BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G62020.1
Length=4098
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg475134 jgi|Araly1|475134|fgenesh2_kg.2__264__AT1G62020.1 6482 0.0
Ahg932069 jgi|Araly1|932069|scaffold_400057.1 3779 0.0
Ahg932070 jgi|Araly1|932070|scaffold_400058.1 2809 0.0
> Ahg475134 jgi|Araly1|475134|fgenesh2_kg.2__264__AT1G62020.1
Length=3945
Score = 6482 bits (3510), Expect = 0.0
Identities = 3804/3947 (96%), Gaps = 15/3947 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 152 ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAAAGTAACAGAGTTAAGGGACTGAGTTTTCACCCTAAA 211
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAGAGTAACAGAGTTAAGGGTCTGAGCTTTCACCCTAAA 60
Query 212 CGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTATG 271
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 CGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTTTGGGATTATCGTATG 120
Query 272 GGTACTTTGATCGATAGATTCGACGAACACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCAC 331
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GGTACTTTGATCGATAGATTCGATGAGCACGAAGGACATGTTCGTGGTGTTCATTTCCAC 180
Query 332 AATTCTCAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTAC 391
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AATTCACAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTAC 240
Query 392 AAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTAGGGCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCAG 451
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTTGGCCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCAG 300
Query 452 TTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCAAGTGATGATCAAACTATCCGTATATGG 511
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 301 TTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGTATATGG 360
Query 512 AACTGGCAATCACGGACTTGTGTTTCTGTATTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGT 571
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AACTGGCAATCAAGGACTTGTGTTTCTGTTTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTGT 420
Query 572 GCTTCTTTCCATCCGAAAGAAGACCTCGTCGTATCAGCTTCGTTAGATCAGACTGTTCGT 631
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 421 GCTTCTTTCCATCCGAAAGAAGATCTCGTCGTATCAGCTTCTTTAGATCAGACTGTCCGT 480
Query 632 GTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGATATCATGAGG 691
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 481 GTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGACATCATGAGG 540
Query 692 TTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCCATTGTCAAGTACGTTCTT 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 541 TTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCTATAGTCAAGTACGTTCTT 600
Query 752 GAAGGTCATGATAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTTATTGTC 811
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 601 GAAGGTCATGACAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTCATTGTC 660
Query 812 TCGGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAG 871
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TCCGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCCGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGGAG 720
Query 872 GTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAACAG 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCATGCAAAACAG 780
Query 932 GACATAATTGTATCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAGCGA 991
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GACATAATTGTGTCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCTACCAAGCGA 840
Query 992 ACTGGACTTCAGACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCACCCT 1051
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ACTGGACTTCAAACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCACCCT 900
Query 1052 GAGATGAATCTACTAGCAGCAGGACATGACAGTGGCATGATTGTGTTCAAGCTTGAGAGA 1111
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 901 GAGATGAATCTACTAGCAGCAGGTCATGACAGCGGCATGATCGTGTTCAAACTTGAGAGA 960
Query 1112 GAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATTCTTG 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATTCTTG 1020
Query 1172 CGGTACTATGAATATTCAACTCAAAGGGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCCGGGT 1231
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 CGGTACTACGAATATTCAACTCAAAGAGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCCTGGT 1080
Query 1232 ACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCCACTGAAAATGCAGTT 1291
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1081 ACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCGACTGAAAATGCAGTT 1140
Query 1292 TTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCGTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGATAGT 1351
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 TTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGATAGT 1200
Query 1352 GTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACAGGTGGCTCTGCAGTATTC 1411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACCGGTGGCTCTGCAGTATTC 1260
Query 1412 ATTGCCCGTAACCGATTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAAGTGCTAGTCAAGAAT 1471
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1261 ATTGCCCGTAACCGGTTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTCAAGAAT 1320
