BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G61850.1
Length=4065
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg475145 jgi|Araly1|475145|fgenesh2_kg.2__275__AT1G61850.1 5297 0.0
> Ahg475145 jgi|Araly1|475145|fgenesh2_kg.2__275__AT1G61850.1
Length=3798
Score = 5297 bits (2868), Expect = 0.0
Identities = 3033/3115 (97%), Gaps = 2/3115 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 952 GAAAACACTTCCTATTTTGGGGCATCTAGGCACAAGCTCAGTGCCTTCTCTCCCCTTATA 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 685 GAAAACACTTCCTATTTTGGGGCATCTAGGCACAAGCTAAGTGCCTTCTCTCCCCTTATA 744
Query 1012 TTCCGTTCGTCGTCTTGTCATCATCCTCTTCTAGCATCTACATTGGTGAAGATAATGCAA 1071
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 745 TTCCGTTCTTCGTCTTGTCATCATCCTCTTCTAGCATCTACATTGGTGAAAATAATGCAA 804
Query 1072 GATGAAGGAAATCGTTCTGTTATTGGTAAAGATGAAAATGCGGTGAGGCAGCTTATAAGT 1131
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GATGAAGGAAACCGTTCTGTTATTGGTAAAGATGAAAATGCGGTGAGGCAGCTTATAAGT 864
Query 1132 ATGATAACTAGTGACAATCAACACGTGGTTGAGCAAGCTTGTGTTGCTTTATCATCTCTT 1191
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 ATGATAACTAGTGACAATCGCCACGTGGTTGAGCAAGCTTGTGTTGCTTTATCATCTCTC 924
Query 1192 GCTCGAGATGTTGGCGTAGCAATGCAGCTGATGAAGTGTGATATAATGAAGCCGACTGAA 1251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 925 GCTCGAGATGTTGGCGTAGCAATGCAGCTGATGAAGTGTGATATTATGAAACCAACTGAA 984
Query 1252 ACAGTTCTGAAATCTTCGTCCCCAGACGAAGTGATATCCGTTTTACAAGTCGTGGTCACC 1311
|| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 ACTGTTCTGAAATCTTCGGCCCCGGACGAAGTTATATCCGTTTTACAAGTCGTGGTCACC 1044
Query 1312 TTAGCTTTTGTATCTGATTCCGTTTCTCAGAAGATGCTCACCAAGGATATGCTAAAAGCT 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1045 TTAGCTTTTGTATCTGATTCCGTTTCTCAGAAGATGCTCACCAAGGATATGCTGAAAGCC 1104
Query 1372 TTAAAATCCTTGTGTGCCCATAAGAATCCTGAAGTTCAAAGACAAGCCTTATTAGCAGTT 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 TTAAAATCCTTGTGTGCCCATAAGAATCCTGAAGTTCAAAGACAAGCCTTATTAGCAGTT 1164
Query 1432 GGGAACTTGGCCTTCTGTTTAGAAAATCGTCGTATTCTGATTACTTCAGAGAGTTTGAGA 1491
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1165 GGGAACTTGGCCTTCTGTTTAGAAAACCGTCGTATTCTGATTACTTCAGAGAGCTTGAGG 1224
Query 1492 GAGTTATTGATGCGGTTAATTGTCACACCTGAACCACGAGTCAACAAAGCTGCGGCTCGA 1551
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1225 GAGTTATTGATGCGGTTAACTGTTACACCTGAACCACGAGTCAACAAAGCTGCGGCTAGA 1284
Query 1552 GCTTTGGCAATTCTTGGAGAAAATGAAATTCTGCGACGTTCCATAAAAGGCAGGCAAGTA 1611
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 GCTTTGGCAATTCTTGGCGAAAATGAAATTCTGCGACGTTCCATAAAAGGCAGGCAAGTA 1344
Query 1612 CCAAAACAGGGACTGCGGATACTCACCATGGATGGAGGAGGAATGAAAGGTCTTGCAACG 1671
