BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G51470.1
Length=1713
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg474259 jgi|Araly1|474259|fgenesh2_kg.1__4213__AT1G47600.1 2680 0.0
Ahg922901 jgi|Araly1|922901|scaffold_104182.1 2521 0.0
Ahg474221 jgi|Araly1|474221|fgenesh2_kg.1__4175__AT1G47600.1 2512 0.0
Ahg914284 jgi|Araly1|914284|Al_scaffold_0001_4538 1847 0.0
> Ahg474259 jgi|Araly1|474259|fgenesh2_kg.1__4213__AT1G47600.1
Length=1748
Score = 2680 bits (1451), Expect = 0.0
Identities = 1632/1716 (95%), Gaps = 25/1716 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 AACCATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGCAGTTCTTGTCCTTCTCTTTGTCGT 67
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||
Sbjct 41 AACCATGGCAATTACAAAAGCTCACTACTCCTTAGCAGTTCTTGTCGTTCTC-TT-T-GT 97
Query 68 CGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTG 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 CGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTG 157
Query 128 CGATAATACTCATGCATTCAACCGTAGTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGC 187
||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 CGACAATACTCATGCATTCAACCGAACTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGC 217
Query 188 TACTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTT 247
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 218 TACTTCGGCATATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTACTT 277
Query 248 CACGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGCAGATCTTGCTTGTGATTC 307
||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 278 CACTCATAGATATCCAGAAAAAGTTCCCGATCGCAGTTCAGGAGACCTTGCTTGTGATTC 337
Query 308 GTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTGCTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCG 367
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 GTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCG 397
Query 368 TCTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGA 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 398 ACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGATTGGGGGAGTGGACGA 457
Query 428 GAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACC 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 GAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACC 517
Query 488 ATATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTT 547
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 ATATGTGACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTT 577
Query 548 CTTAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATT 607
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 CTTAAGCCCACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATT 637
Query 608 CGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTCTCTCTCTTGC-ACTCAAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||
Sbjct 638 TGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAAC-CAAAG 696
Query 667 GCTATGGAAATGGATCTTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGATT 726
| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 697 GTTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAATTTGGAGGAGATT 756
Query 727 CTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTCT 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
Sbjct 757 CTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCCAAAGCTGTAT 816
Query 787 CTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCG 846
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 CTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTCCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCG 876
Query 847 GGAGATGGTTCGTCCCGCTAAATGAATTTAGTGAACTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAG 906
|||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 GGAGATGGTTCGCCCCGCTAAACGAATTTAGCGAACTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAG 936
Query 907 CATTCGACTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAACA- 965
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 937 CATTCGATTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAA-AG 995
Query 966 ATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCTTTA 1025
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 ATTATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCTTTA 1055
Query 1026 GTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTTCACAATATGCAACTGAC 1085
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 1056 GTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTACACAATATGCAACCGAC 1115
Query 1086 GCACCTCCTCCGACACAACCTAATGCAATAACGGATGCACGAGTTACTCTTGGATTTTAC 1145
|||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 GCACCTGCTCCGGCAAAACCTAGTGCAATAACTGATCCACGAGTTACTCTTGGATTTTAC 1175
Query 1146 CGCAATGGAAG-TCCTATTGGTGTTGTGGCTTCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATT 1204
|||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 CGCAATGG-AGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATT 1234