Query 1472 CTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTCCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTTTTAT 1531
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTTTTAT 1380
Query 1532 GCTGGGACTGGGAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATCTTTGACCTCCAG 1591
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1381 GCCGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATATTTGACCTCCAG 1440
Query 1592 CAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTCCAGT 1651
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1441 CAAAGGCTTGTTCTTGGTGAACTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTCTAGT 1500
Query 1652 GATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATCGCGAGCAAAAAACTT 1711
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GATATGGAGAGGGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATAATTATCGCGAGCAAAAAACTT 1560
Query 1712 GTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGATAAT 1771
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGATAAC 1620
Query 1772 GGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGATAGT 1831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGATAGT 1680
Query 1832 GGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATACAATC 1891
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCGATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATACAATC 1740
Query 1892 TTTTGCTTGGATCGGGATGGCAAAAACAAGGCTATCACCATTAATGCAACCGAGTACATT 1951
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1741 TTCTGCTTGGATCGGGATGGGAAAAACAAGGCTATCACCATCAATGCAACCGAGTACATT 1800
Query 1952 TTCAAGCTTTCACTGCTGAGGAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAACTCT 2011
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TTCAAGCTTTCACTTCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAACTCC 1860
Query 2012 CAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTACCTGCAGCAGAAAGGATTCCCTGAAGTTGCC 2071
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTATCTGCAGCAAAAAGGATTCCCTGAAGTTGCT 1920
Query 2072 CTCCATTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAATCTGGCTCTTGAAAGTGGCAACATC 2131
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CTCCATTTTGTTGAAGATGAAAGGATCCGATTCAACCTGGCTCTTGAAAGTGGCAACATC 1980
Query 2132 AGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACTTGGA 2191
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 AGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGACTTGGG 2040
Query 2192 GTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTTGAGTTTGCATACCAGCAGACAAAG 2251
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTAGAGTTTGCATACCAGCAGACAAAG 2100
Query 2252 AACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGAAATTTGGACAAGCTTTCAAAG 2311
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 2101 AACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGTAATTTGGATAAGCTTTCAAAG 2160
Query 2312 TTGATGAAGATTGCAGAAGTGAAGAACAACGTAATGGGACAGTTTCACAATGCTCTCTAC 2371
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 TTGATGAAGATTGCGGAAGTAAAGAACAACGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTCTCTAC 2220
Query 2372 CTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCT 2431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCT 2280
Query 2432 TATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGAGTTA 2491
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2281 TATATTACGGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGAGCTA 2340
Query 2492 GGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGACA 2551
|||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 GGAGACAATGTGCCCTCCTTACCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGACA 2400
Query 2552 CCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTTCTTAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGA 2611
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 CCCATCATGTGCGGTGGTGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGA 2460
Query 2612 GGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAAGAAGATGTTGAAGGGGATTGG 2671
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||
Sbjct 2461 GGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAGGAGGATGCTGAAGGTGATTGG 2520
Query 2672 GGTGAGGAACTTGACATTAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGATATTGAAGACATTTTG 2731
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||
Sbjct 2521 GGTGAGGAACTTGACATAAATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGACATCGAAGACATCTTG 2580
Query 2732 GCGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGATGGGGA---CTTGAA 2788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2581 GCGGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGATGGGGAGGTCTTGAT 2640
Query 2789 GACTTGGTGCTCCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTAATGCACGTTCATCT 2848
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2641 GACTTGGAGCTCCCACCCGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCTAATGCCCGTTCATCA 2700
Query 2849 GTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGAGCTGGAGCCAGAAATCTTCT 2908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2701 GTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATCTGGAGCCAGAAATCTTCT 2760
Query 2909 CTTGCTGCTGAGCAAGCCGCAGCGGGAAGCTTCGACACTGCAATGCGTCTGCTCCACAGA 2968