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 CCAAAACAGGGACTGCGGATTCTCACCATGGATGGAGGTGGAATGAAAGGTCTTGCAACG 1404
Query 1672 GTGCAGATTCTTAAGGAGATTGAGAAGGGAAGTGGCAAGCCTATTCATGAACTATTCGAC 1731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1405 GTGCAGATTCTTAAGGAGATTGAGAAGGGAAGTGGCAAGCCTATACATGAACTATTCGAC 1464
Query 1732 CTTATATGTGGCACATCAACAGGAGGAATGCTAGCTATTGCCCTTGGTGTCAAGCTTATG 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 CTTATATGTGGCACATCAACAGGAGGAATGCTAGCTATTGCCCTTGGTGTCAAGCTTATG 1524
Query 1792 ACATTGGAACAATGTGAAGAAATTTACAAGAATCTAGGAAAGCTTGTTTTTGCTGAATCT 1851
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 ACACTGGAACAATGTGAAGAAATTTACAAGAATCTAGGAAAGCTTGTTTTTGCTGAATCT 1584
Query 1852 GTCCCAAAGGACAATGAAGCTGCAAGCTGGCGGGAAAAGTTGGATCAGCTATATAAAAGT 1911
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585 GTCCCAAAGGACAATGAAGCTGCAAGTTGGCGGGAAAAGTTGGATCAGCTATATAAAAGT 1644
Query 1912 TCATCGCAAAGTTTTAGAGTTGTTATCCATGGATCTAAGCACAGTGCAAACGAGTTTGAG 1971
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1645 TCATCGCAAAGTTTCAGAGTTGTTATCCATGGATCTAAGCACAGTGCAAACGAGTTCGAG 1704
Query 1972 AGACTGTTAAAGGAAATGTGTGCTGATGAGGATGGAGATTTACTAATAGAATCAGCTGTG 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 AGACTGTTAAAGGAAATGTGTGCTGATGAGGATGGAGATCTACTAATAGAATCAGCTGTG 1764
Query 2032 AAGAATGTTCCAAAAGTATTTGTTGTATCTACTCTTGTTAGTGTGATGCCTGCGCAACCA 2091
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 AAGAATGTTCCAAAAGTCTTTGTTGTATCTACTCTTGTTAGTGTGATGCCTGCGCAACCA 1824
Query 2092 TTTATATTTCGGAACTACCAGTATCCTGTTGGAACACCGGAAATGTCGTATGCATTTTCA 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1825 TTTATATTTCGGAACTACCAGTATCCTGTTGGAACACCGGAGATGTCATATGCATTTTCA 1884
Query 2152 GATCATTCAGGCGGCAGTACACTAACTTCATCAACTGCCAGTGATCAAGCTGGCTACTAC 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1885 GATCATTCAGGCGGCAGTACACTAACTTCATCAACTGCCAGTGATCAAGCTGGCTACTAC 1944
Query 2212 AAGCAAAGTGCTTTTATGGGAAGTTGTAAGCATCAGGTTTGGCAAGCGATACGAGCATCA 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1945 AAGCAAAGTGCTTTTATGGGAAGTTGTAAGCATCAGGTTTGGCAAGCGATACGAGCATCA 2004
Query 2272 TCAGCTGCTCCATATTATCTTGATGATTTTTCAGTTGGTACAAACTCATATCGCTGGCAA 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 TCAGCTGCTCCATATTATCTTGATGATTTTTCAGTTGGTACAAACTCATATCGCTGGCAA 2064
Query 2332 GATGGTGCAATAGTGGCAAACAATCCTACAATCTTTGCCATCAGAGAAGCACAACTTCTA 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 GATGGTGCAATAGTGGCAAACAATCCTACAATCTTTGCCATCAGAGAAGCACAACTTCTA 2124
Query 2392 TGGCCTGACACAAAAATTGATTGCTTGGTTTCGATTGGCTCTGGCTCTGTACCAACAAGG 2451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 TGGCCTGACACAAAAATTGATTGCTTGGTTTCGATTGGCTCTGGCTCTGTACCAACAAGG 2184