Query 1205 CCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGA 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235 CCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGA 1294
Query 1265 AAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAA 1324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 AAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAA 1354
Query 1325 TGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGCCATGAAGGATGG 1384
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 TGGACGAATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGCCATGAAGGATGG 1414
Query 1385 ATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGG 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 ATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGG 1474
Query 1445 TTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTGCTGATCGTAAAGA 1504
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 1475 TTACACTCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTTCTGATCGAAAAGA 1534
Query 1505 GAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAAGCC--C--TAG 1560
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |
Sbjct 1535 AAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAAGCCGGCCCTTG 1594
Query 1561 ATATAAATCCAAACCTCGAATGTAATAACAATTGCACTGTATGTATTTCATCT-TTTTAA 1619
||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||
Sbjct 1595 ATATAAATCCAAACCTCAAATGTAATAACAATTGTACTGTATGTATT--AT-TATTTTAA 1651
Query 1620 AACTACCTATACCTT--GT-T-GTGTGT-TGTT---ACTAATGTTGTAATAATCGAATCT 1671
||| |||| ||||| || | |||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 1652 GACTGCCTAAACCTTATGTGTTGTGTGTATGTTGTTAATAATGTTGTGATAATCGGATCT 1711
Query 1672 TAATTCGGGGTCAGTTCATAAATAAATAAAAATGTA 1707
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 TAATTCGGGGCCAGTTCATAAATAAATAAAAATGTA 1747
> Ahg922901 jgi|Araly1|922901|scaffold_104182.1
Length=1574
Score = 2521 bits (1365), Expect = 0.0
Identities = 1488/1547 (96%), Gaps = 9/1547 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 CCATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGCAGTTCTTGTCCTTCTCTTTGTCGTCG 69
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||
Sbjct 20 CCATGGCAATTACAAAAGCTCACTACTCTTTAGCAGTTCTTGTCGTTCTC-TT-T-GTCG 76
Query 70 TTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCG 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 77 TTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCG 136
Query 130 ATAATACTCATGCATTCAACCGTAGTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTA 189
| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 ACAATACTCATGCATTCAACCGAACTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTA 196
Query 190 CTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCA 249
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 197 CTTCGGCATATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTACTTCA 256
Query 250 CGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGCAGATCTTGCTTGTGATTCGT 309
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 257 CTCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGCAGTTCAGGAGACCTTGCTTGTGATTCGT 316
Query 310 ATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTGCTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCGTC 369
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 317 ATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCGAC 376
Query 370 TCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAGA 429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 377 TCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGATTGGGGGAGTGGACGAGA 436
Query 430 ATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCAT 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 437 ATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATAGCATAGAACCAT 496
Query 490 ATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCT 549
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 ATGTGACTATTTTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTCT 556
Query 550 TAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTCG 609
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 557 TAAGCCCACGTATAGTGGAGGATTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGGTTCG 616
Query 610 GAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTCTCTCTCTTGC-ACTCAAAGGC 668
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||
Sbjct 617 GAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAAC-CAAAGGT 675
Query 669 TATGGAAATGGATCTTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGATTCT 728
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 676 TATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAATTTGGAGGAGATTCT 735
Query 729 GGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTCTCT 788
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||
Sbjct 736 GGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATTACCAACTTCTAGCTCATGCGAAAGCTGTATCT 795
Query 789 TTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGG 848