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2761 CTTGCTGCTGAGCAAGCTGCAGCGGGAAGCTTTGACACTGCAATGCGCCTGCTCCACAGA 2820
Query 2969 CAGCTTGGTATCAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTAGATCTGTTCAATGGC 3028
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2821 CAGCTTGGTATAAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTTGATCTGTTCAATGGC 2880
Query 3029 AGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATGTCCTGTGGTTCCACTTGCCATTGAGCGT 3088
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 AGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCACTTGCCATTGAGCGT 2940
Query 3089 GGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTCCGTAGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTC 3148
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2941 GGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTTCGTGGCCCACCAGCTCTTGTTTATGATTTC 3000
Query 3149 TCTCAGCTAGACGAGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAACAACTGGGAAATTCACT 3208
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 3001 TCTCAGCTAGACGAGAAGCTTAAATCCGGCTACAAAGCCACAACAAGTGGGAAATTCACT 3060
Query 3209 GAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTGCACACCATCCCTCTAGTGGTAGTCGAGACA 3268
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3061 GAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTCCACACCATCCCTCTAGTGGTAGTCGAGTCA 3120
Query 3269 AGAAGAGAAGTGGATGAGGTCAAGGAATTAATCGTTATCGTTAAAGAATATGTCCTTGGT 3328
||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3121 AGAAGAGAAGTCGATGAGGTGAAGGAACTAATCGTTATCGTTAAAGAATATGTCCTTGGT 3180
Query 3329 CTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTC 3388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 CTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTC 3240
Query 3389 GCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTACGGCTTGCGCTGCTTAGT 3448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 GCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTACGGCTTGCGCTGCTTAGT 3300
Query 3449 GCAATGGGTGTCTGCTACAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGCTTCTAATTTCGCCAGAAGA 3508
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3301 GCAATGGGCGTCTGCTTCAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGCTTCTAATTTTGCCAGAAGA 3360
Query 3509 CTGTTGGAAACAAGCCCAGTTGATAGCCAAGCCAAGATGGCTAGACAAGTTGTGCAAGCC 3568
|| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 3361 CTATTGGAAACAAGCCCAGTGGATAGCCAGGCCAAGATGGCTAGAAAAGTTGTACAAGCC 3420
Query 3569 GCTGAACGTAACATGACCGATGAAACAAAGCTTAACTACGACTTCAGGAACCCTTTTGTG 3628
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3421 GCTGAAAGTAACATGACCGATGAAACCAAGCTTAACTACGACTTCAGGAATCCATTTGTG 3480
Query 3629 GTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACAGAAAGACGTCTCATGTCCTTAC 3688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 GTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACAGAAAGACGTCTCATGTCCTTAC 3540
Query 3689 TGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCA 3748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 TGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCA 3600
Query 3749 GTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGTTATGCTCTCCATCTCAAGTCCGGTGATCAATT 3808
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3601 GTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTCTCCATCTCAAGTCCGGTGATCAATT 3660
Query 3809 T-CAGATTTCATAATCAATACAGAGATGCTCTATTAACAGAATAAGAGTGTTGAACTTTT 3867
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 3661 TTCAGATTTCATAATCAATACAGAGATGCTCTATTAACAGAATAAGAATGTTGAGCTTTT 3720
Query 3868 GGTGTTTTTGTGATTGTGTACTTACCAATCAGGTTTGAGGATTTTTCTCGTTGCAGGTTT 3927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3721 GGTGTTTTTGTGATTGTGTACTTACCAATCAGGTTTGTGGATTTTTCTCGTTGCAGGTTT 3780
Query 3928 TT--ATTACTCTTTTAAAAGTTGTTTCTTATCTTTTAGTA-CA-CA-----TGAGAACTT 3978
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct 3781 TTCTATTACTCTTTTTAAAGTTGTTTCTTATCTTTTAGTAACAACAACACATGAGAACTT 3840
Query 3979 TAGCTTCTTGCTTTATAATTTCTCTTTTTGATGCATAGTAGCACTGGATAACTTGTAATT 4038
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| | || |||||
Sbjct 3841 TAGCTTCTTGCTTTATAATTTCT-TTTT-GATGCATAGTAGTGCTGGATGATTTTTAATT 3898
Query 4039 TCAATTTCGGAAATTATGGTTTACTTGTGAAATTATGATTTTATAAA 4085
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3899 TCAATTTCGAAAATTATGGTTTACTTGTGAAATTATGATTTTATAAA 3945
> Ahg932069 jgi|Araly1|932069|scaffold_400057.1
Length=3713
Score = 3779 bits (2046), Expect = 0.0
Identities = 2586/2849 (91%), Gaps = 28/2849 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 988 GCGAACTGGACTTCAGACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCAGTTCA 1047
|||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||
Sbjct 864 GCGAACTGGAATCCAAACTTTTCGCCGTGAACATGATCGATTTTGGATACTTGCAGTTCA 923
Query 1048 CCCTGAGATGAATCTACTAGCAGCAGGACATGACAGTGGCATGATTGTGTTCAAGCTTGA 1107
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct 924 CCCTGAGATTAATTTACTGGCAGCAGGACATGACAATGGTATGATTGTCTTCAAACTTGA 983
Query 1108 GAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGATAGATT 1167
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 984 GAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGTGATTCATTATTCTATGCCAAGGATAGATT 1043
Query 1168 CTTGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAGGGATTCCCAAGTTATCCCTATACGGCGTCC 1227