Query 2452 GTACGGAAAGGTGGATGGCGTTATTTAGATACTGGGCAAGTACTGATTGAGAGTGCATGC 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2185 CCACGGAAAGGTGGATGGCGTTATTTAGATACTGGGCAAGTACTGATTGAGAGTGCATGC 2244
Query 2512 TCAGTGGAACGTGTTGAAGAAGCTCTAAGCACATTGCTCCCTATGTTGCCAGAAATACAA 2571
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2245 TCAGTGGAACGGGTTGAAGAAGCTCTAAGCACATTGCTCCCTATGTTGCCAGAAATACAA 2304
Query 2572 TATTTTCGGTTCAACCCAGTTGACGATCGCTGTGGAATGGAGTTGGATGAGACTGATCCA 2631
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2305 TATTTTCGGTTCAACCCAGTTGATGATCGCTGCGGAATGGAGTTGGATGAGACTGATCCA 2364
Query 2632 GCGATCTGGCTAAAATTGGAAGCTGCGATTGAAGAATTCATACAAAGCAATCCCCAAGTA 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2365 GCGATCTGGCTAAAATTGGAAGCTGCGATTGAAGAATTCATACAAAGCAATTCCCAAGTA 2424
Query 2692 TTTAAAAACGTATGCGAGAGATTAACACTCCCCTTCCTAAACGATGAGAAATGGTGTGAT 2751
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2425 TTTAAAAACGCATGCGAGAGATTAACACTCCCCTTCCTAAACGATGAGAAATGGTGTGAG 2484
Query 2752 AATTTGAAACCAC-GATTTATGAATGGAAAGCTACCAAATAGCAGAGTAGAGAGCAGTCC 2810
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485 AATTTGAAACCACAG-TTTATGAATGGAAAGCTACCAAATAGCAGAGTAGAGAGCAGTCC 2543
Query 2811 TTCTCTTGGATGGAGACGCAATGTTTTGCTTATGGAGGCTCAGCATAGTCCTGACTCAGG 2870
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2544 TTCTCTAGGATGGAGACGCAATGTTTTGCTTATGGAGGCTCAGCATAGTCCTGACTCAGG 2603
Query 2871 GAGAGTAAAGTATCATGCTCGTGCGCTCGAGTCATTTTGTTCGAATAATGGAATAAAGTT 2930
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2604 GAGAGTAAAGTATCATGCTCGTGCGCTTGAGTCATTTTGTTCGAATAATGGAATAAAGTT 2663
Query 2931 ATCCTCATTACATACTACTGCTACTCCTGGATGCCAAAAACCATCTCCAGGAACTGCTTT 2990
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2664 ATCCTCATTACATACTACTGCTACTCCTGGATGCCCGAAACCATCTCCAGGGACTGCTTT 2723
Query 2991 TCCCACACCATTTACCTCTCCTCTTATAACTGGAAGCTTGCCTCCGAGCCCCCTTCTCTT 3050
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 TCCCACTCCATTTACCTCTCCTCTTATATCTGGAAGCTTGCCTCCGAGCCCCCTTCTCTT 2783
Query 3051 CACTCCTGAGCTTGGCCCACAAAAGTTCAATAGGATTGATATGGTTCCGCCACTTAGCTT 3110
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2784 CACTCCTGATCTTGGCCCACAAAAGTTCAATAGGATTGATATGGTTCCGCCACTTAGCTT 2843
Query 3111 GGATGGGGGACATGTTGGGAAGACGGTTATGTCGCCTCCATCATCTCCTCCGCGACAAAG 3170
||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2844 GGATGGGGGTCATGGTGGAAAGACGGTTATGTCGCCTCCATCATCTCCTCCACGACAAAG 2903
Query 3171 ACAACTCTATCTTCCACTACGACAGATGCATGAAAAGTTACAGAATTTACCCCAAGTGGG 3230
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2904 ACAACTCTATCTTCCATTACGACAGATGCATGAAAAGTTACAGAATTTACCCCAAGTGGG 2963