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 CTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTCCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCGGG 855
Query 849 AGATGGTTCGTCCCGCTAAATGAATTTAGTGAACTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGAGCA 908
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 856 AGATGGTTCGCCCCGCTAAACGAATTTAGCGAACTCGACAAAGCTGCTGCAAAACGAGCA 915
Query 909 TTCGACTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAACA-AT 967
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 916 TTTGATTTTTTTGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAA-AGAT 974
Query 968 AATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCTTTAGT 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 AATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCTTTAGT 1034
Query 1028 TAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTTCACAATATGCAACTGACGC 1087
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 1035 TAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTACACAATATGCAACCGACGC 1094
Query 1088 ACCTCCTCCGACACAACCTAATGCAATAACGGATGCACGAGTTACTCTTGGATTTTACCG 1147
|||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 ACCTGCTCCGACACAACCTAGTGCAATAACCGATCCACGAGTTACTCTTGGATTTTACCG 1154
Query 1148 CAATGGAAG-TCCTATTGGTGTTGTGGCTTCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCC 1206
|||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 CAATGG-AGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGATTCC 1213
Query 1207 GTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGAAA 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 GTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACCGAAA 1273
Query 1267 ACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATG 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274 ACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGATAATG 1333
Query 1327 GACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGCCATGAAGGATGGAT 1386
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 GACGAATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGCCATGAAGGATGGAT 1393
Query 1387 GCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGGTT 1446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 GCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAATGGTT 1453
Query 1447 ACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTGCTGATCGTAAAGAGA 1506
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
Sbjct 1454 ACACTCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTTCTGATCGAAAAGAAA 1513
Query 1507 AAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAA 1553
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 AAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAA 1560
> Ahg474221 jgi|Araly1|474221|fgenesh2_kg.1__4175__AT1G47600.1
Length=1707
Score = 2512 bits (1360), Expect = 0.0
Identities = 1538/1622 (95%), Gaps = 19/1622 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 AACCATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAGCAGTTCTTGTCCTTCTCTTTGTCGT 67
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||
Sbjct 27 AACCATGGCAATTACAAAAGCTCACTACTCTTTAGCAGTTCTTGTCGTTCTC-TT-T-GT 83
Query 68 CGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTG 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 CGTTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTG 143
Query 128 CGATAATACTCATGCATTCAACCGTAGTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGC 187
||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 CGACAATACTCATGCATTCAACCGAACTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGC 203
Query 188 TACTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTT 247
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 204 TACTTCGGCATATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTACTT 263
Query 248 CACGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGCAGATCTTGCTTGTGATTC 307
||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||
Sbjct 264 CACTCATAGATATCCAGAAAAAGTTCCGGATCGCAGTTCAGGAGACCTTGCGTGTGATTC 323
Query 308 GTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTGCTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCG 367
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 GTATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCG 383
Query 368 TCTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGA 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 384 ACTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGATTGGGGGAGTGGACGA 443
Query 428 GAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACC 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GAATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACC 503
Query 488 ATATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTT 547
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 ATATGTGACTATTTTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTT 563
Query 548 CTTAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATT 607