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1044 TTTGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAAAGATTCCCAAGTTATTCCTATACGGCGTCC 1103
Query 1228 GGGTACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCCACTGAAAATGC 1287
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 1104 TGGTACCCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTTTATCGTACAGTCCGACAGAAAATGC 1163
Query 1288 AGTTTTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCGTATGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1347
||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 AGTCCTAATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTACGAGTTGTACATCATACCGAAAGA 1223
Query 1348 TAGTGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGAGGGACAGGTGGCTCTGCAGT 1407
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||
Sbjct 1224 TAGCGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAAGAGGGGGACAGGGGGTTCTGCGGT 1283
Query 1408 ATTCATTGCCCGTAACCGATTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAAGTGCTAGTCAA 1467
|||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1284 GTTCATTGCTCGAAATCGGTTTGCTGTGCTCGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCTAGTGAA 1343
Query 1468 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTCCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1527
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 GAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCACAGATGCTATCTT 1403
Query 1528 TTATGCTGGGACTGGGAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATCTTTGACCT 1587
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1404 TTATGCTGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGGTCTGAGGATAAAGTGGTTATATTTGACCT 1463
Query 1588 CCAGCAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGTTTGGTC 1647
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1464 TCAACAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCTTTTGTTAGGTATGTTGTTTGGTC 1523
Query 1648 CAGTGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATCGCGAGCAAAAA 1707
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1524 TAACGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACATACTATCATTATTGCGAGCAAAAA 1583
Query 1708 ACTTGTTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGATACGTGTGAAAAGTGGAGCTTGGGACGA 1767
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1584 ACTTGTCCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACAATACGTGTGAAAAGCGGAGCTTGGGACGA 1643
Query 1768 TAATGGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGA 1827
|||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1644 CAATGGTGTCTTCATTTACACAACTCTGAACCACATCAAGTACTGTCTTCCTAATGGAGA 1703
Query 1828 TAGTGGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGTAATAC 1887
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1704 TAGTGGAATCATCAGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTCTGGAAATAC 1763
Query 1888 AATCTTTTGCTTGGATCGGGATGGCAAAAACAAGGCTATCACCATTAATGCAACCGAGTA 1947
|||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1764 AATCTTTTACTTGGACCGGGATGGGAAAAACAGGGCTATCACCATTAATGCAACCGAATA 1823
Query 1948 CATTTTCAAGCTTTCACTGCTGAGGAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 2007
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 CATTTTCAAGCTTGCACTGCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCATGATAAAGAA 1883
Query 2008 CTCTCAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTACCTGCAGCAGAAAGGATTCCCTGAAGT 2067
||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1884 CTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATCGCTTATCTTCAGCAGAAAGGCTTTCCTGAAGT 1943
Query 2068 TGCCCTCCATTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAATC-TGGCTCTTGAAAGTGGCA 2126
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 1944 TGCCCTCCACTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAA-CTTGGCTCTTGAAAGTGGCA 2002
Query 2127 ACATCAGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACTGGTATAGAC 2186
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 ACATCAGTGTAGCTGTTGCATCCGCTACAGAGATTAATGAGAAAGACCACTGGTATAGAC 2062
Query 2187 TTGGAGTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTTGAGTTTGCATACCAGCAGA 2246
| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2063 TCGGAGTGGAGGCTCTTCGTCAAGGAAATTCTAGAATTGTTGAATTTGCATACCAGCAGA 2122
Query 2247 CAAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTTTATCTCATTACTGGAAATTTGGACAAGCTTT 2306
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 2123 CAAAGAACTTTGAGAGGTTATCTTTTCTATATCTCATTACTGGCAATTTAGACAAGCTGT 2182
Query 2307 CAAAGTTGATGAAGATTGCAGAAGTGAAGAACAACGTAATGGGACAGTTTCACAATGCTC 2366
||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2183 CAAAGTTGATGAAAATTGCAGAGGTGAAGAACAATGTAATGGGTCAGTTTCACAATGCTC 2242
Query 2367 TCTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTC 2426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2243 TCTACCTAGGAGATGTTAAAGAGCGTGTTAAGATACTAGAGAATGCTGGTCATTTGCCTC 2302
Query 2427 TAGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTG 2486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2303 TAGCTTATATCACAGCTTCGGTTCATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCCATTG 2362
Query 2487 AGTTAGGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCAC 2546