Query 3231 GATCTTACATCTCTCACTTCAAAATGATTCTAATGGTTCAATACTGAGTTGGCAAAATGA 3290
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2964 GATCATACATCTCTCACTTCAAAATGATTCTAATGGTTCAATACTGAGTTGGCAAAACGA 3023
Query 3291 TGTATTTGTGGTTGCTGAACCTGGAGATCTAGCTGATAAGTTTCTCCAAAGCGTCAAAGT 3350
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3024 TGTATTTGTGGTTGCTGAACCTGGAGATCTCGCTGATAAGTTTCTCCAAAGCGTCAAAGT 3083
Query 3351 CAGTATATTGTCAGTCATGCAAAGTAATCGCCGAAAGGCTGCATCAGTTCTTTCCAATAT 3410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3084 CAGTATATTGTCAGTCATGCAAAGTAATCGCCGAAAGGCTGCATCAGTTCTTTCCAATAT 3143
Query 3411 CTGTTCAATCTCGGATTTGGTGCGTAGCAAGAAATGCTTCCAAGTTGGAAATATCATCCA 3470
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3144 CTACTCAATCTCGGATTTGGTGCGTAGCAAGAAATGCTTCCAGGTTGGAAATATCATCCA 3203
Query 3471 CCGTTATATTGGACGCCAGACCCTAGTGATGGAAGATGATCAAGAAATTGCATCGTTTAT 3530
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3204 CCGTTATATCGGACGCCAAACCCTAGTGATGGAAGATGATCAAGAAATCGCATCATTTAT 3263
Query 3531 GTTCCGCAGAACTGTACCTTCGGCACACTTGACTCCTGATGATATTCGCTGGATGGTAGG 3590
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3264 GTTCCGCAGAACTGTCCCTTCGGCACACTTGACTCCTGATGATATTCGCTGGATGGTAGG 3323
Query 3591 AGCATGGAGAGATAGGATAATAGTCTTCTCAGGAACATTTGGACCAACACAAGCTGTAGT 3650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3324 AGCATGGAGAGATAGGATAATAGTCTTCTCAGGAACATTTGGACCAACACAAGCTGTCGT 3383
Query 3651 TAAAGCCTTTTTGGACTCTGGTGCCAAAGCTGTGATTGGTCCATCAAACGAGCCACAAGA 3710
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3384 TAAAGCCTTTTTGGACTCTGGTGCAAAAGCTGTGATTGGTCCATCAAACGAGCCACTAGA 3443
Query 3711 GACACCACTAATCACATCCCAAGGCTCATCTGAGTACAACATTGGAGATCAGAACGGGAA 3770
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 3444 GACGCCACTAATCACATCCCAAGGCTCATCTGAATACAACATTGTAGATCAGAACGGAAA 3503
Query 3771 GTTTGAGATTggagaagaagaagacgaagatgaagaagtaaacgaggaaacggaaaggga 3830
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 3504 GTTTGAGATTGGAGAAGAAGAAGACGAAGAAGAAGAAGTGAACGAGGAAATGGAAAGGGA 3563
Query 3831 agagatggaaCCACCGACACCGACAAGTGACTGGGAAGATAGCGACCACGAGAAAACAAA 3890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3564 AGAGATGGAACCACCGACACCGACAAGTGACTGGGAAGATAGCGACCACGAGAAAACAAA 3623
Query 3891 CAGAGACGGTAAGTATTGTGGTCTTTGGGAAGATGATGAAGAAGAAGTGTCTGAATTTGT 3950
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3624 CAGAGACGATAAGTGTTGTGGTCTTTGGGAAGATGATGAAGAAGAAGTGTCTGAGTTTGT 3683
Query 3951 TTGCCAGTTATATGATCAGTTGTTCAGAGAGAACTCAAGAGTTGATGTTGCTCTTCAAAA 4010
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3684 TTGCCAGTTATATGATCAGTTGTTCAGAGAGAATTCAAGAGTTGATGTTGCTCTTCAAAA 3743