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 CTTAAGCTCACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATT 623
Query 608 CGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTCTCTCTCTTGC-ACTCAAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||
Sbjct 624 TGGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCTTTCTCTCTTGCAAC-CAAAG 682
Query 667 GCTATGGAAATGGATCTTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGATT 726
| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 683 GTTATGGAGATGGATCGTATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAATTTGGAGGAGATT 742
Query 727 CTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTCT 786
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
Sbjct 743 CCGGAGTGGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCCAAAGCTGTAT 802
Query 787 CTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATCG 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
Sbjct 803 CTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATTGGAACAACTTTGATTG 862
Query 847 GGAGATGGTTCGTCCCGCTAAATGAATTTAGTGAA-CTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGA 905
|||||||||||| ||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 GGAGATGGTTCGCCCCACTAAACGAATCTA-ACAATCTCGACAAGGCTGCTGCAAAACGA 921
Query 906 GCATTCGACTTTTTT-GTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAAC 964
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 922 GCATTCGA-TTTTTTCGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTATGGAAAATATCCAA- 979
Query 965 A-ATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCTT 1023
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 980 AGATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACATCGGAGGAATCAGCTT 1039
Query 1024 TAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTTCACAATATGCAACTG 1083
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 1040 TAGTAAAAGGATCACTTGATTTTTTAGGGTTGAACTATTACGTTACACAATATGCAACCG 1099
Query 1084 ACGCACCTCCTCCGACACAACCTAATGCAATAACGGATGCACGAGTTACTCTTGGATTTT 1143
|||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 ACGCACCTGCTCCAACACAACCTAGTGCAATAACGGATCCACGAGTTACTCTTGGATTTT 1159
Query 1144 ACCGCAATGGAAG-TCCTATTGGTGTTGTGGCTTCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGA 1202
|||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 ACCGCAATGG-AGTTCCTATTGGTGTTGTGGCTCCTAGCTTCGTCTACTATCCTCCAGGA 1218
Query 1203 TTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACC 1262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219 TTCCGTCAGATTCTAAACTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTACCTACATCACC 1278
Query 1263 GAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGAT 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 GAAAACGGAGTTGCTGATCTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACTGCTCTTGCCGAT 1338
Query 1323 AATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGCCATGAAGGAT 1382
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 1339 AATGGACGAATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGCGTTATGATGGAT 1398
Query 1383 GGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTACGAATTCGGAAAT 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCACTGATGGACAATTACGAATTCGGAAAT 1458
Query 1443 GGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTGCTGATCGTAAA 1502
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1459 GGTTACACTCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCTGCTGATCGAAAA 1518
Query 1503 GAGAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAAGCC--C--T 1558
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1519 GAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCCTCGCAAAATAAGTGGAAGCCGGCCCT 1578
Query 1559 AGATATAAATCCAAACCTCGAATGTAATAACAATTGCACTGTATGTATT-TCATCTTTTT 1617
||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | || |||||
Sbjct 1579 TGATATAAATCCAAACCTCGAACGTAATAACAATGGTACTGTATGTATTATTAT-TTTTT 1637
Query 1618 AA 1619
||
Sbjct 1638 AA 1639
> Ahg914284 jgi|Araly1|914284|Al_scaffold_0001_4538
Length=1515
Score = 1847 bits (1000), Expect = 0.0
Identities = 1383/1558 (89%), Gaps = 65/1558 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 12 ATGGCAATTCCAAAAGCTCACTACTCTTTAG-CAGTTC-TTGTCCTTCTCTTTGTCGTCG 69
||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||||||||| | |
Sbjct 1 ATGGCAATTCCAAAACCTCACTACTCTTTAGCCA--TCATTGTTGTTCTCTTTG-CAT-- 55
Query 70 TTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCAAAGAACCCTTCCACTGCG 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 56 TTTCGAGTAGCCAAAAAGTCTGCAATCCAGAATGCAAGGCCGAAGAACCCTTCAACTGCG 115
Query 130 ATAATACTCATGCATTCAACCGTAGTGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCTA 189
| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 116 ACAAAACTCTTGCATTCAACCGAAATGGATTTCCCAAAAATTTCACTTTTGGTGCAGCCA 175
Query 190 CTTCGGCTTATCAAATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCA 249
||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 CTTCGGCATACCAGATTGAAGGTGCAGCACATAGAGCACTTAATGGATGGGACTATTTCA 235
