT  1190
             || | |||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||| || |||||  |
Sbjct  1035  CCAAATTGGCCTGTTGGCACTGATGGCAA-CCGGCCACCAGCGAAGATTCCTGTTCCTGT  1093

Query  1191  TCC-C-TTC-CGATCAACCAAAAACGAA--GAGTCTCGATAC-CGACCTC-AGGAGCTTA  1243
             ||| | ||| |||||||  ||||| | |  ||||||| | |  ||||||| || |||| |
Sbjct  1094  TCCTCCTTCTCGATCAAT-AAAAA-GCACCGAGTCTCAA-AGTCGACCTCTAG-AGCTGA  1149

Query  1244  GTCAACAGGGGC-GAATTCTTGAGGCAGCTATTGAAGCAGCAGCAACTGT-AGTCATCAA  1301
             || || |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| 
Sbjct  1150  GTAAAGAGGGTCAGA-TTCTTGAGGCAGCTATTCAAGCAGCAGCAACTGTGA-TCATCAG  1207

Query  1302  TCTGAAGGATAGTTTGAACGAATGGGATGGAAAAGTAGGTGATGGGGATTGTGGATCAAC  1361
              || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||
Sbjct  1208  CCTTAAGGATAGTTTGAACGAATGGGATGGAAAAGTGGGCGACGGTGATTGTGGGTCAAC  1267

Query  1362  AATGTGCAGAGGTGCAACAGCTATTCTGGAGGACATGAAGAAGTATTATCCGCTCAACGA  1421
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||
Sbjct  1268  AATGTACAGAGGTGCAACAGCTATTCTGGAGGACTTGAAAAACTATTATCCACTCAATGA  1327

Query  1422  TGCTGCGGAAACAGTGAGTGAGATTGGTTCATCGATTAGAAGAGTCATGGGGGGAACAAG  1481
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||
Sbjct  1328  TGCTGCGGAAACAGTGAATGAGATTGGTTCATCAATCAAAAGAGCCATGGGGGGCACAAG  1387

Query  1482  TGGAATAATTTACAATCTCCTCTGTAAGGCAGCATATGCGGAGTTAAAAGCTAACAG-TC  1540
              |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||
Sbjct  1388  CGGAATAATTTACCATCTCCTCTGCAAGGCAGCATACGCGGAGTTAAAAGCAAA-AGCTC  1446

Query  1541  AATCAGAAACCACTTCCAAACACTGGTCTGAAGCACTCAAGTCATCAATCTCTGCTGTCA  1600
             | ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||
Sbjct  1447  AGTCAGAAGTCACTCCCAAAAACTGGTCTGAAGCACTCAAGTCAGCAATCGCTTCAGTCA  1506

Query  1601  GTAAATATGGTGGAGCAACTGCCGGTTATAGAACGATGTTAGATGCGCTCATCCCCGCTT  1660
             | |||||||||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||
Sbjct  1507  GCAAATATGGTGGAGCAAGTGCAGGCTACAGAACGATGCTAGATGCTCTCATCCCAGCTT  1566

Query  1661  CAAAAGTCCTTGAGGAGAAGCTGAGTGTTGGGGAGGACCCTAT-TGCTGCTTTTGTTCTG  1719
             || |||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| || || | |||||||  |||||
Sbjct  1567  CACAAGTTCTTGAGGAGAAGTTGAGCGGTGGAGAGGATCCGATAT-CTGCTTTCATTCTG  1625

Query  1720  TCTGCTGAAGCTGCGACCGCAGGAGCTGAATCTACCATTCATATGAAAGCACAGGCCGGG  1779
             || || ||||| || || |||||||| ||||| || || || ||| |||||||||| |||
Sbjct  1626  TCAGCCGAAGCAGCAACTGCAGGAGCGGAATCAACAATACAGATGCAAGCACAGGCTGGG  1685

Query  1780  AGATCAAGCTATGTATCAGCTGAGATTTTTGCATCAATTCCTGATCCAGGAGCAATGGCT  1839
             |||||||||||||| || || |||||| ||||| |  |||| |||||||| |||||||| 
Sbjct  1686  AGATCAAGCTATGTGTCTGCAGAGATTCTTGCAACGGTTCCAGATCCAGGTGCAATGGCA  1745

Query  1840  GCAGC-GGCATGGTACAGCGCCGCTGCAAGAGCCGTGAAAGAGCAG  1884
             ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct  1746  GCAGCAGG-ATGGTACAGCGCCGCAGCAAGAGCCGTGAAGGAGCAG  1790



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 80408507195


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5