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2363 AGTTAGGAGACAACGTGCCCTCATTGCCTGAAGGGAAAACTCCATCGCTTTTAATGCCAC 2422
Query 2547 CGACACCCATCATGTGTGGTGGTGATTGGCCTCTTCTTAGAGTGATGAAAGGAATATTTG 2606
|| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2423 CGCCTCCCATCATGTGTGGTGGCGATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTG 2482
Query 2607 AAGGAGGACTTGAGAGTGCAGACAGAGGAGGTACTGTTGATGAAG-A-A-GA---TGTTG 2660
||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | | || |||||
Sbjct 2483 AAGGAGGGCTTGAGAGTGCAAACCGAGGAGGGGCTGTTGATGAAGTAGAAGAAGATGTTG 2542
Query 2661 AAGGGGATTGGGGTGAGGAACTTGACA--TTA-ATGTTGATGGAATGGAGAACAGAGATA 2717
|||| || |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 2543 AAGGCGACTGGGGTGAGGGACTTGATAAATTCGATGTTGATGGAATGGAGAACACAGACA 2602
Query 2718 TTGAAGACATTTTGGC-GGCTGCAGAAGCAGGTGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGA 2776
|||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||
Sbjct 2603 TTGAAGCCATATTGGATGG-TGCAGAAGCAGCTGAAGATGAAGACGACGAGGAAGGTGGA 2661
Query 2777 TGGGG---ACTTGAAGACTTGGTGCTCCCACCAGAGCTTGACACTCCTAAAGCCTCTGCT 2833
||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2662 TGGGGGGGACTTGAAGACTTGGAGCTTCCACCAGAGCTTGATACTCCTAAAGCCTCTGCT 2721
Query 2834 AATGCACGTTCATCTGTTTTTGTGACACCTCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGAGCTGG 2893
|| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2722 AACGCACGTTCATCTATTTTTGTGACACCTACTCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGATTTGG 2781
Query 2894 AGCCAGAAATCTTCTCTTGCTGCTGAGCAAGCCGCAGCGGGAAGCTTCGACACTGCAATG 2953
|||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2782 AGCCAGAAATCTTCCCTTGCTGCTGAGCAGGCTGCAGCAGGAAGCTTCGACACTGCAATG 2841
Query 2954 CGTCTGCTCCACAGACAGCTTGGTATCAAGAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTA 3013
||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2842 CGTTTGCTCCACAGACAGCTTGGCATTAAGAACTTTGCTCCTTTGAAATCGATGTTTCTT 2901
Query 3014 GATCTGTTCAATGGCAGCCATAGCTATCTGCGTGCTTTTTCTTCATGTCCTGTGGTTCCA 3073
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2902 GATCTGTTCAGTGGGAGCCATAGCTATCTGCGTGCCTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCT 2961
Query 3074 CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGCGAGTCTTCCAGTCCCAACGTCCGTAGCCCACCAGCT 3133
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||
Sbjct 2962 CTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGTGAGTCTTCCAGTCCTAACGTCCGTGGCCCGCCAGCT 3021
Query 3134 CTTGTTTAT-GATTTCTCTCAGCTAGACGAGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAAC 3192
||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3022 CTTGTTT-TCGATTTCTCTCAGCTAGAAGCGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCCACAAC 3080
Query 3193 AACTGGGAAATTCA-CTGAGGCTCTCCGTCTCTTCCTTTCTATCCTGCACACCATCCC-T 3250
| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |
Sbjct 3081 AGCTGGGAAATT-ATCTGAGGCTCTCCGTGTCTTCCTTTCTATTCTCCAAACCATCCCAT 3139
Query 3251 CTAGTGGTAGTCGAGACAAGAAGAGAAGTGGATGAGGTCAAGGAATTAATCGTTATCGTT 3310
| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||| | || | || ||
Sbjct 3140 -TGGTGGTAGTTGAGTCAAGAAGAGAAGTCGATGATGTTAAGGAACTGGTCATCATTGTC 3198
Query 3311 AAAGAATATGTCCTTGGTCTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCG 3370
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3199 AAAGAATATGTCCTCGGTCTTCAAATGGAGCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCG 3258
Query 3371 GTGAGGCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTTCACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTA 3430
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||
Sbjct 3259 GTGAGGCAGCAAGAGCTTGCTGCTTACTTCACTCACTGTAAACTCCAAACACCTCACCTA 3318
Query 3431 CGGCTTGCGCTGCTT-AGTGCAATGGGTGTCTGCTACAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGC 3489
||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||
Sbjct 3319 CGGCTCGCG-TACTTTAGTGCAATGACCGTCTGCTACAAGGCAAAGAACATGGCTACTGC 3377
Query 3490 TTCTAATTTCGCCAGAAGACTGTTGGAAACAAGCCC-AGT-T-GATAGCCAAGCCAAGAT 3546
| | | ||||||||||| ||||||| |||| ||| | | | || ||||| |||| ||
Sbjct 3378 TGCCCACTTCGCCAGAAGTTTGTTGGATACAAACCCTACTATTGAGAGCCAGGCCAGGAC 3437
Query 3547 GGCTAGACAAGTTGTGCAAGCCGCTGAACGTAACATGACCGATGAAACAAAGCTTAACTA 3606
||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| ||| |||||
Sbjct 3438 GGCTAGACAAGTTATGCAAGCTGCTGACCGCAACATGACAGATGCAACCGCGCTCAACTA 3497
Query 3607 CGACTTCAGGAACCCTTTTGTGGTATGTGGTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACA 3666
|||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||
Sbjct 3498 CGACTTTAGAAACCCGTTTGTGATATGCGGGTCCACTTATGTGCCAATCTACAAAGGACA 3557
Query 3667 GAAAGACGTCTCATGTCCTTACTGCACCGCCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACAT 3726
|||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 3558 GAAAGATGTGGCATGTCCTTACTGCACTGCCCGGTTTGTACCAAGCCAGGAAGGTAACAT 3617
Query 3727 CTGCACGGTCTGTGATCTAGCAGTGATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGTTATGCTCTCC 3786
|||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3618 CTGCTCGGTCTGTGATCTTGCAGTCATTGGCGCAGACGCATCTGGTTTGCTATGCTCTGC 3677
Query 3787 ATCTCAAGTCCGGTGATCAATTTCAGATT 3815
||||||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 3678 GTCTCAAGTCCGGTGAACAAGT-CAGATT 3705
Score = 961 bits (520), Expect = 0.0