Query 250 CGCATAGATATCCAGAAAAAGTACCGGATCGTAGTTCAGCAGATCTTGCTTGTGATTCGT 309
| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||
Sbjct 236 CTCATAGATATCCAGAAAAAGTACCAGATCGCAGTACGGGAGACCTTGCTTGTAATTCGT 295
Query 310 ATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTGCTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCG-T 368
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 296 ATGATCTTTATAAGGATGATGTCAAACTACTAAAAAGAATGAATGTTCAAGCATACCGAT 355
Query 369 CTCTCGATAGCATGGTCAAGGGTCTTACCAAAGGGAAGACTGACTGGGGGAGTGGACGAG 428
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||
Sbjct 356 -TCTCAATAGCATGGTCGAGGGTCTTACCAAAGGGAAGATTAATTGGGGGAGTCGATGAG 414
Query 429 AATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCA 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 AATGGGATAACATACTACAACAATCTCATTAACGAGTTGAAAGCAAATGGCATAGAACCA 474
Query 489 TATGTTACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTC 548
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 TTTGTGACTATATTTCATTGGGATGTTCCCCAGACTTTAGAAGACGAATATGGAGGCTTC 534
Query 549 TTAAGCACACGTATAGTGGAGGACTACACAAACTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTC 608
|||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 TTAAGCCCACGTATAGTGGAGGACTTCAAAAATTACGCTGAGCTTCTATTCCAAAGATTC 594
Query 609 GGAGACAGGGTCAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCC-TCTCTCTCTTGCA-CTCAAAG 666
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||
Sbjct 595 GGAGACAGAGTTAAATTTTGGATCACTTTAAATCAGCCGT-TCTCTCTCGCAAC-CAAAG 652
Query 667 GCTATGGAAATGGATCT-TATCCACCAGGACGGTGCACCGGCTGTGAACTTGGAGGAGAT 725
| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||
Sbjct 653 GTTATGGAGATGGA-CAGTATCCACCAGGACGGTGCACTGACTGTGAATTTGGAGGAGAT 711
Query 726 TCTGGAGTTGAACCTTATACAGTTGCACATAACCAACTTCTAGCTCATGCAAAAACTGTC 785
|||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| || || |||||||
Sbjct 712 TCTGGAACTGAACCTTATATAGTTGGACATCACGAACTTCTAGCACACGCGGAAACTGTA 771
Query 786 TCTTTATACAGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGAACAACCTTGATC 845
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||
Sbjct 772 TCTTTATACCGAAAAAGATATCAGAAATTTCAAGGTGGTAAGATAGGGACGACATTGATC 831
Query 846 GGGAGATGGTTCGTCCCGCTAAATGAATTTAGTGAA-CTCGACAAGGCTGCTGCAAAACG 904
|| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 GGTAGATGGTTCATCCCACTAAATGAAACTAGC-AATCTCGACAAGGCTGCTGCAAAACG 890
Query 905 AGCATTCGACTTTTTT-GTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTGTACGGAAAATATCCAA 963
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 891 AGCATTCGA-TTTTTCAGTTGGATGGTTCTTGGATCCATTGGTATACGGACAATATCCAA 949
Query 964 CA-ATAATGAGAGAGATGGTAGGAGATAGATTGCCAGAATTCACACCTGAGGAATCAGCT 1022
| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 950 -AGATAATGAGAGAGATGTTAGGAGATAGACTACCAAAATTCACGCCTGAGGAATCAGCT 1008
Query 1023 TTAGTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTATTACGTTTCACA-ATATGCAAC 1081
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||
Sbjct 1009 TTACTTAAAGGATCACTTGATTTTCTAGGGTTGAACTACTACGTTACA-AGATATGCAAC 1067
Query 1082 -TGACGCACCTCCTCC---G---ACACAACCTAATG-CAATAACGGATGCACGAGTTACT 1133
| || |||||||||| | |||||||||| || | |||| ||| || ||||||||
Sbjct 1068 CT-ACACACCTCCTCCAATGCCGACACAACCTAGTGTCC-TAACTGATTCAGGAGTTACT 1125
Query 1134 CTTGGATTTTACCGCAATGGAAGT-CCTATTGGTGTTGTGGCTTCTAGCTTCGTCTACTA 1192
|||||||| | ||||||||| || ||||||||| || |||| || | |
Sbjct 1126 ATTGGATTTGAGCGCAATGGA-GTTCCTATTGGTATTAAGGCT---AG--------A-T- 1171
Query 1193 TCCTCCAGGATTCCGTCAGATTCTAAA-CTACATCAAAGACAACTACAAAAATCCACTTA 1251
||| | | | |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |
Sbjct 1172 TCC----G--T-C----AGATTCTAAATC-ACATCAAAAACAACTACAAGAATCCACTAA 1219
Query 1252 CCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGAT-CTTGATCTTGGAAACGTAACGCTTGCAACT 1310
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| |||||| |
Sbjct 1220 CCTACATCACCGAAAACGGAGTTGCTGATGCT-GATTTTGGAAACGTTACGATTGCAAAT 1278
Query 1311 GCTCTTGCCGATAATGGACGGATTCAAAACCATTGCAGCCATCTCTCTTGTCTCAAATGC 1370
|||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1279 GCTCTTGCCGATAATGGACGAATTCAATTTCAATGCAGCCATCTTTCTTGTCTCAAATGC 1338
Query 1371 GCCATGAAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTAC 1430
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 GCCATGCAGGATGGATGCAACGTAGCAGGATATTTTGCATGGTCATTGATGGACAATTAC 1398
Query 1431 GAATTCGGAAATGGTTACACCCTCCGGTTTGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCT 1490
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GAATTCGGAAATGGTTACACTCTCCGGTTCGGTATGAATTGGGTCAACTTCACTAATCCT 1458
Query 1491 GCTGATCGTAA-AGAGAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAAGTTCCTCGCAAAATAA 1547
|||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||
Sbjct 1459 GCTGATCG-AAGAGAAAAAGCTTCTGGAAAATGGTTCTCTAGGTTCATTGCAAAATAA 1515
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 64258243315
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5