Query 4011 AGCTCTTGCCTCTCATCGAAAGCTCAGGTACACTTGTCATCTTCCTAATGTATAG 4065
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3744 AGCTCTTGCCTCTCATCGAAAGCTCAGGTACACTTGTCATCTTCCTAATGTATAG 3798
Score = 1031 bits (558), Expect = 0.0
Identities = 632/668 (95%), Gaps = 4/668 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 130 ATGTCTTC-TACATGTTCTTCTCCATCCGCCGTGGAGGATCCTGAATTAGGGTTTCGGAT 188
|||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 1 ATGTCTTCGT-CGTGTTCTTCTCCATCCGCGGTGGAGGATCCGGAATTAGGGTTCCGTAT 59
Query 189 TGATTTAGATTGGACGGCAGGCGATTCGGAGGATCAGGTAGCGTTGCGATTGGAATCGCA 248
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 TGATTTAGATTGGACAGCAGGCGATTCGGAGGATCAGGTAGCGTTGCGATTGGAATCGCA 119
Query 249 GCTGATGGTGGCTTTGCCTGCACCGCATGATACAGTAGTGGTTGAATTGAAGGGAATTGG 308
| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 GTTAATGGTGGCTTTACCTGCACCGCATGATACAGTGGTGGTTGAATTGAAGGGAATTGG 179
Query 309 CGATGACGATGAAGGTGGTT-TAGAGAATGTTGGATTAGAGATGAGAGTTGAGAAACGGA 367
|||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 180 AGATGGCGATGAAGGT-GTTATAGAGAATGTTGGATTAGAGATGAGAGTTGAGAAACGTA 238
Query 368 GAGAGCCGTTACGAGCAGTTACATTGATGAAAGCGGTTGGTTCCGGTCAGCAGTACGACG 427
| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 239 GGGAGCCTTTGCGAGCAGTTACATTGATGAAAGCGGTTGGTTCTGGTCAGCAGTATGATG 298
Query 428 GTGTCGGCGTTTTGACAAGGCTAATGCGGTCTGATATGATGCCTGCAGCCATTCCTGCGC 487
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 GTGTAGGCGTTTTGACTAGGCTAATGCGGTCTGATATGATGCCTGCAGCCATTCCTGCGC 358
Query 488 CGGCTATCGACGTTGCTTCTTCTTGTGGGGTGCATTGGAAGACTGTGACTTCGTTGAGTC 547
|||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CGGCTATCGATGTTGCGTCATCTTGTGGGGTGCATTGGAAGACTGTGACTTCGTTGAGTC 418
Query 548 TATCTGGTTGTGGTTTATTGGTAATGCCAGTTGAAGTGACTGAGTTACCTCTGCTTGAGA 607
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 419 TATCTGGTTGTGGTTTATTGGTAATGCCAGTTGAAGTGACTGAGTTACCTCTTCTTGAGA 478
Query 608 AGCTATGCCTTGAGCACAATAAACTGTCAGTTTTGCCACCTGAGATAGGGAAGCTGAAGA 667
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 479 AGCTATGCCTTGAGCACAATAAATTGTCAGTTTTGCCACCTGAGATAGGGAAGCTGAAAA 538
Query 668 ACCTTAAGATACTTAGGGTTGACAATAACATGCTTATTTCTGTCCCAGTGGAACTAAGAC 727
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 539 ATCTTAAGATACTTAGAGTTGACAATAACATGCTTATTTCTGTGCCAGTGGAACTAAGAC 598
Query 728 AGTGTGTAGGTCTTGTTGAATTGTCGTTGGAACACAATAAACTTGTCCGGCCTCTTCTTG 787
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 AGTGTGCGGGTCTTGTTGAATTGTCGTTGGAACACAATAAACTTGTCCGGCCTCTTCTTG 658
Query 788 ATTTCAGG 795
||||||||
Sbjct 659 ATTTCAGG 666
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 153676479774
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5