Identities = 685/767 (89%), Gaps = 2/767 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 151 TATGTTGACAAAGTTCGAAACCAAAAGTAACAGAGTTAAGGGACTGAGTTTTCACCCTAA 210
|||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 99 TATGCTGACGAAGTTCGAGACCAAGAGTAACCGAGTTAAGGGTCTGAGTTTCCACCCTAA 158
Query 211 ACGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTAT 270
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 159 ACGACCATGGATTCTCGCCAGTTTGCACAGTGGTGTGATCCAGCTCTGGGATTATCGTAT 218
Query 271 GGGTACTTTGATCGATAGATTCGACGAACACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCA 330
||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219 GGGTACTTTGATCGATAGATTTGATGAGCACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTCATTTCCA 278
Query 331 CAATTCTCAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGTGGAACTA 390
|| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 279 CAGTTCTCAGCCTTTATTCGTCTCTGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTTTGGAACTA 338
Query 391 CAAAAACCACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTAGGGCATCTTGATTATATCCGCACGGTTCA 450
|||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 339 CAAACTTCACAGGTGTCTTTTCACTCTTCTCGGGCATCTTGATTATATCCGCACTGTCCA 398
Query 451 GTTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCAAGTGATGATCAAACTATCCGTATATG 510
|| || || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 399 ATTTCACCACGAAAACCCATGGATTGTGAGTGCTAGTGACGATCAGACTATCCGCATATG 458
Query 511 GAACTGGCAATCACGGACTTGTGTTTCTGTATTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTG 570
||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 GAACTGGCAGTCAAGAACTTGTATTTCCGTGTTGACTGGTCACAATCATTATGTTATGTG 518
Query 571 TGCTTCTTTCCATCCGAAA-GAAGACCTCGTCGTATCAGCTTCGTTAGATCAGACTGTTC 629
||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| || | ||||||||||| |
Sbjct 519 TGCTTCTTTCCATCC-AAAGGAAGACCTTGTTGTGTCAGCATCACTGGATCAGACTGTCC 577
Query 630 GTGTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGATATCATGA 689
|||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||
Sbjct 578 GTGTTTGGGACATTGGTGCTCTTAAGAAGAAGTCAGCATCTCCTGCTGATGACCTCATGC 637
Query 690 GGTTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCCATTGTCAAGTACGTTC 749
| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |
Sbjct 638 GATTTAGTCAGATGAATTCTGATCTTTTTGGTGGGGTTGACGCTATAGTTAAGTACGTAC 697
Query 750 TTGAAGGTCATGATAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCTCTTATTG 809
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 698 TTGAAGGTCATGATAGAGGAGTAAACTGGGCTTCTTTTCATCCCACCCTTCCTCTCATTG 757
Query 810 TCTCGGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGG 869
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 TCTCTGGTGCCGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAAGCTTGGG 817
Query 870 AGGTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATG 916
| ||||||||||||| | | || |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 818 AAGTGGATACATTGCCAAGTCACATGAATAATGTTTCATCCGTTATG 864
> Ahg932070 jgi|Araly1|932070|scaffold_400058.1
Length=3496
Score = 2809 bits (1521), Expect = 0.0
Identities = 1928/2125 (91%), Gaps = 25/2125 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 146 GAGATTATGTTGACAAAGTTCGAA-ACCAAAAGTAACAGAGTTAAGGGACTGAGTTTTCA 204
|||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 15 GAGATTATGTTGACCAAGTTC-AAGACCAAGAGTAACAGAGTTAAAGGTCTGAGCTTTCA 73
Query 205 CCCTAAACGACCATGGATTCTCGCGAGTTTGCACAGTGGCGTGATCCAGCTCTGGGATTA 264
||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CCCTAAAAGACCATGGATTCTCGCCAGTTTACACAGTGGTGTGATCCAGCTCTGGGATTA 133
Query 265 TCGTATGGGTACTTTGATCGAT-AGATTCGACGAACACGAAGGACCTGTTCGTGGTGTTC 323
||| ||||||| ||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 134 CCGTGTGGGTACCTTGATCGATAAG-TTTGACGGGCACCAAGGACCTGTTCGTGGTGTTC 192
Query 324 ATTTCCACAATTCTCAGCCTCTCTTCGTCTCCGGAGGGGATGATTACAAGATTAAAGTGT 383
|||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |
Sbjct 193 ATTTTCACACTTCACAGCCTCTATTCGTCTCTGGAGGGGATGATTGCAAGATAAAAGTTT 252
Query 384 GGAACTACAAAAAC-CACAGGTGCCTTTTCACTCTTCTAGGGCATCTTGATTATATCCGC 442
|||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 253 GGAACTAC-AAAACACACTGGTGTCTTTTCACTCTTCTTGGACATCTTGATTATATCCGC 311
Query 443 ACGGTTCAGTTCCATCATGAGTACCCATGGATTGTGAGTGCAAGTGATGATCAAACTATC 502
||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||
Sbjct 312 ACGGTTCAGTTTCATCACGAATACCCATGGATTCTGAGTGCCAGTGACGACCAAACTATC 371
Query 503 CGTATATGGAACTGGCAATCACGGACTTGTGTTTCTGTATTGACTGGTCACAATCATTAT 562
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||
Sbjct 372 CGTATATGGAACTGGCAATCACGGACTTGTGTCTCTGTCTTGGCTGCTCACAATCATTAT 431
Query 563 GTTATGTGTGCTTCTTTCCATCCGAAAGAAGACCTCGTCGTATCAGCTTCGTTAGATCAG 622
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 432 GTTATGTGTGCTTCTTTCCACCCAAAAGATGACCTTGTTGTATCAGCTTCCTTAGATCAG 491
Query 623 ACTGTTCGTGTTTGGGATATTGGTGCTCTTAGGAAGAAGACTGTATCTCCTGCTGATGAT 682
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 492 ACTGTTCGTGTTTGGGAAATTGGTGCTCTTAAGAAGAAGACTGTATCTCCTTCTGATGAT 551
Query 683 ATCATGAGGTTGACTCAGATGAATAGTGATCTTTTTGGTGGAGTTGATGCCATTGTCAAG 742
|||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | | ||||||| || |||||
Sbjct 552 ATCATGAGGTTGGCTGAGATAAATAGTGATCTTTTTGATAGTGTTGATGTCACAGTCAAA 611
Query 743 TACGTTCTTGAAGGTCATGATAGAGGTGTAAACTGGGCTGCTTTTCATCCCACCCTGCCT 802
||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 612 TACGTCCTTGAAGGTCATGAAAGAGGTGTAATTTGGGCTGCTTTTCATCCCAACCTGCCT 671
Query 803 CTTATTGTCTCGGGTGCAGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAA 862
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 CTTATCGTCTCGGGTTCAGATGACCGCCAAGTAAAGCTGTGGCGTATGAATGAAACTAAA 731
Query 863 GCTTGGGAGGTGGATACATTGCGAGGCCATATGAATAACGTTTCATCTGTTATGTTCCAT 922
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 732 GCTTGGGAGGTGGATACATTGCGAGGTCACATGAATAATGTTTCATCCGTTATGTTCCAT 791
Query 923 GCAAAACAGGACATAATTGTATCAAACTCTGAAGATAAGAGCATCCGTGTCTGGGATGCT 982
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 792 GCAAAACAAGACATAATTGTATCAAACTCTGAGGATAAAAGCATCCGTGTCTGGGATGCT 851
Query 983 ACCAAGCGAACTGGACTTCAGACTTTCCGTCGTGAACATGATAGATTCTGGATTCTTGCA 1042
||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 852 ACCAAGCGAACTGGAATCCAAACTTTTCGCCGTGAACATGATCGATTCTGGAGTCTTGCA 911
Query 1043 GTTCACCCTGAGATGAATCTACTAGCAGCAGGACATGACAGTGGCATGATTGTGTTCAAG 1102
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||
Sbjct 912 GTTCACCCTGAGATTAATCTACTAGCAGCAGGACATGACAATGGTATGATTGTCTTCAAA 971
Query 1103 CTTGAGAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGGGATTCTTTGTTCTATGCCAAGGAT 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 972 CTTGAGAGAGAACGTCCTGCATTTGCTTTGAGTGGTGATTCATTATTCTATGCCAAGGAT 1031
Query 1163 AGATTCTTGCGGTACTATGAATATTCAACTCAAAGGGATTCCCAAGTTATCCCTATACGG 1222
||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1032 AGATTTTTACGGTGCTATGAATATTCAACTCAAAAAGATTCCCAAGTTATTCCTATACGG 1091
Query 1223 CGTCCGGGTACTCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTCTATCATACAGTCCCACTGAA 1282
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||
Sbjct 1092 AGTCCTGGTACCCCAAGCTTGAATCAAAGTCCTAGGACTTTATCGTACAGTCCAACAGAA 1151
Query 1283 AATGCAGTTTTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCGTATGAGTTGTACATCATACCG 1342
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1152 AATGCAGTTCTGATCTGCTCAGATCTGGATGGTGGTTCTTACGAGTTGTACATCATACCA 1211
Query 1343 AAAGATAGTGTTGGCAGGAGTGACGTTGTGCAAGATGCAAA-GAGAGGGACAGGTGGCTC 1401
||||| || | || |||||||||||||||| ||| | | |||| |||||| ||
Sbjct 1212 AAAGACAG-------A--AGCGACGTTGTGCAAGATG-AAATGCGGGGGAAAGGTGGTTC 1261
Query 1402 TGCAGTATTCATTGCCCGTAACCGATTTGCTGTTCTCGAGAAAAGCACCAGCCAAGTGCT 1461
||| || |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1262 TGCGGTGTTCATTGCTCGAAATCGGTTTGCTGTTCTGGAGAAAAGCACCAGCCAGGTGCT 1321
Query 1462 AGTCAAGAATCTAAAGAATGAGGTGGTTAAAAAGAGTCCTCTGCCTATTCCCACAGATGC 1521
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1322 AGTGAAGAATCTAAAGAATGAGGTGGTTGAAAAGAGTTCTCTGCCTATTCCCGCAGACGC 1381
Query 1522 TATCTTTTATGCTGGGACTGGGAATTTGCTTTGTAGATCTGAGGATAAAGTAGTTATCTT 1581
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1382 TATCTTTTATGCTGGGACTGGAAATTTGCTTTGTAGGTCTGAGGATAAAGTGGTTATATT 1441
Query 1582 TGACCTCCAGCAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGACACCATTTGTTAGGTACGTTGT 1641
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1442 TGACCTTCAACAAAGGCTTGTTCTTGGTGAGCTTCAGATACCGTTTCTTAGGTACGTTGT 1501
Query 1642 TTGGTCCAGTGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCAGCAAACAT-ACTATCATTATCGCGA 1700
|||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||
Sbjct 1502 TTGGTCTAACGATATGGAGAGTGTTGCTTTGCTCGGCAAACATTA-TATCATTATTGCGA 1560
Query 1701 GCAAAAAACTTG-TTCTCCAGTGCACGCTTCATGAGACGA-TACGTGTGAAAAGTGGAGC 1758
|||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GCAAAAAACTTGCTT-TCCAGTGCATGCTTCATGAGA-GAATACGTGTGAAAAGTGGAGC 1618
Query 1759 TTGGGACGATAATGGTGTCTTCATTTACACAACTTTGAATCATATCAAGTACTGTCTTCC 1818
|||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 1619 ATGGGACGACAATGGTGTCTTCATTTACACTACTCTGAACCACATCAAGTATTGTCTTCC 1678
Query 1819 TAATGGAGATAGTGGAATCATCCGAACCCTGGATGTCCCAATCTATATCACCAAGGTGTC 1878
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1679 TAATGGAGATAGTGGAATCATCAAAACCCTGGATGTCCCAATCTACATCACCAAGGTGTC 1738
Query 1879 TGGTAATACAATCTTTTGCTTGGATCGGGATGGCAAAAACAAGGCTATCACCATTAATGC 1938
||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1739 TGGAAATACAATCTTTTGCTTGGACCGGGATGGGAAAAACAGGGCTATCACCATTAATGC 1798
Query 1939 AACCGAGTACATTTTCAAGCTTTCACTGCTGAGGAAGAGATATGATCATGTCATGAGCAT 1998
||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 AACTGAATACATTTTCAAGCTTGCACTGCTGAGAAAGAGATATGATCATGTCATGAGCAT 1858
Query 1999 GATAAAGAACTCTCAGCTATGTGGACAGGCTATGATTGCTTACCTGCAGCAGAAAGGATT 2058
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 1859 GATAAAGAACTCCCAGCTATGTGGACAGGCTATGATCGCTTATCTTCAGCAGAAAGGTTT 1918
Query 2059 CCCTGAAGTTGCCCTCCATTTTGTTGAAGATGAGAGGATCCGATTCAATCT-GGCTCTTG 2117
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1919 TCCTGAAGTTGCCCTCCACTTTGTTGAAGACGAGAGGATCCGATTCAA-CTTGGCTCTTG 1977
Query 2118 AAAGTGGCAACATCAGTGTGGCTGTTGCATCCGCTACACAGATTAACGAGAAAGACCACT 2177
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1978 AAAGTGGCAACATCAGTGTAGCTGTTGCATCCGCTACAGAGATTAATGAGAAAGACCACT 2037
Query 2178 GGTATAGACTTGGAGTGGAGGCTCTTCGCCAAGGTAATTCTGGAATTGTTGAGTTTGCAT 2237
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 2038 GGTATAGACTCGGAGTGGAGGCTCTTCGTCAAGGAAATTCTAGAATTGTTGAGTTTGCGT 2097
Query 2238 ACCAGCAGACAAAGAACTTTGAGAG 2262
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 ACCAGCAGACAAAGAACTTTGAGAG 2122
Score = 1103 bits (597), Expect = 0.0
Identities = 926/1085 (85%), Gaps = 21/1085 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2749 TGAAGAAGAAAACGATGAGGAAGGTGGAT--GG-GGACTTGAAGACTTGG-TGCTCCCAC 2804
||||||||| ||||| | || ||| || || ||| | | |||||||| | || |||
Sbjct 2417 TGAAGAAGATAACGACGGGGTTTGTGAATGGGGAGGAATCGGAGACTTGGAT-CTTCCAA 2475
Query 2805 CAGAGCTTGACACTC-CT-AAAGCCTCTGCTAATGCACGTTCATCTGTTTTTGTGACACC 2862
||||| || | |||| || |||| ||||| || ||| ||||||| |||||| | || ||
Sbjct 2476 CAGAG-TT-AGACTCTCTGAAAGTCTCTGTTAGCGCATGTTCATCGGTTTTTATTACCCC 2533
Query 2863 TCCCCAAGGTATGCCCGTAAGTCAGAGCTGGAGCCAGAAATCTTCTCTTGCTGCTGAGCA 2922
| | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2534 TACACAAGGCATGCCCGTAAGTCAGATTTGGAGCGAGAAATCTTCCCTTGCTGCTGAGCA 2593
Query 2923 AGCCGCAGCGGGAAGCTTCGACACTGCAATGCGTCTGCTCCACAGACAGCTTGGTATCAA 2982
||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2594 AGCTGCAGCGGGAAGCTTTGACACTGCAATGCGTTTGCTCCACAGACAGCTTGGCATAAA 2653
Query 2983 GAACTTTACACCTTTGAAATCGATGTTTCTAGATCTGTTCAATGGCAGCCATAGCTATCT 3042
||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2654 GAACTTTGCGCCTTTAAAATCGAAGTTTCTTGATCTGTTCAGTGGGAGCCATAGCTATCT 2713
Query 3043 GCGTGCTTTTTCTTCATGTCCTGTGGTTCCACTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGCGAGTC 3102
|||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2714 GCGTGCCTTTTCTTCATCTCCTGTGGTTCCTCTTGCCATTGAGCGTGGATGGAGTGAGTC 2773
Query 3103 TTCCAGTCCCAACGTCCGTAGCCCACCAGCTCTTGTTTAT-GATTTCTCTCAGCTAGACG 3161
||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
Sbjct 2774 TTCCAGTCCTAACGTCCGTGGCCCGCCAGCTCTTGTTT-TCGATTTCTCTCAGCTAGAAG 2832
Query 3162 AGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCTACAACAACTGGGAAATTCA-CTGAGGCTCTCCGT 3220
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 2833 CGAAGCTCAAATCCGGCTACAAAGCCACAACAGCTGGGAAATT-ATCTGAGGCTCTCCGT 2891
Query 3221 CTCTTCCTTTCTATCCTGCACACCATCCC-TCTAGTGGTAGTCGAGACAAGAAGAGAAGT 3279
||||||||||||| || || |||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 2892 GTCTTCCTTTCTATTCTCCAAACCATCCCAT-TGGTGGTAGTTGAGTCAAGAAGAGAAGT 2950
Query 3280 GGATGAGGTCAAGGAATTAATCGTTATCGTTAAAGAATATGTCCTTGGTCTTCAAATGGA 3339
||||| || |||||| | || | || || |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2951 CGATGATGTTAAGGAACTGGTCATCATAGTCAAAGAATATGTCCTCGGTCTTCAAATGGA 3010
Query 3340 GCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTCGCTGCTTACTT 3399
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3011 GCTCAAGAGGAGAGAGATGAAAGATGATCCGGTGAGGCAGCAAGAGCTTGCTGCTTACTT 3070
Query 3400 CACTCACTGCAACCTCCAAACACCTCACTTACGGCTTGCGCTGCTT-AGTGCAATGGGTG 3458
||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||| |
Sbjct 3071 CACTCACTGTAAACTCCAAACACCTCACCTACGGCTCGCG-TACTTTAGTGCAATGACCG 3129
Query 3459 TCTGCTACAAGGCAAAGAACCTCGCCACTGCTTCTAATTTCGCCAGAAGACTGTTGGAAA 3518
|||||||||||||||||||| | || |||||| | | ||||||||||| ||||||| |
Sbjct 3130 TCTGCTACAAGGCAAAGAACATGGCTACTGCTGCCCACTTCGCCAGAAGTTTGTTGGATA 3189
Query 3519 CAAGCCC-AGT-T-GATAGCCAAGCCAAGATGGCTAGACAAGTTGTGCAAGCCGCTGAAC 3575
||| ||| | | | || ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| |
Sbjct 3190 CAAACCCTACTATTGAGAGCCAGGCCAGGACGGCTAGACAAGTTATGCAAGCTGCTGACC 3249
Query 3576 GTAACATGACCGATGAAACAAAGCTTAACTACGACTTCAGGAACCCTTTTGTGGTATGTG 3635
| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| |
Sbjct 3250 GCAACATGACAGATGCAACCGCGCTCAACTACGACTTTAGAAACCCGTTTGTGATATGCG 3309
Query 3636 GTTCCACATATGTCCCGATCTACAGAGGACAGAAAGACGTCTCATGTCCTTACTGCACCG 3695
| ||||| || || || ||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| |
Sbjct 3310 GGTCCACTTACGTGCCAATCTACAAAGGACAGAAAGATGTGGCATGTCCTTATTGCACTG 3369
Query 3696 CCCGGTTTGTACCAAACCAGGAAGGAAACATCTGCACGGTCTGTGATCTAGCAGTGATTG 3755
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 3370 CCCGGTTTGTACCAAGCCAGGAAGGAAACATTTGCACAGTCTGCGATCTTGCAGTCATTG 3429
Query 3756 GCGCAGACGCATCTGGTTTGTTATGCTCTCCATCTCAAGTCCGGTGATCAATTTCAGATT 3815
| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||
Sbjct 3430 GTGCAGATGCTTCTGGTTTGCTATGCTCTCCGTCTCAAGTCCTATGAAGAAATTAAGATT 3489
Query 3816 TCATA 3820
||||
Sbjct 3490 -CATA 3493
Score = 379 bits (205), Expect = 8e-104
Identities = 233/247 (94%), Gaps = 0/247 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2391 GTGTTAAGATACTGGAGAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCTTATATCACAGCTTCGGTTC 2450
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140 GTGTTAAGATACTAGATAATGCTGGTCATTTGCCTCTAGCTTATATCACAGCTTCGGTTC 2199
Query 2451 ATGGTTTAAATGACATTGCTGAGCGACTGGCAACTGAGTTAGGAGACAACGTGCCCTCAT 2510
|||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2200 ATGGTTTAAATGACGTCGCTGAGCGACTGGCCATTGAGTTAGGAGACAACGTGCCCTCAT 2259
Query 2511 TGCCTGAAGGAAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGACACCCATCATGTGTGGTGGTG 2570
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
Sbjct 2260 TGCCTGAAGGGAAAACTCCATCGCTTCTAATGCCACCGCCTCCCATCATGTGTGGTGGCG 2319
Query 2571 ATTGGCCTCTTCTTAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGAGGACTTGAGAGTGCAGACA 2630
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 2320 ATTGGCCTCTTCTGAGAGTGATGAAAGGAATATTTGAAGGAGGGCTTGAGAGTGCAAACC 2379
Query 2631 GAGGAGG 2637
|||||||
Sbjct 2380 GAGGAGG 2386
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 154932379683
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5